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基于Solexa高通量测序的黄曲条跳甲转录组学研究被引量：16: 1; 作者贺华良宾淑英 +1 位作者吴仲真林进添《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期1-11,共11页; 黄曲条跳甲Phyllotretastriolata(Fabricius)是十字花科蔬菜的重要害虫。为深入了解其遗传信息,本研究应用新一代高通量测序技术Illumina'sSolexa平台对黄曲条跳甲成虫的转录组进行测序,并结合SOAPdenovo拼接聚类等分析软件,获取大... 展开更多; 关键词黄曲条跳甲 solexa测序序列重叠群独立基因转录组; 在线阅读下载PDF 职称材料

第二代测序技术用于水稻和稻瘟菌互作早期转录组的分析被引量：14: 2; 作者李湘龙柏斌 +2 位作者吴俊邓启云周波《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期102-112,共11页; 稻瘟菌为了实现对水稻的有效侵染,在侵染水稻时可能通过表达和转运一定数量的效应蛋白进入到水稻细胞,抑制和干扰水稻的先天免疫机制。文章利用Solexa第二代测序技术,通过开展水稻和稻瘟菌互作早期转录组的测定和分析,克隆和鉴定在互作... 展开更多; 关键词 solexa测序技术分泌蛋白转录组分析表达特异性稻瘟菌; 在线阅读下载PDF 职称材料

非编码RNA检测技术的研究进展被引量：3: 3; 作者李艳丁先锋苗杰《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2010年第11期5546-5548,共3页; 非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)广泛存在于生物体中,不编码蛋白质,以RNA的形式在许多生命过程中发挥着重要的作用。随着越来越多ncRNA生物学功能的揭示,检测ncRNA在不同生理和病理状态下表达谱的变化,已迅速成为研究的热点。为了将nc... 展开更多; 关键词非编码RNA 检测技术实时荧光定量PCR 微阵列芯片 solexa测序技术; 在线阅读下载PDF 职称材料

