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Ⅰ类新城疫病毒NDV08-004株微型基因组的构建及其功能鉴定
被引量:
1
1
作者
陈云霞
管峰
+4 位作者
赵云玲
郑东霞
张维
刘华雷
王志亮
《中国动物检疫》
CAS
2011年第9期27-31,共5页
目的本研究旨在构建Ⅰ类新城疫病毒NDV08-004的微型基因组和辅助质粒,为构建病毒拯救体系奠定基础。方法根据Ⅰ类新城疫病毒NDV08-004的全基因组序列,采用SOE方法将增强绿色荧光蛋白基因(eGFP)插入NDV08-004的3’-Leader和5’-Trailer...
目的本研究旨在构建Ⅰ类新城疫病毒NDV08-004的微型基因组和辅助质粒,为构建病毒拯救体系奠定基础。方法根据Ⅰ类新城疫病毒NDV08-004的全基因组序列,采用SOE方法将增强绿色荧光蛋白基因(eGFP)插入NDV08-004的3’-Leader和5’-Trailer区域之间后反向插入转录载体pOLTV5中,构建了NDV08-004的微型基因组pLGT-03。将pLGT-03转染辅助病毒NDV08-004感染的表达T7RNA聚合酶BSRT7/5细胞进行功能鉴定。采用RT-PCR将NDV08-004的NP、P和L蛋白基因亚克隆入表达载体pCI-neo中,分别构建了三个辅助质粒pCI-NP、pCI-P、pCI-L。通过构建的微型基因组pLGT-03和三个辅助质粒按照一定的比例共转染BSRT7/5细胞来验证辅助质粒的功能。结果微型基因组pLGT-03转染辅助病毒感染的BSRT7/5细胞后可见明显荧光,表明微型基因组构建成功。微型基因组和辅助质粒共转染可见荧光表达,表明三个辅助质粒均具有相应的功能。结论表明微型基因组和辅助质粒均具有相应的功能,为建立NDV08-004的反向遗传操作平台奠定了基础。
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关键词
ⅰ类新城疫病毒
辅助性质粒
微型基因组
病毒
拯救
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职称材料
4株新出现的Ⅰ类新城疫病毒F基因的变异分析
2
作者
魏润宇
罗瑶瑶
+6 位作者
吕艳
王静静
郑东霞
赵云玲
刘文博
刘华雷
王志亮
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第8期1781-1788,共8页
为了分析我国新出现的Ⅰ类新城疫病毒的分布和分子特性,对2016年分离到的4株Ⅰ类新城疫病毒进行F基因序列分析和遗传进化分析。结果显示:4株Ⅰ类新城疫病毒F基因编码长度均为1 662nt,共编码553个氨基酸,分离株之间氨基酸相似性为97.9%~1...
为了分析我国新出现的Ⅰ类新城疫病毒的分布和分子特性,对2016年分离到的4株Ⅰ类新城疫病毒进行F基因序列分析和遗传进化分析。结果显示:4株Ⅰ类新城疫病毒F基因编码长度均为1 662nt,共编码553个氨基酸,分离株之间氨基酸相似性为97.9%~100%。4株分离株F蛋白裂解位点的氨基酸组成均为112 ERQERL117,符合新城疫病毒弱毒株的分子特征。F基因高变区(47—420nt)遗传进化分析结果显示这4株病毒为国内新出现的基因型,利用F基因编码区全长序列构建系统进化树显示4株病毒属于基因1c亚型,与北美分离株高度同源,而与国内基因1c亚型分离株(Duck/Guangxi/1261/2015)相似性仅为95.5%~97%。监测数据表明这种新出现的Ⅰ类新城疫病毒具有在国内进一步流行和扩散的风险。
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关键词
ⅰ类新城疫病毒
分子特征
遗传进化分析
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职称材料
2016—2019年我国Ⅰ类新城疫病原学监测与遗传进化分析
被引量:
9
3
作者
王静静
于晓慧
+3 位作者
蒋文明
李阳
刘华雷
王志亮
《中国动物检疫》
CAS
2020年第11期1-5,共5页
为掌握我国Ⅰ类新城疫病毒(Newcastle disease virus,NDV)的分布及分子演化特征,2016—2019年,随机从国内23个省(自治区、直辖市)998个采样点,采集家禽口咽/泄殖腔双拭子样本、野鸟粪便样本和环境样本共45 458份,通过病毒分离和RT-PCR鉴...
