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A novel hyper-cube shrink algorithm to predict metabolic fluxes based on enzyme activity only
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作者 XIE Zheng-wei ZHANG Tian-yu OUYANG Qi 《中国药理学与毒理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第10期1085-1085,共1页
OBJECTIVE One of the long-expected goals of genome-scale metabolic modeling is to evaluate the influence of the perturbed enzymes to the yield of an expected end product.METHDOS Metabolic control analysis(MCA)performs... OBJECTIVE One of the long-expected goals of genome-scale metabolic modeling is to evaluate the influence of the perturbed enzymes to the yield of an expected end product.METHDOS Metabolic control analysis(MCA)performs such role to calculate the sensitivity of flux change upon that of enzymes under the framework of ordinary differential equation(ODE)models,which are restricted in small-scale networks and require explicit kinetic parameters.The constraint-based models,like flux balance analysis(FBA),lack of the room of performing MCA because they are parameters-free.In this study,we developed a hyper-cube shrink algorithm(HCSA)to incorporate the enzymatic properties to the FBA model by introducing a pair of parameters for each reaction.Our algorithm was able to handle not only prediction of knockout strains but also strains with an adjustment of expression level of certain enzymes.RESULTS We first showed the concept by applying HCSA to a simplest three-nodes network.Then we show the HCSA possesses Michaelis-Menten like behaviors characterized by steady state of ODE.We obtained good prediction of a synthetic network in Saccharomyces cerevisiae producing voilacein and analogues.Finally we showed its capability of predicting the flux distribution in genome-scale networks by applying it to sporulation in yeast.CONCLUSION We have developed an algorithm the impact on fluxes when certain enzymes were inhibited or activated.It provides us a powerful tool to evaluate the consequences of enzyme inhibitor or activator. 展开更多
