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Identification of quantitative trait loci and epistasis for root characteristics and root exudations in maize (Zea mays L.) under deficient phosphorus
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作者 陈俊意 《Journal of Chongqing University》 CAS 2010年第2期105-116,共12页
The phosphorus uptake (PU) in above-ground parts of plant, root characteristics and root exudations as well as the quantitative trait loci (QTLs) associated with these characteristics were determined for a F2:3 p... The phosphorus uptake (PU) in above-ground parts of plant, root characteristics and root exudations as well as the quantitative trait loci (QTLs) associated with these characteristics were determined for a F2:3 population derived from the cross of two contrasting maize (Zea mays L.) genotypes, 082 and Yel07. A total of 241 F2:3 families were evaluated in replicated trials under deficient phosphorus conditions in 2007 at two sites (Kaixian County and Southwest University, Chongqing, P. R. China). The results show pleiotropy and close linkage among QTLs. Four common regions in different environments were in bnlg100- bnlg1268b (bins 1.02) for QTL of H+, bnlg1268a-umc1290a (bins 1.09) for QTL of AP (acid phospbatase activity), dupssrl5- P 1MT/a (bins 6.06) for QTLs of PU (phosphorus uptake) and RW (root weight), and P IM3/d-P1M3/g (bins9.04) for QTLs of PU and AP. These QTLs are non-environment or minor QTLs x environment. By epistatic analysis, three main QTLs and eighteen QTLs x QTLs interactions were detected for the seven measured characteristics. These QTLs may affect trait expression by epistatic interaction with the other loci, and make a substantial contribution to phosphorus utilization efficiency, which should be considered when breeding maize varieties with high P efficiency. Two regions were detected in dupssrl 5- P1MT/a (bins 6.06) for QTL of RW and P1M3/d- P 1M3/g (bins 9.04) for QTL of PU and AP. They were detected in two different environments and by two methods of QTL analysis, which were useful for marker-assisted selection. 展开更多
