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水牛SFRP 1基因序列分析、真核表达载体构建及组织表达分析
1
作者
黄丽清
段安琴
+2 位作者
郑海英
杨春艳
尚江华
《中国畜牧兽医》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第5期1807-1818,共12页
【目的】获取水牛分泌型卷曲相关蛋白1(SFRP1)基因CDS区序列,并预测其编码蛋白的结构功能,构建SFRP 1基因真核表达载体,检测SFRP 1基因在水牛不同组织中的表达情况,为探索SFRP 1基因在水牛生长发育中的作用奠定基础。【方法】以水牛卵...
【目的】获取水牛分泌型卷曲相关蛋白1(SFRP1)基因CDS区序列,并预测其编码蛋白的结构功能,构建SFRP 1基因真核表达载体,检测SFRP 1基因在水牛不同组织中的表达情况,为探索SFRP 1基因在水牛生长发育中的作用奠定基础。【方法】以水牛卵巢组织cDNA为模板,通过RT-PCR对SFRP 1基因CDS区序列进行扩增并测序,利用生物信息学在线分析软件对水牛SFRP 1基因与不同物种进行比对和系统进化树构建,并预测SFRP1蛋白理化性质、信号肽、跨膜结构等。将获得的目的基因连接至pCMV-HAhyPBase-mcheery载体并转染至水牛颗粒细胞,检测转染后荧光和基因表达情况。通过实时荧光定量PCR检测水牛不同组织中SFRP 1基因表达情况。【结果】水牛SFRP 1基因CDS区长927 bp,共编码308个氨基酸。多重序列比对结果显示,水牛SFRP 1基因氨基酸序列与黄牛、牦牛、山羊、虎鲸、黑猩猩、北极狐、猫、人、小鼠的相似性分别为100%、100%、99.65%、98.58%、98.23%、98.23%、98.58%、98.23%、96.45%,存在CRD_FZ、NTR_like和DUF3367结构域。水牛SFRP 1基因核苷酸序列与黄牛、绵羊、山羊、牦牛、野牛、马鹿、野骆驼、猪、人的相似性分别为97.3%、95.9%、95.8%、94.5%、94.2%、93.7%、80.4%、78.5%和77.3%。系统进化树结果显示,水牛与黄牛、牦牛、野牛聚为一支。生物信息学分析结果显示,SFRP1蛋白呈碱性,为不稳定蛋白;第1—15位氨基酸处存在信号肽,为分泌型蛋白,存在跨膜结构,主要定位于细胞外;存在21个磷酸化位点和8个O-糖基化修饰位点。二级结构主要由α-螺旋、延伸链和无规则卷曲构成;水牛、黄牛、人的SFRP1蛋白三级结构高度相似。成功构建pCMV-mcheery-SFRP1真核表达载体并转染水牛颗粒细胞,转染72 h后pCMV-mcheery-SFRP1重组质粒组细胞内SFRP 1基因表达量极显著高于对照组(P<0.01)。实时荧光定量PCR结果显示,SFRP 1基因在水牛不同组织中均有表达,且在脾脏中表达量最高,极显著高于其他组织(P<0.01)。【结论】SFRP 1基因在不同物种以及遗传进化过程中具有高保守性,在水牛不同组织中广泛表达。研究结果为今后探究SFRP 1基因在水牛生长发育中的功能及分子机制奠定基础。
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关键词
水牛
SFRP
1
基因
序列分析
真核表达载体
组织表达
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职称材料
重组质粒pEGFP-C1-LRIG1的构建及其在SHG44细胞中的稳定表达
2
作者
方园
屈建强
+3 位作者
张熙
周乐
孙梦瑶
娄淼
《西安交通大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第4期541-544,共4页
目的构建含目的基因多亮氨酸重复区免疫球蛋白样区1(LRIG1)的重组质粒pEGFP-C1-LRIG1,为胶质瘤等多种上皮源性肿瘤的分子治疗奠定基础。方法采用RT-PCR方法,从人全血总RNA中,扩增出3 282bp的LRIG1cDNA片段,再用XhoⅠ和ClaⅠ双酶切后,定...
