鳜类系统发育的线粒体Cytb基因全序列分析 被引量：8

1

作者 章群 任岗 +1 位作者 钱开诚 陈泉梅 《生态科学》 CSCD 2006年第5期430-432,436,共4页

测定了鳜、大眼鳜、斑鳜、暗鳜、波纹鳜、长体鳜、中国少鳞鳜等7种鳜类12个个体的线粒体细胞色素b基因全序列。结合GenBank中的同源序列,共分析了9种鳜类的系统发育关系。序列分析表明,鳜属鱼类属内种间的遗传距离(0.015～0.093)明显小... 测定了鳜、大眼鳜、斑鳜、暗鳜、波纹鳜、长体鳜、中国少鳞鳜等7种鳜类12个个体的线粒体细胞色素b基因全序列。结合GenBank中的同源序列,共分析了9种鳜类的系统发育关系。序列分析表明,鳜属鱼类属内种间的遗传距离(0.015～0.093)明显小于少鳞鳜属鱼类属内种间的遗传距离(0.152～0.178)。在分子系统发育树上,长体鳜与鳜属的鳜、大眼鳜、斑鳜、波纹鳜、暗鳜聚合成一分支,少鳞鳜属的种类聚成另一分支;支持将长体鳜归入鳜属,鳜类分为鳜属和少鳞鳜属等二个属的分类处理。在鳜属鱼类中,鳜和大眼鳜亲缘关系十分密切;斑鳜与波纹鳜亲缘较近;长体鳜与鳜属其它5个种的亲缘关系较远。在少鳞鳜属鱼类中,中国少鳞鳜和日本少鳞鳜的亲缘关系较远,韩国少鳞鳜的系统位置较不明确。鳜类的单系性及其鳜类的系统位置仍有待进一步研究。 展开更多

关键词 鳜类 线粒体细胞色素b基因 序列分析 系统发育

在线阅读 下载PDF 职称材料

松江鲈鱼Cytb基因序列分析及种质鉴定 被引量：4

2

作者 马亚 岳志芹 +3 位作者 赵玉然 梁成珠 徐彪 汪东风 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第8期119-124,共6页

采用PCR方法扩增四尾松江鲈鱼线粒体细胞色素b(mitochondrial cytochrome b,Cytb)基因序列,全序列长度为1 141 bp,并建立了松江鲈鱼的实时定量PCR检测方法对该物种进行种质鉴定。分析Cytb基因序列基本特征显示,Cytb基因在第3位密码子表... 采用PCR方法扩增四尾松江鲈鱼线粒体细胞色素b(mitochondrial cytochrome b,Cytb)基因序列,全序列长度为1 141 bp,并建立了松江鲈鱼的实时定量PCR检测方法对该物种进行种质鉴定。分析Cytb基因序列基本特征显示,Cytb基因在第3位密码子表现出明显的反G偏倚,显示出脊椎动物Cytb基因的共同特性。第2位密码子嘧啶的含量远高于嘌呤的含量,有5个位点发生转换,0个位点发生颠换。选取杜父鱼科(Cottidae)的10种鱼类,与松江鲈鱼进行序列分析,构建发育系统树并分析遗传距离,与鲈鱼的亲缘关系最远。以松江鲈鱼Cytb基因序列为靶基因,利用PRIMER EXPRESS2.0软件设计引物和Taqman探针,建立检测松江鲈鱼的定量PCR方法,特异性强,灵敏度高,检测限为3.20×102拷贝/反应。 展开更多

关键词 松江鲈鱼 细胞色素b基因 序列分析 定量PCR 种质鉴定

在线阅读 下载PDF 职称材料

利用Cytb基因序列研究翘嘴红鲌的系统发生 被引量：6

3

作者 黄丽英 丁诗华 +2 位作者 张海琪 杜建明 何中央 《西南农业大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2005年第6期909-913,共5页