关键词 maize root characteristics root exudations quantitative trait loci analysis EPISTASIS
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基于全基因组关联分析的水稻穗长QTL定位及其候选基因分析 被引量:1
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作者 祝小雅 闫蕴韬 +3 位作者 桂金鑫 石居斌 张海清 贺记外 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期1-9,共9页
分别于2021年和2022年在湖南长沙种植254份水稻3K种质资源,在成熟期测定各种质的穗长。结合种质基因型进行全基因组关联分析,共检测到3个穗长QTL,分布于水稻第1、5、6号染色体,分别命名为qPL-1、qPL-5和qPL-6,相对贡献率为9.06%~28.27%... 分别于2021年和2022年在湖南长沙种植254份水稻3K种质资源,在成熟期测定各种质的穗长。结合种质基因型进行全基因组关联分析,共检测到3个穗长QTL,分布于水稻第1、5、6号染色体,分别命名为qPL-1、qPL-5和qPL-6,相对贡献率为9.06%~28.27%;结合QTL区间内基因功能注释和基因不同单倍型的穗长差异显著性分析结果,最终获得qPL-1、qPL-5和qPL-6的候选基因,其中qPL-6与sped1-D共定位,Os01g0715600、Os05g0132700为调控穗长的新候选基因;对Os01g0715600、Os05g0132700和Os06g0597500的单倍型进行聚合分析,发现这3个基因存在累加效应。 展开更多
关键词 水稻 穗长 数量性状位点 候选基因 单倍型 基因聚合
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玉米抗旱性的QTL分析研究进展和发展趋势 被引量:25
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作者 黎裕 王天宇 +1 位作者 石云素 宋艳春 《干旱地区农业研究》 CSCD 北大核心 2004年第1期32-39,共8页
由于分子标记技术的广泛应用,使玉米抗旱性的复杂遗传机制得到逐步了解,其中的一个重要研究进展是通过对玉米抗旱性的数量性状位点(QTL)进行作图和定位,大致了解了一些对抗旱性有显著贡献的基因的染色体位置及其效应,这些结果为分子标... 由于分子标记技术的广泛应用,使玉米抗旱性的复杂遗传机制得到逐步了解,其中的一个重要研究进展是通过对玉米抗旱性的数量性状位点(QTL)进行作图和定位,大致了解了一些对抗旱性有显著贡献的基因的染色体位置及其效应,这些结果为分子标记辅助选择和进一步的深入研究打下了基础。在总结分析国际上近十年来在玉米抗旱性QTL分析方面的研究资料的基础上,对研究中涉及到的主要性状及其相互关系、QTL分析中需要注意的主要问题和在该领域的主要研究进展进行了分析评述。认为构建通用的连锁图谱、与功能基因组学研究相结合、应用新的QTL分析技术和抗旱QTL的克隆及其利用将是今后的发展趋势。 展开更多
关键词 玉米 抗旱性 qtl分析 数量性状位点
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猪4、8和13染色体上肉质性状的QTL定位 被引量:8
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作者 张敬虎 熊远著 +6 位作者 左波 雷明刚 蒋思文 李凤娥 郑嵘 李家连 钱辉跃 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第10期1009-1014,共6页
