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甘蓝型油菜BnTT3基因的表达与eQTL定位分析被引量：2: 1; 作者卢坤曲存民 +5 位作者李莎赵会彦王瑞徐新福梁颖李加纳《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第11期1758-1766,共9页; 类黄酮途径中, TT3编码的4-二氢黄铜醇还原酶是参与原花色素和花青素合成的关键酶。为了明确该基因可能的上游调控网络,利用黄籽母本 GH06和黑籽父本 ZY821构建的遗传图谱,以 BnTT3基因在高世代重组自交系群体中随机选取的94个株系花后4... 展开更多; 关键词甘蓝型油菜种子 TT3 重组自交系表达数量性状位点; 在线阅读下载PDF 职称材料

应用基因表达数量性状基因座定位(eQTL)研究PINK1表达调控被引量：2: 2; 作者殷冬梅陈颖 +5 位作者黄超兰杜青青吴娟娟许玲莉陆璐沈勤《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第2期140-146,共7页; Pink 1基因编码定位于线粒体上的丝/苏氨酸激酶(即PARK6),为常染色体隐性遗传性帕金森病(Parkinson's disease,PD)连锁的基因.该基因在遗传性和散发性PD的发病中起重要作用,但其发病机理尚未明确.本研究以近交系C57BL/6J(B6)和DBA/2... 展开更多; 关键词 PINK1 基因表达数量性状基因座帕金森病; 在线阅读下载PDF 职称材料

大豆叶绿素含量动态表达的QTL分析被引量：12: 3; 作者李广军李河南 +1 位作者程利国章元明《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第2期242-248,共7页; 叶绿素是光合作用中最重要的色素,与大豆籽粒产量密切相关。本研究采用溧水中子黄豆×南农493-1后代衍生的244个F2单株及筛选的150个SSR分子标记构建的连锁遗传图谱,在苗期至开花期测定F2衍生F2:3和F2:4家系生长正常单株的倒3复叶... 展开更多; 关键词大豆叶绿素含量 QTL 动态表达; 在线阅读下载PDF 职称材料

优质水稻品种越光(Koshihikari)中控制稻米淀粉RVA谱特征值的QTL分析被引量：14: 4; 作者张永生江玲 +4 位作者刘喜刘世家陈亮明翟虎渠万建民《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第2期137-144,共8页; 利用南京11×Koshihikari RIL群体在南京两年的种植结果,检测与稻米淀粉RVA谱特征值峰值黏度、最低黏度、最终黏度、崩解值、消减值、峰值时间和糊化温度相关加性和上位性效应QTL,并分析其表达稳定性。结果表明,7个稻米淀粉RVA谱特... 展开更多; 关键词稻米淀粉黏滞性谱数量性状基因座加性效应上位性表达稳定性; 在线阅读下载PDF 职称材料

整合玉米基因表达与遗传分析资料发掘耐渍性候选基因被引量：4: 5; 作者尤莉邱法展 +1 位作者张祖新刘瑞响《河北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第3期9-13,共5页; 对用cDNA microarray技术鉴定所得的玉米自交系Hz32(耐)与Mo17(敏)的根系在淹水胁迫早期响应的88个3倍差异表达ESTs进行电子定位,其中47条ESTs可分别排列到玉米10条染色体上;ESTs电子定位结果与玉米耐渍性QTLs图谱的整合发现,10条ESTs... 展开更多; 关键词表达序列标签(EST) 数量性状位点(QTL) 耐渍性基因表达; 在线阅读下载PDF 职称材料

EGR1基因与中国汉族人群阿尔茨海默病发病风险的关联研究: 6; 作者方新宇卢卫红 +6 位作者王慧珍倪建良张江涛蔡军李涛张登峰张晨《上海交通大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期153-159,共7页; 目的·探讨早期生长反应基因1(early growth response gene 1,EGR1)与中国汉族人群阿尔茨海默病(Alzheimer's disease,AD)发病风险的关联。方法·纳入2个独立样本共计715例AD患者和760例健康对照(包括来自华东地区的382例A... 展开更多; 关键词阿尔茨海默病基因多态性早期生长反应基因1 表达数量性状基因座差异表达; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名甘蓝型油菜BnTT3基因的表达与eQTL定位分析被引量：2: 1; 作者卢坤曲存民李莎赵会彦王瑞徐新福梁颖李加纳; 机构西南大学农学与生物科技学院重庆市油菜工程技术研究中心; 出处《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第11期1758-1766,共9页; 基金国家自然科学基金项目(31401412 U1302266) +6 种基金 2362015xk05)资助; 文摘类黄酮途径中, TT3编码的4-二氢黄铜醇还原酶是参与原花色素和花青素合成的关键酶。