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Scheduling transactions in mobile distributed real-time database systems 被引量:1
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作者 雷向东 赵跃龙 +1 位作者 陈松乔 袁晓莉 《Journal of Central South University of Technology》 EI 2008年第4期545-551,共7页
A DMVOCC-MVDA (distributed multiversion optimistic concurrency control with multiversion dynamic adjustment) protocol was presented to process mobile distributed real-time transaction in mobile broadcast environment... A DMVOCC-MVDA (distributed multiversion optimistic concurrency control with multiversion dynamic adjustment) protocol was presented to process mobile distributed real-time transaction in mobile broadcast environments. At the mobile hosts, all transactions perform local pre-validation. The local pre-validation process is carried out against the committed transactions at the server in the last broadcast cycle. Transactions that survive in local pre-validation must be submitted to the server for local final validation. The new protocol eliminates conflicts between mobile read-only and mobile update transactions, and resolves data conflicts flexibly by using multiversion dynamic adjustment of serialization order to avoid unnecessary restarts of transactions. Mobile read-only transactions can be committed with no-blocking, and respond time of mobile read-only transactions is greatly shortened. The tolerance of mobile transactions of disconnections from the broadcast channel is increased. In global validation mobile distributed transactions have to do check to ensure distributed serializability in all participants. The simulation results show that the new concurrency control protocol proposed offers better performance than other protocols in terms of miss rate, restart rate, commit rate. Under high work load (think time is ls) the miss rate of DMVOCC-MVDA is only 14.6%, is significantly lower than that of other protocols. The restart rate of DMVOCC-MVDA is only 32.3%, showing that DMVOCC-MVDA can effectively reduce the restart rate of mobile transactions. And the commit rate of DMVOCC-MVDA is up to 61.2%, which is obviously higher than that of other protocols. 展开更多
关键词 mobile distributed real-time database systems muliversion optimistic concurrency control multiversion dynamic adjustment pre-validation multiversion data broadcast
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Validation concurrency control protocol in parallel real-time database systems 被引量:3
