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长期保护性耕作对纤维素降解基因cbh Ⅰ多样性的影响
被引量:
5
1
作者
陈坤
李传海
+3 位作者
朱安宁
彭文涛
钱明媚
曹慧
《土壤学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第2期406-414,共9页
研究了免耕秸秆覆盖(CntWntS)、耕作秸秆覆盖(CntWtS)、免耕秸秆不覆盖(CntWnt)和耕作秸秆不覆盖(CntWt)四种保护性耕作措施对黄淮海平原典型潮土中纤维素降解菌多样性的影响。采用PCRRFLP技术分别对纤维素降解菌cbh I基因进行...
研究了免耕秸秆覆盖(CntWntS)、耕作秸秆覆盖(CntWtS)、免耕秸秆不覆盖(CntWnt)和耕作秸秆不覆盖(CntWt)四种保护性耕作措施对黄淮海平原典型潮土中纤维素降解菌多样性的影响。采用PCRRFLP技术分别对纤维素降解菌cbh I基因进行多样性分析。结果表明,CntWntS与CntWnt相比,纤维素降解菌的数量增加了148%,而CntWtS与CntWt相比,纤维素降解菌的数量也增加了130%。纤维素降解菌cbh I基因分型在四个处理小区比较丰富,共有44个OTUs,其中CntWntS、CntWtS、CntWnt、CntWt处理中分别有35、34、30、30个OTUs。多样性指数分析显示,Shannon-Wiener指数的数值范围为3.09~3.36。系统发育分析表明,文库中的纤维素降解菌分别属于Basidiomycota(担子菌门)和Ascomycota(子囊菌门),同时发现土壤中存在大量的未培养纤维素降解菌。因此,免耕和秸秆覆盖等保护性耕作能够明显提高土壤中纤维素降解菌数量和cbh I基因多样性。
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关键词
保护性耕作
纤维素降解菌
cbh
ⅰ
基因
多样性
PCR-RFLP分析
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职称材料
中国耐力运动员线粒体DNA高变区I多样性及其与其他人群的比较研究
被引量:
4
2
作者
常芸
于长隆
+2 位作者
刘爱杰
高晓嶙
胡水清
《中国运动医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2004年第4期363-366,共4页
为了探讨人类运动能力的相关基因标记与分子遗传学机制 ,选取汉族耐力运动员 61人 ,相应汉人对照 63人 ,对其线粒体基因高变区I(mtDNAHVRⅠ )特异性片段进行扩增、测序 ,评估其单倍型、多样性及偶合概率 ,并与其他人群进行比较研究。结...
为了探讨人类运动能力的相关基因标记与分子遗传学机制 ,选取汉族耐力运动员 61人 ,相应汉人对照 63人 ,对其线粒体基因高变区I(mtDNAHVRⅠ )特异性片段进行扩增、测序 ,评估其单倍型、多样性及偶合概率 ,并与其他人群进行比较研究。结果显示 :中国汉族耐力运动员中有60个单倍型 ,汉人对照有 61个单倍型。中国汉族耐力运动员mtDNA多样性高达 99 95 % ,汉人对照mtDNA基因多样性也达 99 90 % ,二组无关个体间偶合概率均很小 ,经卡方检验上述各参数与频率在汉族耐力运动员和汉人对照两组间的分布无显著性差异 (P >0 0 5 )。与西班牙人、中国台湾人及俄罗斯人等不同人群比较发现 ,mtDNA多样性的差异存在于群体内个体间 ,而群体间的差异较小。结果提示 ,汉族耐力运动员mtDNAHVRⅠ多样性非常高 ,且每个个体间mtDNA单倍型差异很大 ;不同人群mtDNA多样性的差异存在于群体内个体间 ,而群体间的差异较小。
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关键词
中国
耐力运动员
线粒体DNA
高变区
ⅰ多样性
MTDNA
HVR
ⅰ
基因
多样性
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职称材料
紫贻贝野生群体与养殖群体线粒体COⅠ基因的遗传比较分析
被引量:
2
3
作者
庞宇杰
李继姬
郭宝英
《安徽农业科学》
CAS
2012年第14期8068-8070,共3页
[目的]比较紫贻贝野生群体与养殖群体线粒体COⅠ基因的遗传多样性,为其种质资源筛选提供理论依据。[方法]采集山东省乳山市野生紫贻贝(Mytilus edulis Linnaeus)和养殖紫贻贝各12个样本;通过设计特异性引物,采用PCR技术对24个个体的mtDN...
