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4种植物源性成分多重real-time PCR检测方法的建立及其在食用淀粉中的应用 被引量:3
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作者 范维 高晓月 +4 位作者 董雨馨 刘虹宇 李贺楠 赵文涛 郭文萍 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2024年第1期210-216,共7页
建立一种可同时快速检测红薯、木薯、马铃薯、玉米源性成分的多重实时聚合酶链式反应(real-time polymerase chain reaction,real-time PCR)方法。分别以红薯g3pdh基因、木薯g3pdh基因、马铃薯UGPase基因、玉米zSSIIb基因为靶基因设计... 建立一种可同时快速检测红薯、木薯、马铃薯、玉米源性成分的多重实时聚合酶链式反应(real-time polymerase chain reaction,real-time PCR)方法。分别以红薯g3pdh基因、木薯g3pdh基因、马铃薯UGPase基因、玉米zSSIIb基因为靶基因设计特异性引物和TaqMan探针,以18S rRNA基因为内参基因,建立多重real-time PCR方法,开展方法学验证,并对不同掺入比例模拟样品和实际淀粉样品进行检测。结果显示,该方法具有高通量、特异性强、灵敏度高等优点。与15种非目标源性均无交叉反应;对目标DNA的检测灵敏度可达到3×10^(-3) ng/μL,且具有良好的线性关系和扩增效率;对淀粉样品的检出限可达0.1%,对50份实际样品进行检测,结果与参比方法一致,说明建立的多重real-time PCR法可用于食用淀粉种类掺假鉴别检测。 展开更多
关键词 多重实时聚合酶链式反应 食用淀粉 木薯 红薯 马铃薯 玉米
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马乳酒样乳杆菌马乳酒样亚种real-time PCR检测方法的建立与应用 被引量:1
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作者 吕厚姣 李欣媛 +3 位作者 白小佳 贾龙刚 耿伟涛 王艳萍 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2024年第9期102-108,共7页
本研究建立了一种特异性实时聚合酶链式反应(real-time polymerase chain reaction,real-time PCR)检测方法,根据模式菌株马乳酒样乳杆菌马乳酒样亚种ZW3的16S rDNA序列和全基因组序列设计筛选特异性引物,采用SYBR Green I荧光染料建立r... 本研究建立了一种特异性实时聚合酶链式反应(real-time polymerase chain reaction,real-time PCR)检测方法,根据模式菌株马乳酒样乳杆菌马乳酒样亚种ZW3的16S rDNA序列和全基因组序列设计筛选特异性引物,采用SYBR Green I荧光染料建立real-time PCR方法,并对方法的特异性、灵敏度、重复性和混合体系等进行检测。结果表明,本研究所建立的方法特异性强、灵敏度高、重复性好,建立real-time PCR的标准曲线,其决定系数R2为0.965,具有良好的线性关系,且在马乳酒样乳杆菌马乳酒样亚种及混合体系中可以特异性检出。综上,本研究建立的real-time PCR法可以快速、准确地检测马乳酒样乳杆菌马乳酒样亚种,为马乳酒样乳杆菌的特异性定性定量检测提供了一种新的方法。 展开更多
关键词 马乳酒样乳杆菌马乳酒样亚种 实时聚合酶链式反应 特异性引物
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BORRELIA BURGDORFERI DNA IN BIOLOGICAL SAMPLES FROM PATIENTS WITH SARCOIDOSIS USING THE POLYMERASE CHAIN REACTION TECHNIQUE 被引量:1
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作者 连伟 罗慰慈 《Chinese Medical Sciences Journal》 CAS CSCD 1995年第2期93-95,共3页
