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连作苹果园土壤真菌的T-RFLP分析 被引量:42
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作者 尹承苗 王功帅 +3 位作者 李园园 陈学森 吴树敬 毛志泉 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期837-846,共10页
为探讨连作苹果园不同土壤空间真菌群落结构,应用T-RFLP(Terminal Restriction Fragment Length Polymorphism)技术,比较了3个连作园不同取样位置(行间、原穴、株间)和不同土层(0—30 cm、30—60 cm)的土壤真菌多样性,并结合不同样品TR... 为探讨连作苹果园不同土壤空间真菌群落结构,应用T-RFLP(Terminal Restriction Fragment Length Polymorphism)技术,比较了3个连作园不同取样位置(行间、原穴、株间)和不同土层(0—30 cm、30—60 cm)的土壤真菌多样性,并结合不同样品TRFLP图谱的差异,采用多样性指数分析、聚类分析和主成分分析(PCA),分析了3个连作园土壤真菌群落结构特征。结果表明,磁窑、道朗和金城连作园的土壤真菌多样性存在差异,各采样地区的Shannon多样性指数在0.43—2.47之间,Pielou均匀度指数在0.17—0.85之间,Simpson优势度指数在0.12—0.81之间,Margalef丰富度指数最高的是金城树穴0—30 cm土层(R=4.55),最低的是磁窑行间30—60 cm土层(R=0.77)。在调查的不同取样位置、不同土层中,原树穴具有最高的多样性指数、均匀度指数、丰富度指数和最低的优势度指数;0—30 cm土层的土壤真菌多样性指数、均匀度指数、丰富度指数均高于30—60cm土层,而优势度指数的趋势正好相反;PCA和聚类分析结果显示磁窑、道朗和金城连作园的土壤真菌群落结构均有明显差异,3个连作园的土壤真菌各自构成一个独立的群落结构,这些群落能够适应各自的土壤环境并成为环境的优势群落。 展开更多
关键词 连作果园 土壤真菌 t-rflp
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连作烟草对土壤微生物区系影响的T-RFLP分析 被引量:19
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作者 杨宇虹 陈冬梅 +6 位作者 晋艳 王海斌 段玉琪 徐照丽 尤垂淮 郭徐魁 林文雄 《中国烟草学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2012年第1期40-45,共6页
应用T-RFLP技术研究连作烟草根际土壤微生物的区系变化。结果表明:与对照相比,烟草连作导致38种微生物数量显著下降,其中与碳素循环相关的12种,与氮素循环相关的9种,与改善土壤质地相关的4种,益生菌5种,病原菌8种;而烟草连作造成35种微... 应用T-RFLP技术研究连作烟草根际土壤微生物的区系变化。结果表明:与对照相比,烟草连作导致38种微生物数量显著下降,其中与碳素循环相关的12种,与氮素循环相关的9种,与改善土壤质地相关的4种,益生菌5种,病原菌8种;而烟草连作造成35种微生物数量显著上升,其中病原菌23种,占总体的65.71%。可见烟草连作导致土壤营养元素循环相关微生物数量显著下降,而病原菌数量显著上升,并最终导致烟草连作障碍的形成。 展开更多
关键词 烟草 连作障碍 微生物 多样性 t-rflp
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营养注入后油藏微生物群落16S rRNA基因的T-RFLP对比分析 被引量:13
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作者 程海鹰 肖生科 +2 位作者 马光东 汪卫东 王修林 《石油勘探与开发》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2006年第3期356-359,373,共5页
