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杉木纤维素合成酶类似蛋白基因ClCslD1的克隆及其生物信息学分析
被引量：
3
1
作者
彭沙沙
童再康
+3 位作者
黄华宏
周厚君
时剑
林二培
《浙江农林大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第1期1-6,共6页
纤维素合成酶类似蛋白(CSL)作为一种重要的膜蛋白与纤维素合成酶具有相类似的蛋白结构,都含有D,D,D,QXXRW保守区。利用其他物种中的CesA基因的保守序列设计简并引物,采用反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)结合cDNA末端快速扩增技术(RACE)...
纤维素合成酶类似蛋白(CSL)作为一种重要的膜蛋白与纤维素合成酶具有相类似的蛋白结构,都含有D,D,D,QXXRW保守区。利用其他物种中的CesA基因的保守序列设计简并引物,采用反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)结合cDNA末端快速扩增技术(RACE)成功地从杉木Cunninghamia lanceolata中扩增出一个含有完整阅读框架的cDNA序列,长度为4 150 bp,开放阅读框架为3 396 bp,编码1 132个氨基酸并含有保守的D,D,D,QXXRW天冬氨酸残基序列。应用美国国家生物技术信息中心(NCBI)数据库对获得的基因进行序列分析比对,发现它属于CslD基因家族,命名为ClCslD1基因。多重序列比对结果分析表明,该蛋白与来自颤杨Populus tremuloides,水稻Oryza sativa,拟南芥Arabidopsis thaliana等的同源基因相似性高达71%以上。利用生物软件对其进行生物学分析,为进一步研究其在植物纤化中的功能奠定基础。
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关键词
林木育种学
杉木
纤维素合成酶类似蛋白
克隆
表达
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职称材料
题名
杉木纤维素合成酶类似蛋白基因ClCslD1的克隆及其生物信息学分析
被引量：
3
1
作者
彭沙沙
童再康
黄华宏
周厚君
时剑
林二培
机构
浙江农林大学林业与生物技术学院
出处
《浙江农林大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第1期1-6,共6页
基金
浙江省重大科技专项(2008C02004-1)
浙江省自然科学基金资助项目(Y3090510)
浙江省林业厅资助项目(08A10)
文摘
纤维素合成酶类似蛋白(CSL)作为一种重要的膜蛋白与纤维素合成酶具有相类似的蛋白结构,都含有D,D,D,QXXRW保守区。利用其他物种中的CesA基因的保守序列设计简并引物,采用反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)结合cDNA末端快速扩增技术(RACE)成功地从杉木Cunninghamia lanceolata中扩增出一个含有完整阅读框架的cDNA序列,长度为4 150 bp,开放阅读框架为3 396 bp,编码1 132个氨基酸并含有保守的D,D,D,QXXRW天冬氨酸残基序列。应用美国国家生物技术信息中心(NCBI)数据库对获得的基因进行序列分析比对,发现它属于CslD基因家族,命名为ClCslD1基因。多重序列比对结果分析表明,该蛋白与来自颤杨Populus tremuloides,水稻Oryza sativa,拟南芥Arabidopsis thaliana等的同源基因相似性高达71%以上。利用生物软件对其进行生物学分析,为进一步研究其在植物纤化中的功能奠定基础。
关键词
林木育种学
杉木
纤维素合成酶类似蛋白
克隆
表达
Keywords
forest tree breeding
Cunninghamia lanceolata
cellulose synthase-like （csl） protein
clone
expression
分类号
S722.1 [农业科学—林木遗传育种]
Q785 [生物学—分子生物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
杉木纤维素合成酶类似蛋白基因ClCslD1的克隆及其生物信息学分析
彭沙沙
童再康
黄华宏
周厚君
时剑
林二培
《浙江农林大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012
3
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