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基于Real-time PCR法检测乳粉中牛源性成分定量研究
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作者 陈晨 史国华 +5 位作者 陈勃旭 张瑞 王玉欣 贾文珅 陈佳 周巍 《粮油食品科技》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期159-164,共6页
基于Real-timePCR建立了乳粉中牛源性成分相对定量检测方法,并对牛的特异性引物与探针进行了特异性、灵敏度和稳定性测试。通过模拟不同浓度牛乳粉与马乳粉混合样本,根据其△Ct值的函数关系进行线性拟合进而绘制标准曲线,建立乳粉中牛... 基于Real-timePCR建立了乳粉中牛源性成分相对定量检测方法,并对牛的特异性引物与探针进行了特异性、灵敏度和稳定性测试。通过模拟不同浓度牛乳粉与马乳粉混合样本,根据其△Ct值的函数关系进行线性拟合进而绘制标准曲线,建立乳粉中牛源性成分的相对定量检测。结果显示,该方法的最低检测限为0.00001 mg/mL,回收率为91.11%~119.2%,组间变异系数≤0.58%、组内变异系数≤1.44%。说明该方法在特异性与稳定性上适用于乳粉中牛源性成分及含量的掺假检测。 展开更多
关键词 牛乳粉 马乳粉 real-time pcr 掺假检测
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一种基于real-time PCR技术的TTV检测方法的建立及应用
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作者 贾毅博 王高玉 +4 位作者 邓宛心 林彩云 杨华 陈运春 尹飞飞 《海南医学院学报》 CAS 北大核心 2024年第7期489-497,共9页
目的:本研究旨在开发一种具有更高灵敏度和特异性的TTV检测技术,为揭示TTV在多种疾病过程中的作用提供重要的技术支持。方法:为了更精确、灵敏的检测TTV,本研究分析了目前公布的所有亚型的TTV基因序列,在此基础上建立了一种基于UTR区域... 目的:本研究旨在开发一种具有更高灵敏度和特异性的TTV检测技术,为揭示TTV在多种疾病过程中的作用提供重要的技术支持。方法:为了更精确、灵敏的检测TTV,本研究分析了目前公布的所有亚型的TTV基因序列,在此基础上建立了一种基于UTR区域的real-time PCR检测方法,并与文献报道应用较为广泛的PCR检测方法进行了对比。结果:本研究建立的方法在1×10^(7)~1×10^(1) copies/μL标准品浓度范围内具有良好的线性关系,相关系数为1.000,斜率为-3.446,检测下限为1×10^(1) copies/μL。重复性试验结果显示,组内变异系数为7.22%,表明本方法重复性、稳定性较强。针对30份临床样本,使用本研究建立的real-time PCR检测方法及目前被多个研究所使用的4套引物进行对比。结果表明,本研究所建立的方法灵敏度显著高于文献中报道的4种方法(P<0.01);Sanger测序结果表明,本方法检测出的30份阳性样本均为TTV,检测特异性为100%。结论:本研究采用基于TaqMan探针的real-time PCR检测方法,检测灵敏性高、覆盖基因型范围广,尤其对于TTV病毒载量较低的情况下能够进行定量检测,对于TTV病毒的致病性及作为免疫标志物的应用提供重要的技术支持。 展开更多
关键词 Torque teno virus 基因组扩增测序 real-time pcr检测
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一种莱姆病螺旋体real-time PCR方法的建立及其在鼠标本检测中的应用评价(英文) 被引量:12
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作者 耿震 侯学霞 +1 位作者 张琳 郝琴 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第9期812-816,共5页
目的基于莱姆病螺旋体recA基因,建立一种检测鼠中莱姆病螺旋体的real-time PCR方法。方法通过GenBank分析比较莱姆病螺旋体recA基因,选择其保守序列设计MGB探针及引物并进行方法学评估。并应用建立的real-time PCR方法和nested PCR方法... 目的基于莱姆病螺旋体recA基因,建立一种检测鼠中莱姆病螺旋体的real-time PCR方法。方法通过GenBank分析比较莱姆病螺旋体recA基因,选择其保守序列设计MGB探针及引物并进行方法学评估。并应用建立的real-time PCR方法和nested PCR方法对收集的123份鼠标本进行检测分析。结果本研究建立的real-time PCR方法仅对莱姆病螺旋体检测阳性,其最小检出浓度为101copies/μL。标准曲线各浓度点Ct值批内、批间平均变异系数(CV)分别为1.56%和2.30%。123份鼠标本中,real-time PCR检测59例阳性,nested PCR检测43例阳性。结论新建立的real-time PCR方法具有快速、敏感和特异的优点,可用于鼠标本中莱姆病螺旋体的检测。 展开更多
