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陈山红心杉基因组DNA提取方法的比较与分析 被引量:9
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作者 伍艳芳 徐海宁 +2 位作者 肖复明 熊振宇 江香梅 《江西农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第3期517-521,527,共6页
采用尿素法、柠檬酸钠法、改良的CTAB法和SDS法4种方法提取陈山红心杉基因组DNA,并对提取效果进行比较和分析。结果表明,改良的CTAB法较适合陈山红心杉基因组DNA提取,其提取的DNA纯度高、质量好,具有典型的天然DNA分子的标准紫外吸收光... 采用尿素法、柠檬酸钠法、改良的CTAB法和SDS法4种方法提取陈山红心杉基因组DNA,并对提取效果进行比较和分析。结果表明,改良的CTAB法较适合陈山红心杉基因组DNA提取,其提取的DNA纯度高、质量好,具有典型的天然DNA分子的标准紫外吸收光谱特点,A_(260)/A_(280)比值在1.8左右,且凝胶检测条带整齐清晰,杂质少、无明显降解。而尿素法和柠檬酸钠法难以提取基因组DNA,SDS法因提取的DNA有蛋白质、多糖等杂质污染均不太适用陈山红心杉基因组DNA提取。酶切分析也证明,改良的CTAB法提取的DNA适用于进行后续分子生物学分析。采用改良的CTAB法能够提取得到陈山红心杉幼叶、老叶、嫩芽和幼茎的基因组DNA产率不同,分别为158.4μg/g、129.6μg/g、177.6μg/g和98.40μg/g。考虑到幼叶样品的采集要比嫩芽方便,因此,可以直接采用幼叶进行陈山红心杉基因组DNA提取。 展开更多
关键词 陈山红心杉 dna提取方法 改良的CTAB法 SDS法
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油棕基因组DNA 3种提取方法的比较研究 被引量:9
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作者 周丽霞 肖勇 +1 位作者 杨耀东 马子龙 《江西农业学报》 CAS 2013年第8期9-11,共3页
采用CTAB小样提取法、PVP法和SDS-CTAB改良法,分别从油棕嫩叶和老叶中提取基因组DNA,并通过紫外分光光度计、琼脂糖凝胶电泳和PCR反应进行检测。研究结果表明:用CTAB小样提取法提取的油棕嫩叶总DNA的质量最好,纯度最高;用其他2种方法提... 采用CTAB小样提取法、PVP法和SDS-CTAB改良法,分别从油棕嫩叶和老叶中提取基因组DNA,并通过紫外分光光度计、琼脂糖凝胶电泳和PCR反应进行检测。研究结果表明:用CTAB小样提取法提取的油棕嫩叶总DNA的质量最好,纯度最高;用其他2种方法提取的DNA的质量均较差。 展开更多
关键词 油棕 基因组dna 提取 CTAB小样提取法 PVP法 SDS-CTAB改良法
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4种滑叶铁线莲基因组DNA提取方法比较 被引量:7
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作者 胡祎晨 孙正海 +3 位作者 王锦 李世峰 辛培尧 范萱 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2011年第36期22215-22216,22363,共3页
[目的]对4种滑叶铁线莲基因组DNA提取方法进行比较研究,建立滑叶铁线莲最适DNA提取方法。[方法]以滑叶铁线莲叶片为材料,比较改良CTAB法Ⅰ、改良CTAB法Ⅱ、改良CTAB法Ⅲ、改良SDS法这4种基因组DNA提取法在提取DNA纯度、浓度和提取时间... [目的]对4种滑叶铁线莲基因组DNA提取方法进行比较研究,建立滑叶铁线莲最适DNA提取方法。[方法]以滑叶铁线莲叶片为材料,比较改良CTAB法Ⅰ、改良CTAB法Ⅱ、改良CTAB法Ⅲ、改良SDS法这4种基因组DNA提取法在提取DNA纯度、浓度和提取时间等方面的不同。[结果]4种方法都可提取滑叶铁线莲基因组DNA。改良CTAB法Ⅰ提取DNA纯度最高,但浓度最低且提取时间最长;改良SDS法提取DNA浓度最高,所需时间较短,但纯度较低;改良CTAB法Ⅲ提取所需时间最短。[结论]建立了铁线莲最适DNA提取方法,为运用分子生物学手段对其研究提供支持。 展开更多
