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线粒体DNA D-loop区单核苷酸多态性及拷贝数与皮肌炎发病风险关系 被引量:1
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作者 檀紫瑞 张晶晶 +2 位作者 贾园园 彭晨星 赵宇飞 《安徽医科大学学报》 北大核心 2025年第1期130-135,共6页
目的探究线粒体DNA(mtDNA)的D-loop区单核苷酸多态性(SNPs)和mtDNA拷贝数与皮肌炎(DM)发病风险的关系及其影响因素。方法收录74例DM患者和92例健康受试者,从外周血液中提取基因组DNA,利用PCR技术将mtDNA的D-loop区目的片段进行扩增,对... 目的探究线粒体DNA(mtDNA)的D-loop区单核苷酸多态性(SNPs)和mtDNA拷贝数与皮肌炎(DM)发病风险的关系及其影响因素。方法收录74例DM患者和92例健康受试者,从外周血液中提取基因组DNA,利用PCR技术将mtDNA的D-loop区目的片段进行扩增,对产物进行测序;应用高灵敏度活性氧(ROS)检测套件,测定血清ROS水平;采用流式免疫荧光微球技术测定细胞因子白细胞介素(IL)-5、IL-13、干扰素(IFN)-γ、IL-2、IL-6、IL-10、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、IL-4表达水平,使用Wilcoxon秩和检验评估细胞因子与DM风险相关SNPs的潜在相关性;进行实时荧光定量聚合酶链反应(qPCR)分析,测量mtDNA的相对拷贝数。结果DM患者组存在2个与其发病风险有关的多态性变异位点(16304T/C、16519T/C),线粒体D-loop区的等位基因16304C(χ^(2)=4.937,P=0.026)和16519C(χ^(2)=4.405,P=0.036)与DM患者发病风险有关;DM风险相关等位基因16304C与IL-4低表达相关(P=0.016)。DM患者中的mtDNA拷贝数高于对照组(P<0.001)。结论线粒体D-loop区SNPs可能是DM风险的潜在生物标志物,SNPs可能通过影响细胞因子参与DM的发生。DM的mtDNA拷贝数呈现高表达,mtDNA拷贝数的增加可能会导致线粒体功能障碍,从而引发DM的发病。 展开更多
关键词 皮肌炎 D-loop SNPS 细胞因子 ROS mtDNA拷贝数 发病风险
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甘肃滩羊体线粒体DNA D-loop区遗传多样性及系统进化分析
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作者 王燕燕 王珂 +5 位作者 徐建峰 石福岳 郭海龙 高登伟 顾玲荣 王胜明 《家畜生态学报》 北大核心 2025年第6期16-20,共5页
为了探讨甘肃滩羊的遗传多样性与母系起源,试验以甘肃环县、景泰县和靖远县的滩羊为研究对象,采用PCR扩增和直接测序法获得滩羊mtDNA D-loop区序列,分析其遗传多样性、遗传结构并构建系统发育树。结果显示,3个滩羊群体共存在7种不同长度... 为了探讨甘肃滩羊的遗传多样性与母系起源,试验以甘肃环县、景泰县和靖远县的滩羊为研究对象,采用PCR扩增和直接测序法获得滩羊mtDNA D-loop区序列,分析其遗传多样性、遗传结构并构建系统发育树。结果显示,3个滩羊群体共存在7种不同长度的mtDNA D-loop区序列,范围为1107~1183 bp,以1182 bp为主;3个群体的A、G、T、C、A+T、C+G平均含量分别为33.24%、14.29%、29.56%、22.88%、62.87%、37.18%,A+T含量明显高于C+G;共有154个变异位点,33种单倍型,3个滩羊群体mtDNA D-loop序列的Hd平均值为0.977,Pi平均值为0.035;系统发育分析显示,41只滩羊分为3个分支,表明甘肃滩羊可能存在3个母系起源。研究认为甘肃滩羊遗传多样性丰富,遗传稳定,存在3个母系起源。 展开更多
关键词 滩羊 mtDNA D-loop 遗传多样性 系统进化
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基于D-loop区多态性分析新疆地区7个哈萨克牛群体遗传结构和母系起源 被引量:1
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作者 王盼盼 沙拉玛提·波代 +2 位作者 巴合提·博代 李振伟 吾热力哈孜·哈孜汗 《中国畜牧兽医》 北大核心 2025年第3期1166-1179,共14页
【目的】利用线粒体DNA(mtNDA)D-loop区序列多态性作为标记,探究新疆7个哈萨克牛群体间遗传结构和母系起源,为新疆黄牛品种合理利用和生物多样性保护提供资料。【方法】采集哈萨克牛血液提取DNA,测定179头哈萨克牛个体mtDNA D-loop序列... 【目的】利用线粒体DNA(mtNDA)D-loop区序列多态性作为标记,探究新疆7个哈萨克牛群体间遗传结构和母系起源,为新疆黄牛品种合理利用和生物多样性保护提供资料。【方法】采集哈萨克牛血液提取DNA,测定179头哈萨克牛个体mtDNA D-loop序列,利用SnapGene软件对所获序列与参考序列进行比对、校正,确定mtDNA D-loop区序列的长度和位置,并统计碱基含量;利用DnaSP 5.10软件统计哈萨克牛种群单核苷酸多态性(SNP)位点,并计算单倍型数(H)、核苷酸多样性(Pi)、单倍型多样度(Hd)等参数;利用Arlequin 3.0软件分析哈萨克牛种群的遗传结构;采用Mega 11.0软件计算mtDNA D-loop区哈萨克牛种群的遗传距离,并构建Neighbor-Joining(NJ)系统进化树。【结果】哈萨克牛群体mtDNA D-loop区全序列长909~911 bp,其A、G、T、C 4种碱基平均含量分别为32.8%、13.8%、28.8%和24.6%,AT含量高于GC含量,179个个体共检测到131个SNPs,其中变异位点占所测核苷酸全长的14.40%,定义了89种单倍型,Hd和Pi分别为0.974和0.01288,表明哈萨克牛群体的遗传多样性十分丰富。分子变异分析结果表明,97.13%的变异属于群体内,2.87%则来自群体间变异,遗传距离为0.0109~0.0186,群体间遗传分化指数(F st)为―0.0053~0.0782,且均无显著分化(P>0.05)。系统发生树显示,新疆地区7个哈萨克牛群体有普通牛和瘤牛两大母系起源。【结论】新疆地区哈萨克牛源于两个母系,遗传多样性丰富。尽管群体间存在遗传分化,但并未形成明显的地理隔离,且遗传结构差异正在缩小。本研究结果为保护和利用哈萨克牛遗传资源提供了理论依据。 展开更多
