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接种根瘤菌对‘蒙农三叶草1号’根部转录水平的影响
被引量:
1
1
作者
曹克璠
索荣臻
+4 位作者
张慧敏
马一鸣
吴倩
包立高
王明玖
《草地学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第9期2759-2768,共10页
为探究‘蒙农三叶草1号’(Trifolium ambiguum Bieb.‘Mengnong No.1’)与根瘤菌共生过程中相关基因的分子机制及代谢通路,本研究选取了接种根瘤菌的‘蒙农三叶草1号’以及未接种的对照组为研究对象,通过转录组测序,比较了共生与非共生...
为探究‘蒙农三叶草1号’(Trifolium ambiguum Bieb.‘Mengnong No.1’)与根瘤菌共生过程中相关基因的分子机制及代谢通路,本研究选取了接种根瘤菌的‘蒙农三叶草1号’以及未接种的对照组为研究对象,通过转录组测序,比较了共生与非共生状态下的转录组差异。结果表明,与未接种组相比,接种组共筛选出1105个差异表达基因(Differentially expressed genes,DEGs)。进一步分析发现,这些DEGs涉及多个代谢通路和生物学过程,包括苯丙烷生物合成、氨基糖和核苷酸糖代谢、半胱氨酸和甲硫氨酸代谢等。其中,677个基因上调,428个基因下调。通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)对部分基因进行验证,证实了转录组测序的可靠性。本研究揭示了‘蒙农三叶草1号’在根瘤菌共生状态下的转录组特征,为深入理解植物与根瘤菌共生机制提供了重要参考。
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关键词
‘蒙农三叶草1号’
接种根瘤菌
差异表达基因
转录组学
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职称材料
基于代谢组学的‘蒙农三叶草1号’与结瘤相关的根系代谢物研究
被引量:
1
2
作者
刘嘉伟
王明玖
+4 位作者
曹克璠
何丽君
郝新艳
张慧敏
郝璐
《草地学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第9期2703-2711,共9页
为探究高加索三叶草与根瘤菌互作后根系代谢物的变化,本研究以‘蒙农三叶草1号’高加索三叶草(Trifolium ambiguum Bieb.‘Mengnong No.1’)为试验材料,通过设置接种与不接种根瘤菌处理,观察其结瘤效果,并运用代谢组学技术分析接种根瘤...
为探究高加索三叶草与根瘤菌互作后根系代谢物的变化,本研究以‘蒙农三叶草1号’高加索三叶草(Trifolium ambiguum Bieb.‘Mengnong No.1’)为试验材料,通过设置接种与不接种根瘤菌处理,观察其结瘤效果,并运用代谢组学技术分析接种根瘤菌后根系代谢产物的变化。结果表明,在接种根瘤菌后,‘蒙农三叶草1号’根系出现结瘤现象,共有249个化合物含量发生显著变化,主要注释在“次生代谢产物生物合成”过程中;共有75个化合物富集在47个通路中,主要富集在“黄酮和黄酮醇的生物合成”和“类黄酮生物合成”过程中。其中有16个差异代谢物在结瘤过程中起重要作用,酮戊二酸、山奈酚、槲皮苷、根皮苷、杨梅素和黄豆黄甙促进了该三叶草结瘤过程,精氨酸促进根瘤的生长。本研究可为后期提高高加索三叶草结瘤效率提供理论参考。
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关键词
‘蒙农三叶草1号’
高加索
三叶草
结瘤固氮
代谢组学
根系代谢产物
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职称材料
题名
接种根瘤菌对‘蒙农三叶草1号’根部转录水平的影响
被引量:
1
1
作者
曹克璠
索荣臻
张慧敏
马一鸣
吴倩
包立高
王明玖
机构
内蒙古农业大学草原与资源环境学院/草地资源教育部重点实验室
内蒙古自治区农牧业技术推广中心
出处
《草地学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第9期2759-2768,共10页
基金
国家自然科学基金(31960353)资助。
文摘
为探究‘蒙农三叶草1号’(Trifolium ambiguum Bieb.‘Mengnong No.1’)与根瘤菌共生过程中相关基因的分子机制及代谢通路,本研究选取了接种根瘤菌的‘蒙农三叶草1号’以及未接种的对照组为研究对象,通过转录组测序,比较了共生与非共生状态下的转录组差异。结果表明,与未接种组相比,接种组共筛选出1105个差异表达基因(Differentially expressed genes,DEGs)。进一步分析发现,这些DEGs涉及多个代谢通路和生物学过程,包括苯丙烷生物合成、氨基糖和核苷酸糖代谢、半胱氨酸和甲硫氨酸代谢等。其中,677个基因上调,428个基因下调。通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)对部分基因进行验证,证实了转录组测序的可靠性。本研究揭示了‘蒙农三叶草1号’在根瘤菌共生状态下的转录组特征,为深入理解植物与根瘤菌共生机制提供了重要参考。
关键词
‘蒙农三叶草1号’
接种根瘤菌
差异表达基因
转录组学
Keywords
‘Mengnong Clover No.
1
’
Rhizobium inoculation
Differentially expressed genes(DEGs)
Transcriptomics
分类号
S541.2 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
基于代谢组学的‘蒙农三叶草1号’与结瘤相关的根系代谢物研究
被引量:
1
2
作者
刘嘉伟
王明玖
曹克璠
何丽君
郝新艳
张慧敏
郝璐
机构
内蒙古农业大学草地资源教育部重点实验室/草原与资源环境学院
内蒙古农业大学农学院
出处
《草地学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第9期2703-2711,共9页
基金
国家自然科学基金“‘蒙农三叶草1号’结瘤固氮机理及根瘤菌多样性研究”(31960353)
国家自然科学基金“‘蒙农三叶草1号’花期延长及其调控机理研究”(32160334)资助。
文摘
为探究高加索三叶草与根瘤菌互作后根系代谢物的变化,本研究以‘蒙农三叶草1号’高加索三叶草(Trifolium ambiguum Bieb.‘Mengnong No.1’)为试验材料,通过设置接种与不接种根瘤菌处理,观察其结瘤效果,并运用代谢组学技术分析接种根瘤菌后根系代谢产物的变化。结果表明,在接种根瘤菌后,‘蒙农三叶草1号’根系出现结瘤现象,共有249个化合物含量发生显著变化,主要注释在“次生代谢产物生物合成”过程中;共有75个化合物富集在47个通路中,主要富集在“黄酮和黄酮醇的生物合成”和“类黄酮生物合成”过程中。其中有16个差异代谢物在结瘤过程中起重要作用,酮戊二酸、山奈酚、槲皮苷、根皮苷、杨梅素和黄豆黄甙促进了该三叶草结瘤过程,精氨酸促进根瘤的生长。本研究可为后期提高高加索三叶草结瘤效率提供理论参考。
关键词
‘蒙农三叶草1号’
高加索
三叶草
结瘤固氮
代谢组学
根系代谢产物
Keywords
Trifolium ambiguum Bieb.‘Mengnong No.
1
’
Caucasian Clover
Nodular nitrogen fixation
Metabolomics
Root metabolites
分类号
S5412 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
接种根瘤菌对‘蒙农三叶草1号’根部转录水平的影响
曹克璠
索荣臻
张慧敏
马一鸣
吴倩
包立高
王明玖
《草地学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
1
在线阅读
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职称材料
2
基于代谢组学的‘蒙农三叶草1号’与结瘤相关的根系代谢物研究
刘嘉伟
王明玖
曹克璠
何丽君
郝新艳
张慧敏
郝璐
《草地学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
1
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