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基于Annotation的Spring AOP系统设计 被引量:7
1
作者 刘荣辉 薛冰 《计算机应用与软件》 CSCD 2009年第9期18-20,共3页
简要介绍AOP(Aspect Oriented Programming)技术和Annotation技术,讨论了Spring中的AOP的两种实现。通过同一个案例阐述了在Spring中通过XML配置来实现AOP和使用了Annotation在Spring中实现AOP,比较了两种实现方式的优缺点。对在Spring... 简要介绍AOP(Aspect Oriented Programming)技术和Annotation技术,讨论了Spring中的AOP的两种实现。通过同一个案例阐述了在Spring中通过XML配置来实现AOP和使用了Annotation在Spring中实现AOP,比较了两种实现方式的优缺点。对在Spring使用Annotation实现AOP作了总结,从而体现了Annotation在设计系统时其简洁性和良好的扩展性。 展开更多
关键词 SPRING XML AOP annotation
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一种基于.NET Services的标注系统框架“MyAnnotation.NET”
2
作者 谢波 申瑞民 王加俊 《计算机工程》 CAS CSCD 北大核心 2003年第16期179-181,共3页
“MyAnnotation.NET”是一种自动收集、管理、检索和共享个人信息的标准的开放的与操作系统和具体应用无关的通用标注框架 (Annotation Framework),它以.NET Services的形式提供标准化、模块化的网络服务(Web Service)。该文介绍了... “MyAnnotation.NET”是一种自动收集、管理、检索和共享个人信息的标准的开放的与操作系统和具体应用无关的通用标注框架 (Annotation Framework),它以.NET Services的形式提供标准化、模块化的网络服务(Web Service)。该文介绍了它的体系架构、核心算法以及一个e-Learning领域的实施案例。 展开更多
关键词 标注榧架 .NET SERVICES SDT VITERBI TFIDF
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A Hierarchical Image Annotation Method Based on SVM and Semi-supervised EM 被引量:8
3
作者 GAO Yan-Yu YIN Yi-Xin UOZUMI Takashi 《自动化学报》 EI CSCD 北大核心 2010年第7期960-967,共8页
关键词 数字图像 自动化系统 准确性 意义 图像标注
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Global Annotation of Small RNA and MicroRNA Mature Sequences from Developing Ovules of Gossypium hirsutum L.
4
作者 ABDURAKHMONOV Ibrokhim Y DEVOR Eric J BURIEV Zabardast T MAKAMOV Abdusalom SHERMATOV Shukhrat E ABDUKARIMOV Abdusattor 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2008年第S1期11-,共1页
The involvement of small RNAs in cotton fiber development is under explored.The objective of this work was to directly clone,annotate,and analyze small RNAs of developing ovules to reveal
