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秦川牛及其杂种牛UCP3基因SNPs检测及其与胴体、肉质性状的相关性 被引量:9
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作者 韩瑞华 昝林森 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第6期806-812,共7页
采用PCR-SSCP技术对秦川牛(QQ)及其杂种牛西秦(XQ)、安秦(AQ)、德秦(DQ)4个群体共计229头个体UCP3基因进行SNPs多态性检测,发现了AA、AB、AC、AD 4种基因型。测序结果表明,AA基因型为纯合型;AB基因型在第820位发生C→T突变;AC基因型在第... 采用PCR-SSCP技术对秦川牛(QQ)及其杂种牛西秦(XQ)、安秦(AQ)、德秦(DQ)4个群体共计229头个体UCP3基因进行SNPs多态性检测,发现了AA、AB、AC、AD 4种基因型。测序结果表明,AA基因型为纯合型;AB基因型在第820位发生C→T突变;AC基因型在第775位发生G→A突变;AD基因型在951位发生G→T突变。方差分析结果表明,4个群体中AA基因型个体在宰前活体质量、胴体质量、胴体长、眼肌面积、系水力、大理石花纹中显著高于AB、AC、AD基因型个体(P<0.05);AB基因型个体的背膘厚显著高于AA、AC、AD基因型个体(P<0.05)。初步推断,AA基因型为优势基因型,A为优势等位基因,对选择有正向效应。 展开更多
关键词 秦川牛 ucp3基因 PCR-SSCP SNPS
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UCP3基因在巴马猪和藏猪脂肪组织中的表达和甲基化分析 被引量:5
2
作者 范一萍 王彦芳 陶聪 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2019年第12期3627-3634,共8页
为探究解偶联蛋白3(uncoupling protein 3,UCP3)基因在巴马猪和藏猪皮下脂肪组织中的表达和甲基化水平,试验采用实时荧光定量PCR技术检测UCP 3基因在巴马猪和藏猪皮下脂肪组织中的mRNA表达水平;针对猪UCP 3基因启动子区域(-3580^+920 b... 为探究解偶联蛋白3(uncoupling protein 3,UCP3)基因在巴马猪和藏猪皮下脂肪组织中的表达和甲基化水平,试验采用实时荧光定量PCR技术检测UCP 3基因在巴马猪和藏猪皮下脂肪组织中的mRNA表达水平;针对猪UCP 3基因启动子区域(-3580^+920 bp),利用在线软件MethPrimer对该区域进行CpG岛预测,并采用亚硫酸氢盐测序法(bisulfite sequencing PCR,BSP)检测其甲基化水平,探究UCP 3基因甲基化水平在巴马猪和藏猪中的差异。结果显示,巴马猪皮下脂肪组织UCP 3基因表达量显著高于藏猪(P<0.05);在UCP 3基因启动子区预测到3个CpG甲基化岛,分别是CpG island1(-3171^-2928 bp)、CpG island2(-154^-2 bp)和CpG island3(+648^+806 bp),其中CpG island1和CpG island3的甲基化水平在巴马猪和藏猪中差异较小,而藏猪CpG island2的甲基化水平(42.61%)高于巴马猪(24.49%)。本研究绘制了2个猪种CpG island2甲基化水平的黑白点图,其中CpG位点为4、8、9、10、11、12、15,藏猪甲基化频率分别比巴马猪高28.26%、17.39%、26.09%、26.09%、26.09%、23.91%和34.78%。在CpG island2处预测到3个转录因子结合位点(SP2、PPARγ和EGR1)。结果表明,巴马猪和藏猪皮下脂肪组织中UCP 3基因mRNA水平的表达差异可能是由于CpG island2的甲基化水平不同所导致,藏猪DNA甲基化水平在一定程度上阻碍了转录因子与启动子调控区域的结合,从而抑制了UCP 3基因的表达。 展开更多
关键词 巴马猪 藏猪 ucp 3基因 脂肪组织 甲基化
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G-protein beta 3 subunit polymorphisms and essential hypertension: a case-control association study in northern Han Chinese 被引量:4
3
作者 Mei LI Bei ZHANG Chuang LI Jie-Lin LIU Li-Juan WANG Ya LIU Zuo-Guang WANG Shao-Jun WEN 《Journal of Geriatric Cardiology》 SCIE CAS CSCD 2015年第2期127-134,共8页