关键词 metabolic network linear programming flux balance analysis
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基于MFA的青岛市城阳区物质代谢研究 被引量:10
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作者 孙磊 周震峰 《环境科学研究》 EI CAS CSCD 北大核心 2007年第6期154-157,共4页
基于欧盟的物质流分析(MFA)框架,对青岛市城阳区的物质代谢状态和代谢强度进行了系统分析.结果表明:1995─2004年城阳区资源投入量和污染物排放量分别增长3.6和1.8倍,化石燃料和矿物约占资源投入量的50.26%~76.30%,进口资源量所占比例... 基于欧盟的物质流分析(MFA)框架,对青岛市城阳区的物质代谢状态和代谢强度进行了系统分析.结果表明:1995─2004年城阳区资源投入量和污染物排放量分别增长3.6和1.8倍,化石燃料和矿物约占资源投入量的50.26%~76.30%,进口资源量所占比例呈逐年增长趋势,经济发展的资源外部依赖性较强.万元GDP资源投入由6.01 t降至3.56 t,万元GDP污染物排放量也降低了63.74%,表明城阳区经济发展的资源利用效率和生态效率已有不同程度的提高,但仍远高于发达国家20世纪末期的水平,因此提高资源生产力和控制污染物排放是实现城阳区可持续发展的必由之路. 展开更多
关键词 物质流分析 物质代谢 代谢强度
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酵母基因组规模模型进展及发展趋势 被引量:1
3
作者 李永珠 陈禹 《合成生物学》 北大核心 2025年第3期585-602,共18页
酵母作为常用的真核模式生物,在合成生物学和系统生物学研究中具有重要地位。然而,由于其代谢系统较为复杂,进行代谢网络研究和设计时存在一定困难,因此,研究人员提出了基因组规模的建模方法,利用基因组序列及注释信息,整合细胞内复杂... 酵母作为常用的真核模式生物,在合成生物学和系统生物学研究中具有重要地位。然而,由于其代谢系统较为复杂,进行代谢网络研究和设计时存在一定困难,因此,研究人员提出了基因组规模的建模方法,利用基因组序列及注释信息,整合细胞内复杂的代谢反应和细胞过程,模拟细胞系统各部分的相互作用,得到对应的表型、功能和行为,辅助寻找代谢工程改造靶点,为理解复杂细胞系统提供了强有力的工具。本文介绍了基因组规模模型中传统代谢模型及整合多种生理学约束和多种细胞过程的模型的构建和分析方法,回顾了酵母属中多种酵母基因组规模模型的发展历程及主要应用,并基于此分析了当前酵母基因组规模模型研究中面临的主要问题,提出了提升模型准确率以及未来进一步优化模型的方法和趋势。 展开更多
关键词 基因组规模模型 酵母 代谢工程 细胞代谢 通量分析
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提升头孢菌素C发酵效率的复合碳源补料工艺开发及代谢机制
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作者 杨倚铭 陈震 +1 位作者 田锡炜 储炬 《华东理工大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期687-694,共8页
开发了一种以葡萄糖和豆油为底物碳源的复合补料策略,能够显著提升头孢菌素C(CPC)的合成效率,使其产量提升了14.8%,并观测到碳源变化在宏观呼吸代谢、中间代谢物、细胞内通量分配和还原力NADPH利用方面产生了全局影响,其中二氧化碳释放... 开发了一种以葡萄糖和豆油为底物碳源的复合补料策略,能够显著提升头孢菌素C(CPC)的合成效率,使其产量提升了14.8%,并观测到碳源变化在宏观呼吸代谢、中间代谢物、细胞内通量分配和还原力NADPH利用方面产生了全局影响,其中二氧化碳释放速率(CER)的变化表明在葡萄糖和豆油复合补料策略下细胞中心代谢网络的通量发生了明显改变,碳流向CPC的通量得到增强,同时促进了蛋氨酸和丝氨酸的胞外吸收。胞内有机酸α-酮戊二酸、丙酮酸、苹果酸的浓度明显提升,有利于谷氨酸、缬氨酸和半胱氨酸等核心氨基酸的合成,从而有利于CPC生产。主成分分析(PCA)的载荷测定结果表明大多数氨基酸和CPC合成呈正相关,谷氨酸的胞内含量与CPC合成的关联性最强,而α-氨基己二酸和赖氨酸积累反而不利于CPC合成。细胞还原力方面,豆油和葡萄糖组合工艺有助于NADPH更多地用于CPC合成,使得CPC快速合成时对NADPH的大量需求得到了满足。这些结果表明改变底物能够对细胞内部的代谢产生全方位的影响,复合补料策略在优化CPC合成中具有巨大潜力。 展开更多
