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Expression of transcription factors in polycystic ovary syndrome
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作者 ZHANG Qi ZHU Shujuan JIANG Bin 《中南大学学报(医学版)》 北大核心 2025年第3期447-456,共10页
Objective:Polycystic ovary syndrome(PCOS)is a common endocrine disorder that affects women’s health.This study aims to investigate gene and transcription factor(TF)expression differences between PCOS patients and hea... Objective:Polycystic ovary syndrome(PCOS)is a common endocrine disorder that affects women’s health.This study aims to investigate gene and transcription factor(TF)expression differences between PCOS patients and healthy individuals using bioinformatics approaches,and to verify the function of key transcription factors,with the goal of providing new insights into the pathogenesis of PCOS.Methods:Differentially expressed genes(DEGs)and differentially expressed transcription factors(DETFs)between PCOS patients and controls were identified from the RNA sequencing dataset GSE168404 using bioinformatics methods.Functional enrichment analysis was performed using Gene Ontology(GO)and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)databases.The expression and function of core transcription factors were further validated in ovarian tissues of PCOS model mice and control mice using Western blotting and reverse transcription quantitative polymerase chain reaction(RTqPCR).Results:A total of 332 DEGs were identified between PCOS patients and controls,including 259 upregulated and 73 downregulated genes in the PCOS group.19 DETFs were further screened,of which 16 were upregulated and 3 were downregulated in PCOS.The upregulated DETFs(including TFCP2L1,DACH1,ESR2,AFF3,SMAD9,ZNF331,HOPX,ATOH8,HIF3α,DPF3,HOXC4,HES1,ID1,JDP2,SOX4,and ID3)were primarily associated with lipid metabolism,development,and cell adhesion.Protein and mRNA expression analysis in PCOS model mice revealed significantly decreased levels of hypoxia-inducible factor(HIF)1αand HIF2α,and significantly increased expression of HIF3αcompared to control mice(all P<0.001).Conclusion:Significant differences in gene and TF expression exist between PCOS patients and healthy individuals.HIF-3αmay play a crucial role in PCOS and could serve as a novel biomarker for diagnosis and a potential therapeutic target. 展开更多
关键词 polycystic ovary syndrome transcription factor hypoxia-inducible factors regulatory networks BIOINFORMATICS
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Roles of NAC transcription factors in cotton
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作者 XU Yuewei ZHAO Yunlei +3 位作者 CHEN Wei SANG Xiaohui ZHAO Pei WANG Hongmei 《Journal of Cotton Research》 CAS 2024年第3期289-301,共13页
