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茄子及其近缘野生种遗传多样性的SRAP分析
被引量：
10
1
作者
房超
李跃建
+4 位作者
帅波
刘独臣
刘小俊
梁根云
杨宏
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2011年第5期1853-1860,共8页
应用SRAP分子标记技术对87份来茄子及其近缘野生种进行了遗传多样性分析。结果显示,从88对SRAP引物中筛选出18对多态性高、稳定性好的引物组合,共检测出309清晰个位点,平均每对引物检测到17.2个扩增位点。.参试茄属植物种质群体位点的...
应用SRAP分子标记技术对87份来茄子及其近缘野生种进行了遗传多样性分析。结果显示,从88对SRAP引物中筛选出18对多态性高、稳定性好的引物组合,共检测出309清晰个位点,平均每对引物检测到17.2个扩增位点。.参试茄属植物种质群体位点的平均杂合度为0.6962;平均多态信息含量为0.6441。82份栽培种茄子材料的平均相似系数为0.822,表明茄子栽培种的基因库较小,遗传基础较为狭窄。聚类分析结果表明,87份材料可分成4大类,可以较好地将茄子栽培种与其近缘野生种分开,并且基本可将高级栽培种(S.melongena L.subsp.melongena)和原始栽培种(S.melongena L.subsp.ovigerum Salis)在亚种水平上区分开来。由此可见,SRAP标记在茄子遗传研究中是一种经济、有效和可靠的分子标记手段。
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关键词
茄子
遗传多样性
srap
(
sequence-related
amplified
polymorphism
)
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职称材料
利用SRAP分子标记研究美洲海蓬子实生群体遗传多样性
被引量：
5
2
作者
张旭
邢锦城
+3 位作者
陈健华
余桂红
张春银
马鸿翔
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2009年第6期1252-1257,共6页
选取28株不同形态的海蓬子株系,调查植株高度、分枝夹角、果荚长度等生物性状,并采用SRAP技术对海蓬子株系进行遗传多样性分析。测定数据显示,海蓬子的不同株系在植株高度、分枝夹角、果荚长度均存在显著差异。SRAP标记多态条带比率(PPB...
选取28株不同形态的海蓬子株系,调查植株高度、分枝夹角、果荚长度等生物性状,并采用SRAP技术对海蓬子株系进行遗传多样性分析。测定数据显示,海蓬子的不同株系在植株高度、分枝夹角、果荚长度均存在显著差异。SRAP标记多态条带比率(PPB)、Shannon多样性指数(I)以及Nei氏基因多样度(h)均显示海蓬子实生群体具有较为丰富的遗传多样性。SRAP标记相似系数变异范围为0.42～0.92。以相似系数平均值0.76为阈值,可将所有供试材料划分为11个亚类,表明海蓬子不同株系间存在明显的表型差异与遗传多样性。建议在实生群体内通过选择来培育海蓬子新品种。
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关键词
盐生植物
海蓬子
遗传多样性
srap
标记
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职称材料
基于SCAR标记和DNA条形码技术的苍术基原鉴别研究
3
作者
陈研
冯露露
+1 位作者
黄荣
齐伟辰
《世界科学技术-中医药现代化》
CSCD
北大核心
2024年第2期490-501,共12页
目的开发出能同时鉴别北苍术和关苍术的分子标记方法,并探究不同种质资源苍术的遗传进化关系。方法对不同地区北苍术Atractylodes chinensis(Bunge)Koidz及关苍术A.japonica Koidz.ex Kitam基因组DNA的差异片段进行测序,结合SRAP、ISSR...
目的开发出能同时鉴别北苍术和关苍术的分子标记方法,并探究不同种质资源苍术的遗传进化关系。方法对不同地区北苍术Atractylodes chinensis(Bunge)Koidz及关苍术A.japonica Koidz.ex Kitam基因组DNA的差异片段进行测序,结合SRAP、ISSR、DAMD分子标记方法,优化PCR反应体系,筛选并转换成特异性标记,同时,采用条形码方法分析种间序列差异。结果通过SRAP、ISSR、DAMD三种分子标记方法的PCR扩增,共筛选出198对能稳定扩增且重现性好的引物,转换出7对能稳定、快速鉴别北苍术和关苍术的SCAR引物。条形码方法检测出北苍术ITS2序列长度为454 bp,关苍术ITS2序列长度为453 bp,与其他苍术属植物之间遗传距离较远。NJ树结果显示,北苍术、关苍术及其他苍术属植物均各自聚为一支,表现出良好的单系性。依据ITS2二级结构,4种苍术属植物在螺旋区的茎环数目、大小、位置均有明显差异,可以直观地进行区分。结论所开发的特异性SCAR标记为苍术属植物优良品种的筛选提供了新方法,DNA条形码能稳定、准确鉴别北苍术。
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关键词
北苍术
关苍术
Internal
transcribed
spacer
2(ITS2)
sequence-related
amplified
polymorphism
(
srap
)
Inter-simple
sequence
repeat(ISSR)
Direct
amplifi
cation
of
minisatellite
region
DNA(DAMD)
Sequence
characterized
amplified
regions(SCAR)
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职称材料
题名
茄子及其近缘野生种遗传多样性的SRAP分析
被引量：
10
1
作者
房超
李跃建
帅波
刘独臣
刘小俊
梁根云
杨宏
机构
四川省农业科学院园艺研究所
蔬菜品种改良与种质创新四川省重点实验室
四川省农业科学院
四川省仁寿县宝马乡农办
出处
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2011年第5期1853-1860,共8页
基金
国家大宗蔬菜产业技术体系专项资金项目(CARS-25)
四川省"十二五"农作物育种攻关项目
四川省"十二五"基因工程财政专项项目
文摘