关键词 头孢菌素C 碳源 呼吸代谢 代谢通量分析 主成分分析
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城市物质流分析框架及其指标体系构建 被引量:12
5
作者 陈波 杨建新 +1 位作者 石垚 欧阳志云 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第22期6289-6296,共8页
借鉴国内外物质流分析的研究成果,结合我国城市物质代谢特点,建立了城市物质流分析的框架及指标体系。该框架以城市社会经济系统物质通量的变化为核心,增加了对城市社会经济系统可持续能力的考察以及对城市和区域循环经济贡献的关注。... 借鉴国内外物质流分析的研究成果,结合我国城市物质代谢特点,建立了城市物质流分析的框架及指标体系。该框架以城市社会经济系统物质通量的变化为核心,增加了对城市社会经济系统可持续能力的考察以及对城市和区域循环经济贡献的关注。论文识别了城市物质流分析中系统边界界定等关键问题,并提出了解决方法;指标体系在借鉴国家层面物质流分析指标体系的基础上,注重对城市经济系统内部循环及不同城市经济系统间的物质循环的考察,增加了再生资源输入量、内部资源回收量、可回收废物输出量、新鲜水输入量、中水回用量等指标,用于表征城市可持续发展的能力及实践成果。 展开更多
关键词 物质流分析 城市 代谢分析
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产朊假丝酵母分批发酵生产谷胱甘肽的代谢通量分析 被引量:16
6
作者 卫功元 李寅 +1 位作者 堵国成 陈坚 《化工学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2006年第6期1410-1417,共8页
根据产朊假丝酵母利用葡萄糖作为惟一碳源生物合成谷胱甘肽的代谢网络,利用代谢通量分析方法分析了谷胱甘肽分批发酵不同阶段各代谢途径碳通量的分布和变化规律.在此基础上,通过分阶段温度控制和L-半胱氨酸添加等策略,调节谷胱甘肽分批... 根据产朊假丝酵母利用葡萄糖作为惟一碳源生物合成谷胱甘肽的代谢网络,利用代谢通量分析方法分析了谷胱甘肽分批发酵不同阶段各代谢途径碳通量的分布和变化规律.在此基础上,通过分阶段温度控制和L-半胱氨酸添加等策略,调节谷胱甘肽分批发酵过程中的代谢通量分布,谷胱甘肽生物合成的产量明显提高,最大增加幅度分别达到23%和91%·同时对这些策略下谷胱甘肽的过量合成机理进行了解释. 展开更多
关键词 谷胱甘肽 分批发酵 代谢网络 代谢通量分析
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克鲁斯假丝酵母分批发酵生产甘油的代谢流分布 被引量:24
7
作者 唐军 蔡水洪 叶勤 《高校化学工程学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2002年第1期58-63,共6页
采用Candida krusei 分批发酵生产甘油,在碳元素平衡基础上作代谢流分析得知,典型生长阶段(6~12h)形成菌体流量较大,占50%以上,且有12%的乙醇流量,甘油流量较小;典型生产阶段(48~54h)甘油流量增大为42%, 菌体和乙醇流量为0, 有11%的... 采用Candida krusei 分批发酵生产甘油,在碳元素平衡基础上作代谢流分析得知,典型生长阶段(6~12h)形成菌体流量较大,占50%以上,且有12%的乙醇流量,甘油流量较小;典型生产阶段(48~54h)甘油流量增大为42%, 菌体和乙醇流量为0, 有11%的有机酸流量. 展开更多
关键词 Candidakrusei 分批发酵 代谢流分布 甘油 发酵法生产 克鲁斯假丝酵母 碳硫平衡法