Objective To explore the association between the three polymorphisms [ C825T, C1429T and G(-350)A] of the gene encoding the G protein beta 3 subunit (GNB3) and hypertension by performing a case-control study in th... Objective To explore the association between the three polymorphisms [ C825T, C1429T and G(-350)A] of the gene encoding the G protein beta 3 subunit (GNB3) and hypertension by performing a case-control study in the northern Han Chinese population. Methods We recnaited 731 hypertensive patients and 673 control subjects (the calculated power value was 〉 0.8). Genotyping was performed to identify C825T, C1429T and G(-350)A polymorphisms using the TaqMan assay. Comparisons of allelic and genotypic frequencies between cases and controls were made by using the chi-square test. Logistic regression analyses were performed to investigate the relationships between the three polymorphisms of GNB3 gene under different genetic models (additive, dominant and recessive models). Results The genotype dis- tribution and allele frequencies of C825T, C1429T and G(-350)A polymorphisms did not differ significantly between hypertensive patients and control subjects, either when the full sample was assessed, or when the sample was stratified by gender. No significant association was observed between C825T, C 1429T and G(-350)A polymorphisms and the risk of essential hypertension in any genetic model. Linkage dis- equilibrium was only detected between C825T and C 1429T polymorphisms. Haplotype analyses observed that none of the three estimated haplotypes significantly increased the risk of hypertension. Conclusions Our study suggested that the GNB3 gene polymorphisms [C825T, C 1429T and G(-350)A] were not significantly associated with essential hypertension in northern Han Chinese population. 展开更多
关键词 G protein beta 3 subunit gene HAPLOTYPE Hypertension POLYMORPHISM
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组织DDX5、PBX3的表达对前列腺癌术后复发的预测价值 被引量:1
4
作者 李玉梅 《罕少疾病杂志》 2024年第4期74-76,共3页
