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题名珠子参β-香树素合成酶基因的克隆和生物信息学分析
被引量：11
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作者
吴亚运
赵小龙
陈平
张绍鹏
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机构
武汉轻工大学生物与制药工程学院
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出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第2期109-117,共9页
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基金
国家自然科学基金(81274023)
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文摘
β-香树素合成酶(beta-amyrin synthaseβAS)是定向分流齐墩果烷型皂苷和达玛烷型皂苷的限速酶,对药用植物三萜皂苷的生物合成具有重要的调控作用。基于珠子参转录组数据中βAS转录本序列设计引物,利用RT-PCR方法从珠子参根状茎中克隆得到βAS基因全长c DNA序列,命名为pjβAS。经测序鉴定该基因长度为2 655 bp,包含一个2 286 bp的完整开放阅读框,编码761个氨基酸,在Gen Bank数据库的登录号为KX254566。生物信息学分析显示,其编码蛋白分子量为87.90 k D,理论等电点(p I)5.84,不含跨膜区,为非分泌蛋白,含有38处磷酸化位点,主要于叶绿体和内质网中发挥生理作用;二级结构预测发现其α-螺旋占39.82%、延伸链16.56%、β-转角10.38%、无规则卷曲33.24%,具有DCTAE、QW(QXXXXXW)和MWCRCY3个氧化鲨烯环化酶(OCS)基因家族特征保守基序;pjβAS蛋白与竹节参(AKN23431.1)序列的一致性为100%,系统进化分析中与竹节参(AKN23431.1)、西洋参(AGG09939.1)、柴胡(ABY90140.2)划为同一分支。通过实时荧光定量PCR分析pjβAS在珠子参不同组织中的相对表达量,发现pjβAS基因在花、叶、茎、根状茎中均有表达,在叶中表达量最高,根状茎中表达量最低。
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关键词
珠子参
β-香树素合成酶
三萜皂苷
基因克隆
生物系信息学分析
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Keywords
Panaxjaponicus var. major
β-amyrin synthase
triterpenoid saponin
gene cloning
bioinformatics analysis
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分类号
S567.53
[农业科学—中草药栽培]
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题名油茶氧化鲨烯环化酶基因序列分析
被引量：7
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作者
赵松子
黄建建
高伟
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机构
江西省林业科学院
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出处
《江西林业科技》
2014年第1期1-5,9,共6页
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基金
江西省级油茶产业发展基金计划课题(低皂苷油茶新种质创制)
江西省林业科学院博士基金资助
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文摘
氧化鲨烯环化酶(oxidosqualene cyclase,OSC)是甾醇和三萜合成的关键酶之一。以油茶(Camellia oleifera)未成熟种仁为材料进行转录组分析,并鉴定出4个OSC基因,分别命名为CoOSC1/CoCAS、CoOSC2/CobAS、CoOSC3/CoLAS及CoOSC4/CoaAS,CoOSC1和CoOSC2为全长序列。OSC系统进化树表明,CoOSC1为环阿屯醇合成酶、CoOSC2为β-香树素合成酶、CoOSC3为羊毛甾醇合成酶、CoOSC4为α-香树素合成酶。
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关键词
油茶
氧化鲨烯环化酶
β-香树素合成酶
羊毛甾醇合成酶
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Keywords
Camellia oleifera
oxidosqualene cyclase
β-amyrin synthase
lanosterol synthas
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分类号
S794.4
[农业科学—林木遗传育种]
Q789
[生物学—分子生物学]
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