为掌握我国Ⅰ类新城疫病毒(Newcastle disease virus,NDV)的分布及分子演化特征,2016—2019年,随机从国内23个省(自治区、直辖市)998个采样点,采集家禽口咽/泄殖腔双拭子样本、野鸟粪便样本和环境样本共45 458份,通过病毒分离和RT-PCR鉴定,共分离到Ⅰ类NDV 558株。从时间分布看,2016—2019年Ⅰ类NDV分离率分别为0.95%、0.89%、1.88%和1.37%,有增高趋势;从地理分布看,我国16个省(自治区、直辖市)分离到Ⅰ类NDV,主要集中于华东、西南和西北地区;从场点分布看,活禽批发市场和农贸市场的Ⅰ类NDV阳性率明显高于养殖场和屠宰场;从宿主分布看,Ⅰ类NDV主要来源于鸡和鸭,少量来自鹅、鸽和环境样本;从基因型分布看,558株Ⅰ类NDV属于2个基因亚型,其中1.1.2亚型为近年来我国流行的主要基因亚型。研究表明,我国Ⅰ类NDV污染面广,宿主范围广泛,且存在2种基因亚型。研究提示,应加强Ⅰ类NDV的免疫、监测,同时加强饲养管理,提高家禽抵抗力,降低病毒基因变异致毒力增强的风险。本研究为我国科学防控新城疫提供了参考数据。
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关键词
ⅰ类新城疫病毒
病毒
分离
遗传进化分析
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职称材料
题名
Ⅰ类新城疫病毒NDV08-004株微型基因组的构建及其功能鉴定
被引量:
1
1
作者
陈云霞
管峰
赵云玲
郑东霞
张维
刘华雷
王志亮
机构
中国动物卫生与流行病学中心
广西大学动物科学学院
出处
《中国动物检疫》
CAS
2011年第9期27-31,共5页
基金
国家自然科学基金(30901079)
文摘
目的本研究旨在构建Ⅰ类新城疫病毒NDV08-004的微型基因组和辅助质粒,为构建病毒拯救体系奠定基础。方法根据Ⅰ类新城疫病毒NDV08-004的全基因组序列,采用SOE方法将增强绿色荧光蛋白基因(eGFP)插入NDV08-004的3’-Leader和5’-Trailer区域之间后反向插入转录载体pOLTV5中,构建了NDV08-004的微型基因组pLGT-03。将pLGT-03转染辅助病毒NDV08-004感染的表达T7RNA聚合酶BSRT7/5细胞进行功能鉴定。采用RT-PCR将NDV08-004的NP、P和L蛋白基因亚克隆入表达载体pCI-neo中,分别构建了三个辅助质粒pCI-NP、pCI-P、pCI-L。通过构建的微型基因组pLGT-03和三个辅助质粒按照一定的比例共转染BSRT7/5细胞来验证辅助质粒的功能。结果微型基因组pLGT-03转染辅助病毒感染的BSRT7/5细胞后可见明显荧光,表明微型基因组构建成功。微型基因组和辅助质粒共转染可见荧光表达,表明三个辅助质粒均具有相应的功能。结论表明微型基因组和辅助质粒均具有相应的功能,为建立NDV08-004的反向遗传操作平台奠定了基础。
关键词
ⅰ类新城疫病毒
辅助性质粒
微型基因组
病毒
拯救
Keywords
Newcastle disease virus (NDV)
class I
help-plasmid
mini-genome
rescue of virus
分类号
S852.659.5 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
4株新出现的Ⅰ类新城疫病毒F基因的变异分析
2
作者
魏润宇
罗瑶瑶
吕艳
王静静
郑东霞
赵云玲
刘文博
刘华雷
王志亮
机构
扬州大学兽医学院
中国动物卫生与流行病中心
江苏高校动物重要疫病与人畜共患病防控协同创新中心
青岛农业大学
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第8期1781-1788,共8页
基金
国家重点研发计划(2016YFD0500800)
公益性行业(农业)科研专项(201303033)