Polymerase chain reaction (PCR) was used to detect the presence of Barrelia burgdoferi DNA in biological samples from patients with sarcoidosis. The target DNA sequence was of chromosomal origin. The amplified DNA seq... Polymerase chain reaction (PCR) was used to detect the presence of Barrelia burgdoferi DNA in biological samples from patients with sarcoidosis. The target DNA sequence was of chromosomal origin. The amplified DNA sequence was analyzed by agarose gel electrophoresis, PAGE with silver staining, and the identity of amplified DNA was confirmed by restriction enzyme cleavage and DNA-DNA hybridization with a 32P-labelled probe. The assay was sensitive to fewer than two copies of B. burgdorferi genome, even in the presence of a 104-fold excess of human eukaryotic DNA , and was also specific to different B. burgdorferi strains tested. Sera serologically positive to B. burgdcrferi (n=26), bronchoalveolar lavage fluid and supernatant of BALF (n=26) and peripheral blood (n=9) from sarcoidosis patients were tested. The positive rate was low (4/26, 2/26. and 0/9, respectively). It was considered that DNA from B. burgdor ferimay be identified in a minority of patients with sarcoidosis, and it may play a pathogenetic role in such cases. More studies need to be done before advancing the hypothesis of an etiologic role of B. burgdorferi in sarcoidosis. 展开更多
关键词 SARCOIDOSIS Borrelia burgdorferi polymerase chain reaction (pcr)
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一种5重real-time PCR筛查转基因水稻方法的建立 被引量:6
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作者 董立明 杨帆 +4 位作者 邢珍娟 李葱葱 闫伟 龙丽坤 李飞武 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2021年第24期329-334,共6页
以转基因水稻中最常用的CaMV35S启动子、NOS终止子、Cry1Ab/Ac基因、HPT基因及SPS水稻内标基因为研究对象,利用5种不同的荧光信号(FAM、HEX、Taxas Red、Cy5、Cy5.5)进行多重实时聚合酶链式反应(realtime polymerase chain reaction,rea... 以转基因水稻中最常用的CaMV35S启动子、NOS终止子、Cry1Ab/Ac基因、HPT基因及SPS水稻内标基因为研究对象,利用5种不同的荧光信号(FAM、HEX、Taxas Red、Cy5、Cy5.5)进行多重实时聚合酶链式反应(realtime polymerase chain reaction,real-time PCR)检测方法的研究。通过引物组合筛选、反应体系优化、特异性测试、灵敏度测试、适用性测试等一系列实验,建立了5重real-time PCR方法,灵敏度可达0.032%。此方法具有灵敏度高、结果准确、通量大等优点,可实现水稻中转基因成分的快速、高效检测。 展开更多
关键词 转基因水稻 筛查元件 单一实时聚合酶链式反应 5重实时聚合酶链式反应 高通量检测方法
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4种动物源性成分多重real-time PCR检测方法的建立及其在驴肉制品检测中的应用 被引量:8
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作者 范维 高晓月 +4 位作者 李贺楠 董雨馨 刘虹宇 李宇轩 郭文萍 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2023年第8期317-323,共7页