关键词 哈萨克牛 线粒体DNA D-loop 遗传多样性 系统进化
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鲫属鱼类线粒体D-loop区结构及其系统发育分析
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作者 周益成 邓彬华 +5 位作者 郑鹏 刘兰苑 陈锭娴 林胜跃 蔡国军 李强 《湖南农业科学》 2025年第9期77-82,共6页
鲫属鱼类广泛分布于亚欧地区,由于其外观形态复杂多变,且存在多种倍性和繁殖方式,其分类体系尚未达成共识。本研究采用PCR和基因测序技术,对金鱼、缩骨鲫、彭泽鲫鱼和鲫鱼4种鲫属鱼类线粒体D-loop区进行测序,并与NCBI上已发表的鱼类相... 鲫属鱼类广泛分布于亚欧地区,由于其外观形态复杂多变,且存在多种倍性和繁殖方式,其分类体系尚未达成共识。本研究采用PCR和基因测序技术,对金鱼、缩骨鲫、彭泽鲫鱼和鲫鱼4种鲫属鱼类线粒体D-loop区进行测序,并与NCBI上已发表的鱼类相关序列进行联合对比。结果表明:鲫属鱼类mtDNA D-loop序列长度为919~959 bp,A+T平均含量65.7%,呈现A+T碱基组成偏倚性;种间平均遗传距离为0.002~0.078,金鱼与缩骨鲫、彭泽鲫与方正银鲫D品系之间遗传距离最小,淇河鲫与黑鲫之间的遗传距离最大;基于邻接法构建的系统发育树显示,15种鲫属鱼类聚为4大支系,支系Ⅰ涵盖10种中国本土鲫鱼及选育种,支系Ⅱ为3种日本鲫鱼,支系Ⅲ为白鲫,支系Ⅳ为黑鲫;支系Ⅰ又可分为A、B和C 3个姐妹支系,其中金鱼与缩骨鲫存在较近的亲缘关系,彭泽鲫与银鲫存在较近的亲缘关系。 展开更多
关键词 鲫属鱼类 D-loop 系统发育
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Vibration-induced bias error reduction using loop gain compensation for high-precision fiber optic gyroscopes
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作者 CHEN Heyu QIN Xuexin +2 位作者 XIE Huan KONG Linghai ZHENG Yue 《Journal of Systems Engineering and Electronics》 2025年第1期224-232,共9页
Vibration-induced bias deviation,which is generated by intensity fluctuations and additional phase differences,is one of the vital errors for fiber optic gyroscopes(FOGs)operating in vibration environment and has seve... Vibration-induced bias deviation,which is generated by intensity fluctuations and additional phase differences,is one of the vital errors for fiber optic gyroscopes(FOGs)operating in vibration environment and has severely restricted the applications of high-precision FOGs.The conventional methods for suppressing vibration-induced errors mostly concentrate on reinforcing the mechanical structure and optical path as well as the compensation under some specific operation parameters,which have very limited effects for high-precision FOGs maintaining performances under vibration.In this work,a technique of suppressing the vibration-induced bias deviation through removing the part related to the varying gain from the rotation-rate output is put forward.Particularly,the loop gain is extracted out by adding a gain-monitoring wave.By demodulating the loop gain and the rotation rate simultaneously under distinct frequencies