目的探讨山东省部分地区规模化养猪厂的动物、环境以及员工生活区域中共同存在的菌种的耐药性和亲缘关系,通过细菌溯源分析为理解耐药菌的传播机制提供科学依据。方法从两养猪厂采集样本,通过细菌分离和纯化,利用16S r RNA基因测序鉴定...目的探讨山东省部分地区规模化养猪厂的动物、环境以及员工生活区域中共同存在的菌种的耐药性和亲缘关系,通过细菌溯源分析为理解耐药菌的传播机制提供科学依据。方法从两养猪厂采集样本,通过细菌分离和纯化,利用16S r RNA基因测序鉴定分离菌株种属。对于在猪、环境和生活区域中同时存在的菌种,使用VITEK-2 Compact药物敏感性分析仪及纸片扩散法进行药物敏感性测试。此外,利用Illumina Miniseq平台进行全基因组测序,对菌株的耐药基因进行注释,并通过多位点序列分型(MLST)和核心基因组单核苷酸多态性(cgSNP)分析进行耐药菌的溯源。结果通过对动物、环境以及员工生活区域样本细菌分离与培养,鉴定出3种在上述3个区域均有分布的菌种,分别为金黄色葡萄球菌、铜绿假单胞菌以及蜡样芽胞杆菌,其显示出耐药谱多样性和遗传多样化。此外,研究还发现在猪尿、厂内外土壤、人饮水、食堂及宿舍中存在耐药谱、耐药基因、ST型和SNP位点高度一致的菌株。结论养猪厂在养殖区与生活区之间存在条件致病菌的传播风险。特别是耐甲氧西林金黄色葡萄球菌在环境中的传播,应予以重视。展开更多
文摘目的探讨山东省部分地区规模化养猪厂的动物、环境以及员工生活区域中共同存在的菌种的耐药性和亲缘关系,通过细菌溯源分析为理解耐药菌的传播机制提供科学依据。方法从两养猪厂采集样本,通过细菌分离和纯化,利用16S r RNA基因测序鉴定分离菌株种属。对于在猪、环境和生活区域中同时存在的菌种,使用VITEK-2 Compact药物敏感性分析仪及纸片扩散法进行药物敏感性测试。此外,利用Illumina Miniseq平台进行全基因组测序,对菌株的耐药基因进行注释,并通过多位点序列分型(MLST)和核心基因组单核苷酸多态性(cgSNP)分析进行耐药菌的溯源。结果通过对动物、环境以及员工生活区域样本细菌分离与培养,鉴定出3种在上述3个区域均有分布的菌种,分别为金黄色葡萄球菌、铜绿假单胞菌以及蜡样芽胞杆菌,其显示出耐药谱多样性和遗传多样化。此外,研究还发现在猪尿、厂内外土壤、人饮水、食堂及宿舍中存在耐药谱、耐药基因、ST型和SNP位点高度一致的菌株。结论养猪厂在养殖区与生活区之间存在条件致病菌的传播风险。特别是耐甲氧西林金黄色葡萄球菌在环境中的传播,应予以重视。