建立一种同时快速检测驴、马、猪及鸭源性成分的四重实时聚合酶链式反应(real-time polymerase chain reaction,real-time PCR)方法。分别以4种源性成分的Nad5、ATpase6、ATP8、cytb基因为靶基因设计特异性引物和TaqMan探针,以18S rRNA... 建立一种同时快速检测驴、马、猪及鸭源性成分的四重实时聚合酶链式反应(real-time polymerase chain reaction,real-time PCR)方法。分别以4种源性成分的Nad5、ATpase6、ATP8、cytb基因为靶基因设计特异性引物和TaqMan探针,以18S rRNA基因为内参基因,建立多重real-time PCR方法,并对该方法进行方法学验证,同时对不同掺入比例模拟样品、不同加工工艺模拟样品和实际驴肉样品进行检测。结果显示,该方法具有高通量、特异性强、灵敏度高等优点。当Ct值≤35.0时,方法对16种非目标源性具有良好特异性;灵敏度可检测到质量浓度为2×10^(-4)ng/μL的模板DNA;对生肉的检出限为肉含量的0.001%,对熟肉制品的检出限为肉含量的0.01%;对100份实际样品进行检测,结果与标准方法一致,说明建立的多重real-time PCR法可用于肉及肉制品中常见掺假源性成分的检测。 展开更多
关键词 多重实时聚合酶链式反应 掺假鉴别 驴肉 马肉 猪肉 鸭肉
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3种致病菌多重real-time PCR检测方法的建立及其在散装即食肉制品中的应用 被引量:15
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作者 范维 高晓月 +4 位作者 李贺楠 董雨馨 李宇轩 刘虹宇 郭文萍 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2022年第2期332-338,共7页
建立一种同时快速检测沙门氏菌、金黄色葡萄球菌和蜡样芽孢杆菌的三重实时聚合酶链式反应(realtime polymerase chain reaction,real-time PCR)方法。以沙门氏菌invA基因、金黄色葡萄球菌Sa442基因和蜡样芽孢杆菌Cereolysin AB基因为靶... 建立一种同时快速检测沙门氏菌、金黄色葡萄球菌和蜡样芽孢杆菌的三重实时聚合酶链式反应(realtime polymerase chain reaction,real-time PCR)方法。以沙门氏菌invA基因、金黄色葡萄球菌Sa442基因和蜡样芽孢杆菌Cereolysin AB基因为靶基因设计引物和TaqMan探针,建立多重real-time PCR方法,对该方法进行方法学验证,并对实际的散装即食肉制品样品进行检测。结果表明,该方法特异性强、灵敏度高、重复性好。对15株非目标菌进行检测,结果均为阴性;3种致病菌的定量线性浓度范围为10^(2)~10^(8) CFU/mL,且定量检测批内和批间的变异系数均小于2%;沙门氏菌、金黄色葡萄球菌和蜡样芽孢杆菌在未增菌的即食肉制品样品中检出限分别为3.8×10^(2)、4.9×10^(2) CFU/mL和5.7×10^(2) CFU/mL,经增菌5 h后,检出限提高到3.8、4.9 CFU/mL和5.7 CFU/mL。对100份实际样品进行检测,结果与标准方法一致,说明建立的多重real-time PCR法可以用于散装即食肉制品中3种致病菌的检测。 展开更多
关键词 沙门氏菌 金黄色葡萄球菌 蜡样芽孢杆菌 多重实时聚合酶链式反应 即食肉制品
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多重real-time PCR技术快速鉴别特种乳中的乳源动物成分 被引量:11
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作者 杨艳歌 李莉 +4 位作者 王丹丹 李唯熙 王洪越 刘鸣畅 吴亚君 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2021年第16期312-321,共10页
建立一种特种乳中乳源动物成分快速鉴别多重实时聚合酶链式反应技术。通过筛选建立8种不同乳源物种检测的多重实时聚合酶链式反应方法,在一个反应体系里可同时检测4种乳源的特异性靶基因,绝对灵敏度达0.1~5 pg/μL,检出限可达0.1%。同时... 建立一种特种乳中乳源动物成分快速鉴别多重实时聚合酶链式反应技术。通过筛选建立8种不同乳源物种检测的多重实时聚合酶链式反应方法,在一个反应体系里可同时检测4种乳源的特异性靶基因,绝对灵敏度达0.1~5 pg/μL,检出限可达0.1%。同时,建立了高效的DNA提取方法,样品裂解后可在12 min左右完成96个样品的DNA提取,大大缩短了样品前处理时间。采用该方法对市售特色乳产品进行调查,结果显示标识不准确的产品比例达36.36%。 展开更多
关键词 多重实时聚合酶链式反应 特种乳 乳源动物 掺伪 鉴别
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全基因组测序和real-time PCR法检测食源性沙门氏菌parC、gyrA基因突变特征 被引量:10
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作者 毕旺来 赵巍薇 +2 位作者 马达 李睿 周敏 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2022年第12期296-302,共7页