214头猪(180头F2个体)组成的资源家系中,在猪的第4、8和13染色体上共选取23个微卫星标记,对11种肉质性状做了QTL定位,这些肉质性状包括:背最长肌肌内脂肪率(IMF)、背最长肌含水量(WM)、背最长肌系水力(WHC)、背最长肌失水率(DLR)、背最... 214头猪(180头F2个体)组成的资源家系中,在猪的第4、8和13染色体上共选取23个微卫星标记,对11种肉质性状做了QTL定位,这些肉质性状包括:背最长肌肌内脂肪率(IMF)、背最长肌含水量(WM)、背最长肌系水力(WHC)、背最长肌失水率(DLR)、背最长肌pH(pH1)、股二头肌pH(pH2)、头半棘肌pH(pH3)、背最长肌肉色值(MCV1)、股二头肌色值(MCV2)、背最长肌大理石纹评分(MMS1)和股二头肌大理石纹评分(MMS2)。结果表明:检测到2个染色体极显著水平的QTL(P≤0.01),它们是定位在SSC13上55 cM处的IMF QTL,和定位在SSC4上10 cM处的WM QTL;4个染色体显著水平的QTL(P≤0.05),它们是2个MCV2 QTL(SSC8上110 cM处和SSC13上70 cM处)、1个MMS1 QTL(SSC8上185 cM处)和1个MMS2 QTL(SSC8上185 cM处)。上述QTL解释的表型变异从0.16%(SSC8上MCV2 QTL)到17.84%(SSC8上MMS2 QTL)。 展开更多
关键词 数量性状位点(qtl) 肉质性状
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黄瓜瓜长性状的QTL定位分析 被引量:15
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作者 程周超 顾兴芳 +4 位作者 张圣平 苗晗 张若纬 刘苗苗 杨双娟 《中国蔬菜》 北大核心 2010年第12期20-25,共6页
以黄瓜野生变种PI183967(Cucumis sativus L.hardwickii)和新泰密刺选系931为亲本获得的包含179个单株的F2群体为作图群体,构建了一张包含234个SSR标记、7个连锁群(分别对应黄瓜的7条染色体)的黄瓜遗传图谱,该图谱覆盖基因组长度829.7cM... 以黄瓜野生变种PI183967(Cucumis sativus L.hardwickii)和新泰密刺选系931为亲本获得的包含179个单株的F2群体为作图群体,构建了一张包含234个SSR标记、7个连锁群(分别对应黄瓜的7条染色体)的黄瓜遗传图谱,该图谱覆盖基因组长度829.7cM,平均图距3.5cM。结合F2和F3的表型数据,共检测到5个瓜长QTL,分布在第1、4、6号染色体上,贡献率在7.1%~14.1%之间。 展开更多
关键词 黄瓜 SSR 遗传图谱 瓜长 数量性状位点(qtl)
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紫花苜蓿QTL与全基因组选择研究进展及其应用 被引量:9
6
作者 康俊梅 张铁军 +2 位作者 王梦颖 张怡 杨青川 《草业学报》 CSCD 北大核心 2014年第6期304-312,共9页
四倍体紫花苜蓿是重要的豆科牧草之一,由于其复杂的遗传背景与二倍体作物相比遗传作图与重要性状数量性状位点(quantitative trait locus,QTL)定位研究相对滞后。然而,二倍体苜蓿的相关研究起步较早,已经建立了高密度遗传图谱和物理图谱... 四倍体紫花苜蓿是重要的豆科牧草之一,由于其复杂的遗传背景与二倍体作物相比遗传作图与重要性状数量性状位点(quantitative trait locus,QTL)定位研究相对滞后。然而,二倍体苜蓿的相关研究起步较早,已经建立了高密度遗传图谱和物理图谱,这些研究为四倍体苜蓿遗传作图与QTL定位奠定了基础。随着第三代分子标记与测序技术的快速发展,极大地促进了四倍体苜蓿的高密度遗传图谱构建与QTL定位研究,并借助分子标记辅助育种技术对提高苜蓿选育效率,加速育种进程具有重要意义。本文对苜蓿遗传图谱构建与QTL定位研究及发展趋势进行了总结,并对苜蓿关联作图与全基因组选择的研究进展及应用前景加以概述,旨在为读者就相关研究领域有较全面的了解。 展开更多
关键词 苜蓿 遗传连锁图谱 qtl 全基因组选择 分子标记辅助育种
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不同供水条件下水稻叶绿素含量的QTL分析 被引量:15
7
作者 沈波 庄杰云 +2 位作者 樊叶杨 蒋靓 郑康乐 《浙江大学学报(农业与生命科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2007年第4期400-406,共7页