线粒体细胞色素b基因序列分析可显示种间及种内遗传差异,广泛用于种类鉴定和系统发生研究。为了阐明翘嘴红鲌与其他鳊亚科鱼类的亲缘关系,扩增并测定了翘嘴红鲌的414 bp细胞色素b基因片段序列。所获序列与4种鳊亚科鱼类细胞色素b基因的... 线粒体细胞色素b基因序列分析可显示种间及种内遗传差异,广泛用于种类鉴定和系统发生研究。为了阐明翘嘴红鲌与其他鳊亚科鱼类的亲缘关系,扩增并测定了翘嘴红鲌的414 bp细胞色素b基因片段序列。所获序列与4种鳊亚科鱼类细胞色素b基因的相应序列进行比较,发现共有61个多态性核苷酸位点(14.73%),大多数位点出现在密码子的第3位且主要为碱基转换。翘嘴红鲌与鳊之间的序列同源性最高,为93.48%,与广东鲂、三角鲂和团头鲂的序列同源性则分别为90.58%,90.82%,91.30%。以鲤为外群,分别利用MP法和NJ法分析上述序列数据,获得相似的系统发生树。该结果显示,翘嘴红鲌和鳊聚为1个支系,广东鲂、三角鲂以及团头鲂则聚为另1个支系,说明翘嘴红鲌与鳊的亲缘关系较近,而与广东鲂、三角鲂及团头鲂的亲缘关系则较远。 展开更多

关键词 翘嘴红鲌 线粒体DNA 细胞色素b基因 序列分析 系统发生

在线阅读 下载PDF 职称材料

两种鼠蛲虫线粒体cytb基因的种间及种内序列变异研究

4

作者 杨言川 鲁力 +3 位作者 田伟鹏 刘光学 朱兴全 孙晓林 《甘肃农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第5期29-32,共4页

首次研究了小鼠四翼无刺线虫和隐管状线虫在线粒体细胞色素b(cytb)基因部分序列的种间及种内变异.从甘肃兰州地区LY和LS两个实验动物中心的小鼠肠道内收集了41个蛲虫样品(LY1-20、LS1-21),PCR扩增其cytb基因部分序列,经测序和序列分析... 首次研究了小鼠四翼无刺线虫和隐管状线虫在线粒体细胞色素b(cytb)基因部分序列的种间及种内变异.从甘肃兰州地区LY和LS两个实验动物中心的小鼠肠道内收集了41个蛲虫样品(LY1-20、LS1-21),PCR扩增其cytb基因部分序列,经测序和序列分析结果发现:四翼无刺线虫cytb有效序列为531bp,而隐管状线虫有效序列为567bp.用软件ClustalX1.83截取两种鼠蛲虫cytb基因长度共同的序列,比对后发现无种内差异,但种间差异高达31.51%.研究结果初步表明,cytb基因序列在鼠蛲虫种内较保守,但种间存在较高的变异率,可作为两种常见鼠蛲虫种间分子鉴定的遗传标记. 展开更多

关键词 蛲虫 小鼠 线粒体DNA 细胞色素 b基因 序列分析

在线阅读 下载PDF 职称材料

小蔗螟Cytb基因序列的分析研究(鳞翅目:螟蛾总科:草螟亚科) 被引量：5

5

作者 李玮玮 张修月 +1 位作者 陈伟才 岳碧松 《四川动物》 CSCD 北大核心 2009年第3期353-357,共5页

扩增并测定了小蔗螟线粒体细胞色素b(Cytb)基因,其序列全长1146 bp,利用分子生物学软件分析了包括小蔗螟在内的4目(鳞翅目、双翅目、鞘翅目、缨尾目)共19条Cytb基因序列。分析结果显示:鳞翅目昆虫AT含量明显低于其它昆虫,其中小蔗螟AT... 扩增并测定了小蔗螟线粒体细胞色素b(Cytb)基因,其序列全长1146 bp,利用分子生物学软件分析了包括小蔗螟在内的4目(鳞翅目、双翅目、鞘翅目、缨尾目)共19条Cytb基因序列。分析结果显示:鳞翅目昆虫AT含量明显低于其它昆虫,其中小蔗螟AT含量为75.1%;AT含量与A或T碱基使用的偏倚没有明显的相关性;碱基替换主要发生在密码子第三位,并且颠换率远大于转换率;密码子使用频率与基因碱基组成AT偏倚有相关性;相比于核苷酸数据,氨基酸所显示的遗传距离更为准确;使用Cytb基因构建的系统进化树支持昆虫的单源进化学说。 展开更多

