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fv-gs6:一个与金针菇菌柄伸长相关的葡聚糖合酶基因
被引量：
1
1
作者
龙莹
严俊杰
+5 位作者
仝宗军
刘媛媛
苗娟
陶永新
江玉姬
谢宝贵
《福建农林大学学报（自然科学版）》
CSCD
北大核心
2018年第6期698-704,共7页
根据金针菇(Flammulina velutipes)基因组及转录组数据,筛选得到1个β-1,6-葡聚糖合酶(β-1,6-glucan synthase)编码基因,命名为fv-gs6.该基因全长1 439 bp,含有9个外显子,8个内含子,编码339个氨基酸.多序列比对及系统进化分析结果表明:...
根据金针菇(Flammulina velutipes)基因组及转录组数据,筛选得到1个β-1,6-葡聚糖合酶(β-1,6-glucan synthase)编码基因,命名为fv-gs6.该基因全长1 439 bp,含有9个外显子,8个内含子,编码339个氨基酸.多序列比对及系统进化分析结果表明:fv-gs6编码蛋白(Fv-GS6)具有β-1,6-葡聚糖合酶的保守motif,且与担子菌的β-1,6-葡聚糖合酶聚在同一个分支.生物信息学分析表明:该蛋白具备信号肽、亚细胞定位于细胞外,属于分泌蛋白;推测Fv-GS6蛋白可能直接在细胞外催化β-1,6-葡聚糖的合成.通过qRT-PCR方法检测该基因在子实体不同发育时期的表达量,结果显示:fv-gs6在菌柄上高表达,且在伸长期菌柄表达量最高;其中,菌柄的伸长区段表达量是不伸长区段的5.42倍.根据β-1,6-葡聚糖合酶在真菌细胞壁合成中的功能,推测fv-gs6的高表达可能促进细胞壁合成,参与金针菇菌柄的伸长过程.
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关键词
金针菇
β-
1
6
-
葡
聚
糖
合
酶
基因结构
细胞壁
合
成
菌柄伸长
差异表达
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职称材料
燕麦葡聚糖合酶基因AsCSLH的克隆及特征分析
被引量：
6
2
作者
吴斌
张宗文
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第4期723-728,共6页
β-葡聚糖是燕麦发挥保健作用的重要功能因子,分离其合成关键基因有助于解析燕麦β-葡聚糖积累的分子机制。以高β-葡聚糖燕麦地方品种夏莜麦为材料,通过RACE和染色体步移的方法克隆了燕麦β-葡聚糖合酶基因AsCSLH及其基因组序列并分析...
β-葡聚糖是燕麦发挥保健作用的重要功能因子,分离其合成关键基因有助于解析燕麦β-葡聚糖积累的分子机制。以高β-葡聚糖燕麦地方品种夏莜麦为材料,通过RACE和染色体步移的方法克隆了燕麦β-葡聚糖合酶基因AsCSLH及其基因组序列并分析其序列结构特征,采用半定量RT-PCR方法研究该基因组织表达特性。分离出的燕麦CSLH基因包含6个内含子,内含子剪接方式均符合GT/AG剪接规则,编码区全长2277bp,在序列上与水稻CSLH基因的编码区序列相似性最高,所预测的编码蛋白含有相关多糖合成酶保守结构域。AsCSLH基因在燕麦各组织中均有表达,在灌浆期籽粒中表达水平最高。推测AsCSLH基因在燕麦籽粒的β-葡聚糖合成中起重要作用。
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关键词
燕麦
β-葡聚糖合酶
基因克隆
表达分析
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职称材料
题名
fv-gs6:一个与金针菇菌柄伸长相关的葡聚糖合酶基因
被引量：
1
1
作者
龙莹
严俊杰
仝宗军
刘媛媛
苗娟
陶永新
江玉姬
谢宝贵
机构
福建农林大学生命科学学院菌物研究中心
福建农林大学园艺学院
福建农林大学食品科学学院
出处
《福建农林大学学报（自然科学版）》
CSCD
北大核心
2018年第6期698-704,共7页
基金
国家重点基础研究发展计划(2014CB138302)
福建省现代农业食用菌产业技术体系项目(K83139295)
文摘
根据金针菇(Flammulina velutipes)基因组及转录组数据,筛选得到1个β-1,6-葡聚糖合酶(β-1,6-glucan synthase)编码基因,命名为fv-gs6.该基因全长1 439 bp,含有9个外显子,8个内含子,编码339个氨基酸.多序列比对及系统进化分析结果表明:fv-gs6编码蛋白(Fv-GS6)具有β-1,6-葡聚糖合酶的保守motif,且与担子菌的β-1,6-葡聚糖合酶聚在同一个分支.生物信息学分析表明:该蛋白具备信号肽、亚细胞定位于细胞外,属于分泌蛋白;推测Fv-GS6蛋白可能直接在细胞外催化β-1,6-葡聚糖的合成.通过qRT-PCR方法检测该基因在子实体不同发育时期的表达量,结果显示:fv-gs6在菌柄上高表达,且在伸长期菌柄表达量最高;其中,菌柄的伸长区段表达量是不伸长区段的5.42倍.根据β-1,6-葡聚糖合酶在真菌细胞壁合成中的功能,推测fv-gs6的高表达可能促进细胞壁合成,参与金针菇菌柄的伸长过程.
关键词
金针菇
β-
1
6
-
葡
聚
糖
合
酶
基因结构
细胞壁
合
成
菌柄伸长
差异表达
Keywords
Flammulina velutipes
β-
1
6
-
glucan synthase
gene structure
cell wall synthesis
stipe elongation
differential ex
-
pression
分类号
S646.15 [农业科学—蔬菜学]
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职称材料
题名
燕麦葡聚糖合酶基因AsCSLH的克隆及特征分析
被引量：
6
2
作者
吴斌
张宗文
机构
中国农业科学院作物科学研究所
出处
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第4期723-728,共6页
基金
国家自然科学基金项目(30800699)
中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(2060302-17)资助
文摘
β-葡聚糖是燕麦发挥保健作用的重要功能因子,分离其合成关键基因有助于解析燕麦β-葡聚糖积累的分子机制。以高β-葡聚糖燕麦地方品种夏莜麦为材料,通过RACE和染色体步移的方法克隆了燕麦β-葡聚糖合酶基因AsCSLH及其基因组序列并分析其序列结构特征,采用半定量RT-PCR方法研究该基因组织表达特性。分离出的燕麦CSLH基因包含6个内含子,内含子剪接方式均符合GT/AG剪接规则,编码区全长2277bp,在序列上与水稻CSLH基因的编码区序列相似性最高,所预测的编码蛋白含有相关多糖合成酶保守结构域。AsCSLH基因在燕麦各组织中均有表达,在灌浆期籽粒中表达水平最高。推测AsCSLH基因在燕麦籽粒的β-葡聚糖合成中起重要作用。
关键词
燕麦
β-葡聚糖合酶
基因克隆
表达分析
Keywords
Oat （Avena sativa L.）
β-
glucan synthase
Gene cloning
Expression analysis
分类号
S512.6 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
fv-gs6:一个与金针菇菌柄伸长相关的葡聚糖合酶基因
龙莹
严俊杰
仝宗军
刘媛媛
苗娟
陶永新
江玉姬
谢宝贵
《福建农林大学学报（自然科学版）》
CSCD
北大核心
2018
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
燕麦葡聚糖合酶基因AsCSLH的克隆及特征分析
吴斌
张宗文
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011
6
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