关键词 Global annotation of Small RNA and MicroRNA Mature Sequences from Developing Ovules of Gossypium hirsutum L RNA
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Cloning,Characterization,and Gene Annotation of Cellulose Synthase Genes from Arabidopsis thaliana
5
作者 BALASUBRAMANI G AMUDHA J KATEGERI I S KHADI B M 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2008年第S1期50-,共1页
The mechanistic basis of cellulose biosynthesis in plants has gained ground during last decade or so.The isolation of plant cDNA clones encoding cotton homologs of the bacterial cellulose
关键词 Cloning Characterization and Gene annotation of Cellulose Synthase Genes from Arabidopsis thaliana
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1株猪源动物联合乳杆菌S7全基因组测序及生物信息学分析
6
作者 刘辉 季海峰 +2 位作者 王四新 陈美霞 张董燕 《中国畜牧兽医》 北大核心 2025年第1期25-38,共14页
[目的]旨在对1株具有较强耐酸耐胆盐特性的猪源动物联合乳杆菌S7进行全基因组测序及生物信息学分析。[方法]结合三代PacBio RSⅡ和二代Illumina HiSeq 2000测序技术对动物联合乳杆菌S7进行了全基因组测序,在此基础上使用GO、EggNOG、KEG... [目的]旨在对1株具有较强耐酸耐胆盐特性的猪源动物联合乳杆菌S7进行全基因组测序及生物信息学分析。[方法]结合三代PacBio RSⅡ和二代Illumina HiSeq 2000测序技术对动物联合乳杆菌S7进行了全基因组测序,在此基础上使用GO、EggNOG、KEGG、CAZy、VFDB和CARD等数据库注释功能基因,利用TYGS(Type Strain Genome Server)构建系统发育树,并与2株同源模式菌株进行了共线性分析。[结果]动物联合乳杆菌S7的基因组大小为2.03 Mb, GC含量为44.14%,共预测到1 993个编码基因,包含65个tRNA、19个rRNA、35个sRNA、29个持家基因、11个基因组岛、6个前噬菌体、4个CRISPR-Cas、8个插入序列和10个转座子;分别有1 521、1 567、1 185和60个基因在GO、EggNOG、KEGG和CAZy数据库中得到注释;在VFDB和CARD数据库中注释到181个毒力基因和110个耐药基因;另外有14个基因参与耐酸,2个基因参与耐胆盐,22个基因参与黏附和聚集;基因组中还包括与温度应激、氧化应激和细菌素合成等多种与益生功能相关的基因。系统发育树和共线性分析发现,该菌株与模式菌株Ligilactobacillus animalis P38的进化关系最近。[结论]动物联合乳杆菌S7基因组中具有与耐酸、耐胆盐、黏附和聚集、温度应激、氧化应激和细菌素等相关的功能基因,可为菌株在饲料添加剂中的科学应用提供理论依据。 展开更多
关键词 动物联合乳杆菌 全基因组测序 基因注释
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茶银尺蠖触角转录组及相关嗅觉基因的分析
7
作者 张方梅 尤伟晨 +5 位作者 郭世保 陈俊华 史洪中 耿书宝 周洲 乔利 《环境昆虫学报》 北大核心 2025年第2期504-514,共11页
