期刊文献+
共找到99篇文章
< 1 2 5 >
每页显示 20 50 100
鸽ADSL基因组织表达谱分析、SNP检测及其与肉质性状的关联分析
1
作者 董丽艳 王清艳 +4 位作者 魏彩霞 吴春琴 李瑞萍 陈晓燕 温积辉 《中国家禽》 北大核心 2025年第2期22-26,共5页
为研究腺苷酸琥珀酸裂解酶(ADSL)基因的组织表达谱及该基因对鸽肉质性状的影响,试验1以6只白羽王鸽的16个组织为研究材料,采用荧光定量PCR进行组织表达谱研究;试验2以140个白羽王鸽个体为研究材料,采用直接测序法筛选ADSL基因序列SNPs,... 为研究腺苷酸琥珀酸裂解酶(ADSL)基因的组织表达谱及该基因对鸽肉质性状的影响,试验1以6只白羽王鸽的16个组织为研究材料,采用荧光定量PCR进行组织表达谱研究;试验2以140个白羽王鸽个体为研究材料,采用直接测序法筛选ADSL基因序列SNPs,采集这140个个体的胸肌进行剪切力、肉色、pH值、电导率等肉质指标测定,采用索氏抽提法测定肌内脂肪含量;采用气相色谱-质谱联用法测定脂肪酸含量。结果显示:ADSL基因呈组成性表达模式,其在肝脏、胸肌、腿肌中的表达水平最高。ADSL基因序列中有11个突变位点,其中T2305C、G2476A、C2664T位点SNPs与多不饱和脂肪酸、肌内脂肪以及肌苷酸有显著或极显著相关性。说明ADSL基因这些SNPs可以作为肉质性状的分子标记,为肉鸽的育种提供基础资料。 展开更多
关键词 腺苷酸琥珀酸裂解酶基因 组织表达谱 单核苷酸多态性 肉质性状
在线阅读 下载PDF
基于SNP标记的玉米株高及穗位高QTL定位 被引量:52
2
作者 郑德波 杨小红 +4 位作者 李建生 严建兵 张士龙 贺正华 黄益勤 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期549-556,共8页
为进一步明确玉米株高和穗位高的遗传机制,为育种生产提供服务,本研究以K22×CI7、K22×Dan340的F2群体为作图群体,利用覆盖玉米10条染色体的SNP标记构建了2个连锁图谱。并将这2个F2群体衍生的分别含237和218个家系的F2:3群体... 为进一步明确玉米株高和穗位高的遗传机制,为育种生产提供服务,本研究以K22×CI7、K22×Dan340的F2群体为作图群体,利用覆盖玉米10条染色体的SNP标记构建了2个连锁图谱。并将这2个F2群体衍生的分别含237和218个家系的F2:3群体用于田间性状的鉴定。用复合区间作图模型对2个群体的株高、穗位高表型进行QTL定位分析。结果显示,在广西南宁和湖北武汉两种环境条件下共定位到21个株高QTL和27个穗位高QTL;单个QTL表型变异贡献率的变幅为4.9%~17.9%;株高和穗位高QTL的作用方式以加性和部分显性为主;第7染色体上可能存在控制株高和穗位高的主效QTL。 展开更多
关键词 SNP 数量性状位点(qtL) 连锁图谱 株高 穗位高 玉米
在线阅读 下载PDF
利用双向导入系剖析水稻源、库相关性状的QTL 被引量:8
3
作者 张强 陈凯 +5 位作者 梁云涛 章禄标 郑天清 徐建龙 张文忠 黎志康 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期261-271,共11页
以我国高产籼稻特青和美国优质粳稻Lemont为亲本培育的双向回交导入系为材料,采用单核苷酸多态性标记定位源相关性状(剑叶长、剑叶宽、剑叶面积、叶干重和比叶重)和库相关性状(穗总粒数、千粒重和穗实粒重)的QTL。特青剑叶长、穗总粒数... 以我国高产籼稻特青和美国优质粳稻Lemont为亲本培育的双向回交导入系为材料,采用单核苷酸多态性标记定位源相关性状(剑叶长、剑叶宽、剑叶面积、叶干重和比叶重)和库相关性状(穗总粒数、千粒重和穗实粒重)的QTL。特青剑叶长、穗总粒数和穗实粒重显著大于Lemont,剑叶宽则显著小于Lemont。双向导入系群体检测到影响源、库相关性状的QTL 62个,平均每个QTL解释群体表型变异的9.0%,变幅为3.0%~27.9%。Lemont背景导入系在第2、3、4、6、9和11等6个染色体的区段同时定位到影响源、库相关性状QTL 17个,占Lemont背景导入系定位QTL总数的50%。特青背景导入系在第1、3、4、8和12等5个染色体区段同时定位到影响源、库相关性状的QTL 13个,占特青背景导入系定位QTL总数的28.3%。Lemont背景下绝大多数位点导入特青等位基因均增加性状值,而特青背景绝大多数位点导入Lemont等位基因都减小性状值。两个背景共同检测到影响源、库相关性状的QTL有18个,占定位到62个QTL的29.0%,表明源、库相关性状QTL定位存在明显的遗传背景效应。发现第3染色体影响剑叶长、剑叶面积、叶片干重、每穗总粒数和穗实粒重的35576704~36341768区间和第4染色体影响比叶重、穗总粒数和穗实粒重的4560663~13503095区间,在以往不同群体中均被检测到,是影响水稻源、库相关性状的重要染色体区域,对标记辅助选择培育源、库协调的超高产水稻品种具有重要的应用价值。 展开更多