应用SRAP分子标记技术对87份来茄子及其近缘野生种进行了遗传多样性分析。结果显示,从88对SRAP引物中筛选出18对多态性高、稳定性好的引物组合,共检测出309清晰个位点,平均每对引物检测到17.2个扩增位点。.参试茄属植物种质群体位点的平均杂合度为0.6962;平均多态信息含量为0.6441。82份栽培种茄子材料的平均相似系数为0.822,表明茄子栽培种的基因库较小,遗传基础较为狭窄。聚类分析结果表明,87份材料可分成4大类,可以较好地将茄子栽培种与其近缘野生种分开,并且基本可将高级栽培种(S.melongena L.subsp.melongena)和原始栽培种(S.melongena L.subsp.ovigerum Salis)在亚种水平上区分开来。由此可见,SRAP标记在茄子遗传研究中是一种经济、有效和可靠的分子标记手段。
关键词
茄子
遗传多样性
srap
(
sequence-related
amplified
polymorphism
)
Keywords
Eggplant
Genetic Diversity
srap
分类号
S641.1 [农业科学—蔬菜学]
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职称材料
题名
利用SRAP分子标记研究美洲海蓬子实生群体遗传多样性
被引量：
5
2
作者
张旭
邢锦城
陈健华
余桂红
张春银
马鸿翔
机构
江苏省农业科学院农业生物技术研究所
南京农业大学农学院
江西农业大学农学院
盐城绿苑海蓬子开发有限公司
出处
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2009年第6期1252-1257,共6页
基金
国家科技支撑计划项目(2006BAD09A08-04
2006BAD09A-04-07-01)
文摘
选取28株不同形态的海蓬子株系,调查植株高度、分枝夹角、果荚长度等生物性状,并采用SRAP技术对海蓬子株系进行遗传多样性分析。测定数据显示,海蓬子的不同株系在植株高度、分枝夹角、果荚长度均存在显著差异。SRAP标记多态条带比率(PPB)、Shannon多样性指数(I)以及Nei氏基因多样度(h)均显示海蓬子实生群体具有较为丰富的遗传多样性。SRAP标记相似系数变异范围为0.42～0.92。以相似系数平均值0.76为阈值,可将所有供试材料划分为11个亚类,表明海蓬子不同株系间存在明显的表型差异与遗传多样性。建议在实生群体内通过选择来培育海蓬子新品种。
关键词
盐生植物
海蓬子
遗传多样性
srap
标记
Keywords
halophyte
Salicornia bigelorii
genetic diversity
sequence-related amplified polymorphism （srap） nlarker
分类号
S156.4 [农业科学—土壤学]
在线阅读
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职称材料
题名
基于SCAR标记和DNA条形码技术的苍术基原鉴别研究
3
作者
陈研
冯露露
黄荣
齐伟辰
机构
长春中医药大学药学院
出处
《世界科学技术-中医药现代化》
CSCD
北大核心
2024年第2期490-501,共12页
基金
2022年吉林省教育厅科学技术研究项目一般课题(JJKH20220874KJ):吉林省药材苍术分子鉴定研究,负责人:齐伟辰
2020年吉林省科技发展计划项目一般课题(20200708041YY):北苍术药材生产技术集成及规范化生产基地建设,负责人:齐伟辰。
文摘
目的开发出能同时鉴别北苍术和关苍术的分子标记方法,并探究不同种质资源苍术的遗传进化关系。方法对不同地区北苍术Atractylodes chinensis(Bunge)Koidz及关苍术A.japonica Koidz.ex Kitam基因组DNA的差异片段进行测序,结合SRAP、ISSR、DAMD分子标记方法,优化PCR反应体系,筛选并转换成特异性标记,同时,采用条形码方法分析种间序列差异。结果通过SRAP、ISSR、DAMD三种分子标记方法的PCR扩增,共筛选出198对能稳定扩增且重现性好的引物,转换出7对能稳定、快速鉴别北苍术和关苍术的SCAR引物。条形码方法检测出北苍术ITS2序列长度为454 bp,关苍术ITS2序列长度为453 bp,与其他苍术属植物之间遗传距离较远。NJ树结果显示,北苍术、关苍术及其他苍术属植物均各自聚为一支,表现出良好的单系性。依据ITS2二级结构,4种苍术属植物在螺旋区的茎环数目、大小、位置均有明显差异,可以直观地进行区分。结论所开发的特异性SCAR标记为苍术属植物优良品种的筛选提供了新方法,DNA条形码能稳定、准确鉴别北苍术。
关键词
北苍术
关苍术
Internal
transcribed
spacer
2(ITS2)
sequence-related
amplified
polymorphism
(
srap
)
Inter-simple
sequence
repeat(ISSR)
Direct
amplifi
cation
of
minisatellite
region
DNA(DAMD)
Sequence
characterized
amplified
regions(SCAR)
Keywords
Atractylodes chinensis(Bunge)Koidz
Atractylodes japonica Koidz.ex Kitam
Internal transcribed spacer 2(ITS2)
sequence-related
amplified
polymorphism
(
srap
)
Inter-simple sequence repeat(ISSR)
Direct
amplifi
cation
分类号
R-058 [医药卫生]
在线阅读
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
茄子及其近缘野生种遗传多样性的SRAP分析
房超
李跃建
帅波
刘独臣
刘小俊
梁根云
杨宏
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2011
10
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
利用SRAP分子标记研究美洲海蓬子实生群体遗传多样性
张旭
邢锦城
陈健华
余桂红
张春银
马鸿翔
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2009
5
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
基于SCAR标记和DNA条形码技术的苍术基原鉴别研究
陈研
冯露露
黄荣
齐伟辰
《世界科学技术-中医药现代化》
CSCD
北大核心
2024
0
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职称材料
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