本研究利用IIIumina Hiseq 4000高通量测序平台对茶银尺蠖Scopula subpunctaria(Herrich-Schaeffer)雌雄成虫触角进行转录组测序,共获得93335条unigenes,N50长度为1151 bp。通过基因功能注释,有23581条unigenes注释到六大公共数据库中,... 本研究利用IIIumina Hiseq 4000高通量测序平台对茶银尺蠖Scopula subpunctaria(Herrich-Schaeffer)雌雄成虫触角进行转录组测序,共获得93335条unigenes,N50长度为1151 bp。通过基因功能注释,有23581条unigenes注释到六大公共数据库中,其中注释到NR数据库的unigenes最多,占39.96%,且与家蚕Bombyx mori相似基因数目最多,占20.32%;10718条unigenes注释到GO数据库的生物过程、细胞组分和分子功能3个大类46个亚类;5464条unigenes注释到KEGG数据库的38个小类代谢通路,其中注释在信号传导通路的unigenes最多,占10.64%。根据注释信息,共筛选得到60个候选嗅觉基因,包含17个气味结合蛋白基因(Odorant binding protein genes,OBPs)、13个化学感受蛋白基因(Chemosensory protein genes,CSPs)、14个嗅觉受体基因(Olfactory receptor genes,ORs)、13个离子型受体基因(Ionotropic receptor genes,IRs)和3个感觉神经膜蛋白基因(Sensory neuron membrane protein genes,SNMPs)。利用FPKM值对SsubOBPs和SsubCSPs基因进行表达量分析发现,SsubOBP2和SsubOBP3在茶银尺蠖雌雄成虫触角中均高丰度表达(FPKM>2000),SsubCSP4、SsubCSP7和SsubCSP9在茶银尺蠖雌雄成虫触角中均高丰度表达(FPKM>900)。本研究首次获得了茶银尺蠖触角转录组数据,并鉴定出候选嗅觉相关基因,结果为进一步研究茶银尺蠖的嗅觉感受机制提供分子基础。 展开更多
关键词 茶银尺蠖 触角转录组 嗅觉相关蛋白 基因注释
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亡佚的经典:试论《苍颉篇》的经典化及经典地位
8
作者 白军鹏 《东北师大学报(哲学社会科学版)》 北大核心 2025年第1期99-106,共8页
《苍颉篇》的经典地位问题以往学者均未论及,它是秦代“书同文”政策的产物,也是这一活动的重要组成,在文字编排及结构两个方面都深刻地影响了《说文解字》的编纂。在汉代,《苍颉篇》不仅与入仕息息相关,从同墓葬的伴出文献可推知它也... 《苍颉篇》的经典地位问题以往学者均未论及,它是秦代“书同文”政策的产物,也是这一活动的重要组成,在文字编排及结构两个方面都深刻地影响了《说文解字》的编纂。在汉代,《苍颉篇》不仅与入仕息息相关,从同墓葬的伴出文献可推知它也是深受贵族重视的典籍,尤其值得重视的是它对汉代辞赋家产生过重要影响。通过官方所组织的两次文字会议均以之为核心来看,除表明《苍颉篇》的特殊地位,还可知其与古文经学有重要的关联。经过扬雄、杜林、张揖、郭璞等的注释工作后,《苍颉篇》的身份在南北朝隋唐时期发生了转换,它开始成为学者注释古书的重要参考。本文所论也提示我们应该重新审视对虽已亡佚却在历史上产生过深远影响的古书的评价。 展开更多
关键词 《苍颉篇》 经典 文本 注释
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建筑内基于虚拟仿真的跨视域行人监测研究
9
作者 陶振翔 李滢 +3 位作者 黄绪勃 王一森 张平 杨锐 《中国安全科学学报》 北大核心 2025年第5期161-168,共8页
为解决高层建筑楼宇或复杂开放建筑环境中多路视频数据采集成本高、长时间高质量标注难等问题,实现跨视域多路视频数据的生成与行人图像的自动标注,首先,设计虚拟现实场景,模拟行人运动并自动获取标记数据;其次,研究无监督领域自适应方... 为解决高层建筑楼宇或复杂开放建筑环境中多路视频数据采集成本高、长时间高质量标注难等问题,实现跨视域多路视频数据的生成与行人图像的自动标注,首先,设计虚拟现实场景,模拟行人运动并自动获取标记数据;其次,研究无监督领域自适应方法,降低源域数据与目标域数据的特征分布差异,使模型泛化至目标建筑场景;最后,验证模型泛化能力。研究结果表明:构建的虚拟现实场景能有效克服跨视域视频数据采集与高质量标注的困难;无监督领域自适应方法将平均首位命中率从22.02%提升至45.48%;结合源域风格转换、数据增广和目标域伪标签生成,首位命中率提升20%,降低了分布偏差,有助于实现模型在不同建筑场景中的泛化。 展开更多
