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植物中的钙依赖蛋白激酶(CDPK)的结构特征和功能研究进展 被引量:12
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作者 姜珊珊 张丹 +2 位作者 孔祥培 周严 李德全 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第6期12-19,共8页
Ca2+是植物中重要的第二信使,细胞中的钙信号经钙传感蛋白(CaMs、CaMLs、CBLs和CDPKs)传递到下游组分(转录因子,NADPH氧化酶基因等),引起相关基因的表达,使植物对生物或非生物胁迫作出响应。钙依赖蛋白激酶(CDPKs)是在植物及原生动物中... Ca2+是植物中重要的第二信使,细胞中的钙信号经钙传感蛋白(CaMs、CaMLs、CBLs和CDPKs)传递到下游组分(转录因子,NADPH氧化酶基因等),引起相关基因的表达,使植物对生物或非生物胁迫作出响应。钙依赖蛋白激酶(CDPKs)是在植物及原生动物中发现的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶,在Ca2+介导的信号途径中起重要作用。CDPKs是由多基因家族编码,分属4个亚家族,各亚族成员具有相同或不同的表达模式、亚细胞定位、底物特异性、功能各异或冗余等特性。综述CDPKs的结构特征、表达模式、定位、调控、体内外底物、抑制剂,以及在响应生物及非生物胁迫中的作用等方面的研究进展,旨在探讨CDPKs的功能及其调控机制。 展开更多
关键词 钙依赖蛋白激酶(cdpks) 结构特征 调控机制 生物学功能
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梨CDPK基因家族全基因组序列鉴定分析 被引量:11
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作者 许园园 李晓刚 +2 位作者 李慧 蔺经 常有宏 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2015年第3期659-666,共8页
CDPK是植物特有的一类丝氨酸/苏氨酸型蛋白激酶,在介导植物生育信号和逆境信号转导中具有重要作用。为揭示CDPK基因在梨生长发育与抗逆防御机制中的作用,本研究通过生物信息学手段,结合梨基因组注释信息,鉴定梨基因组中CDPK家族基... CDPK是植物特有的一类丝氨酸/苏氨酸型蛋白激酶,在介导植物生育信号和逆境信号转导中具有重要作用。为揭示CDPK基因在梨生长发育与抗逆防御机制中的作用,本研究通过生物信息学手段,结合梨基因组注释信息,鉴定梨基因组中CDPK家族基因成员,利用MEGA6.0程序进行多序列比对、分类并构建系统进化树;利用per1程序以及GSDS工具进行基因结构与保守性分析,为植物CDPK基因功能分析与利用提供依据。结果表明,本研究成功鉴定出26个CDPK家族成员,根据系统发育树分析,所有PbCDPK被分为4类;基因结构预测结果表明,大多数PbCDPK均含有6~7个内含子;且预测的PbCDPK氨基酸序列绝大多数含4个EF-hand功能域;为了深入分析梨与其他物种的同源进化关系,构建了梨与拟南芥、水稻的CDPK基因系统进化树,进化树聚类分析结果将所有的CDPK蛋白分为四类。综上所述,目前已初步获得26个梨CDPK基因,为在基因组范围内研究CDPK基因在梨生长发育与逆境响应中的功能奠定了基础。 展开更多
关键词 cdpk家族基因 全基因组鉴定 系统进化
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钙依赖型蛋白激酶(CDPKs)在植物中的生理功能 被引量:12
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作者 倪天华 魏幼璋 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2002年第6期241-246,共6页