为了监测油藏微生物群落动态,应用不依赖微生物培养与克隆的T-RFLP方法研究了模拟油藏环境中营养物的注入对油藏微生物群落结构的影响。以基因组总DNA为模板,用细菌和古菌的荧光标记引物对16S rRNA基因进行PCR扩增,扩增产物经限制性内切... 为了监测油藏微生物群落动态,应用不依赖微生物培养与克隆的T-RFLP方法研究了模拟油藏环境中营养物的注入对油藏微生物群落结构的影响。以基因组总DNA为模板,用细菌和古菌的荧光标记引物对16S rRNA基因进行PCR扩增,扩增产物经限制性内切酶RsaI和MspI消化,用毛细管凝胶电泳分离酶切产物后利用LIFD检测器精确检测T-RFs,以确定每个片断的长度和丰度。不同时期微生物群落的T-RFLP对比分析表明,营养物注入后,T-RF的数量与丰度都有显著提高,且不同时期呈现出不同的群落结构。在内源微生物驱油研究中,T-RFLP方法是跟踪油藏微生物群落动态和对比分析群落结构的有效方法。 展开更多
关键词 油藏 微生物群落 16S RRNA 分子技术 聚合酶链反应 t-rflp 毛细管凝胶电泳
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利用T-RFLP技术对温榆河微生物群落结构研究 被引量:16
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作者 董萍 孙寓姣 +2 位作者 王红旗 陈利顶 张辉 《中国环境科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2011年第4期631-636,共6页
利用T-RFLP技术(综合运用PCR技术、DNA限制性酶切技术和DNA序列自动分析技术)对温榆河不同尺度、不同时期的微生物群落结构进行了研究.从微生物的种类数、物种丰度、优势菌落、群落结构稳定性等方面特征着手,找出其优势群落;利用两种多... 利用T-RFLP技术(综合运用PCR技术、DNA限制性酶切技术和DNA序列自动分析技术)对温榆河不同尺度、不同时期的微生物群落结构进行了研究.从微生物的种类数、物种丰度、优势菌落、群落结构稳定性等方面特征着手,找出其优势群落;利用两种多样性指数(香侬一威勒多样性指数、辛普森多样性指数)探讨各种微生物群落结构的多样性以及同一群落随时间而发生的变化;比较了微生物指标与水质指标COD之间的变化关系.结果表明,温榆河不同尺度、不同时期的微生物具有明显变化,说明季节性变化对水体中微生物群落产生了明显的影响;T-RF67bp、151bp、440bp、481bp、488bp所代表的微生物群落体现其为优势种群;T-RF为135bp、151bp、440bp的微生物群落对于外界反映最敏感,验证其有可能能作为环境变化的指示性生物;微生物指标与COD呈现明显的正相关. 展开更多
关键词 t-rflp 微生态系统 群落结构 16SRRNA基因
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新疆沙尘暴源区塔克拉玛干空气真菌群落的T-RFLP分析 被引量:5
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作者 段魏魏 娄恺 +6 位作者 曾军 胡蓉 史应武 何清 刘新春 孙建 晁群芳 《新疆农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期769-775,共7页
【目的】了解新疆塔克拉玛干沙漠周边地区空气真菌物种多样性及群落结构特征。【方法】应用末端限制性片段长度多态性(T-RFLP)技术分析和比较塔克拉玛干沙漠空气真菌多样性。【结果】塔克拉玛干沙漠周边且末地区的空气真菌物种多样性最... 【目的】了解新疆塔克拉玛干沙漠周边地区空气真菌物种多样性及群落结构特征。【方法】应用末端限制性片段长度多态性(T-RFLP)技术分析和比较塔克拉玛干沙漠空气真菌多样性。【结果】塔克拉玛干沙漠周边且末地区的空气真菌物种多样性最高,尉犁地区最少,9个地区空气样品间相似性介于8.3%~41.9%,其中若羌和莎车地区的相似性最高,达到41.9%;尉犁地区与且末、叶城的相似性最低,为8.3%,与聚类分析结果大体上相一致。典型性相关分析(CCA)表明非生物环境因子(海拔、温度、风速等)影响空气真菌群落的多样性。【结论】塔克拉玛干沙漠周边9个地区空气真菌多样性较丰富,且各地区的优势真菌种群和丰度不同;限制性内切酶的种类对空气真菌群落信息的描述有较大影响。 展开更多