在水分胁迫和非水分胁迫条件下分别种植水稻亲本和重组自交系(RIL)群体,在苗期生长阶段和开花后采用漆标定位方法分别考察叶片的叶绿素含量变化,进行不同水分环境下叶绿素含量和胁迫敏感指数的遗传分析.在两种不同水分供应条件下... 在水分胁迫和非水分胁迫条件下分别种植水稻亲本和重组自交系(RIL)群体,在苗期生长阶段和开花后采用漆标定位方法分别考察叶片的叶绿素含量变化,进行不同水分环境下叶绿素含量和胁迫敏感指数的遗传分析.在两种不同水分供应条件下,在不同生育期共定位到13个控制叶绿素含量的具有加性效应的QTL,其中干旱环境中检测到6个,贡献率为4.74%~19.86%;水田环境中检测到7个,贡献率为4.92%~14.02%;未检测到两种环境下共同表达的QTL.检测到7个影响胁迫敏感指数的QTL,其中在苗期和开花期第1次测定时分别检测到的影响胁迫敏感指数的QTL(qkhChl-ga和qkhChl-6)贡献率高达25.29%和38.70%,增效等位基因均来自母本珍汕97B. 展开更多
关键词 水稻 重组自交系 数量性状座位 叶绿素含量 干旱
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水稻数量性状位点(QTL)定位研究进展 被引量:18
8
作者 徐建龙 薛庆中 +1 位作者 梅捍卫 黎志康 《浙江农业学报》 CSCD 2001年第5期315-321,共7页
20世纪 80年代以来 ,DNA标记技术的诞生给数量性状的遗传研究带来了革命性的变化。本文综述了近年来水稻QTL定位的研究进展。对水稻QTL分子标记辅助选择育种进行了探讨 ,并对今后QTL的研究方向提出了一些思考。
关键词 水稻 数量性状位点 分子标记 标记辅助选择 qtl
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水稻苗期不同阶段与低氮耐性相关的QTL分析 被引量:6
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作者 冯跃 曹立勇 +5 位作者 吴伟明 沈希宏 占小登 翟荣荣 陈代波 程式华 《植物营养与肥料学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期880-886,共7页
以超级杂交稻协优9308(协青早B/中恢9308)的重组自交系(R IL)为材料,通过溶液培养试验检测苗期不同阶段与低氮耐性相关的数量性状基因座(QTL)。结果共检测到14个QTLs,单个QTL可解释的表型变异为7.13%1~3.03%。其中,处理后15 d检测... 以超级杂交稻协优9308(协青早B/中恢9308)的重组自交系(R IL)为材料,通过溶液培养试验检测苗期不同阶段与低氮耐性相关的数量性状基因座(QTL)。结果共检测到14个QTLs,单个QTL可解释的表型变异为7.13%1~3.03%。其中,处理后15 d检测到6个QTLs,分别位于第1、7、1、7、10和11染色体上;处理后30 d检测到8个QTLs,分别位于第3、8、3、10、3、8、10和4染色体上。处理后15 d,在第1染色体RM297-RM212区间检测到同时控制相对冠干重和相对总干重的QTL,与氮循环有关,此染色体区域可能富含关键的氮代谢基因。定位结果表明,两个时间检测出的低氮耐性QTL的差异表达与水稻不同发育阶段基因的时空表达密切相关,从而反映在低氮耐性位点的差异上。 展开更多
关键词 水稻苗期 低氮耐性 数量性状座位(qtl)
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大豆苗期耐盐性的遗传及QTL定位分析 被引量:8
10
作者 陈华涛 陈新 喻德跃 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期231-234,共4页
利用亲本为科丰1号和南农1138-2的重组自交系群体NJRIKY进行大豆苗期耐盐性的遗传及QTL定位分析。以每个家系的平均存活时间为耐盐指标,采用主基因+多基因混合遗传模型进行RIL遗传分析,结果表明,NJRIKY群体的耐盐性遗传符合F-3模型,即由... 利用亲本为科丰1号和南农1138-2的重组自交系群体NJRIKY进行大豆苗期耐盐性的遗传及QTL定位分析。以每个家系的平均存活时间为耐盐指标,采用主基因+多基因混合遗传模型进行RIL遗传分析,结果表明,NJRIKY群体的耐盐性遗传符合F-3模型,即由3对主基因控制,没有多基因修饰,主基因遗传率是64.4%。利用Cartographer V.2.5进行QTL定位,结果显示,共检测到3个耐盐QTL,它们分别位于B1、G和K三个连锁群上,分别解释8.4%、17.9%和11.3%的表型变异。 展开更多