为了明确该基因可能的上游调控网络,利用黄籽母本 GH06和黑籽父本 ZY821构建的遗传图谱,以 BnTT3基因在高世代重组自交系群体中随机选取的94个株系花后40 d种子的表达量作为性状,采用复合区间作图法进行eQTL分析。结果共检测到5个表达量相关的eQTL,分别位于A03、A08、A09和C01染色体,单个eQTL解释表型变异的5.22%~24.05%。A09染色体上存在2个主效 eQTL,单个 eQTL 分别解释24.05%和16.55%的表型变异,分别位于标记 KS10260~KBrB019I24.15和B055B21-5~KS30880之间,微效eQTL分布于A03、A08和C01染色体上。A09染色体上的2个主效eQTL区间（包含200 kb侧翼序列）与拟南芥、白菜、甘蓝和芸薹族近缘物种基因组同源区段具有很好的共线性关系。基因注释结果表明检测到的eQTL均为trans-QTL,2个主效eQTL区段共包含78个基因,包括MYB51、MYB52和bZIP5转录因子,可能为 BnTT3基因的上游直接调控因子,对这些基因功能的深入分析将有助于阐明甘蓝型油菜黄籽性状形成的分子调控机制,为黄籽候选基因的克隆筛选奠定基础。; 关键词甘蓝型油菜种子 TT3 重组自交系表达数量性状位点; Keywords Brassica napus L. Seeds TRANSPARENT TESTA3 Recombinant inbred lines （RILs） expression quantitative trait locus （eqtl）; 分类号 S565.4 [农业科学—作物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名应用基因表达数量性状基因座定位(eQTL)研究PINK1表达调控被引量：2: 2; 作者殷冬梅陈颖黄超兰杜青青吴娟娟许玲莉陆璐沈勤; 机构南通大学医学院生化教研室南通大学组织学与胚胎学教研室; 出处《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第2期140-146,共7页; 基金国家自然科学基金资助项目(No.30770666 No.30771200 +1 种基金 No.30971591) 江苏高校优势学科建设工程资助项目~~; 文摘 Pink 1基因编码定位于线粒体上的丝/苏氨酸激酶(即PARK6),为常染色体隐性遗传性帕金森病(Parkinson's disease,PD)连锁的基因.该基因在遗传性和散发性PD的发病中起重要作用,但其发病机理尚未明确.本研究以近交系C57BL/6J(B6)和DBA/2J(D2)小鼠制作MPTP诱导的PD鼠为模型,借助基因表达数量性状基因座(eQTL),结合分子生物学方法,分析Pink1的表达调控.结果显示,Pink 1基因在PD模型组中表达显著升高.区间连锁分析检测显示,引起Pink 1基因表达水平差异的染色体区域,定位于4号染色体上,距Pink 1基因自身5 Mb范围之类,属于顺式调节eQTL.Pearson相关分析表明,在BXD基因重组近交系(recombinant inbred,RI)小鼠脑中,Camk2n等30个基因的表达与Pink 1基因高度相关,相互间可能存在一定的协同作用.Pink 1基因在行使特定生物学功能时,很可能协同这些基因一起发挥相应的作用,这部分基因是深入研究Pink 1基因在PD发病中分子机制的重要靶点.; 关键词 PINK1 基因表达数量性状基因座帕金森病; Keywords Pink1 expression quantitative trait locus（eqtl） Parkinson＇s disease（PD）; 分类号 R742.5 [医药卫生—神经病学与精神病学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名大豆叶绿素含量动态表达的QTL分析被引量：12: 3; 作者李广军李河南程利国章元明; 机构南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室/国家大豆改良中心临沂师范学院; 出处《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第2期242-248,共7页; 基金国家自然科学基金项目(30470998) 教育部新世纪优秀人才支持计划项目(NECT-05-0489) +2 种基金教育部高等学校学科创新引智计划(111计划)(B08025)资助; 文摘叶绿素是光合作用中最重要的色素,与大豆籽粒产量密切相关。