Climate deterioration,water shortages,and abiotic stress are the main threats worldwide that seriously affect cotton growth,yield,and fiber quality.Therefore,research on improving cotton yield and tolerance to biotic ... Climate deterioration,water shortages,and abiotic stress are the main threats worldwide that seriously affect cotton growth,yield,and fiber quality.Therefore,research on improving cotton yield and tolerance to biotic and abiotic stresses is of great importance.The NAC proteins are crucial and plant-specific transcription factors(TFs)that are involved in cotton growth,development,and stress responses.The comprehensive utilization of cotton NAC TFs in the improvement of cotton varieties through novel biotechnological methods is feasible.Based on cotton genomic data,genome-wide identification and analyses have revealed potential functions of cotton NAC genes.Here,we comprehensively summarize the recent progress in understanding cotton NAC TFs roles in regulating responses to drought,salt,and Verticillium wilt-related stresses,as well as leaf senescence and the development of fibers,xylem,and glands.The detailed regulatory network of NAC proteins in cotton is also elucidated.Cotton NAC TFs directly bind to the promoters of genes associated with ABA biosynthesis and secondary cell-wall formation,participate in several biological processes by interacting with related proteins,and regulate the expression of downstream genes.Studies have shown that the overexpression of NAC TF genes in cotton and other model plants improve their drought or salt tolerance.This review elucidates the latest findings on the functions and regulation of cotton NAC proteins,broadens our understanding of cotton NAC TFs,and lays a fundamental foundation for further molecular breeding research in cotton. 展开更多
关键词 COTTON NAC transcription factor STRESS Regulatory network
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Regulatory Network of Transcription Factors in Response to Drought in Arabidopsis and Crops 被引量:2
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作者 Chen Li-miao Li Wen-bin Zhou Xin-an 《Journal of Northeast Agricultural University(English Edition)》 CAS 2012年第3期1-13,共13页
Drought is one of the most important environmental constraints limiting plant growth, development and crop yield. Many drought-inducible genes have been identified by molecular and genomic analyses in Arabidopsis, ric... Drought is one of the most important environmental constraints limiting plant growth, development and crop yield. Many drought-inducible genes have been identified by molecular and genomic analyses in Arabidopsis, rice and other crops. To better understand reaction mechanism of plant to drought tolerance, we mainly focused on introducing the research of transcription factors (TFs) in signal transduction and regulatory network of gene expression conferring drought. A TF could bind multiple target genes to increase one or more kinds of stress tolerance. Sometimes, several TFs might act together with a target gene. So drought-tolerance genes or TFs might respond to high-salinity, cold or other stresses. The crosstalk of multiple stresses signal pathways is a crucial aspect of understanding stress signaling. 展开更多
