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Structural features of substituted triazole-linked chalcone derivatives as antimalarial activities against D_(10) strains of Plasmodium falciparum: A QSAR approach
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作者 Mukesh C.Sharma 《Journal of Central South University》 SCIE EI CAS CSCD 2015年第10期3738-3744,共7页
A quantitative structure–activity relationship(QSAR) was performed to analyze antimalarial activities against the D10 strains of Plasmodium falciparum of triazole-linked chalcone and dienone hybrid derivatives using ... A quantitative structure–activity relationship(QSAR) was performed to analyze antimalarial activities against the D10 strains of Plasmodium falciparum of triazole-linked chalcone and dienone hybrid derivatives using partial least squares regression coupled with stepwise forward–backward variable selection method. QSAR analyses were performed on the available IC50 D10 strains of Plasmodium falciparum data based on theoretical molecular descriptors. The QSAR model developed gave good predictive correlation coefficient(r2) of 0.8994, significant cross validated correlation coefficient(q2) of 0.7689, r2 for external test set)(2predr of 0.8256, coefficient of correlation of predicted data set)(2sepred,r of 0.3276. The model shows that antimalarial activity is greatly affected by donor and electron-withdrawing substituents. The study implicates that chalcone and dienone rings should have strong donor and electron-withdrawing substituents as they increase the activity of chalcone. Results show that the predictive ability of the model is satisfactory, and it can be used for designing similar group of antimalarial compounds. The findings derived from this analysis along with other molecular modeling studies will be helpful in designing of the new potent antimalarial activity of clinical utility. 展开更多
关键词 quantitative structureactivity relationship(QSAR) CHALCONE ANTIMALARIAL Plasmodium falciparum stepwise forward–backward partial least squares
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液相法制备Al5052/PMMA接头界面结构与结合性能研究
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作者 殷官超 丁纪俊 +3 位作者 张睿智 张建 罗国强 李家劲 《表面技术》 北大核心 2025年第4期251-261,共11页