关键词 小蔗螟 鳞翅目 CYT b基因 序列分析

在线阅读 下载PDF 职称材料

基于Cytb和COⅠ基因部分序列的15种麻蝇之间的系统发育关系(双翅目:麻蝇科)(英文) 被引量：4

6

作者 宋忠魁 王珣章 梁铬球 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期298-306,共9页

本研究通过测序Cytb基因和COⅠ基因的部分序列来推定15种麻蝇之间的系统发育关系。在世界麻蝇名录中,本研究的15种麻蝇能够代表麻蝇属Sarcophaga的6个亚属。连接序列(972bp)被用于系统发育分析;分析方法包括了了最大简约法、最大似然法... 本研究通过测序Cytb基因和COⅠ基因的部分序列来推定15种麻蝇之间的系统发育关系。在世界麻蝇名录中,本研究的15种麻蝇能够代表麻蝇属Sarcophaga的6个亚属。连接序列(972bp)被用于系统发育分析;分析方法包括了了最大简约法、最大似然法以及贝叶斯法。我们的结果提示了亚麻蝇亚属Parasarcophaga、别麻蝇亚属Boettcherisca以及红麻蝇亚属Liopygia的单系性,同时也表明蛇麻蝇亚属Liosarcophaga和德麻蝇亚属Pandelleisca并不是单源的。不过,目前的研究并不能分辨野德麻蝇S.(Pandelleisca)similis和峨眉叉麻蝇S.(Robineauella)coei的系统发育位置。此外,最大简约分析和似然功能分析在scopariiformis-iwuensis进化枝和polystylata-hui进化枝的关系上产生了不一致的系统发育推断。因此,后续研究不仅需要其他的分子标记,也需要更多的分类取样。 展开更多

关键词 贝叶斯分析 系统发育 cytb基因 COⅠ基因

在线阅读 下载PDF 职称材料

荣成湾孔鳐群体线粒体DNA cytb部分序列的遗传多样性分析 被引量：1

7

作者 刘梦侠 王丽娟 +5 位作者 孔令怡 刘洪军 吴志昊 辛梦娇 张伟 尤锋 《海洋科学》 CAS CSCD 北大核心 2012年第10期85-91,共7页

对2009年和2011年采自荣成湾的孔鳐(Raja porosa)群体共54尾鱼的线粒体DNA细胞色素b基因(cytb)部分序列进行测定,以分析其遗传多样性和群体遗传结构。结果显示,在所获得的782 bp序列中,共检测到11个单倍型、15个多态位点,其单倍型多样... 对2009年和2011年采自荣成湾的孔鳐(Raja porosa)群体共54尾鱼的线粒体DNA细胞色素b基因(cytb)部分序列进行测定,以分析其遗传多样性和群体遗传结构。结果显示,在所获得的782 bp序列中,共检测到11个单倍型、15个多态位点,其单倍型多样性指数(H)为0.498±0.081,核苷酸多样性指数(π)为0.0018±0.0005,遗传多样性水平较低。其中,2009年样品检测到3种单倍型、4个单一变异位点,其H和π值分别为0.378±0.181和0.0010±0.0006;2011年样品检测到9种单倍型、6个单一变异位点和6个简约信息位点,其H和π值分别为0.352±0.086和0.0020±0.0006。分子方差分析(AMOVA)分析显示它们的遗传变异主要集中在同年度个体间(98.22%),而不同年度个体间的遗传变异远远小于同年度内个体间的变异。Kimura’s 2-parameter模型分析得到的2009,2011年度孔鳐间的遗传距离为0.0013,遗传分化系数为0.01778,也表明2009年和2011年孔鳐的遗传分化程度低,没有明显的遗传变异。中性检验表明,荣成湾孔鳐群体可能发生过种群扩张。 展开更多