关键词 drought stress stress tolerance transcription factor gene expression signal pathway
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INHIBITION OF C-MYC PROTEIN EXPRESSION AND CELL PROLIFERATION IN HL-60 CELLS BY ANTISENSE TRANSCRIPTS TO c-myc
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作者 郝秀娟 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 1995年第4期370-375,共6页
The human promyelocytic cell line HL-60 overexpresses the c-myc protooncogene. Plasmid pDACx carrying antisense human c-myc DNA and neo gene was introduced into HL-60 cells with lipofectin reagent. Upon DNA entering t... The human promyelocytic cell line HL-60 overexpresses the c-myc protooncogene. Plasmid pDACx carrying antisense human c-myc DNA and neo gene was introduced into HL-60 cells with lipofectin reagent. Upon DNA entering the tar-geted celis and expression of antisense transcripts to c-myc, C-MYC protein level, cell proliferation and colony-forming potentiality were all definitely inhibited. 展开更多
关键词 C-MYC PROTOONCOGENE ANTISENSE transcript gene transfer
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An Integrated Genetic,Physical and Transcript Map of Homoeologous Chromosomes 12 and 26 in Upland Cotton(Gossypium hirsutum L.) 被引量:2
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作者 KOHEL Russell J CHO Jaemin TOMKINS Jeffrey YU John Z 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2008年第S1期22-,共1页
While Upland cotton(Gossypium hirsutum L.) represents 95% of the world production,its genetic improvement is hindered by the shortage of effective genomic tools and resources.The
关键词 An Integrated Genetic Physical and transcript Map of Homoeologous Chromosomes 12 and 26 in Upland Cotton Gossypium hirsutum L
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C-myc antisense transcripts acceleratec differentiation and start apoptosis in human leukemia cells
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作者 X.J. Hao, P.M. Tang, D.L. Du, N. Mao, M. Wu Beijing Institute of Basic Medical Sciences, Beijing100850 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 1997年第3期324-324,共1页
To demonstrate that low c-myc expression mightexert the effects on differentiation and survival ofleukemic cells, antisense technique was used. Human 2. 7kb c-myc DNA fragment containing exon l, intron 1 and127nt exon... To demonstrate that low c-myc expression mightexert the effects on differentiation and survival ofleukemic cells, antisense technique was used. Human 2. 7kb c-myc DNA fragment containing exon l, intron 1 and127nt exon 2 was ligated into retroviral vector pDOR-neoin reverse direction. This recombinant plasmid 展开更多