以45株食源性沙门氏菌喹诺酮耐药株为对象,采取全基因组测序和实时聚合酶链式反应(real-time polymerase chain reaction,real-time PCR)法检测parC、gyrA基因突变位点,并对检测方法可靠性、耐药基因突变特征进行评估和分析。首先将4株... 以45株食源性沙门氏菌喹诺酮耐药株为对象,采取全基因组测序和实时聚合酶链式反应(real-time polymerase chain reaction,real-time PCR)法检测parC、gyrA基因突变位点,并对检测方法可靠性、耐药基因突变特征进行评估和分析。首先将4株沙门氏菌进行二代全基因组测序,根据测序数据分析结果,建立了一种real-time PCR法检测gyrA Asp87Tyr、gyrA Asp87Asn、parC Thr57Ser和parC Ser80Ile这4个突变位点。将沙门氏菌进行qnrS、qnrA、qnrB的real-time PCR检测,发现有31株菌未检出qnr基因。以这31株菌为对象,采取real-time PCR法筛查基因突变位点,结果发现parC Thr57Ser和gyrA Asp87Asn型突变最常见。将real-time PCR阳性的10株菌扩增parC、gyrA基因全长并测序,real-time PCR检测和测序结果完全吻合,说明了real-time PCR检测的可靠性。全基因组测序和real-time PCR法相结合的方法用于耐药基因突变筛查,既可以发现新的基因突变,又可以快速筛查大样本的主要突变类型,可作为沙门氏菌耐药性研究的一种可靠手段。 展开更多
关键词 沙门氏菌 全基因组测序 实时聚合酶链式反应 喹诺酮 耐药基因
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三重real-time PCR检测副溶血弧菌主要毒力基因 被引量:4
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作者 陈松 雷舒文 +2 位作者 上官文丹 刘丹 钟青萍 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2021年第22期298-304,共7页
针对编码副溶血弧菌的特异性基因和主要毒力基因tlh、tdh、ureR进行引物及探针设计,通过优化反应条件,建立基于Taqman探针快速检测副溶血弧菌毒力基因的三重实时聚合酶链式反应(real-time polymerase chain reaction,real-time PCR)方... 针对编码副溶血弧菌的特异性基因和主要毒力基因tlh、tdh、ureR进行引物及探针设计,通过优化反应条件,建立基于Taqman探针快速检测副溶血弧菌毒力基因的三重实时聚合酶链式反应(real-time polymerase chain reaction,real-time PCR)方法。利用10株副溶血弧菌和22株非副溶血弧菌对设计的引物及探针进行特异性验证,结果表明设计的引物及探针具有很高的特异性;优化后的引物浓度分别为tdh 0.15μmol/L、tlh 0.15μmol/L、ureR 0.80μmol/L,探针浓度分别为HEX 0.50μmol/L、FAM 0.50μmol/L;该方法即使在高浓度的背景细菌存在下,DNA浓度与Ct值均呈良好的线性关系,检出限为1.8×10^(2)拷贝/mL;以完整菌细胞的悬液为模板时,预变性时间为30 min,扩增检测效果与以基因组DNA(gDNA)为模板相当(ΔCt<1)。本研究建立的三重real-time PCR方法能实现快速定量检测副溶血弧菌,并能有效区分致病性及非致病性副溶血弧菌,为副溶血弧菌的快速定量检测和风险评估提供快速、灵敏、准确的方法。 展开更多
关键词 副溶血弧菌 多重实时聚合酶链式反应 快速检测 毒力基因
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高灵敏度real-time PCR在低病毒载量病毒性肝病中的临床应用价值 被引量:4
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作者 陈鹏 孙玉良 +1 位作者 邓星 肖明中 《中国医药导报》 CAS 2020年第19期151-155,共5页
目的 评估高灵敏度实时荧光定量聚合酶链反应(real-time PCR)在病毒性肝病病毒核酸定量检测中的临床应用价值,为该方法的普及应用提供依据.方法 收集2016年1月~2018年12月于湖北省中医院(以下简称“我院”)就诊的病毒性肝病患者895例,... 目的 评估高灵敏度实时荧光定量聚合酶链反应(real-time PCR)在病毒性肝病病毒核酸定量检测中的临床应用价值,为该方法的普及应用提供依据.方法 收集2016年1月~2018年12月于湖北省中医院(以下简称“我院”)就诊的病毒性肝病患者895例,同期选取我院100名健康体检者作为对照组.分别应用常规方法和高灵敏度real-time PCR方法检测血清病毒核酸载量,比较两种方法检测结果的差异.对其中低病毒载量患者的生物化学指标、免疫学指标、凝血国际标准化比值(INR)和肝纤维化FIB-4指数的变化趋势、特点及其与病毒核酸载量的相关性进行统计分析.结果 受检人群中低病毒载量患者呈高比例分布.