关键词 滑叶铁线莲 基因组dna提取 改良CTAB法 改良SDS法
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利用不同方法从深加工牦牛肉产品中提取基因组DNA效果的比较 被引量:11
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作者 何建文 韩建林 罗玉柱 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第10期162-167,共6页
为了从深加工牦牛肉产品中获得片段较大、数量较多的基因组DNA,以用于分子追溯的检测,尝试并系统地比较了异硫氰酸胍法、酚-氯仿抽提法和试剂盒提取法的提取效果。通过定量分析、凝胶电泳和PCR片段大小梯度扩增等手段,对利用3种方法提... 为了从深加工牦牛肉产品中获得片段较大、数量较多的基因组DNA,以用于分子追溯的检测,尝试并系统地比较了异硫氰酸胍法、酚-氯仿抽提法和试剂盒提取法的提取效果。通过定量分析、凝胶电泳和PCR片段大小梯度扩增等手段,对利用3种方法提取的基因组DNA的数量和质量进行了比较。结果显示,利用酚-氯仿抽提法提取的基因组DNA质量不佳,异硫氰酸胍法和试剂盒提取法的提取效果相当,PCR可以扩增出730 bp左右的核外基因细胞色素b,而核内基因只能扩增出300bp左右的核基因DNA片段(内乳铁蛋白基因,271 bp;BoLA-DRB3基因,302 bp)。综合考虑提取时间、费用、数量和质量等各方面的因素,认为异硫氰酸胍法操作简便、快速、廉价、有效,是较好的从动物深加工肉产品中提取基因组DNA的方法。 展开更多
关键词 异硫氰酸胍法 酚-氯仿抽提法 试剂盒方法 深加工牦牛肉产品 基因组dna
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刺参基因组DNA提取的探讨 被引量:2
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作者 孙孝德 孙国华 +3 位作者 杨建敏 吉成龙 王卫军 宋志乐 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期149-153,共5页
以刺参为试验材料,分别以CTAB法、SDS法、Segama试剂盒法对刺参的触手、管足、体壁、纵肌、肠和呼吸树组织进行基因组DNA的提取,均得到了高质量的基因组DNA。Segama试剂盒提取DNA条带较其他两种方法清晰,杂质少且无降解,效果最佳。对比... 以刺参为试验材料,分别以CTAB法、SDS法、Segama试剂盒法对刺参的触手、管足、体壁、纵肌、肠和呼吸树组织进行基因组DNA的提取,均得到了高质量的基因组DNA。Segama试剂盒提取DNA条带较其他两种方法清晰,杂质少且无降解,效果最佳。对比6种不同的刺参组织,其中纵肌组织3种方法均获得高质量基因组DNA,为提取基因组DNA的首选组织。开发了利用刺参触手和管足活体取样提取基因组DNA的方法,得到了高质量的基因组DNA,这为刺参无损伤取样提供了数据支持,使得将来刺参家系建立过程中保证亲体的健康存活及减少试验样品取样所带来的损伤成为可能。 展开更多
关键词 刺参 基因组dna dna提取 无损伤取样 CTAB法 SDS法 Segama试剂盒法
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2种提取猪肝基因组DNA方法的比较 被引量:3
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作者 周春丽 刘华 李玉萍 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2009年第18期8355-8356,共2页
[目的]对2种猪肝基因组DNA提取方法,进行比较研究。[方法]分别采用试剂盒法和常规的氯仿/异戊醇抽提法,提取新鲜猪肝基因组DNA,并对其进行综合分析。[结果]试剂盒方法得到的DNA浓度较低,其OD260nm/OD280nm比值达到2.05,虽然蛋白质除的... [目的]对2种猪肝基因组DNA提取方法,进行比较研究。[方法]分别采用试剂盒法和常规的氯仿/异戊醇抽提法,提取新鲜猪肝基因组DNA,并对其进行综合分析。[结果]试剂盒方法得到的DNA浓度较低,其OD260nm/OD280nm比值达到2.05,虽然蛋白质除的较干净,但是含RNA较高;而氯仿/异戊醇抽提法得到的DNA浓度高,其OD260nm/OD280nm比值1.88,纯度较高,且成本低。[结论]氯仿/异戊醇法对猪肝基因组DNA提取效果优于试剂盒法。 展开更多