关键词 ANTISENSE transcriptS PLASMID TRANSFECTION DNA INTRON exogenous STAINING morphological RNA
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In vitro Expression and Characterization of a GhDREB Transcription Factor Containing AP2 Domain in Gossypium hirsutum
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作者 Xian-guo CHENG , Yu-xia HOU(Department of Biological Science and Biotechnology, Tsinghua University, 100084 Beijing, China) 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2002年第S1期62-63,共2页
Abiotic stress including drought,lowtemperature,ABA and high salt is major factoraffecting the plant growth.Isolation andfunctional study of abiotic stress-related genewill be helpful to elucidate the signaltransducti... Abiotic stress including drought,lowtemperature,ABA and high salt is major factoraffecting the plant growth.Isolation andfunctional study of abiotic stress-related genewill be helpful to elucidate the signaltransduction mechanism of the target gene underabiotic stress during the growth of plant.Byusing gene-transfer technique,the target gene isincorporated into the plant to improve theadaptation of plant to abiotic stress. 展开更多
关键词 GOSSYPIUM ABIOTIC drought transcription cotton helpful elucidate DOMAIN TRANSDUCTION ATTEMPT
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Myocardin-Related Transcription Factor A Mediates OxLDL-Induced Endothelial Injury 被引量:12
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作者 Fang, Fei Yang, Yuyu +4 位作者 Yuan, Zhibin Gao, Yuqi Zhou, Jiliang Chen, Qi Xu, Yong 《南京医科大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2011年第6期842-842,共1页
关键词 动脉粥样硬化 内皮损伤 低密度脂蛋白 细胞反应
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植物热激转录因子研究进展与展望 被引量:2
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作者 郭秀林 戚润思 +6 位作者 孟祥照 张华宁 马贞玉 段硕楠 李国良 刘子会 尚忠林 《华北农学报》 北大核心 2025年第1期1-13,共13页
作为植物抵御多种逆境胁迫的重要调节因子,植物热激转录因子(Hsf)家族基因数目多,结构、特性和功能复杂多样。植物Hsf不仅通过直接转录调控热激蛋白和相关基因的表达,参与对多种逆境胁迫的响应和适应过程,还介导植物诸多生命活动过程。... 作为植物抵御多种逆境胁迫的重要调节因子,植物热激转录因子(Hsf)家族基因数目多,结构、特性和功能复杂多样。植物Hsf不仅通过直接转录调控热激蛋白和相关基因的表达,参与对多种逆境胁迫的响应和适应过程,还介导植物诸多生命活动过程。自20世纪80年代酵母Hsf被首先克隆以来,多个物种的Hsf家族被识别和研究,模式植物番茄和拟南芥Hsf研究比较早且相对深入,研究主要集中在HsfA族,B族研究较少,C族报道更少。随着全球气候变化,极端高温事件频发,已严重威胁小麦、玉米等粮食作物的产量和品质,深入研究作物耐热性机制从而挖掘功能基因、通过生物技术方法改良作物的耐热性,是抵抗高温逆境的关键。大田作物中Hsf家族数目大小不等,基因组复杂,研究起步晚。为此,植物生理与分子生物学研究室从2009年开始对作物Hsf家族基因进行研究,依据最新的基因组信息,确定了家族基因数目及核酸和蛋白质结构特性、明确了家族基因的时空表达特性及其对多种非生物逆境的响应规律。克隆获得多个基因并借助遗传转化和基因编辑技术创制转基因材料和突变体,对其耐热性以及抗逆性调控功能多层面进行了鉴定,并对下游调控机制进行了深入解析。研究不仅丰富了大田作物耐热性调控理论基础,也为作物耐热性研究和生物育种提供优异新种质。目前,关于Hsf的研究主要集中在功能鉴定和对下游基因的转录调控方面,其上游哪些组分通过何种方式介导Hsf参与耐热性调控方面的研究还缺乏证据,机制尚不清楚。基于本研究室多年来对小麦、玉米Hsf家族的研究结果,结合他人的相关研究报道,详述了近年来植物Hsf在抗逆性响应和适应过程中调控功能、机制及其主要研究进展,以期为深入阐明Hsf家族的作用及其调控网络提供理论依据,为耐热生物育种挖掘强效的基因资源和备选位点。 展开更多