目的探讨与分析组织死亡盒蛋白5(Dead-boxpolypeptide5,DDX5)、前B细胞白血病同源盒基因3(pre-B-cell leukemia homeobox 3,PBX3)的表达对前列腺癌术后复发的预测价值。方法采用回顾性方法,2018年8月到2022年5月选择在南阳市第一人民医... 目的探讨与分析组织死亡盒蛋白5(Dead-boxpolypeptide5,DDX5)、前B细胞白血病同源盒基因3(pre-B-cell leukemia homeobox 3,PBX3)的表达对前列腺癌术后复发的预测价值。方法采用回顾性方法,2018年8月到2022年5月选择在南阳市第一人民医院诊治的前列腺癌患者90例作为研究对象,采用免疫组化法检测癌组织DDX5、PBX3表达水平。随访患者的术后复发情况并进行预测价值分析。结果90例患者随访到2022年8月,平均随访时间为16.20±2.22个月,复发10例(复发组),占比11.1%,其中吻合口复发2例,淋巴结复发9例。复发组的DDX5、PBX3表达阳性率为80.0%、90.0%,显著高于非复发组的26.3%、21.3%(P<0.05)。Spearsman分析显示DDX5、PBX3表达阳性率与术后复发存在相关性(P<0.05);COX回归分析显示DDX5、PBX3表达阳性率为影响术后复发的重要因素(P<0.05);ROC曲线显示DDX5、PBX3表达阳性率预测术后复发的曲线下面积分别为0.806、0.857。结论前列腺癌术后复发比较常见,多伴随有DDX5、PBX3的高表达,组织DDX5、PBX3的表达对前列腺癌术后复发的预测具有重要价值。 展开更多
关键词 前列腺癌 复发 预测价值 死亡盒蛋白5 前B细胞白血病同源盒基因3
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喉癌前病变及喉癌中Livin表达的意义及其与Caspase-3表达的关系 被引量:10
5
作者 周兰柱 王文忠 +1 位作者 孙哲 吴俊 《中国耳鼻咽喉头颈外科》 CSCD 2016年第3期173-174,共2页
喉癌是呼吸道上皮常见肿瘤,正常上皮由增生开始发展为恶性肿瘤,一般要经过一个量变到质变的过程,即由正常上皮→不典型增生→原位癌,其中包括一个癌前病变阶段,进年来癌前病变的研究已渐成为癌症研究的重点。喉癌前病变包括:喉白斑病... 喉癌是呼吸道上皮常见肿瘤,正常上皮由增生开始发展为恶性肿瘤,一般要经过一个量变到质变的过程,即由正常上皮→不典型增生→原位癌,其中包括一个癌前病变阶段,进年来癌前病变的研究已渐成为癌症研究的重点。喉癌前病变包括:喉白斑病、喉厚皮病、成人喉乳头状瘤、慢性肥厚性喉炎。 展开更多
关键词 喉肿瘤(Laryngeal Neoplasms) 凋亡抑制蛋白质类(Inhibitor of Appotosis proteins) 逆转录聚合酶链反应(Reverse Transcriptase POLYMERASE Chain Reaction) Caspase-3基因(Caspase-3 gene)
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甜瓜14-3-3基因家族全基因组鉴定与进化分析 被引量:4
6
作者 马勇 刘嘉荣 +1 位作者 巴德仁贵 哈斯阿古拉 《广东农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第24期104-111,共8页
以拟南芥的14-3-3蛋白保守结构域为探针序列,对甜瓜全基因组的蛋白质数据库进行搜索,获得9个14-3-3蛋白序列,其中ε类5个、非ε类4个。对甜瓜14-3-3基因家族进行了系统发生分析、内含子数量分析、序列相似性比对,通过对所有甜瓜的14-3-... 以拟南芥的14-3-3蛋白保守结构域为探针序列,对甜瓜全基因组的蛋白质数据库进行搜索,获得9个14-3-3蛋白序列,其中ε类5个、非ε类4个。对甜瓜14-3-3基因家族进行了系统发生分析、内含子数量分析、序列相似性比对,通过对所有甜瓜的14-3-3蛋白相匹配的Unigene分析后发现,部分基因在多种组织中均有表达,部分基因在甜瓜果实以及花中高丰度特异表达,而且不同成员之间的表达模式存在较大差异。甜瓜14-3-3基因家族成员的分子进化及表达模式的研究结果表明基因重复后发生功能分化。 展开更多
关键词 甜瓜 14—33蛋白 基因家族 进化分析
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新疆盐生植物猪毛菜逆向运输蛋白基因SaNHX1 3’-RACE的克隆及序列分析 被引量:3
7
作者 张雨良 罗淑萍 +3 位作者 杨峰山 魏岩 袁辉 郭长奎 《新疆农业科学》 CAS CSCD 2008年第3期511-516,共6页