高灵敏度real-time PCR方法检测HBV DNA的阳性率远高于常规方法(P<0.05),而对于HCV RNA,两种方法检测结果的一致性较好.低病毒载量患者的多项生物化学指标波动并不明显,且多项生物化学指标与病毒核酸载量无相关性(P>0.05).大部分低病毒载量乙肝患者表现为HBeAg阴性的低水平复制状态.免疫学诊断指标与病毒核酸载量间存在不同程度的不一致和弱关联度.低病毒载量患者的凝血INR和肝纤维化FIB-4指数均高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05),但其与病毒核酸载量无相关性(P>0.05).结论 高灵敏度real-time PCR方法对病毒核酸载量的检测具有不可比拟的优势,结合其他的诊断指标,其可在低拷贝病毒性肝病的病程管理中发挥不可替代的重要作用. 展开更多
关键词 高灵敏度 实时荧光定量聚合酶链反应 病毒性肝病 病毒核酸定量 低病毒载量
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Real-time PCR法检测水产品中异鳞蛇鲭、棘鳞蛇鲭源性成分 被引量:6
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作者 信红梅 姚琳 +5 位作者 陆键萍 曲梦 江艳华 李风铃 郭莹莹 王联珠 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2020年第24期273-280,共8页
目的:建立异鳞蛇鲭、棘鳞蛇鲭实时聚合酶链式反应(real-time polymerase chain reaction,real-time PCR)检测方法。方法:对比异鳞蛇鲭、棘鳞蛇鲭、大西洋鳕等18种鳕鱼及易掺假品种的线粒体细胞色素C氧化酶I(cytochrome C oxidase subuni... 目的:建立异鳞蛇鲭、棘鳞蛇鲭实时聚合酶链式反应(real-time polymerase chain reaction,real-time PCR)检测方法。方法:对比异鳞蛇鲭、棘鳞蛇鲭、大西洋鳕等18种鳕鱼及易掺假品种的线粒体细胞色素C氧化酶I(cytochrome C oxidase subunit I,COI)基因,设计异鳞蛇鲭、棘鳞蛇鲭物种特异性引物/探针,建立两种鱼的real-time PCR检测方法,评估其特异性、绝对灵敏度和相对灵敏度;用该方法对50份市售标称“鳕鱼”制品进行检测,评估其实际使用效果。结果:两种检测方法特异性强,绝对灵敏度为0.002 ng/μL(异鳞蛇鲭)和0.0002 ng/μL(棘鳞蛇鲭),相对灵敏度均达0.01%,满足实际检测需求。在50份市售样品中检出1份含异鳞蛇鲭成分,1份含棘鳞蛇鲭成分,与测序比对结果一致。结论:本研究建立的异鳞蛇鲭和棘鳞蛇鲭源性成分的检测方法特异性强、灵敏度高,为保护消费者权益和水产品掺杂使假的检测提供技术支持。 展开更多
关键词 异鳞蛇鲭 棘鳞蛇鲭 油鱼 实时聚合酶链式反应 COI基因
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Real-time PCR和双向电泳联合鉴别婴幼儿配方羊乳粉的乳源成分 被引量:3
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作者 侯艳梅 杨艳歌 +4 位作者 吴桐 刘鸣畅 王洪越 王丹丹 吴亚君 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2022年第8期324-333,共10页
为实现对婴幼儿配方羊乳粉中乳源成分的准确判别,将基因检测作为初筛方法,以蛋白质双向电泳作为确证方法,研究该技术路线下对乳源成分检测的灵敏度、准确性等指标。优化建立的基于嗜热蛋白酶的一步式DNA提取法,仅需通过温控反应在17 mi... 为实现对婴幼儿配方羊乳粉中乳源成分的准确判别,将基因检测作为初筛方法,以蛋白质双向电泳作为确证方法,研究该技术路线下对乳源成分检测的灵敏度、准确性等指标。优化建立的基于嗜热蛋白酶的一步式DNA提取法,仅需通过温控反应在17 min内完成DNA步骤,极大缩短了样品前处理时间;建立的快速实时聚合酶链式反应(real-time polymerase chain reaction,real-time PCR)程序仅需28 min 26 s即可完成检测。通过牛(家牛、水牛、牦牛)、羊(山羊和绵羊)、山羊、绵羊单一乳源成分,以及哺乳动物内参照检测体系,可以实现对低至10~100 pg/μL DNA的检测,对混合样品中牛源性成分检测的灵敏度可达1%(m/m)。然后结合双向电泳技术进一步确证产品的蛋白成分来源,可以判定牛基因检测阳性的样品是否含有来源于牛乳酪蛋白或乳清蛋白,进而对样品的真实性进行判定。real-time PCR法和双向电泳技术联合检测解决了以往婴幼儿配方乳粉检测中因配料复杂乳源判别困难的瓶颈问题。 展开更多
关键词 婴幼儿配方羊乳粉 实时聚合酶链式反应 双向电泳 乳源检测
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三重real-time PCR同步检测黄牛、水牛和牦牛成分 被引量:2