关键词 植物热激转录因子 非生物胁迫 功能与机制 调控网络
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猪繁殖与呼吸综合征病毒生命周期的研究进展 被引量:1
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作者 刘爱军 张传亮 +1 位作者 黄晓兵 周彩琴 《畜牧兽医学报》 北大核心 2025年第3期1027-1041,共15页
猪繁殖与呼吸综合征(porcine reproductive and respiratory syndrome,PRRS)是由猪繁殖与呼吸综合征病毒(porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)引起的以猪呼吸系统疾病和母猪繁殖障碍为主要特征的传染病,给全球... 猪繁殖与呼吸综合征(porcine reproductive and respiratory syndrome,PRRS)是由猪繁殖与呼吸综合征病毒(porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)引起的以猪呼吸系统疾病和母猪繁殖障碍为主要特征的传染病,给全球养猪业造成了巨大的经济损失。然而,PRRS至今仍没有安全有效的疫苗和药物进行防治。全面深入理解PRRSV生命周期可以为PRRS防控提供新的思路。因此,本文在简述PRRSV生命周期的基础上,重点对病毒侵入、复制与转录、翻译及翻译后修饰、组装等过程的研究进展进行综述,以期为PRRSV致病机制及防控研究提供参考。 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒 入侵 复制和转录 翻译及翻译后修饰 组装
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葛根素调控SIRT1-FOXO1通路抑制成骨细胞凋亡 被引量:1
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作者 周凡 高扬 +3 位作者 胡艳平 向超 万骐 周茹 《中国骨质疏松杂志》 北大核心 2025年第5期671-675,702,共6页
目的 探讨葛根素(puerarin, PR)调节沉默信息调节因子1(SIRT1)-叉头状转录因子O1(FOXO1)信号通路对类固醇诱导的成骨细胞自噬和凋亡的影响。方法 用浓度为0~50μmol/L的PR及10μmol/L的地塞米松(DEX)共同处理小鼠成骨细胞(MC3T3-E1),MT... 目的 探讨葛根素(puerarin, PR)调节沉默信息调节因子1(SIRT1)-叉头状转录因子O1(FOXO1)信号通路对类固醇诱导的成骨细胞自噬和凋亡的影响。方法 用浓度为0~50μmol/L的PR及10μmol/L的地塞米松(DEX)共同处理小鼠成骨细胞(MC3T3-E1),MTT法筛选最佳PR作用浓度;将MC3T3-E1细胞分为对照组(不进行任何干预)、DEX组(10μmol/L DEX)、PR+DEX组(10μmol/L DEX+40μmol/L PR)、DEX+EX527组(10μmol/L DEX+100 nmol/L的SIRT1抑制剂EX527)、PR+DEX+EX527组(10μmol/L DEX+40μmol/L PR+100 nmol/L EX527),MTT法、流式细胞术、MDC法测定各组细胞增殖活力、凋亡率及细胞自噬数量;Western Blot检测SIRT1-FOXO1通路相关蛋白、自噬标志蛋白Beclin-1、LC3及凋亡蛋白Bax、Bcl-2表达水平。结果 0~40μmol/L的PR可促进DEX诱导的MC3T3-E1细胞增殖活力,40μmol/L PR处理后MC3T3-E1细胞增殖活力最高,选择40μmol/L PR进行后续实验。与对照组比较,DEX组MC3T3-E1细胞增殖活力、自噬阳性率、SIRT1、FOXO1、Beclin-1、LC3、Bax蛋白表达均降低,凋亡率及Bcl-2蛋白表达升高(P<0.05);与DEX组对比,PR+DEX组凋亡率及Bcl-2蛋白表达降低,上述其余指标均升高(P<0.05),DEX+EX527组凋亡率及Bcl-2蛋白表达升高,上述其余指标均降低(P<0.05);与PR+DEX组对比,PR+DEX+EX527组凋亡率及Bcl-2蛋白表达升高,上述其余指标均降低(P<0.05)。结论 PR可通过激活SIRT1-FOXO1信号通路增强MC3T3-E1细胞自噬进而抑制DEX诱导的细胞凋亡。 展开更多
关键词 葛根素 沉默信息调节因子1-叉头状转录因子O1 类固醇 成骨细胞 自噬
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舒芬太尼通过调节HIF-1α-Kcnq1ot1影响缺氧-复氧导致的心肌细胞损伤 被引量:1
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作者 邓方方 李继勇 +4 位作者 张力 邹高锐 陈治军 辛欢 乐薇 《中国药理学通报》 北大核心 2025年第3期500-507,共8页
目的探讨舒芬太尼(sufentanil,Suf)能否通过调节缺氧诱导因子-1α(hypoxia inducible factor-1α,HIF-1α)-KCNQ1重叠转录物1(KCNQ1 opposite strand/antisense transcript 1,Kcnq1ot1)改善缺氧-复氧(hypoxia-reoxygenation,H/R)导致的... 目的探讨舒芬太尼(sufentanil,Suf)能否通过调节缺氧诱导因子-1α(hypoxia inducible factor-1α,HIF-1α)-KCNQ1重叠转录物1(KCNQ1 opposite strand/antisense transcript 1,Kcnq1ot1)改善缺氧-复氧(hypoxia-reoxygenation,H/R)导致的心肌细胞损伤。方法生物信息学分析预测HIF-1α与Kcnq1ot1的相互作用。将H9c2细胞分为Ctrl组、H/R组、Suf组;oe-HIF-1α组、oe-HIF-1α+Suf组、sh-HIF-1α组、sh-HIF-1α+Kcnq1ot1组。