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作者 LEI Xiang-dong(雷向东) YUAN Xiao-li(袁晓莉) 《Journal of Central South University of Technology》 2002年第3期197-201,共5页
In parallel real-time database systems, concurrency control protocols must satisfy time constraints as well as the integrity constraints. The authors present a validation concurrency control(VCC) protocol, which can e... In parallel real-time database systems, concurrency control protocols must satisfy time constraints as well as the integrity constraints. The authors present a validation concurrency control(VCC) protocol, which can enhance the performance of real-time concurrency control mechanism by reducing the number of transactions that might miss their deadlines, and compare the performance of validation concurrency control protocol with that of HP2PL(High priority two phase locking) protocol and OCC-TI-WAIT-50(Optimistic concurrency control-time interval-wait-50) protocol under shared-disk architecture by simulation. The simulation results reveal that the protocol the author presented can effectively reduce the number of transactions restarting which might miss their deadlines and performs better than HP2PL and OCC-TI-WAIT-50. It works well when arrival rate of transaction is lesser than threshold. However, due to resource contention the percentage of missing deadline increases sharply when arrival rate is greater than the threshold. 展开更多
关键词 PARALLEL database system real-time database CONCURRENCY control VALIDATION TRANSACTIONS
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基于Agricultural Animal Omics Database(AAOD)数据库挖掘绵羊GDF9基因变异
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作者 潘晔君 刘耿 +2 位作者 潘传英 张清峰 蓝贤勇 《畜牧兽医杂志》 2025年第3期1-9,共9页
目前利用大数据和组学数据库提高绵羊繁殖性能成为解决当前产业发展的关键之一。绵羊生长分化因子9(GDF9)基因对卵泡发育、排卵率及产羔数起着至关重要的作用,也是目前确定的绵羊多胎性状的主效基因之一;虽然其部分重要突变位点与产羔... 目前利用大数据和组学数据库提高绵羊繁殖性能成为解决当前产业发展的关键之一。绵羊生长分化因子9(GDF9)基因对卵泡发育、排卵率及产羔数起着至关重要的作用,也是目前确定的绵羊多胎性状的主效基因之一;虽然其部分重要突变位点与产羔数有关,但绵羊该基因所有可能基因变异如何挖掘仍然是一个尚待解决的问题。近年来,西北农林科技大学动物科技学院姜雨团队开发出Agricultural Animal Omics Database(AAOD)数据库,它整合了全球公共数据及中国本地特色绵羊品种的高深度基因组数据,涵盖50多个品种的遗传变异(SNPs、InDels)、表观标记及表型关联信息,并实现每月动态更新。基于此,本研究旨在利用AAOD数据库挖掘绵羊GDF9基因变异,并期望深入解析GDF9基因的分子结构、表达模式、富集分析、挖掘新的与繁殖力相关的突变位点及其在绵羊繁殖力中的潜在作用。这些结果将为基因编辑技术改良绵羊繁殖力提供新的潜在位点,将为提高绵羊繁殖力提供了遗传改良的理论依据与策略。 展开更多
关键词 绵羊 GDF9基因 Agricultural Animal Omics database(AAOD)数据库 单核苷酸多态性 插入缺失
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运用Real-time PCR方法研究日粮添加豆油与胡麻油对肉牛瘤胃纤维分解菌数量的影响 被引量:13
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作者 李旦 王加启 +3 位作者 卜登攀 杨舒黎 魏宏阳 周凌云 《动物营养学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期256-260,共5页