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pH值对运动发酵单胞菌葡萄糖代谢酶活性影响的研究 被引量:3
8
作者 陈玲 王成涛 +2 位作者 孙宝国 曹雁平 童军茂 《中国酿造》 CAS 北大核心 2010年第2期29-32,共4页
以运动发酵单胞菌(Zymomonas mobilis)ATCC31821模式菌株,研究pH值条件对其葡萄糖代谢关键酶活力的影响。结果表明:发酵液pH5.5时,胞内乙醇脱氢酶、丙酮酸脱羧酶、葡萄糖激酶、葡萄糖-6-磷酸脱氢酶的活力较高,而异柠檬酸脱氢酶... 以运动发酵单胞菌(Zymomonas mobilis)ATCC31821模式菌株,研究pH值条件对其葡萄糖代谢关键酶活力的影响。结果表明:发酵液pH5.5时,胞内乙醇脱氢酶、丙酮酸脱羧酶、葡萄糖激酶、葡萄糖-6-磷酸脱氢酶的活力较高,而异柠檬酸脱氢酶活性较低,能促进乙醇的生成:pH5.0时,苹果酸脱氢酶的酶活力较低,使糖酵解反应向另一个方向发生偏移,促进乙醇的形成。pH4.0-6.5时,丙酮酸激酶和甘油醛.3-磷酸脱氢酶的酶活力水平相差不大,说明pH值对这2种酶的活性影响甚微。因此,pH5.0~5.5,代谢途径(如糖酵解途径、ED途径等)中的胞内代谢酶活性增强,有利于乙醇的产生。 展开更多
关键词 运动发酵单胞菌 糖代谢 酶活力 代谢流量
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城市物质流分析框架及测算方法 被引量:30
9
作者 石磊 楼俞 《环境科学研究》 EI CAS CSCD 北大核心 2008年第4期196-200,共5页
在借鉴国家物质流分析(MFA)框架基础上,针对进出城市系统的物质数据缺乏且难以统计的特点,引入面向元素或产品的物质流分析(SFA)要素,建立了城市尺度物质流分析框架.与国家物质流分析相比,该框架总体结构和物质分类上相同,但输入量、净... 在借鉴国家物质流分析(MFA)框架基础上,针对进出城市系统的物质数据缺乏且难以统计的特点,引入面向元素或产品的物质流分析(SFA)要素,建立了城市尺度物质流分析框架.与国家物质流分析相比,该框架总体结构和物质分类上相同,但输入量、净存量和输出量的计算顺序和假设条件不同.对于化石能源,可由城市统计年鉴中的能源平衡表直接得出本地开采量、净存量、调入量和调出量;对于生物质,本地开采(生产)量一般都有统计,净存量可通过假设人均消费量相对稳定估算得出,而调入量和调出量则需要对大宗工业用途进行调查并做少量假设计算得出;对于金属矿物及其产品、工业非金属矿物及其产品、建筑材料3类物质,本地开采量和消费量一般都有所统计,而调入量和调出量的计算则需要首先采用针对元素或成品的物质流分析来获取城市系统中的净存量,然后再配合生产和消费数据并做少量假设测算得出.其他项目的获取或测算同国家物质流分析,由此得到的城市物质流分析框架可以用于城市间物质代谢的比较. 展开更多
关键词 城市 物质代谢 物质流分析
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代谢工程的发展现状和未来 被引量:10
10
作者 赵学明 马红武 班睿 《化学工程》 EI CAS CSCD 北大核心 1997年第5期57-59,56,共4页
代谢工程采用基因工程技术对细胞内的代谢通量进行重新设计,该文讨论了代谢工程的发展以及三种主要的定量分析方法,并提出了需要进一步深入研究的问题及生化工作者应在代谢工程研究中作出的贡献。
关键词 代谢工程 代谢通量分析 细胞 生物化学
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耐高渗酿酒酵母的代谢流分析 被引量:11
11
作者 李晓军 徐鹏 +2 位作者 栾静 苗君 赵长新 《食品与生物技术学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期356-360,共5页
研究了指数生长期的酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)在高渗胁迫下的生理代谢。甘油和海藻糖是酿酒酵母的主要相容性溶质。在高渗环境下,胞外酒精质量浓度、甘油质量浓度、海藻糖质量浓度分别较对照提高100%、400%和11%。代谢流分析... 研究了指数生长期的酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)在高渗胁迫下的生理代谢。甘油和海藻糖是酿酒酵母的主要相容性溶质。在高渗环境下,胞外酒精质量浓度、甘油质量浓度、海藻糖质量浓度分别较对照提高100%、400%和11%。代谢流分析表明,高渗环境下,从节点6-磷酸葡萄糖合成海藻糖的碳流较常规培养增加了47.3%;从节点磷酸二羟丙酮和3-磷酸甘油醛合成甘油的碳流增加了55.7%;从节点丙酮酸流向乙醇的碳流增加了300%,而流向三羧酸(TCA)循环的流量减少了21.7%。 展开更多