and investigating their quantitative relationship,the vibrationinduced bias error is compensated without limiting the operating parameters or environments,like the applied modulation depth.The experimental results show that the proposed method has achieved the reduction of bias error from about 0.149°/h to0.014°/h during the random vibration with frequencies from20 Hz to 2000 Hz.This technique provides a feasible route for enhancing the performances of high-precision FOGs heading towards high environmental adaptability. 展开更多
关键词 vibration-induced error fiber optic gyroscope(FOG) loop gain
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基于线粒体DNA D-loop标记的华南地区4种鲤亚科鱼类遗传多样性分析 被引量:1
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作者 姚东林 张涛 朱静璇 《渔业研究》 2025年第1期11-18,共8页
【目的】研究华南地区鲤亚科鱼类的遗传多样性,为开展淡水鱼类的遗传育种工作提供参考。【方法】本研究采集位于海南省、广东省、广西壮族自治区的华南鲤(Cyprinus car-piorubrofuscus Lacepede)、尖鳍鲤(Cyprinus acutidorsalis Wang)... 【目的】研究华南地区鲤亚科鱼类的遗传多样性,为开展淡水鱼类的遗传育种工作提供参考。【方法】本研究采集位于海南省、广东省、广西壮族自治区的华南鲤(Cyprinus car-piorubrofuscus Lacepede)、尖鳍鲤(Cyprinus acutidorsalis Wang)、三角鲤(Cyprinus multita-eniata Pellegrin et Chevey)和须鲫(Carassioides cantonensis Heincke)4种鲤亚科鱼类的6个种群共156个样本,采用线粒体D-loop标记分析其遗传多样性。【结果】研究结果表明,华南鲤的海南、珠江和榕江3个种群的遗传多样性相对较高,其线粒体控制区的单倍型多样性分别为0.814、0.895和0.879;须鲫、尖鳍鲤和三角鲤的单倍型多样性较低,分别为0.748、0.794和0.536。华南鲤的遗传多样性较高,其中海南种群略低于珠江种群和榕江种群,可能与历史上的冰期活动和琼州海峡的阻隔有关。须鲫、尖鳍鲤和三角鲤三者的遗传多样性相对较低,这可能与3个物种本身的分布范围较小、生存能力较差有关。【意义】本研究结果为进一步探明华南地区鲤亚科鱼类的自然资源状况和开展淡水鱼类的遗传育种工作提供了重要的参考。 展开更多
关键词 华南鲤 尖鳍鲤 三角鲤 须鲫 D-loop 遗传多样性
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早胜牛mtDNA D-loop区遗传多样性及起源分析
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作者 梁永虎 梁万鹏 +7 位作者 贺怀刚 苏涛龙 李增录 袁婧 赵凤妮 宋敏 施海娜 刘雨田 《中国牛业科学》 2025年第4期20-27,32,共9页
为了有效保护早胜牛种质资源、提升其生产性能,对抗突变、漂变、近交等不良因素,试验采用PCR扩增、测序及生物信息学技术,对早胜牛线粒体DNA控制区(mtDNA D-loop区)序列多态性与母系起源进行了研究。结果表明,从早胜牛98个样本中成功获... 为了有效保护早胜牛种质资源、提升其生产性能,对抗突变、漂变、近交等不良因素,试验采用PCR扩增、测序及生物信息学技术,对早胜牛线粒体DNA控制区(mtDNA D-loop区)序列多态性与母系起源进行了研究。结果表明,从早胜牛98个样本中成功获取84条长度约为910 bp及1条长度953 bp的核苷酸序列。经分析发现,碱基组成中腺嘌呤(A)占比最高,平均达32.92%;胸腺嘧啶(T)次之,占28.75%;胞嘧啶(C)与鸟嘌呤(G)分别占24.57%和13.71%,这表明D-loop区长度在种群内具备较高一致性。进一步分析显示,早胜牛线粒体D-loop区存在60个有效多态位点,98个样本共鉴定出45种单倍型,单倍型多样性指数较高,为0.946±0.014。核苷酸多样性为0.017 84±0.002 15,意味着该区域序列变异适度,既不过于保守,也非极端变异。45种单倍型间遗传距离介于0.013~1.508,均值为0.088,其中最小遗传距离为0.013,暗示部分单倍型或源自共同祖先,分化时间较近。进化树分析结果揭示,早胜牛的45种单倍型与普通牛(Bos taurus)和瘤牛(Bos indicus)亲缘关系紧密,尤其多数单倍型(如Hap 17、Hap 39、Hap 43等)与普通牛遗传距离更近,说明普通牛大概率为早胜牛的主要遗传起源。 展开更多
关键词 早胜牛 种质资源 遗传多样性 D-loop
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基于线粒体D-loop区和COI基因序列的毕节地区2种裂腹鱼遗传多样性分析
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作者 刘伟 王霞 +3 位作者 向燕 吕振宇 曾圣 詹会祥 《贵州农业科学》 2025年第7期81-89,共9页