关键词 建筑场景 虚拟仿真 跨视域 行人运动 自动标注
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多粘类芽胞杆菌T-9全基因组测序及生物信息分析
10
作者 王金昌 《中国生物防治学报》 北大核心 2025年第4期836-850,共15页
多粘类芽胞杆菌Paenibacillus polymyxa T-9对尖孢镰刀菌黄瓜专化型Fusarium oxysporum f.sp.cucumerinum等植物病原菌有较强抑制作用,为研究其抑菌机制,采用第二代BGISEQ与第三代PacBio平台相结合的测序技术对菌株T-9进行全基因组测序... 多粘类芽胞杆菌Paenibacillus polymyxa T-9对尖孢镰刀菌黄瓜专化型Fusarium oxysporum f.sp.cucumerinum等植物病原菌有较强抑制作用,为研究其抑菌机制,采用第二代BGISEQ与第三代PacBio平台相结合的测序技术对菌株T-9进行全基因组测序,并对测序数据进行基因组组装、进行基因预测与功能注释、共线性分析、次级代谢产物合成基因簇预测和比较基因组等分析。结果表明,菌株T-9全基因组全长为5621664 bp,GC含量为45.52%,共编码4937个开放阅读框(ORF),含有109个tRNA基因、42个rRNA、0个sRNA、6个串联重复序列和5个卫星RNA。在NR、Swiss-Prot、eggNOG、GO和KEGG数据库分别注释到基因4888、3603、4422、3512和2261个。同时,在菌株T-9全基因组中预测到18个次级代谢产物基因簇,其中6个相似度达到100%,分别为抗生素合成基因簇fusaricidin B、paenibacillin、tridecaptin M、thermoactinoamide A、polymyxin和paenicidin A,其中paenibacillin和tridecaptin M是菌株T-9特有的。与具有生防功能的多粘类芽胞杆菌CR1、M1、HY96-2、SC2和SQR-2进行了比较基因组分析发现,菌株T-9在进化过程中精简了一些基因,有9个特异基因簇,有类胆碱毒素Hol-Tox和色氨酸RNA结合衰减蛋白MtrB等2个特有基因。本文从基因层面对菌株T-9的抑菌机制进行了初步解析,为深入了解多粘类芽胞杆菌次级代谢产物的合成途径提供参考信息,对菌株T-9后续相关研究具有重要意义。 展开更多
关键词 多粘类芽胞杆菌 基因组 基因注释 次级代谢
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基于对比学习的可扩展交通图像自动标注方法
11
作者 侯越 李前辉 +3 位作者 袁鹏 张鑫 王甜甜 郝紫微 《浙江大学学报(工学版)》 北大核心 2025年第8期1634-1643,共10页
针对现有交通图像自动标注方法标注类别不可扩展、精度低的问题,提出基于模态间对比学习的可扩展交通图像自动标注方法.该方法以文本和图像双模态数据为研究对象,通过对比学习捕获模态间特征的相似关系,采用模态间特征增强策略优化跨模... 针对现有交通图像自动标注方法标注类别不可扩展、精度低的问题,提出基于模态间对比学习的可扩展交通图像自动标注方法.该方法以文本和图像双模态数据为研究对象,通过对比学习捕获模态间特征的相似关系,采用模态间特征增强策略优化跨模态数据的有效对齐.在文本特征提取阶段,提出文本距离融合编码模块,通过构建距离感知特征融合组件,增强文本序列的局部特征表达能力.在图像特征提取阶段,设计可变形过滤卷积结构,在增强不规则目标识别能力的同时,有效过滤噪声信息.建立组合对比损失函数,改进原有的损失结构,提升模态间正、负样本的区分度.实验结果表明,相较于同类规模的其他模型,所提模型在BIT车辆数据集上的m AP0.5和mAP0.5:0.95分别提升了5.3%、4.8%,在交通图像自动标注方面,表现更优. 展开更多
关键词 图像标注 对比学习 双模态 类别可扩展 交通视频图像
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一株猪源肠出血性大肠杆菌O157:H7的全基因组测序及毒力和耐药基因分析
12