以新疆盐生植物猪毛菜(Salsola collina Pall.)为材料提取总RNA,根据NHX1家族同源序列保守区设计1对简并引物,进行RT-PCR扩增,得到猪毛菜逆向运输蛋白基因cDNA中间一段619 bp序列。再用快速扩增cDNA 3’末端(3’RACE)方法,得到约1 000 b... 以新疆盐生植物猪毛菜(Salsola collina Pall.)为材料提取总RNA,根据NHX1家族同源序列保守区设计1对简并引物,进行RT-PCR扩增,得到猪毛菜逆向运输蛋白基因cDNA中间一段619 bp序列。再用快速扩增cDNA 3’末端(3’RACE)方法,得到约1 000 bp 3’末端序列。将两段序列进行拼接,得到猪毛菜长为1 585bp(Gen Bank登陆号为EU072932)的逆向运输蛋白基因(SaNHX1)cDNA序列,编码370个氨基酸,其编码序列、氨基酸序列与同科耐盐植物盐角草相应序列同源性为85%和87%,研究为进一步克隆猪毛菜NHX1全基因序列和研究其功能打下基础。 展开更多
关键词 猪毛菜 逆向运输蛋白 SaNHX1基因 3’-RACE 克隆
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PI3K/AKT/FoxO信号通路在胰岛素类似生长因子1调节神经细胞PRNP基因表达中的作用 被引量:9
8
作者 蒋国红 王长明 张丽 《山东医药》 CAS 北大核心 2017年第11期19-21,共3页
目的探讨磷脂酰肌醇3激酶(PI3K)/蛋白激酶B(AKT)/叉头状转录因子O亚家族蛋白(Fox O)信号通路在胰岛素类似生长因子1(IGF-1)调节神经细胞PC12细胞株PRNP基因表达中发挥的作用。方法将对数生长期的PC12细胞分为IGF-1组、实验1组和实验2组... 目的探讨磷脂酰肌醇3激酶(PI3K)/蛋白激酶B(AKT)/叉头状转录因子O亚家族蛋白(Fox O)信号通路在胰岛素类似生长因子1(IGF-1)调节神经细胞PC12细胞株PRNP基因表达中发挥的作用。方法将对数生长期的PC12细胞分为IGF-1组、实验1组和实验2组和对照组。IGF-1组加入终浓度80 ng/m L的IGF-1;实验1、2组先加入25、50μmol/L的PI3K/AKT/Fox O信号通路抑制剂LY294002,37℃培养30 min后再滴入80 ng/m L的IGF-1。对照组不加药物。继续培养24 h。采用实时荧光定量PCR法测算各组PC12细胞PRNP mRNA相对表达量,采用Western blotting法测算各组PC12细胞AKT、磷酸化AKT(p AKT)、Fox O3a和磷酸化Fox O3a(p Fox O3a)蛋白相对表达量。结果 IGF-1组PC12细胞PRNP mRNA及p AKT、p Fox O3a蛋白相对表达量高于对照组(P均<0.05)。实验1、2组PC12细胞PRNP mRNA及p AKT、p Fox O3a蛋白相对表达量低于IGF-1组(P均<0.05),且实验2组低于实验1组(P均<0.05)。结论 IGF-1通过磷酸化PI3K/AKT/Fox O信号通路蛋白AKT、Fox O3a调节PC12细胞PRNP基因表达。 展开更多
关键词 磷脂酰肌醇3激酶 蛋白激酶B 叉头状转录因子O亚家族蛋白 胰岛素样生长因子1 PRNP基因
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日本血吸虫14-3-3蛋白质编码基因在原核细胞中的表达 被引量:3
9
作者 汪学龙 沈继龙 蒋作君 《安徽医学》 2001年第2期5-7,共3页
目的 :为了寻找日本血吸虫病新的诊断和候选疫苗分子 ,克隆日本血吸虫 14 -3 -3蛋白质编码基因 ,并进行表达。方法 :提取日本血吸虫成虫RNA ,设计合成引物 ,用RT -PCR法扩增出日本血吸虫 14 -3 -3抗原 (Sj14 -3 -3 )基因编码序列 ,将其... 目的 :为了寻找日本血吸虫病新的诊断和候选疫苗分子 ,克隆日本血吸虫 14 -3 -3蛋白质编码基因 ,并进行表达。方法 :提取日本血吸虫成虫RNA ,设计合成引物 ,用RT -PCR法扩增出日本血吸虫 14 -3 -3抗原 (Sj14 -3 -3 )基因编码序列 ,将其克隆入pGEM -T载体 ,然后在真核表达载体 pBKCMV中亚克隆 ,用IPTG诱导表达 ,SDS -PAGE观察表达结果。结果 :RT -PCR法扩增出一条大小约 765bp的特异性片断 ,克隆质粒pGEM -Sj14 -3 -3和真核表达质粒pBKCMV经双酶切和以重组质粒为模板进行PCR扩增 ,均可获得一条与PCR产物一致的DNA片段 ,诱导表达后 ,经SDS -PAGE可见一条约 3 2 5kDa大小的融合蛋白条带。结论 :本实验成功地克隆了日本血吸虫 14 -3 -3抗原的编码基因 ,并在原核细胞中进行表达 ,为进一步的免疫诊断和核酸疫苗研究奠定了基础。 展开更多
关键词 日本血吸虫 14-3-3蛋白质 基因克隆 原核细胞
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Caspase-3在黄鳝性腺性逆转过程中的表达及定位分析 被引量:2
10
作者 何智 何治德 +3 位作者 何亮 阮会斌 李松 严太明, 《淡水渔业》 CSCD 北大核心 2019年第3期8-13,共6页
