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SRAP分析体系的优化及在枇杷种质资源研究上的应用 被引量：45
1
作者 乔燕春 林顺权 +1 位作者 刘成明 杨向晖 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期348-352,共5页
以me7(5’-TGAGTCCAAACCGGTCC-3’)和em7(5’-GACTGCGTACGAATTCAA-3’)正反向引物组合对西班牙枇杷品种Javierin进行了SRAP分析体系的优化,结果表明,在25μL反应体系中,5种主要成分的适宜浓度或用量分别是:dNTPs0.3mmol/L,Mg2+2.5mmol/L... 以me7(5’-TGAGTCCAAACCGGTCC-3’)和em7(5’-GACTGCGTACGAATTCAA-3’)正反向引物组合对西班牙枇杷品种Javierin进行了SRAP分析体系的优化,结果表明,在25μL反应体系中,5种主要成分的适宜浓度或用量分别是:dNTPs0.3mmol/L,Mg2+2.5mmol/L,TaqDNA聚合酶1.0U,引物0.3μmol/L,模板DNA20ng,优化的扩增程序为:94℃预变性5min,94℃变性1min,35℃复性1min,72℃延伸1min30s,5个循环;之后94℃变性1min,50℃复性1min,72℃延伸1min30s,35个循环;最后72℃下延伸10min。并将该优化的体系在来自中国、西班牙、日本、意大利和美国的46份枇杷种质资源上进行了SRAP扩增的初步应用,经琼脂糖和聚丙烯酰胺凝胶电泳均获得了清晰、重复性好的SRAP指纹图谱。 展开更多
关键词 枇杷 种质资源 srap 体系优化
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青藏高原东南缘老芒麦自然居群遗传多样性的SRAP和SSR分析 被引量：30
2
作者 鄢家俊 白史且 +4 位作者 张新全 常丹 游明鸿 张昌兵 李达旭 《草业学报》 CSCD 北大核心 2010年第4期122-134,共13页
基于SRAP和SSR分子标记分析了青藏高原东南缘8个老芒麦自然居群遗传变异及群体遗传结构,获得下述结果:1)16对SRAP引物在90个单株中共扩增出384条可统计条带,其中多态性条带334条,占86.98%;16个SSR位点共检测出等位变异221个,平均每个位... 基于SRAP和SSR分子标记分析了青藏高原东南缘8个老芒麦自然居群遗传变异及群体遗传结构,获得下述结果:1)16对SRAP引物在90个单株中共扩增出384条可统计条带,其中多态性条带334条,占86.98%;16个SSR位点共检测出等位变异221个,平均每个位点13.8个,其中具有多态性的位点数192个,占86.88%。2)2种分子标记检测到老芒麦居群水平的基因多样性(He)分别为0.1092和0.1296,而物种水平的基因多样性达0.2434和0.3732。3)基于2种标记的Nei氏遗传分化指数Gst(0.5525和0.5158)表明老芒麦居群出现了较大程度的遗传分化,居群间的基因流非常有限,分别为0.4050和0.4694,老芒麦的遗传变异主要分布在居群间,居群内变异相对较小,Shannon多样性指数和分子方差变异(AMOVA)分析显示了相似的结果。4)基于聚类分析结果表明各居群间存在较为明显的地理分化,8个居群分化为采集地范围内的南、北和中部3个分支。通过对老芒麦遗传多样性和遗传结构的分析提出了对该物种遗传多样性的保护策略。 展开更多
关键词 老芒麦 遗传多样性 群体遗传结构 srap SSR
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应用ISSR与SRAP分析烟草种质资源遗传多样性及遗传演化关系 被引量：29
3
作者 祁建民 梁景霞 +5 位作者 陈美霞 徐建堂 牛小平 周东新 王涛 陈顺辉 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第8期1425-1434,共10页
应用ISSR与SRAP两种分子标记,研究国内外96份烟草种质的遗传多样性及不同栽培类型种质的遗传演化关系。表明烟属种间具有丰富的遗传多样性,种间的遗传相似性(GS)在0.28～0.58之间,遗传分化系数(Gst)为0.83。普通栽培种品种间遗传多样性... 应用ISSR与SRAP两种分子标记,研究国内外96份烟草种质的遗传多样性及不同栽培类型种质的遗传演化关系。表明烟属种间具有丰富的遗传多样性,种间的遗传相似性(GS)在0.28～0.58之间,遗传分化系数(Gst)为0.83。普通栽培种品种间遗传多样性水平较低,品种间的遗传相似性在0.61～0.99之间,栽培种内的遗传多样性为烤烟>晒晾烟>白肋烟>香料烟。当相似系数在0.67作切割线时,基于2种标记的96份烟草种质资源的聚类结果显示:(1)普通烟草栽培品种材料91份聚在同一大类,而黄花烟、黏烟草、浅波烟草、哥西氏烟草、香甜烟草5个种也分别为单独的个类,同普通烟草栽培种类群完全区别开来;(2)从进化上看,烤烟和晒晾烟间的遗传进化关系最近,香料烟和黄花烟之间的亲缘关系较远;普通烟草栽培种中国内外来源的烟草品种亲缘关系极其相近,遗传分化现象甚微;(3)2种分子标记虽然原理不同,但分析结果趋势相近(r=0.68,P=1.000)。 展开更多