[目的]比较紫贻贝野生群体与养殖群体线粒体COⅠ基因的遗传多样性,为其种质资源筛选提供理论依据。[方法]采集山东省乳山市野生紫贻贝(Mytilus edulis Linnaeus)和养殖紫贻贝各12个样本;通过设计特异性引物,采用PCR技术对24个个体的mtDNA COⅠ序列进行了扩增,测序得到的序列总碱基数为706 bp;采用MEGA(Version 4.0)和DnaSP(Version 4.0)软件对序列进行了分析。[结果]24条序列中T、C、A和G碱基平均含量分别为34.6%、16.7%、25.9%和22.8%,其中A+T的含量(60.5%)显著高于G+C含量(39.5%),表现了明显的碱基偏倚。24个个体表现为18种单倍型,包括568个多态位点,单倍型间平均遗传距离为0.683,单倍型多态性(h)为0.953,核苷酸多态性(π)值为0.317 69。[结论]紫贻贝的遗传多样性水平较高,且乳山养殖群体和野生群体无遗传分化。
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关键词
紫贻贝
CO
ⅰ
遗传
多样性
遗传结构
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职称材料
题名
长期保护性耕作对纤维素降解基因cbh Ⅰ多样性的影响
被引量:
5
1
作者
陈坤
李传海
朱安宁
彭文涛
钱明媚
曹慧
机构
南京农业大学农业部农业环境微生物工程重点实验室
封丘农田生态系统国家试验站土壤与农业可持续发展国家重点实验室(中国科学院南京土壤研究所)
出处
《土壤学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第2期406-414,共9页
基金
国家重点基础研究发展计划项目(2011CB100504)
国家自然科学基金项目(42371262
41471239)资助
文摘
研究了免耕秸秆覆盖(CntWntS)、耕作秸秆覆盖(CntWtS)、免耕秸秆不覆盖(CntWnt)和耕作秸秆不覆盖(CntWt)四种保护性耕作措施对黄淮海平原典型潮土中纤维素降解菌多样性的影响。采用PCRRFLP技术分别对纤维素降解菌cbh I基因进行多样性分析。结果表明,CntWntS与CntWnt相比,纤维素降解菌的数量增加了148%,而CntWtS与CntWt相比,纤维素降解菌的数量也增加了130%。纤维素降解菌cbh I基因分型在四个处理小区比较丰富,共有44个OTUs,其中CntWntS、CntWtS、CntWnt、CntWt处理中分别有35、34、30、30个OTUs。多样性指数分析显示,Shannon-Wiener指数的数值范围为3.09~3.36。系统发育分析表明,文库中的纤维素降解菌分别属于Basidiomycota(担子菌门)和Ascomycota(子囊菌门),同时发现土壤中存在大量的未培养纤维素降解菌。因此,免耕和秸秆覆盖等保护性耕作能够明显提高土壤中纤维素降解菌数量和cbh I基因多样性。
关键词
保护性耕作
纤维素降解菌
cbh
ⅰ
基因
多样性
PCR-RFLP分析
Keywords
Conservation tillage
Cellulose degradation bacteria
The diversity of cbh 1 gene
PCR-RFLP
分类号
Q938.1 [生物学—微生物学]
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职称材料
题名
中国耐力运动员线粒体DNA高变区I多样性及其与其他人群的比较研究
被引量:
4
2
作者
常芸
于长隆
刘爱杰
高晓嶙
胡水清
机构
国家体育总局体育科学研究所
北京大学运动医学研究所
国家皮划艇队
出处
《中国运动医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2004年第4期363-366,共4页
基金
国家自然科学基金资助项目
No .3 0 2 70 640
文摘