关键词 大豆 耐盐性 遗传分析 qtl
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水稻苗期耐冷性QTLs的分子定位 被引量:37
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作者 詹庆才 曾曙珍 +2 位作者 熊伏星 齐藤浩二 加藤明 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2003年第1期7-11,共5页
进行耐冷性数量性状(QTLs)的精细定位,可为水稻耐冷性分子育种提供条件.以籼稻品种二九青和粳稻品种Yukihikari杂交后自交8代得到的79个重组自交系(RIL)群体为材料,用89个微卫星标记构建了该群体的分子连锁图谱.用4种低温处理21d的幼苗... 进行耐冷性数量性状(QTLs)的精细定位,可为水稻耐冷性分子育种提供条件.以籼稻品种二九青和粳稻品种Yukihikari杂交后自交8代得到的79个重组自交系(RIL)群体为材料,用89个微卫星标记构建了该群体的分子连锁图谱.用4种低温处理21d的幼苗高度作为耐冷性指标,对RIL群体进行了耐冷性分析.4种温度条件下共定位了10个耐冷性数量性状位点,其中2个QTLs在4种环境条件下都能检测到,1个QTL在三种环境条件下能检测到,6个QTLs在2种环境条件下能检测到,而1个QTLs却只能在1种环境条件下检测到.10个QTLs可解释的表型变异从4.85%到22.47%.位于第1染色体上的RM104和位于第9染色体上的RM160位点,在4种环境下都能稳定表达,是对环境条件相对稳定的QTLs,可作为苗期耐冷性分子标记辅助选择育种的依据. 展开更多
关键词 水稻 苗期耐冷性 微卫星标记 qtl分析
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在两个环境中检测控制水稻抽穗期的QTL(英文) 被引量:6
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作者 包劲松 包志毅 +1 位作者 何平 朱立煌 《浙江大学学报(农业与生命科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2002年第1期27-32,共6页
利用一个 DH群体研究了控制抽穗期的 QTL ,实验分别在杭州 (HZ)和海南 (HN)两地进行 ,抽穗期分别在 4个和 3个不同发育阶段调查 .结果表明 :在 2个环境和 7个发育阶段中共检测到 8个QTL,分别分布在第 1,6,8,10 ,12号染色体上 .其中 ,2个... 利用一个 DH群体研究了控制抽穗期的 QTL ,实验分别在杭州 (HZ)和海南 (HN)两地进行 ,抽穗期分别在 4个和 3个不同发育阶段调查 .结果表明 :在 2个环境和 7个发育阶段中共检测到 8个QTL,分别分布在第 1,6,8,10 ,12号染色体上 .其中 ,2个 QTL,q HD- 1- 1和 q HD- 12能在 2个环境中检测到 ,其它只能在 1个环境中检测到 .在 HN中一个 QTL q HD- 10 - 1主要在发芽后 75~ 85 d检测到其效应 ,它可解释 19.6%的变异 .在 HZ一个主效 QTL q HD- 8- 1在发芽后 80~ 90 d时检测到效应 .其它的QTL只在某一阶段表达 .最后讨论了抽穗期 展开更多
关键词 水稻 抽穗期 数量性状基因位点 qtl 检测
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玉米持绿相关QTL整合图谱构建及一致性QTL区域内候选基因发掘 被引量:17
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作者 方永丰 李永生 +5 位作者 白江平 慕平 孟亚雄 张金林 王汉宁 尚勋武 《草业学报》 CSCD 北大核心 2012年第4期175-185,共11页