【目的】探明贵州毕节地区昆明裂腹鱼(Schizothorax grahami)和四川裂腹鱼(Schizothorax kozlovi)的遗传多样性,为其种质资源保护及增殖放流提供参考。【方法】以线粒体D-loop区和COI基因为分子标记,分析2种裂腹鱼的遗传多样性。【结果... 【目的】探明贵州毕节地区昆明裂腹鱼(Schizothorax grahami)和四川裂腹鱼(Schizothorax kozlovi)的遗传多样性,为其种质资源保护及增殖放流提供参考。【方法】以线粒体D-loop区和COI基因为分子标记,分析2种裂腹鱼的遗传多样性。【结果】基于线粒体D-loop区和COI基因序列,38尾昆明裂腹鱼分别定义10种和9种单倍型,单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样性(π)分别为0.781、0.630和0.00644、0.00373;34尾四川裂腹鱼分别定义5种和4种单倍型,单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样性(π)分别为0.524、0.485和0.00262、0.00121。中性检测及核苷酸错配分布表明,2种裂腹鱼近期可能未经历大规模种群扩张事件。【结论】毕节地区昆明裂腹鱼的遗传多样性处于中等水平,而四川裂腹鱼的遗传多样性较低。 展开更多
关键词 昆明裂腹鱼 四川裂腹鱼 D-loop COI基因 遗传多样性
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郧西马头山羊线粒体DNA D-loop区遗传多样性分析
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作者 程蕾 刘辰晖 +6 位作者 陈杨 向敏 余婕 钟朱夏 夏永春 杨务军 胡修忠 《湖北农业科学》 2025年第7期198-202,共5页
基于线粒体DNA(mtDNA)D-loop区序列的遗传变异分析,评估郧西马头山羊(Capra hircus)的遗传多样性。通过PCR扩增和测序获得184只郧西马头山羊mtDNA D-loop区全序列,系统分析其核苷酸多态性和单倍型多样性,开展中性检验(Tajima’s D、Fu’... 基于线粒体DNA(mtDNA)D-loop区序列的遗传变异分析,评估郧西马头山羊(Capra hircus)的遗传多样性。通过PCR扩增和测序获得184只郧西马头山羊mtDNA D-loop区全序列,系统分析其核苷酸多态性和单倍型多样性,开展中性检验(Tajima’s D、Fu’s Fs)和错配分布分析,并与不同山羊品种的mtDNA D-loop序列进行聚类分析。结果表明,郧西马头山羊mtDNA D-loop的A、G、C、T 4种碱基占比分别为30.77%、14.26%、26.26%、28.71%,A+T碱基的占比为59.48%,明显高于G+C(40.52%)。郧西马头山羊mtDNA D-loop共有52种单倍型,131个变异位点,其中单一多态位点51个,简约信息位点80个。Fu’s Fs检验结果显示,Fs为-2.48,显著偏离中性模型(P<0.05)。郧西马头山羊与其他5个山羊品种(川东白山羊、陕南白山羊、黄淮山羊、北川白山羊、波尔山羊)的系统发育树显示,184个个体被分为3个大分支,分别为2个本地支与1个波尔山羊杂交支。郧西马头山羊群体的多态程度高,遗传多样性丰富,具有较大的育种潜能,但存在周边多个地方山羊品种和波尔山羊的遗传渗入现象。 展开更多
关键词 郧西马头山羊(Capra hircus) 线粒体DNA D-loop 遗传多样性
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量子Loop代数U_(q)(L(sl_(2)))的单权模 被引量:1
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作者 吴青云 谭易兰 夏利猛 《吉林大学学报(理学版)》 CAS 北大核心 2024年第2期256-262,共7页
用构造的方法解决量子Loop代数U_(q)(L(sl_(2)))具有一个一维权空间的单权模的结构问题,得到了任意一个具有一维权空间的单权模必同构于U_(q)(L(sl_(2)))的四类单权模之一.此外,还构造了一类权空间维数为2的既非最高权也非最低权的量子L... 用构造的方法解决量子Loop代数U_(q)(L(sl_(2)))具有一个一维权空间的单权模的结构问题,得到了任意一个具有一维权空间的单权模必同构于U_(q)(L(sl_(2)))的四类单权模之一.此外,还构造了一类权空间维数为2的既非最高权也非最低权的量子Loop代数U_(q)(L(sl_(2)))的单权模. 展开更多
关键词 量子loop代数 权模 单模 Dense模
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基于线粒体Cyt b基因和D-loop区分析元江鲤和杞麓鲤群体遗传结构 被引量:2
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作者 张铭枭 赵玉姣 +6 位作者 姚创 刘霄 黄松茂 李红涛 代忠礼 武祥伟 孔令富 《水产学杂志》 CAS 2024年第3期13-21,共9页