关键词 塔克拉玛干沙漠 t-rflp 空气真菌多样性 沙尘暴
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T-RFLP技术及其在微生物群落结构研究中的应用 被引量:22
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作者 贾俊涛 宋林生 李筠 《海洋科学》 CAS CSCD 北大核心 2004年第3期64-68,共5页
关键词 t-rflp技术 微生物 群落结构 分子生物学技术 原理
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T-RFLP分析技术在肉鸡肠道微生物研究中的应用 被引量:3
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作者 张华 蔡辉益 +3 位作者 刘国华 常文环 郝晓洁 周晓 《动物营养学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期364-369,共6页
本文阐述了末端限制性片段长度多态性(T-RFLP)分析技术的基本原理和技术路线,讨论了应用T-RFLP分析技术相对于应用传统方法研究肉鸡肠道微生物的优势,总结了应用T-RFLP分析技术研究肉鸡肠道微生物的发展历程,分析了应用T-RFLP分析技术... 本文阐述了末端限制性片段长度多态性(T-RFLP)分析技术的基本原理和技术路线,讨论了应用T-RFLP分析技术相对于应用传统方法研究肉鸡肠道微生物的优势,总结了应用T-RFLP分析技术研究肉鸡肠道微生物的发展历程,分析了应用T-RFLP分析技术研究肉鸡肠道微生物存在的问题及解决方法,并对其应用前景进行了展望。 展开更多
关键词 t-rflp分析技术 肉鸡 肠道微生物
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太湖有机聚集体上附着细菌群落结构与动态的T-RFLP分析(英文) 被引量:6
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作者 汤祥明 高光 秦伯强 《生态科学》 CSCD 2008年第5期341-345,共5页
有机聚集体(organic aggregates),是指由浮游动(植)物的残体、粪便颗粒及各种有机碎屑、活的自养及异养微生物以及无机颗粒等由于物理的、化学的或生物的作用聚集而成的颗粒物。人们对水生态系统中有机聚集体的认识始于 20 世纪 50 年... 有机聚集体(organic aggregates),是指由浮游动(植)物的残体、粪便颗粒及各种有机碎屑、活的自养及异养微生物以及无机颗粒等由于物理的、化学的或生物的作用聚集而成的颗粒物。人们对水生态系统中有机聚集体的认识始于 20 世纪 50 年代的海洋学研究。细菌是有机聚集体最重要的组成部分之一。有机聚集体在水体中物质与能量循环中的作用很大程度上是靠附着其上的异养细菌而起作用的。目前,有机聚集体的概念在水生态系统中已被广泛接受,由于其独特的物理、化学及生物组成,以及复杂的形成、转化过程,使其在水生态系统中具有重要的生态学作用。然而,有关浅水湖泊中有机聚集体上细菌群落的研究目前尚未见报道。近年来,基于 DNA 多聚酶链式反应(PCR)的末端限制性片段长度多态性(T-RFLP)技术是一种新兴的研究微生物多态性的分子生物学方法。该技术由于具有快捷、高分辨率、高通量和不依赖于培养等优点而被广泛应用于微生物群落结构的时空演替研究。本研究采用 T-RFLP 技术,研究了太湖梁溪河入湖河口(Site A)和贡湖湾(Site B)2006 年 6 月至2007 年 5 月一年间有机聚集体上附着细菌群落组成的时空变化规律。T-RFLP 分析检测到这两个采样点共有 187 个独特的末端限制性片段(T-RFs),月平均 T-RFs 分别 42.7 和 44.9。t 检验显示它们没有显著性差异(P >0.05)。虽然河口的营养盐浓度要显著高于贡湖湾(P <0.01),T-RFLP 结果表明,太湖中营养盐的浓度已经不是有机聚集体上附着细菌多样性的限制因子。聚类分析显示,除了春季外,河口和贡湖湾有机聚集体上细菌群落结构有明显的不同。在 T-RFLP 分析附着细菌群落组成及季节变化的基础上,采用多元统计方法研究环境因子与附着细菌群落组成变化的相关性。典型对应分析(CCA)结果表明诸多环境因子中,DIP、DIN 和水温与有机聚集体上细菌群落结构的变化具有显著的相关性 (P < 0.05)。 展开更多