关键词 猪肝 基因组dna 氯仿/异戊醇抽提法 试剂盒法 比较
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高质量丝栗栲基因组DNA的提取方法 被引量:3
7
作者 伍艳芳 江香梅 +2 位作者 肖复明 熊振宇 邱凤英 《林业科技开发》 北大核心 2012年第5期82-85,共4页
为了促进丝栗栲分子生物学的研究,采用尿素法、柠檬酸钠法、改良CTAB法和SDS法4种方法提取丝栗栲叶片基因组DNA,并对提取效果进行了比较和分析。结果表明,改良CTAB法较适合丝栗栲基因组DNA提取,其提取的DNA产率高,凝胶检测条带整齐清晰... 为了促进丝栗栲分子生物学的研究,采用尿素法、柠檬酸钠法、改良CTAB法和SDS法4种方法提取丝栗栲叶片基因组DNA,并对提取效果进行了比较和分析。结果表明,改良CTAB法较适合丝栗栲基因组DNA提取,其提取的DNA产率高,凝胶检测条带整齐清晰,杂质少、无明显降解,OD260/OD280比值在1.8左右;而尿素法难以提取基因组DNA,SDS法提取的DNA得率较低,柠檬酸钠法有蛋白质、多糖等杂质污染均不太适用丝栗栲基因组DNA提取。采用改良CTAB法提取得到丝栗栲幼叶、老叶、嫩芽和幼茎基因组DNA,产率分别为177.3、167.1、242.0和156.7μg/g。酶切分析也证明,改良CTAB法提取的不同组织DNA适用于进行后续分子生物学研究。 展开更多
关键词 丝栗栲 dna提取方法 改良的CTAB法
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狗牙根基因组DNA提取方法的比较 被引量:6
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作者 周少云 黄春琼 刘国道 《湖南农业科学》 2009年第11期8-10,14,共4页
以狗牙根的嫩叶为材料,在传统CTAB法的基础上加以改良,建立了狗牙根基因组DNA的CTAB提取方法。得到的DNA经核酸蛋白质分析仪测得A260/A280值处于1.69~2.02之间、A260/A230集中处于1.82~2.08之间,经琼脂糖凝胶电泳检测各样品具有一条... 以狗牙根的嫩叶为材料,在传统CTAB法的基础上加以改良,建立了狗牙根基因组DNA的CTAB提取方法。得到的DNA经核酸蛋白质分析仪测得A260/A280值处于1.69~2.02之间、A260/A230集中处于1.82~2.08之间,经琼脂糖凝胶电泳检测各样品具有一条明亮主带并无拖尾现象,经ISSR-PCR检测出现清晰稳定的条带,说明改良CTAB法提取得到的DNA完整性好,纯度高,适用于分子标记等分子生物学的研究。 展开更多
关键词 狗牙根 基因组dna提取 改良CTAB法
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3种提取淡水涡虫基因组DNA方法比较
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作者 孙健 张合彩 +1 位作者 陈广文 刘德增 《河南师范大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期168-171,共4页
分别用试剂盒法、改良的CTAB法、改良的酚-氯仿抽提法提取活体涡虫和95%酒精固定的涡虫标本的基因组DNA.结果显示:试剂盒法提取的基因组DNA质量最好,主要表现在分子完整,几乎无降解,并且该方法所得DNA的产率也比另外两种方法的产率要高... 分别用试剂盒法、改良的CTAB法、改良的酚-氯仿抽提法提取活体涡虫和95%酒精固定的涡虫标本的基因组DNA.结果显示:试剂盒法提取的基因组DNA质量最好,主要表现在分子完整,几乎无降解,并且该方法所得DNA的产率也比另外两种方法的产率要高,试剂盒法是最适合涡虫基因组DNA制备的方法.相同起始物质量条件下,3种方法从活体涡虫中提取的DNA量和纯度均高于95%酒精固定的涡虫标本,但试剂盒法提取95%酒精固定半年以上的涡虫标本,所得DNA产率较高、质量较好,可满足PCR扩增等分子生物学实验的要求. 展开更多
关键词 淡水涡虫 dna提取 试剂盒法 改良CTAB法 改良酚-氯仿法
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蔺草基因组DNA提取方法的比较研究
10