关键词 水稻 单核苷酸多态性标记 库源相关性状 比叶重 遗传背景
在线阅读 下载PDF
嘉积鸭APOC3基因多态性与生长性状关联分析
4
作者 谢攀攀 徐铁山 +1 位作者 顾丽红 张丽 《西南农业学报》 北大核心 2025年第4期855-864,共10页
【目的】筛查嘉积鸭载脂蛋白C3(APOC3)基因潜在的单核苷酸多态性(SNPs)位点,并分析其与生长性状的关联性,为嘉积鸭分子选育提供理论支撑。【方法】以嘉积鸭为研究对象,利用PCR扩增和直接测序法检测APOC3基因SNPs,并进行遗传多样性分析;... 【目的】筛查嘉积鸭载脂蛋白C3(APOC3)基因潜在的单核苷酸多态性(SNPs)位点,并分析其与生长性状的关联性,为嘉积鸭分子选育提供理论支撑。【方法】以嘉积鸭为研究对象,利用PCR扩增和直接测序法检测APOC3基因SNPs,并进行遗传多样性分析;采用SPSS对不同多态位点所对应的基因型与体尺指标进行相关性分析;利用HaploView软件分析APOC3基因SNPs的连锁不平衡和单倍型;通过NAfold WebServer软件预测不同基因型的mRNA二级结构。【结果】在嘉积鸭的APOC3基因中共发现11个SNPs,其中4个位于5′UTR,1个位于2号外显子中且为同义突变,其他6个为内含子突变,均存在3种基因型。其中,仅有3个SNPs即g.6555762G>A、g.6555842G>A、g.6555964C>T符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。SNPs多态位点与体重体尺关联分析结果表明,具有显著关联(P<0.05)的是2个SNPs位点(g.6555465G>A、g.6555516G>A)与龙骨长,1个SNP位点(g.6555516G>A)与胫长,2个SNPs位点(g.6555632C>T、g.6555640C>A)与体重,2个SNPs位点(g.6555762G>A、g.6555842G>A)与胸深,1个SNPs位点(g.6555842G>A)与体斜长,1个SNPs位点(g.6555964C>T)与胫围。g.6555513C>T和g.6555516G>A存在强连锁关系,形成3种单倍型,即H1(CA)、H2(CG)、H3(TG)。g.6555465G>A和g.6555494G>A位点的突变导致mRNA最小自由能升高,降低了mRNA二级结构稳定性,其余3个位点的突变降低了最小自由能,增加了二级结构稳定性。【结论】嘉积鸭APOC3基因的7个SNPs(g.6555465G>A、g.6555516G>A、g.6555632C>T、g.6555640C>A、g.6555762G>A、g.6555964C>T、g.6555842G>A)对体重、体斜长等生长指标具有显著影响,可作为嘉积鸭选育的候选标记。 展开更多
关键词 嘉积鸭 APOC3基因 生长性状 单核苷酸多态性 关联分析
在线阅读 下载PDF
杉虎杂交斑肌球蛋白重链基因分子结构分析及生长相关SNPs筛选
5
作者 曹柳 马军 +5 位作者 卢艳 武雅彤 王钧 钟立静 苏珊珊 黄海 《南方水产科学》 北大核心 2025年第4期171-184,共14页
肌球蛋白重链(Myosin heavy chain)参与鱼类肌纤维肥大和增生过程,在肌肉生长和收缩过程中扮演重要角色。为筛选出与生长性状相关的单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphisms,SNPs)位点,采用PCR扩增技术获得海水经济养殖鱼类—... 肌球蛋白重链(Myosin heavy chain)参与鱼类肌纤维肥大和增生过程,在肌肉生长和收缩过程中扮演重要角色。为筛选出与生长性状相关的单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphisms,SNPs)位点,采用PCR扩增技术获得海水经济养殖鱼类——杉虎杂交斑(棕点石斑鱼Epinephelus fuscoguttatus♀×清水石斑鱼E.polyphekadion♂)的肌球蛋白重链基因序列全长,并基于相关性分析筛选与生长性状相关的SNPs位点。结果表明,杉虎杂交斑肌球蛋白重链基因序列全长为12129 bp,包含36个外显子和35个内含子,可编码1934个氨基酸。该基因包含4种类型的蛋白结构域:Myosin_N、MYSc、IQ和Myosin_tail_1。经比对分析发现,该基因的核苷酸序列及蛋白结构域在鲈形目、鲀形目和鲽形目鱼类中均表现出较高的保守性。在肌球蛋白重链基因中检测到62个SNPs位点,其中8个符合Hardy-Weinberg平衡。有12个SNPs位点位于外显子区域,且均与体质量、全长等多个生长表型性状显著相关(p<0.05)。在这12个SNPs位点中仅有g5417 C>G为错义突变,导致丙氨酸变成甘氨酸;其余位点均为同义突变。这些与生长相关的SNPs位点可作为杉虎杂交斑生长分子标记开发的候选位点。 展开更多
