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基于常规引物靶向结核分枝杆菌Ⅱ型分枝杆菌散在重复单位的恒温扩增: 1; 作者吴康屈蓉 +4 位作者王刚薛清华吕建新 Douglas BLowrie 范小勇《复旦学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2020年第6期799-808,共10页; 目的探讨基于特异常规引物(即引物不需折叠成特定二级结构)靶向恒温扩增重复DNA序列的方法,并测试其检测结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,Mtb)的可能性。方法以合成的重复DNA或以抽提的细菌基因组DNA为模板,用Bst 2.0 WarmStar... 展开更多; 关键词恒温扩增重复DNA 结核分枝杆菌 ⅱ型分枝杆菌散在重复单位; 在线阅读下载PDF 职称材料

分枝杆菌散在重复单位对结核分枝杆菌分型的研究被引量：2: 2; 作者郭艳玲刘洋 +2 位作者王甦民李传友宋长兴《中国防痨杂志》 CAS 2009年第2期80-84,共5页; 目的评价分枝杆菌散在重复单位(MIRU)分型方法在结核病流行病学上的应用,探讨该方法的应用前景。方法采用MIRU分型对158株结核分枝杆菌进行基因分型,这些菌株均已进行IS6110-RFLP分型。结果MIRU分型结果产生只需1d。158株结核分枝杆菌... 展开更多; 关键词分枝杆菌结核分枝杆菌散在重复单位 IS6110 RFLP; 在线阅读下载PDF 职称材料

吉林省鹿源牛分枝杆菌MIRU分型研究: 3; 作者杨莉王春雨 +3 位作者孟庆峰王海军刘金华王全凯《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第12期935-938,共4页; 为了解鹿源牛分枝杆菌(M.bovis)基因多态性,初步建立适合吉林省鹿源M.bovis的基因分型方法,本研究利用12个分枝杆菌散在重复单位(MIRU)位点,对96株鹿源M.bovis吉林分离株进行MIRU基因分型研究。结果显示,12个位点中有8个位点(MIRU2、4... 展开更多; 关键词鹿源牛分枝杆菌分枝杆菌散在重复单位基因分型流行病学; 在线阅读下载PDF 职称材料

结核分枝杆菌Mtub-39位点多态性与下游基因表达关系的研究被引量：2: 4; 作者周爱萍徐志弘 +2 位作者孙青姚玉峰吴兴福《上海交通大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2012年第11期1415-1420,共6页; 目的分析结核分枝杆菌(MTB)北京型菌株及非北京型菌株5个有明显差异的MTB散在分布重复单位(MIRU)位点,研究其多态性与下游基因表达的关系。方法利用生物信息学方法预测5个MIRU位点(ETR-C、Mtub-30、Mtub-39、MIRU-27、MIRU-40)下游相邻... 展开更多; 关键词结核分枝杆菌 MTB散在分布重复单位位点 pMC210 启动子; 在线阅读下载PDF 职称材料

某高级中学一起结核病聚集性疫情传播的时空序列与分子流行病学分析被引量：3: 5; 作者陈蕊明林健雄 +2 位作者陈壮濠刘苏洋符慧《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2023年第11期1369-1375,共7页; 目的探讨本起学校结核病聚集性疫情传播的原因、特点和规律,为持续改进学校结核病控制策略的有效实施提供科学依据。方法遵照广东省汕头市卫生健康局对本起疫情处置工作的具体要求,以指示病例为中心、以学习生活空间要素为重点、以人际... 展开更多; 关键词结核学校聚集性疫情数目可变串联重复序列-结核分枝杆菌散在重复单位; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基于常规引物靶向结核分枝杆菌Ⅱ型分枝杆菌散在重复单位的恒温扩增: 1; 作者吴康屈蓉王刚薛清华吕建新 Douglas BLowrie 范小勇; 机构上海市(复旦大学附属)公共卫生临床中心温州医科大学检验医学院和生命科学学院; 出处《复旦学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2020年第6期799-808,共10页; 基金国家重点研发计划(2018YFD0500900) 国家科技重大专项(2018ZX10731301,2018ZX10302301) 上海市科委医学引导项目(18411970700)。; 文摘目的探讨基于特异常规引物(即引物不需折叠成特定二级结构)靶向恒温扩增重复DNA序列的方法,并测试其检测结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,Mtb)的可能性。方法以合成的重复DNA或以抽提的细菌基因组DNA为模板,用Bst 2.0 WarmStart DNA聚合酶进行恒温扩增。用琼脂糖凝胶电泳检测扩增结果。结果合成的重复DNA可用其特异常规引物进行恒温扩增。进一步,Mtb H37Rv Ⅱ型分枝杆菌散在重复单位(mycobacterial interspersed repetitive units,MIRUs)可用其特异常规引物对(即Ⅱ_MIRU-F和Ⅱ_MIRU-R)或单引物(即Ⅱ_MIRU-F)进行恒温扩增。