本文利用线粒体Cyt b基因和D-loop区部分序列,分析元江鲤(Cyprinus carpio yuankiang)和杞麓鲤(Cyprinus carpio chilia)群体的遗传结构。结果表明,在两个鲤群体中均获得929 bp的Cyt b基因序列和650 bp的D-Loop区序列。两个群体间平均... 本文利用线粒体Cyt b基因和D-loop区部分序列,分析元江鲤(Cyprinus carpio yuankiang)和杞麓鲤(Cyprinus carpio chilia)群体的遗传结构。结果表明,在两个鲤群体中均获得929 bp的Cyt b基因序列和650 bp的D-Loop区序列。两个群体间平均遗传距离为0.00595(Cyt b)、0.00852(D-loop)。Cyt b基因共检测出元江鲤3种、杞麓鲤15种单倍型,两个群体共享两个单倍型(C-Hap1和C-Hap3);D-loop区序列共检测出元江鲤3种、杞麓鲤6种单倍型,两个群体共享两个单倍型(D-Hap1和D-Hap2)。元江鲤和杞麓鲤群体单倍型多样性(Hd)分别为0.30±0.10(Cyt b)、0.25±0.10(D-loop)和0.89±0.04(Cyt b)、0.73±0.05(D-loop)。元江鲤和杞麓鲤群体核苷酸多样性(π)分别为0.12±0.04(Cyt b)、0.12±0.09(D-loop)和0.77±0.09(Cyt b)、0.87±0.07(D-loop),杞麓鲤遗传多样性水平明显高于元江鲤群体。分子方差分析(AMOVA)显示,两个群体间有明显的遗传分化,且遗传变异主要来源于群体间。系统发育分析显示,元江鲤群体单倍型较少,类型较单一,与杞麓鲤群体差异大,多数元江鲤样本单倍型属于华南鲤(Cyprinus carpio rubrofuscus)类型;多数杞麓鲤样本具特有单倍型,部分属于华南鲤、远东鲤(Cyprinus carpio haematopterus)类型。结果表明,杞麓鲤与元江鲤群体遗传分化明显,元江鲤线粒体遗传多样性较低。 展开更多
关键词 元江鲤 杞麓鲤 Cyt b基因 D-loop 群体遗传结构 遗传多样性
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庆阳驴mtDNA D-loop区遗传多样性及起源分析
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作者 施海娜 王永杰 +5 位作者 梁万鹏 耿智广 李世恩 徐振飞 刘刚 刘哲 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期601-613,共13页
[目的]研究庆阳驴养殖群体的遗传多样性与母系起源,了解其遗传信息,为保护庆阳驴种质资源、选育和遗传改良工作提供理论依据。[方法]随机选取133头庆阳驴,对其线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)D-loop区序列进行PCR扩增、测序及比对,... [目的]研究庆阳驴养殖群体的遗传多样性与母系起源,了解其遗传信息,为保护庆阳驴种质资源、选育和遗传改良工作提供理论依据。[方法]随机选取133头庆阳驴,对其线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)D-loop区序列进行PCR扩增、测序及比对,并探讨庆阳驴的遗传多样性与母系起源。[结果]在获得的520 bp D-loop碱基序列中,AT含量(57.3%)高于GC含量(42.8%),表现出碱基的偏倚性;检测到38个变异位点,包含8个碱基对的转换;其核苷酸多样性(Pi)、单倍型多样性(Hd)、平均核苷酸差异(K)分别为0.01591、0.895和8.274,与欧洲家驴和中国家驴研究的平均值相比较低,说明该驴品种核苷酸变异较为贫乏。庆阳驴mtDNA D-loop区存在35个单倍型,单倍型之间的遗传距离为0.002~0.042。系统进化结果显示,庆阳驴存在2个线粒体支系,表明其具有2个母系起源,且遗传距离表明,庆阳驴与克罗地亚家驴之间的遗传距离较近。[结论]本研究从分子水平初步揭示庆阳驴核苷酸变异比较贫乏,杂交程度高,mtDNA遗传多态性正逐步丧失,应加强庆阳驴品种的遗传资源保护工作。 展开更多
关键词 庆阳驴 MTDNA D-loop 遗传多样性 起源
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Structural insights into Deinococcus radiodurans BamA:extracellular loop diversity and its evolutionary implications
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作者 Zhenzhou Wang Jinchan Xue +3 位作者 Jiajia Wang Jiangliu Yu Hongwu Qian Xinxing Yang 《中国科学技术大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第9期34-43,69,共11页
Diderm bacteria,characterized by an additional lipid membrane layer known as the outer membrane,fold their outer membrane proteins(OMPs)via theβ-barrel assembly machinery(BAM)complex.Understanding how the BAM complex... Diderm bacteria,characterized by an additional lipid membrane layer known as the outer membrane,fold their outer membrane proteins(OMPs)via theβ-barrel assembly machinery(BAM)complex.Understanding how the BAM complex,particularly its key component BamA,assists in OMP folding remains crucial in bacterial cell biology.Recent research has focused primarily on the structural and functional