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不同规格黄鳍金枪鱼红肌转录组比较分析
被引量：
1
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作者
闫路路
郭杰匀
+4 位作者
赵超
王鹏飞
张博
邱丽华
陈作志
《海洋渔业》
CSCD
北大核心
2024年第1期1-10,共10页
为探究黄鳍金枪鱼(Thunnus albacores)由“变温”型发育为“恒温”型的分子调控过程,基于RNA-Seq技术,对不同发育阶段黄鳍金枪鱼红肌组织RNA进行转录组测序并进行生物信息学分析。结果发现,与“变温”型相比,“恒温”型黄鳍金枪鱼红肌...
为探究黄鳍金枪鱼(Thunnus albacores)由“变温”型发育为“恒温”型的分子调控过程,基于RNA-Seq技术,对不同发育阶段黄鳍金枪鱼红肌组织RNA进行转录组测序并进行生物信息学分析。结果发现,与“变温”型相比,“恒温”型黄鳍金枪鱼红肌中43个差异表达基因表达量显著上调,79个显著下调。随机选取8个差异表达基因用qRT-PCR方法验证其相对表达量,发现与转录组测序结果相符。通过GO富集分析发现,差异表达基因富集在肌球蛋白复合体、肌动蛋白细胞骨架和横纹肌细丝等与肌肉运动密切相关的GO条目中。通过KEGG富集分析发现,差异表达基因富集在心肌收缩、磷酸戊糖途径和生热等与肌肉运动和能量代谢相关的通路上。结果表明,黄鳍金枪鱼“恒温”发育过程是一个涉及多组织、多基因的复杂过程,能量代谢和肌肉运动在这一过程中可能起到非常重要的作用。研究结果可以为今后深入开展黄鳍金枪鱼发育调控机制研究提供参考。
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关键词
黄鳍金枪鱼
能量代谢
肌动蛋白
RNA-SEQ
红肌
“恒温”表型
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职称材料
题名
不同规格黄鳍金枪鱼红肌转录组比较分析
被引量：
1
1
作者
闫路路
郭杰匀
赵超
王鹏飞
张博
邱丽华
陈作志
机构
中国水产科学研究院南海水产研究所
农业农村部水生动物基因组学重点实验室
中国水产科学研究院南海水产研究所热带水产研究开发中心
三亚热带水产研究院
出处
《海洋渔业》
CSCD
北大核心
2024年第1期1-10,共10页
基金
农业农村部财政专项项目(NFZX2021)
广东省重点领域研发计划项目(2020B1111030001)
+1 种基金
广东省基础与应用基础研究重大项目课题(2019B030302004)
中国水产科学研究院基本科研业务费专项(2020TD21)。
文摘
为探究黄鳍金枪鱼(Thunnus albacores)由“变温”型发育为“恒温”型的分子调控过程,基于RNA-Seq技术,对不同发育阶段黄鳍金枪鱼红肌组织RNA进行转录组测序并进行生物信息学分析。结果发现,与“变温”型相比,“恒温”型黄鳍金枪鱼红肌中43个差异表达基因表达量显著上调,79个显著下调。随机选取8个差异表达基因用qRT-PCR方法验证其相对表达量,发现与转录组测序结果相符。通过GO富集分析发现,差异表达基因富集在肌球蛋白复合体、肌动蛋白细胞骨架和横纹肌细丝等与肌肉运动密切相关的GO条目中。通过KEGG富集分析发现,差异表达基因富集在心肌收缩、磷酸戊糖途径和生热等与肌肉运动和能量代谢相关的通路上。结果表明,黄鳍金枪鱼“恒温”发育过程是一个涉及多组织、多基因的复杂过程,能量代谢和肌肉运动在这一过程中可能起到非常重要的作用。研究结果可以为今后深入开展黄鳍金枪鱼发育调控机制研究提供参考。
关键词
黄鳍金枪鱼
能量代谢
肌动蛋白
RNA-SEQ
红肌
“恒温”表型
Keywords
Thunnus albacares
energy metabolism
myosin
RNASeq
red muscle
“endothermic”phenotype
分类号
G315 [文化科学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
不同规格黄鳍金枪鱼红肌转录组比较分析
闫路路
郭杰匀
赵超
王鹏飞
张博
邱丽华
陈作志
《海洋渔业》
CSCD
北大核心
2024
1
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