目的构建含目的基因多亮氨酸重复区免疫球蛋白样区1(LRIG1)的重组质粒pEGFP-C1-LRIG1,为胶质瘤等多种上皮源性肿瘤的分子治疗奠定基础。方法采用RT-PCR方法,从人全血总RNA中,扩增出3 282bp的LRIG1cDNA片段,再用XhoⅠ和ClaⅠ双酶切后,定向克隆到真核细胞表达载体pEGFP-C1中,用限制性内切酶酶切分析和DNA序列分析鉴定重组质粒;免疫细胞化学法检测LRIG1基因的表达情况。结果人LRIG1基因的cDNA已克隆到真核细胞表达载体pEGFP-C1质粒中;经脂质体转染SHG44细胞后,G418进行筛选,可见转染细胞胞膜上有大量LRIG1蛋白表达。结论成功构建了pEGFP-C1-LRIG1的真核表达载体,为研究LRIG1基因在胶质瘤等多种上皮源性肿瘤中的作用和其治疗奠定一定的实验基础。
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关键词
基因克隆
真核表达载体pEGFP-C
1
重组质粒
胶质瘤
多亮氨酸重复区免疫球蛋白样区
1
(LRIG
1
基因)
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职称材料
脂质体包裹人促甲状腺激素受体胞外段基因真核表达质粒的构建
3
作者
杨于力
罗清礼
吕红彬
《国际眼科杂志》
CAS
2014年第12期2151-2154,共4页
目的:构建阳离子脂质体包裹的人促甲状腺激素受体胞外段基因真核表达质粒。方法:PCR扩增穿梭质粒PHMCMVTSHR289目的基因并连接于真核表达质粒pcD NA3.1+上,重组质粒pcD NA3.1+/TSHR289采用酶切及测序法鉴定。阳离子脂质体包裹重组质粒pc...
目的:构建阳离子脂质体包裹的人促甲状腺激素受体胞外段基因真核表达质粒。方法:PCR扩增穿梭质粒PHMCMVTSHR289目的基因并连接于真核表达质粒pcD NA3.1+上,重组质粒pcD NA3.1+/TSHR289采用酶切及测序法鉴定。阳离子脂质体包裹重组质粒pcD NA3.1+/TSHR289。结果:重组质粒pcD NA3.1+/TSHR289用Hind III酶切后产物经0.8%琼脂糖凝胶电泳检测显示出现512bp条带。正向测序发现AAC突变为AAT,为同义突变。反向测序发现GCG突变为GCT,亦为同义突变。阳离子脂质体与重组质粒的体积质量比例为3∶1。结论:酶切及测序鉴定重组质粒pcD NA3.1+/TSHR289构建成功。
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关键词
人促甲状腺激素受体胞外段基因
穿梭质粒PHMCMVTSHR289
真核表达质粒pcDNA3
.
1
+
重组质粒pcDNA3
.
1
+/TSHR289
阳离子脂质体
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职称材料
题名
水牛SFRP 1基因序列分析、真核表达载体构建及组织表达分析
1
作者
黄丽清
段安琴
郑海英
杨春艳
尚江华
机构
广西水牛研究所
农业农村部水牛遗传繁育技术重点实验室
出处
《中国畜牧兽医》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第5期1807-1818,共12页
基金
广西科技重大专项(桂科AA22068099-1)
广西自然科学基金(2021GXNSFAA196021)
国家现代农业产业技术体系广西奶水牛产业创新团队(nycytxgxcxtd-2021-21-01)。
文摘
【目的】获取水牛分泌型卷曲相关蛋白1(SFRP1)基因CDS区序列,并预测其编码蛋白的结构功能,构建SFRP 1基因真核表达载体,检测SFRP 1基因在水牛不同组织中的表达情况,为探索SFRP 1基因在水牛生长发育中的作用奠定基础。【方法】以水牛卵巢组织cDNA为模板,通过RT-PCR对SFRP 1基因CDS区序列进行扩增并测序,利用生物信息学在线分析软件对水牛SFRP 1基因与不同物种进行比对和系统进化树构建,并预测SFRP1蛋白理化性质、信号肽、跨膜结构等。将获得的目的基因连接至pCMV-HAhyPBase-mcheery载体并转染至水牛颗粒细胞,检测转染后荧光和基因表达情况。通过实时荧光定量PCR检测水牛不同组织中SFRP 1基因表达情况。【结果】水牛SFRP 1基因CDS区长927 bp,共编码308个氨基酸。多重序列比对结果显示,水牛SFRP 1基因氨基酸序列与黄牛、牦牛、山羊、虎鲸、黑猩猩、北极狐、猫、人、小鼠的相似性分别为100%、100%、99.65%、98.58%、98.23%、98.23%、98.58%、98.23%、96.45%,存在CRD_FZ、NTR_like和DUF3367结构域。水牛SFRP 1基因核苷酸序列与黄牛、绵羊、山羊、牦牛、野牛、马鹿、野骆驼、猪、人的相似性分别为97.3%、95.9%、95.8%、94.5%、94.2%、93.7%、80.4%、78.5%和77.3%。系统进化树结果显示,水牛与黄牛、牦牛、野牛聚为一支。生物信息学分析结果显示,SFRP1蛋白呈碱性,为不稳定蛋白;第1—15位氨基酸处存在信号肽,为分泌型蛋白,存在跨膜结构,主要定位于细胞外;存在21个磷酸化位点和8个O-糖基化修饰位点。二级结构主要由α-螺旋、延伸链和无规则卷曲构成;水牛、黄牛、人的SFRP1蛋白三级结构高度相似。成功构建pCMV-mcheery-SFRP1真核表达载体并转染水牛颗粒细胞,转染72 h后pCMV-mcheery-SFRP1重组质粒组细胞内SFRP 1基因表达量极显著高于对照组(P<0.01)。实时荧光定量PCR结果显示,SFRP 1基因在水牛不同组织中均有表达,且在脾脏中表达量最高,极显著高于其他组织(P<0.01)。【结论】SFRP 1基因在不同物种以及遗传进化过程中具有高保守性,在水牛不同组织中广泛表达。研究结果为今后探究SFRP 1基因在水牛生长发育中的功能及分子机制奠定基础。