本研究采用溧水中子黄豆×南农493-1后代衍生的244个F2单株及筛选的150个SSR分子标记构建的连锁遗传图谱,在苗期至开花期测定F2衍生F2:3和F2:4家系生长正常单株的倒3复叶功能叶(非离体)的叶绿素含量13次,通过Windows QTL Cartographer v2.5软件包的复合区间法,动态定位了大豆叶绿素含量的QTL。结果表明,不同时间点共检测到20个QTL,其中,不同发育阶段间、年份间和地点间共同的QTL较少,不同时间点上的QTL差异较大,重复出现在N、D1a、F和K连锁群的QTL有3～4次。这些结果为叶绿素含量的遗传剖析和标记辅助育种提供理论依据。; 关键词大豆叶绿素含量 QTL 动态表达; Keywords Soybean Chlorophyll content quantitative trait locus Dynamic expression; 分类号 S565.1 [农业科学—作物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名优质水稻品种越光(Koshihikari)中控制稻米淀粉RVA谱特征值的QTL分析被引量：14: 4; 作者张永生江玲刘喜刘世家陈亮明翟虎渠万建民; 机构南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室/江苏省植物基因工程技术研究中心中国农业科学院作物科学研究所; 出处《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第2期137-144,共8页; 基金国家973计划前期预研资助项目(2008CB117004) 国家863计划资助项目(2006AA10Z1A5 +3 种基金 2009AA101101) BE2009301-3); 文摘利用南京11×Koshihikari RIL群体在南京两年的种植结果,检测与稻米淀粉RVA谱特征值峰值黏度、最低黏度、最终黏度、崩解值、消减值、峰值时间和糊化温度相关加性和上位性效应QTL,并分析其表达稳定性。结果表明,7个稻米淀粉RVA谱特征值在两年中均呈连续分布,且存在超亲遗传现象。共检测到8个具有加性效应的QTL与稻米6项淀粉RVA谱特征值有关,两年中能重复出现的QTL有6个,即qTPV-6、qFPV-6、qBDV-6、qSBV-6、qPKT-6和qPT-6,分别控制最低黏度、最终黏度、崩解值、消减值、峰值时间和糊化温度,两年的平均贡献率分别为46.4%、60.3%、31.1%、71.9%、38.5%和12.4%,而qSBV-8和qPT-5仅在1年中被检测到,环境稳定性差。此外,还检测到5对影响稻米淀粉RVA谱特征值的QTL具有上位性效应,互作既发生在相同染色体上也发生在不同染色体之间,但贡献率较小,且受环境的影响较小。控制稻米淀粉RVA谱特征值的稳定、主效QTL,可为Koshihikari中稻米优良蒸煮食味品质相关基因的育种利用提供基础。; 关键词稻米淀粉黏滞性谱数量性状基因座加性效应上位性表达稳定性; Keywords rice starch viscosity profile quantitative trait locus additive effect epistatic effect expression stability; 分类号 S511 [农业科学—作物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名整合玉米基因表达与遗传分析资料发掘耐渍性候选基因被引量：4: 5; 作者尤莉邱法展张祖新刘瑞响; 机构长江大学生命科学学院华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室河北农业大学农学院; 出处《河北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第3期9-13,共5页; 基金国家自然科学基金项目资助(30571171); 文摘对用cDNA microarray技术鉴定所得的玉米自交系Hz32(耐)与Mo17(敏)的根系在淹水胁迫早期响应的88个3倍差异表达ESTs进行电子定位,其中47条ESTs可分别排列到玉米10条染色体上;ESTs电子定位结果与玉米耐渍性QTLs图谱的整合发现,10条ESTs落入耐渍性QTLs区段内,并分别位于第1、2、4、5、9和10号染色体上。对这些ESTs的功能分析,推测其中3个基因为玉米耐渍性重要候选基因。整合基因差异表达与QTLs定位资料对筛选和发掘重要数量性状的侯选基因具有一定的指导作用。