 简要介绍了钙依赖型蛋白激酶(Calcium-dependentProteinKinases,CDPKs)的结构特点及家族成员,重点对CDPKs在植物环境胁迫、防御反应、生长发育、离子通道调节和激素信号等方面的生理功能研究进展进行了综述和讨论,并展望了该领域的研...  简要介绍了钙依赖型蛋白激酶(Calcium-dependentProteinKinases,CDPKs)的结构特点及家族成员,重点对CDPKs在植物环境胁迫、防御反应、生长发育、离子通道调节和激素信号等方面的生理功能研究进展进行了综述和讨论,并展望了该领域的研究前景。 展开更多
关键词 钙依赖型蛋白激酶 生理功能 植物 cdpkS 激素信号
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小桐子CDPK及相关激酶基因家族的全基因组鉴定及表达分析 被引量:2
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作者 王海波 郭俊云 +4 位作者 辛胡 刘潮 高永 代冬琴 唐利洲 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期105-116,共12页
基于小桐子基因组数据库,在全基因组水平对小桐子CDPK及相关激酶基因家族进行鉴定,并对其系统进化、基因结构、保守结构域、染色体定位以及器官与低温胁迫表达进行分析,为深入开展小桐子CDPK及相关激酶基因的功能鉴定及其在小桐子遗传... 基于小桐子基因组数据库,在全基因组水平对小桐子CDPK及相关激酶基因家族进行鉴定,并对其系统进化、基因结构、保守结构域、染色体定位以及器官与低温胁迫表达进行分析,为深入开展小桐子CDPK及相关激酶基因的功能鉴定及其在小桐子遗传改良中的应用提供依据。利用CDPK结构域的隐马尔可夫模型对小桐子蛋白质数据库进行相似性检索,经过Pfam与CDD在线工具的验证获得小桐子CDPK及相关激酶基因家族成员。利用不同的工具对CDPK及相关激酶基因进行生物信息学对比分析。通过小桐子器官与低温表达谱数据进行CDPK及相关激酶基因的表达分析。小桐子基因组中共检索到17个CDPK基因、5个CRK基因、2个PPCK基因、4个PEPRK基因以及1个CCaMK基因,各基因家族成员的基因长度、蛋白质等电点及亚细胞定位等理化参数具有家族特异性。序列比对与系统进化分析显示,5个基因家族都单独聚类,而CDPK与PEPRK基因家族又分别聚类为4个与2个亚族,且鉴定到小桐子CDPK家族成员的N-端可变区、激酶结构区、自抑区及EF-hand调控区4个保守结构域以及其他激酶成员的激酶结构域。同时,分别有21个与24个CDPK及相关激酶可能发生N-豆蔻酰化与N-十六烷酰化的修饰。染色体定位表明,小桐子CDPK及相关激酶基因不均匀地分布于10条染色体上,且存在JcCDPK7/JcCDPK9串联复制现象。转录组表达分析表明,29个CDPK及相关激酶基因中,有24个基因在叶片、根及种子中都有表达,而JcCDPK3、JcCDPK11、JcCRK3及JcCCaMK属于低温诱导高表达基因,与小桐子的抗冷性直接相关。 展开更多
关键词 小桐子 CA^2+ 蛋白激酶 cdpk基因 基因家族 表达分析
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高等植物中的CDPK及其生理生化功能 被引量:5
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作者 杨洪强 梁小娥 《山东农业大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2003年第2期284-288,共5页
蛋白激酶主要催化蛋白质的磷酸化作用 ,参与细胞的信号识别与转导。CDPK是一类钙依赖钙调素不依赖的蛋白激酶 (Calcium -dependentandcalmodulin -independentproteinkinase) ,与细胞Ca2 + 信号进一步传递有密切关系。
关键词 高等植物 cdpk 生理生化功能 磷酸化作用 信号识别 蛋白激酶
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柠条锦鸡儿CkCDPK基因的克隆、表达分析及载体构建 被引量:2
