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LDL-R基因多态性与丙型肝炎易感性的相关性分析
1
作者
张青杨
金丹宁
+2 位作者
金国江
康辉
尚红
《中国医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第12期1109-1113,共5页
目的探讨低密度脂蛋白受体(LDL-R)基因rs688 C/T、rs5925 C/T单核苷酸多态性(SNP)与丙型肝炎易感性之间的相关性。方法采用聚合酶链式反应(PCR)结合高分辨率熔解曲线(HRM-PCR)的方法,对179例丙型肝炎病毒(HCV)感染者和178名体检健康者...
目的探讨低密度脂蛋白受体(LDL-R)基因rs688 C/T、rs5925 C/T单核苷酸多态性(SNP)与丙型肝炎易感性之间的相关性。方法采用聚合酶链式反应(PCR)结合高分辨率熔解曲线(HRM-PCR)的方法,对179例丙型肝炎病毒(HCV)感染者和178名体检健康者或无病毒性肝炎史的其他疾病患者基因rs688和rs5929两个位点的单核苷酸多态性进行检测。结果在HCV感染组和未感染HCV对照组之间,LDL-R SNP中rs688和rs5925分布差异无统计学意义(P>0.05)。结论 rs688和rs5925这两个多态性位点可能与丙型肝炎感染无相关性。
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关键词
低密度脂蛋白受体
基因多态性
高分辨率熔解曲线
聚合酶链式反应
丙型肝炎
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职称材料
人杀菌/渗透增强蛋白N端功能片段基因突变文库的构建和鉴定
2
作者
李晶琴
孔庆利
安云庆
《首都医科大学学报》
CAS
北大核心
2017年第6期903-910,共8页
目的为提高杀菌/渗透性增强蛋白N端功能片段BPI_(23)对内毒素(lipopolysaccharides,LPS)的亲和性,通过易错聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)和DNA改组技术,对其编码序列BPI_(600)进行突变,在大肠杆菌XL10-Gold中构建BPI_(...
目的为提高杀菌/渗透性增强蛋白N端功能片段BPI_(23)对内毒素(lipopolysaccharides,LPS)的亲和性,通过易错聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)和DNA改组技术,对其编码序列BPI_(600)进行突变,在大肠杆菌XL10-Gold中构建BPI_(600)基因突变体库。方法通过控制Mg2+和Mn2+的浓度进行易错PCR,获得BPI_(600)随机突变基因片段,经测序和基因比对,确定BPI_(600)的随机突变率。再对易错PCR产物进行DNA改组,将改组产物克隆至pYD1载体中,转化大肠杆菌XL10-Gold,从Amp抗性(LuriaBertani,LB)固体培养平板上任选10个单菌落,增菌后提取质粒,得到pYD1-shuffled BPI_(600)重组质粒,将质粒进行HindⅢ/XhoⅠ酶切鉴定,取5个阳性质粒进行DNA测序,通过基因和氨基酸比对鉴定突变情况。结果测序和基因比对显示,BPI_(600)经易错PCR所获突变文库的随机突变率达2.3%;改组后重组质粒的酶切结果表明,在随机选择的10个菌落所提质粒中,有6个含BPI_(600),表明构建了重组质粒pYD1-shuffled BPI_(600);在5个阳性质粒中,有4个重组质粒的BPI_(23)编码序列分别发生了6、9、11和14个碱基突变;1个不仅有10个碱基突变,还存在1个碱基的缺失。氨基酸比对表明,有2个质粒(分别有6和14个碱基突变)具有正确的读码框,能够翻译完整的蛋白质,各有4或14个氨基酸突变。3个质粒因含终止密码子而不能表达完整目的蛋白。结论成功构建pYD1-shuffled BPI_(600)重组质粒,获得库容量为2×105的突变文库,为高内毒素亲和力突变体的筛选奠定了基础。
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关键词
人杀菌
渗透增强蛋白
定向进化
易错
p
c
r
DNA改组
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职称材料
题名
LDL-R基因多态性与丙型肝炎易感性的相关性分析
1
作者
张青杨
金丹宁
金国江
康辉
尚红
机构
中国医科大学附属第一医院检验科
