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脉冲场凝胶电泳在肠炎沙门菌食源性疾病溯源中的应用 被引量:6
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作者 李孝权 庞杏林 +7 位作者 邓志爱 张欣强 石晓路 兰全学 莫自耀 陈守义 杨智聪 王鸣 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期245-248,共4页
目的对2006年广州地区食源性疾病中分离的肠炎沙门菌进行分子分型,探讨广州地区肠炎沙门菌的分子型别和多态性,为食源性疾病溯源及致病菌数据库的建立提供依据。方法采用限制性内切酶XbaI,对2006年分离到的菌株进行PFGE分子分型,使用Bio... 目的对2006年广州地区食源性疾病中分离的肠炎沙门菌进行分子分型,探讨广州地区肠炎沙门菌的分子型别和多态性,为食源性疾病溯源及致病菌数据库的建立提供依据。方法采用限制性内切酶XbaI,对2006年分离到的菌株进行PFGE分子分型,使用BioNumericsVersion4.0软件(使用Dice系数和UPGMA法)对菌株进行聚类分析,并与深圳市的肠炎沙门菌PFGE型别进行比较。结果所有74株肠炎沙门菌均得到一致的PFGE克隆型,表明两次不同的食源性疾病均由同一PFGE型引起。广州与深圳的肠炎沙门菌PFGE图谱的比较表明,两地食源性疾病分离株具有很近的亲缘关系。结论PFGE分子分型与流行病学资料紧密结合可增强对肠炎沙门菌食源性疾病的溯源和预警。 展开更多
关键词 肠炎沙门菌 脉冲场凝胶电泳(pfge) 分子分型 食源性疾病
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根瘤菌参比菌株23S rRNA基因数量和定位及其系统发育群 被引量:1
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作者 郑君芳 刘桂荣 +1 位作者 刘树林 贺俊崎 《浙江大学学报(农业与生命科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2008年第5期482-490,共9页
为了明确23S rRNA基因数量和定位是否可更好地揭示根瘤菌参比菌株的系统发育关系,采用I-CeuI酶切和脉冲场凝胶电泳(PFGE)结合的方法,对根瘤菌株23S rRNA基因的数量和定位进行分析,并依据其相似性进行聚群.结果显示,根瘤菌参比菌株可聚... 为了明确23S rRNA基因数量和定位是否可更好地揭示根瘤菌参比菌株的系统发育关系,采用I-CeuI酶切和脉冲场凝胶电泳(PFGE)结合的方法,对根瘤菌株23S rRNA基因的数量和定位进行分析,并依据其相似性进行聚群.结果显示,根瘤菌参比菌株可聚为19个系统发育群.其中,在属的水平上,13个系统发育群与现行分类群(不包括依据16S rRNA基因序列分析结果)一致,6个不一致.在种的水平上,现行分类群中同种的根瘤菌可进一步细分为不同的系统发育群.这表明:I-CeuI酶切和PFGE结合的方法能从基因组特征角度对根瘤菌参比菌株进行更加细化的系统发育分类,并使其属种间的同质性更好. 展开更多
关键词 根瘤菌 23S RRNA基因 系统发育分析 脉冲场电泳 I-CeuI
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宁夏志贺菌病原学特征分析
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作者 郭邦成 刘翔 +5 位作者 郝琼 闫立群 谢明英 景怀琦 王鑫 梁俊容 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第3期252-255,共4页
目的探讨宁夏地区志贺菌菌群分布、药物敏感性情况,并通过同源性分析研究其分子流行病学特征,为菌痢防控提供依据。方法通过系统生化条(API20E)鉴别菌株,用血清玻片凝集鉴定菌型,采用K-B法检测分离菌株对10种常用抗生素的敏感性,并应用... 目的探讨宁夏地区志贺菌菌群分布、药物敏感性情况,并通过同源性分析研究其分子流行病学特征,为菌痢防控提供依据。方法通过系统生化条(API20E)鉴别菌株,用血清玻片凝集鉴定菌型,采用K-B法检测分离菌株对10种常用抗生素的敏感性,并应用脉冲场凝胶电泳技术(PFGE)进行分子分型,所得结果用BioNumericsV4.0软件UPGMA方法进行聚类分析。结果 176株志贺菌中,福氏志贺菌112株,占63.64%,其中福氏2b型52株,占29.55%;宋内志贺氏菌64株,占36.36%。药敏试验显示耐药率最高的药物为氨苄西林、萘啶酸、四环素、利福平;其次为阿莫西林、复方新诺明;而敏感性最高药物依次为环丙沙星(CIP)、头孢噻肟和头孢噻吩,其中福氏志贺菌和宋内志贺菌对10种抗生素的耐药谱略显不同;112株福氏志贺菌共分为36个带型,其中,JZXN11.NX06、JZXN11.NX07、JZXN11.NX021、JZXN11.NX0025占所有分型菌株的57.14%,为我省主要的暴发型。64株宋内志贺菌分为21个带型,J16X01.NX0011和J16X01.NX0012为两个主要流行带型,分别占分型菌株的31.25%和15.63%。结论本省志贺菌流行以福氏为主,其中F2b为优势菌型,F4c和宋内氏菌检出率显著增高;志贺菌对氨苄西林(AMP)、四环素(Te)、阿莫西林(AML)和萘啶酸耐药率最高,多重耐药现象严重;PFGE型别呈现多元化流行特点,流行的优势带型减弱、多种型别并存的复杂形态。 展开更多
关键词 脉冲场凝胶电泳(pfge) 志贺氏菌 药敏分析
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