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滇牡丹ω-6脂肪酸脱氢酶基因的克隆与功能分析
被引量：
6
1
作者
李苏雨
王毅
+2 位作者
原晓龙
王娟
杨宇明
《西部林业科学》
CAS
2016年第2期22-28,共7页
ω-6脂肪酸脱氢酶(FAD2)是亚油酸合成的关键酶,催化油酸脱氢形成亚油酸。以滇牡丹种子为材料,研究根据转录组数据设计的特异引物,采用RT-PCR方法,克隆滇牡丹ω-6脂肪酸脱氢酶(FAD2)并分析其功能。获得一个ω-6脂肪酸脱氢酶基因,将其命名...
ω-6脂肪酸脱氢酶(FAD2)是亚油酸合成的关键酶,催化油酸脱氢形成亚油酸。以滇牡丹种子为材料,研究根据转录组数据设计的特异引物,采用RT-PCR方法,克隆滇牡丹ω-6脂肪酸脱氢酶(FAD2)并分析其功能。获得一个ω-6脂肪酸脱氢酶基因,将其命名为Pd FAD2。结果表明,该基因与芍药的同源性为98.7%。经氨基酸序列比对,推断滇牡丹FAD2具有植物FAD2特有的3个组氨酸区,包含完整的c DNA开放阅读框,由1 155bp组成,编码384个氨基酸残基。半定量PCR的结果显示,滇牡丹FAD2基因在花、茎、叶、种子中均有表达,在根中只有微弱表达。研究结果为研究滇牡丹不饱和脂肪酸代谢奠定基础,也为油用滇牡丹育种提供理论依据。
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关键词
ω-6脂肪酸脱氢酶
滇牡丹
基因克隆
基因功能分析
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职称材料
马齿苋PoFAD6基因克隆、原核表达及对低温胁迫的响应
2
作者
周麟笔
韩洪强
+4 位作者
王彪
赵大芹
马关鹏
刘峰
文林宏
《种子》
北大核心
2023年第10期1-7,15,共8页
本研究以马齿苋为材料,采用同源克隆获得马齿苋ω-6脂肪酸脱氢酶PoFAD6基因,并对其进行了生物信息学分析、原核表达及在低温胁迫下的表达研究。结果表明,PoFAD6基因CDS全长为1380 bp,推导编码459个氨基酸,其氨基酸序列具有Membrane-FADS...
本研究以马齿苋为材料,采用同源克隆获得马齿苋ω-6脂肪酸脱氢酶PoFAD6基因,并对其进行了生物信息学分析、原核表达及在低温胁迫下的表达研究。结果表明,PoFAD6基因CDS全长为1380 bp,推导编码459个氨基酸,其氨基酸序列具有Membrane-FADS-like超家族共同的保守结构域。PoFAD6蛋白N端无信号肽,具有4个跨膜结构,为不稳定亲水蛋白,亚细胞预测定位于叶绿体上,二级结构主要包括α-螺旋和不规则卷曲。氨基酸同源比对和系统发育树分析结果表明,PoFAD6与藜麦FAD6氨基酸序列一致性最高,为77.54%,亲缘关系最近。PoFAD6融合蛋白可在大肠杆菌BL21表达宿主中成功表达,分子量约为53 kD。RT-qPCR结果表明,5℃低温处理0~24 h,PoFAD6基因的表达模式呈先升后降的趋势,说明PoFAD6基因能响应低温胁迫。
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关键词
马齿苋
ω-6脂肪酸脱氢酶
原核表达
低温胁迫
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职称材料
题名
滇牡丹ω-6脂肪酸脱氢酶基因的克隆与功能分析
被引量：
6
1
作者
李苏雨
王毅
原晓龙
王娟
杨宇明
机构
西南林业大学
国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室
云南省林业科学院
出处
《西部林业科学》
CAS
2016年第2期22-28,共7页
基金
云南省科技计划项目(2015A005)
云南省应用基础研究重点项目(2013FA054)
云南省中青年学术技术带头人后备人才培养项目(2010CI016)
文摘