细粒棘球绦虫miRNAs的鉴定及分析: 4; 作者郝力力李锐李必富《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2012年第4期654-657,共4页; 细粒棘球绦虫具有复杂的基因调控模式,在中间宿主和终末宿主体内具有截然不同的生物学特性。miRNA是真核生物内存在的非常重要的调控因子,本研究采用Solexa高通量测序技术,对G1株原头蚴mi-croRNAs进行了鉴定和分析,总共发现了108条miRN... 展开更多; 关键词细粒棘球绦虫 MIRNAS solexa高通量测序技术; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基于Solexa高通量测序的黄曲条跳甲转录组学研究被引量：16: 1; 作者贺华良宾淑英吴仲真林进添; 机构仲恺农业工程学院外来有害生物预警与控制研究所; 出处《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期1-11,共11页; 基金国家自然科学基金青年科学基金项目(31101500); 文摘黄曲条跳甲Phyllotretastriolata(Fabricius)是十字花科蔬菜的重要害虫。为深入了解其遗传信息,本研究应用新一代高通量测序技术Illumina'sSolexa平台对黄曲条跳甲成虫的转录组进行测序,并结合SOAPdenovo拼接聚类等分析软件,获取大量的EST和挖掘功能基因。本文最终获得了4924条序列重叠群(contig),其中包含2209种与黑腹果蝇Drosophilamelanogaster蛋白基因具直系同源的独立基因(unigene)和610种黄曲条跳甲物种特有的unigene。结合GeneOntology(GO)数据库进行分析,发现大部分的unigene具结合能力(bindingcapability)和催化活性(catalyticactivity);上百种unigene可聚类于生物学过程分类中的配子发生、生殖腺发育和交配行为等重要功能。另外,结合KEGGPathway数据库分析发现,共有363种unigene参与或涉及了40种代谢路径,其中生物钟调控路径和植物次生代谢物路径等相关基因的发现,有助于深入研究黄曲条跳甲行为发生的内在机理。Solexa高通量测序技术作为昆虫功能基因组研究的重要手段,为发掘黄曲条跳甲功能基因发挥了重要作用,也为在分子水平上研发黄曲条跳甲的防治新策略提供了更翔实的基因信息。; 关键词黄曲条跳甲 solexa测序序列重叠群独立基因转录组; Keywords Phyllotreta striolata Illumina＇s solexa sequencing technology contig unigene transcriptome; 分类号 Q966 [生物学—昆虫学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名第二代测序技术用于水稻和稻瘟菌互作早期转录组的分析被引量：14: 2; 作者李湘龙柏斌吴俊邓启云周波; 机构中南大学研究生院隆平分院浙江省农业科学院病毒学与生物技术研究所国家杂交水稻工程技术研究中心浙江大学生物与技术研究所; 出处《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期102-112,共11页; 基金转基因生物新品种培育重大专项(编号:2009ZX08001-012B) 中央高校基本科研业务费专项(编号:2009QNA6024)资助; 文摘稻瘟菌为了实现对水稻的有效侵染,在侵染水稻时可能通过表达和转运一定数量的效应蛋白进入到水稻细胞,抑制和干扰水稻的先天免疫机制。文章利用Solexa第二代测序技术,通过开展水稻和稻瘟菌互作早期转录组的测定和分析,克隆和鉴定在互作早期表达的稻瘟菌效应蛋白基因。利用序列同源比对,我们从总计约12.5 M条序列标签中,分离和鉴定了338 942条来源于稻瘟菌的序列,并最终定位到779个稻瘟菌预测基因。其中108个基因很可能参与了水稻和稻瘟菌互作过程,42个基因为预测的分泌蛋白基因。通过RT-PCR分析,最终确认了42个预测分泌蛋白基因中有12个基因在侵染水稻早期有显著的表达,而其中有4个基因表现为侵染早期特异表达。文章尝试利用第二代测序技术实现稻瘟菌侵染早期特异表达基因,尤其是分泌蛋白基因的快速克隆和鉴定,为稻瘟菌效应蛋白基因的克隆和功能鉴定提供了较为有意义的探索。; 关键词 solexa测序技术分泌蛋白转录组分析表达特异性稻瘟菌; Keywords solexa sequencing technology secreted protein transcriptome analysis expression specificity Mag-naporthe oryzae; 分类号 S435.111.41 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名非编码RNA检测技术的研究进展被引量：3: 3; 作者李艳丁先锋苗杰; 机构浙江理工大学生命科学学院; 出处《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2010年第11期5546-5548,共3页; 基金国家高技术研究发展计划(863)资助项目(2007AA02-Z165); 文摘非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)广泛存在于生物体中,不编码蛋白质,以RNA的形式在许多生命过程中发挥着重要的作用。随着越来越多ncRNA生物学功能的揭示,检测ncRNA在不同生理和病理状态下表达谱的变化,已迅速成为研究的热点。为了将ncRNA更好地应用于农业生产和生物医学研究,笔者对ncRNA最新检测技术的原理与应用进行了综述。; 关键词非编码RNA 检测技术实时荧光定量PCR 微阵列芯片 solexa测序技术; Keywords Non-coding RNA Detection technology Real-time quantitative PCR Microarray solexa sequencing; 分类号 Q52 [生物学—生物化学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名细粒棘球绦虫miRNAs的鉴定及分析: 4; 作者郝力力李锐李必富; 机构西南民族大学生命科学与技术学院浙江省农业科学院农产品质量标准研究所; 出处《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2012年第4期654-657,共4页; 基金西南民族大学中央高校基本科研业务费(11NZYQN06); 文摘细粒棘球绦虫具有复杂的基因调控模式,在中间宿主和终末宿主体内具有截然不同的生物学特性。miRNA是真核生物内存在的非常重要的调控因子,本研究采用Solexa高通量测序技术,对G1株原头蚴mi-croRNAs进行了鉴定和分析,总共发现了108条miRNAs,其中26条属于保守家族,82条是细粒棘球绦虫特有。; 关键词细粒棘球绦虫 MIRNAS solexa高通量测序技术; Keywords Echinococcus granulosus miRNAs solexa high-throughput sequencing technology; 分类号 S852.7 [农业科学—基础兽医学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	基于Solexa高通量测序的黄曲条跳甲转录组学研究	贺华良宾淑英吴仲真林进添	《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心	2012	16	在线阅读下载PDF 职称材料
2	第二代测序技术用于水稻和稻瘟菌互作早期转录组的分析	李湘龙柏斌吴俊邓启云周波	《遗传》 CAS CSCD 北大核心	2012	14	在线阅读下载PDF 职称材料
3	非编码RNA检测技术的研究进展	李艳丁先锋苗杰	《安徽农业科学》 CAS 北大核心	2010	3	在线阅读下载PDF 职称材料
4	细粒棘球绦虫miRNAs的鉴定及分析	郝力力李锐李必富	《浙江农业学报》 CSCD 北大核心	2012	0	在线阅读下载PDF 职称材料