关键词 杉虎杂交斑 肌球蛋白重链基因 生长性状 单核苷酸多态性位点
在线阅读 下载PDF
利用双向回交导入系定位水稻苗期耐亚铁毒和锌毒的QTL 被引量:2
6
作者 张建 Aijaz Ahmed SOOMRO +5 位作者 柴路 崔彦茹 王小倩 郑天清 徐建龙 黎志康 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第10期1754-1765,共12页
铁和锌是水稻生长必需的微量元素,但在低洼或酸性土壤中,过量的二价铁和锌对水稻生长具毒害作用,最终造成生物量和产量下降。为探讨水稻苗期耐亚铁毒、锌毒的遗传机制,利用优质粳稻品种Lemont和高产籼稻品种特青为亲本构建的高代双向回... 铁和锌是水稻生长必需的微量元素,但在低洼或酸性土壤中,过量的二价铁和锌对水稻生长具毒害作用,最终造成生物量和产量下降。为探讨水稻苗期耐亚铁毒、锌毒的遗传机制,利用优质粳稻品种Lemont和高产籼稻品种特青为亲本构建的高代双向回交导入系和308个在染色体上均匀分布的SNP标记剖析耐亚铁毒、锌毒相关的QTL。从双向导入系共检测到42个影响耐亚铁毒、锌毒相关性状如苗高、苗干重、根干重以及胁迫与对照相对值的QTL,多数位点增强亚铁毒、锌毒抗性的有利等位基因来自Lemont。其中同时在2个背景下表达的QTL有4个,占定位QTL总数的9.52%,说明大多数QTL的表达具有明显的遗传背景效应。同一遗传背景下同时影响耐亚铁毒和锌毒的QTL有9个,其中QSdw5在2个背景中均被检测到,其效应大小和方向一致,说明水稻苗期耐亚铁毒、锌毒之间存在遗传重叠位点。因此,通过分子标记辅助选择从Lemont中导入或聚合有利的遗传重叠区域,可以提高特青对亚铁毒、锌毒的抗性水平。 展开更多
关键词 耐亚铁毒害 耐锌毒害 qtL SNP 水稻
在线阅读 下载PDF
玉米苗期耐盐性状的QTL分析 被引量:1
7
作者 张宁 李冬冬 +4 位作者 陈阳松 任蒙蒙 王瑞 张凌霄 郑军 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第8期1536-1542,共7页
为探究玉米苗期耐盐性状的遗传调控机理,以耐盐的热带自交系CML298与盐敏感的温带自交系Zong31构建得到200份F2:3家系的初定位群体为试验材料,结合Illumina Maize 6K芯片获取相应的基因型数据,通过调查苗期盐胁迫处理前后的株高比率(SHR... 为探究玉米苗期耐盐性状的遗传调控机理,以耐盐的热带自交系CML298与盐敏感的温带自交系Zong31构建得到200份F2:3家系的初定位群体为试验材料,结合Illumina Maize 6K芯片获取相应的基因型数据,通过调查苗期盐胁迫处理前后的株高比率(SHR)、株高差值(SHD)、鲜重比率(SFWR)、鲜重差值(SFWD)4个耐盐指标,对玉米苗期的耐盐性进行评价。结果表明,共检测到2个与SHR相关的QTL位点q SHR4、q SHR8,分别解释7.08%和9.40%的表型变异;2个与SHD相关的QTL位点q SHD4、q SHD8,分别解释7.87%、9.21%的表型变异;3个与SFWR相关的QTL位点q SFWR3-1、q SFWR3-2和q SFWR9,分别解释6.15%、11.14%和6.27%的表型变异;2个与SFWD相关的QTL位点q SFWD4与q SFWD7,分别解释6.89%和6.04%的表型变异。其中,在第4号染色体129 c M位置与第8号染色体8c M位置都定位到了与SHR、SHD相关的QTL位点。本研究结果为玉米苗期耐盐相关基因的挖掘奠定了理论基础。 展开更多
关键词 玉米 耐盐性 qtL SNP
在线阅读 下载PDF
翘嘴鳜mstn和mtor基因SNP位点鉴定及其与生长性状的关联分析
8
作者 缪云亮 范旺远 +1 位作者 陈柏湘 何珊 《华中农业大学学报》 北大核心 2025年第5期126-133,共8页
