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系统生物模型转换研究——从SBML到Stochastic Pi Calculus
被引量:
1
1
作者
董驻鹏
董笑菊
倪佳华
《上海交通大学学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2005年第8期1280-1283,共4页
分析了系统生物标记语言(SBML)模型和用随机Pi演算对生物建模(BioSPI)的不同特点,给出了两种模型之间转换的一系列处理规则;在规则的指导下将具体的SBML模型转换为BioSPI表示的程序语言,并借助分析工具来模拟该SBML模型运动变化过程.提...
分析了系统生物标记语言(SBML)模型和用随机Pi演算对生物建模(BioSPI)的不同特点,给出了两种模型之间转换的一系列处理规则;在规则的指导下将具体的SBML模型转换为BioSPI表示的程序语言,并借助分析工具来模拟该SBML模型运动变化过程.提出了自动实现转换的方法以及将转换扩展到其他进程演算形式的构想.
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关键词
系统生物
系统生物标记语言
随机
pi
演算对生物建模
形式化方法
DNA计算机
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题名
系统生物模型转换研究——从SBML到Stochastic Pi Calculus
被引量:
1
1
作者
董驻鹏
董笑菊
倪佳华
机构
上海交通大学计算机科学与工程系
出处
《上海交通大学学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2005年第8期1280-1283,共4页
基金
国家杰出青年科学基金资助项目(60225012)
上海科委交叉领域创新团队专项课题(03DZ14025)
文摘
分析了系统生物标记语言(SBML)模型和用随机Pi演算对生物建模(BioSPI)的不同特点,给出了两种模型之间转换的一系列处理规则;在规则的指导下将具体的SBML模型转换为BioSPI表示的程序语言,并借助分析工具来模拟该SBML模型运动变化过程.提出了自动实现转换的方法以及将转换扩展到其他进程演算形式的构想.
关键词
系统生物
系统生物标记语言
随机
pi
演算对生物建模
形式化方法
DNA计算机
Keywords
systems
biology
systems
biology
markup language (SBML)
modeling biology with stochastic pi calculus (biospi)
formal method
DNA computer
分类号
TP371.77 [自动化与计算机技术—计算机系统结构]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
系统生物模型转换研究——从SBML到Stochastic Pi Calculus
董驻鹏
董笑菊
倪佳华
《上海交通大学学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2005
1
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