关键词 莱姆病螺旋体 real-time pcr nested pcr
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运用Real-time PCR方法研究日粮添加豆油与胡麻油对肉牛瘤胃纤维分解菌数量的影响 被引量:13
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作者 李旦 王加启 +3 位作者 卜登攀 杨舒黎 魏宏阳 周凌云 《动物营养学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期256-260,共5页
本研究分别以产琥珀酸丝状杆菌(Fibrobacter succinogenes)、黄色瘤胃球菌(Ruminococcus flavefaciens)、白色瘤胃球菌(Ruminobacter albus)和溶纤维丁酸弧菌(Butyrivibrio fibrisolvens)16S rDNA序列设计引物,运用Real-ti me PCR技术... 本研究分别以产琥珀酸丝状杆菌(Fibrobacter succinogenes)、黄色瘤胃球菌(Ruminococcus flavefaciens)、白色瘤胃球菌(Ruminobacter albus)和溶纤维丁酸弧菌(Butyrivibrio fibrisolvens)16S rDNA序列设计引物,运用Real-ti me PCR技术研究日粮中添加豆油与胡麻油对肉牛上述4种瘤胃纤维分解菌数量的影响。结果表明,与对照组(CK)相比,添加豆油组(LOC1)和胡麻油(LOC2)组,产琥珀酸丝状杆菌(Fibrobacter succinogenes)、黄色瘤胃球菌(Ruminococcus flavefaciens)、白色瘤胃球菌(Ruminobacter albus)和溶纤维丁酸弧菌(Butyrivibrio fibrisol-vens)数量显著减少(P<0.05),分别降低了78%和31%、30%和36%、27%和23%、6%和13%。通过该方法的结果表明日粮中添加4%的豆油和胡麻油显著减少了瘤胃中纤维分解菌,对产琥珀酸丝状杆菌的影响明显。而且采用Real-ti me PCR方法对瘤胃纤维分解菌进行定量,可以快速有效反映出在日粮改变的情况下菌的数量变化趋势,相对于传统计数方法更直观、快捷与准确。 展开更多
关键词 real-time pcr 瘤胃纤维菌 定量 肉牛
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非洲猪瘟病毒常规PCR及Real-time PCR检测方法的建立 被引量:22
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作者 张泉 朱鸿飞 孙怀昌 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第6期458-461,共4页
根据非洲猪瘟病毒(African swine fever virus,ASFV)P72基因的核苷酸序列,设计并合成引物以及荧光标记的TaqMan探针,以含P72基因的重组质粒作为阳性模板,用于常规PCR和Real-time PCR方法的建立,结果表明常规PCR的检测灵敏度是600个拷贝... 根据非洲猪瘟病毒(African swine fever virus,ASFV)P72基因的核苷酸序列,设计并合成引物以及荧光标记的TaqMan探针,以含P72基因的重组质粒作为阳性模板,用于常规PCR和Real-time PCR方法的建立,结果表明常规PCR的检测灵敏度是600个拷贝的病毒核酸分子,Real-time PCR的检测灵敏度是20个拷贝的病毒核酸分子,两种PCR检测方法均具有特异性强、简单快速的优点。可以用于出入境检验检疫部门对非洲猪瘟病毒的快速检测。 展开更多
关键词 非洲猪瘟 常规pcr real-time pcr
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用DGGE和Real-Time PCR对低温沼气池中产甲烷古菌群落的研究 被引量:23
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作者 王彦伟 徐凤花 +3 位作者 阮志勇 宋金龙 王庆 赵斌 《中国沼气》 北大核心 2012年第1期8-12,共5页