相比于非分枝杆菌菌株、非结核分枝杆菌菌株、Mtb复合物菌株和临床分离株,Ⅱ_MIRU-F能够高特异地扩增Mtb菌株。Ⅱ_MIRU-F针对Mtb H37Rv基因组DNA的检测下限较高,且不能特异地区分Mtb阴性痰液样本和Mtb阳性痰液样本。结论常规引物可恒温扩增重复DNA序列(包括MtbⅡ型MIRUs);MtbⅡ型MIRUs特异引物Ⅱ_MIRU-F不适合用于痰液样本的检测。; 关键词恒温扩增重复DNA 结核分枝杆菌 ⅱ型分枝杆菌散在重复单位; Keywords isothermal amplification repetitive DNA Mycobacterium tuberculosis type ⅱ mycobacterial interspersed repetitive units; 分类号 R378.911 [医药卫生—病原生物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名分枝杆菌散在重复单位对结核分枝杆菌分型的研究被引量：2: 2; 作者郭艳玲刘洋王甦民李传友宋长兴; 机构北京市结核病胸部肿瘤研究所北京结核病控制研究所; 出处《中国防痨杂志》 CAS 2009年第2期80-84,共5页; 文摘目的评价分枝杆菌散在重复单位(MIRU)分型方法在结核病流行病学上的应用,探讨该方法的应用前景。方法采用MIRU分型对158株结核分枝杆菌进行基因分型,这些菌株均已进行IS6110-RFLP分型。结果MIRU分型结果产生只需1d。158株结核分枝杆菌共产生105个类型,其中65个为独特类型。在MIRU的12个区中,重复区4、10、26、40具有较高的多态性。用Hunter-Gaston Index(HGI)对2种方法进行评价,IS6110-RFLP的分辨指数为99.4%,MIRU技术的分辨指数为97.8%。当IS6110拷贝数小于等于10个时,IS6110-RFLP的分辨指数为98%,MI-RU的分辨指数达到98.2%。结论MIRU分型方法具有快速、简便、分辨力较高的特点,便于普及,可在结核病分子流行病学研究中发挥重要作用。; 关键词分枝杆菌结核分枝杆菌散在重复单位 IS6110 RFLP; Keywords Mycobacterium tuberculosis MIRU IS6110, RFLP; 分类号 R450 [医药卫生—治疗学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名吉林省鹿源牛分枝杆菌MIRU分型研究: 3; 作者杨莉王春雨孟庆峰王海军刘金华王全凯; 机构吉林农业大学中药材学院吉林出入境检验检疫局吉林省中韩动物科学研究院; 出处《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第12期935-938,共4页; 基金国际科技合作与交流项目(2011DFA32900) 吉林省科技厅国际合作项目(20100718); 文摘为了解鹿源牛分枝杆菌(M.bovis)基因多态性,初步建立适合吉林省鹿源M.bovis的基因分型方法,本研究利用12个分枝杆菌散在重复单位(MIRU)位点,对96株鹿源M.bovis吉林分离株进行MIRU基因分型研究。结果显示,12个位点中有8个位点(MIRU2、4、16、23、27、31、39及40)具有多态性,可以将96株菌株分为11个基因型,分辨力指数(H)为0.893,其中6个中度多态性位点的分辨力为0.877。其余4个位点(MIRU10、20、24及26)未显示多态性。研究结果表明,鹿源M.bovis与其他宿主来源的M.bovis在基因分型上存在差异。MIRU位点对鹿源M.bovis具有良好的分辨力,该分型方法可以作为鹿结核病分子流行病学研究的有效方法。; 关键词鹿源牛分枝杆菌分枝杆菌散在重复单位基因分型流行病学; Keywords deer origined Mycobacterium bovis MIRU genotyping epidemiology; 分类号 S852.61 [农业科学—基础兽医学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名结核分枝杆菌Mtub-39位点多态性与下游基因表达关系的研究被引量：2: 4; 作者周爱萍徐志弘孙青姚玉峰吴兴福; 机构上海交通大学基础医学院病原生物学教研室西藏民族学院医学院苏州市第五人民医院检验科; 出处《上海交通大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2012年第11期1415-1420,共6页; 基金国家重点基础研究发展计划("九七三"计划)(2009CB522605) 国家自然科学基金(31200109)~~; 文摘目的分析结核分枝杆菌(MTB)北京型菌株及非北京型菌株5个有明显差异的MTB散在分布重复单位(MIRU)位点,研究其多态性与下游基因表达的关系。方法利用生物信息学方法预测5个MIRU位点(ETR-C、Mtub-30、Mtub-39、MIRU-27、MIRU-40)下游相邻基因启动子区域。通过PCR方法扩增该区域并与分枝杆菌启动子探针载体pMC210连接,重组质粒测序正确后,用电穿孔方法转化耻垢分枝杆菌mc2155。采用Real-Time PCR技术检测报告基因lacZ的转录水平,验证MIRU位点多态性对其下游基因表达的影响。结果 Mtub-39位点核心区域内含有其下游基因的启动子。成功构建了分别带有1、3、5个拷贝重复序列的Mtub-39位点的重组质粒。