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作者 贾会丽 郭继承 +5 位作者 吴欣明 王运琦 刘建宁 方志红 石永红 董宽虎 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2019年第3期43-51,共9页
钙依赖蛋白激酶作为一个关键的信号传导器,通过调控和参与植物体内的代谢途径等方式在植物抵御逆境胁迫过程中发挥着重要作用。为了探索柠条锦鸡儿相关基因的功能,本研究利用同源克隆的方法,从柠条锦鸡儿中克隆了1个CDPK类基因的CDS,命... 钙依赖蛋白激酶作为一个关键的信号传导器,通过调控和参与植物体内的代谢途径等方式在植物抵御逆境胁迫过程中发挥着重要作用。为了探索柠条锦鸡儿相关基因的功能,本研究利用同源克隆的方法,从柠条锦鸡儿中克隆了1个CDPK类基因的CDS,命名为CkCDPK。通过测序和生物信息学分析,结果显示,该基因包含1710bp的开放阅读框,编码570个氨基酸,分子质量为64.03ku,蛋白质等电点(PI)为9.12。结构分析显示,CkCDPK含有N端可变区、蛋白激酶区、4个EF手型结构和类似钙调素等结构域。利用实时荧光定量PCR检测了CkCDPK基因在不同逆境胁迫下的表达量,结果显示,NaCl胁迫和干旱胁迫下该基因的表达量呈现出单峰趋势,其中,盐胁迫6h、干旱胁迫4h表达量最高,外源ABA诱导下该基因的表达量基本呈逐渐上升趋势。表明该基因可能参与了柠条锦鸡儿的抗逆性调控。构建植物超表达载体pCAMBIA3301-CkCDPK,可为进一步研究CkCDPK基因在柠条锦鸡儿抗逆性调控中的作用奠定基础。 展开更多
关键词 柠条锦鸡儿 钙依赖蛋白激酶(cdpk) 逆境胁迫 载体构建
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杜氏盐藻CDPK基因的克隆及其序列的分析 被引量:2
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作者 段金秀 郭丽 +3 位作者 曹致中 张向东 王小行 郭蜀光 《草业科学》 CAS CSCD 2006年第9期51-55,共5页
首先对拟南芥Arabidopsis thaliana等其他物种CDPK基因的同源序列进行相似性分析,设计1对简并引物,利用RT-PCR技术获得一个长636bp的片段,经克隆测序分析发现其同拟南芥的CDPK基因有60.3%的相似性,然后再以此片段为模板设计引物... 首先对拟南芥Arabidopsis thaliana等其他物种CDPK基因的同源序列进行相似性分析,设计1对简并引物,利用RT-PCR技术获得一个长636bp的片段,经克隆测序分析发现其同拟南芥的CDPK基因有60.3%的相似性,然后再以此片段为模板设计引物,通过RACE技术构建杜氏盐藻Dunaliella salina CDPK基因的全长序列。在GenBank中进行Blastp检索,发现该片段与许多植物CDPK基因具有较高的相似性(50.2%~73.0%)。 展开更多
关键词 同源克隆 简并引物 钙依赖蛋白激酶 RACE
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钙依赖蛋白激酶(CDPKs)在植物钙信号转导中的生理功能 被引量:3
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作者 雷志华 陈军营 陈新建 《福建林业科技》 北大核心 2007年第3期244-249,254,共7页
介绍了钙依赖蛋白激酶(CDPKs)的结构特点以及酶活性调节,从激素信号、生长发育、细胞骨架、胁迫信号、防御反应、碳氮代谢以及离子通道调节几个方面阐述了CDPKs在植物钙信号转导中的生理功能,并对该领域的研究前景作了展望。
关键词 蛋白激酶 cdpkS 信号转导 植物钙
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小麦幼胚脱分化过程中CDPKs基因的差异表达分析
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作者 雷志华 崔琰 +2 位作者 赵一丹 陈新建 陈军营 《麦类作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第4期579-582,共4页