作者 周艳 万启旸 +3 位作者 朱树娇 张辉 包红朵 王冉 《广东农业科学》 2025年第2期58-70,共13页
[目的]分析一株猪源肠出血性大肠杆菌O157:H7菌株EO157-1的全基因组信息及其毒力和耐药基因。[方法]基于Nanopore三代测序技术平台和Illumina二代测序技术平台对猪源肠出血性大肠杆菌O157:H7菌株EO157-1进行全基因组测序,利用Prokka软... [目的]分析一株猪源肠出血性大肠杆菌O157:H7菌株EO157-1的全基因组信息及其毒力和耐药基因。[方法]基于Nanopore三代测序技术平台和Illumina二代测序技术平台对猪源肠出血性大肠杆菌O157:H7菌株EO157-1进行全基因组测序,利用Prokka软件预测基因组序列信息,并通过UniProt、KEGG、KEGG Pathway、GO、Pfam、COG、TIGERfams、RefSeq和NR数据库进行基因预测和注释,再利用碳水化合物酶(CAZy)、病原与宿主互作(PHI)、毒力因子(VFDB)和耐药基因(CARD)数据库进行基因功能分析。[结果]肠出血性大肠杆菌O157:H7菌株EO157-1基因组大小为5404747 bp,GC含量为50.49%,该菌株含有3个质粒;共预测到5674个蛋白质编码基因,包含22个rRNA(7个23S rRNA、7个16S rRNA、8个5S rRNA)、1个tmRNA、102个tRNA基因和282个小RNA分子;预测出9个CRISPR序列、273个重复序列;KEGG、KEGG Pathway、NR、UniProt、GO、COG、Pfam、RefSeq和TIGERfams数据库分别注释到1712、1693、5265、5264、4029、4294、4688、5252和2741个基因;CAZy数据库注释筛选出100个基因,PHI数据库注释筛选出2354个基因,VFDB数据库注释筛选出的毒力基因主要包括菌毛、鞭毛、Ⅱ型分泌系统、Ⅲ型分泌系统、Ⅵ型分泌系统、紧密黏附素、铁转运系统、脂多糖、荚膜、侵袭素和外毒素;CARD数据库注释筛选出的耐药基因与多重耐药外排泵、大环内酯类抗生素、四环素、多粘菌素、杆菌肽、氨基糖苷类抗生素、肽类抗生素及甲硝唑相关。[结论]获得一株肠出血性大肠杆菌O157:H7菌株EO157-1全基因组序列,序列分析表明该菌株携带大量毒力基因与耐药基因。 展开更多
关键词 肠出血性大肠杆菌O157∶H7 食源性人兽共患病 全基因组测序 基因 功能注释
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无线局域网多模态数据标签自适应标注方法
13
作者 陈琳 魏娟 《吉林大学学报(理学版)》 北大核心 2025年第3期878-884,共7页
针对无线局域网的动态性导致数据标签有效性随时间变化,需定期更新和重新标注数据,增加了数据标签标注难度的问题,提出一种无线局域网多模态数据标签自适应标注方法.首先,通过动态滑动邻近排序算法清洗重复的无线局域网多模态数据,利用... 针对无线局域网的动态性导致数据标签有效性随时间变化,需定期更新和重新标注数据,增加了数据标签标注难度的问题,提出一种无线局域网多模态数据标签自适应标注方法.首先,通过动态滑动邻近排序算法清洗重复的无线局域网多模态数据,利用循环神经网络融合多模态数据,获取更全面的数据信息.其次,将融合后的无线局域网数据划分为确定集和模糊集,采用支持向量机标注确定集数据标签,利用K-近邻(KNN)分类器标注模糊集数据标签,从而实现无线局域网多模态数据标签自适应标注.实验结果表明,该方法的重复数据删除率始终高于12%,一致指数为0.9928,平均绝对百分比误差为0.4539,ROC曲线更靠近坐标轴左上角,AUC值为0.9824,内存占用率始终低于10%,无线局域网多模态数据标签标注效果较好. 展开更多
关键词 无线局域网 多模态数据 标签标注 支持向量机 KNN分类器
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戴震论中庸之道及其世俗伦理面向——以《中庸补注》为中心
14
作者 孙邦金 谢柳青 《安徽大学学报(哲社版)》 北大核心 2025年第3期19-26,共8页