以玉米高密度遗传连锁图谱IBM2 2008Neighbors为参考图谱,收集来自不同实验中的173个玉米持绿相关数量性状位点(quantitative trait locus,QTL)信息,利用BioMercator 2.1软件,构建出玉米持绿相关QTL整合图谱;采用元分析技术,在1,4,5,9... 以玉米高密度遗传连锁图谱IBM2 2008Neighbors为参考图谱,收集来自不同实验中的173个玉米持绿相关数量性状位点(quantitative trait locus,QTL)信息,利用BioMercator 2.1软件,构建出玉米持绿相关QTL整合图谱;采用元分析技术,在1,4,5,9号染色体上发掘出5个持绿"一致性"QTL区间。根据"一致性"QTL区间两端标记在玉米物理图谱B73RefGen_v2上的位置,将"一致性"QTL区间进行物理图谱定位,利用Plant GDB(http://www.plantgdb.org/)在线区段批量下载工具(download region data)下载"一致性"区间的1 445个预测基因序列并进行生物信息学分析,发现预测基因主要参与具体的细胞过程,执行结合功能,催化、转移酶活性和氧化还原酶活性等分子功能。根据"一致性"QTL区间的基因位点名称,在NCBI中下载相关基因序列,与所在"一致性"QTL区间所有预测基因保守结构域进行比对,在5个"一致性"持绿QTL区间内初步确定8个持绿相关候选基因。利用GRAMENE网站(http://www.gramene.org/)的Cmap功能,将水稻持绿基因sgr(stay green)转定位于玉米物理图谱B73RefGen_v2上,找到与其同源的玉米候选基因GRMZM2G091837_T01,其序列与已发表的玉米衰老诱导叶绿体持绿蛋白基因sgr1序列一致。 展开更多
关键词 玉米 持绿性 数量性状位点(qtl) 整合图谱 元分析
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小麦抗旱性生理生化机制及QTL研究进展 被引量:25
14
作者 张维军 袁汉民 +3 位作者 陈东升 王小亮 亢玲 何进尚 《干旱地区农业研究》 CSCD 北大核心 2015年第6期139-148,共10页
根据现有文献资料,综述了小麦抗旱性的鉴定方法和抗旱小麦的外部形态特征,并对小麦胚芽鞘长度、叶绿素含量、叶绿素荧光动力、渗透调节、水分利用效率、碳稳定同位素等抗旱性鉴定评价指标和抗旱性产量评价方法、干旱胁迫下特异蛋白代谢... 根据现有文献资料,综述了小麦抗旱性的鉴定方法和抗旱小麦的外部形态特征,并对小麦胚芽鞘长度、叶绿素含量、叶绿素荧光动力、渗透调节、水分利用效率、碳稳定同位素等抗旱性鉴定评价指标和抗旱性产量评价方法、干旱胁迫下特异蛋白代谢及抗旱性状的数量性状位点(QTL)等方面的研究进展进行总结,对目前小麦抗旱性研究存在的问题和发展趋势进行了探讨。认为,抗旱性研究仍是农业研究的热点领域,但在不同的生态区要有所侧重,同时选择与产量相关性高的指标进行深入研究;应加强干旱胁迫下根系形态结构及生理代谢的研究;随着分子生物学研究的不断发展,抗旱性研究也应从分子水平阐明干旱胁迫引起作物生理生化变化的原因,并借助基因工程手段进行抗旱基因重组,进而创制、培育综合性状优良的抗旱小麦品种。 展开更多
关键词 小麦 抗旱鉴定 抗旱指标 水分利用效率 数量性状位点 胚芽鞘长度
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田间条件下控制玉米开花前后根系性状的QTL定位 被引量:4
15
作者 蔡红光 刘建超 +4 位作者 米国华 袁力行 陈晓辉 陈范骏 张福锁 《植物营养与肥料学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期317-324,共8页
在田间原位条件下,利用根系形态差异显著的自交系掖478和武312为亲本构建的BC4F3群体,采用改进的PLABQTL软件中的复合区间作图法对抽雄期(开花前10 d)和灌浆初期(开花后15 d)玉米根系性状的变化和地上部生物量进行QTL定位。并分析其遗... 在田间原位条件下,利用根系形态差异显著的自交系掖478和武312为亲本构建的BC4F3群体,采用改进的PLABQTL软件中的复合区间作图法对抽雄期(开花前10 d)和灌浆初期(开花后15 d)玉米根系性状的变化和地上部生物量进行QTL定位。并分析其遗传机制。结果表明,花前花后对根干重、总根长、侧根长、轴根长、轴根数等根系性状共检测出27个QTL,单个QTL贡献率为5.2%~15.7%,其中在染色体臂6.02和10.04区域同时检测到控制着地上部生物量、总根长、侧根长和轴根数等性状的QTLs,两个不同生育时期检测到的共同QTL共有8个。玉米花前花后控制根系生长的QTL因生长发育阶段不同而存在着特异性,而且对地上部生物量形成有重要贡献,这为了解田间条件下根系的生长发育和进一步进行遗传改良奠定了遗传基础。 展开更多