为获得与翘嘴鳜(Siniperca chuatsi)生长性状相关的分子标记,辅助选育鳜优良品种,基于翘嘴鳜生长基因mstn和mtor的基因组DNA序列开展单核苷酸多态性(SNP)位点鉴定,并对这些位点进行生长性状的相关性分析。结果显示,2个基因筛查到mstn-in... 为获得与翘嘴鳜(Siniperca chuatsi)生长性状相关的分子标记,辅助选育鳜优良品种,基于翘嘴鳜生长基因mstn和mtor的基因组DNA序列开展单核苷酸多态性(SNP)位点鉴定,并对这些位点进行生长性状的相关性分析。结果显示,2个基因筛查到mstn-in2、mtor-in26和mtor-E11共3个SNP位点,3个SNP位点多态信息含量(PIC)为0.2808~0.3729,在贵州和广东群体中均表现为中度多态性水平;标记-性状关联性分析显示:翘嘴鳜贵州群体中,mstn-in2位点为GG基因型的个体,其全长、体长和体质量的平均值均显著高于该位点为CC基因型的个体(P<0.05)。翘嘴鳜广东群体中,mstn-in2位点为GG基因型的个体,其全长、体长、体高和体质量的平均值均显著高于该位点为CC基因型的个体(P<0.05);mtor-in26位点为TT基因型的个体,其全长、体质量和肥满度平均值均显著高于该位点为TC基因型和CC基因型的个体(P<0.05)。以上结果表明,mstn-in2位点GG基因型和mtor-in26位点TT基因型为生长优势基因型,可将mstn基因和mtor基因作为翘嘴鳜分子标记辅助育种的重要候选基因。 展开更多
关键词 翘嘴鳜 生长性状 MSTN基因 mtor基因 单核苷酸多态性(SNP)
在线阅读 下载PDF
猪肉pHI和pHU相关SNP-QTL检测
9
作者 蒋隽 马海明 +3 位作者 柳小春 黄生强 何俊 张细权 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2010年第2期203-205,共3页
以1个丹麦家猪家系为试验材料,对猪全基因组单核苷酸多态性(SNP)标记筛选与猪肉pHI和pHU值有关的QTL.结果发现在6号染色体上存在一个显著影响pHI和pHU值的QTL,与pHI显著相关的QTL的效应为2.6%~8.5%,其中单倍型FLJ30670的贡... 以1个丹麦家猪家系为试验材料,对猪全基因组单核苷酸多态性(SNP)标记筛选与猪肉pHI和pHU值有关的QTL.结果发现在6号染色体上存在一个显著影响pHI和pHU值的QTL,与pHI显著相关的QTL的效应为2.6%~8.5%,其中单倍型FLJ30670的贡献率最高,为8.5%,与pHU显著相关的QTL中效应为2.1%~4.3%,都低于pHI有关的效应,其中效应最大的单倍型为FUT1,贡献率为4.3%,估计是猪肉24h酸度变化受外界其他因素的影响更多. 展开更多
关键词 猪肉 pH值 单核甘酸多态性 数量性状位点
在线阅读 下载PDF
关岭黄牛GH1基因多态性及其与生长性状的关联分析和GH1蛋白功能预测
10
作者 张海娟 赵永 +5 位作者 杨红文 吴燕 向进 付红梅 丁义杰 张依裕 《中国畜牧兽医》 北大核心 2025年第9期4226-4236,共11页
【目的】生长激素1(growth hormone 1,GH1)是一种合成代谢激素,属于生长激素/催乳素蛋白家族,对于动物的生长发育具有极其重要的作用。试验旨在筛选关岭黄牛GH1基因单核苷酸多态性(SNP)位点,并与生长性状进行关联分析,为开展关岭黄牛的... 【目的】生长激素1(growth hormone 1,GH1)是一种合成代谢激素,属于生长激素/催乳素蛋白家族,对于动物的生长发育具有极其重要的作用。试验旨在筛选关岭黄牛GH1基因单核苷酸多态性(SNP)位点,并与生长性状进行关联分析,为开展关岭黄牛的分子育种提供科学依据。【方法】根据NCBI数据库中牛GH1基因序列(登录号:NC_037346.1),采用Primer Premier 3.0软件设计3对引物,PCR扩增关岭黄牛GH1基因,利用双向直接测序和序列比对挖掘SNP位点;利用HaploView软件对SNP位点进行连锁不平衡(LD)分析,并识别相关单倍型以探索基因间的相互作用和遗传结构。利用SPSS 21.0软件分析GH1基因与关岭黄牛生长性状的相关性,并对GH1蛋白进行功能预测。【结果】在关岭黄牛GH1基因外显子5上发现3个SNPs位点:g.44119526 C>G、g.44119662 C>T和g.44119676 C>A。其中,g.44119526 C>G和g.44119676 C>A位点属于中度多态,g.44119662 C>T位点属于低度多态;g.44119662 C>T和g.44119676 C>A位点分布符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05),g.44119526 C>G位点极显著偏离Hardy-Weinberg平衡(P<0.01)。3个SNPs共组成4种单倍型(H1、H2、H3、H4)和5种双倍型(H1H1、H1H2、H1H3、H1H4、H2H3)。关联分析结果显示,关岭黄牛GH1基因g.44119676 C>A位点CC基因型个体腰长显著高于AA基因型(P<0.05),双倍型H1H1(CCCCCC)个体腰长显著高于H2H3(GCCCAA)(P<0.05)。蛋白功能预测结果显示,GH1基因编码217个氨基酸,为稳定蛋白;其二级结构、三级结构主要以α-螺旋和无规则卷曲为主。【结论】关岭黄牛GH1基因5外显子上的g.44119676 C>A位点突变对于腰长具有显著影响,双倍型H1H1可作为改善关岭黄牛生长性状的遗传标记。 展开更多