《中庸》作为宋明新儒学重建道德形而上学最主要的文本依据和思想来源,历来备受重视。戴震立志要“打破宋儒家中《太极图》”的时候,由《中庸》而《孟子》,在结撰《原善》三篇之前应该先有了未竟之作《中庸补注》。如果将《中庸补注》... 《中庸》作为宋明新儒学重建道德形而上学最主要的文本依据和思想来源,历来备受重视。戴震立志要“打破宋儒家中《太极图》”的时候,由《中庸》而《孟子》,在结撰《原善》三篇之前应该先有了未竟之作《中庸补注》。如果将《中庸补注》与《原善》《孟子字义疏证》《答彭进士允初书》诸篇中所援引的多条内容放在一起看,戴震对《中庸》的思想诠释大体上是完整的。戴震站在反理学的立场上,从民众日常生活经验和实践理性层面来审视中庸之道,并特别重视其中“不出人伦日用之常”的人道内涵,与朱熹等人着重从个体内在精神超越层面阐发“天命”“中和”“中庸”的含义构成了鲜明反差,凸显了儒学的实践理性与世俗伦理面向。这一诠释明显带有清儒普遍悬置甚至拒斥形而上学的时代特征,却暗合于现代社会不断通过理性袪魅的世俗化转型,更能接榫以世俗伦理为主导的现代社会,而且对于当下有关儒学宗教性之限度的讨论亦多有启示意义。 展开更多
关键词 戴震 《中庸补注》 中庸之道 世俗伦理 儒学的宗教性
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大语言模型下古诗笺注知识库的构建与应用 被引量:2
15
作者 李佳斌 魏庭新 +3 位作者 曲维光 李斌 冯敏萱 王东波 《图书馆论坛》 北大核心 2025年第3期99-109,共11页
古诗中典故、意象、专名等具有高语义复杂度的组块桎梏大众对古诗的语义理解。文章对古诗中的复杂语义组块进行梳理并分类;借助大语言模型的文本处理与信息抽取能力,对搜集到的各类词典知识进行整合处理,构建用于古诗笺注的知识库,并在... 古诗中典故、意象、专名等具有高语义复杂度的组块桎梏大众对古诗的语义理解。文章对古诗中的复杂语义组块进行梳理并分类;借助大语言模型的文本处理与信息抽取能力,对搜集到的各类词典知识进行整合处理,构建用于古诗笺注的知识库,并在古诗自动笺注和翻译任务中进行验证与应用。实验结果显示,构建的笺注知识库在古诗的五个关键组块笺注任务上,宏平均F1值达93.90%,优于现有的笺注方案。利用知识库再次预训练得到的古诗领域语言模型AnnoKB_GLM,在古诗机器翻译任务上的性能超越现有现代汉语通用大语言模型和古籍文本基座模型,验证了该笺注知识库的实用价值。 展开更多
关键词 古诗笺注 知识库构建 大语言模型
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南美白对虾养殖领域中文命名实体识别数据集构建
16
作者 彭小红 邓峰 余应淮 《计算机工程与应用》 北大核心 2025年第9期353-362,共10页
该研究致力于构建一个高质量的数据集,用于南美白对虾养殖领域的命名实体识别(named entity recognition,NER)任务,命名为VamNER。为确保数据集的多样性,从CNKI数据库中收集了近10年的高质量论文,并结合权威书籍进行语料构建。邀请专家... 该研究致力于构建一个高质量的数据集,用于南美白对虾养殖领域的命名实体识别(named entity recognition,NER)任务,命名为VamNER。为确保数据集的多样性,从CNKI数据库中收集了近10年的高质量论文,并结合权威书籍进行语料构建。邀请专家讨论实体类型,并经过专业培训的标注人员使用IOB2标注格式进行标注,标注过程分为预标注和正式标注两个阶段以提高效率。在预标注阶段,标注者间一致性(inter-annotation agreement,IAA)达到0.87,表明标注人员的一致性较高。最终,VamNER包含6115个句子,总字符数达384602,涵盖10个实体类型,共有12814个实体。研究通过与多个通用领域数据集和一个特定领域数据集进行比较,揭示了VamNER的独特特性。在实验中使用了预训练的基于变换器的双向编码器表示(bidirectional encoder representations from Transformers,BERT)模型、双向长短期记忆神经网络(bidirectional long short-term memory network,BiLSTM)和条件随机场模型(conditional random fields,CRF),最优模型在测试集上的F1值达到82.8%。VamNER成为首个专注于南美白对虾养殖领域的NER数据集,为中文特定领域NER研究提供了丰富资源,有望推动水产养殖领域NER研究的发展。 展开更多