为探究黄鳝( Monopterus albus )Caspase-3在性腺性逆转发育过程中的功能和作用,实验扩增黄鳝 caspase-3 的部分序列,检测了其在不同发育时期性腺中mRNA表达水平、蛋白相对含量以及表达位置。通过PCR扩增获得黄鳝 caspase-3 基因cDNA序... 为探究黄鳝( Monopterus albus )Caspase-3在性腺性逆转发育过程中的功能和作用,实验扩增黄鳝 caspase-3 的部分序列,检测了其在不同发育时期性腺中mRNA表达水平、蛋白相对含量以及表达位置。通过PCR扩增获得黄鳝 caspase-3 基因cDNA序列,推导的氨基酸序列对比发现,黄鳝 caspase-3 与大黄鱼( Larimichthys crocea )和鳜( Siniperca chuatsi )亲缘关系最近。实时定量PCR ( qRT-PCR)结果显示, caspase-3 mRNA在黄鳝各发育时期性腺中均有表达,在卵黄生成期性腺中表达量最高,并伴随性腺向雄性发育表达量呈下降的趋势;而其蛋白相对含量在性腺性逆转过程中呈现逐渐上升的趋势,间性晚期最高。免疫组织化学染色结果显示,Caspase-3蛋白阳性信号定位于卵黄生成期卵母细胞细胞质、皮质小泡期卵母细胞的细胞核和颗粒细胞,以及各个发育时期性腺中初级生长期卵母细胞的细胞质和细胞核。综上,Caspase-3与黄鳝性逆转过程关系密切,推测其可能参与了性逆转过程中卵母细胞的凋亡过程。 展开更多
关键词 黄鳝(Monopterusalbus) Casaspe-3 基因表达 蛋白定位
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G蛋白β_3亚单位基因多态性与高血压病及降压疗效的关系 被引量:5
11
作者 李东宝 华琦 《医学研究生学报》 CAS 2003年第9期692-695,共4页
G蛋白参与多种细胞信息传递 ,引发多种生物学效应。G蛋白 β3 亚单位基因 (GNB3)多态性与高血压病及其并发症密切相关 ,而且可能与降压疗效的个体差异存在联系。
关键词 G蛋白Β3亚单位 基因多态性 高血压
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日本血吸虫14-3-3蛋白epsilon亚型基因扩增及表达载体的构建 被引量:1
12
作者 唐小牛 汪学龙 +1 位作者 沈继龙 蒋作君 《皖南医学院学报》 CAS 2002年第3期171-173,共3页
目的 扩增日本血吸虫 1 4 3 3蛋白epsilon亚型编码基因并构建其表达载体 ,以研究其在血吸虫信号转导以及免疫预防和诊断方面的作用。方法 以日本血吸虫成虫总RNA为模板逆转录合成cDNA链 ,设计合成引物 ,用PCR法扩增 1 4 3 3蛋白epsi... 目的 扩增日本血吸虫 1 4 3 3蛋白epsilon亚型编码基因并构建其表达载体 ,以研究其在血吸虫信号转导以及免疫预防和诊断方面的作用。方法 以日本血吸虫成虫总RNA为模板逆转录合成cDNA链 ,设计合成引物 ,用PCR法扩增 1 4 3 3蛋白epsilon亚型基因编码序列 ,将其克隆入pGEM T载体 ,双酶切和以质粒为模板的PCR鉴定后 ,将基因片段亚克隆入表达载体pBK CMV ,转染大肠杆菌BL2 1 ,经双酶切后鉴定。结果 RT PCR扩增出一条约 753bp的特异性条带 ,TA克隆重组质粒的双酶切和以质粒为模板的PCR均获得了一条与RT PCR扩增出大小相同条带 ,pBK Sj1 4 3 3表达载体经双酶切后也同样获得了一条约 753bp的特异性条带。 结论 在体外成功的扩增了日本血吸虫 1 4 3 3蛋白epsilon亚型编码基因并构建了 pBK Sj1 4 3 3表达载体 ,为进一步的免疫预防和免疫诊断研究提供了条件。 展开更多
关键词 日本血吸虫 714-3-3蛋白 epsilon亚型 基因扩增 表达载体 免疫预防 免疫诊断
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RNA干扰survivin基因对宫颈癌细胞中survivin蛋白表达及caspase-3酶活性的影响 被引量:4
13
作者 李元宏 常冰梅 《中国医药导报》 CAS 2012年第22期22-23,43,共3页
目的观察RNA干扰survivin基因对宫颈癌细胞中survivin蛋白表达及caspase-3酶活性的影响。方法针对survivin mRNA序列设计合成3对编码小干扰RNA(siRNA)的DNA模板,构建shRNA重组质粒,转染Hela细胞,筛选获得转染效率最高的阳性克隆,阴性对... 目的观察RNA干扰survivin基因对宫颈癌细胞中survivin蛋白表达及caspase-3酶活性的影响。方法针对survivin mRNA序列设计合成3对编码小干扰RNA(siRNA)的DNA模板,构建shRNA重组质粒,转染Hela细胞,筛选获得转染效率最高的阳性克隆,阴性对照为阳性克隆随机打乱序列。Western blot方法检测survivin蛋白表达,分光光度法检测caspase-3酶活性。结果干扰48 h时,siRNA-168载体干预组干预效果最好,siRNA阳性质粒干扰组(实验组)survivin蛋白表达量为阴性对照组中survivin蛋白表达量的13%,是空白组survivin蛋白表达量的16%。干扰后caspase-3活性表达升高,实验组与阴性对照组、实验组与空白组相比差异均有统计学意义(P<0.05)。结论siRNA可有效抑制Hela细胞survivin蛋白表达,升高caspase-3酶活性。 展开更多