关键词 酿酒酵母 高渗胁迫 甘油 海藻糖 代谢流分析
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生物信息学用于代谢网络研究的进展与展望 被引量:14
12
作者 何锋 马红武 +2 位作者 赵学明 元英进 曾安平 《化工学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2004年第10期1593-1601,共9页
如何分析基因测序和高通量分析方法所获得的海量数据和信息 ,及由此而得到的复杂生物网络 ,是生物信息学研究者所面临的重要任务 .本文综述了基于基因组的大规模代谢网络重建和分析的进展 ,论述了利用生物信息学方法分析代谢网络结构的... 如何分析基因测序和高通量分析方法所获得的海量数据和信息 ,及由此而得到的复杂生物网络 ,是生物信息学研究者所面临的重要任务 .本文综述了基于基因组的大规模代谢网络重建和分析的进展 ,论述了利用生物信息学方法分析代谢网络结构的主要方法和结果 ;比较了现阶段两种最常用的代谢途径分析方法 ,即基元模式和极端途径的差异 ;列举了这两种方法在代谢网络结构和功能分析、工程菌设计等多方面的重要应用 ;指出了现阶段在途径分析领域存在的问题和应对的策略 . 展开更多
关键词 生物信息学 基因组学 代谢网络 代谢途径 基元模式 极端途径
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氧化还原电位调控对产琥珀酸放线杆菌代谢通量分布的影响 被引量:10
13
作者 姜岷 黄秀梅 +4 位作者 李建 陈可泉 杨卓娜 郑晓宇 韦萍 《化工学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2009年第10期2555-2561,共7页
利用代谢通量分析方法分析了氧化还原电位调控对产琥珀酸放线杆菌NJ113厌氧发酵产丁二酸过程的影响。结果表明,氧化还原电位调控可以改变HMP与EMP途径的代谢通量,从而影响胞内NADH/NAD+。在菌体最适氧化还原电位(-350 mV)条件下,HMP途径... 利用代谢通量分析方法分析了氧化还原电位调控对产琥珀酸放线杆菌NJ113厌氧发酵产丁二酸过程的影响。结果表明,氧化还原电位调控可以改变HMP与EMP途径的代谢通量,从而影响胞内NADH/NAD+。在菌体最适氧化还原电位(-350 mV)条件下,HMP途径与EMP途径的通量比由43.6∶56.2提高至63.2∶36.5,间接合成更多的NADH,解决了丁二酸合成过程中还原力不足的矛盾,整个发酵过程中胞内NADH/NAD+比值有明显提高,发酵初期NADH/NAD+比值由2.19提高至8.73。最终丁二酸代谢通量从114.5 mmol.(g DCW)-1.h-1增至129.3 mmol.(g DCW)-1.h-1,副产物乙酸、甲酸的代谢通量分别降低30.6%、30.2%;丁二酸收率由75.46%提高至89.34%,生产强度达到1.18 g.L-1.h-1。 展开更多
关键词 丁二酸 厌氧发酵 氧化还原电位 代谢通量分析
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厦门市资源水与虚拟水耦合代谢效率评价 被引量:6
14
作者 黄初龙 于昌平 +1 位作者 高兵 黄云凤 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第22期7267-7278,共12页