本研究分别以产琥珀酸丝状杆菌(Fibrobacter succinogenes)、黄色瘤胃球菌(Ruminococcus flavefaciens)、白色瘤胃球菌(Ruminobacter albus)和溶纤维丁酸弧菌(Butyrivibrio fibrisolvens)16S rDNA序列设计引物,运用Real-ti me PCR技术... 本研究分别以产琥珀酸丝状杆菌(Fibrobacter succinogenes)、黄色瘤胃球菌(Ruminococcus flavefaciens)、白色瘤胃球菌(Ruminobacter albus)和溶纤维丁酸弧菌(Butyrivibrio fibrisolvens)16S rDNA序列设计引物,运用Real-ti me PCR技术研究日粮中添加豆油与胡麻油对肉牛上述4种瘤胃纤维分解菌数量的影响。结果表明,与对照组(CK)相比,添加豆油组(LOC1)和胡麻油(LOC2)组,产琥珀酸丝状杆菌(Fibrobacter succinogenes)、黄色瘤胃球菌(Ruminococcus flavefaciens)、白色瘤胃球菌(Ruminobacter albus)和溶纤维丁酸弧菌(Butyrivibrio fibrisol-vens)数量显著减少(P<0.05),分别降低了78%和31%、30%和36%、27%和23%、6%和13%。通过该方法的结果表明日粮中添加4%的豆油和胡麻油显著减少了瘤胃中纤维分解菌,对产琥珀酸丝状杆菌的影响明显。而且采用Real-ti me PCR方法对瘤胃纤维分解菌进行定量,可以快速有效反映出在日粮改变的情况下菌的数量变化趋势,相对于传统计数方法更直观、快捷与准确。 展开更多
关键词 real-time PCR 瘤胃纤维菌 定量 肉牛
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非洲猪瘟病毒常规PCR及Real-time PCR检测方法的建立 被引量:22
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作者 张泉 朱鸿飞 孙怀昌 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第6期458-461,共4页
根据非洲猪瘟病毒(African swine fever virus,ASFV)P72基因的核苷酸序列,设计并合成引物以及荧光标记的TaqMan探针,以含P72基因的重组质粒作为阳性模板,用于常规PCR和Real-time PCR方法的建立,结果表明常规PCR的检测灵敏度是600个拷贝... 根据非洲猪瘟病毒(African swine fever virus,ASFV)P72基因的核苷酸序列,设计并合成引物以及荧光标记的TaqMan探针,以含P72基因的重组质粒作为阳性模板,用于常规PCR和Real-time PCR方法的建立,结果表明常规PCR的检测灵敏度是600个拷贝的病毒核酸分子,Real-time PCR的检测灵敏度是20个拷贝的病毒核酸分子,两种PCR检测方法均具有特异性强、简单快速的优点。可以用于出入境检验检疫部门对非洲猪瘟病毒的快速检测。 展开更多
关键词 非洲猪瘟 常规PCR real-time PCR
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一种莱姆病螺旋体real-time PCR方法的建立及其在鼠标本检测中的应用评价(英文) 被引量:13
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作者 耿震 侯学霞 +1 位作者 张琳 郝琴 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第9期812-816,共5页
目的基于莱姆病螺旋体recA基因,建立一种检测鼠中莱姆病螺旋体的real-time PCR方法。方法通过GenBank分析比较莱姆病螺旋体recA基因,选择其保守序列设计MGB探针及引物并进行方法学评估。并应用建立的real-time PCR方法和nested PCR方法... 目的基于莱姆病螺旋体recA基因,建立一种检测鼠中莱姆病螺旋体的real-time PCR方法。方法通过GenBank分析比较莱姆病螺旋体recA基因,选择其保守序列设计MGB探针及引物并进行方法学评估。并应用建立的real-time PCR方法和nested PCR方法对收集的123份鼠标本进行检测分析。结果本研究建立的real-time PCR方法仅对莱姆病螺旋体检测阳性,其最小检出浓度为101copies/μL。标准曲线各浓度点Ct值批内、批间平均变异系数(CV)分别为1.56%和2.30%。123份鼠标本中,real-time PCR检测59例阳性,nested PCR检测43例阳性。结论新建立的real-time PCR方法具有快速、敏感和特异的优点,可用于鼠标本中莱姆病螺旋体的检测。 展开更多
关键词 莱姆病螺旋体 real-time PCR nested PCR
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用DGGE和Real-Time PCR对低温沼气池中产甲烷古菌群落的研究 被引量:23
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作者 王彦伟 徐凤花 +3 位作者 阮志勇 宋金龙 王庆 赵斌 《中国沼气》 北大核心 2012年第1期8-12,共5页