目的提高Al5052/PMMA接头结合性能,研究界面结构与结合强度之间的构效关系。方法采用激光打孔结合盐酸腐蚀对5052铝合金(Al5052)表面进行处理,制备了具有多级轮廓特征的表面形貌。随后,采用液相法实现聚甲基丙烯酸甲酯(PMMA)与Al5052的... 目的提高Al5052/PMMA接头结合性能,研究界面结构与结合强度之间的构效关系。方法采用激光打孔结合盐酸腐蚀对5052铝合金(Al5052)表面进行处理,制备了具有多级轮廓特征的表面形貌。随后,采用液相法实现聚甲基丙烯酸甲酯(PMMA)与Al5052的直接连接。最后通过剪切与拉伸实验,并结合离散界面单元模型的仿真结果,系统地讨论了Al5052/PMMA接头界面结构与结合强度之间的构效关系。结果对于先由激光打孔,后经盐酸腐蚀的Al5052基板,与PMMA连接后最大剪切强度为13.94 MPa,最大抗拉强度为9.35 MPa;与未激光打孔、仅盐酸腐蚀的样品相比,最大强度提高了约30%。Al5052/PMMA接头脱粘面根据其形态和失效机制可分为韧性断裂与脆性断裂区域。结论Al5052表面粗糙程度随着盐酸腐蚀处理时间增加,原激光打孔的截面形状逐渐由方变圆,纵深也随之减小。使用液相法制备黏接样品时,Al5052/PMMA接头界面轮廓在物理层面上充分咬合。接头的剪切与拉伸强度均随盐酸腐蚀时间的增加呈现出先增后减的趋势。所得构效关系的结果及其分析过程,将为涉及多级尺度轮廓特征的材料界面结合问题提供重要参考。 展开更多
关键词 金属-聚合物连接 表面处理 液相法 结合性能 构效关系
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基于多元线性回归和反向传播人工神经网络预测离子液体的声速
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作者 季常征 万仁 +2 位作者 时兆翀 彭昌军 刘洪来 《华东理工大学学报(自然科学版)》 北大核心 2025年第2期158-165,共8页
离子液体的声速可采用实验测定、半经验模型和理论研究方法获得,其中,定量结构-性质关系(QSPR)模型已受到广泛关注,但构造一个有效的QSPR模型取决于选择合适的分子描述符。本文采用片段活度系数类导体屏蔽模型(COSMO-SAC)获得离子液体... 离子液体的声速可采用实验测定、半经验模型和理论研究方法获得,其中,定量结构-性质关系(QSPR)模型已受到广泛关注,但构造一个有效的QSPR模型取决于选择合适的分子描述符。本文采用片段活度系数类导体屏蔽模型(COSMO-SAC)获得离子液体电荷密度分布片段面积(Sσ)和空穴体积(VCOSMO)两个描述符,并分别采用多元线性回归(MLR)和反向传播人工神经网络(BP-ANN)构建了用于描述离子液体声速的线性QSPR模型u-MLR和非线性QSPR模型u-ANN,模型中包含了温度和离子液体相对分子量,所涉及的数据集包括171种离子液体的5 114个数据点。在总的离子液体声速数据集中,u-MLR和u-ANN的决定系数(R2)分别为0.970 6和0.999 5,平均绝对相对偏差(AARD)分别为1.59%和0.10%,均方根误差(RMSE)分别为30.68 m/s和4.12 m/s。结果表明,基于人工神经网络建立的u-ANN模型的预测效果明显优于基于线性回归方法建立的u-MLR模型的预测效果。 展开更多
关键词 声速 离子液体 人工神经网络 多元线性回归 定量结构-性质关系
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新污染物诱导12种细胞核受体相关活性的机器学习预测模型
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作者 李建青 王天勤 +3 位作者 滕跃发 郭磊 黄杨 李斐 《色谱》 北大核心 2025年第8期959-970,I0009,共13页
合成化合物在生产生活中被广泛使用,并不可避免地进入环境成为潜在的新污染物,进而与人类接触,危害人体健康。为了防治潜在新污染物的健康危害,需要全面评估已经和即将进入市场的化合物的毒性。基于实验的毒性评估速度远低于新化合物进... 合成化合物在生产生活中被广泛使用,并不可避免地进入环境成为潜在的新污染物,进而与人类接触,危害人体健康。为了防治潜在新污染物的健康危害,需要全面评估已经和即将进入市场的化合物的毒性。基于实验的毒性评估速度远低于新化合物进入市场的速度,且传统毒性实验不仅耗费时间与经济成本,还会在不同实验室的实验结果之间产生争议,使毒性筛查标准不一。因此,亟需开发基于人工智能、机器学习标准的高通量毒性预测模型,以高效填补化合物毒性数据空缺。本研究基于机器学习方法对Tox21数据库中各种类别化合物进行毒性预测。化合物的结构数据使用简化分子线性输入规范(SMILES)格式表示,表征物理化学性质和实验条件的信息使用RDKit库和Mordred库编码为描述符。通过Python的Sklearn库与XGBoost库计算并筛选各变量的信息增益得到新的特征集,并依此建立毒性预测模型,实现对12类细胞核受体相关活性指标的精准预测。模型在12个数据集上的平均接收者操作特性曲线下面积(AUC)为0.84,所有训练和测试集数据均位于模型应用域内。外部验证结果表明,本研究所构建模型性能优于在Tox21挑战赛中的其他模型。通过SHAP算法对模型参数进行分析,解释了毒性机理,发现log P、分子拓扑结构、ZMIC、piPC等描述符是影响活性的主要原因。为了方便具有不同学科背景的研究人员和政策制定者使用该模型,将模型开发为可视化软件,允许以SMILES格式输入化合物结构并进行毒性预测。本研究开发的预测模型及其配套软件能够快速筛查新污染物的毒性,并为新化学品的安全设计提供指导。 展开更多