自然水循环与社会水循环的关联研究是制定系统性水代谢对策的前提。从水资源代谢过程与格局角度,用物质流分析法(MFA)剖析了亚热带季风气候雨影区缺水城市枯水年份资源水与虚拟水耦合代谢的路径、数量,提取代谢效率评价所需的过程与结... 自然水循环与社会水循环的关联研究是制定系统性水代谢对策的前提。从水资源代谢过程与格局角度,用物质流分析法(MFA)剖析了亚热带季风气候雨影区缺水城市枯水年份资源水与虚拟水耦合代谢的路径、数量,提取代谢效率评价所需的过程与结构指标,以社会、经济、生态环境效益最优化为评价原则构建了城市水资源代谢效率评价指标体系,采用层次分析法赋权,评价了近10年来枯水年份厦门市资源水与虚拟水耦合代谢效率。结果表明,厦门水资源代谢效率呈加速提高趋势,主要由用水效率类和水代谢过程与结构类指标驱动。说明提高水资源代谢效率的根本对策在于用水行为和用水过程与结构的改善。采用情景分析法设计主导驱动指标不同组合下水资源代谢效率情景方案,提高了方案的可操作性,可基于这些指标制定水资源管理对策。基于MFA结果提取指标丰富了指标体系构建理论。 展开更多
关键词 资源水 虚拟水 水资源代谢效率 物质流分析(mfa) 指标体系 情景分析
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温度对Zymomonas mobilis糖代谢关键酶活力和代谢流量的影响 被引量:2
15
作者 陈玲 王成涛 +2 位作者 曹雁平 孙宝国 童军茂 《食品工业科技》 CAS CSCD 北大核心 2009年第12期182-185,共4页
以运动发酵单胞菌(Zymomonas mobilis)ATCC31821为模式菌株,研究不同温度条件对其葡萄糖代谢关键酶活力的影响。采用全自动发酵罐,在整个发酵过程中通过充入氮气调节发酵液的溶氧量(DO)=0%,添加0·5mol/LNaOH溶液控制pH=5·5,... 以运动发酵单胞菌(Zymomonas mobilis)ATCC31821为模式菌株,研究不同温度条件对其葡萄糖代谢关键酶活力的影响。采用全自动发酵罐,在整个发酵过程中通过充入氮气调节发酵液的溶氧量(DO)=0%,添加0·5mol/LNaOH溶液控制pH=5·5,发酵温度分别控制为25、30、35、40℃,发酵24h,测定其糖代谢网络中ED、HMP、TCA等途径的关键酶活力和代谢物成分。结果表明,在发酵温度为30~35℃时,乙醇脱氢酶(ADH)、葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(G-6-PDH)、丙酮酸脱羧酶(PDC)、葡萄糖激酶(GK)、丙酮酸激酶(PK)和甘油醛-3-磷酸脱氢酶(GD-3-PDH)的活力较高,菌体的ED途径代谢活跃,碳素流量增加,乙醇生产量和糖转化率较高,而TCA途径的苹果酸脱氢酶(MDH)和异柠檬酸脱氢酶(ICDH)等活力较低,进入TCA途径的碳素流量明显减少;发酵温度为25、40℃时,TCA途径的酶活力升高,ED途径的酶活力减弱,生成乙醇的代谢流量减少,因此温度是Z·mobilis发酵过程中调控菌体细胞生长和糖代谢的一个重要因素。 展开更多
关键词 运动发酵单胞茵 温度 糖代谢 酶活力 代谢流量分配
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不同溶氧控制方式下的谷胱甘肽分批发酵过程分析 被引量:17
16
作者 卫功元 王大慧 陈坚 《化工学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2007年第9期2329-2335,共7页
分析了产朊假丝酵母生产谷胱甘肽(GSH)的摇瓶发酵过程,发现溶氧浓度的大小成为影响细胞生长和GSH产量的重要因素。在此基础上,研究了恒溶氧和恒转速条件下的GSH分批发酵过程,与恒转速发酵相比,恒溶氧控制发酵可以明显提高细胞干重和GSH... 分析了产朊假丝酵母生产谷胱甘肽(GSH)的摇瓶发酵过程,发现溶氧浓度的大小成为影响细胞生长和GSH产量的重要因素。在此基础上,研究了恒溶氧和恒转速条件下的GSH分批发酵过程,与恒转速发酵相比,恒溶氧控制发酵可以明显提高细胞干重和GSH产量,当恒溶氧浓度为35%时,二者的提高幅度最多可分别达到22%和30%。最后分别采用发酵动力学模型和代谢网络中各代谢物通量的分布情况对该结果产生的原因进行了定量解释。 展开更多
关键词 谷胱甘肽 分批发酵 溶解氧 动力学 代谢通量分析
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邯郸市物质流分析 被引量:12
17
作者 楼俞 石磊 《环境科学研究》 EI CAS CSCD 北大核心 2008年第4期201-204,共4页