Real-Time PCR结果显示,有多态性的Mtub-39位点(pMC210-Mtub-39-N158、pMC210-Mtub-39-N139及pMC210-Mtub-39-N146)对报告基因lacZ的转录调控差异有统计学意义(P=0.006 5)。结论 Mtub-39位点的多态性能明显影响下游基因启动子的活性进而调节其表达。; 关键词结核分枝杆菌 MTB散在分布重复单位位点 pMC210 启动子; Keywords Mycobacterium tuberculosis mycobacterial interspersed repetitive units locus pMC210 promoter; 分类号 R378.911 [医药卫生—病原生物学] Q786 [生物学—分子生物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名某高级中学一起结核病聚集性疫情传播的时空序列与分子流行病学分析被引量：3: 5; 作者陈蕊明林健雄陈壮濠刘苏洋符慧; 机构汕头市结核病防治所汕头大学公共卫生学院; 出处《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2023年第11期1369-1375,共7页; 基金汕头市医疗卫生科技计划项目(编号:201815519号)。; 文摘目的探讨本起学校结核病聚集性疫情传播的原因、特点和规律,为持续改进学校结核病控制策略的有效实施提供科学依据。方法遵照广东省汕头市卫生健康局对本起疫情处置工作的具体要求,以指示病例为中心、以学习生活空间要素为重点、以人际交往活动要素为辅助进行密切接触者筛查,对纳入者进行结核病可疑症状检查、X线胸部检查和结核菌素(PPD)皮肤试验;对其中任何1项异常者进行IFN-γ释放试验、CT影像检查、痰涂片抗酸染色检查、分枝杆菌培养与菌种鉴定和Xpert MTB/RIF分子检测,以综合诊断结核病例;对分离培养获得的结核分枝杆菌,分析其ETRA、ETRB、ETRC、ETRE、ETRF、MIRU10、MIRU20、MIRU26、MIRU39、MIRU40、Mtub04、Mtub21、Mtub38、Oub11b、Qub26等15个基因位点的串联重复拷贝数,分析其成簇性以判断病例间的传播关系。结果(1)指示病例首次结核可疑症状出现并一直在校学习5个月后,出现双肺上叶斑片状、斑点状、条索状密度增高影和左肺上叶多发空洞(最大者约2.1 cm×1.7 cm)等病变,培养与分子检测阳性;(2)指示病例发现的3个月内,在该校相继发现其他15例学生肺结核患者,其中3例有临床症状、3例痰涂片镜检可疑阳性、9例培养阳性、7例分子检测阳性,10例与指示病例有同班上课、同舍住宿和同室晚自习等空间性密切接触,4例与指示病例有直接或间接的人际密切交往,1例则未找到明确的密切交往线索;(3)对9例患者分离培养的结核分枝杆菌进行基因分型,8例得到成功结果,15个VNTR-MIRU分型位点的拷贝数模式完全相同;(4)依据PPD皮肤试验≥5 mm判断结核感染,409例受检者中252例阳性,潜伏感染率为61.61%,潜伏感染率在指示病例班级与后续发现病例班级学生间差异有统计学意义(100%vs.56.58%,χ^(2)=30.781,P<0.001),而在男-女、学生-教职工、寄宿生-走读生、不同楼层学生、同层同侧-同层对侧学生等多组人群间则差异无统计学意义(P>0.05)。结论该起结核聚集性疫情为同一传染源传播所致,且导致了远高于一般人群的结核潜伏感染率,学校结核病控制管理缺失为其主要原因,强化学校结核病控制措施的有效执行力刻不容缓。; 关键词结核学校聚集性疫情数目可变串联重复序列-结核分枝杆菌散在重复单位; Keywords tuberculosis school,clustered epidemic,variable number tandem repeat-Mycobacterial in-terspersed repetitive unit; 分类号 R52 [医药卫生—内科学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	基于常规引物靶向结核分枝杆菌Ⅱ型分枝杆菌散在重复单位的恒温扩增	吴康屈蓉王刚薛清华吕建新 Douglas BLowrie 范小勇	《复旦学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心	2020	0	在线阅读下载PDF 职称材料
2	分枝杆菌散在重复单位对结核分枝杆菌分型的研究	郭艳玲刘洋王甦民李传友宋长兴	《中国防痨杂志》 CAS	2009	2	在线阅读下载PDF 职称材料
3	吉林省鹿源牛分枝杆菌MIRU分型研究	杨莉王春雨孟庆峰王海军刘金华王全凯	《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心	2014	0	在线阅读下载PDF 职称材料
4	结核分枝杆菌Mtub-39位点多态性与下游基因表达关系的研究	周爱萍徐志弘孙青姚玉峰吴兴福	《上海交通大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心	2012	2	在线阅读下载PDF 职称材料
5	某高级中学一起结核病聚集性疫情传播的时空序列与分子流行病学分析	陈蕊明林健雄陈壮濠刘苏洋符慧	《实用医学杂志》 CAS 北大核心	2023	3	在线阅读下载PDF 职称材料