关键词 关岭黄牛 GH1基因 生长性状 单核苷酸多态性 蛋白功能
在线阅读 下载PDF
利用SNP高密度遗传连锁图谱定位甘蓝型油菜种子硫苷含量的QTL(英文) 被引量:7
11
作者 荐红举 魏丽娟 +3 位作者 李加纳 徐新福 谌利 刘列钊 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第8期1386-1391,共6页
种子硫苷在甘蓝型油菜中有着重要的生物学作用和经济价值。本文旨在通过复合区间作图法利用高密度SNP 遗传连锁图谱定位种子硫苷的 QTL。用近红外扫描获得种子硫苷含量,每株系扫描3次,取平均值。所用的高密度SNP遗传图谱包含2795个SNP... 种子硫苷在甘蓝型油菜中有着重要的生物学作用和经济价值。本文旨在通过复合区间作图法利用高密度SNP 遗传连锁图谱定位种子硫苷的 QTL。用近红外扫描获得种子硫苷含量,每株系扫描3次,取平均值。所用的高密度SNP遗传图谱包含2795个SNP多态性标记位点,图谱总长1832.9 cM,相邻标记间平均距离为0.66 cM。定位了2年的种子硫苷含量QTL,其中有5个QTL在2年内被重复检测到,分别分布在A03、A09和C02染色体上, LOD阈值在2.90~10.40之间。这些QTL在2011和2012年试验中分别解释了56.9%和55.1%的表型变异。另外有5个QTL仅在其中一年被检测到,这些QTL能够解释4.1%~7.9%的表型变异, QTL阈值在2.53~3.83之间。 展开更多
关键词 甘蓝型油菜 单核苷酸多态性 数量性状位点 种子硫苷含量
在线阅读 下载PDF
利用单核苷酸多态性标记定位玉米叶夹角主效QTL
12
作者 张沁斌 秦永田 +3 位作者 许蒙蒙 陈永强 李卫华 付志远 《河南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第2期157-160,共4页
对EMS诱变获得的平展叶夹角突变体M 87-1的遗传规律进行了标记分析。结果表明,在豫82背景影响下,M 87-1与豫82组配的分离群体的叶夹角表现典型的数量性状遗传。在3 072个单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphisms,SNPs)标记中,... 对EMS诱变获得的平展叶夹角突变体M 87-1的遗传规律进行了标记分析。结果表明,在豫82背景影响下,M 87-1与豫82组配的分离群体的叶夹角表现典型的数量性状遗传。在3 072个单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphisms,SNPs)标记中,共检测到1 254个SNPs在双亲间存在多态性。通过简化的数量性状位点(Quantitative trait locus,QTLs)分析方法,对BC1((豫82×M 87-1)×M 87-1)分离群体的叶夹角性状进行遗传定位,共检测到3个主效QTLs,分别位于第1,2,7染色体上,其中位于第7染色体上的QTL与叶夹角表型拟合程度最高,可能包含EMS诱变的突变位点。 展开更多
关键词 玉米 叶夹角 主效qtL 单核苷酸多态性
在线阅读 下载PDF
棉花纤维品质SNP标记研究进展
13
作者 冯常辉 李林 +4 位作者 张友昌 王琼珊 张教海 王孝刚 夏松波 《湖北农业科学》 2024年第S1期5-9,13,共6页
综述了近10年来基于连锁分析和关联分析的棉花主要纤维品质性状相关SNP标记鉴定的研究进展。QTL定位和分析的研究结果显示,QTL簇、一因多效位点以及QTL互作是纤维品质性状遗传的重要特点。在棉花纤维品质性状上精细定位的QTL和基因数量... 综述了近10年来基于连锁分析和关联分析的棉花主要纤维品质性状相关SNP标记鉴定的研究进展。QTL定位和分析的研究结果显示,QTL簇、一因多效位点以及QTL互作是纤维品质性状遗传的重要特点。在棉花纤维品质性状上精细定位的QTL和基因数量不足以开展优质棉全基因组分子设计育种。随着新一代测序技术的发展应用,利用SNP标记增加遗传图谱标记密度可为棉花纤维品质QTL精细定位以及优异等位基因挖掘提供有利条件。在分子标记辅助育种中,与表型贡献大、稳定的QTL紧密连锁的SNP标记一般可以提高优良纤维品质性状选择的准确性和效率。SNP标记在棉花分子设计育种上深入应用将缩短优质高产棉花新品种的培育周期。 展开更多