ω-6脂肪酸脱氢酶(FAD2)是亚油酸合成的关键酶,催化油酸脱氢形成亚油酸。以滇牡丹种子为材料,研究根据转录组数据设计的特异引物,采用RT-PCR方法,克隆滇牡丹ω-6脂肪酸脱氢酶(FAD2)并分析其功能。获得一个ω-6脂肪酸脱氢酶基因,将其命名为Pd FAD2。结果表明,该基因与芍药的同源性为98.7%。经氨基酸序列比对,推断滇牡丹FAD2具有植物FAD2特有的3个组氨酸区,包含完整的c DNA开放阅读框,由1 155bp组成,编码384个氨基酸残基。半定量PCR的结果显示,滇牡丹FAD2基因在花、茎、叶、种子中均有表达,在根中只有微弱表达。研究结果为研究滇牡丹不饱和脂肪酸代谢奠定基础,也为油用滇牡丹育种提供理论依据。
关键词
ω-6脂肪酸脱氢酶
滇牡丹
基因克隆
基因功能分析
Keywords
omega
-
6
fatty acid desaturase
Paeonia delavayi
gene clone
gene function analysis
分类号
S685.11 [农业科学—观赏园艺]
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职称材料
题名
马齿苋PoFAD6基因克隆、原核表达及对低温胁迫的响应
2
作者
周麟笔
韩洪强
王彪
赵大芹
马关鹏
刘峰
文林宏
机构
贵州省农业科学院园艺研究所
贵州民族大学民族医药学院
宁波城市职业技术学院景观生态学院
出处
《种子》
北大核心
2023年第10期1-7,15,共8页
基金
贵州省科技计划项目(黔科合支撑[2022]重点019号、黔科合服企[2022]005)
贵阳市科技计划项目(筑科合同[2021]5-1号)
+1 种基金
宁波市公益类科技计划项目(2021S026)
贵州省高等学校绿色化学与资源环境创新团队(黔教技[2022]13号)。
文摘
本研究以马齿苋为材料,采用同源克隆获得马齿苋ω-6脂肪酸脱氢酶PoFAD6基因,并对其进行了生物信息学分析、原核表达及在低温胁迫下的表达研究。结果表明,PoFAD6基因CDS全长为1380 bp,推导编码459个氨基酸,其氨基酸序列具有Membrane-FADS-like超家族共同的保守结构域。PoFAD6蛋白N端无信号肽,具有4个跨膜结构,为不稳定亲水蛋白,亚细胞预测定位于叶绿体上,二级结构主要包括α-螺旋和不规则卷曲。氨基酸同源比对和系统发育树分析结果表明,PoFAD6与藜麦FAD6氨基酸序列一致性最高,为77.54%,亲缘关系最近。PoFAD6融合蛋白可在大肠杆菌BL21表达宿主中成功表达,分子量约为53 kD。RT-qPCR结果表明,5℃低温处理0~24 h,PoFAD6基因的表达模式呈先升后降的趋势,说明PoFAD6基因能响应低温胁迫。
关键词
马齿苋
ω-6脂肪酸脱氢酶
原核表达
低温胁迫
Keywords
Portulaca oleracea L.
ω-
6
fatty acid desaturase
prokaryotic expression
low temperature stress
分类号
S567.219 [农业科学—中草药栽培]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
滇牡丹ω-6脂肪酸脱氢酶基因的克隆与功能分析
李苏雨
王毅
原晓龙
王娟
杨宇明
《西部林业科学》
CAS
2016
6
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
马齿苋PoFAD6基因克隆、原核表达及对低温胁迫的响应
周麟笔
韩洪强
王彪
赵大芹
马关鹏
刘峰
文林宏
《种子》
北大核心
2023
0
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职称材料
已选择
0
条
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参考文献
引证文献
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