利用DGGE及Real-Time PCR技术对不同地区低温沼气池中沼泥行进发酵前期、后期产甲烷古菌群落变化进行了研究。DGGE技术用于分析发酵前后产甲烷古菌优势群落的变化;Real-Time PCR技术用于分析发酵前期、后期样品产甲烷古菌的数量变化。... 利用DGGE及Real-Time PCR技术对不同地区低温沼气池中沼泥行进发酵前期、后期产甲烷古菌群落变化进行了研究。DGGE技术用于分析发酵前后产甲烷古菌优势群落的变化;Real-Time PCR技术用于分析发酵前期、后期样品产甲烷古菌的数量变化。结果表明,沼气低温发酵的过程中,不同沼泥样品发酵前期、后期产甲烷古菌的优势群落差异明显且数量上也存在较大差异;主要变化的产甲烷古菌的优势群落为甲烷粒菌属(Methanocor-pusculum),甲烷八叠球菌属(Methanosarcina),甲烷鬃毛菌属(Methanosaeta)。甲烷八叠球菌属(Methanosarcina)在黑龙江沼泥样品(A1)发酵后期成为优势群落,甲烷鬃毛菌属(Methanosaeta)在山东发酵前期(B1),后期样品(B2)及安徽发酵前期样品(C1)中占有绝对优势。产甲烷古菌的数量介于104~105个.mL-1之间,其中黑龙江样品中产甲烷菌数量最多,而安徽样品中产甲烷菌数量最少。 展开更多
关键词 沼泥 产甲烷古菌 DGGE real-time pcr
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Real-time PCR技术的应用研究进展 被引量:6
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作者 李珊珊 王加启 +3 位作者 李旦 董晓丽 赵圣国 卜登攀 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第8期60-62,共3页
Real-time PCR(RT-PCR)是基于PCR,利用不同的荧光检测定量核酸的技术,广泛应用于基因分型,单核苷酸多态性,等位基因突变检测等方面。综述了RT-PCR作为一种检测技术,在医学、食品、环境微生物等不同领域的应用进展。
关键词 real-time pcr基因诊断 基因检测 基因表达
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Real-time PCR方法检测肉品中的沙门氏菌 被引量:16
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作者 方平 杨永莉 +1 位作者 杨宝 王晓闻 《山西农业科学》 2010年第8期71-76,共6页
应用SYBR Green I染料能选择性结合双链DNA的特点,可检测到沙门氏菌fimI基因特异性靶序列扩增所产生的荧光信号,通过熔解曲线可知其熔点值约为85.6℃,而对其他非沙门氏菌则检测不到荧光信号。建立了一种肉品中的沙门氏菌Real-time PCR... 应用SYBR Green I染料能选择性结合双链DNA的特点,可检测到沙门氏菌fimI基因特异性靶序列扩增所产生的荧光信号,通过熔解曲线可知其熔点值约为85.6℃,而对其他非沙门氏菌则检测不到荧光信号。建立了一种肉品中的沙门氏菌Real-time PCR检测方法,用该方法检测市售牛肉、香肠中的沙门氏菌,其检测灵敏度分别为13,12 cfu/25 g,从样品的处理到得出检验结果可以在10 h内完成。该检测方法具有简便、快速、特异性强、敏感度高等特点。 展开更多
关键词 沙门氏菌 real-time pcr 快速检测 肉品
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运用Real-time quantification PCR方法建立副溶血性弧菌在即食虾中的生长预测模型 被引量:5
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作者 彭织云 王敬敬 +2 位作者 唐晓阳 潘迎捷 赵勇 《食品工业科技》 CAS CSCD 北大核心 2013年第8期108-110,共3页
运用Real-time quantification PCR(real-time qPCR)方法建立副溶血性弧菌在即食虾中生长预测模型。首先构建质粒标准品,梯度稀释后建立标准曲线,然后用Real-time qPCR方法检测虾中副溶血性弧菌的数量,最后建立37℃下即食虾中副溶血性... 运用Real-time quantification PCR(real-time qPCR)方法建立副溶血性弧菌在即食虾中生长预测模型。首先构建质粒标准品,梯度稀释后建立标准曲线,然后用Real-time qPCR方法检测虾中副溶血性弧菌的数量,最后建立37℃下即食虾中副溶血性弧菌生长预测模型,并与传统涂布计数方法进行比较。结果表明,Real-time qPCR方法和传统计数方法均可建立Gmopertz模型、Logistic模型和Richards模型,模型拟合的相关系数R2均在0.9以上。基于Real-timeqPCR方法省时省力、特异性好等优点,用Real-time qPCR方法建立微生物预测模型是未来预测微生物学领域的一种发展趋势。 展开更多