作者 王忠华 李礼君 王焯毅 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第2期148-151,共4页
以16个蔺草品种实生苗和4个蔺草品种组培苗为材料,探讨了CTAB改良法与DNA试剂盒法对蔺草基因组DNA提取质量的影响。结果发现,对于同一品种而言,CTAB改良法提取获得的DNA A260nm和OD值远低于试剂盒提取法,前者的DNA浓度仅为0.65-4.90μg/... 以16个蔺草品种实生苗和4个蔺草品种组培苗为材料,探讨了CTAB改良法与DNA试剂盒法对蔺草基因组DNA提取质量的影响。结果发现,对于同一品种而言,CTAB改良法提取获得的DNA A260nm和OD值远低于试剂盒提取法,前者的DNA浓度仅为0.65-4.90μg/ml,而后者则为5.10-32.80μg/ml,后者为前者的1.6-21.2倍。这表明试剂盒提取法更适合于蔺草基因组DNA的提取。试验还发现提取材料对基因组DNA的质量有显著影响,蔺草组培苗优于实生苗。 展开更多
关键词 蔺草 基因组dna 提取 改良CTAB法 试剂盒提取法
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第三代测序细菌基因组DNA提取方法的比较 被引量:7
11
作者 穰杰 李莉 +4 位作者 唐琼 杨琦 何恋 丁学知 夏立秋 《湖南师范大学自然科学学报》 CAS 北大核心 2015年第6期14-20,共7页
为筛选有效提取细菌菌株总DNA的方法,分别采用SDS法、CTAB-SDS法、试剂盒法和改良试剂盒法对苏云金芽胞杆菌、粘细菌和放线菌进行总DNA的提取、电泳检测、NanoDrop 2000测定、PCR扩增.对放线菌和苏云金芽胞杆菌,用改良试剂盒法所提取的... 为筛选有效提取细菌菌株总DNA的方法,分别采用SDS法、CTAB-SDS法、试剂盒法和改良试剂盒法对苏云金芽胞杆菌、粘细菌和放线菌进行总DNA的提取、电泳检测、NanoDrop 2000测定、PCR扩增.对放线菌和苏云金芽胞杆菌,用改良试剂盒法所提取的总DNA纯度较高,电泳条带清晰,DNA主带位于23 kb,单位体积菌液所提取到的总DNA较SDS法和CTAB-SDS法高,能满足下游的PCR扩增等分子操作.对待测样品所做的质检报告也证实样品合格,可用于后续建库、测序.而粘细菌提取到的总DNA由于它们的OD260/230在2.0以下,没有达到第三代测序样品的要求.改良试剂盒法所提取到的总DNA大多数可以满足第三代测序技术样品制备的要求. 展开更多
关键词 第三代测序技术 dna提取方法 CTAB-SDS法 改良溶液型试剂盒法
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富含多糖的强旱生植物半日花基因组DNA提取方法 被引量:3
12
作者 白沙如拉 庞磊 +1 位作者 史树德 魏磊 《天津农业科学》 CAS 2014年第3期1-4,共4页
半日花(Helianthemum soongoricum)属强旱生植物,其组织富含多糖和多酚等次生代谢物质,采用常规CTAB和SDS等方法提取的半日花基因组DNA由于含有多糖等杂质,无法进行PCR扩增和限制性酶切等试验,为此,在CTAB法的基础上进行了改进。第1步... 半日花(Helianthemum soongoricum)属强旱生植物,其组织富含多糖和多酚等次生代谢物质,采用常规CTAB和SDS等方法提取的半日花基因组DNA由于含有多糖等杂质,无法进行PCR扩增和限制性酶切等试验,为此,在CTAB法的基础上进行了改进。第1步通过向植物组织CTAB提取液中添加高盐和乙醇来沉淀部分多糖,第2步将获得的DNA粗提液,经过CTAB分离溶液沉淀、NaCl溶解、乙醇沉淀等方法,可有效去除半日花组织中的残余多糖等杂质,提取DNA的质量和纯度经凝胶电泳条带清晰、无降解、无多糖等杂质。PCR扩增和限制性内切酶的结果表明,通过改进的方法所获得的DNA,可以进行PCR扩增试验,扩增条带清晰,基因组DNA能被限制性内切酶完全酶切,该方法为后续半日花分子生物学研究奠定了重要基础。 展开更多
关键词 强旱生植物 半日花 多糖 改进CTAB法
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脆木耳基因组DNA提取方法优化 被引量:2
13
作者 王艺琴 郭豪 +1 位作者 张素勤 耿广东 《中国食用菌》 2022年第4期48-52,共5页