关键词
水牛
SFRP
1
基因
序列分析
真核表达载体
组织表达
Keywords
buffalo
SFRP
1
gene
sequence analysis
eukaryotic
expression
vector
tissue
expression
分类号
S823.83 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
重组质粒pEGFP-C1-LRIG1的构建及其在SHG44细胞中的稳定表达
2
作者
方园
屈建强
张熙
周乐
孙梦瑶
娄淼
机构
西安交通大学医学院第二附属医院神经外科
西安市中心医院神经外科
出处
《西安交通大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第4期541-544,共4页
基金
陕西省科技计划项目(No.2009K12-02)~~
文摘
目的构建含目的基因多亮氨酸重复区免疫球蛋白样区1(LRIG1)的重组质粒pEGFP-C1-LRIG1,为胶质瘤等多种上皮源性肿瘤的分子治疗奠定基础。方法采用RT-PCR方法,从人全血总RNA中,扩增出3 282bp的LRIG1cDNA片段,再用XhoⅠ和ClaⅠ双酶切后,定向克隆到真核细胞表达载体pEGFP-C1中,用限制性内切酶酶切分析和DNA序列分析鉴定重组质粒;免疫细胞化学法检测LRIG1基因的表达情况。结果人LRIG1基因的cDNA已克隆到真核细胞表达载体pEGFP-C1质粒中;经脂质体转染SHG44细胞后,G418进行筛选,可见转染细胞胞膜上有大量LRIG1蛋白表达。结论成功构建了pEGFP-C1-LRIG1的真核表达载体,为研究LRIG1基因在胶质瘤等多种上皮源性肿瘤中的作用和其治疗奠定一定的实验基础。
关键词
基因克隆
真核表达载体pEGFP-C
1
重组质粒
胶质瘤
多亮氨酸重复区免疫球蛋白样区
1
(LRIG
1
基因)
Keywords
gene cloning
eukaryotic
expression
vector
of pEGFP-C1
recombinant plasmid
glioma
lecocine-rich repeats and immunoglobulin-like domain
1
(LRIG
1
)
分类号
R739.41 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
脂质体包裹人促甲状腺激素受体胞外段基因真核表达质粒的构建
3
作者
杨于力
罗清礼
吕红彬
机构
第三军医大学西南医院西南眼科医院
四川大学华西医院眼科
泸州医学院附属医院眼科
出处
《国际眼科杂志》
CAS
2014年第12期2151-2154,共4页
文摘
目的:构建阳离子脂质体包裹的人促甲状腺激素受体胞外段基因真核表达质粒。方法:PCR扩增穿梭质粒PHMCMVTSHR289目的基因并连接于真核表达质粒pcD NA3.1+上,重组质粒pcD NA3.1+/TSHR289采用酶切及测序法鉴定。阳离子脂质体包裹重组质粒pcD NA3.1+/TSHR289。结果:重组质粒pcD NA3.1+/TSHR289用Hind III酶切后产物经0.8%琼脂糖凝胶电泳检测显示出现512bp条带。正向测序发现AAC突变为AAT,为同义突变。反向测序发现GCG突变为GCT,亦为同义突变。阳离子脂质体与重组质粒的体积质量比例为3∶1。结论:酶切及测序鉴定重组质粒pcD NA3.1+/TSHR289构建成功。
关键词
人促甲状腺激素受体胞外段基因
穿梭质粒PHMCMVTSHR289
真核表达质粒pcDNA3
.
1
+
重组质粒pcDNA3
.
1
+/TSHR289
阳离子脂质体
Keywords
human thyrotropin receptor extracellular domain gene
cationic liposomes
shuttle
vector
PHMCMVTSHR289
eukaryotic
expression
plasmid pcDNA3. 1 + recombination plasmid pcDNA3. 1+/TSHR289
分类号
R346 [医药卫生—基础医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
水牛SFRP 1基因序列分析、真核表达载体构建及组织表达分析
黄丽清
段安琴
郑海英
杨春艳
尚江华
《中国畜牧兽医》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
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职称材料
2
重组质粒pEGFP-C1-LRIG1的构建及其在SHG44细胞中的稳定表达
方园
屈建强
张熙
周乐
孙梦瑶
娄淼
《西安交通大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2013
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
脂质体包裹人促甲状腺激素受体胞外段基因真核表达质粒的构建
杨于力
罗清礼
吕红彬
《国际眼科杂志》
CAS
2014
0
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职称材料
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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