MTT法检测细胞活性,TUNEL法检测细胞凋亡,ELISA法检测细胞上清液中的CK-MB与HBDH浓度,Western blot分析细胞中HIF-1α蛋白表达,逆转录定量PCR(RT-qPCR)测定Kcnq1ot1的mRNA表达水平。构建心肌缺血/再灌注大鼠模型,评估Suf对体内心肌缺血/再灌注的治疗潜力。结果生物信息学分析发现,HIF-1α与Kcnq1ot1之间存在直接的相互作用。与Ctrl组相比,H/R组的H9c2细胞活性降低,细胞凋亡增加,CK-MB与HBDH浓度上调,HIF-1α与Kcnq1ot1的表达增强(均P<0.05)。转染oe-HIF-1α后,进一步加剧了上述结果(均P<0.05);而Suf干预抑制了以上结果(均P<0.05)。与H/R组相比,sh-HIF-1α组的细胞活性明显改善,凋亡减少,CK-MB与HBDH浓度降低(均P<0.05);转染Kcnq1ot1则部分逆转了这些结果(均P<0.05)。动物实验发现,Suf能够改善大鼠心肌缺血/再灌注损伤。结论Suf通过抑制HIF-1α-Kcnq1ot1改善心肌H/R损伤。 展开更多
关键词 舒芬太尼 缺氧诱导因子-Α KCNQ1重叠转录物1 心肌缺氧-复氧损伤 缺血/再灌注损伤 心肌损伤
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独活寄生汤对老年膝骨关节炎血清TLR4/NF-κB信号通路的影响 被引量:1
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作者 薛英 田永祥 +1 位作者 刘峰瑞 郝耀 《中华中医药学刊》 北大核心 2025年第4期201-205,共5页
目的观察独活寄生汤用于老年膝骨关节炎疗效及其对Toll样受体4(TLR4)/核转录因子κB(NF-κB)信号通路的影响。方法将118例老年膝骨关节炎患者按照随机数字表法分为观察组和对照组,各59例。对照组患者给予盐酸氨基葡萄糖片治疗,观察组在... 目的观察独活寄生汤用于老年膝骨关节炎疗效及其对Toll样受体4(TLR4)/核转录因子κB(NF-κB)信号通路的影响。方法将118例老年膝骨关节炎患者按照随机数字表法分为观察组和对照组,各59例。对照组患者给予盐酸氨基葡萄糖片治疗,观察组在对照组基础上联合独活寄生汤治疗,4周为1个疗程,共治疗2个疗程。比较两组临床疗效,比较两组治疗前后中医证候积分、西安大略和麦克马斯特大学骨关节炎指数(WOMAC)量表评分及视觉模拟量表(VAS)评分,观察两组治疗前后血清白细胞介素-6(IL-6)、基质金属蛋白酶-1(MMP-1)、骨钙素(BGP)、I型前胶原羧基末端肽β降解产物(β-CTX)、I型前胶原羧基末端肽(PICP)水平及TLR4、NF-κB蛋白表达。结果治疗后观察组总有效率96.61%(57/59)高于对照组的83.05%(49/59),差异有统计学意义(P<0.05);治疗后两组各项中医证候积分较治疗前降低,并且观察组均低于对照组(P<0.05);治疗后,两组WOMAC评分及VAS评分较治疗前降低,并且观察组低于对照组(P<0.05);治疗后两组IL-6、MMP-1及TLR4、NF-κB蛋白水平较治疗前降低,并且观察组均低于对照组(P<0.05);治疗后,两组血清BGP、PICP水平较治疗前升高,并且观察组高于对照组,两组血清β-CTX水平较治疗前降低,并且观察组低于对照组(P<0.05)。结论独活寄生汤用于老年膝骨关节炎患者有利于提高临床疗效,减轻疼痛、乏力等症状,并改善关节功能,其作用机制可能与改善骨代谢指标、通过TLR4/NF-κB信号通路抑制炎症因子水平、减轻软骨损伤等因素有关。 展开更多
关键词 膝骨关节炎 独活寄生汤 TOLL样受体4 核转录因子ΚB 炎症因子
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番茄APETALA2乙烯响应因子重鉴定及抗逆相关基因筛选
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作者 史建磊 黄少勇 +2 位作者 陈先知 宰文珊 熊自立 《福建农业学报》 北大核心 2025年第2期113-122,共10页
【目的】探明番茄APETALA2乙烯响应因子(APETALA2/ethylene-responsive factor, AP2/ERF)的组学特征及生物胁迫响应机制,促进其在番茄抗病育种中的应用。【方法】利用新版公共数据进行AP2/ERF鉴定,结合番茄自交系在青枯菌(Ralstonia sol... 【目的】探明番茄APETALA2乙烯响应因子(APETALA2/ethylene-responsive factor, AP2/ERF)的组学特征及生物胁迫响应机制,促进其在番茄抗病育种中的应用。【方法】利用新版公共数据进行AP2/ERF鉴定,结合番茄自交系在青枯菌(Ralstonia solanacearum)侵染下的转录测序数据,挖掘青枯病抗性相关AP2/ERF。【结果】173个番茄AP2/ERF转录因子家族成员被鉴定,主要成簇分布在染色体端部,50.3%的AP2/ERF具有共线性,尤其是3号和8号染色体。基于系统进化关系,AP2亚家族包含22个(12.7%)成员,主要分为2类;ERF亚家族包含93个(53.8%)成员,可进一步分为6类;DREB亚家族包含49个(28.3%)成员,可进一步分为2类;RAV亚家族仅有3个成员。71对AP2/ERF同源基因的Ka/Ks值均小于1。26.8%的AP2/ERF主要在根中表达,几种生物胁迫下,ERF_4-6和DREB_2基因转录表达水平较高,尤其是Solyc03g005500.1(ERF_6)和Solyc08g078170.1(ERF_5)。青枯菌侵染下,在抗、感材料间筛选到10个差异表达AP2/ERF(分属AP2和ERF),其中Solyc06g068570.4(AP2)为正调控基因,其他9个为负调控基因。50.9%的AP2/ERF形成193对互作关系,Solyc01g096860.3(AP2_2)与Solyc08g078190.2(ERF_5)互作可信度最大,而Solyc06g068570.4(AP2)与Solyc03g093560.1(ERF_5)正负互作在番茄青枯病响应中可能发挥重要作用。【结论】综合基因组分析和转录表达鉴定了番茄AP2/ERF转录因子,获得若干青枯病响应基因,丰富了番茄抗病育种基础理论和基因资源。 展开更多
关键词 番茄 AP2/ERF转录因子 基因组特征 生物胁迫 转录表达