关键词 细菌群落结构 有机聚集体 浅水湖泊 t-rflp 微生物生态学
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应用T-RFLP技术分析不同土壤温度和施肥方式下设施土壤细菌群落结构 被引量:2
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作者 董飞 闫秋艳 +2 位作者 李汛 段增强 邢鹏 《土壤》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期495-501,共7页
采用末端限制性片段长度多态性分析(T-RFLP)和荧光定量PCR技术,研究了两种土壤温度(对照不增温,10°C ±2°C;增温,20°C ±2°C)和两种施肥方式(对照不施肥;鸡粪有机肥底肥+尿素追肥)对土壤细菌群落结构及其... 采用末端限制性片段长度多态性分析(T-RFLP)和荧光定量PCR技术,研究了两种土壤温度(对照不增温,10°C ±2°C;增温,20°C ±2°C)和两种施肥方式(对照不施肥;鸡粪有机肥底肥+尿素追肥)对土壤细菌群落结构及其多样性和数量特征的影响。结果表明:相同施肥方式下,土壤增温增加土壤速效养分含量,尤其在施肥时增加幅度更明显。分析显示施肥对土壤细菌群落结构的影响在不同土壤温度条件下表现不同。土壤不增温条件下,施肥增加细菌Pielou均匀度指数和Shannon-Weiner多样性指数,Simpson优势度指数降低;土壤增温条件下,则效果相反。与不增温比,增温使土壤细菌Pielou均匀度指数和Shannon-Weiner多样性指数降低,但物种个体数和Simpson优势度指数增加明显。增温改变了土壤细菌群落结构,62 bp和93 bp两种限制性末端片段在土壤增温条件下优势度提高,主要包括共生菌和杆菌。 展开更多
关键词 设施土壤 t-rflp技术 施肥方式 土壤温度 细菌群落和丰度
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小叶满江红(Azolla microphylla)内生细菌多样性的T-RFLP分析 被引量:5
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作者 郑斯平 陈彬 +1 位作者 王瑾 陆培基 《安徽农业科学》 CAS 2012年第29期14185-14187,14270,共4页
[目的]应用T-RFLP技术揭示小叶满江红内生细菌的多样性。[方法]将分离自实验室无菌培养的小叶满江红内生细菌进行16SrDNA-PCR扩增,产物用MspI、HhaI、HaeIII、HinfI 4种内切酶进行酶切,通过检测带荧光标记的片段,将所获得的数据用相关... [目的]应用T-RFLP技术揭示小叶满江红内生细菌的多样性。[方法]将分离自实验室无菌培养的小叶满江红内生细菌进行16SrDNA-PCR扩增,产物用MspI、HhaI、HaeIII、HinfI 4种内切酶进行酶切,通过检测带荧光标记的片段,将所获得的数据用相关的软件工具Phylogenetic Assignment Tool(PAT)进行比对分析。[结果]通过比对获得10个科42个属的细菌菌种。[结论]T-RFLP技术配合生物信息学软件能较有效地揭示小叶满江红内生细菌的多样性。 展开更多
关键词 满江红 内生细菌 t-rflp
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T-RFLP微生物监测技术及矿场应用研究 被引量:10
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作者 赵凤敏 《油气地质与采收率》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期64-66,i0007,共4页