关键词 命名实体识别 VamNER数据集 标注者间一致性(IAA) 基于变换器的双向编码器表示(BERT) 双向长短期记忆神经网络(BiLSTM) 条件随机场(CRF)
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钢板表面缺陷图像增强与自动标注方法研究
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作者 杨璐雅 黄新波 +1 位作者 任玉成 韩琪 《机械科学与技术》 北大核心 2025年第3期445-452,共8页
数据标注为机器学习提供了大量带标签的数据,在数据集制作时需要借助各种标注工具手动对图像进行画框标注,受主观因素影响较大,且工业现场环境复杂,采集到的图像质量不稳定,也会影响标注效果。因此提出一种改进MSR(Multi-scale retinex... 数据标注为机器学习提供了大量带标签的数据,在数据集制作时需要借助各种标注工具手动对图像进行画框标注,受主观因素影响较大,且工业现场环境复杂,采集到的图像质量不稳定,也会影响标注效果。因此提出一种改进MSR(Multi-scale retinex)钢板缺陷图像数据集增强算法和基于图像分块和像素差分的自适应目标框标注算法,首先在MSR基础上提出一种自适应权值计算方法对采集到的缺陷图像进行增强,通过计算信息熵占比自动确定权值Wk,克服了传统MSR算法需要人工调整权值的缺点;然后为了解决直接对整幅图像提取目标边界计算量太大的问题,提出一种分块计算像素差分的方法,分别计算每个子块图像的均值矩阵和2阶差分矩阵,通过判别目标在各个子块的分布情况,选取合适的子块分别计算矩形框的4个边界,代替人工画框辅助数据集的标注,并采用Faster R-CNN和YOLOv5进行缺陷检测验证。结果表明:提出算法的平均IoU为0.87,平均检测时间为457 ms,在公开数据集上的平均IoU和检测时间分别为0.84和473 ms,性能均优于其他方法,基于提出算法Faster R-CNN和YOLOv5的检测准确率分别提升了4.8%和5.9%,可以为深度学习模型提供质量稳定的数据集。 展开更多
关键词 数据标注 深度学习 数据集增强 像素2阶差分 自适应目标框标注
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透明带结合蛋白ZPBP2在公猪睾丸中的表达调控及生物信息学分析
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作者 张霞 冯彩平 +2 位作者 王瑞 贺莹 王海贞 《四川农业大学学报》 北大核心 2025年第2期435-443,共9页
【目的】研究ZPBP2在滇南小耳猪(Diannan small-eared pig,DSE)中的基因结构和蛋白网络调控特征,探寻其在猪受精过程中的生理功能。【方法】采用RNA测序技术对成年DSE的睾丸进行全转录组测序分析,获得ZPBP2在睾丸中的表达量,分析ZPBP2... 【目的】研究ZPBP2在滇南小耳猪(Diannan small-eared pig,DSE)中的基因结构和蛋白网络调控特征,探寻其在猪受精过程中的生理功能。【方法】采用RNA测序技术对成年DSE的睾丸进行全转录组测序分析,获得ZPBP2在睾丸中的表达量,分析ZPBP2基因结构和蛋白特征;分析氨基酸序列同源性和邻近基因并构建系统进化树;进而挖掘ZPBP2的互作蛋白,并构建蛋白互作网络,进行GO功能注释和KEGG功能富集分析;预测潜在调控的ceRNA并构建调控网络图。【结果】ZPBP2编码区全长981 bp,含有8个外显子以及7个内含子,编码326个氨基酸;二级结构中无规则卷曲的占比最高,含有丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸磷酸化位点并且含有信号肽;进化分析表明,ZPBP2在各物种中均具有高度的保守性以及同源性;蛋白互作分析发现ZPBP2与ZP3R、CCT6A、CCT8、ZPBP、CCT3等多种蛋白均存在互作关系;GO与KEGG功能富集分析发现这些蛋白主要富集在受精、精子与透明带的结合、糖解与糖代谢合成以及碳代谢等信号通路上;功能注释发现ZPBP2在免疫球蛋白产生的负向调节、基因表达的昼夜节律调节以及精子与透明带的结合等方面具有重要功能;ceRNA网络图分析表明ZPBP2受ssc-miR-122-5p靶向调控。【结论】ZPBP2基因在DSE受精过程中参与了表达调控,获得的结构特征为进一步研究该基因在猪精子发生过程的功能奠定了基础。 展开更多