为了解研究蛋白激酶(CDPKs)在小麦幼胚脱分化过程中的作用,利用Affymetrix小麦基因芯片检测了小麦幼胚脱分化过程中CDPKs基因的表达变化。结果表明,在检测到的16个CDPKs基因中,有13个基因在小麦幼胚脱分化过程中发生了有意义的变化,... 为了解研究蛋白激酶(CDPKs)在小麦幼胚脱分化过程中的作用,利用Affymetrix小麦基因芯片检测了小麦幼胚脱分化过程中CDPKs基因的表达变化。结果表明,在检测到的16个CDPKs基因中,有13个基因在小麦幼胚脱分化过程中发生了有意义的变化,其中上调表达基因有5个,上调2-6.5倍,下调表达基因有8个,下调2-16倍。根据已知CDPKs生物功能和它们表达变化趋势以及这些变化趋势与脱分化过程中的吻合程度分析结果,推测CPK6、BJ286005、CK211705、BJ274015和BJ246895参与了小麦幼胚脱分化过程的启动和愈伤组织的形成。 展开更多
关键词 小麦 蛋白激酶(cdpks) 幼胚脱分化 基因表达
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玉米ZmRBOHD1和ZmCDPK32的蛋白相互作用研究
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作者 李洁 初智霖 +1 位作者 李小蒙 周晓今 《北京师范大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期629-636,共8页
为探索玉米呼吸爆发氧化酶(RBOH)与钙依赖型蛋白激酶(CDPK)协同调控花粉管极性生长的机制,通过蛋白保守结构域分析获得14个ZmRBOH家族基因,且利用转录组数据分析了ZmRBOH的时空表达模式.结果显示,ZmRBOHD1和ZmRBOHD2在玉米成熟花粉中特... 为探索玉米呼吸爆发氧化酶(RBOH)与钙依赖型蛋白激酶(CDPK)协同调控花粉管极性生长的机制,通过蛋白保守结构域分析获得14个ZmRBOH家族基因,且利用转录组数据分析了ZmRBOH的时空表达模式.结果显示,ZmRBOHD1和ZmRBOHD2在玉米成熟花粉中特异表达.选择花粉特异表达的ZmRBOHD1和功能已知的花粉管极性生长调节因子ZmCDPK32开展蛋白相互作用研究,结论有如下2点:1)通过瞬时表达ZmRBOHD1-GFP融合蛋白证明ZmRBOHD1定位于细胞膜;2)利用酵母双杂交和双分子荧光互补技术证实ZmRBOHD1可以和ZmCDPK32相互作用,并且生物信息学分析发现ZmRBOHD1具有潜在的CDPK磷酸化靶点.结果表明,ZmCDPK32可能通过与ZmRBOHD1的相互作用协同调控玉米花粉管发育,这为深入探究花粉管极性生长的分子机制奠定了基础. 展开更多
关键词 玉米 呼吸爆发氧化酶 钙依赖型蛋白激酶 酵母双杂交 双分子荧光互补
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钙依赖蛋白激酶(CDPKs)介导植物信号转导的分子基础 被引量:9
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作者 王娇娇 韩胜芳 +3 位作者 李小娟 谷俊涛 路文静 肖凯 《草业学报》 CSCD 北大核心 2009年第3期241-250,共10页
钙依赖蛋白激酶(CDPKs)是生长发育信号和逆境信号诱发的钙信号的重要信号传递体,在调控植物信号转导途径中下游基因的表达、生化代谢、离子和水分跨膜运输等生物学过程中具有重要作用。本研究对植物种属CDPK的结构特点、CDPK在植株体内... 钙依赖蛋白激酶(CDPKs)是生长发育信号和逆境信号诱发的钙信号的重要信号传递体,在调控植物信号转导途径中下游基因的表达、生化代谢、离子和水分跨膜运输等生物学过程中具有重要作用。本研究对植物种属CDPK的结构特点、CDPK在植株体内的分布特征、CDPK生理生化特性及生化反应调控特性、CDPK在信号转导中的作用,以及CDPK在植株体内的生物学功能进行了概述。旨在为今后牧草作物CDPK的鉴定及其介导的信号转导机制的研究提供参考依据。 展开更多
关键词 钙依赖蛋白激酶(cdpks) 结构 钙信号 信号转导 生物学功能
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两种不同生境植物棉花与雪莲CDPK1基因的克隆及生物信息学分析 被引量:2