运用基于聚合酶链式反应的分子生态学监测技术,分离和纯化了油藏产出液中微生物的总DNA,以纯化的DNA样品为模版扩增出代表油藏微生物种群特征的。16SrDNA,然后进行基因末端限制性片断长度多态性的分析,建立了分子水平的油藏微生物监测方... 运用基于聚合酶链式反应的分子生态学监测技术,分离和纯化了油藏产出液中微生物的总DNA,以纯化的DNA样品为模版扩增出代表油藏微生物种群特征的。16SrDNA,然后进行基因末端限制性片断长度多态性的分析,建立了分子水平的油藏微生物监测方法,为微生物驱矿场试验中注入功能菌的跟踪分析提供了快速、简便、可靠的监测手段。文章介绍了T-RFLP微生物监测技术在罗家油田罗801块微生物驱油现场试验中的应用情况。 展开更多
关键词 16S RDNA 微生物 基因 监测 t-rflp 罗家油田
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应用T-RFLP技术分析鲈鱼肠道菌群 被引量:1
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作者 潘艳艳 钱云霞 张德民 《生物学杂志》 CAS CSCD 2015年第6期100-104,共5页
鱼类肠道菌群在鱼类的消化、吸收、免疫反应以及器官的发育等方面起着重要作用。为确定鲈鱼肠道不同部位和粪便的主要细菌类型与群落结构,运用末端限制性片段长度多态性(T-RFLP)技术分析了鲈鱼肠道壁的前肠壁、中肠壁、后肠壁及粪便中... 鱼类肠道菌群在鱼类的消化、吸收、免疫反应以及器官的发育等方面起着重要作用。为确定鲈鱼肠道不同部位和粪便的主要细菌类型与群落结构,运用末端限制性片段长度多态性(T-RFLP)技术分析了鲈鱼肠道壁的前肠壁、中肠壁、后肠壁及粪便中的细菌群落特征及多样性。结果表明:粪便的菌落结构区别于肠道壁,其多样性最高;变形菌是鱼类最重要的肠道菌,尤其是γ-变形菌纲普遍存在于鲈鱼肠道壁的不同部位与粪便中;后肠壁组以T-RF493 bp所代表的不动杆菌属(Acinetobacter)为最优势菌,T-RF 488 bp所代表的丛毛单胞菌属(Comamonas)则同时为中肠壁组和前肠壁组的最优势菌,而T-RF 434 bp所代表菌为粪便最优势菌。 展开更多
关键词 鲈鱼 细菌群落 肠道 t-rflp
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T-RFLP指纹图谱技术分析细菌型微生物肥料菌种稳定性 被引量:1
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作者 魏霜 刘建华 +5 位作者 吴西源 黄帅 周陆宁 林春贵 吴希阳 刘中勇 《安徽农业科学》 CAS 2017年第1期143-144,154,共3页
[目的]建立一种分析微生物肥料菌种稳定性的T-RFLP指纹图谱技术。[方法]采用T-RFLP指纹图谱技术对进口细菌型微生物肥料菌种的稳定性进行分析。[结果]样品中优势菌的T-RFs片段主要是87、246、247、330 bp,其中330 bp为主要片段,Shannon... [目的]建立一种分析微生物肥料菌种稳定性的T-RFLP指纹图谱技术。[方法]采用T-RFLP指纹图谱技术对进口细菌型微生物肥料菌种的稳定性进行分析。[结果]样品中优势菌的T-RFs片段主要是87、246、247、330 bp,其中330 bp为主要片段,Shannon多样性指数和均一性指数测定结果表明,不同批次产品间差异性较小,微生物群落结构较稳定。[结论]建立了微生物肥料菌种稳定性分析的T-RFLP指纹图谱技术,为进出口微生物肥料产品提供了一种快速分析方法。 展开更多
关键词 t-rflp 微生物肥料 稳定性
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核桃举肢蛾和桃蛀螟幼虫肠道细菌多样性的PCR-DGGE和T-RFLP分析 被引量:8
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作者 王娇莉 南小宁 +2 位作者 任争争 明洁 唐光辉 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2016年第6期76-85,共10页
