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新基因6次跨膜表位抗原4在肥胖患儿脂肪组织的表达及生物信息学分析
被引量：
3
1
作者
高春林
刘光陵
+7 位作者
夏正坤
邱洁
高远赋
樊忠民
伏洁
任献国
徐敏
郭锡熔
《医学研究生学报》
CAS
2011年第2期117-121,共5页
目的肥胖呈现全球流行趋势。目前,已基本证实其为一种多基因遗传病,先前研究小组筛选获得肥胖相关的新基因6次跨膜表位抗原(six-transmembrane epithelial antigen of the prostate 4,STEAP4)在肥胖患儿脂肪组织中差异表达,旨在进一步...
目的肥胖呈现全球流行趋势。目前,已基本证实其为一种多基因遗传病,先前研究小组筛选获得肥胖相关的新基因6次跨膜表位抗原(six-transmembrane epithelial antigen of the prostate 4,STEAP4)在肥胖患儿脂肪组织中差异表达,旨在进一步验证其在肥胖儿童脂肪组织中的表达,并初步探讨STEAP4的生物信息学特征。方法采用实时荧光定量PCR(Realtime-qPCR)技术验证肥胖与健康儿童脂肪组织中STEAP4基因的表达差异,应用DNA Star、Blast、ProtParam、SOPMA、Tar-getP、TMHMM、ProtScale、Interpro Scan和SMART等软件或数据库分析STEAP4的核苷酸基本特征、蛋白质理化性质、信号肽、跨膜结构域、疏水性/亲水性、结构域及亚细胞定位等。结果 STEAP4基因是一个功能未知的基因,低表达于肥胖患儿脂肪组织中,生物信息学分析该基因cDNA全长4454 bp,开放阅读框(open reading frame,ORF)长1380 bp,编码459个氨基酸,预测相对分子质量51981.2,定位在胞膜,蛋白序列分析显示为6次跨膜螺旋结构,为可溶的亲水性蛋白,蛋白结构域分析显示具有黄素蛋白跨膜成分(三铁还原酶结构域),NAD(P)结合结构域,NADP氧化还原酶(依赖辅酶F420)和血红素蛋白保守位点。结论 STEAP4基因是一低表达于肥胖患儿脂肪组织中的基因,高度提示该蛋白与肥胖及其相关的胰岛素抵抗的发生存在相关性,值得进一步研究证实。
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关键词
肥胖症
STEAP
基因表达
计算生物学
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职称材料
题名
新基因6次跨膜表位抗原4在肥胖患儿脂肪组织的表达及生物信息学分析
被引量：
3
1
作者
高春林
刘光陵
夏正坤
邱洁
高远赋
樊忠民
伏洁
任献国
徐敏
郭锡熔
机构
南京军区南京总医院儿科
南京医科大学附属南京儿童医院普外科
南京医科大学附属南京妇幼保健院
出处
《医学研究生学报》
CAS
2011年第2期117-121,共5页
基金
国家自然科学基金(30772364)
江苏省医学领军人才培养经费基金(LJ200624)
文摘
目的肥胖呈现全球流行趋势。目前,已基本证实其为一种多基因遗传病,先前研究小组筛选获得肥胖相关的新基因6次跨膜表位抗原(six-transmembrane epithelial antigen of the prostate 4,STEAP4)在肥胖患儿脂肪组织中差异表达,旨在进一步验证其在肥胖儿童脂肪组织中的表达,并初步探讨STEAP4的生物信息学特征。方法采用实时荧光定量PCR(Realtime-qPCR)技术验证肥胖与健康儿童脂肪组织中STEAP4基因的表达差异,应用DNA Star、Blast、ProtParam、SOPMA、Tar-getP、TMHMM、ProtScale、Interpro Scan和SMART等软件或数据库分析STEAP4的核苷酸基本特征、蛋白质理化性质、信号肽、跨膜结构域、疏水性/亲水性、结构域及亚细胞定位等。结果 STEAP4基因是一个功能未知的基因,低表达于肥胖患儿脂肪组织中,生物信息学分析该基因cDNA全长4454 bp,开放阅读框(open reading frame,ORF)长1380 bp,编码459个氨基酸,预测相对分子质量51981.2,定位在胞膜,蛋白序列分析显示为6次跨膜螺旋结构,为可溶的亲水性蛋白,蛋白结构域分析显示具有黄素蛋白跨膜成分(三铁还原酶结构域),NAD(P)结合结构域,NADP氧化还原酶(依赖辅酶F420)和血红素蛋白保守位点。结论 STEAP4基因是一低表达于肥胖患儿脂肪组织中的基因,高度提示该蛋白与肥胖及其相关的胰岛素抵抗的发生存在相关性,值得进一步研究证实。
关键词
肥胖症
STEAP
基因表达
计算生物学
Keywords
Obesity
six-transmembrane epithelial antigen of the prostate 4
Gene expression
Computational biology
分类号
Q786 [生物学—分子生物学]
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作者
出处
发文年
被引量
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1
新基因6次跨膜表位抗原4在肥胖患儿脂肪组织的表达及生物信息学分析
高春林
刘光陵
夏正坤
邱洁
高远赋
樊忠民
伏洁
任献国
徐敏
郭锡熔
《医学研究生学报》
CAS
2011
3
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