利用DGGE及Real-Time PCR技术对不同地区低温沼气池中沼泥行进发酵前期、后期产甲烷古菌群落变化进行了研究。DGGE技术用于分析发酵前后产甲烷古菌优势群落的变化;Real-Time PCR技术用于分析发酵前期、后期样品产甲烷古菌的数量变化。... 利用DGGE及Real-Time PCR技术对不同地区低温沼气池中沼泥行进发酵前期、后期产甲烷古菌群落变化进行了研究。DGGE技术用于分析发酵前后产甲烷古菌优势群落的变化;Real-Time PCR技术用于分析发酵前期、后期样品产甲烷古菌的数量变化。结果表明,沼气低温发酵的过程中,不同沼泥样品发酵前期、后期产甲烷古菌的优势群落差异明显且数量上也存在较大差异;主要变化的产甲烷古菌的优势群落为甲烷粒菌属(Methanocor-pusculum),甲烷八叠球菌属(Methanosarcina),甲烷鬃毛菌属(Methanosaeta)。甲烷八叠球菌属(Methanosarcina)在黑龙江沼泥样品(A1)发酵后期成为优势群落,甲烷鬃毛菌属(Methanosaeta)在山东发酵前期(B1),后期样品(B2)及安徽发酵前期样品(C1)中占有绝对优势。产甲烷古菌的数量介于104~105个.mL-1之间,其中黑龙江样品中产甲烷菌数量最多,而安徽样品中产甲烷菌数量最少。 展开更多
关键词 沼泥 产甲烷古菌 DGGE real-time PCR
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Real-time PCR方法检测肉品中的沙门氏菌 被引量:16
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作者 方平 杨永莉 +1 位作者 杨宝 王晓闻 《山西农业科学》 2010年第8期71-76,共6页
应用SYBR Green I染料能选择性结合双链DNA的特点,可检测到沙门氏菌fimI基因特异性靶序列扩增所产生的荧光信号,通过熔解曲线可知其熔点值约为85.6℃,而对其他非沙门氏菌则检测不到荧光信号。建立了一种肉品中的沙门氏菌Real-time PCR... 应用SYBR Green I染料能选择性结合双链DNA的特点,可检测到沙门氏菌fimI基因特异性靶序列扩增所产生的荧光信号,通过熔解曲线可知其熔点值约为85.6℃,而对其他非沙门氏菌则检测不到荧光信号。建立了一种肉品中的沙门氏菌Real-time PCR检测方法,用该方法检测市售牛肉、香肠中的沙门氏菌,其检测灵敏度分别为13,12 cfu/25 g,从样品的处理到得出检验结果可以在10 h内完成。该检测方法具有简便、快速、特异性强、敏感度高等特点。 展开更多
关键词 沙门氏菌 real-time PCR 快速检测 肉品
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Real-time PCR技术的应用研究进展 被引量:6
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作者 李珊珊 王加启 +3 位作者 李旦 董晓丽 赵圣国 卜登攀 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第8期60-62,共3页
Real-time PCR(RT-PCR)是基于PCR,利用不同的荧光检测定量核酸的技术,广泛应用于基因分型,单核苷酸多态性,等位基因突变检测等方面。综述了RT-PCR作为一种检测技术,在医学、食品、环境微生物等不同领域的应用进展。
关键词 real-time PCR基因诊断 基因检测 基因表达
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Real-Time PCR探针法定量检测沙门菌方法的建立及应用 被引量:3
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作者 耿士忠 潘志明 +5 位作者 方强 丛秋霞 刘杰 刘志成 文志发 焦新安 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第11期1004-1007,1027,共5页
目的建立快速、特异性好、灵敏度高的Real-Time PCR方法定量检测沙门菌。方法根据编码沙门菌肠毒素基因stn的核苷酸序列,设计荧光探针和一对引物,通过对荧光定量PCR反应体系和反应条件的摸索,建立定量检测沙门菌的方法。结果建立的Real-... 目的建立快速、特异性好、灵敏度高的Real-Time PCR方法定量检测沙门菌。方法根据编码沙门菌肠毒素基因stn的核苷酸序列,设计荧光探针和一对引物,通过对荧光定量PCR反应体系和反应条件的摸索,建立定量检测沙门菌的方法。结果建立的Real-Ti me PCR方法有很好的特异性与敏感性,所检测沙门菌结果均为阳性,而非沙门菌均为阴性;标准曲线相关系数为R2=0.993,其敏感性为5CFU。运用该方法对108份鸡粪便、50份鸡肉以及58份水样进行检测,阳性率分别为3.7%(6/108)、4%(2/50)和3.4%(2/58),与传统细菌分离检测结果相符。结论结果表明该方法具有简便、快速、特异性强、敏感性高等特点,此研究为环境及疾病诊断中沙门菌快速检测提供了新方法。 展开更多
关键词 沙门菌 real-time PCR 荧光定量 快速检测
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猪圆环病毒2型SYBRGreen Real-time qPCR检测方法的建立 被引量:9
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作者 冯华 刘运超 +2 位作者 陈玉梅 魏蔷 张改平 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2018年第4期98-103,共6页