【目的】了解危害核桃果实青皮的核桃举肢蛾和桃蛀螟幼虫肠道细菌群落结构与多样性。【方法】采用基于16SrRNA基因的变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)和末端限制性片段长度多样性(T-RFLP)技术分析2种害虫幼虫肠道细菌群落特征。【结果】1)PCR... 【目的】了解危害核桃果实青皮的核桃举肢蛾和桃蛀螟幼虫肠道细菌群落结构与多样性。【方法】采用基于16SrRNA基因的变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)和末端限制性片段长度多样性(T-RFLP)技术分析2种害虫幼虫肠道细菌群落特征。【结果】1)PCR-DGGE分析显示核桃举肢蛾幼虫肠道细菌主要有沃尔巴克氏体属、肠球菌属、肠杆菌属、根瘤菌属和假单胞菌属,其中沃尔巴克氏体属是优势菌群,占测得序列的40.0%;桃蛀螟幼虫肠道细菌主要有沃尔巴克氏体属、肠球菌属、根瘤菌属和假单胞菌属,其中肠球菌属是优势菌群,占测得序列的62.9%。2)DGGE条带的系统发育分析显示,核桃举肢蛾幼虫肠道中,72.5%的菌株属变形菌门,12.5%的菌株属于厚壁菌门,15.0%的菌株属于拟杆菌菌门。桃蛀螟幼虫肠道中,37.0%的菌株属于变形菌门,63.0%的菌株属于厚壁菌门,未检测到拟杆菌门细菌。3)T-RFLP分析显示76 bp和122 bp T-RFs分别是桃蛀螟和核桃举肢蛾幼虫肠道的优势菌群,T-RFLP的主成分和聚类分析显示核桃举肢蛾和桃蛀螟幼虫肠道细菌群落结构明显地分为2类。4)PCRDGGE和T-RFLP 2种方法均显示核桃举肢蛾幼虫与桃蛀螟幼虫肠道细菌多样性差异不显著但种类组成所占比例有较大差异。【结论】初步揭示了危害核桃果实的2种不同食性昆虫幼虫肠道细菌组成特点,可为进一步探讨其肠道微生物与其食性之间的关系提供理论基础。 展开更多
关键词 核桃举肢蛾 桃蛀螟 肠道微生物 PCR-DGGE t-rflp
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基于T-RFLP和因子分析的香蒲根际细菌群落研究 被引量:7
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作者 马栋山 熊薇 +3 位作者 张琼琼 郭羿宏 赵文吉 郭逍宇 《中国环境科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2014年第10期2684-2691,共8页
以北京市永定河王平湿地为研究对象,应用末端限制性片段长度多态性(T-RFLP)对王平湿地再生水补水口及其远离补水口的香蒲根际细菌和氨氧化细菌(AOB)的群落结构及多样性变化进行分析,在此基础上结合MiCA3比对、典范对应分析(CCA)和多元... 以北京市永定河王平湿地为研究对象,应用末端限制性片段长度多态性(T-RFLP)对王平湿地再生水补水口及其远离补水口的香蒲根际细菌和氨氧化细菌(AOB)的群落结构及多样性变化进行分析,在此基础上结合MiCA3比对、典范对应分析(CCA)和多元统计中因子分析(FA),解析湿地不同空间细菌群落功能特性的变化.结果显示再生水补水口细菌群落各多样性指数均明显低于远离补水口细菌群落,而氨氧化细菌群落则呈现相反趋势.基于传统的T-RFLP片段MiCA3比对、CCA和FA相结合的分析表明:对细菌群落,占再生水补水口细菌群落总丰度55.6%的菌群与150bp代表的鞘氨醇单胞菌(Sphingomonas sp.)具相似净化功能,并与总有机碳生物化学循环过程具密切关系,其次占再生水补水口上游细菌群落总丰度75.5%的菌群与81bp为代表的假单胞菌属(Pseudomonas sp.)和Geitlerinema sp.具相似净化功能,并与氮的生物化学循环过程具密切关系.占再生水补水口下游细菌群落总丰度68.7%的菌群与138bp代表的小单孢菌属(Micromonospora sp.)具相似净化功能,同时与重金属Cu、V、和Ti生物化学循环具密切关系.对氨氧化细菌,266bp受铵态氮影响较大,占再生水补水口氨氧化细菌群落总丰度65.5%的菌群与266bp代表的Nitrosomonas sp.具相似的生境特征,适合在高氨环境中生长;与58bp所代表的Nitrosospira sp.具相似功能特性菌群丰度在远离补水口样点中较前者呈现显著增加趋势,表征该类菌群适合在相对低氨环境中生长. 展开更多