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作者 吴姗 张明哲 +7 位作者 方云 陈哲 张荃 孙超 沈旭芳 虞惠贞 尹文秀 张晓峰 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2021年第20期280-285,共6页
为准确快速地鉴定黄牛、水牛和牦牛的成分,研发具有这3种牛特异性的引物和探针,并建立单重、双重和三重实时聚合酶链式反应(real-time polymerase chain reaction,real-time PCR)方法,同步检测上述3种牛的成分。单重real-time PCR检测... 为准确快速地鉴定黄牛、水牛和牦牛的成分,研发具有这3种牛特异性的引物和探针,并建立单重、双重和三重实时聚合酶链式反应(real-time polymerase chain reaction,real-time PCR)方法,同步检测上述3种牛的成分。单重real-time PCR检测时,3种牛的检测灵敏度均为0.025 ng/μL;双重real-time PCR检测时,两两组合的引物探针含量比例为1∶1时,黄牛的检测灵敏度降低至0.1 ng/μL,而水牛和牦牛仍为0.025 ng/μL;对三重real-time PCR检测体系进行优化,当黄牛、水牛和牦牛3组引物探针的含量比例为3∶3∶2时,检测灵敏度最佳,黄牛和水牛的检测灵敏度可达到0.1 ng/μL,而牦牛的灵敏度仍可达到0.025 ng/μL。但上述双重和三重real-time PCR检测的灵敏度,是建立在3种牛的含量比例为1∶1∶1的情况下,若3种牛的比例差异较大,特别是黄牛和牦牛的含量比例差异较大时,如比例为9∶1时,含量低的成分会存在漏检。因此,在对整块肉的样品进行检测时,可采用三重real-time PCR的方法同步检测3种牛的成分;若样品可能为上述3种肉的为混合物,如肉糜、肉松等,则建议采用单重real-time PCR检测。 展开更多
关键词 黄牛 水牛 牦牛 三重real-time pcr
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PMA-qPCR定量检测饮用水中铜绿假单胞菌的方法
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作者 张瑞停 王园媛 +2 位作者 邢方潇 张晓 张岚 《净水技术》 2025年第5期206-215,共10页
【目的】为预防水源性疾病暴发和保障水质安全,建立快速、准确的检测水中活性病原菌的方法至关重要。鉴于生活饮用水细菌含量较低,建立一种适用于大体积饮用水中铜绿假单胞菌检测的富集浓缩及叠氮溴化丙锭-定量聚合酶链式反应(PMA-qPCR... 【目的】为预防水源性疾病暴发和保障水质安全,建立快速、准确的检测水中活性病原菌的方法至关重要。鉴于生活饮用水细菌含量较低,建立一种适用于大体积饮用水中铜绿假单胞菌检测的富集浓缩及叠氮溴化丙锭-定量聚合酶链式反应(PMA-qPCR)方法。【方法】通过调整涡旋振荡时长,计算加标回收率,优化富集浓缩方法;采用L_(16)(4^(3))正交试验筛选能够有效去除铜绿假单胞菌死菌脱氧核糖核酸的PMA处理条件的最佳组合,并进行验证。【结果】通过膜过滤法将10 L饮用水中的铜绿假单胞菌富集至膜上后,采用涡旋振荡(转速为3000 r/min,振荡时间为15 min,重复2次)及离心(8000 g,10 min)的方式将膜上的细菌洗脱至1 mL磷酸盐缓冲液(PBS)中。该方法在50 min内完成且回收率可达80.95%±7.43%。PMA-qPCR法的最优PMA处理条件:PMA浓度为30μmol/L、黑暗中孵育时间为20 min、光暴露时间为20 min。该方法与平板计数法的检测结果一致,可有效抑制死菌DNA的扩增。活菌数与PMA-qPCR扩增循环数为1×10^(2)~1×10^(6)CFU/mL时呈现良好的线性关系(R2=0.99),建立的标准曲线方程(y=-3.541x+44.11)可定量检测活菌数量。PMA-qPCR法定量限为1×10^(2)CFU/mL,且结合富集的方式,灵敏度可被提高1×10^(4)倍。【结论】该研究建立的检测方法适用于10 L大体积饮用水中铜绿假单胞菌活菌的定量分析,为后续深入研究提供了有效的技术手段。 展开更多
关键词 铜绿假单胞菌 叠氮溴化丙锭(PMA) 荧光定量聚合酶链式反应(pcr) 活菌计数 饮用水
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基于LNA-TaqMan探针实时荧光定量PCR检测技术的天山雪莲掺伪研究
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作者 王多梅 杨建波 +6 位作者 杨乐 于新兰 李海芳 胡冲 陈灵丽 蒲婧哲 张亚中 《中国现代中药》 2025年第2期202-209,共8页