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作者 田晓涵 刘玉玲 +4 位作者 李永梅 李锦 庞学兵 祝建波 朱新霞 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2016年第5期1005-1012,共8页
为了研究两种不同生境植物钙依赖性蛋白激酶基因1(CDPK1)的差异,分别从冷敏感作物陆地棉和高耐寒植物天山雪莲中克隆得到GhCDPK1和SikCDPK1基因。通过生物信息学分析发现,GhCDPK1和SikCDPK1的开放阅读框长度分别为1 764 bp和1 716 bp,... 为了研究两种不同生境植物钙依赖性蛋白激酶基因1(CDPK1)的差异,分别从冷敏感作物陆地棉和高耐寒植物天山雪莲中克隆得到GhCDPK1和SikCDPK1基因。通过生物信息学分析发现,GhCDPK1和SikCDPK1的开放阅读框长度分别为1 764 bp和1 716 bp,各编码587和571个氨基酸。蛋白质表现为弱酸性,且不稳定,亲水;二级结构中以无规则卷曲和α-螺旋为主,三级结构同源建模成功;无跨膜结构域和信号肽,有多个磷酸化位点,但数量存在差异;均具有典型的CDPK保守结构域。GhCDPK1和SikCDPK1氨基酸序列同源性为79.9%,二者明显的区别在于GhCDPK1含有4个EF-hand基序,但SikCDPK1只存在2个EF-hand基序。进化分析结果表明,GhCDPK1与可可CDPK1亲缘关系最近,SikCDPK1与菊花CDPK2亲缘关系最近。 展开更多
关键词 钙依赖性蛋白激酶(cdpk) 生物信息学 序列分析 结构预测
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陆地棉钙依赖蛋白激酶GhCDPK28-A10参与抗黄萎病的功能分析 被引量:3
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作者 邵武奎 赵准 +6 位作者 胡文冉 郝晓燕 高升旗 李建平 陈果 刘晓东 黄全生 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2023年第1期17-28,共12页
【目的】解析GhCDPK28-A10在棉花黄萎病反应中的作用机制,并为棉花抗病育种提供基因资源。【方法】从棉花基因组数据库获得Gh CDPK28-A10基因同源序列,进行生物信息学分析。采用实时荧光定量聚合酶链式反应(real-time quantitative poly... 【目的】解析GhCDPK28-A10在棉花黄萎病反应中的作用机制,并为棉花抗病育种提供基因资源。【方法】从棉花基因组数据库获得Gh CDPK28-A10基因同源序列,进行生物信息学分析。采用实时荧光定量聚合酶链式反应(real-time quantitative polymerase chain reaction,qRT-PCR)方法检测在经大丽轮枝菌(Verticillium dahliae)、茉莉酸甲酯(methyl jasminate,MeJA)、水杨酸(salicylic acid,SA)或H_(2)O_(2)处理的棉株中GhCDPK28-A10基因的表达量变化。通过病毒诱导的基因沉默(virus-induced gene silencing,VIGS)技术验证GhCDPK28-A10在棉花抗黄萎病中的作用。【结果】进化树和基因结构分析表明,陆地棉中GhCDPK28-A10的6个同源蛋白具有相似数量的基序和CDPK家族典型的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶结构域;启动子区域的序列分析发现GhCDPK28-A10包含响应茉莉酸(jasmonic acid,JA)的顺式作用元件。组织特异性表达分析表明GhCDPK28-A10在根、茎和真叶中均表达,且在真叶中表达水平最高。在大丽轮枝菌、MeJA和H_(2)O_(2)胁迫下,GhCDPK28-A10的表达量显著升高。VIGS沉默Gh CDPK28-A10的棉株中抗病相关基因PR1、NPR1、PR4表达增强;JA合成负调控基因JAZ1表达量降低,说明随着CDPK28-A10表达水平的降低,JAZ1对JA合成的抑制作用减弱,活性氧富集,进而增强棉株的黄萎病抗性。【结论】GhCDPK28-A10通过调控防御相关基因的表达,负向调控棉花对黄萎病的抗性反应,是提高棉花黄萎病抗性的候选基因。 展开更多