关键词 新污染物 定量构效关系 机器学习 生物效应
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QSPR中变量选择和建模算法的研究进展
5
作者 马倩 宋项宁 +5 位作者 苑媛 万可风 杜红岩 张宏哲 郭亚逢 张金梅 《化学研究与应用》 北大核心 2025年第3期513-523,共11页
为满足大量化学品危险特性的评价需要,定量结构-性质关系(QSPR)在化学品安全领域的研究与应用得到了迅猛发展。QSPR研究的发展侧重模型预测能力或注重机理解释,都要依靠计算方法的不断优化来提高模型的拟合能力、预测能力、稳定性或处... 为满足大量化学品危险特性的评价需要,定量结构-性质关系(QSPR)在化学品安全领域的研究与应用得到了迅猛发展。QSPR研究的发展侧重模型预测能力或注重机理解释,都要依靠计算方法的不断优化来提高模型的拟合能力、预测能力、稳定性或处理复杂混合物的能力等。本文综述了QSPR研究在化学品危险特性评价中的发展,特别是特征描述符选择算法、建模算法和基于图神经网络的深度QSPR的技术原理与应用实践。 展开更多
关键词 定量结构-性质关系 化学品安全 特征选择 机器学习 图神经网络
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药品及个人护理品废水中臭氧反应速率预测模型研究
6
作者 赵文琛 张冰 +6 位作者 邢维龙 汪贞 王蕾 石利利 纪剑 周建中 范德玲 《生态与农村环境学报》 北大核心 2025年第7期970-976,共7页
药品及个人护理品(PPCPs)是近年来受到广泛关注的一类新兴污染物,废水中臭氧反应速率(kO3)对于PPCPs的环境风险评价具有重要意义。本文采用量子化学方法对50种PPCPs类化合物进行结构优化,基于因子分析法筛选Dragon分子结构描述符,运用... 药品及个人护理品(PPCPs)是近年来受到广泛关注的一类新兴污染物,废水中臭氧反应速率(kO3)对于PPCPs的环境风险评价具有重要意义。本文采用量子化学方法对50种PPCPs类化合物进行结构优化,基于因子分析法筛选Dragon分子结构描述符,运用遗传算法-多元线性回归法构建废水中PPCPs与臭氧反应速率的定量结构-活性关系(QSAR)模型,从分子描述符结构上解释影响臭氧反应速率的关键因素,并根据经济合作与发展组织关于QSAR模型构建与验证导则对模型进行表征。结果显示,模型具有良好的拟合优度、稳健性和较好的预测能力。基于Williams图定义的模型应用域(AD)结果表明,模型有1个X离群点和2个Y离群点。因此,所构建的QSAR模型可用于预测应用域内其他PPCPs废水中臭氧反应速率,对提升污水处理厂PPCPs的去除工艺具有指导意义。 展开更多
关键词 药物及个人护理品 臭氧反应速率 定量结构-活性关系(QSAR)
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全氟和多氟烷基化合物(PFASs)对水生生物急性毒性机制的理论计算研究
7
作者 卢鸿泽 艾玥洁 《环境化学》 北大核心 2025年第1期10-27,共18页
全氟和多氟烷基物质(PFASs)是水环境中普遍存在的持久性化合物,具有生物累积性和生物毒性,对动植物和人类健康构成潜在威胁.尽管近年来已有大量关于PFASs毒性的研究,但对其水生毒性的关键影响因素仍缺乏深入探讨.除生物实验外,计算模型... 全氟和多氟烷基物质(PFASs)是水环境中普遍存在的持久性化合物,具有生物累积性和生物毒性,对动植物和人类健康构成潜在威胁.尽管近年来已有大量关于PFASs毒性的研究,但对其水生毒性的关键影响因素仍缺乏深入探讨.除生物实验外,计算模型在获取PFASs的毒理学数据和信息方面发挥了至关重要的作用.本研究通过构建PFASs单一水生生物急性毒性和食物链联合毒性2D-QSAR模型,研究了PFASs对水生生物毒性的主要影响因素和毒性机理.结果表明,PFASs分子的水生急性毒性与其得失电子能力、静电相互作用能力、疏水性和生物累积性密切相关.通过分子对接技术发现,PFASs主要通过范德华力和静电相互作用与水生生物的靶蛋白结合,从而导致毒性效应.此外,采用分子动力学模拟研究了不同环境条件对PFASs水生生物毒性的影响.模拟结果显示,溶剂化效应对PFASs的水生毒性具有显著影响,同时温度和离子强度条件对不同的水生生物表现出不同的影响.本研究从计算模型的角度揭示了PFASs对水生生物的毒性机制,为未来研究新型PFASs的毒性特性提供了理论依据. 展开更多
关键词 全氟和多氟烷基化合物 水生生物 急性毒性 定量构效关系 分子对接 分子动力学模拟
