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纳通道内λ-DNA过孔信号的小波去噪及统计分析
被引量：
1
1
作者
王霏
倪中华
+3 位作者
陈云飞
刘磊
马建
毕晨
《东南大学学报（自然科学版）》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2013年第1期50-54,共5页
针对λ噬菌体中的脱氧核糖核酸(λ-DNA)通过纳米通道时的过孔信号噪音大,强度弱且非平稳的缺点,提出了使用具有良好时频域分辨能力的小波分析方法对其进行去噪处理,并对有效去噪后的λ-DNA过孔信号进行了统计分析.首先根据小波去噪原理...
针对λ噬菌体中的脱氧核糖核酸(λ-DNA)通过纳米通道时的过孔信号噪音大,强度弱且非平稳的缺点,提出了使用具有良好时频域分辨能力的小波分析方法对其进行去噪处理,并对有效去噪后的λ-DNA过孔信号进行了统计分析.首先根据小波去噪原理,选择合适的小波函数,确定最佳的分解层数并选取合适的阈值,对实验采集到的含噪声信号进行去噪处理.根据最终去噪效果可得,以sym7为小波基函数、分解层数5层、使用默认软阈值可以有效降低信号中的噪声,提高信噪比.然后,对具有48 000个碱基对(48 kbp)的λ-DNA通过60 nm氮化硅(SiN)纳米孔的特征信号进行了统计分析,分析结果表明,阻塞电流和过孔时间分别符合双峰高斯分布和偏正态分布,这为后续DNA分子的辨识工作提供了依据.
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关键词
纳米通道
λ-dna过孔信号
小波去噪
信噪比
统计分析
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职称材料
题名
纳通道内λ-DNA过孔信号的小波去噪及统计分析
被引量：
1
1
作者
王霏
倪中华
陈云飞
刘磊
马建
毕晨
机构
东南大学江苏省微纳生物医疗器械设计与制造重点实验室
出处
《东南大学学报（自然科学版）》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2013年第1期50-54,共5页
基金
国家重点基础研究发展计划(973计划)资助项目(2011CB707601
2011CB707605).
文摘
针对λ噬菌体中的脱氧核糖核酸(λ-DNA)通过纳米通道时的过孔信号噪音大,强度弱且非平稳的缺点,提出了使用具有良好时频域分辨能力的小波分析方法对其进行去噪处理,并对有效去噪后的λ-DNA过孔信号进行了统计分析.首先根据小波去噪原理,选择合适的小波函数,确定最佳的分解层数并选取合适的阈值,对实验采集到的含噪声信号进行去噪处理.根据最终去噪效果可得,以sym7为小波基函数、分解层数5层、使用默认软阈值可以有效降低信号中的噪声,提高信噪比.然后,对具有48 000个碱基对(48 kbp)的λ-DNA通过60 nm氮化硅(SiN)纳米孔的特征信号进行了统计分析,分析结果表明,阻塞电流和过孔时间分别符合双峰高斯分布和偏正态分布,这为后续DNA分子的辨识工作提供了依据.
关键词
纳米通道
λ-dna过孔信号
小波去噪
信噪比
统计分析
Keywords
nanopores
signal of
λ-dna
translocation
wavelet denoising
signal to noise ratio
statistical analysis
分类号
TH776 [机械工程—精密仪器及机械]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
纳通道内λ-DNA过孔信号的小波去噪及统计分析
王霏
倪中华
陈云飞
刘磊
马建
毕晨
《东南大学学报（自然科学版）》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2013
1
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