characteristics of BamA within the Gracilicutes clade,such as in Escherichia coli(E.coli).However,another major evolutionary branch,Terrabacteria,has received comparatively less attention.An example of a Terrabacteria is Deinococcus radiodurans(D.radiodurans),a Gram-positive bacterium that possesses a distinctive outer membrane structure.In this study,we first demonstrated that theβ-barrel domains of BamA are not interchangeable between D.radiodurans and E.coli.The structure of D.radiodurans BamA was subsequently determined at 3.8Åresolution using cryo-electron microscopy,revealing obviously distinct arrangements of extracellular loop 4(ECL4)and ECL6 after structural comparison with their counterparts in gracilicutes.Despite the overall similarity in the topology of theβ-barrel domain,our results indicate that certain ECLs have evolved into distinct structures between the Terrabacteria and Gracilicutes clades.While BamA and its function are generally conserved across diderm bacterial species,our findings underscore the evolutionary diversity of this core OMP folder among bacteria,offering new insights into bacterial physiology and evolutionary biology. 展开更多
关键词 BamA extracellular loop outer membrane protein Deinococcus radiodurans
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Mission-oriented capability evaluation for combat network based on operation loops
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作者 Yang Wang Junyong Tao +2 位作者 Xiaoke Zhang Guanghan Bai Yunan Zhang 《Defence Technology(防务技术)》 SCIE EI CAS CSCD 2024年第12期156-175,共20页
With continuous growth in scale,topology complexity,mission phases,and mission diversity,challenges have been placed for efficient capability evaluation of modern combat systems.Aiming at the problems of insufficient ... With continuous growth in scale,topology complexity,mission phases,and mission diversity,challenges have been placed for efficient capability evaluation of modern combat systems.Aiming at the problems of insufficient mission consideration and single evaluation dimension in the existing evaluation approaches,this study proposes a mission-oriented capability evaluation method for combat systems based on operation loop.Firstly,a combat network model is given that takes into account the capability properties of combat nodes.Then,based on the transition matrix between combat nodes,an efficient algorithm for operation loop identification is proposed based on the Breadth-First Search.Given the mission-capability satisfaction of nodes,the effectiveness evaluation indexes for operation loops and combat network