关键词 棉花 单核苷酸多态性(SNP)标记 数量性状位点 纤维品质
在线阅读 下载PDF
肉鸡屠宰性状全基因组关联分析 被引量:2
14
作者 王一东 陈智武 +7 位作者 黄超 粟永春 余洋 崔焕先 郑麦青 赵桂苹 文杰 王述柏 《中国家禽》 北大核心 2024年第2期1-6,共6页
为研究影响肉鸡屠宰性状选育的主要遗传因素,试验采用全基因组关联分析(Genome-wide association study,GWAS)挖掘与屠宰性状相关的单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)位点和候选基因。以264只金陵花鸡终端父系公鸡为... 为研究影响肉鸡屠宰性状选育的主要遗传因素,试验采用全基因组关联分析(Genome-wide association study,GWAS)挖掘与屠宰性状相关的单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)位点和候选基因。以264只金陵花鸡终端父系公鸡为试验材料,采集血液提取DNA,使用全基因组重测序技术获取个体基因型数据,使用PLINK 1.90软件对基因型数据进行质量控制。对宰前体重、屠体重、半净膛重、全净膛重4个性状进行屠宰测定,使用EXCEL和R语言进行正态分布检验和相关性分析。使用GEMMA软件进行GWAS分析,定位出显著的SNP位点。使用SPSS软件分析屠宰性状的有利基因型。结果显示:屠宰性状均符合正态分布,相关度在0.96以上。定位到4个显著的SNP位点,注释到一个基因为RAB6A。1和3号染色体显著位点TT为有利基因型,19号染色体上显著位点CC为有利基因型。研究提示:应根据挖掘到的显著SNPs和候选基因进行屠宰性状的选择,加强肉鸡屠宰性状分子育种的理论基础以提高屠宰加工型肉鸡的选择进展。 展开更多
关键词 肉鸡 屠宰性状 全基因组关联分析 单核苷酸多态性
在线阅读 下载PDF
全基因组关联分析在5种农作物中的应用及展望 被引量:3
15
作者 王乐 于茗兰 +3 位作者 陈强 柳雨汐 郑晓明 逄洪波 《福建农林大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期289-297,共9页
农作物是人类赖以生存的基础。然而,随着全球极端天气的增加、耕地的减少、人口数量的增多以及人民生活需求的提高,培育具备多个优良性状的聚合品种已成为解决粮食安全问题和现代农业分子设计育种的核心任务。全基因组关联分析(GWAS)是... 农作物是人类赖以生存的基础。然而,随着全球极端天气的增加、耕地的减少、人口数量的增多以及人民生活需求的提高,培育具备多个优良性状的聚合品种已成为解决粮食安全问题和现代农业分子设计育种的核心任务。全基因组关联分析(GWAS)是挖掘农作物优异基因的有效方法,已广泛应用于各类农作物中。这种分析方法成功揭示了控制农作物产量、品质以及抗逆性等关键育种性状的基因。本文系统总结了GWAS在5种代表性农作物中的最新研究进展,同时深入剖析了GWAS的局限性及未来发展趋势,期望为未来农作物的遗传改良提供有益参考。 展开更多
关键词 全基因组关联分析 农艺性状 单核苷酸多态性 农作物
在线阅读 下载PDF
中华绒螯蟹MIH基因SNP位点筛选及其与生长性状的关联分析 被引量:1
16
作者 丁秀芳 冯文荣 +2 位作者 李建林 苏胜彦 唐永凯 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2024年第6期1053-1059,共7页
为明确蜕皮抑制激素基因(MIH)对中华绒螯蟹的生长调控机制,本研究选取100只中华绒螯蟹幼蟹个体,分析幼蟹MIH基因的单核苷酸多态性(SNP)位点及基因型,并对与生长指标相关的多态性位点进行连锁不平衡和单倍型分析,进一步明确多态性位点单... 为明确蜕皮抑制激素基因(MIH)对中华绒螯蟹的生长调控机制,本研究选取100只中华绒螯蟹幼蟹个体,分析幼蟹MIH基因的单核苷酸多态性(SNP)位点及基因型,并对与生长指标相关的多态性位点进行连锁不平衡和单倍型分析,进一步明确多态性位点单倍型与生长性状之间的相关性。结果显示,在中华绒螯蟹幼蟹MIH基因中共筛选鉴定出5个SNP位点,其中3个位点(C640G、C2529T和G2595T)与中华绒螯蟹生长性状具有相关性;3个相关位点中共检测到5种单倍型,其中H1单倍型(GCG)的占比最高(68.8%),为优势单倍型;H3单倍型(GTT)个体的生长性状指标最高,显著高于H2单倍型(CCG)。本研究得到的中华绒螯蟹MIH基因上3个与生长性状相关的SNP位点,可作为候选分子标记用于中华绒螯蟹优质品种选育。 展开更多