关键词 玉米 抽雄期 灌浆初期 根系 qtl
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UV-B辐射增强下水稻苗期硅营养性状的QTL定位及其与环境互作效应分析 被引量:4
16
作者 吴杏春 王茵 +4 位作者 王清水 熊君 余彦 方长旬 林文雄 《中国生态农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期129-135,共7页
以"Lemont"和"Dular"杂交建立的包含123个家系的水稻重组自交系(RILs)群体为材料,选用水稻根系硅吸收能力和叶片硅利用率为指标,进行水稻硅营养遗传性状QTL定位,并分析其与UV-B辐射增强的互作效应。结果表明,控制... 以"Lemont"和"Dular"杂交建立的包含123个家系的水稻重组自交系(RILs)群体为材料,选用水稻根系硅吸收能力和叶片硅利用率为指标,进行水稻硅营养遗传性状QTL定位,并分析其与UV-B辐射增强的互作效应。结果表明,控制水稻叶片硅利用率的4个加性QTL分别在第2、3、10染色体上,而控制根系硅吸收能力的1个加性QTL位于第11染色体上。QTL与UV-B辐射互作分析发现2对控制根系硅吸收能力和3对控制叶片硅利用率的基因×环境上位性QTL,其中只有1对控制根系硅吸收能力的QTL效应值较大。说明水稻这两种硅营养性状中,根系硅吸收能力较叶片硅利用率受UV-B辐射影响大,在抗UV-B辐射育种中以叶片硅利用率为水稻硅营养遗传选择的指标具有较高效率。 展开更多
关键词 水稻 苗期 RILs群体 硅营养性状 UV-B辐射增强 qtl qtl与环境互作
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水稻穗长上位性效应和QE互作效应的QTL遗传研究(英文) 被引量:5
17
作者 曹钢强 朱军 +2 位作者 何慈信 高用明 吴平 《浙江大学学报(农业与生命科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2001年第1期55-61,共7页
利用基于混合模型的 QTL定位方法研究了由籼稻品种 IR64和粳稻品种 Azucena杂交衍生的DH群体在四个环境中穗长的 QTL上位性效应和环境互作效应。结果表明上位性可能是数量性状的重要遗传基础 ,并揭示了上位性的几个重要特点。在本研究... 利用基于混合模型的 QTL定位方法研究了由籼稻品种 IR64和粳稻品种 Azucena杂交衍生的DH群体在四个环境中穗长的 QTL上位性效应和环境互作效应。结果表明上位性可能是数量性状的重要遗传基础 ,并揭示了上位性的几个重要特点。在本研究中 ,所有的 QTL中只有两个没有参与上位性效应的形成 ,在参与上位性效应的 QTL中 ,64.7%的 QTL还具有本身的加性效应。因此传统方法对 QTL加性效应的估算会由于上位性的影响而有偏。其它 35.3%的 QTL没有本身的加性效应 ,却参与了上位性互作 ,这些位点可能通过诱发和修饰其它位点而起作用。上位性的特点还包括 ,经常发现一个 QTL与多个 QTL发生互作 ;大效应的 QTL也参与上位性互作 ;上位性互作易受环境影响。QTL与环境的互作效应比 QTL的主效应更多次地被检测到 。 展开更多
关键词 水稻 穗长 环境互作效应 上位性效应 位点
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通过条件QTL定位分析油菜不同脂肪酸组分对含油量性状的影响 被引量:6
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作者 王继变 陈洪成 +3 位作者 陈玉波 张晓玉 徐海明 赵坚义 《浙江大学学报(农业与生命科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2013年第5期504-512,共9页