关键词 棉花 黄萎病 钙依赖性蛋白激酶 抗病基因 病毒诱导的基因沉默
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植物钙依赖性蛋白激酶及其相关蛋白激酶(CDPKs/CRKs)的研究进展 被引量:6
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作者 何乐平 张蕾 《安徽农业科学》 CAS 2020年第18期26-30,51,共6页
作为细胞第二信使,Ca^2+协调着植物对各种生理反应的感知。钙离子传感器向下游传递钙信号并引发级联反应,调控植物生长发育以及对环境的响应等过程。钙依赖性蛋白激酶在Ca^2+介导的信号转导中起重要作用。综述了近年来植物CDPKs/CRKs相... 作为细胞第二信使,Ca^2+协调着植物对各种生理反应的感知。钙离子传感器向下游传递钙信号并引发级联反应,调控植物生长发育以及对环境的响应等过程。钙依赖性蛋白激酶在Ca^2+介导的信号转导中起重要作用。综述了近年来植物CDPKs/CRKs相关研究进展,包括分子结构和作用机制、表达模式、亚细胞定位和生物学功能,旨在为CDPKs/CRKs相关研究提供参考。 展开更多
关键词 钙依赖性蛋白激酶 钙依赖性蛋白激酶相关蛋白激酶 调控机制 生物学功能
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组蛋白激活拟南芥CDPK催化CaMBP10的体外磷酸化反应
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作者 王立强 田晓龙 +2 位作者 赵静 胖铁良 李翠凤 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第7期643-648,共6页
植物转脂蛋白(plant lipid transfer proteins,LTPs)是高等植物中广泛存在的多基因编码的小分子碱性蛋白.本研究室已经证明白菜和豌豆LTPs可分别被内源胞浆可溶性和膜结合钙依赖性蛋白激酶(calcium-dependent protein kinase,CDPK)磷酸... 植物转脂蛋白(plant lipid transfer proteins,LTPs)是高等植物中广泛存在的多基因编码的小分子碱性蛋白.本研究室已经证明白菜和豌豆LTPs可分别被内源胞浆可溶性和膜结合钙依赖性蛋白激酶(calcium-dependent protein kinase,CDPK)磷酸化.为深入研究CDPK对白菜钙调素结合蛋白10(calmodulin-binding protein-10,CaMBP10)的磷酸化性质及特征,本文从拟南芥可溶性蛋白粗提物中检测到1个分子量约为54 kD的CDPK对CaMBP10有磷酸化作用.研究表明,组蛋白可增强CDPK对CaMBP10的磷酸化活性,促进磷酸化进程.而且组蛋白和Ca2+对CDPK具有协同调节效应,二者共同作用时比Ca2+单独作用时,激酶的活力增强约12倍.此外,不同组蛋白对CDPK的激活能力不同,组蛋白1对该激酶活性的激活能力要比组蛋白3高约8倍. 展开更多
关键词 钙依赖性蛋白激酶 组蛋白 植物转脂蛋白 磷酸化作用
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植物中钙依赖蛋白激酶的研究进展 被引量:25
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作者 麻浩 王爽 周亚丽 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第4期565-572,共8页