关键词 中华绒螯蟹 MIH基因 单核苷酸多态性(SNP)位点 单倍型 生长性状
在线阅读 下载PDF
粤西卷羽鸡BMP6基因多态性与生长性状及屠宰性状的关联分析 被引量:1
17
作者 李国 张丽 +7 位作者 王府建 李磊 宾乘峰 郭东雪 王晓彤 林君媛 林树带 谢婷婷 《华南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期477-486,共10页
[目的]探讨BMP6基因多态性对粤西卷羽鸡生长性状及屠宰性状的影响。[方法]以120只粤西卷羽鸡为试验材料,对BMP6基因外显子设计特异性扩增引物,采取PCR产物直接测序法分析SNP位点,利用单因素方差分析对SNP位点基因型与生长性状及屠宰性... [目的]探讨BMP6基因多态性对粤西卷羽鸡生长性状及屠宰性状的影响。[方法]以120只粤西卷羽鸡为试验材料,对BMP6基因外显子设计特异性扩增引物,采取PCR产物直接测序法分析SNP位点,利用单因素方差分析对SNP位点基因型与生长性状及屠宰性状进行关联分析。[结果]在BMP6基因外显子区域共检测到7个SNP位点,其中,g.64185950 T>C、g.64195411 G>A和g.64195613 C>T处于编码区,均为同义突变。HardyWeinberg平衡检验结果显示,g.64195833 T>A在粤西卷羽鸡群体中显著偏离Hardy-Weinberg平衡(P<0.05)。基因型与生长性状关联分析结果表明:在公鸡中,g.64195613 C>T位点CC基因型胫长显著高于TT基因型(P<0.05);在母鸡中,g.64195411 G>A位点AA基因型龙骨长显著高于AG基因型(P<0.05),g.64196373 T>C位点CC基因型胫长极显著高于CT基因型(P<0.01),g.64196735 T>C位点CT基因型胫长显著高于TT基因型(P<0.05)。基因型与屠宰性状关联分析结果表明:在公鸡中,g.64196735 T>C位点CC基因型活体质量显著高于CT基因型(P<0.05);在母鸡中,g.64195613 C>T位点CC基因型腹脂率显著高于CT基因型(P<0.05),g.64196373 T>C位点CC基因型半净膛率显著高于CT基因型(P<0.05)。[结论]BMP6基因多态性与粤西卷羽鸡的部分生长性状及屠宰性状相关,可作为粤西卷羽鸡标记辅助选择的候选基因。 展开更多
关键词 粤西卷羽鸡 BMP6基因 生长性状 屠宰性状 单核苷酸多态性 关联分析
在线阅读 下载PDF
黑龙江流域草鱼养殖群体种质特征 被引量:2
18
作者 王瑞 鲁翠云 +5 位作者 孙志鹏 刘天奇 常玉梅 刘鹏 曹庆 郑先虎 《水产学杂志》 2024年第6期66-74,共9页
为了解黑龙江流域草鱼养殖群体种质特征,本研究检测了草鱼养殖群体的形态指标、肉质品质、抗氧化能力及群体遗传多样性,对黑龙江养殖群体进行综合性评价。形态指标分析发现:草鱼养殖群体的肥满度为1.69,体型偏长;生长因子为2.381,呈异... 为了解黑龙江流域草鱼养殖群体种质特征,本研究检测了草鱼养殖群体的形态指标、肉质品质、抗氧化能力及群体遗传多样性,对黑龙江养殖群体进行综合性评价。形态指标分析发现:草鱼养殖群体的肥满度为1.69,体型偏长;生长因子为2.381,呈异速生长趋势。肌肉营养成分分析发现:黑龙江流域养殖草鱼群体蛋白质含量较丰富(18.00 g/100 g)而脂肪含量较低(0.83 g/100 g),具有较高的营养价值;必需氨基酸占比(44.8%)符合FAO/WHO优质蛋白模式的要求,氨基酸组成合理;脂肪酸的种类丰富(23种),多不饱和脂肪酸中EPA(3.60%)和DHA(13.79%)均高于长江和珠江流域草鱼养殖群体。免疫酶活性测定结果显示:草鱼肌肉中过氧化氢酶(224.17±3.90)U/g、超氧化物歧化酶(38.81±2.37)U/g等活性较高,表明机体具有较好的免疫能力。基于基因组重测序SNP标记评估结果显示:草鱼群体的多态信息含量(PIC)为0.2041±0.1202,处于低多态水平(PIC<0.25),略低于长江群体。研究结果表明,黑龙江流域草鱼养殖群体生长状况良好,具有较高的营养价值和遗传基础,本研究可为草鱼在高寒地区的养殖、开发和利用提供参考。 展开更多
关键词 草鱼 形态性状 肌肉营养成分 酶活性 单核苷酸多态性
在线阅读 下载PDF
香菇“沪香F2”自交群体产量等性状的GWAS分析
19
作者 杨沁閻 李巧珍 +3 位作者 向泉桔 尚晓冬 章炉军 辜运富 《四川农业大学学报》 CSCD 北大核心 2024年第6期1280-1289,I0005,I0006,共12页