为了探讨人类运动能力的相关基因标记与分子遗传学机制 ,选取汉族耐力运动员 61人 ,相应汉人对照 63人 ,对其线粒体基因高变区I(mtDNAHVRⅠ )特异性片段进行扩增、测序 ,评估其单倍型、多样性及偶合概率 ,并与其他人群进行比较研究。结果显示 :中国汉族耐力运动员中有60个单倍型 ,汉人对照有 61个单倍型。中国汉族耐力运动员mtDNA多样性高达 99 95 % ,汉人对照mtDNA基因多样性也达 99 90 % ,二组无关个体间偶合概率均很小 ,经卡方检验上述各参数与频率在汉族耐力运动员和汉人对照两组间的分布无显著性差异 (P >0 0 5 )。与西班牙人、中国台湾人及俄罗斯人等不同人群比较发现 ,mtDNA多样性的差异存在于群体内个体间 ,而群体间的差异较小。结果提示 ,汉族耐力运动员mtDNAHVRⅠ多样性非常高 ,且每个个体间mtDNA单倍型差异很大 ;不同人群mtDNA多样性的差异存在于群体内个体间 ,而群体间的差异较小。
关键词
中国
耐力运动员
线粒体DNA
高变区
ⅰ多样性
MTDNA
HVR
ⅰ
基因
多样性
Keywords
Chinese endurance athletes,mtDNA HVR
ⅰ
,haplotype,genetic diversity, coincident probability.
分类号
R87 [医药卫生—运动医学]
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职称材料
题名
紫贻贝野生群体与养殖群体线粒体COⅠ基因的遗传比较分析
被引量:
2
3
作者
庞宇杰
李继姬
郭宝英
机构
浙江海洋学院海洋科学学院国家海洋设施养殖工程技术研究中心
出处
《安徽农业科学》
CAS
2012年第14期8068-8070,共3页
基金
国家海洋公益性行业科研专项(201005013)
国家国际科技合作项目(2010DFA22770)
海洋渔业科学与技术浙江省重中之重学科开放课题(20110218)
文摘
[目的]比较紫贻贝野生群体与养殖群体线粒体COⅠ基因的遗传多样性,为其种质资源筛选提供理论依据。[方法]采集山东省乳山市野生紫贻贝(Mytilus edulis Linnaeus)和养殖紫贻贝各12个样本;通过设计特异性引物,采用PCR技术对24个个体的mtDNA COⅠ序列进行了扩增,测序得到的序列总碱基数为706 bp;采用MEGA(Version 4.0)和DnaSP(Version 4.0)软件对序列进行了分析。[结果]24条序列中T、C、A和G碱基平均含量分别为34.6%、16.7%、25.9%和22.8%,其中A+T的含量(60.5%)显著高于G+C含量(39.5%),表现了明显的碱基偏倚。24个个体表现为18种单倍型,包括568个多态位点,单倍型间平均遗传距离为0.683,单倍型多态性(h)为0.953,核苷酸多态性(π)值为0.317 69。[结论]紫贻贝的遗传多样性水平较高,且乳山养殖群体和野生群体无遗传分化。
关键词
紫贻贝
CO
ⅰ
遗传
多样性
遗传结构
Keywords
Mytilus edulis
CO
ⅰ
Genetic diversity
Genetic structure
分类号
S944.4 [农业科学—水产养殖]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
长期保护性耕作对纤维素降解基因cbh Ⅰ多样性的影响
陈坤
李传海
朱安宁
彭文涛
钱明媚
曹慧
《土壤学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015
5
在线阅读
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职称材料
2
中国耐力运动员线粒体DNA高变区I多样性及其与其他人群的比较研究
常芸
于长隆
刘爱杰
高晓嶙
胡水清
《中国运动医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2004
4
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
紫贻贝野生群体与养殖群体线粒体COⅠ基因的遗传比较分析
庞宇杰
李继姬
郭宝英
《安徽农业科学》
CAS
2012
2
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职称材料
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