关键词 SURVIVIN基因 宫颈癌细胞 SURVIVIN蛋白 CASPASE-3
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建兰花叶病毒外壳蛋白基因和3'UTR序列测定与分析 被引量:1
14
作者 郑国华 苏勇波 +2 位作者 郑志忠 彭德伟 明艳林 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2013年第2期13-19,共7页
采用单链构象多态性分析从建兰花叶病毒(Cymbidium mosaic virus,CyMV)的8个分离物筛选得到5个存在遗传变异的分离物,并测定了外壳蛋白(coat protein,CP)基因和3′非编码区(3′UTR)序列,经序列分析表明5个分离物与其他分离物间的CP核苷... 采用单链构象多态性分析从建兰花叶病毒(Cymbidium mosaic virus,CyMV)的8个分离物筛选得到5个存在遗传变异的分离物,并测定了外壳蛋白(coat protein,CP)基因和3′非编码区(3′UTR)序列,经序列分析表明5个分离物与其他分离物间的CP核苷酸和氨基酸序列相似性分别为87.1%~99.9%和91.1%~99.6%,属于亚组A成员。CP基因不同片段受到正选择压力的作用不一样,C端受到负选择压力的作用不易发生变异,而N端受到正选择压力的作用容易发生变异。通过RNAsharpes软件分析3′UTR序列发现各分离物均形成带有Potexvirus属保守核苷酸序列"AC(C/T)TAA"的三叶草茎环结构,这种结构的功能可能与病毒RNA复制有关。 展开更多
关键词 建兰花叶病毒 外壳蛋白基因 3'非编码区 分子变异
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猪蛋白编码基因3’UTR中IRPRE1元件的鉴定及其基因特征分析 被引量:1
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作者 赵为民 曹静 +5 位作者 邢菲 王丽 任守文 付言峰 李碧侠 方晓敏 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2020年第3期336-342,共7页
为鉴定猪全基因组范围内蛋白编码基因3’UTR(3’-untranslated region)中反向重复PRE1(inverted repeated PRE1,IRPRE1)元件,对猪全基因组的22342个蛋白编码基因的3’UTR序列进行重复序列元件的生物信息学分析。结果表明:猪蛋白编码基因... 为鉴定猪全基因组范围内蛋白编码基因3’UTR(3’-untranslated region)中反向重复PRE1(inverted repeated PRE1,IRPRE1)元件,对猪全基因组的22342个蛋白编码基因的3’UTR序列进行重复序列元件的生物信息学分析。结果表明:猪蛋白编码基因的3’UTR序列中短散在重复序列与简单重复序列在重复序列的类别中所占比例较高,分别为27.58%与31.08%;在SINE/t RNA的重复元件中,Pre0_SS和PRE1x元件所占的比例较高,分别为41.83%和37.51%;共有1 094个候选蛋白编码基因的3’UTR中含有IRPRE1元件;GO分析发现这些候选基因主要参与m RNA经由剪接体的剪接、细胞分裂、RNA通过酯交换反应发生的剪接、T细胞激活、RNA剪接、T细胞受体信号通路、对糖苷反应、甘油三酯稳态、外源性凋亡信号通路的正调节及胆固醇合成等生物过程;KEGG pathway分析发现这些候选基因参与了缬草碱、亮氨酸和异亮氨酸降解途径、TNF信号通路、T细胞受体信号通路、RIG-I样受体信号通路、吞噬体、剪接体、胆汁分泌、甲状腺激素合成和凋亡;对3个蛋白编码基因的3’UTR中的IRPRE1元件进行鉴定发现,其在多个组织中广泛表达。 展开更多
关键词 蛋白编码基因 3’UTR IRPRE1元件 特征分析
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基于Tet-On 3G的IFITM3诱导表达MDCK细胞系的建立及功能分析 被引量:1
