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蒜头果中3-酮酯酰-CoA合酶基因克隆与表达分析
被引量：
6
1
作者
李云琴
陈中华
+1 位作者
原晓龙
王毅
《中国油脂》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第3期128-133,共6页
以蒜头果(Malania oleifera)为实验材料,基于转录组数据分析,采用RT-PCR方法获得蒜头果3-酮酯酰-CoA合酶(KCS)基因的cDNA序列,命名为MoKCS1,GenBank登录号为MK210592。序列分析显示MoKCS1基因cDNA全长为1 539 bp,编码512个氨基酸,属于KC...
以蒜头果(Malania oleifera)为实验材料,基于转录组数据分析,采用RT-PCR方法获得蒜头果3-酮酯酰-CoA合酶(KCS)基因的cDNA序列,命名为MoKCS1,GenBank登录号为MK210592。序列分析显示MoKCS1基因cDNA全长为1 539 bp,编码512个氨基酸,属于KCS家族。序列比对分析显示Mo KCS1拥有KCS家族特有的3个功能保守结构域,与榴莲(Durio zibethinus) KCS的蛋白序列同源性为80. 66%;与已知超长链KCS蛋白进行系统进化分析显示,MoKCS1独立形成一个分支。荧光定量PCR分析表明,MoKCS1在蒜头果果实膨大期的表达量最高,而在叶中几乎不表达。
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关键词
蒜头果
3
-
酮
酯
酰
-coa
合
酶
基因
荧光定量PCR
基因
表达分析
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职称材料
滇牡丹3-酮酯酰-CoA合酶基因克隆与功能分析
被引量：
3
2
作者
朱金鑫
孙金金
+3 位作者
原晓龙
王娟
杨宇明
王毅
《江苏农业科学》
2018年第2期20-23,共4页
3-酮酯酰-CoA合酶(3-ketoacyl-CoA synthase,简称KCS)是超长链单不饱和脂肪酸生物合成途径的关键酶。依据转录组数据设计特异性引物,使用RT-PCR方法从滇牡丹(Paeonia delavayi)中克隆得到1个KCS基因的cDNA全长序列,命名为PdKCS(Gen Ban...
3-酮酯酰-CoA合酶(3-ketoacyl-CoA synthase,简称KCS)是超长链单不饱和脂肪酸生物合成途径的关键酶。依据转录组数据设计特异性引物,使用RT-PCR方法从滇牡丹(Paeonia delavayi)中克隆得到1个KCS基因的cDNA全长序列,命名为PdKCS(Gen Bank登录号KX524949)。生物信息学分析结果表明,PdKCS基因片段序列全长1527 bp,包含完整的cDNA开放阅读框(ORF),编码含有502个氨基酸残基的蛋白质;Blast比对结果显示,该蛋白质属于KCS蛋白家族;系统进化分析结果显示,该蛋白质属于跨膜、亲水性蛋白;RT-PCR结果显示,其在种子中的表达随着种子的成熟出现双峰型的表达量变化。研究结果可为进一步研究该蛋白的调控机制提供理论依据及获得含高不饱和脂肪酸转基因滇牡丹品种奠定理论基础。
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关键词
滇牡丹
3
-
酮
酯
酰
-coa
合
酶
基因
克隆
基因
功能分析
RT
-
PCR
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职称材料
碎米荠CarKCS基因全长CDS克隆、序列分析及表达载体构建
被引量：
3
3
作者
杨慧
魏解冰
+1 位作者
阮颖
刘春林
《作物研究》
2012年第3期213-218,共6页
根据KCS基因的保守性设计引物,以高神经酸含量的碎米荠叶片DNA为模板(KCS基因无内含子),克隆碎米荠超长链脂肪酸合成的限速酶β-酮脂酰-CoA合酶(KCS)基因全长CDS序列,命名为CarKCS。Blast比对及序列分析表明,目的片段序列和GenBank上报...