关键词 real-time quantification pcr 副溶血性弧菌 生长预测模型
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Real-Time PCR探针法定量检测沙门菌方法的建立及应用 被引量:3
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作者 耿士忠 潘志明 +5 位作者 方强 丛秋霞 刘杰 刘志成 文志发 焦新安 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第11期1004-1007,1027,共5页
目的建立快速、特异性好、灵敏度高的Real-Time PCR方法定量检测沙门菌。方法根据编码沙门菌肠毒素基因stn的核苷酸序列,设计荧光探针和一对引物,通过对荧光定量PCR反应体系和反应条件的摸索,建立定量检测沙门菌的方法。结果建立的Real-... 目的建立快速、特异性好、灵敏度高的Real-Time PCR方法定量检测沙门菌。方法根据编码沙门菌肠毒素基因stn的核苷酸序列,设计荧光探针和一对引物,通过对荧光定量PCR反应体系和反应条件的摸索,建立定量检测沙门菌的方法。结果建立的Real-Ti me PCR方法有很好的特异性与敏感性,所检测沙门菌结果均为阳性,而非沙门菌均为阴性;标准曲线相关系数为R2=0.993,其敏感性为5CFU。运用该方法对108份鸡粪便、50份鸡肉以及58份水样进行检测,阳性率分别为3.7%(6/108)、4%(2/50)和3.4%(2/58),与传统细菌分离检测结果相符。结论结果表明该方法具有简便、快速、特异性强、敏感性高等特点,此研究为环境及疾病诊断中沙门菌快速检测提供了新方法。 展开更多
关键词 沙门菌 real-time pcr 荧光定量 快速检测
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鸡传染性喉气管炎病毒TaqMan real-time PCR检测方法的建立 被引量:4
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作者 赵妍 孔聪聪 +10 位作者 张晓敏 崔红玉 石星明 赵晓岩 薛美 胡顺磊 闫帅 牛秀杰 李巧玲 王玫 王云峰 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第8期642-646,共5页
为建立鸡传染性喉气管炎病毒(ILTV)TaqMan Real-time PCR检测方法,本研究根据GenBank中登录的ILTV gB基因序列设计了2对引物与一条特异性TaqMan探针,通过对反应体系和反应条件的优化,特异性、敏感性以及重复性试验,证明该方法在核酸含量... 为建立鸡传染性喉气管炎病毒(ILTV)TaqMan Real-time PCR检测方法,本研究根据GenBank中登录的ILTV gB基因序列设计了2对引物与一条特异性TaqMan探针,通过对反应体系和反应条件的优化,特异性、敏感性以及重复性试验,证明该方法在核酸含量108拷贝/μL~101拷贝/μL范围内具有良好的线性关系;能够检测初始模板中10-3EID50的病毒核酸及16拷贝的标准品;与其它相关的鸡源病毒均无交叉反应,并且批内、批间变异系数均小于2%,具有良好的重复性。该检测方法的建立为ILTV的临床检测和定量分析提供了一种快速、准确的技术手段。 展开更多
关键词 鸡传染性喉气管炎病毒 GB基因 TAQMAN real-time pcr
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利用SYBR Green检测衣原体Real-Time PCR方法的建立 被引量:2
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作者 杨建民 郝永新 +1 位作者 赵德明 何诚 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第1期84-90,共7页
利用SYBR Green建立了检测种特异性衣原体的Real-Time PCR方法。本方法应用衣原体种特异性的高度保守特异引物,能够扩增627bp特异片段;使用定量标准基因组DNA,本方法能准确检测最少250fg衣原体DNA。Real-TimePCR方法与免疫荧光方法... 利用SYBR Green建立了检测种特异性衣原体的Real-Time PCR方法。本方法应用衣原体种特异性的高度保守特异引物,能够扩增627bp特异片段;使用定量标准基因组DNA,本方法能准确检测最少250fg衣原体DNA。Real-TimePCR方法与免疫荧光方法的检测结果表明:检测4种衣原体临床样本,Real-TimePCR敏感性均在96%~98%;特异性均为100%;这两种方法符合率达97%以上(n=60);批内和批间重复性试验结果表明,本方法具有良好的准确性。本方法的建立对于快速、准确检测临床样本种特异性衣原体提供了一种切实有效的方法。 展开更多