江苏高校优势学科建设工程资助项目(PAPD)
文摘
为了分析我国新出现的Ⅰ类新城疫病毒的分布和分子特性,对2016年分离到的4株Ⅰ类新城疫病毒进行F基因序列分析和遗传进化分析。结果显示:4株Ⅰ类新城疫病毒F基因编码长度均为1 662nt,共编码553个氨基酸,分离株之间氨基酸相似性为97.9%~100%。4株分离株F蛋白裂解位点的氨基酸组成均为112 ERQERL117,符合新城疫病毒弱毒株的分子特征。F基因高变区(47—420nt)遗传进化分析结果显示这4株病毒为国内新出现的基因型,利用F基因编码区全长序列构建系统进化树显示4株病毒属于基因1c亚型,与北美分离株高度同源,而与国内基因1c亚型分离株(Duck/Guangxi/1261/2015)相似性仅为95.5%~97%。监测数据表明这种新出现的Ⅰ类新城疫病毒具有在国内进一步流行和扩散的风险。
关键词
ⅰ类新城疫病毒
分子特征
遗传进化分析
Keywords
Class I Newcastle disease virus
molecular characteristics
phylogenetic analysis
分类号
S852.659.5 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
2016—2019年我国Ⅰ类新城疫病原学监测与遗传进化分析
被引量:
9
3
作者
王静静
于晓慧
蒋文明
李阳
刘华雷
王志亮
机构
中国动物卫生与流行病学中心
出处
《中国动物检疫》
CAS
2020年第11期1-5,共5页
基金
国家重点研发计划项目(2016YFD0500800)。
文摘
为掌握我国Ⅰ类新城疫病毒(Newcastle disease virus,NDV)的分布及分子演化特征,2016—2019年,随机从国内23个省(自治区、直辖市)998个采样点,采集家禽口咽/泄殖腔双拭子样本、野鸟粪便样本和环境样本共45 458份,通过病毒分离和RT-PCR鉴定,共分离到Ⅰ类NDV 558株。从时间分布看,2016—2019年Ⅰ类NDV分离率分别为0.95%、0.89%、1.88%和1.37%,有增高趋势;从地理分布看,我国16个省(自治区、直辖市)分离到Ⅰ类NDV,主要集中于华东、西南和西北地区;从场点分布看,活禽批发市场和农贸市场的Ⅰ类NDV阳性率明显高于养殖场和屠宰场;从宿主分布看,Ⅰ类NDV主要来源于鸡和鸭,少量来自鹅、鸽和环境样本;从基因型分布看,558株Ⅰ类NDV属于2个基因亚型,其中1.1.2亚型为近年来我国流行的主要基因亚型。研究表明,我国Ⅰ类NDV污染面广,宿主范围广泛,且存在2种基因亚型。研究提示,应加强Ⅰ类NDV的免疫、监测,同时加强饲养管理,提高家禽抵抗力,降低病毒基因变异致毒力增强的风险。本研究为我国科学防控新城疫提供了参考数据。
关键词
ⅰ类新城疫病毒
病毒
分离
遗传进化分析
Keywords
class
ⅰ
NDV
virus isolation
phylogenetic analysis
分类号
S852.65 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
Ⅰ类新城疫病毒NDV08-004株微型基因组的构建及其功能鉴定
陈云霞
管峰
赵云玲
郑东霞
张维
刘华雷
王志亮
《中国动物检疫》
CAS
2011
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
4株新出现的Ⅰ类新城疫病毒F基因的变异分析
魏润宇
罗瑶瑶
吕艳
王静静
郑东霞
赵云玲
刘文博
刘华雷
王志亮
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
2016—2019年我国Ⅰ类新城疫病原学监测与遗传进化分析
王静静
于晓慧
蒋文明
李阳
刘华雷
王志亮
《中国动物检疫》
CAS
2020
9
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