目的:采用锁核酸(LNA)-TaqMan实时荧光定量聚合酶链式反应(PCR)技术建立一种高效、快速鉴定天山雪莲中掺伪水母雪兔子、绵头雪兔子的方法。方法:基于LNA-TaqMan探针实时荧光定量PCR技术,利用天山雪莲及其常见易混伪品水母雪兔子、绵头... 目的:采用锁核酸(LNA)-TaqMan实时荧光定量聚合酶链式反应(PCR)技术建立一种高效、快速鉴定天山雪莲中掺伪水母雪兔子、绵头雪兔子的方法。方法:基于LNA-TaqMan探针实时荧光定量PCR技术,利用天山雪莲及其常见易混伪品水母雪兔子、绵头雪兔子的叶绿体基因组序列差异,根据伪品水母雪兔子、绵头雪兔子与天山雪莲的特异性差异位点设计筛选探针引物,并对引物及LNA-TaqMan探针的特异性进行验证,根据扩增曲线临界循环数(C)t值的差值计算掺伪比例。结果:基于LNA-TaqMan探针检测方法,通过出现特异性扩增曲线判定检测出水母雪兔子和绵头雪兔子,根据扩增曲线Ct值的差值能有效确定掺伪比例,且在掺伪1%时仍可稳定检出。结论:该方法用于天山雪莲中掺伪水母雪兔子和绵头雪兔子检测灵敏度高、特异性强,可有效解决天山雪莲混伪品难以鉴别的问题,为天山雪莲药材质量控制提供技术支持。 展开更多
关键词 天山雪莲 水母雪兔子 绵头雪兔子 锁核酸-TaqMan探针 实时荧光定量聚合酶链式反应 掺伪
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PCR双向开启硫黄素T/G四链体探针无标记检测牛奶中沙门氏菌方法研究
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作者 尚慧杰 徐建国 +2 位作者 彭育勃 陈伟 姚丽 《合肥工业大学学报(自然科学版)》 北大核心 2025年第5期677-681,687,共6页
文章提出一种基于聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)的硫黄素T(ThT)/G-四链体探针无标记检测牛奶中沙门氏菌(Salmonella)方法。以沙门氏菌的invA基因为检测目标,设计特异性发卡引物,通过PCR和特异功能的G-四链体实现对沙... 文章提出一种基于聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)的硫黄素T(ThT)/G-四链体探针无标记检测牛奶中沙门氏菌(Salmonella)方法。以沙门氏菌的invA基因为检测目标,设计特异性发卡引物,通过PCR和特异功能的G-四链体实现对沙门氏菌的检测。结果表明,该检测方法操作简便、特异性强、灵敏度高。在最优反应体系下,沙门氏菌的浓度与信号输出值具有良好的线性关系,其回归方程为Y=27.149X+0.292,R^(2)=0.981,其线性范围为10^(2)~10^(6) CFU/mL。纯菌样品和实际样品都能在细菌浓度为10^(2) CFU/mL时检测出信号,表明该方法具有抗基质效应。研究结果为食源性致病菌的检测提供了一种新的思路。 展开更多
关键词 G-四链体 硫黄素T 沙门氏菌 无标记检测 聚合酶链式反应(pcr)
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叠氮溴化丙锭-qPCR定量检测发酵乳中动物双歧杆菌乳亚种BB-12和植物乳植杆菌ST-Ⅲ
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作者 张玉律 包静 王琳玲 《食品安全质量检测学报》 2025年第7期255-261,共7页
目的将叠氮溴化丙锭(propidium monoazide,PMA)与实时荧光定量聚合酶链式反应(real-time fluorescence quantitative polymerase chain reaction,qPCR)联合,建立一种发酵乳体系中动物双歧杆菌乳亚种BB-12和植物乳植杆菌ST-Ⅲ的活菌定量... 目的将叠氮溴化丙锭(propidium monoazide,PMA)与实时荧光定量聚合酶链式反应(real-time fluorescence quantitative polymerase chain reaction,qPCR)联合,建立一种发酵乳体系中动物双歧杆菌乳亚种BB-12和植物乳植杆菌ST-Ⅲ的活菌定量检测方法。方法首先设计动物双歧杆菌乳亚种BB-12和植物乳植杆菌ST-Ⅲ的特异性基因序列的引物探针,验证引物探针特异性,优化PMA反应条件,建立标准曲线,验证灵敏度,最后定量检测发酵乳样品中动物双歧杆菌乳亚种BB-12和植物乳植杆菌ST-Ⅲ菌株的数量。结果动物双歧杆菌乳亚种BB-12与植物乳植杆菌ST-Ⅲ经PMA处理受损菌的最佳质量浓度为10μg/mL,处理菌液样品的最佳曝光时间为10 min,PMA-qPCR方法能够准确检测发酵乳体系中的动物双歧杆菌乳亚种BB-12与植物乳植杆菌ST-Ⅲ。结论本研究建立了一种快速、准确PMA-qPCR检测方法,用于检测发酵乳体系中的动物双歧杆菌乳亚种BB-12与植物乳植杆菌ST-Ⅲ,为发酵乳产品中益生菌的定量检测提供一定的借鉴意义。 展开更多
关键词 叠氮溴化丙锭 实时荧光定量聚合酶链式反应 动物双歧杆菌乳亚种BB-12 植物乳植杆菌ST-Ⅲ
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荧光定量PCR法检测肉制品中小肠结肠炎耶尔森菌 被引量:1
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作者 于明明 孙广雷 +2 位作者 汪忆梦 姜丽丹 沈万恒 《食品安全导刊》 2024年第35期79-82,共4页