利用先前构建的Sollux/Gaoyou DH群体在4种环境下的表型结果和最新遗传图谱,通过条件和非条件QTL定位剖析油菜种子4种主要脂肪酸含量与含油量之间的遗传相关.结果显示,检测到的所有主效、上位性和环境互作QTL效应值均较小,但主效QTL都... 利用先前构建的Sollux/Gaoyou DH群体在4种环境下的表型结果和最新遗传图谱,通过条件和非条件QTL定位剖析油菜种子4种主要脂肪酸含量与含油量之间的遗传相关.结果显示,检测到的所有主效、上位性和环境互作QTL效应值均较小,但主效QTL都达到极显著水平(P<0.01).分别检测到7、10、10和5个芥酸、油酸、亚油酸和亚麻酸QTL位点,其中位于A2、A7、A9和C1上的芥酸,C7和A9上的油酸和亚麻酸以及A4、A10、C6、C7和C9上的亚油酸位点为新检测出的微效QTL.条件QTL定位结果表明,OilA9、OilC2和OilC8-1受亚油酸影响较大.OilA4同时受油酸、亚麻酸和芥酸的影响,OilA1、OilA7和OilC8-2所在区间可能存在控制油酸含量的微效基因,对含油量起调控作用.另外,还检测出4个效应值更小的条件QTL新位点,进一步说明含油量性状的复杂性和难以操控性.检出的芥酸和3个18碳脂肪酸的QTL数量远多于已有在芥酸分离群体中定位到的QTL,但效应值均较小,表明在无主效芥酸等位基因分离情况下,使控制芥酸和3种18碳脂肪酸的众多微效基因得以表达.通过标志辅助聚合微效高芥酸等位基因可能对选育工业专用高芥酸油菜品种具有特殊意义,通过标志辅助选择OilA7和OilC8位点的高含油量等位基因可同步提高种子中油酸含量. 展开更多
关键词 甘蓝型油菜 含油量 脂肪酸 数量性状基因座 条件qtl定位
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水稻抗UV-B的QTL定位和环境互作分析 被引量:4
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作者 林文雄 江宝月 +3 位作者 贾小丽 邓家耀 吴杏春 梁康迳 《中国生态农业学报》 CAS CSCD 2008年第3期644-648,共5页
以“Lemont”(美国)和“Dular”(印度)杂交建立的包含123个家系的水稻重组自交系(RIL)群体,构建了含有97对SSR分子标记的水稻遗传连锁图谱。以该遗传群体及其亲本为材料,分别在2005年晚季和2006年早季进行UV—B辐射增强处理,... 以“Lemont”(美国)和“Dular”(印度)杂交建立的包含123个家系的水稻重组自交系(RIL)群体,构建了含有97对SSR分子标记的水稻遗传连锁图谱。以该遗传群体及其亲本为材料,分别在2005年晚季和2006年早季进行UV—B辐射增强处理,考察了株高性状,并转换成抑制率进行混合线性模型的复合区间作图定位,共检测到2个抗UV—B辐射增强的加性QTLs,分别位于第4和第6染色体上,解释了4.72%和2.69%的遗传变异,分析还发现控制该性状QTL存在环境互作效应,分别解释了8.36%和5.42%的遗传变异,大于加性QTLs。同时检测到7对上位性互作基因,解释了0.00~6.88%的遗传变异,也存在-9环境的互作效应,解释了1.94%~23.31%的遗传变异,暗示着基因上位性的重要作用。 展开更多
关键词 水稻 数量性状定位 重组自交系 抗UV—B 遗传连锁图谱 qtl与环境互作
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不同环境效应对西瓜果实可溶性固形物含量的QTL的影响 被引量:6
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作者 郭绍贵 许勇 +2 位作者 张海英 宫国义 王永健 《中国蔬菜》 北大核心 2005年第B10期13-16,共4页
利用西瓜栽培品种97103和野生品种PI296341-FR为亲本构建重组自交系群体及其分子遗传连锁图谱,在新疆和北京不同生长环境中对果实可溶性固形物含量进行QTL比较分析。结果表明,共检测到6个QTL, 两种环境中能重复检出的QTL 1个,这些QTL在... 利用西瓜栽培品种97103和野生品种PI296341-FR为亲本构建重组自交系群体及其分子遗传连锁图谱,在新疆和北京不同生长环境中对果实可溶性固形物含量进行QTL比较分析。结果表明,共检测到6个QTL, 两种环境中能重复检出的QTL 1个,这些QTL在不同的环境中的加性效应方向一致,但遗传效应差异较大,表明数量性状基因的表达易受环境的影响。根据不同环境条件下的QTL比较分析结果,认为第6连锁组群的qSSC-6a 可能是控制可溶性固形物含量性状表达的主要QTL位点。 展开更多
关键词 西瓜 可溶性固形物含量 qtl
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