【目的】为有效利用分子辅助育种技术提高香菇产量,挖掘定位SNP位点与候选基因。【方法】以“沪香F2”自交后代的100株菌株为研究对象,采用全基因组重测序获得供试菌株的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)数据,结合... 【目的】为有效利用分子辅助育种技术提高香菇产量,挖掘定位SNP位点与候选基因。【方法】以“沪香F2”自交后代的100株菌株为研究对象,采用全基因组重测序获得供试菌株的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)数据,结合在栽培过程中统计的子实体产量相关性状表型数据,开展单性状全基因组关联分析(genome wide association study,GWAS)。【结果】定位到产量性状相关的主效区间位于1号染色体2585129~4051693区段,共有1306个显著SNP位点;定位到与菇蕾性状中一潮平均蕾数关联的29个SNP显著位点,与一潮现蕾天数性状关联的199个SNP显著位点;定位到与菌棒品质性状中的软硬度性状关联的109个SNP显著位点,与转色性状关联的29个SNP显著位点;筛选到与产量性状相关的12个候选基因,与菇蕾性状相关的10个候选基因,与菌棒品质性状相关的2个候选基因。【结论】首次利用GWAS分析香菇单亲本群体,为改良香菇产量提供有效的候选分子标记,有利后续分子辅助育种开展,同时为后续功能基因精细定位奠定了基础。 展开更多
关键词 香菇子实体 农艺性状 GWAS SNP 候选基因
在线阅读 下载PDF
柯乐猪CRISP 3基因SNP鉴定及其对繁殖性状的影响 被引量:1
20
作者 向进 王春源 +3 位作者 吴燕 谭元成 杨酸 张依裕 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2024年第6期1270-1278,共9页
为分析富半胱氨酸的分泌蛋白3(cysteine rich secretory protein 3,CRISP3)基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点对柯乐猪繁殖性状的影响,采用Sanger测序法检测250头健康经产柯乐猪母猪CRISP 3基因的SNP突变位点... 为分析富半胱氨酸的分泌蛋白3(cysteine rich secretory protein 3,CRISP3)基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点对柯乐猪繁殖性状的影响,采用Sanger测序法检测250头健康经产柯乐猪母猪CRISP 3基因的SNP突变位点,利用SPSS 22.0软件分析SNP位点与柯乐猪产活仔猪数、初生窝重、初生均重、断奶窝重、断奶仔猪数和断奶均重6个指标的关联性。结果显示,在柯乐猪CRISP 3基因第4内含子共发现3个SNP突变位点,即g.43796318T>C、g.43796424T>A和g.43796425G>T,均存在3种基因型。g.43796318T>C和g.43796424T>A位点的优势基因型为TT,优势等位基因为T;g.43796425G>T位点的优势基因型为GG,优势等位基因为G。χ^(2)检验显示,g.43796318T>C位点基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05);g.43796424T>A和g.43796425G>T位点基因型分布均极显著(P<0.01)偏离Hardy-Weinberg平衡状态。3个SNP位点的多态信息含量(PIC)为0.25~0.50,表现为中度多态。连锁不平衡分析显示,g.43796424T>A与g.43796425G>T之间存在强连锁不平衡。关联分析显示,g.43796318T>C位点TT和CC基因型个体的初生窝重和初生均重均显著(P<0.05)高于TC基因型;g.43796424T>A位点TA基因型个体的产活仔猪数、初生窝重和断奶仔猪数均显著(P<0.05)高于TT和AA基因型;g.43796425G>T位点GT基因型个体的产活仔猪数、初生窝重和断奶仔猪数均显著(P<0.05)高于GG和TT基因型。双倍型关联分析显示,双倍型H2H4(CCTAGT)个体的产活仔猪数、初生窝重、断奶仔猪数和断奶窝重显著(P<0.05)高于H1H2(TCTAGT)个体和H2H2(CCAATT)个体;双倍型H2H2(CCAATT)个体的初生均重显著(P<0.05)高于除H4H4(CCTTGG)个体外的其他个体,且其断奶均重显著(P<0.05)高于其他双倍型个体。CRISP 3基因第4内含子上的3个突变位点与柯乐猪的6个繁殖性状均存在显著关联,可作为柯乐猪繁殖性状选择的候选分子标记。 展开更多
关键词 柯乐猪 CRISP 3基因 单核苷酸多态性 繁殖性状
在线阅读 下载PDF
上一页 1 2 5 下一页 到第
使用帮助 返回顶部