关键词 孔鳐(Rajaporosa) 荣成湾 细胞色素b基因(cytb)部分序列 群体遗传多样性

在线阅读 下载PDF 职称材料

基于形态和Cytb序列的短颌鲚种群遗传分化研究 被引量：3

8

作者 王玮欣 李宇 +3 位作者 朱洪赓 张婉茹 冯广朋 陈建华 《水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2022年第6期949-958,共10页

为探明鄱阳湖与洪泽湖短颌鲚的种群遗传分化情况,利用形态度量学和线粒体细胞色素b(Cytb)序列,研究鄱阳湖的都昌、瑞洪及洪泽湖的高良涧、临淮4个水域短颌鲚种群的遗传分化。短颌鲚26个性状参数的聚类分析结果显示,都昌种群与瑞洪种群... 为探明鄱阳湖与洪泽湖短颌鲚的种群遗传分化情况,利用形态度量学和线粒体细胞色素b(Cytb)序列,研究鄱阳湖的都昌、瑞洪及洪泽湖的高良涧、临淮4个水域短颌鲚种群的遗传分化。短颌鲚26个性状参数的聚类分析结果显示,都昌种群与瑞洪种群首先聚为一支,然后与临淮种群、高良涧种群相聚;主成分分析结果显示,前3个主成分总贡献率为65.12%;判别分析结果显示,都昌种群、瑞洪种群、高良涧种群与临淮种群的判别准确率分别为91.40%、80.00%、84.60%和82.50%。上述形态分析表明,同一湖区内部种群的形态差异较小,而不同湖区间的种群存在较大的形态差异。Cytb序列遗传分析显示,60条序列共有33个单倍型;基因多态性(H_(d))总计为0.957±0.013,核苷酸多态性(P_(i))总计为0.00462±0.00047;4个种群间遗传分化指数(F_(st))为0.00362~0.60873,基因流为0.16069~68.81077;中性检验结果显示,4个种群的Tajima'sD值、Fu'sF_(s)值均为负数;单倍型分布以及遗传距离构建的系统发育树均分为鄱阳湖和洪泽湖两支。上述结果表明,两个湖泊间的短颌鲚种群产生了显著的遗传分化。 展开更多

关键词 短颌鲚 形态度量学 线粒体细胞色素b序列 遗传分化 鄱阳湖 洪泽湖

在线阅读 下载PDF 职称材料

羚牛细胞色素b基因序列分析和系统进化研究 被引量：12

9

作者 蒙世杰 王静 +2 位作者 刘佩 宿兵 张亚平 《西北大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2001年第4期347-350,354,共5页

应用聚合酶链式反应 ( PCR)分别扩增了羚牛、绵羊、山羊、黄牛细胞色素 b基因 ,并对其全序列 ( 1 1 40 bp)进行了测定。其中羚牛细胞色素 b基因序列属首次报道。通过对 8种偶蹄类动物细胞色素 b基因序列差异分析和基于序列差异所构建的... 应用聚合酶链式反应 ( PCR)分别扩增了羚牛、绵羊、山羊、黄牛细胞色素 b基因 ,并对其全序列 ( 1 1 40 bp)进行了测定。其中羚牛细胞色素 b基因序列属首次报道。通过对 8种偶蹄类动物细胞色素 b基因序列差异分析和基于序列差异所构建的分子系统树 ,发现羚牛与羊亚科的动物亲缘关系最近 ,与其他动物亲缘关系较远 ,表明将羚牛放入羊亚科较为合理。序列差异分析还表明羚牛约在距今 5 0 0万年前 (上新世 )从牛类动物中分化出来 ,牛类分化时间约在 60 0万年前的中新世( Miocene) 展开更多