关键词 SYBR Green 衣原体 real-time pcr 检测
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Real-time PCR方法和PCR方法检测虾白斑综合征病毒 被引量:2
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作者 熊炜 邱璐 +5 位作者 李健 蒋静 王巧全 李树清 杨锡佺 胡永强 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期138-141,共4页
由白斑综合征病毒引起的虾白斑综合征是国际兽医局(OIE)规定的必须上报的水生动物二类疫病。本研究首先通过设计新的PCR引物,提高了PCR检测白斑综合征病毒的阳性检出率。为进一步提高白斑综合征病毒检测的灵敏度,本研究采用TaqMan探针... 由白斑综合征病毒引起的虾白斑综合征是国际兽医局(OIE)规定的必须上报的水生动物二类疫病。本研究首先通过设计新的PCR引物,提高了PCR检测白斑综合征病毒的阳性检出率。为进一步提高白斑综合征病毒检测的灵敏度,本研究采用TaqMan探针技术建立了快速检测白斑综合征病毒的real-time PCR方法,通过与常规PCR方法比较,证实其检测灵敏度显著提高。 展开更多
关键词 白斑综合征病毒 real-time pcr pcr
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猪链球菌2型的Real-time PCR定量检测研究 被引量:6
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作者 蒋鲁岩 蔡潭溪 陈国强 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第9期843-845,850,共4页
目的 建立了基于TaqMan探针的Real-time PCR方法,实时、定量检测猪链球菌2型。针对GenBank公布的猪链球菌2型的csp2J基因序列设计一对引物和TaqMan探针,建立了Real-time PCR检测方法,制作标准曲线,定量检测猪链球菌2型。通过对6种... 目的 建立了基于TaqMan探针的Real-time PCR方法,实时、定量检测猪链球菌2型。针对GenBank公布的猪链球菌2型的csp2J基因序列设计一对引物和TaqMan探针,建立了Real-time PCR检测方法,制作标准曲线,定量检测猪链球菌2型。通过对6种细菌(9株菌株)的DNA进行扩增。结果所有4株猪链球菌2型均可产生扩增曲线,其他5株非猪链球菌2型均不产生扩增曲线。细菌纯培养物的检测敏感度为6~8CFU/PCR反应体系,相关系数均为0.99(r^2=0.99),整个试验可在1.5h内完成。建立的方法可用于猪链球菌2型的快速、定量检测。 展开更多
关键词 TAQMAN探针 real-time pcr 猪链球菌csp2J基因 定量检测
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猪PD-1及其配体PD-L1和PD-L2 SYBR Green Ⅰ Real-time PCR检测方法的建立及应用 被引量:2
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作者 岳锋 周娟娟 +3 位作者 朱艳平 李鹏 孙国鹏 王选年 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2016年第11期2892-2899,共8页
本试验旨在研究猪PD-1及其配体在疾病状态下的转录水平,建立检测猪PD-1及其配体的Real-time PCR方法。根据GenBank中猪PD-1、PD-L1和PD-L2基因序列,分别设计3对特异性引物,PCR扩增目的基因片段,回收目的基因片段与pMD18-T连接后转化至... 本试验旨在研究猪PD-1及其配体在疾病状态下的转录水平,建立检测猪PD-1及其配体的Real-time PCR方法。根据GenBank中猪PD-1、PD-L1和PD-L2基因序列,分别设计3对特异性引物,PCR扩增目的基因片段,回收目的基因片段与pMD18-T连接后转化至大肠杆菌DH5α感受态细胞中,提取重组质粒,经PCR及测序鉴定正确,作为标准品绘制标准曲线,并进行特异性和重复性检测。结果显示,Real-time PCR的Ct值与模板浓度对数呈良好的线性反比关系,相关系数R2>0.99,熔解曲线出现狭窄单一峰;Real-time PCR产物经琼脂糖凝胶电泳,呈单一目的条带,无引物二聚体,特异性强;组内和组间重复性检测结果显示,组内和组间的变异系数均小于3%,重复性好;用建立的Real-time PCR方法检测猪自然感染PCV2后PD-1及其配体转录水平,PD-L1和PD-L2转录水平极显著或显著升高(P<0.01;P<0.05),PD-1转录水平无显著变化(P>0.05)。本试验建立了检测猪PD-1、PDL1和PD-L2mRNA的Real-time PCR方法并进行了初步应用,为猪PD-1、PD-L1和PD-L2基因表达模式研究奠定基础。 展开更多