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作者 曹婷婷 杜寿文 +11 位作者 许汪 邢彬 赵飞 王茂鹏 朱羿龙 白杰英 田宇飞 刘立明 赵翠青 周义发 李昌 金宁一 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2017年第5期770-777,共8页
利用Tet-On 3G系统构建了含人IFITM3基因的真核表达质粒pTRE3G-IFITM3,并将其与调控质粒pLVX-Tet3G共转染犬肾细胞(MDCK),转染后48 h用G418和嘌呤霉素进行筛选,用多西环素(Dox)对获得的细胞系进行诱导表达鉴定,并进行Dox敏感性分析、IFI... 利用Tet-On 3G系统构建了含人IFITM3基因的真核表达质粒pTRE3G-IFITM3,并将其与调控质粒pLVX-Tet3G共转染犬肾细胞(MDCK),转染后48 h用G418和嘌呤霉素进行筛选,用多西环素(Dox)对获得的细胞系进行诱导表达鉴定,并进行Dox敏感性分析、IFITM3^+细胞百分数及定位分析.用含萤光素酶(Luciferase)报告基因的禽流感病毒H5/H7蛋白或VSV G蛋白包裹的假型慢病毒颗粒进行感染实验,检测萤光素酶活性.结果表明,筛选获得了携带人IFITM3的MDCK诱导表达细胞系,且IFITM3表达量与Dox剂量和诱导时间相关;确定Dox工作浓度为2.5μg/mL,诱导12 h时IFITM3^+细胞数达75%以上,且IFITM3在晚期内体/溶酶体存在分布;假型病毒感染及萤光素酶活性分析表明,IFITM3可显著抑制禽流感病毒H5,H7和VSV G蛋白介导的病毒进入,为深入探究其具体的抑制机制奠定了基础. 展开更多
关键词 干扰素诱导跨膜蛋白3 干扰素刺激基因 诱导表达 病毒进入 抑制
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猪神经元蛋白3.1基因3'侧翼区多聚腺苷酸数目多态性及其与肉质性状的关系
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作者 杨云 曾勇庆 +4 位作者 张哲 徐正刚 陈伟 房国锋 王守栋 《浙江大学学报(农业与生命科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期237-244,共8页
选取54头莱芜猪和40头鲁莱黑猪,宰后测定肉质性状,利用聚合酶链反应及单链构象多态性(polymerase chain reaction-single strand conformation polymorphism,PCR-SSCP)技术检测其神经元蛋白3.1(neuronal protein 3.1,P311)基因3'侧... 选取54头莱芜猪和40头鲁莱黑猪,宰后测定肉质性状,利用聚合酶链反应及单链构象多态性(polymerase chain reaction-single strand conformation polymorphism,PCR-SSCP)技术检测其神经元蛋白3.1(neuronal protein 3.1,P311)基因3'侧翼区2个多聚腺苷酸(poly A)结构的长度多态性,测序确定连续腺苷酸的数目,并与肉质性状进行关联分析,以期发现有效多态位点.结果表明:1)在莱芜猪和鲁莱黑猪中共检测出2个连续腺苷酸数目的多态位点poly A-L1和poly A-L2,两者的poly A数目分别为18、15和15、12,2个位点的3种基因型分别记为poly A-L1位点的MM型、NN型和MN型,以及poly A-L2位点的BB型、DD型和BD型;这2个多态位点在莱芜猪和鲁莱黑猪群体中均处于哈代-温伯格平衡(P>0.05),其多态性在2个猪种间的分布差异在统计学上均不显著.2)莱芜猪poly A-L1位点的3种基因型之间在肉质性状上均未表现出统计学上的显著差异,但MN型个体各项肉质性状普遍优于2个纯合型,肉质较好,鲁莱黑猪中的结果与此相同.3)莱芜猪poly A-L2位点的3种基因型之间在肉质性状上均未表现出统计学上的显著差异,但鲁莱黑猪在该位点处的失水率和烹饪损失指标在统计学上差异显著,其中DD型个体的失水率显著高于BD型个体,BB型和DD型个体的烹饪损失显著高于BD型,其余各指标的基因型间在统计学上差异不显著.总之,在这2个位点处普遍表现为杂合型的肉质性状优于纯合型,生产中应重视2个纯合型个体间的杂交利用,以产生更多肉质优良的杂合型个体. 展开更多
关键词 神经元蛋白3.1基因 3′侧翼区 多态性 肉质性状
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胃癌患者血清DKK-1、HE4、PARP-1、LAG-3表达水平及其与临床病理特征的相关性研究 被引量:4
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作者 米彩锋 余儒桓 +1 位作者 李亚利 余守雅 《内科》 2022年第6期614-617,共4页