are proposed,followed by node importance measure.Through a case study of the combat scenario involving space-based support against surface ships under different strategies,the effectiveness of the proposed method is verified.The results indicated that the ROI-priority attack method has a notable impact on reducing the overall efficiency of the network,whereas the O-L betweenness-priority attack is more effective in obstructing the successful execution of enemy attack missions. 展开更多
关键词 Combat network Operation loop identification Mission-oriented Network reliability Network effectiveness evaluation Strike strategies
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基于D-loop序列的从江田鱼与野生鲤形态和遗传差异分析
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作者 陆俊杰 何旭盟 +4 位作者 李志力 张宵 胡文静 孙佳敏 刘其根 《淡水渔业》 CSCD 北大核心 2024年第5期51-58,共8页
利用形态学测量方法和D-loop序列分析了解从江田鱼与都柳江野生鲤的形态和遗传差异分析。结果显示,体长/体宽特征存在极显著差异,野生鲤独有17个单倍型,其核苷酸多样性(Pi)和单倍型多样性(Hd)较从江田鱼更高。野生鲤与从江田鱼的Fst值... 利用形态学测量方法和D-loop序列分析了解从江田鱼与都柳江野生鲤的形态和遗传差异分析。结果显示,体长/体宽特征存在极显著差异,野生鲤独有17个单倍型,其核苷酸多样性(Pi)和单倍型多样性(Hd)较从江田鱼更高。野生鲤与从江田鱼的Fst值达到了0.15以上有较高的遗传分化。单倍型网络图显示,从江田鱼和野生鲤存在明显的遗传分化。分子方差(AMOVA)分析表明,从江田鱼群体的主要的遗传变异来自于群体内部个体间(80.66%)。基因流分析表明从江田鱼群体间基因交流水平不高但与野生鲤基因交流较频繁。研究表明,从江田鱼可能来源于野生鲤,其地理分布相对独立且有特定养殖模式,但受到自然和人工选择,其种群遗传多样性降低,种质资源存在退化风险需要保护。 展开更多
关键词 从江田鱼 线粒体D-loop 遗传多样性 遗传结构
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建水黄褐鸭线粒体D-loop区遗传多样性分析
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作者 李昕鹏 展亚楠 +4 位作者 信爱国 黄艳 黄合特 张雪伟 孔小艳 《安徽农业科学》 CAS 2024年第2期83-86,共4页
[目的]了解建水黄褐鸭系统发育、遗传分化和遗传多样性。[方法]选取18只建水黄褐鸭、4只北京鸭、6只揭阳鸭和6只克里莫M18,利用PCR技术对其mtDNA D-loop区序列进行扩增,结合NCBI部分野鸭和家鸭序列,利用MEGA、DNAsp、Arlequin软件进行... [目的]了解建水黄褐鸭系统发育、遗传分化和遗传多样性。[方法]选取18只建水黄褐鸭、4只北京鸭、6只揭阳鸭和6只克里莫M18,利用PCR技术对其mtDNA D-loop区序列进行扩增,结合NCBI部分野鸭和家鸭序列,利用MEGA、DNAsp、Arlequin软件进行聚类分析、遗传分化和遗传多样性分析。[结果]建水黄褐鸭与绿头鸭及斑嘴鸭2种野鸭亲缘关系更近;遗传分化指数和遗传距离均以建水黄褐鸭和北京鸭之间最大;建水黄褐鸭、北京鸭、揭阳鸭和克里莫M18这4个群体中建水黄褐鸭群体遗传多样性最低。[结论]建水黄褐鸭可能有绿头鸭和斑嘴鸭2个母系起源;建水黄褐鸭群体遗传多样性偏低,为今后更好地利用地方畜禽资源,应采取相应措施保护其遗传多样性。 展开更多
关键词 建水黄褐鸭 D-loop 遗传分化 遗传距离 遗传多样性
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运用超声心动图多模态参数评估肥厚型心肌病患者早期左心室功能变化 被引量:3
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作者 张艳娟 王璎瑛 +3 位作者 赵迪 吴红平 孙伟 雍永宏 《南京医科大学学报(自然科学版)》 北大核心 2025年第2期240-244,259,共6页
目的:运用超声心动图的多模态参数评估肥厚型心肌病(hypertrophic cardiomyopathy,HCM)患者早期左心室收缩及舒张功能的变化。方法:选取2019年10月—2021年6月在南京医科大学第一附属医院门诊就诊的HCM患者共54例,其中包括非梗阻性HCM患... 目的:运用超声心动图的多模态参数评估肥厚型心肌病(hypertrophic cardiomyopathy,HCM)患者早期左心室收缩及舒张功能的变化。方法:选取2019年10月—2021年6月在南京医科大学第一附属医院门诊就诊的HCM患者共54例,其中包括非梗阻性HCM患者34例和梗阻性HCM患者20例,同时选择30例正常人作为对照组,运用超声心动图的多模态参数,比较3组间左心室收缩及舒张功能的变化。结果:HCM患者左室收缩功能及舒张功能均降低,其中梗阻性HCM患者左心室整体长轴应变(global longitudinal strain,GLS)、整体做功指数(global work index,GWI)、整体有效功(global constructive work,GCW)、整体做功效率(global work efficiency,GWE)降低更为明显,整体无效功(global waste work,GWW)在3组间差异无统计学意义。结论:超声心动图的多模态参数可以早期全面地评价HCM患者左室收缩及舒张功能的受损情况,为临床诊疗及预后提供重要依据。 展开更多