木耳属子实体含有大量多糖、蛋白质和色素等物质,严重干扰基因组DNA(gDNA)的提取,普通方法难以提取脆木耳子实体的高质量gDNA。以脆木耳子实体为试材,利用4种方法提取gDNA,以期筛选出最佳的提取方法。结果表明,4种方法提取的脆木耳子实... 木耳属子实体含有大量多糖、蛋白质和色素等物质,严重干扰基因组DNA(gDNA)的提取,普通方法难以提取脆木耳子实体的高质量gDNA。以脆木耳子实体为试材,利用4种方法提取gDNA,以期筛选出最佳的提取方法。结果表明,4种方法提取的脆木耳子实体gDNA浓度及纯度各不相同。改良CTAB法提取的脆木耳子实体gDNA浓度和纯度最低;CTAB-free法提取的gDNA浓度较低,且有明显的蛋白污染;试剂盒法虽可提取出较高浓度的gDNA,但其纯度较低;试剂盒联合CTAB-free法可以有效提取出浓度和纯度都较高的gDNA。使用内参基因木耳多聚泛素(UBQ)引物对4种方法提取的g DNA进行PCR扩增,试剂盒联合CTAB-free法提取的g DNA可以扩增出清晰的目标条带,证明该方法提取的gDNA可用于后续分子生物学分析。 展开更多
关键词 脆木耳 子实体 基因组dna 提取方法 试剂盒联合CTAB-free法
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兴安落叶松DNA提取-试剂盒改良法 被引量:3
14
作者 王洪梅 李艳霞 +4 位作者 翁海龙 周显昌 康迎昆 王福德 王鑫 《安徽农业科学》 CAS 2012年第35期17029-17030,17041,共3页
[目的]寻找一种快速简便的兴安落叶松基因组DNA的提取方法。[方法]对DNA提取试剂盒进行改良,与原试剂盒法(离心柱)进行比较,并用琼脂糖凝胶电泳、蛋白核酸测定和ISSR-PCR对所提取的总DNA进行检测。[结果]试剂盒改良法提取的总DNA纯度和... [目的]寻找一种快速简便的兴安落叶松基因组DNA的提取方法。[方法]对DNA提取试剂盒进行改良,与原试剂盒法(离心柱)进行比较,并用琼脂糖凝胶电泳、蛋白核酸测定和ISSR-PCR对所提取的总DNA进行检测。[结果]试剂盒改良法提取的总DNA纯度和浓度较高,电泳显示其主条带较清晰,无降解现象,A260/A280值为1.75~1.84。[结论]改良后的DNA提取方法更适合兴安落叶松基因组DNA的提取。 展开更多
关键词 兴安落叶松 dna提取 基因组dna 提取试剂盒 改良法
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水牛全血基因组抽提方法优化 被引量:1
15
作者 陆杏蓉 庞春英 +3 位作者 邓廷贤 朱鹏 段安琴 梁贤威 《中国牛业科学》 2016年第2期28-31,共4页
[目的]通过比较三种提取水牛全血基因组DNA的方法,获得一种安全、高效、快速的DNA提取方法,为水牛基因功能的研究奠定基础。[方法]收集43头水牛抗凝血样,每份血样随机分为等量3份,每份血样2mL,分别使用试剂盒改良法、试剂盒说明书法及... [目的]通过比较三种提取水牛全血基因组DNA的方法,获得一种安全、高效、快速的DNA提取方法,为水牛基因功能的研究奠定基础。[方法]收集43头水牛抗凝血样,每份血样随机分为等量3份,每份血样2mL,分别使用试剂盒改良法、试剂盒说明书法及酚仿抽提法提取全血基因组DNA。比较分析三种方法提取的同一头牛三份血样DNA的含量、OD260/280值、琼脂糖凝胶电泳和基因扩增结果。[结果]三种方法提取DNA的含量由高到低依次为试剂盒改良法、酚仿抽提法、试剂盒说明书法,各组间差异显著(1376.72±127.54VS 1121.32±81.64VS 326.18±21.17,P<0.05)。三种方法提取DNA的OD-260/280值依次增加,试剂盒改良法与试剂盒说明书法OD260/280值差异不显著(1.85±0.0017 VS1.86±0.0021,P>0.05),与酚仿抽提法OD260/280值有显著差异(1.85±0.0017VS 1.88±0.0029,1.86±0.0021VS 1.88±0.0029,P<0.05)。三种方法提取DNA琼脂糖凝胶电泳结果显示,试剂盒改良法和试剂盒说明书法DNA条带清晰、光密度高,酚仿抽提法条带模糊有拖带现象。三种方法所提取的基因组PCR扩增stat5基因获得较清晰准确的条带,扩增效果良好。[结论]试剂盒改良法用于水牛全血基因组的提取比试剂盒说明书法和酚氯仿法更安全、高效、便捷。 展开更多
关键词 水牛血液 基因组抽提 试剂盒改良法 试剂盒说明书法 酚仿抽提法
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