钙是植物必需的大量元素之一,同时钙离子(Ca^(2+))是细胞信号转导的第二信使。钙依赖蛋白激酶(calcium-dependent protein kinase,CDPK)作为Ca^(2+)的感受器普遍存在于植物和部分原生动物中,是植物特有的一类丝氨酸/苏氨酸型蛋白激酶,... 钙是植物必需的大量元素之一,同时钙离子(Ca^(2+))是细胞信号转导的第二信使。钙依赖蛋白激酶(calcium-dependent protein kinase,CDPK)作为Ca^(2+)的感受器普遍存在于植物和部分原生动物中,是植物特有的一类丝氨酸/苏氨酸型蛋白激酶,参与了多种Ca^(2+)介导的信号通路,在植物发育信号和逆境信号转导中具有重要作用。本文概述了钙依赖蛋白激酶在植物体内的分布、结构、底物、功能以及大豆CDPK的研究进展,旨在为今后培育抗逆植物品种提供参考依据。 展开更多
关键词 植物 钙依赖蛋白激酶 发育信号 逆境信号 研究进展
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甘蔗钙依赖蛋白激酶基因克隆与序列分析 被引量:3
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作者 曹辉庆 蒋胜理 +7 位作者 黄诚梅 邓智年 吴凯朝 徐林 陆珍 陈丽君 李秋凤 魏源文 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第4期574-580,共7页
【目的】克隆甘蔗钙依赖蛋白激酶基因(ScCDPK1),为其功能解析和育种利用打下基础。【方法】根据甘蔗cDNA文库中的CDPK基因序列信息设计引物,利用RT-PCR克隆ScCDPK1基因,并采用在线生物信息学分析软件对其推导蛋白的理化性质、跨膜结构... 【目的】克隆甘蔗钙依赖蛋白激酶基因(ScCDPK1),为其功能解析和育种利用打下基础。【方法】根据甘蔗cDNA文库中的CDPK基因序列信息设计引物,利用RT-PCR克隆ScCDPK1基因,并采用在线生物信息学分析软件对其推导蛋白的理化性质、跨膜结构、信号肽及保守结构域等进行预测分析。【结果】克隆获得的ScCDPK1基因完整编码区大小1650 bp,编码549个氨基酸,相对分子量61.971 kD,等电点(pI)6.78,不稳定指数35.63。同源性和遗传进化树分析结果显示,ScCDPK1基因与小麦TaCPK7基因亲缘关系最近,同源性达88%;ScCDPK1蛋白与其他已知CDPK蛋白一致,具有CDPKs家族特有的4个保守区域(可变区、蛋白激酶区、自抑制区和钙离子结合区),其二级结构主要由α螺旋(42.80%)和无规则卷曲(32.97%)构成;蛋白功能分类预测结果显示,ScCDPK1蛋白是一种阳离子通道蛋白,可能参与植物胁迫应答、信号转导和翻译调控等生物反应。【结论】ScCDPK1基因编码的蛋白与其他已知CDPK蛋白一致,具有CDPKs家族特有的4个保守区域,是一种阳离子通道蛋白。 展开更多
关键词 甘蔗 钙依赖蛋白激酶基因(cdpk) 克隆 序列分析 生物信息学预测
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钙依赖型蛋白激酶在ABA调控的杨树气孔运动中的作用 被引量:3
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作者 周晓阳 张辉 《科学技术与工程》 2004年第2期80-83,共4页
群众杨叶片下表皮经过植物激素脱落酸(ABA)和钙依赖型蛋白激酶抑制剂三氟拉嗪(TFP)处理后,在扫描电镜下观察了气孔开度的变化,并用透射电镜结合X-射线能谱显微分析技术,对保卫细胞内的K^+、Ca^(2+)含量进行了研究。结果表明:ABA几乎完... 群众杨叶片下表皮经过植物激素脱落酸(ABA)和钙依赖型蛋白激酶抑制剂三氟拉嗪(TFP)处理后,在扫描电镜下观察了气孔开度的变化,并用透射电镜结合X-射线能谱显微分析技术,对保卫细胞内的K^+、Ca^(2+)含量进行了研究。结果表明:ABA几乎完全抑制光照条件下叶片气孔的开放,而同时加入TFP则显著降低ABA对气孔开放的抑制作用。在ABA作用下,保卫细胞细胞质中的K^+含量下降但Ca^(2+)含量增加;而同时加入TFP则可逆转ABA对K^+、Ca^(2+)的作用。研究结果证明,钙依赖型蛋白激酶可能通过对保卫细胞内K^+、Ca^(2+)的调节作用而介导了ABA调控气孔运动的信号转导过程。 展开更多
关键词 钙依赖型蛋白激酶 脱落酸 x-射线显微分析 调控 杨树 气孔运动
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