为了建立一种基于SYBRGreen的猪圆环病毒2型(PCV2)荧光定量PCR诊断方法,以PCV2 ORF2基因序列为研究对象,构建p MD19T-ORF2重组质粒作为阳性标准品,设计特异性引物,对该方法的最适引物浓度、退火进行了优化,并对该方法的灵敏度、特异性... 为了建立一种基于SYBRGreen的猪圆环病毒2型(PCV2)荧光定量PCR诊断方法,以PCV2 ORF2基因序列为研究对象,构建p MD19T-ORF2重组质粒作为阳性标准品,设计特异性引物,对该方法的最适引物浓度、退火进行了优化,并对该方法的灵敏度、特异性、可重复性以及临床样品检出率进行了评价。结果表明,该方法引物的最佳终浓度为0. 2 mol/L,最适退火温度为55℃;检测限可达到3. 0×10~2个拷贝/mL,而普通PCR检测限在3. 0×10~4个拷贝/mL;溶解曲线分析显示,在77~79℃有单一的溶解峰出现,并与CSFV、PPV、PRRSV、PRV没有交叉反应;组内重复性变异系数为0. 29%~0. 32%,组间变异系数为0. 32%~0. 36%;此外,该方法对临床样品的检出率为81. 5%(31/38),而常规PCR为68. 4%(26/38)。因此,相比常规PCR,该方法更为快速、灵敏、特异、稳定,更适合PCV2临床样品的检测,可为该PCV2早期感染的快速检测提供新方法。 展开更多
关键词 猪圆环病毒2型 PCV2 ORF2 SYBRGreen real-time qPCR
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运用Real-time quantification PCR方法建立副溶血性弧菌在即食虾中的生长预测模型 被引量:5
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作者 彭织云 王敬敬 +2 位作者 唐晓阳 潘迎捷 赵勇 《食品工业科技》 CAS CSCD 北大核心 2013年第8期108-110,共3页
运用Real-time quantification PCR(real-time qPCR)方法建立副溶血性弧菌在即食虾中生长预测模型。首先构建质粒标准品,梯度稀释后建立标准曲线,然后用Real-time qPCR方法检测虾中副溶血性弧菌的数量,最后建立37℃下即食虾中副溶血性... 运用Real-time quantification PCR(real-time qPCR)方法建立副溶血性弧菌在即食虾中生长预测模型。首先构建质粒标准品,梯度稀释后建立标准曲线,然后用Real-time qPCR方法检测虾中副溶血性弧菌的数量,最后建立37℃下即食虾中副溶血性弧菌生长预测模型,并与传统涂布计数方法进行比较。结果表明,Real-time qPCR方法和传统计数方法均可建立Gmopertz模型、Logistic模型和Richards模型,模型拟合的相关系数R2均在0.9以上。基于Real-timeqPCR方法省时省力、特异性好等优点,用Real-time qPCR方法建立微生物预测模型是未来预测微生物学领域的一种发展趋势。 展开更多
关键词 real-time quantification PCR 副溶血性弧菌 生长预测模型
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猪PD-1及其配体PD-L1和PD-L2 SYBR Green Ⅰ Real-time PCR检测方法的建立及应用 被引量:3
13
作者 岳锋 周娟娟 +3 位作者 朱艳平 李鹏 孙国鹏 王选年 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2016年第11期2892-2899,共8页
本试验旨在研究猪PD-1及其配体在疾病状态下的转录水平,建立检测猪PD-1及其配体的Real-time PCR方法。根据GenBank中猪PD-1、PD-L1和PD-L2基因序列,分别设计3对特异性引物,PCR扩增目的基因片段,回收目的基因片段与pMD18-T连接后转化至... 本试验旨在研究猪PD-1及其配体在疾病状态下的转录水平,建立检测猪PD-1及其配体的Real-time PCR方法。根据GenBank中猪PD-1、PD-L1和PD-L2基因序列,分别设计3对特异性引物,PCR扩增目的基因片段,回收目的基因片段与pMD18-T连接后转化至大肠杆菌DH5α感受态细胞中,提取重组质粒,经PCR及测序鉴定正确,作为标准品绘制标准曲线,并进行特异性和重复性检测。结果显示,Real-time PCR的Ct值与模板浓度对数呈良好的线性反比关系,相关系数R2>0.99,熔解曲线出现狭窄单一峰;Real-time PCR产物经琼脂糖凝胶电泳,呈单一目的条带,无引物二聚体,特异性强;组内和组间重复性检测结果显示,组内和组间的变异系数均小于3%,重复性好;用建立的Real-time PCR方法检测猪自然感染PCV2后PD-1及其配体转录水平,PD-L1和PD-L2转录水平极显著或显著升高(P<0.01;P<0.05),PD-1转录水平无显著变化(P>0.05)。本试验建立了检测猪PD-1、PDL1和PD-L2mRNA的Real-time PCR方法并进行了初步应用,为猪PD-1、PD-L1和PD-L2基因表达模式研究奠定基础。 展开更多
关键词 real-time PCR PD-1 PD-L1 PD-L2
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A sensor transaction scheduling algorithm for maintaining real-time data temporal validity 被引量:1
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作者 白天 李国徽 刘云生 《Journal of Central South University》 SCIE EI CAS 2011年第6期2068-2073,共6页
