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精确覆盖问题的O(1．414^n)链数DNA计算机算法
被引量：
3
1
作者
李肯立
刘杰
+1 位作者
杨磊
刘文斌
《计算机研究与发展》
EI
CSCD
北大核心
2008年第10期1782-1788,共7页
DNA计算机的可扩展性问题是近年来生物计算领域的重要研究重点之一.根据精确覆盖问题DNA计算求解过程中的并行计算需求,将Aldeman-Lipton模型的操作与粘贴模型的解空间结合,引入荧光标记和凝胶电泳技术,提出了一种求解精确覆盖问题的DN...
DNA计算机的可扩展性问题是近年来生物计算领域的重要研究重点之一.根据精确覆盖问题DNA计算求解过程中的并行计算需求,将Aldeman-Lipton模型的操作与粘贴模型的解空间结合,引入荧光标记和凝胶电泳技术,提出了一种求解精确覆盖问题的DNA计算模型和基于分治方法的DNA计算机算法.算法由初始解空间生成算法Init()、冗余解删除算法IllegalRemove()和并行搜索器ParallelSeacher()共3个子算法组成.与同类算法的性能比较分析表明:本算法在保持多项式生物操作复杂性的条件下,将求解n维精确覆盖问题的DNA链数从O(2n)减少至O(1.414n),从而将DNA计算机在试管内可求解的精确覆盖问题集合的基数从60提高到120,改进了相关文献的研究结果.
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关键词
DNA计算机
NP完全问题
精确覆盖问题
分治法
DNA超级计算
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职称材料
题名
精确覆盖问题的O(1．414^n)链数DNA计算机算法
被引量：
3
1
作者
李肯立
刘杰
杨磊
刘文斌
机构
湖南大学计算机与通信学院
温州大学计算机科学与工程学院
出处
《计算机研究与发展》
EI
CSCD
北大核心
2008年第10期1782-1788,共7页
基金
国家自然科学基金项目(60603053,90715029)
浙江省自然科学基金项目(106654)
高等学校博士后科学基金项目(20060400845)~~
文摘
DNA计算机的可扩展性问题是近年来生物计算领域的重要研究重点之一.根据精确覆盖问题DNA计算求解过程中的并行计算需求,将Aldeman-Lipton模型的操作与粘贴模型的解空间结合,引入荧光标记和凝胶电泳技术,提出了一种求解精确覆盖问题的DNA计算模型和基于分治方法的DNA计算机算法.算法由初始解空间生成算法Init()、冗余解删除算法IllegalRemove()和并行搜索器ParallelSeacher()共3个子算法组成.与同类算法的性能比较分析表明:本算法在保持多项式生物操作复杂性的条件下,将求解n维精确覆盖问题的DNA链数从O(2n)减少至O(1.414n),从而将DNA计算机在试管内可求解的精确覆盖问题集合的基数从60提高到120,改进了相关文献的研究结果.
关键词
DNA计算机
NP完全问题
精确覆盖问题
分治法
DNA超级计算
Keywords
DNA computer
NP-complete problem
exact cover problem
divide super-computing proposed algorithm and conquer
DNA
分类号
TP301.6 [自动化与计算机技术—计算机系统结构]
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作者
出处
发文年
被引量
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1
精确覆盖问题的O(1．414^n)链数DNA计算机算法
李肯立
刘杰
杨磊
刘文斌
《计算机研究与发展》
EI
CSCD
北大核心
2008
3
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