关键词 因子分析(FA) 末端限制性片段长度多态性(t-rflp)技术 再生水 根际细菌
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T-RFLP分析不同森林类型土壤真菌组成及分布 被引量:2
16
作者 武耀祥 王璞 +1 位作者 隋心 韩士杰 《湖北农业科学》 北大核心 2013年第6期1443-1446,共4页
在长白山森林生态系统定位站,利用T-RFLP技术研究了6种不同森林类型土壤真菌组成及其分布特征。结果表明,6种不同森林类型土壤真菌多样性指数以白桦林中后期最高,过熟阔叶红松林次之,杨桦成熟林最低。不同森林类型的真菌群落相似度也很... 在长白山森林生态系统定位站,利用T-RFLP技术研究了6种不同森林类型土壤真菌组成及其分布特征。结果表明,6种不同森林类型土壤真菌多样性指数以白桦林中后期最高,过熟阔叶红松林次之,杨桦成熟林最低。不同森林类型的真菌群落相似度也很低,其数量、类型及分布均存在着差异。 展开更多
关键词 土壤 真菌 DNA提取 ITS-PCR t-rflp
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基于T-RFLP方法的连栽杉木根际土壤细菌群落变化研究 被引量:13
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作者 吴则焰 赵紫檀 +5 位作者 林文雄 李建鹃 刘书影 周柳婷 罗扬 刘金福 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第19期7134-7143,共10页
运用末端限制性片段长度多态性技术(T RFLP),研究福建省尤溪国有林场的多代连栽杉木根际土壤细菌群落变化特征。结果表明:杉木多代连栽后根际微生态失衡,表现为碳循环菌和氮循环菌等有益菌数量减少,病原菌数量增加。在不同代数杉木土壤... 运用末端限制性片段长度多态性技术(T RFLP),研究福建省尤溪国有林场的多代连栽杉木根际土壤细菌群落变化特征。结果表明:杉木多代连栽后根际微生态失衡,表现为碳循环菌和氮循环菌等有益菌数量减少,病原菌数量增加。在不同代数杉木土壤中,4种内切酶消化后产生的末端限制性片段(T RFs)数量具有显著差异,第一代杉木(first Chinese fir rotation plantation,FCP)最高,第二代杉木(second Chinese fir rotation plantation,SCP)次之,第三代杉木(third Chinese fir rotation plantation,TCP)最少。土壤理化性质结果表明连栽导致土壤养分逐代降低,除土壤碳氮比与细菌群落多样性呈显著负相关外,土壤养分含量指标与细菌群落多样性呈显著正相关。T RFLP实验共鉴定出细菌门类12门,其中厚壁菌门、蓝藻门、放线菌门和变形菌门是主要优势菌群。随栽植代数的增加,变形菌门细菌比例递增,而厚壁菌门细菌比例递减。土壤细菌群落多样性指数,表现为随栽植代数增长而减少,呈现FCP>SCP>TCP趋势,与T RFs片段数量变化趋势基本一致,表明多代连栽降低了杉木根际土壤细菌群落多样性。依据功能性不同,可将鉴定出的细菌划分为5类:碳循环功能菌、硫循环功能菌、氮循环功能菌、纤维降解菌及病原菌。连栽导致碳循环菌和氮循环菌相对含量降低,硫循环菌和纤维降解菌相对含量提高,病原菌相对含量随栽植代数增加而上升。 展开更多
关键词 连栽 杉木 土壤微生物 群落多样性 末端限制性片段长度多态性
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基于T-RFLP技术的不同水位梯度植物根际细菌群落多样性特征分析 被引量:16
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作者 张琼琼 黄兴如 郭逍宇 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第14期4518-4530,共13页
