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J亚群禽白血病SYBR GreenⅠ荧光定量PCR检测方法的建立 被引量:4
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作者 王莉 黄安宁 +2 位作者 李槿年 张丹俊 刘雪兰 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第9期733-737,共5页
为建立一种能够快速、灵敏和特异地检测J亚群禽白血病病毒(ALV-J)的SYBR GreenⅠ荧光定量PCR方法,本研究以ALV-J原型病毒株HPRS-103的pol基因3'端与gp85编码基因之间的保守区域(5 258 bp~5 802 bp)为检测目的片段,构建重组质粒并... 为建立一种能够快速、灵敏和特异地检测J亚群禽白血病病毒(ALV-J)的SYBR GreenⅠ荧光定量PCR方法,本研究以ALV-J原型病毒株HPRS-103的pol基因3'端与gp85编码基因之间的保守区域(5 258 bp~5 802 bp)为检测目的片段,构建重组质粒并作为靶基因,通过对其浓度、引物浓度和退火温度的优化,建立了ALV-J SYBR GreenⅠ荧光定量PCR方法。结果显示该方法的最低检测限度为2.36×102拷贝/μL,比普通PCR高100倍;与其他禽源病毒无交叉反应;批内和批间变异系数均小于5%。表明本研究建立的方法具有良好的特异性、稳定性和灵敏性。采用该方法对100只临床病鸡进行检测,ALV的检出率为44%。随机选择10只感染阳性鸡,检测病毒基因在心脏、肝脏、脾脏、肺脏和肾脏中的分布与表达水平,结果表明ALV-J在各主要脏器中均有分布,但以肾脏中的病毒表达量最高。 展开更多
关键词 J亚群禽白血病病毒 SYBR Green 荧光定量PCR 病毒基因表达水平
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QRT-PCR检测目的基因mRNA转录水平的应用 被引量:3
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作者 韩天龙 王敏 李志明 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2011年第30期18432-18434,共3页
[目的]详细介绍One Step SYBR Green I实时荧光定量聚合酶链式反应(Real-time Quantitative Reverse Transcription PolymeraseChain Reaction,简称QRT-PCR)在定量检测靶基因mRNA转录水平上的应用。[方法]从样品准备、引物设计、核酸提... [目的]详细介绍One Step SYBR Green I实时荧光定量聚合酶链式反应(Real-time Quantitative Reverse Transcription PolymeraseChain Reaction,简称QRT-PCR)在定量检测靶基因mRNA转录水平上的应用。[方法]从样品准备、引物设计、核酸提取、反应体系构建、反应条件确定、标准曲线建立和目的基因定量等方面进行了分析。[结果]决定QRT-PCR反应成功与否的几个关键因素有模板的质量、底物的质量与浓度、引物的质量、酶和Mg2+、反应条件的优化。[结论]为畜牧兽医工作者利用分子生物学技术揭示疫病的发生机制和发病机理提供了技术参考,为基因表达的相对定量研究提供了方法支持。 展开更多
关键词 QRT-PCR 荧光定量 基因表达 转录水平
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芹菜品种‘津南实芹’AgICE1基因的克隆及其对非生物胁迫的响应 被引量:3
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作者 杨青青 刘洁霞 +3 位作者 徐志胜 冯凯 黄莹 熊爱生 《植物资源与环境学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期16-24,共9页
从芹菜(Apium graveolens Linn.)品种‘津南实芹’(‘Jinnan Shiqin’)叶片RNA中克隆获得1个转录因子基因,命名为AgICE1。序列分析结果显示:AgICE1基因含有1个长度为1 455 bp的开放阅读框(ORF),编码484个氨基酸。AgICE1转录因子氨基酸... 从芹菜(Apium graveolens Linn.)品种‘津南实芹’(‘Jinnan Shiqin’)叶片RNA中克隆获得1个转录因子基因,命名为AgICE1。序列分析结果显示:AgICE1基因含有1个长度为1 455 bp的开放阅读框(ORF),编码484个氨基酸。AgICE1转录因子氨基酸序列的理论相对分子质量为53 140,理论等电点为pI 5.09,为亲水性蛋白。AgICE1转录因子的氨基酸组成中脂肪族氨基酸的比例最高,酸性氨基酸的比例次之,碱性氨基酸的比例较低,芳香族氨基酸的比例最低。序列比对与系统进化分析结果表明:ICE1转录因子在不同植物中高度保守。实时荧光定量PCR检测结果表明:AgICE1基因在叶片中的相对表达水平显著高于在根和叶柄中的相对表达水平;在高温(38℃)、低温(4℃)、干旱(质量体积分数20%PEG6000)和高盐(0.2 mol·L^(-1) NaCl)处理下,AgICE1基因的相对表达水平总体上升高。研究结果表明:AgICE1转录因子在芹菜非生物胁迫调控中起重要作用。 展开更多
关键词 芹菜 AgICE1转录因子 基因克隆 非生物胁迫 相对表达水平
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酿酒葡萄‘赤霞珠’VvbHLH 93基因的克隆及分析 被引量:2
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作者 徐学蕾 鞠延仑 +2 位作者 王婉妮 吴今人 房玉林 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第11期1844-1850,共7页
bHLH93转录因子参与调节植物的生长发育、应对各种胁迫等多种生理过程,该研究以酿酒葡萄‘赤霞珠’为试验材料,采用RT-PCR方法克隆葡萄VvbHLH 93基因全长,并进行生物信息学分析;用qRT-PCR法分析bHLH93在不同组织和果实不同发育时期的表... bHLH93转录因子参与调节植物的生长发育、应对各种胁迫等多种生理过程,该研究以酿酒葡萄‘赤霞珠’为试验材料,采用RT-PCR方法克隆葡萄VvbHLH 93基因全长,并进行生物信息学分析;用qRT-PCR法分析bHLH93在不同组织和果实不同发育时期的表达量,为进一步探索VvbHLH 93基因的功能及其机制奠定基础。结果表明:(1)成功克隆获得葡萄VvbHLH 93,该基因cDNA全长为1319 bp,开放阅读框长度为939 bp,编码312个氨基酸,相对分子量为35.18 kD,理论等电点为4.68,无信号肽和跨膜域,属于bHLH转录因子家族。(2)葡萄bHLH93蛋白与荷花的亲缘关系较近;VvbHLH93蛋白的C端为酸性结构区,富含丝氨酸、苏氨酸磷酸化位点;VvbHLH 93基因的启动子含有光响应元件和低温、干旱、赤霉素等应答元件。(3)qRT-PCR分析表明,VvbHLH 93在‘赤霞珠’中的表达具有组织特异性,在叶片中基本不表达,在茎中的表达量最高;随着赤霞珠葡萄果实的发育成熟,VvbHLH93相对表达量不断降低,到幼果期(直径>2 mm)后第5周开始相对表达量基本为0,总体呈现降低的变化趋势;与对照相比,在低温胁迫、盐胁迫、高温胁迫及充分灌溉胁迫下VvbHLH 93表达量显著降低。研究推测,VvbHLH 93基因可能是葡萄抗逆胁迫的负转录因子。 展开更多
关键词 赤霞珠 转录因子 VvbHLH 93 基因克隆 表达分析
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