关键词 real-time pcr PD-1 PD-L1 PD-L2
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利用Real-time PCR对外周血白细胞中EIAV前病毒及血浆中病毒RNA含量的测定 被引量:2
16
作者 袁秀芳 周涛 +5 位作者 吴东来 涂亚斌 彭金美 温建新 仇华吉 童光志 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期241-244,249,共5页
利用Real_timePCR和Real_timeRT_PCR方法对马传染性贫血病(EIA)驴白细胞弱毒疫苗(DLA_EIAV)、DLA_EIAV感染性分子克隆衍生毒(vOK8226)、强弱毒嵌合病毒(vOKVltr)以及EIA强毒接种马后不同时期外周血白细胞中前病毒含量及血浆中病毒含量... 利用Real_timePCR和Real_timeRT_PCR方法对马传染性贫血病(EIA)驴白细胞弱毒疫苗(DLA_EIAV)、DLA_EIAV感染性分子克隆衍生毒(vOK8226)、强弱毒嵌合病毒(vOKVltr)以及EIA强毒接种马后不同时期外周血白细胞中前病毒含量及血浆中病毒含量进行了监测,结果发现直接攻击强毒的2匹马及1匹接种vOK8226后再用强毒攻击的马血浆中病毒含量快速升高,伴随着明显的临床反应,最后均以死亡结束。其它免疫接种马在攻击强毒后均获得保护,没有发病,马血浆中有低水平病毒存在,攻毒后3个月血浆中检测不到病毒,说明感染马体内病毒的大量增殖与疾病的进程有着直接的关系。而外周血白细胞中前病毒的含量在各试验马各时期均能检测到,说明EIAV以前病毒的形式潜伏在感染马体内,疫苗的免疫只能控制发病,而不能清除感染的病毒。 展开更多
关键词 马传染性贫血病毒 real-time pcr 前病毒
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鼠源TTV病毒海口株的基因组分析及real-time PCR检测方法的建立 被引量:1
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作者 吴悦 王珊珊 +12 位作者 王文琪 周换换 陈锦龙 易玉芳 马天明 崔秀吉 黄艺 王高玉 彭箬岩 胡小媛 何昌华 吕刚 尹飞飞 《海南医学院学报》 CAS 2019年第4期241-246,共6页
目的:对海南省海口市褐家鼠体内发现的鼠源torque teno virus(RoTTV)地方流行株RoTTV3-HMU1进行全基因组扩增测序及遗传进化分析,并建立一种基于SYBR GreenⅠ荧光染料检测RoTTV3病毒的real-time PCR检测方法。方法:基于高通量宏病毒组... 目的:对海南省海口市褐家鼠体内发现的鼠源torque teno virus(RoTTV)地方流行株RoTTV3-HMU1进行全基因组扩增测序及遗传进化分析,并建立一种基于SYBR GreenⅠ荧光染料检测RoTTV3病毒的real-time PCR检测方法。方法:基于高通量宏病毒组测序分析结果设计特异性扩增引物,采用PCR方法进行全基因组序列拼接。并根据RoTTV3保守序列通过生物信息学分析设计特异性引物,以构建的含ddrp基因的重组质粒为标准品,优化实验条件,建立RoTTV的real-time PCR检测方法。结果:成功拼接获得一株海南省海口市褐家鼠携带的RoTTV的基因组序列,遗传进化分析表明该病毒属于RoTTV3基因型。本实验建立RoTTV3 real-time PCR检测方法,标准曲线在1×10~2~1×10~8拷贝/μL浓度时呈现良好线性关系,其扩增系数为1.000,溶解曲线只出现1特异性峰,检测灵敏度达到10~2个拷贝。结论:本实验首次获得海口地区RoTTV基因组序列,并对其进行遗传进化分析,对RoTTV的起源及进化研究具有重要的意义。本实验建立的RoTTV3 real-time PCR检测方法灵敏度高、特异性好,为RoTTV3的流行病学调查奠定技术基础。 展开更多
关键词 鼠源Torque teno VIRUS 基因组扩增测序 real-time pcr检测
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土壤中烟草根黑腐病菌的real-time PCR分子检测