关键词 羚牛 偶蹄目 细胞色素b基因 DNA序列分析 系统进化 羊亚科 分类

在线阅读 下载PDF 职称材料

细胞色素b基因序列与7种石首鱼类的系统进化 被引量：15

10

作者 田兰香 梁冰 +2 位作者 张树义 赵盛龙 王日昕 《台湾海峡》 CAS CSCD 2004年第4期436-443,共8页

通过比较一段381bp细胞色素b基因序列,分析了石首鱼科7种石首鱼的系统发育关系.该序列有51个单变异多态位点、128个简约信息多态位点,对应的氨基酸序列有41个氨基酸变异位点.根据Kimura2参数构建的邻接树(NJtree)和最大简约树(MPtree)... 通过比较一段381bp细胞色素b基因序列,分析了石首鱼科7种石首鱼的系统发育关系.该序列有51个单变异多态位点、128个简约信息多态位点,对应的氨基酸序列有41个氨基酸变异位点.根据Kimura2参数构建的邻接树(NJtree)和最大简约树(MPtree)都显示同样的结果:7种石首鱼类构成一个单系群.皮氏叫姑鱼位于单系群的基部,且与其他石首鱼分离时间很早;大黄鱼和棘头梅童鱼亲缘关系最近,并与钩牙皇石首鱼和波纹短须石首鱼构成姐妹群.黄姑鱼和鱼也接近树的基部. 展开更多

关键词 鱼类 多态位点 大黄鱼 亲缘关系 变异 系统进化 黄姑鱼 细胞色素b基因 系统发育关系 序列

在线阅读 下载PDF 职称材料

钱塘江粗唇鱼危细胞色素b基因片段序列分析及系统发生研究 被引量：3

11

作者 许宝青 刘凯 +2 位作者 谢楠 冯晓宇 李行先 《水产科学》 CAS 北大核心 2009年第7期383-386,共4页

为研究钱塘江粗唇鱼危与其他鲿科鱼类的亲缘关系,扩增并测定了粗唇鱼危的细胞色素b基因片段序列。用Blastn分析所获序列与其他鲿科鱼类细胞色素b基因的同源性,用Mega4软件构建系统发生树。

关键词 粗唇鱼危 细胞色素b(cytb)基因 序列分析 系统发生

在线阅读 下载PDF 职称材料

中华鳖(Pelodiscus sinensis)5个不同地理种群细胞色素b基因序列变异及种群遗传结构分析 被引量：18

12

作者 张永正 张海琪 +3 位作者 何中央 徐晓林 李智强 杜建明 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期234-239,共6页

利用线粒体细胞色素b基因序列对中华鳖5个不同地理种群(太湖群体、日本群体、江西群体、台湾群体和乌鳖群体)的种群遗传结构进行分析。以特异引物进行PCR扩增,获得了408bp的基因片断序列。序列分析结果表明,在31个中华鳖个体中,共检测... 利用线粒体细胞色素b基因序列对中华鳖5个不同地理种群(太湖群体、日本群体、江西群体、台湾群体和乌鳖群体)的种群遗传结构进行分析。以特异引物进行PCR扩增,获得了408bp的基因片断序列。序列分析结果表明,在31个中华鳖个体中,共检测到17个变异位点,获得8种单倍型。日本群体的2种单倍型在其他4个群体中都未检测到,为该群体所特有,日本种群与其他4个群体的遗传距离最远。除日本群体缺乏主体单倍型外,其他4个群体共同拥有主体单倍型Hap.1,江西群体、台湾群体和乌鳖群体的单倍型类型都和其他群体共同享有,没有其特异的单倍型。MP法和NJ法构建的系统发生树显示日本群体的两种单倍型以很高的置信度聚成一支,这与其地理分布存在一定的相关性,其序列上的差异,可以成为种群鉴别的分子标记;另外4个群体的6种单倍型聚合成一大支,但同一个地理区域的群体并未聚成一类,未按照地理位置形成明显的地理格局。 展开更多