利用邯郸市统计年鉴数据和实地调研资料,采用城市物质流分析框架研究邯郸市2005年物质流全景和1993─2005年物质输入和输出结构的时间序列变化.结果表明:13年间邯郸市地区生产总值增长3.4倍,物质输入增长1.1倍,物质生产力增长1.1倍,由1... 利用邯郸市统计年鉴数据和实地调研资料,采用城市物质流分析框架研究邯郸市2005年物质流全景和1993─2005年物质输入和输出结构的时间序列变化.结果表明:13年间邯郸市地区生产总值增长3.4倍,物质输入增长1.1倍,物质生产力增长1.1倍,由1993年的151.8元/t上升至2005年的320.9元/t,反映了邯郸市前期经济发展与资源投入具有明显的"脱钩"现象;另一方面,邯郸市仍然遵循着"高投入、高排放"的发展模式,2005年物质净存量仅占全年物质通量的12.2%,大部分物质在开采当年并不进入经济系统而直接排放到生态系统中;同时,邯郸市经济发展的对外依存度逐年升高,从该市外调入的物质量所占比例由1993年的10.2%上升至2005年的39.2%,表明邯郸市经济发展将面临更大的资源压力. 展开更多
关键词 城市 物质代谢 物质流分析 邯郸市
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代谢通量分析优化米根霉R1021发酵生产L(+)-乳酸过程 被引量:15
18
作者 白冬梅 付卫明 +3 位作者 赵学明 代海霞 李鑫钢 徐世民 《无锡轻工大学学报(食品与生物技术)》 CSCD 北大核心 2002年第6期554-558,共5页
建立了米根霉R1021的代谢网络,分析了米根霉R1021在分批发酵过程中不同阶段、不同氮源浓度、不同供氧量条件下的代谢通量分布,确定PYR是米根霉代谢网络上的关键节点,此节点的通量分配比影响着乳酸的最终产率.在米根霉发酵中,当NH4NO3质... 建立了米根霉R1021的代谢网络,分析了米根霉R1021在分批发酵过程中不同阶段、不同氮源浓度、不同供氧量条件下的代谢通量分布,确定PYR是米根霉代谢网络上的关键节点,此节点的通量分配比影响着乳酸的最终产率.在米根霉发酵中,当NH4NO3质量浓度为2.0g/L,空气体积流量为2L/min时,流向乳酸的代谢流最大.通过对模型进行优化计算得到L(+) 乳酸的最大理论得率YP/S为98.2%. 展开更多
关键词 代谢通量分析 米根霉R1021 发酵生产 L(+)-乳酸
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盐胁迫条件下酿酒酵母的代谢通量分析 被引量:5
19
作者 李明达 陈霞 +2 位作者 韩丹 莫新迎 赵长新 《吉林大学学报(理学版)》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期699-703,共5页
用计算代谢通量的方法研究酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)在高盐胁迫条件下的生理代谢.结果表明,在盐胁迫条件下,胞外海藻糖、甘油、乙醇和乳酸的质量浓度分别较常规培养条件下提高了24.44%,60.89%,23.32%和26.76%,而柠檬酸、琥珀... 用计算代谢通量的方法研究酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)在高盐胁迫条件下的生理代谢.结果表明,在盐胁迫条件下,胞外海藻糖、甘油、乙醇和乳酸的质量浓度分别较常规培养条件下提高了24.44%,60.89%,23.32%和26.76%,而柠檬酸、琥珀酸和苹果酸的质量浓度分别较常规培养条件下降低了82.11%,50.37%和53.33%.代谢通量分析表明,在盐胁迫培养条件下糖酵解途径各支路的代谢产物通量均有所增加,而TCA循环中各代谢产物的通量均有所减少. 展开更多
关键词 酿酒酵母 盐胁迫 代谢流分析
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应用代谢通量法分析黄原胶发酵实验数据 被引量:10
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作者 赵学明 马红武 唐寅杰 《高校化学工程学报》 EI CAS CSCD 北大核心 1997年第4期394-399,共6页
首次采用代谢通量分析法对黄原胶发酵过程的实验数据进行了定量分析,根据黄单胞菌的胶合成及糖分解代谢机理求得了产胶期的内部代谢通量分布,得出了得率与呼吸商间的关系式;并根据一定维持机理求得了维持系数、P/O及理论得率等。
关键词 代谢通量分析 黄原胶 发酵代谢 维持系数
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