关键词 压力-应变环 肥厚型心肌病 左心室做功 左心室舒张功能
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基于线粒体D-loop区的4个团头鲂养殖群体遗传多样性分析
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作者 严燕 刘帆 +2 位作者 刘鑫鑫 胡桂飞 苏时萍 《现代农业科技》 2024年第15期154-157,共4页
为了解安徽省养殖团头鲂(Megalobrama amblycephala)种质资源现状,本研究基于来自省内不同地区的4个养殖群体117个样本的线粒体D-loop区,分析其遗传多样性及群体结构。遗传多样性分析结果表明,共检测到16个变异位点和14种单倍型,单倍型... 为了解安徽省养殖团头鲂(Megalobrama amblycephala)种质资源现状,本研究基于来自省内不同地区的4个养殖群体117个样本的线粒体D-loop区,分析其遗传多样性及群体结构。遗传多样性分析结果表明,共检测到16个变异位点和14种单倍型,单倍型多样性指数为0.20~0.47,核苷酸多样性指数为0.00022~0.00224。群体结构分析显示,群体间发生了不同程度的分化,遗传分化系数为-0.0138~0.2190。分子变异分析(AMOVA)表明,变异来源全部来自个体间,单倍型网络图显示群体间可通过单倍型Hap_2连接。综上所述,4个群体可能经历了奠基者效应,遗传多样性丢失严重,群体间缺乏分化,4个团头鲂群体的遗传背景可以为安徽省团头鲂种质资源保护与利用提供参考依据。 展开更多
关键词 团头鲂 线粒体DNA D-loop 遗传多样性 群体结构
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麻醉恢复室预约系统应用于术后患者管理的效果评价 被引量:2
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作者 张晨 何苗 +1 位作者 果旭 康百慧 《中国护理管理》 北大核心 2025年第2期180-184,共5页
目的 :分析麻醉恢复室预约系统应用于术后患者管理的效果,以加快患者周转,并保障患者安全。方法 :以医院麻醉排班系统为支撑,构建麻醉恢复室预约系统,2023年6月将该系统应用于麻醉恢复室,比较系统应用前(2022年5月至2023年5月)及应用后(... 目的 :分析麻醉恢复室预约系统应用于术后患者管理的效果,以加快患者周转,并保障患者安全。方法 :以医院麻醉排班系统为支撑,构建麻醉恢复室预约系统,2023年6月将该系统应用于麻醉恢复室,比较系统应用前(2022年5月至2023年5月)及应用后(2023年6月至2024年6月)患者平均等候时长、预约内容错误率、医护人员满意度。结果 :应用麻醉恢复室预约系统后,患者平均等候时长由(13.26±3.44)min缩短至(8.89±2.83)min(P<0.05),预约错误率由0.84%降至0.37%(P<0.05),医护人员满意度由(2.70±0.81)分上升至(4.68±0.62)分(P<0.05)。结论 :麻醉恢复室预约系统优化了麻醉恢复室预约方式,有助于保障患者安全,加速患者周转,提高护理工作效率。 展开更多
关键词 麻醉恢复室 预约系统 信息化 闭环管理
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基于R-loop靶向编辑技术的R-loop功能位点高通量筛选系统
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作者 皮一飞 宋新辉 +3 位作者 王淅琳 李谨谨 孙长斌 徐炜 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第10期181-190,共10页
【目的】开发哺乳动物细胞R-loop靶向编辑技术,探究其在肿瘤细胞耐药性研究中的应用。【方法】构建无酶切活性的Cas9与具有R-loop水解活性的RNase H1融合蛋白dCas9-RNaseH1表达载体,用于实现对R-loop的靶向编辑。在HeLa细胞中稳定表达... 【目的】开发哺乳动物细胞R-loop靶向编辑技术,探究其在肿瘤细胞耐药性研究中的应用。【方法】构建无酶切活性的Cas9与具有R-loop水解活性的RNase H1融合蛋白dCas9-RNaseH1表达载体,用于实现对R-loop的靶向编辑。在HeLa细胞中稳定表达该融合蛋白,建立R-loop靶向编辑细胞模型。转染覆盖全基因组转录起始区域的sgRNA文库,构建R-loop筛选细胞库,筛选影响紫杉醇和顺铂耐药性的R-loop功能位点。【结果】筛选获得744个影响HeLa细胞耐药性的R-loop功能位点,覆盖了细胞周期、凋亡、信号传导等关键生物通路。其中,26个位点使HeLa细胞对这两种药物产生耐药性,8个位点使其对这两种药物敏感,提示可能存在共享的生物通路。功能验证显示,部分R-loop功能位点通过调节相关基因(如ZBTB20、SPON2、ACTRT1等)的表达来影响HeLa细胞对抗肿瘤药物的敏感性。【结论】成功开发出适用于哺乳动物细胞的R-loop靶向编辑系统,并建立高通量筛选平台。 展开更多
关键词 高通量筛选 耐药性 R-loop 定点调控 CRISPR/dCas9
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