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基于加权距离方法的多瘤病毒系统发育关系分析
1
作者
周立前
杨碧波
《湘潭大学自然科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第2期16-21,共6页
多瘤病毒广泛地分布在脊椎动物中,这类病毒会造成肿瘤,有些还会感染人的呼吸系统.因此,研究多瘤病毒的系统发育关系,在生物学和医学上都有着重要的价值.该文基于关联距离和对数关联距离加权的方法构建了70种多瘤病毒完全基因组的系统发...
多瘤病毒广泛地分布在脊椎动物中,这类病毒会造成肿瘤,有些还会感染人的呼吸系统.因此,研究多瘤病毒的系统发育关系,在生物学和医学上都有着重要的价值.该文基于关联距离和对数关联距离加权的方法构建了70种多瘤病毒完全基因组的系统发育树,与Perez-Losada等的工作以及作者以前的工作获得的结果相比较,系统发育树的结构基本上一致.
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关键词
多瘤病毒
系统发育树
关联距离
对数关联距离
加权距离
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职称材料
一种基于线粒体完全基因组的熵密度分布的脊椎动物系统发育树构建方法
2
作者
周立前
《湘潭大学自然科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第4期21-25,共5页
线粒体完全基因组是一种构建脊椎动物系统发育树的非常重要的数据资源.该文中我们应用基于非序列比对的熵密度分布方法结合对数关联距离对64种脊椎动物的线粒体完全基因组进行分析处理并构建系统发育树,产生的树将所选择的生物体分为三...
线粒体完全基因组是一种构建脊椎动物系统发育树的非常重要的数据资源.该文中我们应用基于非序列比对的熵密度分布方法结合对数关联距离对64种脊椎动物的线粒体完全基因组进行分析处理并构建系统发育树,产生的树将所选择的生物体分为三个大类:哺乳类(Mammalia)、鱼类(Fish)和初龙下纲(包括鸟类(Birds)和爬行类(Reptiles)),其拓扑结构与当前已知的用传统方法产生的树相似.
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关键词
完全基因组
系统发育树
组合向量
熵密度分布
对数关联距离
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职称材料
题名
基于加权距离方法的多瘤病毒系统发育关系分析
1
作者
周立前
杨碧波
机构
湖南工业大学计算机与通信学院
湘潭大学数学与计算科学学院
出处
《湘潭大学自然科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第2期16-21,共6页
基金
湖南省国际合作基金资助项目(2011WK3032)
文摘
多瘤病毒广泛地分布在脊椎动物中,这类病毒会造成肿瘤,有些还会感染人的呼吸系统.因此,研究多瘤病毒的系统发育关系,在生物学和医学上都有着重要的价值.该文基于关联距离和对数关联距离加权的方法构建了70种多瘤病毒完全基因组的系统发育树,与Perez-Losada等的工作以及作者以前的工作获得的结果相比较,系统发育树的结构基本上一致.
关键词
多瘤病毒
系统发育树
关联距离
对数关联距离
加权距离
Keywords
polyomavirus
phy
log
enetie tree
correlation
distance
log
-
correlation
distance
weighted
distance
分类号
Q19 [生物学—普通生物学]
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职称材料
题名
一种基于线粒体完全基因组的熵密度分布的脊椎动物系统发育树构建方法
2
作者
周立前
机构
湘潭大学数学与计算科学学院
出处
《湘潭大学自然科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第4期21-25,共5页
基金
国家自然科学基金(30570426)
霍英东青年教师基金(101004)
湖南省教育厅青年基金(05B007)资助项目
文摘
线粒体完全基因组是一种构建脊椎动物系统发育树的非常重要的数据资源.该文中我们应用基于非序列比对的熵密度分布方法结合对数关联距离对64种脊椎动物的线粒体完全基因组进行分析处理并构建系统发育树,产生的树将所选择的生物体分为三个大类:哺乳类(Mammalia)、鱼类(Fish)和初龙下纲(包括鸟类(Birds)和爬行类(Reptiles)),其拓扑结构与当前已知的用传统方法产生的树相似.
关键词
完全基因组
系统发育树
组合向量
熵密度分布
对数关联距离
Keywords
complete genome
vertebrate phy
log
eny
composition vector
entropy density profile ( EDP)
log - correlation distance.
分类号
O221 [理学—运筹学与控制论]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
基于加权距离方法的多瘤病毒系统发育关系分析
周立前
杨碧波
《湘潭大学自然科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012
0
在线阅读
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职称材料
2
一种基于线粒体完全基因组的熵密度分布的脊椎动物系统发育树构建方法
周立前
《湘潭大学自然科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007
0
在线阅读
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职称材料
已选择
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引用分析
参考文献
引证文献
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