A new scheduling algorithm called deferrable scheduling with time slice exchange (DS-EXC) was proposed to maintain the temporal validity of real-time data. In DS-EXC, the time slice exchange method was designed to fur... A new scheduling algorithm called deferrable scheduling with time slice exchange (DS-EXC) was proposed to maintain the temporal validity of real-time data. In DS-EXC, the time slice exchange method was designed to further defer the release time of transaction instances derived by the deferrable scheduling algorithm (DS-FP). In this way, more CPU time would be left for lower priority transactions and other transactions. In order to minimize the scheduling overhead, an off-line scheme was designed. In particular, the schedule for a transaction set is generated off-line until a repeating pattern is found, and then the pattern is used to construct the schedule on-line. The performance of DS-EXC was evaluated by sets of experiments. The results show that DS-EXC outperforms DS-FP in terms of increasing schedulable ratio. It also provides better performance under mixed workloads. 展开更多
关键词 temporal validity real-time database sensor transaction
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利用SYBR Green检测衣原体Real-Time PCR方法的建立 被引量:2
15
作者 杨建民 郝永新 +1 位作者 赵德明 何诚 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第1期84-90,共7页
利用SYBR Green建立了检测种特异性衣原体的Real-Time PCR方法。本方法应用衣原体种特异性的高度保守特异引物,能够扩增627bp特异片段;使用定量标准基因组DNA,本方法能准确检测最少250fg衣原体DNA。Real-TimePCR方法与免疫荧光方法... 利用SYBR Green建立了检测种特异性衣原体的Real-Time PCR方法。本方法应用衣原体种特异性的高度保守特异引物,能够扩增627bp特异片段;使用定量标准基因组DNA,本方法能准确检测最少250fg衣原体DNA。Real-TimePCR方法与免疫荧光方法的检测结果表明:检测4种衣原体临床样本,Real-TimePCR敏感性均在96%~98%;特异性均为100%;这两种方法符合率达97%以上(n=60);批内和批间重复性试验结果表明,本方法具有良好的准确性。本方法的建立对于快速、准确检测临床样本种特异性衣原体提供了一种切实有效的方法。 展开更多
关键词 SYBR Green 衣原体 real-time PCR 检测
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鸡传染性喉气管炎病毒TaqMan real-time PCR检测方法的建立 被引量:4
16
作者 赵妍 孔聪聪 +10 位作者 张晓敏 崔红玉 石星明 赵晓岩 薛美 胡顺磊 闫帅 牛秀杰 李巧玲 王玫 王云峰 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第8期642-646,共5页
为建立鸡传染性喉气管炎病毒(ILTV)TaqMan Real-time PCR检测方法,本研究根据GenBank中登录的ILTV gB基因序列设计了2对引物与一条特异性TaqMan探针,通过对反应体系和反应条件的优化,特异性、敏感性以及重复性试验,证明该方法在核酸含量... 为建立鸡传染性喉气管炎病毒(ILTV)TaqMan Real-time PCR检测方法,本研究根据GenBank中登录的ILTV gB基因序列设计了2对引物与一条特异性TaqMan探针,通过对反应体系和反应条件的优化,特异性、敏感性以及重复性试验,证明该方法在核酸含量108拷贝/μL~101拷贝/μL范围内具有良好的线性关系;能够检测初始模板中10-3EID50的病毒核酸及16拷贝的标准品;与其它相关的鸡源病毒均无交叉反应,并且批内、批间变异系数均小于2%,具有良好的重复性。该检测方法的建立为ILTV的临床检测和定量分析提供了一种快速、准确的技术手段。 展开更多
关键词 鸡传染性喉气管炎病毒 GB基因 TAQMAN real-time PCR