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新型查尔酮衍生物抗乳腺癌活性的3D-QSAR模型构建及分子设计
8
作者 陈艳 冯惠 +1 位作者 冯长君 堵锡华 《南京理工大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期248-252,共5页
为了获得较高抗乳腺癌活性的新型化合物,对18个新型查尔酮衍生物抗乳腺癌活性(pIC_(50))进行了三维定量构效关系(3D-QSAR)研究。其中14个化合物作为训练集用于构建3D-QSAR模型,其余化合物(含模板分子)作为测试集对所建模型进行验证。所... 为了获得较高抗乳腺癌活性的新型化合物,对18个新型查尔酮衍生物抗乳腺癌活性(pIC_(50))进行了三维定量构效关系(3D-QSAR)研究。其中14个化合物作为训练集用于构建3D-QSAR模型,其余化合物(含模板分子)作为测试集对所建模型进行验证。所建3D-QSAR模型的交叉验证系数R^(2)_(CV)为0.569,非交叉验证系数R^(2)为0.974,说明所建模型具有良好的稳定性和预测能力。该模型中立体场、静电场对pIC_(50)的贡献分别为58.8%和41.2%,表明影响该类化合物抗肿瘤活性的主要因素是取代基的疏水性、空间位阻和电荷分布。通过对模型的分析,设计了5个具有较高pIC_(50)的新化合物,有待通过后续医学实验加以验证。 展开更多
关键词 新型查尔酮衍生物 抗乳腺癌活性 三维定量构效关系 分子设计
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低温靶向再生活化剂与废橡胶再生胶性能的构效关系研究
9
作者 王艳秋 张明 +2 位作者 李杰 卢猛 李晓娟 《化工新型材料》 CAS CSCD 北大核心 2024年第11期258-263,共6页
为了实现废橡胶节能减排高品质再生,提出了低温靶向再生活化剂的设计理念,将含有-SH、-OH或-COOH的主再生活化剂(MS)与含有-OH或-COOH的次再生活化剂(有机酸A1)并用,在再生温度25~125℃下开展研究。结果表明:MS/A1具有协同效应,低温靶... 为了实现废橡胶节能减排高品质再生,提出了低温靶向再生活化剂的设计理念,将含有-SH、-OH或-COOH的主再生活化剂(MS)与含有-OH或-COOH的次再生活化剂(有机酸A1)并用,在再生温度25~125℃下开展研究。结果表明:MS/A1具有协同效应,低温靶向再生胶拉伸强度和扯断伸长率分别达15.17MPa、360.65%,门尼黏度为79,达到了《再生橡胶通用规范》(GB/T 13460-2016)全胎胶粉优质品级R-T再生胶的性能要求,再生胶所含18项多环芳烃总含量小于20mg/kg,符合欧盟REACH法规(REACH-2009/48/EC)环保指标的要求。与高温再生工艺相比,低温靶向再生工艺节能20%~60%不等。 展开更多
关键词 低温靶向再生活化剂 物理机械性能 工艺性能 环保性能 构效关系
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人工智能辅助含能分子设计的应用与展望 被引量:5
10
作者 刘锐 刘建 +3 位作者 唐岳川 张朝阳 黄静 黄鑫 《含能材料》 EI CAS CSCD 北大核心 2024年第4期408-421,共14页
含能分子研发面临多重挑战,传统“试错法”效率低下,计算机辅助分子设计的出现改变了研发模式。本综述回顾了含能分子设计的发展历程,介绍了计算机辅助含能分子设计的研究现状,并概述了人工智能技术(AI)在性质预测、分子生成、合成路线... 含能分子研发面临多重挑战,传统“试错法”效率低下,计算机辅助分子设计的出现改变了研发模式。本综述回顾了含能分子设计的发展历程,介绍了计算机辅助含能分子设计的研究现状,并概述了人工智能技术(AI)在性质预测、分子生成、合成路线和反应条件预测等多个设计环节的最新进展,讨论了当前含能分子设计模式与其他材料设计方法的差距,思考差距产生的原因,并对未来AI辅助含能分子设计的发展方向提出展望。研究发现,AI在含能分子性能预测和分子生成等方面已经有了应用,但在合成路径规划和反应条件优化等环节的应用仍有待进一步探索,应用前景巨大。通过数据增强、迁移学习或高通量计算有望能够解决含能分子数据薄弱的问题;加强AI辅助含能分子合成路线与反应条件探索有望贯通“设计→评估→制备→验证”全流程自动化分子设计模式。AI辅助含能分子设计为提升含能分子设计水平提供新的可能性,有助提升含能分子研发效率。 展开更多
关键词 含能分子 分子设计 人工智能 机器学习 定量构效关系
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三种描述符对食源性血管紧张素转化酶抑制二肽定量构效关系研究 被引量:1
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作者 郭星晨 李华鑫 +4 位作者 张钰璇 马金璞 杨具田 李贞子 高丹丹 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2024年第10期290-297,I0011-I0014,共12页