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植物ARF家族成员研究进展
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作者 孟思达 聂晓雨 +6 位作者 叶云珠 朱美玉 韩磊磊 申琦 谭昌华 齐明芳 李天来 《沈阳农业大学学报》 北大核心 2025年第2期160-168,共9页
ARF(Auxin Response Factor)作为生长素信号传导路径中的关键转录因子,调控下游靶基因的表达,参与对多种植物发育进程的调控,如花器官发育、胚发育、叶片极性发育以及根系发育等。ARF家族成员不但对植物形态建成产生影响,还在植物对环... ARF(Auxin Response Factor)作为生长素信号传导路径中的关键转录因子,调控下游靶基因的表达,参与对多种植物发育进程的调控,如花器官发育、胚发育、叶片极性发育以及根系发育等。ARF家族成员不但对植物形态建成产生影响,还在植物对环境胁迫的响应中发挥着重要作用。全面总结ARF家族成员在植物生长发育中的研究进展,包括ARF家族成员的发现与鉴定、结构特点、表达模式,探讨其在激素信号传导、细胞分化和形态建成等方面的具体作用;分析ARF基因在植物应对逆境条件下的响应机制,如干旱胁迫、盐胁迫等因素对其表达的影响。通过系统地梳理现存研究成果,为利用分子生物学手段对植物生长的调控提供参考。 展开更多
关键词 ARF 生长素 转录因子 分子机制
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猪CYP 3A29基因核心启动子鉴定及转录调控分析
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作者 王红 赵为民 +2 位作者 程金花 李惠侠 方晓敏 《畜牧兽医学报》 北大核心 2025年第3期1147-1158,共12页
旨在鉴定猪CYP 3A29基因核心启动子及相应的转录调控因子,分析转录因子对CYP 3A29启动子活性的调控。本研究以3头健康的大白母猪(30 kg)为试验材料,利用PCR和Western blot检测CYP 3A29基因在猪各组织(心、肝、脾、肺、肾、小肠、肌肉)... 旨在鉴定猪CYP 3A29基因核心启动子及相应的转录调控因子,分析转录因子对CYP 3A29启动子活性的调控。本研究以3头健康的大白母猪(30 kg)为试验材料,利用PCR和Western blot检测CYP 3A29基因在猪各组织(心、肝、脾、肺、肾、小肠、肌肉)中的表达分布;构建不同片段长度的CYP 3A29基因启动子双荧光素酶报告载体,转染293T和AML12细胞系,检测荧光素酶活性,确定CYP 3A29基因的核心启动子区域;利用Animal TFDB网站分析CYP 3A29核心启动子区域可能存在的转录调控因子,针对核心启动子区域构建分段缺失双荧光素酶报告载体,检测荧光素酶活性大小,确定转录因子结合位点;构建转录因子结合突变位点的双荧光素酶报告载体和转录因子shRNA载体,探讨转录因子对CYP 3A29核心启动子的调控作用。结果显示,CYP 3A29基因在猪肝脏中表达量最高;CYP 3A29启动子4个不同检测区域(-2026~+62 bp、-1526~+62 bp、-1026~+62 bp和-528~+62 bp)中-528~+62 bp活性最高,为CYP 3A29核心启动子区;CYP 3A29启动子-528~-448 bp区域负向调控核心启动子活性,且含有潜在的转录因子RUNX 1结合位点;突变RUNX 1结合位点可显著降低-528~+62 bp启动子的荧光素酶活性,而干扰RUNX 1基因则显著升高-528~+62 bp野生型启动子的荧光素酶活性,但对-528~+62 bp突变型启动子的荧光素酶活性无显著影响,提示RUNX 1转录因子可负向调控CYP 3A29基因核心启动子活性。本研究结果为进一步解析猪CYP 3A29基因的转录调控机制奠定了基础。 展开更多
关键词 CYP 3A29 核心启动子 RUNX 1 转录调控
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植物调节基因在大豆抗旱基因工程中的应用新进展
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作者 段俊枝 燕照玲 +4 位作者 齐红志 陈海燕 张会芳 杨翠苹 王楠 《大豆科学》 北大核心 2025年第3期135-146,共12页
干旱严重影响大豆的生长发育、产量及品质,应用基因工程技术进行大豆抗旱育种,提高大豆抗旱性,是保障大豆生产的重要措施。在植物抵御干旱胁迫的过程中,基因调控发挥重要作用。目前已证实,调控大豆抗旱性的植物调节基因主要有蛋白激酶... 干旱严重影响大豆的生长发育、产量及品质,应用基因工程技术进行大豆抗旱育种,提高大豆抗旱性,是保障大豆生产的重要措施。在植物抵御干旱胁迫的过程中,基因调控发挥重要作用。目前已证实,调控大豆抗旱性的植物调节基因主要有蛋白激酶基因和转录因子基因两类。蛋白激酶基因主要包括编码CIPK[CBL(Calcineurin B-like protein)-interacting protein kinase]和RLK(Receptor-like protein kinases)的基因。转录因子基因主要包括编码AP2/ERF(APETALA2/ethylene-responsive element binding factor)、bZIP(Basic leucine zipper)、NAC[NAM(No apical meristem)、ATAF1(Arabidopsis transcription activation factor 1)、ATAF2、CUC2(Cup-shaped cotyledon 2)]、NFY(Nuclear factor Y)、锌指蛋白和MYB(Myeloblastosis)的基因。本文综述了植物调节基因在大豆抗旱基因工程中的应用新进展,并对该领域存在的问题进行分析,以期为大豆抗旱遗传改良和育种提供参考。 展开更多
关键词 大豆 抗旱性 基因工程 蛋白激酶 转录因子
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小麦耐盐相关NAC转录因子的生物信息与表达分析
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作者 王伟伟 罗政辉 +6 位作者 邹景伟 张玉杰 钮力亚 王志 王奉芝 赵振杰 于亮 《麦类作物学报》 北大核心 2025年第3期287-299,共13页
