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一种基于组合特征的大肠杆菌σ^(70)启动子识别算法
被引量：
2
1
作者
杜耀华
敖伟
+1 位作者
倪青山
王正志
《国防科技大学学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2005年第6期113-119,共7页
启动子识别是研究基因转录调控的重要环节,但目前算法的识别正确率偏低。在深入分析启动子生物特征的基础上,提出了一种基于多种特征组合的大肠杆菌7σ0启动子识别算法,在启动子序列的组成特征、信号特征和结构特征中选取10种典型特征,...
启动子识别是研究基因转录调控的重要环节,但目前算法的识别正确率偏低。在深入分析启动子生物特征的基础上,提出了一种基于多种特征组合的大肠杆菌7σ0启动子识别算法,在启动子序列的组成特征、信号特征和结构特征中选取10种典型特征,以此为依据,对位于非编码区和编码区内部的启动子分别加以识别。首先通过特征描述模型分别计算各种特征在启动子序列和非启动子序列中的得分,将特征得分组合成10维特征向量,再利用二次判别分析法在特征向量集上进行训练和识别。在实际数据集中进行的刀切法测试验证了算法的有效性。对位于非编码区的启动子,平均正确率达到了86.7%,明显优于其它算法;对位于编码区内部的启动子,平均正确率也达到了82.4%。算法还具有良好的可扩展性,能够方便地容纳新特征,使识别性能不断提高。
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关键词
大肠杆菌
σ^70启动子识别
组合特征
二次判别分析法
刀切法
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职称材料
FUDT在苹果近红外光谱分类中的应用
被引量：
1
2
作者
武斌
马桂香
武小红
《计算机工程与应用》
CSCD
北大核心
2016年第3期193-196,223,共5页
苹果的分类是苹果采收后商品化处理的重要环节。为了快速、无损和有效地实现苹果的分类,利用近红外光谱技术采集四种苹果的近红外反射光谱,用主成分分析对高维的近红外光谱进行降维处理,分别运行线性判别分析,二次判别分析,模糊非相关...
苹果的分类是苹果采收后商品化处理的重要环节。为了快速、无损和有效地实现苹果的分类,利用近红外光谱技术采集四种苹果的近红外反射光谱,用主成分分析对高维的近红外光谱进行降维处理,分别运行线性判别分析,二次判别分析,模糊非相关判别转换和Foley-Sammon判别分析提取鉴别信息,用k-近邻分类器进行分类。分类结果表明,模糊非相关判别转换能更好地提取苹果近红外光谱的品种鉴别信息,达到了最高的分类准确率。
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关键词
苹果分类
近红外光谱
线性判别分析
二次判别分析
模糊非相关判别转换
Foley-Sammon判别分析
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职称材料
题名
一种基于组合特征的大肠杆菌σ^(70)启动子识别算法
被引量：
2
1
作者
杜耀华
敖伟
倪青山
王正志
机构
国防科技大学机电工程与自动化学院
出处
《国防科技大学学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2005年第6期113-119,共7页
基金
国家自然科学基金资助项目(60471003)
文摘
启动子识别是研究基因转录调控的重要环节,但目前算法的识别正确率偏低。在深入分析启动子生物特征的基础上,提出了一种基于多种特征组合的大肠杆菌7σ0启动子识别算法,在启动子序列的组成特征、信号特征和结构特征中选取10种典型特征,以此为依据,对位于非编码区和编码区内部的启动子分别加以识别。首先通过特征描述模型分别计算各种特征在启动子序列和非启动子序列中的得分,将特征得分组合成10维特征向量,再利用二次判别分析法在特征向量集上进行训练和识别。在实际数据集中进行的刀切法测试验证了算法的有效性。对位于非编码区的启动子,平均正确率达到了86.7%,明显优于其它算法;对位于编码区内部的启动子,平均正确率也达到了82.4%。算法还具有良好的可扩展性,能够方便地容纳新特征,使识别性能不断提高。
关键词
大肠杆菌
σ^70启动子识别
组合特征
二次判别分析法
刀切法
Keywords
esehefiehia coil
σ^70 promoter prediction
combined features
quadratic diseriminant analysis （qda）
jackknife method
分类号
Q527 [生物学—生物化学]
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职称材料
题名
FUDT在苹果近红外光谱分类中的应用
被引量：
1
2
作者
武斌
马桂香
武小红
机构
滁州职业技术学院信息工程系
江苏大学电气信息工程学院
出处
《计算机工程与应用》
CSCD
北大核心
2016年第3期193-196,223,共5页
基金
安徽省高等教育振兴计划人才项目"高校优秀青年人才支持计划"(皖教秘人[2014]181号)
安徽省高校省级优秀青年人才基金项目(No.2012SQRL251)
安徽省高校省级科学研究项目(No.KJ2012Z302)
文摘
苹果的分类是苹果采收后商品化处理的重要环节。为了快速、无损和有效地实现苹果的分类,利用近红外光谱技术采集四种苹果的近红外反射光谱,用主成分分析对高维的近红外光谱进行降维处理,分别运行线性判别分析,二次判别分析,模糊非相关判别转换和Foley-Sammon判别分析提取鉴别信息,用k-近邻分类器进行分类。分类结果表明,模糊非相关判别转换能更好地提取苹果近红外光谱的品种鉴别信息,达到了最高的分类准确率。
关键词
苹果分类
近红外光谱
线性判别分析
二次判别分析
模糊非相关判别转换
Foley-Sammon判别分析
Keywords
classification of apples
near infrared spectroscopy
Linear Discriminant
analysis
（LDA）
quadratic
Discriminant
analysis
（qda
）
Fuzzy Uncorrelated Discriminant Transformation（FUDT）
Foley-Sammon discriminant
analysis
分类号
TP391 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
一种基于组合特征的大肠杆菌σ^(70)启动子识别算法
杜耀华
敖伟
倪青山
王正志
《国防科技大学学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2005
2
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
FUDT在苹果近红外光谱分类中的应用
武斌
马桂香
武小红
《计算机工程与应用》
CSCD
北大核心
2016
1
在线阅读
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职称材料
已选择
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参考文献
引证文献
统计分析
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