关键词 中华鳖 线粒体DNA 细胞色素b基因 序列分析 种群遗传结构

在线阅读 下载PDF 职称材料

二倍体泥鳅线粒体细胞色素b基因的序列分析 被引量：3

13

作者 杨承泰 王卫民 +1 位作者 曹玲 姬伟 《水产科学》 CAS 北大核心 2007年第12期652-655,共4页

对二倍体泥鳅的线粒体细胞色素b基因进行PCR扩增和正反测序,在5个个体中均得到序列一致的细胞色素b基因片断,长度为1140 bp,A、T、G、C含量分别为313(28%)、358(31%)、170(15%)、300(26%),A+T>C+G,与其他水生动物相同基因片段碱基序... 对二倍体泥鳅的线粒体细胞色素b基因进行PCR扩增和正反测序,在5个个体中均得到序列一致的细胞色素b基因片断,长度为1140 bp,A、T、G、C含量分别为313(28%)、358(31%)、170(15%)、300(26%),A+T>C+G,与其他水生动物相同基因片段碱基序列含量相似,该基因中密码子第1位核苷酸中4种碱基组成较为均衡;第2位核苷酸中T的使用率较高,为33.4%,G的使用率较低,为17.1%;密码子第3位A的使用率高,为34.2%,而G的使用率较低,仅为7.9%;由泥鳅细胞色素b基因片断推导出对应的氨基酸序列,在氨基酸序列中Leu占11.%,远高于其他氨基酸。 展开更多

关键词 泥鳅 二倍体 细胞色素b基因 序列

在线阅读 下载PDF 职称材料

驼背鲈线粒体细胞色素b基因的序列分析 被引量：4

14

作者 区又君 李加儿 +1 位作者 吴勇 刘楚吾 《南方水产》 CAS 2008年第5期51-54,共4页

采用PCR-DNA测序技术,对驼背鲈线粒体DNA细胞色素b(Cytb)基因全序列进行分析。获得长度为1141bp的Cytb基因片段,序列碱基组成平均是T为29.1%,C为32.3%,A为23.2%,G为14.0%,A+T的碱基百分比总体上略大于C+G,平均值分别是52.3%和46.3%。与... 采用PCR-DNA测序技术,对驼背鲈线粒体DNA细胞色素b(Cytb)基因全序列进行分析。获得长度为1141bp的Cytb基因片段,序列碱基组成平均是T为29.1%,C为32.3%,A为23.2%,G为14.0%,A+T的碱基百分比总体上略大于C+G,平均值分别是52.3%和46.3%。与其它鱼类相同基因片段碱基序列含量相似。在由核苷酸推导的氨基酸中,亮氨酸(Leu)所占的比例最高,为16.03%。 展开更多

关键词 驼背鲈 细胞色素b(Cyt b) 序列

在线阅读 下载PDF 职称材料

斑鳠细胞色素b基因的初步研究 被引量：4

15

作者 任岗 陈艺燕 +2 位作者 钱开诚 陈迪 章群 《生态科学》 CSCD 2005年第3期237-239,共3页

斑鳠是珠江四大名鱼之一,目前资源量急剧下降,种质资源的保护迫在眉睫。测定了斑鳠线粒体细胞色素b 基因的全序列,该序列全长1 137 bp,其中T、C、A、G四种碱基含量分别为31.6%、25.7%、29.6%、13.1%,A+T 的含量(61.2%)显著高于G+C的含量... 斑鳠是珠江四大名鱼之一,目前资源量急剧下降,种质资源的保护迫在眉睫。测定了斑鳠线粒体细胞色素b 基因的全序列,该序列全长1 137 bp,其中T、C、A、G四种碱基含量分别为31.6%、25.7%、29.6%、13.1%,A+T 的含量(61.2%)显著高于G+C的含量(38.8%)。将测定序列(序列自编号:MGGD)与GenBank中的2个斑鳠序列(序列自编号:MGZJ、MGFJ)进行了比较,3个序列之间的序列差异为0.005-0.017,转换后的氨基酸序列间差异位点都仅为2 个,反应出细胞色素b基因作为功能蛋白质编码基因序列相对比较保守。鳠属鱼类线粒体Cytb基因的转换大于颠换。研究为斑鳠渔业种质资源保护和品种选育提供了遗传方面的资料,斑鳠的群体结构有待进一步深入研究。 展开更多