; 关键词表达序列标签(EST) 数量性状位点(QTL) 耐渍性基因表达; Keywords expression sequence tags （ESTs） quantitative trait locus （QTL） waterlogging tolerance; 分类号 Q943 [生物学—植物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名EGR1基因与中国汉族人群阿尔茨海默病发病风险的关联研究: 6; 作者方新宇卢卫红王慧珍倪建良张江涛蔡军李涛张登峰张晨; 机构上海交通大学医学院附属精神卫生中心生化研究室中国科学院昆明动物研究所浙江省立同德医院精神卫生科四川大学华西医院心理卫生中心; 出处《上海交通大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期153-159,共7页; 基金国家自然科学基金(81471358 81771450) +1 种基金上海市卫生和计划生育委员会科研课题重点项目(201540029)~~; 文摘目的·探讨早期生长反应基因1(early growth response gene 1,EGR1)与中国汉族人群阿尔茨海默病(Alzheimer's disease,AD)发病风险的关联。方法·纳入2个独立样本共计715例AD患者和760例健康对照(包括来自华东地区的382例AD患者和426例健康对照以及来自西南地区的333例AD患者和334例健康对照)。采取外周静脉血并提取DNA,利用SNaPshot技术对单核苷酸多态性位点rs11743810进行分型。结合公共数据库探索EGR1基因在AD患者和健康对照的大脑中是否存在差异表达;并通过STRING数据库构建蛋白质–蛋白质交互作用(protein-protein interaction,PPI)网络图,以明确EGR1与AD高风险基因之间是否存在联系;采用表达数量性状基因座(expression quantitative trait loci,eQTL)关联分析探讨rs11743810多态性与AD易感性的关系。结果·差异表达分析发现,AD患者与健康对照脑内EGR1基因在颞叶皮层表达存在显著差异(校正前|log2FC|=0.780,P=0.000;FDR校正后P=0.001)。PPI结果也表明EGR1蛋白与AD高风险基因表达的蛋白如淀粉样蛋白前体(amyloid precursor protein,APP)以及载脂蛋白J(clusterin,CLU)之间存在交互作用。然而,eQTL分析结果显示,EGR1基因单核苷酸多态性rs11743810不同基因型在10个脑区的表达无明显差异(校正后P>0.05)。外周血DNA样本分析结果也提示AD组和健康对照组的rs11743810位点基因型和等位基因分布频率的差异均无统计学意义(P>0.05)。结论·rs11743810多态性位点可能不是中国汉族人群AD的主要致病位点。; 关键词阿尔茨海默病基因多态性早期生长反应基因1 表达数量性状基因座差异表达; Keywords Alzheimer's disease gene polymorphism early growth response gene 1 (EGR1) expression quantitative trait loci (eqtl) differential expression; 分类号 R741 [医药卫生—神经病学与精神病学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	甘蓝型油菜BnTT3基因的表达与eQTL定位分析	卢坤曲存民李莎赵会彦王瑞徐新福梁颖李加纳	《作物学报》 CAS CSCD 北大核心	2015	2	在线阅读下载PDF 职称材料
2	应用基因表达数量性状基因座定位(eQTL)研究PINK1表达调控	殷冬梅陈颖黄超兰杜青青吴娟娟许玲莉陆璐沈勤	《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心	2012	2	在线阅读下载PDF 职称材料
3	大豆叶绿素含量动态表达的QTL分析	李广军李河南程利国章元明	《作物学报》 CAS CSCD 北大核心	2010	12	在线阅读下载PDF 职称材料
4	优质水稻品种越光(Koshihikari)中控制稻米淀粉RVA谱特征值的QTL分析	张永生江玲刘喜刘世家陈亮明翟虎渠万建民	《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心	2010	14	在线阅读下载PDF 职称材料
5	整合玉米基因表达与遗传分析资料发掘耐渍性候选基因	尤莉邱法展张祖新刘瑞响	《河北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心	2007	4	在线阅读下载PDF 职称材料
6	EGR1基因与中国汉族人群阿尔茨海默病发病风险的关联研究	方新宇卢卫红王慧珍倪建良张江涛蔡军李涛张登峰张晨	《上海交通大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心	2019	0	在线阅读下载PDF 职称材料