出处
《中国医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第12期1109-1113,共5页
基金
教育部高等学校博士学科点专项科研基金(20112104110001)
文摘
目的探讨低密度脂蛋白受体(LDL-R)基因rs688 C/T、rs5925 C/T单核苷酸多态性(SNP)与丙型肝炎易感性之间的相关性。方法采用聚合酶链式反应(PCR)结合高分辨率熔解曲线(HRM-PCR)的方法,对179例丙型肝炎病毒(HCV)感染者和178名体检健康者或无病毒性肝炎史的其他疾病患者基因rs688和rs5929两个位点的单核苷酸多态性进行检测。结果在HCV感染组和未感染HCV对照组之间,LDL-R SNP中rs688和rs5925分布差异无统计学意义(P>0.05)。结论 rs688和rs5925这两个多态性位点可能与丙型肝炎感染无相关性。
关键词
低密度脂蛋白受体
基因多态性
高分辨率熔解曲线
聚合酶链式反应
丙型肝炎
Keywords
LDL-
r
single nu
c
leotide
p
olymo
r
p
hism
high
r
esolution melt
polymerase
chain
reaction
he
p
atitis
c
分类号
R512.6 [医药卫生—内科学]
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职称材料
题名
人杀菌/渗透增强蛋白N端功能片段基因突变文库的构建和鉴定
2
作者
李晶琴
孔庆利
安云庆
机构
首都医科大学燕京医学院医学检验学系
首都医科大学基础医学院免疫学系
出处
《首都医科大学学报》
CAS
北大核心
2017年第6期903-910,共8页
文摘
目的为提高杀菌/渗透性增强蛋白N端功能片段BPI_(23)对内毒素(lipopolysaccharides,LPS)的亲和性,通过易错聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)和DNA改组技术,对其编码序列BPI_(600)进行突变,在大肠杆菌XL10-Gold中构建BPI_(600)基因突变体库。方法通过控制Mg2+和Mn2+的浓度进行易错PCR,获得BPI_(600)随机突变基因片段,经测序和基因比对,确定BPI_(600)的随机突变率。再对易错PCR产物进行DNA改组,将改组产物克隆至pYD1载体中,转化大肠杆菌XL10-Gold,从Amp抗性(LuriaBertani,LB)固体培养平板上任选10个单菌落,增菌后提取质粒,得到pYD1-shuffled BPI_(600)重组质粒,将质粒进行HindⅢ/XhoⅠ酶切鉴定,取5个阳性质粒进行DNA测序,通过基因和氨基酸比对鉴定突变情况。结果测序和基因比对显示,BPI_(600)经易错PCR所获突变文库的随机突变率达2.3%;改组后重组质粒的酶切结果表明,在随机选择的10个菌落所提质粒中,有6个含BPI_(600),表明构建了重组质粒pYD1-shuffled BPI_(600);在5个阳性质粒中,有4个重组质粒的BPI_(23)编码序列分别发生了6、9、11和14个碱基突变;1个不仅有10个碱基突变,还存在1个碱基的缺失。氨基酸比对表明,有2个质粒(分别有6和14个碱基突变)具有正确的读码框,能够翻译完整的蛋白质,各有4或14个氨基酸突变。3个质粒因含终止密码子而不能表达完整目的蛋白。结论成功构建pYD1-shuffled BPI_(600)重组质粒,获得库容量为2×105的突变文库,为高内毒素亲和力突变体的筛选奠定了基础。
关键词
人杀菌
渗透增强蛋白
定向进化
易错
p
c
r
DNA改组
Keywords
human ba
c
te
r
i
c
idaL/
p
enneability in
c
r
easing
p
r
otein
di
r
e
c
ted evolution
error-prone polymerase chain reaction（p c r ）
DNA shuffling
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
LDL-R基因多态性与丙型肝炎易感性的相关性分析
张青杨
金丹宁
金国江
康辉
尚红
《中国医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
人杀菌/渗透增强蛋白N端功能片段基因突变文库的构建和鉴定
李晶琴
孔庆利
安云庆
《首都医科大学学报》
CAS
北大核心
2017
0
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