根据KCS基因的保守性设计引物,以高神经酸含量的碎米荠叶片DNA为模板(KCS基因无内含子),克隆碎米荠超长链脂肪酸合成的限速酶β-酮脂酰-CoA合酶(KCS)基因全长CDS序列,命名为CarKCS。Blast比对及序列分析表明,目的片段序列和GenBank上报道的拟南芥KCS18序列同源性达到87%。CarKCS全长1 518bp,不含内含子,编码505个氨基酸。生物信息学分析表明,所有的酶功能活性位点的氨基酸都存在,在N端都有两个,C端有一个高度疏水的跨膜结构域;CarKCS与KCS18同属于KCS基因家族的FAE1-like亚家族。将目的片段连接到pFGC-5941.nap表达载体,经PCR和酶切检测,证明已成功构建了pNapin-CarKCS载体。
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关键词
碎米荠
β-
酮
脂
酰
-coa
合
酶
(
kcs
)
基因
序列分析
表达载体构建
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职称材料
题名
蒜头果中3-酮酯酰-CoA合酶基因克隆与表达分析
被引量：
6
1
作者
李云琴
陈中华
原晓龙
王毅
机构
云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室
出处
《中国油脂》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第3期128-133,共6页
基金
云南省应用基础研究计划青年项目(2017FB169)
国家自然科学基金项目(31860177)
云南省林业科学院创新基金项目(QN2018-01)
文摘
以蒜头果(Malania oleifera)为实验材料,基于转录组数据分析,采用RT-PCR方法获得蒜头果3-酮酯酰-CoA合酶(KCS)基因的cDNA序列,命名为MoKCS1,GenBank登录号为MK210592。序列分析显示MoKCS1基因cDNA全长为1 539 bp,编码512个氨基酸,属于KCS家族。序列比对分析显示Mo KCS1拥有KCS家族特有的3个功能保守结构域,与榴莲(Durio zibethinus) KCS的蛋白序列同源性为80. 66%;与已知超长链KCS蛋白进行系统进化分析显示,MoKCS1独立形成一个分支。荧光定量PCR分析表明,MoKCS1在蒜头果果实膨大期的表达量最高,而在叶中几乎不表达。
关键词
蒜头果
3
-
酮
酯
酰
-coa
合
酶
基因
荧光定量PCR
基因
表达分析
Keywords
Malania oleifera
kcs
gene
RT
-
PCR
gene expression analysis
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
滇牡丹3-酮酯酰-CoA合酶基因克隆与功能分析
被引量：
3
2
作者
朱金鑫
孙金金
原晓龙
王娟
杨宇明
王毅
机构
西南林业大学林学院
国家林业局重点开放性实验室/云南珍稀濒特森林植物保护和繁育实验室/云南省森林植物培育与开发利用重点实验室
云南省林业科学院
出处
《江苏农业科学》
2018年第2期20-23,共4页
基金
国家林业公益性行业科研专项(编号:201204110)
云南省科技计划(编号:2015A005)
云南省应用基础研究重点项目(编号:2013FA054)
文摘
3-酮酯酰-CoA合酶(3-ketoacyl-CoA synthase,简称KCS)是超长链单不饱和脂肪酸生物合成途径的关键酶。依据转录组数据设计特异性引物,使用RT-PCR方法从滇牡丹(Paeonia delavayi)中克隆得到1个KCS基因的cDNA全长序列,命名为PdKCS(Gen Bank登录号KX524949)。生物信息学分析结果表明,PdKCS基因片段序列全长1527 bp,包含完整的cDNA开放阅读框(ORF),编码含有502个氨基酸残基的蛋白质;Blast比对结果显示,该蛋白质属于KCS蛋白家族;系统进化分析结果显示,该蛋白质属于跨膜、亲水性蛋白;RT-PCR结果显示,其在种子中的表达随着种子的成熟出现双峰型的表达量变化。研究结果可为进一步研究该蛋白的调控机制提供理论依据及获得含高不饱和脂肪酸转基因滇牡丹品种奠定理论基础。
关键词
滇牡丹
3
-
酮
酯
酰
-coa
合
酶
基因
克隆
基因
功能分析
RT
-
PCR
分类号
S685.110.1 [农业科学—观赏园艺]
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职称材料
题名
碎米荠CarKCS基因全长CDS克隆、序列分析及表达载体构建
被引量：
3
3
作者
杨慧
魏解冰
阮颖
刘春林
机构
作物种质资源创新与利用国家重点实验室培育基地
湖南农业大学农学院
湖南农业大学生物科学与技术学院
出处
《作物研究》
2012年第3期213-218,共6页
基金
国家973项目(2006CB101603)
文摘
根据KCS基因的保守性设计引物,以高神经酸含量的碎米荠叶片DNA为模板(KCS基因无内含子),克隆碎米荠超长链脂肪酸合成的限速酶β-酮脂酰-CoA合酶(KCS)基因全长CDS序列,命名为CarKCS。Blast比对及序列分析表明,目的片段序列和GenBank上报道的拟南芥KCS18序列同源性达到87%。CarKCS全长1 518bp,不含内含子,编码505个氨基酸。生物信息学分析表明,所有的酶功能活性位点的氨基酸都存在,在N端都有两个,C端有一个高度疏水的跨膜结构域;CarKCS与KCS18同属于KCS基因家族的FAE1-like亚家族。将目的片段连接到pFGC-5941.nap表达载体,经PCR和酶切检测,证明已成功构建了pNapin-CarKCS载体。
关键词
碎米荠
β-
酮
脂
酰
-coa
合
酶
(
kcs
)
基因
序列分析
表达载体构建
Keywords
Cardamine hirsute
β-
ketoacyl
-coa
synthase （
kcs
） gene
Sequence analysis
Construction of expres
-
sion vector
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
蒜头果中3-酮酯酰-CoA合酶基因克隆与表达分析
李云琴
陈中华
原晓龙
王毅
《中国油脂》
CAS
CSCD
北大核心
2019
6
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职称材料
2
滇牡丹3-酮酯酰-CoA合酶基因克隆与功能分析
朱金鑫
孙金金
原晓龙
王娟
杨宇明
王毅
《江苏农业科学》
2018
3
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职称材料
3
碎米荠CarKCS基因全长CDS克隆、序列分析及表达载体构建
杨慧
魏解冰
阮颖
刘春林
《作物研究》
2012
3
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职称材料
已选择
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参考文献
引证文献
统计分析
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