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作者 许大凤 叶磊 +3 位作者 张丽娜 韩永镜 周本国 檀根甲 《中国烟草学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第2期130-134,共5页
根据烟草根黑腐菌与其它近缘真菌在ITS序列上的差异,设计PCR检测引物TbF/TbR,并通过对各菌株基因组DNA扩增验证其特异性;以接种10倍浓度梯度的根黑腐菌孢子的土壤DNA为模板,建立土壤烟草根黑腐菌real-time PCR检测的标准曲线,得出每个... 根据烟草根黑腐菌与其它近缘真菌在ITS序列上的差异,设计PCR检测引物TbF/TbR,并通过对各菌株基因组DNA扩增验证其特异性;以接种10倍浓度梯度的根黑腐菌孢子的土壤DNA为模板,建立土壤烟草根黑腐菌real-time PCR检测的标准曲线,得出每个反应体系中分生孢子数目的对数(x)和对应的Ct值(y)之间呈线性关系:y=-1.5373x+24.955,R2=0.9909(P<0.01)。通过对5块烟田土壤烟草根黑腐菌检测和烟田烟草根黑腐病的调查,证实上述方法可以准确检测土壤中烟草根黑腐菌孢子数量。 展开更多
关键词 烟草根黑腐病 RDNA-ITS real-time pcr
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蝗虫微孢子TaqMan探针Real-time PCR检测新方法
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作者 扈鸿霞 郑秋英 +2 位作者 叶小芳 赵贝 季荣 《中国生物防治学报》 CSCD 北大核心 2017年第6期796-802,共7页
蝗虫微孢子已被广泛运用于蝗虫防治。本研究采用蝗虫微孢子保守性高的小核糖体亚单位RNA为目的基因,将其克隆到pMD18-T载体上构建重组质粒,制备质粒标准品。设计一对特异性引物和TaqMan探针,并对引物浓度、探针浓度分别进行了优化,建立... 蝗虫微孢子已被广泛运用于蝗虫防治。本研究采用蝗虫微孢子保守性高的小核糖体亚单位RNA为目的基因,将其克隆到pMD18-T载体上构建重组质粒,制备质粒标准品。设计一对特异性引物和TaqMan探针,并对引物浓度、探针浓度分别进行了优化,建立了蝗虫微孢子TaqMan实时荧光定量PCR检测方法。该检测方法的灵敏度达1.29×105 copies/L,各浓度质粒标准品的组内和组间重复的变异系数均小于1%。这里建立的蝗虫微孢子TaqMan探针荧光定量PCR检测方法较快速、简便和准确,适用于生产中蝗虫微孢子的快速检测。 展开更多
关键词 蝗虫微孢子 real-time pcr TAQMAN探针
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免疫捕捉real-time PCR对蚜虫中CMV检测体系的建立与应用
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作者 宋丽云 杨金广 +6 位作者 李锡宏 宋玉川 张长华 战徊旭 申莉莉 钱玉梅 王凤龙 《中国烟草科学》 CSCD 2013年第3期105-109,共5页
由黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus,CMV)引起的病毒病是烟草上最主要的病害之一,高虫口密度的带毒蚜虫的迁入是烟草上CMV病害发生的主要致病因子。本研究结合当前CMV的两个检测体系——ELISA和real-time RT-PCR,通过CMV抗血清与带... 由黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus,CMV)引起的病毒病是烟草上最主要的病害之一,高虫口密度的带毒蚜虫的迁入是烟草上CMV病害发生的主要致病因子。本研究结合当前CMV的两个检测体系——ELISA和real-time RT-PCR,通过CMV抗血清与带毒蚜虫研磨液中的病毒粒体结合反应,病毒复合体粘附在PCR管壁上,然后直接进行反转录反应,随后进行real-time PCR检测,建立了免疫捕捉real-time RT-PCR(Immunocapture real-time RT-PCR)检测单头蚜虫体内CMV的实时定量检测技术,与普通real-time RT-PCR和ELISA相比,灵敏性和特异性显著提高。该方法无需RNA提取等步骤,可以有效地减少样品操作过程的污染和蛋白、多糖以及酚类物质等杂质的影响,能够对微量CMV病毒粒体进行准确、快速、特异和灵敏的定量检测,对烟草病毒病的预测预报、无毒种苗的生产和病害防治都具有重要的科学意义。 展开更多
关键词 免疫捕捉real-time pcr 黄瓜花叶病毒(CMV) 蚜虫
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