为探究血管紧张素转化酶(angiotensin converting enzyme,ACE)抑制肽结构与功能的关系,阐明食源性ACE抑制肽作用机理,该文收集最近报道的血管紧张素转化酶抑制二肽的氨基酸序列及其IC_(50)值,用Z-scales、VHSE和SVHEHS三种氨基酸描述符... 为探究血管紧张素转化酶(angiotensin converting enzyme,ACE)抑制肽结构与功能的关系,阐明食源性ACE抑制肽作用机理,该文收集最近报道的血管紧张素转化酶抑制二肽的氨基酸序列及其IC_(50)值,用Z-scales、VHSE和SVHEHS三种氨基酸描述符对ACE抑制二肽的结构进行表征,以氨基酸的疏水性质、立体性质以及电性性质参数作为自变量,ACE抑制二肽的lg(IC_(50))作为因变量,建立ACE抑制二肽的定量构效模型。结果显示基于Z-scales描述符建立的二肽定量构效模型R^(2)为0.8477,Q^(2)为0.8284,模型预测二肽Phe-Phe有较高的ACE抑制活性,预测IC_(50)为1.0499μmol/L,实测IC_(50)为(1.0414±0.0041)μmol/L,预测值与实测值误差为0.0085μmol/L。基于VHSE描述符构建的模型R^(2)为0.8568,Q^(2)为0.8052,模型预测二肽Asp-Trp有较高的ACE抑制能力,预测IC_(50)为1.2160μmol/L,实测IC_(50)为(1.1100±0.0053)μmol/L,误差为0.1060μmol/L。基于SVHEHS描述符构建的定量构效模型R^(2)为0.8581,Q^(2)为0.7453μmol/L,模型预测二肽Ala-Trp有较高的ACE抑制活性,预测IC_(50)为1.0323μmol/L,实测IC_(50)为(1.1290±0.0082)μmol/L,误差为0.0967μmol/L。3种氨基酸描述符均能较为合适地对ACE抑制二肽进行定量构分析。通过模型分析发现ACE抑制肽C端氨基酸残基疏水特性和立体特征与其活性关系更为密切,其氨基酸残基的疏水特征和立体特征越强,ACE抑制肽的活性越强。通过3种ACE抑制二肽与ACE蛋白(2X8 J)进行分子对接发现,3种ACE抑制肽均可与ACE蛋白进行结合。表明通过偏最小二乘法对Z-scales、VHSE、SVHEHS三种描述符对ACE抑制二肽构建定量构效关系模型是可行的。这将对ACE抑制肽的检测、预测和筛选具有积极的意义。 展开更多
关键词 血管紧张素转化酶 定量构效 氨基酸描述符 偏最小二乘法 半抑制浓度
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基于氨基酸描述符对血管紧张素转化酶抑制五肽定量构效关系分析 被引量:1
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作者 郭星晨 李玉豪 +5 位作者 马金璞 张钰璇 李华鑫 杨具田 樊佩如 高丹丹 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2024年第13期38-48,共11页
本研究收集近些年报道的血管紧张素转化酶(angiotensin converting enzyme,ACE)抑制五肽的氨基酸序列及抑制活性(半抑制浓度(half maximal inhibitory concentration,IC_(50))),建立ACE抑制五肽肽库,并将其氨基酸残基用Z-scales、VHSE和... 本研究收集近些年报道的血管紧张素转化酶(angiotensin converting enzyme,ACE)抑制五肽的氨基酸序列及抑制活性(半抑制浓度(half maximal inhibitory concentration,IC_(50))),建立ACE抑制五肽肽库,并将其氨基酸残基用Z-scales、VHSE和SVHEHS氨基酸描述符分别进行表述,以氨基酸残基的疏水性、立体性以及电性参数作为自变量,ACE抑制五肽的lg IC_(50)作为因变量,利用Matlab软件用偏最小二乘法建立ACE抑制肽定量构效关系(quantitative structure-activity relationship,QSAR)模型,结果发现基于Z-scales描述符构建的ACE抑制五肽QSAR模型R2为0.6411,Q^(2)为0.5369,模型预测五肽Gln-Arg-Pro-Asn-Met具有较高的ACE抑制活性,预测IC_(50)为0.0517μmol/L,实测IC_(50)为(0.0400±0.0083)μmol/L,预测值与实测值误差为0.0117μmol/L;基于VHSE描述符构建的QSAR模型R2为0.7636,Q^(2)为0.5081,模型预测五肽Leu-Arg-Ala-Phe-Gln具有较高的ACE抑制活性,预测IC_(50)为0.0438μmol/L,实测值为(0.0273±0.0053)μmol/L,误差为0.0165μmol/L;基于SVHEHS描述符构建的QSAR模型R2为0.8405,Q^(2)为0.4005μmol/L,模型预测五肽Tyr-Phe-Pro-Phe-Gln具有较高的ACE抑制活性,预测值为0.0055μmol/L,实测值为(0.0312±0.0042)μmol/L,误差为0.0257μmol/L。