目的:进一步提高肉制品中小肠结肠炎耶尔森菌的检出效率。方法:按照《食品安全国家标准食品微生物学检验小肠结肠炎耶尔森氏菌检验》(GB 4789.8—2016)进行样品处理、增菌,采用荧光定量聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)... 目的:进一步提高肉制品中小肠结肠炎耶尔森菌的检出效率。方法:按照《食品安全国家标准食品微生物学检验小肠结肠炎耶尔森氏菌检验》(GB 4789.8—2016)进行样品处理、增菌,采用荧光定量聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)方法对增菌液进行初筛,初筛阳性的样本进行菌株分离,挑取选择性平板上典型菌落进行PCR鉴定及生化验证。结果:荧光定量PCR方法能够检出肉制品中低污染水平(1~10 CFU·mL^(-1))的小肠结肠炎耶尔森菌;352份肉制品中共检出小肠结肠炎耶尔森菌阳性样本34份,总检出率为9.66%,其中禽肉检出率为8.94%(27/302),猪肉检出率为14.0%(7/50)。结论:肉制品中小肠结肠炎耶尔森菌污染率较高,采用荧光定量PCR结合传统生化分离法能提高肉制品中小肠结肠炎耶尔森菌检测效率,减少漏检。 展开更多
关键词 小肠结肠炎耶尔森菌 肉制品 实时荧光聚合酶链式反应
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帕利亚姆病毒实时荧光定量RT-PCR检测方法的建立与应用 被引量:1
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作者 杨恒 李占鸿 +5 位作者 宋子昂 高林 李卓然 廖德芳 肖雷 李华春 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期395-400,共6页
本研究拟建立帕利亚姆病毒(Palyam virus,PALV)血清型特异性实时荧光定量RT-PCR(qRT-PCR)方法用于临床样本或媒介中PALV血清型鉴定。根据我国流行PALV毒株的基因节段2序列,设计扩增引物和TaqMan探针,建立PALV血清型特异型qRT-PCR方法,... 本研究拟建立帕利亚姆病毒(Palyam virus,PALV)血清型特异性实时荧光定量RT-PCR(qRT-PCR)方法用于临床样本或媒介中PALV血清型鉴定。根据我国流行PALV毒株的基因节段2序列,设计扩增引物和TaqMan探针,建立PALV血清型特异型qRT-PCR方法,对方法的特异性、灵敏性与重复性进行评估;以我国分离的28株PALV和90份核酸阳性血液样本评估检测方法的可靠性;利用建立的方法对采集库蠓样本中携带的PALV进行血清型鉴定。结果显示,建立的PALV血清型qRT-PCR检测方法具有良好的特异性与灵敏性,可检出核酸拷贝数下限在22至28 copies·μL^(-1)。对28株PALV的qRT-PCR检测结果与病毒测序鉴定结果一致;对PALV不同感染阶段哨兵动物血液(90份)中的qRT-PCR鉴定结果与分离病毒的血清型鉴定结果一致;建立的方法可准确鉴定库蠓中携带PALV的血清型。本研究建立的PALV血清型qRT-PCR定型方法具有良好的特异强、敏感性与重复性,可用于PALV感染动物与媒介中PALV血清型的鉴定,具有良好的应用价值。 展开更多
关键词 帕利亚姆病毒 血清型鉴定 实时荧光定量RT-pcr 检测方法
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位点特异性PCR鉴别水牛角及其伪品
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作者 张竞研 谭冰艳 +5 位作者 康安 王协和 李松 陈盛君 刘睿 段金廒 《中国现代中药》 CAS 2024年第9期1462-1469,共8页
目的:开发一种针对水牛角的特异性聚合酶链式反应(PCR)鉴别方法,快速、准确地鉴别水牛角与其他混伪品。方法:通过比对水牛、黄牛、牦牛、山羊等动物的细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)基因序列差异,筛选水牛的特异性单核苷酸多态性(SNP)位点... 目的:开发一种针对水牛角的特异性聚合酶链式反应(PCR)鉴别方法,快速、准确地鉴别水牛角与其他混伪品。方法:通过比对水牛、黄牛、牦牛、山羊等动物的细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)基因序列差异,筛选水牛的特异性单核苷酸多态性(SNP)位点,设计出相应的鉴别引物,并对影响PCR体系的相关条件进行优化,考察验证方法的耐受性和适用性。结果:PCR条件为扩增体系20μL、退火温度60℃、循环次数32次、DNA模板量为100 ng、10μmol·L^(-1)正反引物对各0.8μL时,使用设计的鉴别引物SN1对水牛角进行PCR扩增,产物经琼脂糖凝胶电泳后出现约358 bp的特异性条带,其他物种的样品均无条带出现。结论:该PCR鉴别方法特异性好,能迅速、准确地鉴别水牛角和其他常见动物角类样品,为水牛角的真伪鉴别提供参考。 展开更多
关键词 水牛角 聚合酶链式反应 鉴别
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