目的分析胃癌患者血清DKK-1、人附睾蛋白(HE)4、多腺苷二磷酸核糖聚合酶(PARP)-1和淋巴细胞活化基因(LAG)-3水平及其与临床病理特征的关系。方法选取60例胃癌患者作为研究组,另选60例同期进行健康体检的体检者作为对照组。比较两组研究... 目的分析胃癌患者血清DKK-1、人附睾蛋白(HE)4、多腺苷二磷酸核糖聚合酶(PARP)-1和淋巴细胞活化基因(LAG)-3水平及其与临床病理特征的关系。方法选取60例胃癌患者作为研究组,另选60例同期进行健康体检的体检者作为对照组。比较两组研究对象、不同临床病理特征胃癌患者的血清DKK-1、HE4、PARP-1和LAG-3的表达水平,并分析胃癌患者预后的影响因素。结果研究组血清DKK-1、HE4、PARP-1、LAG-3水平均高于对照组(均P<0.05)。不同TNM分期、胃癌细胞分化程度、淋巴结转移情况胃癌患者的血清DKK-1、HE4、PARP-1、LAG-3水平差异均有统计学意义(均P<0.05)。TNM分期Ⅲ~Ⅳ期胃癌患者的血清DKK-1、HE4、PARP-1水平均高于Ⅰ~Ⅱ期胃癌患者,血清LAG-3水平低于Ⅰ~Ⅱ期胃癌患者;胃癌细胞分化程度越高,患者的血清DKK-1、HE4、PARP-1表达水平越高,血清LAG-3表达水平越低;伴有淋巴结转移胃癌患者的血清DKK-1、HE4、PARP-1、LAG-3水平均高于无淋巴结转移患者(均P<0.05)。多因素logistic回归分析结果显示,TNM分期和血清DKK-1、HE4、PARP-1、LAG-3水平是胃癌患者死亡的独立危险因素(均P<0.05)。结论胃癌患者血清DKK-1、HE4、PARP-1、LAG-3呈高表达水平,其与胃癌的临床分期、淋巴结转移、胃癌细胞分化程度密切相关,均为胃癌患者死亡的独立危险因素。 展开更多
关键词 胃癌 DKK-1 人附睾蛋白4 多腺苷二磷酸核糖聚合酶-1 淋巴细胞活化基因3 预后
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TMV蚕豆株系CP基因及3′端非编码区序列分析与表达
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作者 刘勇 周雪平 +1 位作者 李德葆 刘志敏 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 1997年第1期1-8,共8页
根据烟草花叶病毒U1株系TMV-U1序列,人工合成引物,通过PCR扩增并克隆了烟草花叶病毒蚕豆株系(TMV-B)的外壳蛋白(CP)基因和3′端非编码区.DNA全序列测定结果表明,外壳蛋白基因全长459个碱基,编码15... 根据烟草花叶病毒U1株系TMV-U1序列,人工合成引物,通过PCR扩增并克隆了烟草花叶病毒蚕豆株系(TMV-B)的外壳蛋白(CP)基因和3′端非编码区.DNA全序列测定结果表明,外壳蛋白基因全长459个碱基,编码151个氨基酸,3′端非编码区全长224个碱基.与TMV-U1株系相比,TMV-B仅在CP基因上有一个碱基缺失,并导致CP基因提前终止,使其编码的氨基酸少7个.将CP基因及3′端非编码区插入pGEMEX-1的T7基因10中,转入E.coli后诱导表达,聚丙烯酰胺凝胶电泳分析呈现一特异的蛋白带.Western免疫检测证明,该特异带与TMV抗血清呈阳性反应.将CP基因正向插入植物表达载体PBⅠ121中,置于花椰菜花叶病毒35S启动子控制之下。 展开更多
关键词 遗传工程 烟草花叶病毒 外壳蛋白基因 蚕豆
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猪H-FABP基因intron3全序列测定
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作者 杨文平 张家琦 +5 位作者 李彩桃 王明艳 张红梅 李超 曹果清 周忠孝 《安徽农业科学》 CAS 2012年第5期2731-2732,共2页
[目的]为将H-FABP基因应用于猪育种过程中的标记辅助选择提供基础资料。[方法]根据GenBank数据库上公开发表的相关的猪H-FABP基因序列设计特异性扩增引物,对H-FABP基因内含子3的PCR产物纯化后直接进行测序。[结果]成功扩增出猪H-FABP基... [目的]为将H-FABP基因应用于猪育种过程中的标记辅助选择提供基础资料。[方法]根据GenBank数据库上公开发表的相关的猪H-FABP基因序列设计特异性扩增引物,对H-FABP基因内含子3的PCR产物纯化后直接进行测序。[结果]成功扩增出猪H-FABP基因intron 3的全序列,全长为1 350 bp,已向GenBank数据库提交,检索号为DQ 002993。[结论]该研究为确定影响肌内脂肪沉积的主效基因奠定了理论基础。 展开更多
关键词 H-FABP基因 intron3 全序列测定
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