3种建模方法对比发现,基于SVHEHS描述符构建的模型拟合能力最强,但是其预测能力较弱,而Z-scales和VHSE描述符所建模型能很好地对五肽进行QSAR分析,通过模型分析发现ACE抑制肽活性与其氨基酸的疏水特征呈负相关,与立体特征呈正相关。将3种ACE抑制肽与ACE蛋白(2X8J)进行分子对接,结果表明3种ACE抑制肽均可与ACE蛋白进行结合。本研究可为开发ACE抑制肽药物提供新手段,为开发和利用食源性ACE抑制肽提供理论基础。 展开更多
关键词 血管紧张素转化酶 偏最小二乘 定量构效关系 氨基酸描述符
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机器学习预测有机化学品对稀有鮈鲫急性毒性 被引量:3
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作者 莫俊超 姚洪伟 曹峰 《中国环境科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2024年第8期4661-4673,共13页
搜集有机化学品对稀有鮈鲫(Gobiocypris rarus)急性毒性数据,并采用部分斑马鱼(Danio rerio)和黑头呆鱼(Pimephales promelas)的急性毒性数据,建立了基于机器学习的有机化学品对稀有鮈鲫急性毒性预测方法.首先使用二分类模型判定有机化... 搜集有机化学品对稀有鮈鲫(Gobiocypris rarus)急性毒性数据,并采用部分斑马鱼(Danio rerio)和黑头呆鱼(Pimephales promelas)的急性毒性数据,建立了基于机器学习的有机化学品对稀有鮈鲫急性毒性预测方法.首先使用二分类模型判定有机化学品对稀有鮈鲫是否会产生急性毒性,若判定为有急性毒性,再使用回归模型预测其半致死浓度LC_(50).对不同机器学习模型进行对比,二分类模型中支持向量机最优,训练集和测试集的准确率分别为92.4%和88.6%;回归模型中弹性网络回归法最优,训练集和测试集的调整R^(2)分别为0.87和0.75,留一法交叉验证系数Q_(LOO)^(2)为0.52,外部验证系数Q_(EXT)^(2)为0.71.两种模型具有较好的准确性、稳健性和预测能力.第一电离势和正辛醇水分配系数对分类影响较大,拓扑荷对回归预测结果影响较大. 展开更多
关键词 有机化学品 稀有鮈鲫 机器学习 急性毒性 定量结构活性关系(QSAR)
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基于定量构效关系模型的有机发光材料接触和吸入危害性评估
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作者 陈锐烽 冯晶晶 +3 位作者 莫凌 蒋倩文 黄亮亮 廖建雄 《广西科学》 CAS 北大核心 2024年第4期657-664,共8页
近期研究表明,部分有机发光材料(Organic Light-Emitting Materials,OLEMs)具有环境持久性和生物富集性。为明确OLEMs对人体健康的潜在危害,本研究通过专利检索,建立了1988种OLEMs的化学品清单,并基于化学品分类和标签数据库(Classifica... 近期研究表明,部分有机发光材料(Organic Light-Emitting Materials,OLEMs)具有环境持久性和生物富集性。为明确OLEMs对人体健康的潜在危害,本研究通过专利检索,建立了1988种OLEMs的化学品清单,并基于化学品分类和标签数据库(Classification and Labelling Inventory,C&L清单)收录的94种OLEMs的人体健康危害分类与标签信息,构建定量构效关系(Quantitative Structure Property Relationship,QSPR)模型,应用欧氏距离、分子描述符标准化和核密度估计的方法定义模型应用域,对C&L清单未收录的1894种OLEMs的接触和吸入危害性进行预测。结果表明,1652种OLEMs可能通过接触对人体健康造成危害,1612种OLEMs可能通过吸入对人体健康造成危害。本研究为优先控制化学品识别和新化学物质环境管理提供了理论依据。 展开更多
关键词 有机发光材料(OLEMs) 定量构效关系 健康危害 核密度估计
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植物精油成分气相色谱保留指数的全息定量构效关系
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作者 郭锐 焦龙 +3 位作者 胡祖彪 王清臣 钟汉斌 景明利 《色谱》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期380-386,共7页