关键词 透明带结合蛋白2 精子发生 蛋白互作 功能注释
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Rv3435c重组耻垢分枝杆菌感染小鼠RAW264.7巨噬细胞的转录组分析
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作者 刘昕玥 李丹妮 +5 位作者 宗颖 时坤 李健明 刁乃超 曾范利 杜锐 《畜牧兽医学报》 北大核心 2025年第9期4657-4672,共16页
前期研究发现,异源表达Rv3435c基因的耻垢分枝杆菌显著抑制巨噬细胞的炎症表达,为了探究Rv3435c基因在该过程行使的功能,使用二代测序分析Rv3435c重组耻垢分枝杆菌感染RAW264.7细胞的转录组差异。结果显示:通过RT-qPCR检测6、12、24、4... 前期研究发现,异源表达Rv3435c基因的耻垢分枝杆菌显著抑制巨噬细胞的炎症表达,为了探究Rv3435c基因在该过程行使的功能,使用二代测序分析Rv3435c重组耻垢分枝杆菌感染RAW264.7细胞的转录组差异。结果显示:通过RT-qPCR检测6、12、24、48 h的IL-1β、TNF-α、IL-6 mRNA表达水平,选择表达量最高的12 h作为转录组测序时间点。将测序获得的原始数据进行数据质量分析及比对结果统计,确定数据质量良好,进行样本关系分析,提示Rv3435c显著改变了小鼠巨噬细胞的基因表达情况。将数据过滤比对共得到14077个差异基因,其中,有278个显著上调表达基因和118个显著下调表达基因。对差异基因进行GO注释,得到的差异基因主要富集在免疫系统过程、对外部刺激的反应、防御响应等方面。对差异基因进行KEGG通路富集分析,主要富集在环境信息处理、细胞过程、人类疾病、有机体系统几方面。通过蛋白互作分析筛选出核心基因10个,分别为IL-6、IL-1β、CCL2、Mmp9、Spp1、Itgam、Cdc20、Ccna2、Kif11、Ccnb2。对差异基因进行荧光定量PCR试验,验证转录组结果可信,根据筛选出的DEGs和RT-qPCR结果,推测SPP1是Rv3435c行使功能的潜在靶点,并通过RT-qPCR、ELISA、Western blot验证结果。本文为结核分枝杆菌Rv3435c基因的功能探索提供了重要的数据支持。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 Rv3435c基因 耻垢分枝杆菌 基因注释 转录组
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石声汉《齐民要术今释》古音校注研究
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作者 陈哓梅 史全社 张波 《西北农林科技大学学报(社会科学版)》 北大核心 2025年第3期153-160,共8页
甲辰初秋斗口雅集古农会倡言,古农学复兴创新将向音韵校勘层次深化,并以此文发其端。石声汉《齐民要术今释》音注材料包括“校记”“注解”和“释文”中的注音。为较全面地展示《齐民要术今释》古音校注的内容、体例、方法和特色,对《... 甲辰初秋斗口雅集古农会倡言,古农学复兴创新将向音韵校勘层次深化,并以此文发其端。石声汉《齐民要术今释》音注材料包括“校记”“注解”和“释文”中的注音。为较全面地展示《齐民要术今释》古音校注的内容、体例、方法和特色,对《齐民要术今释》进行了系统梳理,发现其使用的注音方法主要有汉语拼音、直音法、纽四声法和注明声调四种。《齐民要术今释》古音校注的特色,可以从五个方面来总结:兼用多种注音方法;构拟古音;给引文中的古代反切注音,包括注古音和今音;说明方言读音;参考《说文解字》《广韵》《集韵》《玉篇》等古代字书、韵书对原书注音进行勘误审定。石先生将传统语言文字学和现代科学相结合,开辟了古农书注释的新路子,为后世的古农书整理奠定了方法论基础。 展开更多
关键词 《齐民要术今释》 古音校注 注音方法 拟音
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