关键词 斑鱯 细胞色素b基因 序列差异 种质保护

在线阅读 下载PDF 职称材料

中国花鲈细胞色素b基因片段的序列研究(英文) 被引量：3

16

作者 高天翔 张秀梅 +3 位作者 陈大刚 张美昭 任一平 张亚平 《青岛海洋大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2001年第2期185-189,共5页

参考鳗鲡等鱼类线粒体 DNA序列进行了中国花鲈线粒体 DNA细胞色素 b基因片断的引物设计、PCR扩增及其序列测定。得到中国花鲈的碱基序列为 4 10 bp,其 A、T、G、C含量分别为 10 1bp(2 4 .6 3% )、112 bp(2 7.32 % )、72 bp(17.56 % )、1... 参考鳗鲡等鱼类线粒体 DNA序列进行了中国花鲈线粒体 DNA细胞色素 b基因片断的引物设计、PCR扩增及其序列测定。得到中国花鲈的碱基序列为 4 10 bp,其 A、T、G、C含量分别为 10 1bp(2 4 .6 3% )、112 bp(2 7.32 % )、72 bp(17.56 % )、12 5bp(30 .4 9% ) ,与鳗鲡等其他鱼类相同基因片断序列碱基含量相似。 展开更多

关键词 中国 花鲈 线粒体DNA 细胞色素b DNA序列 碱基序列

在线阅读 下载PDF 职称材料

翘嘴鳜线粒体DNA细胞色素b基因序列分析 被引量：1

17

作者 陈艺燕 钱开诚 章群 《生态科学》 CSCD 2004年第2期154-155,159,共3页

测定了翘嘴鳜(Siniperca chuatsi)的线粒体细胞色素b基因编码区全序列1140个核苷酸序列,并且由此推导出对应的氨基酸序列,A/T所占比例为53.4%,G+C约占46.6%。该基因中密码子第1位核苷酸中4种碱基组成较为均衡,第2位核苷酸中T的使用率较... 测定了翘嘴鳜(Siniperca chuatsi)的线粒体细胞色素b基因编码区全序列1140个核苷酸序列,并且由此推导出对应的氨基酸序列,A/T所占比例为53.4%,G+C约占46.6%。该基因中密码子第1位核苷酸中4种碱基组成较为均衡,第2位核苷酸中T的使用率较高,G的使用率较低;而密码子第3位C/A的使用率高,而G的使用率仅为3.7%;在氨基酸序列中Leu所占比例16.36%,远高于其它氨基酸;而Cys使用比例仅为0.79%。本研究为鳜类的系统发育、资源保护和利用提供了核苷酸序列方面的资料,至于翘嘴鳜线粒体细胞色素b基因序列中密码子不同位置碱基使用比率以及氨基酸组成是翘嘴鳜特有还是鳜类共有特征,尚有待进一步研究。 展开更多