气相色谱保留指数(RI)是色谱分析中的重要参数,但通过实验获取RI值的过程较为繁琐,需要建立一种简便、高效、准确的模型来预测RI值。本文搜集了60种植物精油成分的RI实验值,构建了精油成分化合物的结构性质与RI值之间的全息定量构效关系... 气相色谱保留指数(RI)是色谱分析中的重要参数,但通过实验获取RI值的过程较为繁琐,需要建立一种简便、高效、准确的模型来预测RI值。本文搜集了60种植物精油成分的RI实验值,构建了精油成分化合物的结构性质与RI值之间的全息定量构效关系(HQSAR)模型。当碎片大小(fragment size)、碎片特征(fragment distinction)和全息长度(hologram length)模型参数分别设置为“1~4”、“C,Ch”和199时,可以建立最优HQSAR模型。利用外部测试集验证和留一交叉验证对模型进行检验,经外部测试集验证的预测均方根误差(RMSEP)、预测决定系数(Q_(F3)^(2))、一致性相关系数(CCC)和平均相对误差(MRE)分别为40.45、0.984、0.968和2.20%;经留一交叉验证的交叉验证均方根误差(RMSECV)和MRE分别为72.56和4.17%。此外,HQSAR模型的分子贡献图表明,芳香族化合物的烷基链在连接了羟基基团后,其RI值会增大;脂肪族化合物中存在的长链烷基也会导致RI值增大。研究结果表明,所建立的HQSAR模型能够用于预测植物精油成分的RI值,并为其他精油成分RI值的预测提供可靠依据。 展开更多
关键词 全息定量构效关系 气相色谱保留指数 植物精油 分子贡献图
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基于CoMFA对氟喹诺酮酰胺衍生物的分子建模与设计
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作者 冯惠 冯长君 《化学研究与应用》 CAS 北大核心 2024年第12期2857-2862,共6页
基于比较分子力场分析(CoMFA)方法研究25种氟喹诺酮C-3酰胺衍生物抗肿瘤活性(K_(S)、K_(H))的三维定量构效关系(3D-QSAR)。21个化合物组成训练集用于建立预测模型,余下9个化合物(含13号模板分子和新设计4个分子)组建测试集作为模型验证... 基于比较分子力场分析(CoMFA)方法研究25种氟喹诺酮C-3酰胺衍生物抗肿瘤活性(K_(S)、K_(H))的三维定量构效关系(3D-QSAR)。21个化合物组成训练集用于建立预测模型,余下9个化合物(含13号模板分子和新设计4个分子)组建测试集作为模型验证。所建训练集CoMFA模型的交叉验证系数(R_(cv)^(2))、非交叉验证系数(R^(2)),对于K_(S)分别为0.333、0.883,对于K_(H)分别为0.363、0.887,说明所建模型具有较强的稳定性和良好的预测能力。该模型中立体场、静电场的贡献率,对于K_(S)依次为60.3%、39.7%,对于K_(H)依次为60.8%、39.2%,表明影响抗肿瘤活性(K_(S)、K_(H))的主要因素是取代基的疏水性和空间位阻,其次是取代基的库仑力、氢键及配位作用。基于此研究结果,设计了4个具有较高预测活性的新化合物。这些发现不仅为理解氟喹诺酮C-3酰胺衍生物抗肿瘤机理提供了理论基础,也为设计抗肿瘤活性更高的化合物提供了有用信息。 展开更多
关键词 氟喹诺酮C-3酰胺衍生物 抗肝癌活性(K_(S)) 抗白血病活性(K_(H)) 比较分子力场分析 三维构效关系
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自分泌运动因子(ATX)抑制剂的3D-QSAR和分子对接研究
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作者 沈燕 潘亮 +3 位作者 刘燕 李雪梅 秦菊梅 赵学敏 《重庆理工大学学报(自然科学)》 CAS 北大核心 2024年第8期272-280,共9页
自分泌运动因子(ATX)在心血管疾病、炎症和肿瘤的病理过程中发挥重要作用。对具有抑制ATX活性的吲哚类化合物进行了三维定量构效关系(3D-QSAR)和分子对接研究。采用CoMFA和CoMSIA模型对40个ATX抑制剂构建3D-QSAR模型,阐明了抑制剂结构... 自分泌运动因子(ATX)在心血管疾病、炎症和肿瘤的病理过程中发挥重要作用。对具有抑制ATX活性的吲哚类化合物进行了三维定量构效关系(3D-QSAR)和分子对接研究。采用CoMFA和CoMSIA模型对40个ATX抑制剂构建3D-QSAR模型,阐明了抑制剂结构与生物活性之间的关系,同时利用Surflex-Dock进行分子对接,研究该类化合物与ATX蛋白的结合模式。CoMFA模型(q^(2)=0.668,r^(2)=0.992)和CoMSIA模型(q^(2)=0.727,r^(2)=0.988)表明其具有良好的预测能力和机制可解释能力,分子对接表明上述化合物与ATX均能很好地结合,Ser306、Glu232和His121是影响上述化合物与ATX结合的主要氨基酸残基。本研究为进一步设计合成ATX抑制剂提供理论依据,对开发高效ATX抑制剂具有指导意义。 展开更多