为了解水位梯度控制下不同湿地植物根际细菌群落多样性,以北京市奥林匹克公园植物氧化塘人工湿地为例,采用末端限制性片段长度多态性(T-RFLP)技术结合ANOVA分析,比较了水位梯度控制下三棱草、芦苇、香蒲、睡莲4种植物根际细菌群落的多... 为了解水位梯度控制下不同湿地植物根际细菌群落多样性,以北京市奥林匹克公园植物氧化塘人工湿地为例,采用末端限制性片段长度多态性(T-RFLP)技术结合ANOVA分析,比较了水位梯度控制下三棱草、芦苇、香蒲、睡莲4种植物根际细菌群落的多样性。研究结果显示:随着水位梯度加深,根际细菌群落多样性呈现减少趋势,HhaⅠ、MspⅠ、RsaⅠ3种不同酶切所得结果一致,且综合3种酶切的PAT比对中RFs组合数量随水位梯度加深也呈相应变化趋势。进一步分析发现,随水位梯度加深植物根际可培养细菌RFs数量变化较显著。不同水位梯度下各植物根际细菌群落中差异显著的菌群为Beta变形杆菌纲,水位梯度加深可能导致不同生态型植物根际泌氧能力降低,进而影响植物根际好氧细菌生存,从而出现三棱草根际属水平菌群丰富度最高,其次为芦苇、香蒲,最少为睡莲。各植物根际细菌群落的优势属多数为变形杆菌门,是脱氮除磷的功能性菌门,其中产碱杆菌属和黄杆菌属为四种植物根际细菌的共同优势属,在碳氮循环中起重要作用。 展开更多
关键词 水位梯度 湿地植物 细菌多样性 T—RFLP
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T-RFLP技术及其在微生物群落结构研究中的应用 被引量:7
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作者 罗佳捷 李丽立 张彬 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2009年第7期75-78,共4页
作者介绍了末端限制性片段长度多态性(T-RFLP)分析技术的基本原理和操作方法,并就该方法在生态环境中、动物和人体内微生物群落结构的研究应用情况做了综述。由于T-RFLP分析技术不依赖于细菌培养,并且整合了自动测序仪的高分辨率和高通... 作者介绍了末端限制性片段长度多态性(T-RFLP)分析技术的基本原理和操作方法,并就该方法在生态环境中、动物和人体内微生物群落结构的研究应用情况做了综述。由于T-RFLP分析技术不依赖于细菌培养,并且整合了自动测序仪的高分辨率和高通量特征,因此,对于分析复杂的群落结构比其它的指纹识别技术具有更明显的优势,最后分析了此种技术的不足之处并对它的应用前景做出了展望。 展开更多
关键词 末端限制性片段长度多态性 微生物群落结构 指纹识别 自动测序
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T-RFLP和454焦磷酸测序方法分析制麦过程细菌群落的动态变化 被引量:4
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作者 邱然 陆健 《食品与生物技术学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期71-77,共7页
确定微生物菌群特性是制麦管理与优化的关键一步。本研究以两个不同收获年份及两个同批次不同制麦方式的大麦为样品,采用两种非培养计数方法,即16S核糖体RNA(16S rRNA)末端限制片段长度多态性(T-RFLP)和454焦磷酸测序,检测制麦过程细菌... 确定微生物菌群特性是制麦管理与优化的关键一步。本研究以两个不同收获年份及两个同批次不同制麦方式的大麦为样品,采用两种非培养计数方法,即16S核糖体RNA(16S rRNA)末端限制片段长度多态性(T-RFLP)和454焦磷酸测序,检测制麦过程细菌及乳酸菌菌群结构,以期全面、准确分析细菌群落结构及动态变化。研究结果显示:不同收获年份的大麦细菌菌群结构存在差异,整个细菌群落结构随着制麦过程而发生变化,而不同发芽方式之间并没有明显的区别。454焦磷酸测序结果显示乳酸菌有139个运算分类单元(OTU),所有样品有88%的序列覆盖了5个OTU(如Weissella、Lactobacillus和Leuconostoc菌属),说明制麦过程乳酸菌的多样性较低,优势乳酸菌相对数量随着制麦条件变化而波动,并且大麦的收获年份和制麦环境也影响乳酸菌的菌群结构。 展开更多
关键词 麦芽 微生物菌群 乳酸菌 末端限制片段长度多态性
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