关键词 翘嘴鳜 线粒体 细胞色素b 基因 序列分析 密码子

在线阅读 下载PDF 职称材料

石爬(鱼兆)属2种鱼线粒体DNA细胞色素b基因序列的比较研究

18

作者 杨成 晁燕 +3 位作者 申志新 祁得林 唐文家 王国杰 《水产科学》 CAS 北大核心 2010年第1期23-26,共4页

对采于青海省玛柯河的6尾黄石爬(鱼兆)和四川省都江堰的1尾青石爬(鱼兆)线粒体DNA细胞色素b(Cyt b)基因进行了PCR扩增并进行序列测定。结果表明,黄石爬(鱼兆)6个个体均属同一单倍型。在Cyt b基因全长1140 bp中,2种鱼类存在29个变异位点(... 对采于青海省玛柯河的6尾黄石爬(鱼兆)和四川省都江堰的1尾青石爬(鱼兆)线粒体DNA细胞色素b(Cyt b)基因进行了PCR扩增并进行序列测定。结果表明,黄石爬(鱼兆)6个个体均属同一单倍型。在Cyt b基因全长1140 bp中,2种鱼类存在29个变异位点(2.54%),其中23个(79.3%)突变位点为转换,6个(20.7%)突变位点为颠换。2种鱼类序列差异偏低,提示分化较晚,致使物种间在Cyt b基因上未能积累丰富的碱基变异。黄石爬(鱼兆)遗传多样度较低,可能与其栖息环境的改变有关。 展开更多

关键词 黄石爬(鱼兆) 青石爬(鱼兆) 线粒体DNA细胞色素b基因 序列特征 系统发育

在线阅读 下载PDF 职称材料

不同海域中国花鲈的细胞色素b序列的遗传分析 被引量：6

19

作者 刘明月 蒋琦辰 杨家新 《南京师大学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期102-106,共5页

从辽宁大连、河北黄骅、山东青岛、江苏盐城、浙江宁波、广西北海等6个沿海地区分别采集野生中国花鲈共44尾，通过测定花鲈细胞色素b序列，获得876bp长度的序列，检测到的变异位点26个，22个单倍型，A、C、G、T的碱基组成分别为22．6％... 从辽宁大连、河北黄骅、山东青岛、江苏盐城、浙江宁波、广西北海等6个沿海地区分别采集野生中国花鲈共44尾，通过测定花鲈细胞色素b序列，获得876bp长度的序列，检测到的变异位点26个，22个单倍型，A、C、G、T的碱基组成分别为22．6％，33．1％，16．4％，28．0％．各群体内的遗传差异从0．1％～1％，群体间的遗传差异从0．2％～1％．构建NJ树，分为两大群，取自北海的花鲈单独成群，其它地区的花鲈合为另一分支． 展开更多

关键词 中国花鲈 线粒体DNA 细胞色素b 序列分析

在线阅读 下载PDF 职称材料

柞蚕线粒体Cyt b基因片段的序列多态性分析 被引量：2

20

作者 孙玲 王凤成 +5 位作者 王秋实 刘彦群 仝振祥 冀万杰 张博 王学英 《沈阳农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第5期628-631,共4页

以22个柞蚕品种(品系)为材料,采用PCR技术分别扩增其线粒体DNA(mtDNA)的细胞色素b基因(Cytb),测定5’端485bp的核苷酸序列,并采用Dnaman软件进行分析,结果表明:供试22个柞蚕品种可分成2组,2组之间只在294bp处有一个差异位点。从GenBank... 以22个柞蚕品种(品系)为材料,采用PCR技术分别扩增其线粒体DNA(mtDNA)的细胞色素b基因(Cytb),测定5’端485bp的核苷酸序列,并采用Dnaman软件进行分析,结果表明:供试22个柞蚕品种可分成2组,2组之间只在294bp处有一个差异位点。从GenBank中调取柞蚕豫早1号品种Cytb基因的5’端相应序列(AY242996),与本试验测得的柞蚕青黄1号和青6号对应的核苷酸序列进行了同源性比较,结果表明:青黄1号和青6号的同源性达99.8%,青黄1号和豫早1号的同源性达98.6%,青6号和柞早1号的同源性达98.8%。可见,不同柞蚕品种的表型虽然不同,但在Cytb基因水平上其核苷酸序列的组成却是高度一致,供试品种间的亲缘关系很近,同源性较高。 展开更多

关键词 柞蚕 线粒体 细胞色素b基因 序列分析

在线阅读 下载PDF 职称材料