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利用结构优化的TALE-TF高效诱导MEF细胞内源基因Oct4的表达（英文）
1
作者
吴芸
张志强
+6 位作者
李铎
徐坤
韩芙蓉
任充华
闫强
王昕
张智英
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第5期461-469,共9页
转录激活子样效应因子核酸酶(TALENs)已用于基因组编辑,而TALE转录激活因子(TALE-TFs)可用于内源基因的调控。通过修饰的TALE蛋白与内源基因的启动子特异性结合来激活或抑制基因的表达。但是,对于截短了N端的TALE是否会影响TALENs的效...
转录激活子样效应因子核酸酶(TALENs)已用于基因组编辑,而TALE转录激活因子(TALE-TFs)可用于内源基因的调控。通过修饰的TALE蛋白与内源基因的启动子特异性结合来激活或抑制基因的表达。但是,对于截短了N端的TALE是否会影响TALENs的效率还不确定。本文设计了不同长度N端的TALENs哺乳动物及酵母表达载体,对应哺乳动物绿色荧光报告载体及酵母报告载体。分别在哺乳动物细胞和酵母细胞上对不同长度N端TALENs的活性进行了检测。检测结果发现,含120个氨基酸N端的TALEN在酵母AH109细胞中的活性最高,N端长度为153个氨基酸的TALENs在293T细胞中表现最高的活性,但N端长度为153、140和160个氨基酸的TALENs的活性差异不显著(P>0.05)。随后,将结构优化了的TALE-TF用于小鼠胎儿成纤维细胞中激活Oct4基因。相对阴性对照组,TALE-TF将Oct4基因表达量上调了418倍。本研究结果表明,在哺乳动物细胞和酵母细胞中,具有最高活性TALENs的N端长度是不同的。本研究用结构优化的TALE-TF诱导内源基因高水平的表达,为从体细胞中获得iP S细胞提供了研究策略。
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关键词
tale
-N端
转录激活子样效应因子核酸酶(
tale
Ns)
Oct4基因
tale
转录激活因子(
tale-tf
)
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职称材料
百脉根TALE转录因子家族的鉴定与生物信息学分析
被引量：
5
2
作者
丘日光
张天缘
+2 位作者
杨仕梅
宋莉
赵德刚
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第2期466-475,共10页
三胺酸环延伸(TALE)蛋白是一类在植物生长发育过程中调控分生组织分化的转录因子。本研究通过生物信息学手段从豆科模式植物百脉根(Lotus japonicus(Regel)K.Larsen)全基因组中筛选出分布于6条染色体上的40条TALE家族基因,并对其保守结...
三胺酸环延伸(TALE)蛋白是一类在植物生长发育过程中调控分生组织分化的转录因子。本研究通过生物信息学手段从豆科模式植物百脉根(Lotus japonicus(Regel)K.Larsen)全基因组中筛选出分布于6条染色体上的40条TALE家族基因,并对其保守结构域、基因结构、系统进化、在染色体上的分布、理化性质以及部分典型基因的组织表达差异等进行分析。根据结构域不同可将百脉根TALE家族分为BELL和KNOX两个亚族;百脉根TALE家族在进化上较为保守,分化上与大豆存在较大差异;该家族基因有外显子4～6个,氨基酸序列长度在271～792之间,家族成员蛋白均为弱酸性蛋白。Realtime PCR分析表明该家族基因表达与motif元件数之间存在相关性;BELL亚族主要在顶芽表达,KNOX亚族则主要在根组织中表达。研究结果为进一步克隆百脉根TALE基因和分析其功能奠定基础。
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关键词
百脉根
tale
转录因子家族
生物信息学
系统进化
基因表达
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职称材料
题名
利用结构优化的TALE-TF高效诱导MEF细胞内源基因Oct4的表达（英文）
1
作者
吴芸
张志强
李铎
徐坤
韩芙蓉
任充华
闫强
王昕
张智英
机构
西北农林科技大学动物科技学院
遵义师范学院生物与农业科技学院
出处
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第5期461-469,共9页
基金
Supported by Scientific and Technological Project of Shaanxi Province,China(No.2014K02-07-01)