NAC转录因子对植物抗逆境胁迫具有重要作用。为了解小麦耐盐相关NAC转录因子的生物学信息,对耐盐品种沧麦6005和盐敏感品种科农9204进行转录组测序,筛选耐盐相关NAC转录因子,并对其进行生物信息学分析;对供试材料进行盐胁迫处理,提取根... NAC转录因子对植物抗逆境胁迫具有重要作用。为了解小麦耐盐相关NAC转录因子的生物学信息,对耐盐品种沧麦6005和盐敏感品种科农9204进行转录组测序,筛选耐盐相关NAC转录因子,并对其进行生物信息学分析;对供试材料进行盐胁迫处理,提取根部分生组织RNA,反转录为cDNA,对重点候选基因进行qRT-PCR分析。结果表明,共筛选出28个耐盐相关NAC转录因子,其中10个的等电点呈碱性,其余等电点呈酸性,且均为亲水性蛋白;亚细胞定位主要定位在细胞核;蛋白质二级结构以无规则卷曲和α-螺旋为主。经共线性分析,小麦和水稻的NAC转录因子含有多对共线性关系,表明小麦与水稻亲缘关系较近。NAC转录因子启动子区域含有多种与激素响应和逆境胁迫诱导相关顺式作用元件,其中TaNAC24含有顺式调控元件结合位点最多,共有51个。盐胁迫处理后,9个重要基因中,4个基因表达量显著上调,5个基因表达量显著下调,与转录组测序结果一致,这些基因可能介导了小麦的抗盐性。 展开更多
关键词 小麦 盐胁迫 NAC 转录因子 生物信息学分析
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低氮胁迫下芝麻差异表达ERF基因的鉴定及SiERF08基因的表达分析
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作者 田媛 张鹏钰 +4 位作者 李丰 王东勇 付锦州 戎亚思 高桐梅 《河南农业科学》 北大核心 2025年第4期37-46,共10页
AP2/ERF是植物最大的转录因子家族之一,参与植物代谢生物合成、器官发育、逆境响应和激素信号转导等过程。为了探究ERF基因在芝麻低氮胁迫下的表达特性,从前期芝麻根系低氮胁迫转录组中筛选出24个差异表达SiERF基因,对其进行表达特性和... AP2/ERF是植物最大的转录因子家族之一,参与植物代谢生物合成、器官发育、逆境响应和激素信号转导等过程。为了探究ERF基因在芝麻低氮胁迫下的表达特性,从前期芝麻根系低氮胁迫转录组中筛选出24个差异表达SiERF基因,对其进行表达特性和共表达网络分析,并分析了不同胁迫处理下SiERF08基因的表达特性。结果显示,24个差异表达SiERF基因开放阅读框(ORF)长度为564~1254 bp,编码蛋白质的分子质量为20.92~44.97 ku,等电点4.39~10.92。24个差异表达SiERF基因不均匀地分布在13条染色体上。启动子区域包含植物激素响应元件(ABRE、AuxRE等)、逆境胁迫响应元件(ARE、DRE core、LTR等)、生长发育相关顺式作用元件(O2-site、Gap-box和CAT-box)和光响应元件(G-box、MRE、I-box等)。基因表达和韦恩图分析结果显示,低氮胁迫下,芝麻品种缅甸高产者和郑芝HL05分别检测到24个和14个差异表达SiERF基因,其中SiERF06等3个基因在2个品种低氮胁迫3、9 d均差异表达。通过共表达网络分析筛选出SiERF08等5个低氮胁迫响应的关键候选基因。对关键候选基因SiERF08开展不同胁迫下的表达特性分析,结果显示,该基因在低氮、干旱、高盐、赤霉素及水杨酸等胁迫处理下被诱导表达,且不同胁迫处理下,SiERF08基因的表达模式不同。在干旱、高盐、水杨酸、高温和低温处理6 h,SiERF08基因的表达量最高;在低氮处理12 h,SiERF08基因表达量达到峰值;在赤霉素处理下,SiERF08基因在6 h和72 h诱导表达,且差异显著。综上所述,通过生物信息学手段对低氮胁迫下24个差异表达SiERF基因进行分析,筛选出SiERF08等5个关键候选基因,其中,SiERF08基因在低氮、干旱、高盐、水杨酸等胁迫下诱导表达,为深入探究芝麻SiERF基因功能、揭示芝麻耐低氮分子机制提供了理论依据和基因资源。 展开更多
关键词 芝麻 低氮胁迫 ERF转录因子 基因表达
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菠萝Ac4CL5基因的克隆及表达分析
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作者 宋康华 洪克前 +2 位作者 侯晓婉 谷会 姚全胜 《中国南方果树》 北大核心 2025年第2期91-98,共8页
了解Ac4CL5基因在菠萝果肉酚类物质合成中的作用及调控机制,为利用该基因遗传改良菠萝果实品质和抗逆性奠定基础。以“巴厘”菠萝果肉为材料,克隆菠萝4-香豆酸辅酶A连接酶(4-coumaric acid:coenzyme A ligase,4CL)Ac4CL5基因,并进行生... 了解Ac4CL5基因在菠萝果肉酚类物质合成中的作用及调控机制,为利用该基因遗传改良菠萝果实品质和抗逆性奠定基础。以“巴厘”菠萝果肉为材料,克隆菠萝4-香豆酸辅酶A连接酶(4-coumaric acid:coenzyme A ligase,4CL)Ac4CL5基因,并进行生物信息学分析,同时对Ac4CL5基因进行进化分析、原核表达分析和上游调控因子筛选。结果表明,Ac4CL5编码区全长1659 bp,比基因组获得序列少92 bp,推测由于品种差异导致;Ac4CL5具有4CL基因家族典型的保守结构域,亚细胞定位预测Ac4CL5定位于过氧化物酶体;菠萝Ac4CL5属于Class I家族Type I类,推测Ac4CL5参与菠萝果实木质素生物合成;利用原核表达系统成功诱导出可溶性Ac4CL5目的蛋白,对纯化蛋白的酶活性和最适催化底物分析表明,Ac4CL5的最适催化底物为香豆酸,咖啡酸次之。利用Ac4CL5基因启动子进行酵母单杂交筛库发现,溴结合域蛋白GTE9和C2H2型锌指蛋白可能是调控Ac4CL5表达的上游调控因子。Ac4CL5蛋白主要以香豆酸和咖啡酸为底物,其超量表达与菠萝黑心病发生中该类酚类物质的大量积累密切相关。Ac4CL5可能受到溴结合域蛋白GTE9和C2H2型锌指蛋白转录因子调控。 展开更多
关键词 菠萝 4-香豆酸辅酶A连接酶(4CL) 序列 原核表达 转录调控
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