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马铃薯环腐病菌Real-time Taqman-PCR检测体系的建立 被引量:8
17
作者 魏琪 胡林双 +6 位作者 董学志 闵凡祥 王晓丹 李凤兰 郭梅 芦娜 李学湛 《中国马铃薯》 2010年第5期301-305,共5页
本研究根据环腐病菌16S rRNA保守序列设计特异性引物及探针,建立了马铃薯环腐病菌实时定量荧光PCR检测体系。研究表明,该体系可以准确、稳定、定量的检测出样品中最低浓度为1fg·μL-1(即3.21×103copies·μL-)1的目的基因... 本研究根据环腐病菌16S rRNA保守序列设计特异性引物及探针,建立了马铃薯环腐病菌实时定量荧光PCR检测体系。研究表明,该体系可以准确、稳定、定量的检测出样品中最低浓度为1fg·μL-1(即3.21×103copies·μL-)1的目的基因,检测极限可以达到几个拷贝。该检测体系可对马铃薯环腐病菌进行微量检测,对于保证马铃薯各级种薯、商品薯及其相关产品的质量,提高市场竞争力具有重要意义。 展开更多
关键词 马铃薯 环腐病菌 real-time Taqman-PCR
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Real-time PCR方法和PCR方法检测虾白斑综合征病毒 被引量:2
18
作者 熊炜 邱璐 +5 位作者 李健 蒋静 王巧全 李树清 杨锡佺 胡永强 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期138-141,共4页
由白斑综合征病毒引起的虾白斑综合征是国际兽医局(OIE)规定的必须上报的水生动物二类疫病。本研究首先通过设计新的PCR引物,提高了PCR检测白斑综合征病毒的阳性检出率。为进一步提高白斑综合征病毒检测的灵敏度,本研究采用TaqMan探针... 由白斑综合征病毒引起的虾白斑综合征是国际兽医局(OIE)规定的必须上报的水生动物二类疫病。本研究首先通过设计新的PCR引物,提高了PCR检测白斑综合征病毒的阳性检出率。为进一步提高白斑综合征病毒检测的灵敏度,本研究采用TaqMan探针技术建立了快速检测白斑综合征病毒的real-time PCR方法,通过与常规PCR方法比较,证实其检测灵敏度显著提高。 展开更多
关键词 白斑综合征病毒 real-time PCR PCR
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利用real-time RT-PCR研究大型蚤对铜绿微囊藻毒素合成基因转录水平影响 被引量:3
19
作者 宋瑞峰 王国祥 +4 位作者 徐瑶 邵继海 王中杰 刘洋 李仁辉 《湖泊科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2011年第1期150-154,共5页
近年来关于浮游动物与微囊藻相互作用的研究逐渐被关注,其中有的研究认为浮游动物能够诱导产毒细胞毒素含量的变化.微囊藻毒素是由微囊藻毒素合成基因编码翻译的,目前关于浮游动物对微囊藻毒素合成基因相对表达的影响并无报道,本文首次... 近年来关于浮游动物与微囊藻相互作用的研究逐渐被关注,其中有的研究认为浮游动物能够诱导产毒细胞毒素含量的变化.微囊藻毒素是由微囊藻毒素合成基因编码翻译的,目前关于浮游动物对微囊藻毒素合成基因相对表达的影响并无报道,本文首次通过实时定量逆转录PCR方法研究铜绿微囊藻PCC7806产毒相关基因mcyB和mcyD在大型蚤胁迫下相对表达变化.结果显示微囊藻mcyB、mcyD基因相对表达均有上调,表明铜绿微囊藻PCC7806通过上调产毒基因的转录水平达到对大型蚤的诱导防御,从而为浮游动物与微囊藻相互作用研究提供新的依据. 展开更多
关键词 real-time RT-PCR 微囊藻产毒基因 大型蚤 诱导防御
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利用Real-time PCR对外周血白细胞中EIAV前病毒及血浆中病毒RNA含量的测定 被引量:2
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作者 袁秀芳 周涛 +5 位作者 吴东来 涂亚斌 彭金美 温建新 仇华吉 童光志 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期241-244,249,共5页
利用Real_timePCR和Real_timeRT_PCR方法对马传染性贫血病(EIA)驴白细胞弱毒疫苗(DLA_EIAV)、DLA_EIAV感染性分子克隆衍生毒(vOK8226)、强弱毒嵌合病毒(vOKVltr)以及EIA强毒接种马后不同时期外周血白细胞中前病毒含量及血浆中病毒含量... 利用Real_timePCR和Real_timeRT_PCR方法对马传染性贫血病(EIA)驴白细胞弱毒疫苗(DLA_EIAV)、DLA_EIAV感染性分子克隆衍生毒(vOK8226)、强弱毒嵌合病毒(vOKVltr)以及EIA强毒接种马后不同时期外周血白细胞中前病毒含量及血浆中病毒含量进行了监测,结果发现直接攻击强毒的2匹马及1匹接种vOK8226后再用强毒攻击的马血浆中病毒含量快速升高,伴随着明显的临床反应,最后均以死亡结束。其它免疫接种马在攻击强毒后均获得保护,没有发病,马血浆中有低水平病毒存在,攻毒后3个月血浆中检测不到病毒,说明感染马体内病毒的大量增殖与疾病的进程有着直接的关系。而外周血白细胞中前病毒的含量在各试验马各时期均能检测到,说明EIAV以前病毒的形式潜伏在感染马体内,疫苗的免疫只能控制发病,而不能清除感染的病毒。 展开更多
关键词 马传染性贫血病毒 real-time PCR 前病毒
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