关键词 自分泌运动因子 抑制剂 三维定量构效关系 分子对接 构效关系
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三水铝石矿物颗粒表面吸附芳香族污染物的计算模拟与预测
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作者 刘治山 马芳芳 +1 位作者 徐倩 谢宏彬 《环境化学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第9期3021-3031,共11页
了解芳香族污染物在矿物颗粒表面的吸附行为对于评估其大气归趋及影响具有重要意义.吸附能(E_(ads))是描述芳香族污染物在矿物颗粒表面吸附行为的重要参数,然而,目前该数据十分匮乏.考虑到大气中存在大量的芳香族污染物,逐个揭示芳香族... 了解芳香族污染物在矿物颗粒表面的吸附行为对于评估其大气归趋及影响具有重要意义.吸附能(E_(ads))是描述芳香族污染物在矿物颗粒表面吸附行为的重要参数,然而,目前该数据十分匮乏.考虑到大气中存在大量的芳香族污染物,逐个揭示芳香族污染物在矿物颗粒表面的E_(ads)值需要巨大的计算资源和工作量.因此,亟需建立一种能够快速预测芳香族污染物在矿物颗粒表面E_(ads)值的预测模型.本研究采取第一性原理的方法,探究了21个芳香族污染物在矿物颗粒三水铝石(001)面上的吸附机制.结果发现,21个芳香族污染物与三水铝石(001)面主要形成氢键、O—H…π键以及O—H…X(X=Cl/Br)相互作用,其E_(ads)值的范围在-12 kcal·mol^(-1)至-30 kcal·mol^(-1)之间.基于计算得到的21个E_(ads)值,采用多元线性回归分析方法,建立了预测芳香族污染物在三水铝石(001)面上E_(ads)值的定量结构-活性关系模型.该模型具有很好的拟合优度、稳健性和预测能力,能够用来预测含有—CH_(3)、—OH、—COOH、—NO_(2)、—NH_(2)、—CHO、—F、—Cl、—Br官能团的芳香族污染物.本研究结果对于提高目前对芳香族污染物在矿物颗粒表面上吸附行为的理解具有重要意义,并且为进一步揭示芳香族污染物在三水铝石(001)面上的大气转化奠定了基础. 展开更多
关键词 芳香族污染物 三水铝石 吸附能 第一性原理计算 定量结构-活性关系
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一个新的分子拓扑指数 被引量:18
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作者 蒋玉仁 刘志国 +2 位作者 刘景亚 胡岳华 王淀佐 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2003年第3期198-202,共5页
通过将键参数和量子数引入原子点价,重新定义原子点价δYi,认为分子中某一原子的δYi与该原子的杨氏电负性力标、价电子数、成键电子数及最外层主量子数有关.由此提出新的分子拓扑指数mXY.并用一级指数1XY与饱和烷烃的沸点、液体热容、... 通过将键参数和量子数引入原子点价,重新定义原子点价δYi,认为分子中某一原子的δYi与该原子的杨氏电负性力标、价电子数、成键电子数及最外层主量子数有关.由此提出新的分子拓扑指数mXY.并用一级指数1XY与饱和烷烃的沸点、液体热容、气体热容、蒸发热、临界温度、临界压力,卤代苯的辛醇/水分配系数,烷氧氯硅烷的气相色谱保留指数、含氮杂环化合物的毒性,碱金属卤化物的晶格焓与F心能带,卤化锡的119SnMossbauer等性质/活性进行相关关系的研究.结果表明,1XY与有机物和无机物的性质/活性间具有广泛良好的相关性. 展开更多
关键词 分子拓扑指数 结构-性能关系 结构-活性关系 有机化合物 无机化合物
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活性多糖构效关系研究评述 被引量:57
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作者 王兆梅 李琳 +1 位作者 郭祀远 蔡妙颜 《现代化工》 EI CAS CSCD 北大核心 2002年第8期18-21,23,共5页
从结构与活性、理化性质与活性两个角度分别对活性多糖的构效关系进行论述。影响多糖生物学活性的结构因素包括多糖的主链性质、支链性质和多糖分子的高级结构 ,其中多糖主链的糖单元组成、糖苷键类型均直接决定多糖的活性 ,多糖支链的... 从结构与活性、理化性质与活性两个角度分别对活性多糖的构效关系进行论述。影响多糖生物学活性的结构因素包括多糖的主链性质、支链性质和多糖分子的高级结构 ,其中多糖主链的糖单元组成、糖苷键类型均直接决定多糖的活性 ,多糖支链的类型、聚合度、支链在多糖链上的分布及其取代度决定了多糖活性大小 ,多糖分子的高级结构如链的柔韧性和空间构像与多糖的活性紧密相关。多糖的理化性质如分子质量。 展开更多
关键词 活性多糖 构效关系 研究评述 理化性质 结构
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