China Postdoctoral Science Foundation(No.2015M580887)~~
文摘
转录激活子样效应因子核酸酶(TALENs)已用于基因组编辑,而TALE转录激活因子(TALE-TFs)可用于内源基因的调控。通过修饰的TALE蛋白与内源基因的启动子特异性结合来激活或抑制基因的表达。但是,对于截短了N端的TALE是否会影响TALENs的效率还不确定。本文设计了不同长度N端的TALENs哺乳动物及酵母表达载体,对应哺乳动物绿色荧光报告载体及酵母报告载体。分别在哺乳动物细胞和酵母细胞上对不同长度N端TALENs的活性进行了检测。检测结果发现,含120个氨基酸N端的TALEN在酵母AH109细胞中的活性最高,N端长度为153个氨基酸的TALENs在293T细胞中表现最高的活性,但N端长度为153、140和160个氨基酸的TALENs的活性差异不显著(P>0.05)。随后,将结构优化了的TALE-TF用于小鼠胎儿成纤维细胞中激活Oct4基因。相对阴性对照组,TALE-TF将Oct4基因表达量上调了418倍。本研究结果表明,在哺乳动物细胞和酵母细胞中,具有最高活性TALENs的N端长度是不同的。本研究用结构优化的TALE-TF诱导内源基因高水平的表达,为从体细胞中获得iP S细胞提供了研究策略。
关键词
tale
-N端
转录激活子样效应因子核酸酶(
tale
Ns)
Oct4基因
tale
转录激活因子(
tale-tf
)
Keywords
tale
N-terminal
tale
-based nucleases （
tale
Ns）
Oct4 gene
tale transcript factors （ tale-tf ）
分类号
Q786 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
百脉根TALE转录因子家族的鉴定与生物信息学分析
被引量：
5
2
作者
丘日光
张天缘
杨仕梅
宋莉
赵德刚
机构
贵州大学生命科学学院/农业生物工程研究院/山地植物资源保护与种质创新教育部重点实验室/贵州省农业生物工程重点实验室
贵州省农业科学院
出处
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第2期466-475,共10页
基金
国家转基因生物新品种培育科技重大专项(2016ZX08010003)
国家自然科学基金项目(31660685)
贵州省科技计划项目(黔科合基础[2017]1119)~~
文摘
三胺酸环延伸(TALE)蛋白是一类在植物生长发育过程中调控分生组织分化的转录因子。本研究通过生物信息学手段从豆科模式植物百脉根(Lotus japonicus(Regel)K.Larsen)全基因组中筛选出分布于6条染色体上的40条TALE家族基因,并对其保守结构域、基因结构、系统进化、在染色体上的分布、理化性质以及部分典型基因的组织表达差异等进行分析。根据结构域不同可将百脉根TALE家族分为BELL和KNOX两个亚族;百脉根TALE家族在进化上较为保守,分化上与大豆存在较大差异;该家族基因有外显子4～6个,氨基酸序列长度在271～792之间,家族成员蛋白均为弱酸性蛋白。Realtime PCR分析表明该家族基因表达与motif元件数之间存在相关性;BELL亚族主要在顶芽表达,KNOX亚族则主要在根组织中表达。研究结果为进一步克隆百脉根TALE基因和分析其功能奠定基础。
关键词
百脉根
tale
转录因子家族
生物信息学
系统进化
基因表达
Keywords
Lotus japonicus(Regel)K.Larsen
tale
transcript
ion
factor
family
bioinformatics
phylogenetic analysis
gene expression
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
S541.6 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
利用结构优化的TALE-TF高效诱导MEF细胞内源基因Oct4的表达（英文）
吴芸
张志强
李铎
徐坤
韩芙蓉
任充华
闫强
王昕
张智英
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
百脉根TALE转录因子家族的鉴定与生物信息学分析
丘日光
张天缘
杨仕梅
宋莉
赵德刚
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
5
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已选择
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引证文献
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