关键词 烟草 ISSR srap 遗传多样性 遗传演化
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11个红花品种遗传多样性与亲缘关系的SRAP分析 被引量：17
4
作者 江磊 李刚 +3 位作者 岳帅 刘虹 严兴初 覃瑞 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第5期546-550,共5页
利用SRAP技术对来源于中国不同地区的11份红花品种材料亲缘关系进行了分析.选用了25对具有多态性条带的引物组合,获得了308条清晰的条带,其中109条具有多态性,多态性位点百分率为35％.遗传相似系数变幅在0.82 ～ 0.934 2之间,平均相似... 利用SRAP技术对来源于中国不同地区的11份红花品种材料亲缘关系进行了分析.选用了25对具有多态性条带的引物组合,获得了308条清晰的条带,其中109条具有多态性,多态性位点百分率为35％.遗传相似系数变幅在0.82 ～ 0.934 2之间,平均相似系数为0.87,表明红花种内不同品种间存在一定的遗传多样性.聚类结果分析表明,在相似系数GS=0.891 4处,可以将11份红花材料分为四类. 展开更多
关键词 红花 srap(序列扩增多态性) 基因组
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SRAP/RSAP标记鉴定印度南瓜种子纯度的方法 被引量：15
5
作者 刘泽发 孙小武 +3 位作者 董亚静 罗育才 曾永贤 邹坤 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期124-128,共5页
应用相关序列扩增多态性(SRAP)标记和限制性位点扩增多态性(RSAP)标记对印度南瓜品种杂交种子纯度进行鉴定试验。结果表明,筛选出的引物E1M5和R1R7可很好地区分出红栗二号、红栗、锦栗二号和锦栗南瓜,利用RSAP分子标记R1R7可检测出锦栗... 应用相关序列扩增多态性(SRAP)标记和限制性位点扩增多态性(RSAP)标记对印度南瓜品种杂交种子纯度进行鉴定试验。结果表明,筛选出的引物E1M5和R1R7可很好地区分出红栗二号、红栗、锦栗二号和锦栗南瓜,利用RSAP分子标记R1R7可检测出锦栗杂交种子纯度,分子标记检测结果与田间检测结果吻合率达到90%。 展开更多
关键词 印度南瓜 RSAP srap 纯度鉴定
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辽宁地区主栽杨树品种的SRAP标记遗传多样性分析 被引量：20
6
作者 陈罡 邢兆凯 +5 位作者 潘文利 关明东 魏忠平 叶景丰 马冬菁 高军 《东北林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第10期19-22,共4页
采用SRAP分子标记技术对17个采自辽宁不同地区的杨树材料进行了遗传多样性研究。结果表明:利用31对SRAP引物共扩增出685个多态性条带,平均每个引物扩增出23.2条带,多态性比率为95.3%,各品种之间的遗传相似系数在0.3622～0.9475,平均相... 采用SRAP分子标记技术对17个采自辽宁不同地区的杨树材料进行了遗传多样性研究。结果表明:利用31对SRAP引物共扩增出685个多态性条带,平均每个引物扩增出23.2条带,多态性比率为95.3%,各品种之间的遗传相似系数在0.3622～0.9475,平均相似系数为0.6549。通过UPGMA聚类分析将17个杨树材料分为4个群,其划分结果与传统分类基本一致,证明SRAP标记是一种适于杨树遗传多样性研究的分子标记技术。聚类结果表明,品种间遗传差异最小是银中杨和毛白杨,差异最大的是意大利45杨和毛白杨;2个小胡杨的种内遗传差异最小,而2个意大利45杨的种内遗传差异较大。 展开更多
关键词 杨树 srap 遗传多样性
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Bassam和Sanguinetti银染方法在SRAP和TRAP标记中的比较研究 被引量：23
7
作者 任民 贾兴华 +2 位作者 蒋彩虹 杨爱国 王日新 《生物技术通报》 CAS CSCD 2008年第1期113-116,121,共5页
银染作为一种重要的DNA染色方法,对分子标记检测有重要影响。SRAP标记和TRAP标记是两种较为新型的分子标记,近年来得到了广泛应用,尤其在缺少遗传图谱的物种中应用价值更大。以普通烟草种(Nicotianatabacum L.)烤烟和香料烟品种作为供... 银染作为一种重要的DNA染色方法,对分子标记检测有重要影响。SRAP标记和TRAP标记是两种较为新型的分子标记,近年来得到了广泛应用,尤其在缺少遗传图谱的物种中应用价值更大。以普通烟草种(Nicotianatabacum L.)烤烟和香料烟品种作为供试材料,对Bassam和Sanguinetti两种银染方法,在标记检测效率、成本及染色效果等方面进行了研究,并对其在SRAP标记和TRAP标记中的应用进行了探讨。结果表明,Sanguinetti银染法比Bassam银染更为简便、经济,染色照片的色阶图说明Sanguinetti染色方法的背景与扩增带区分明显,能够清楚地读带;且该方法能够扩增出很好的SRAP和TRAP标记谱带。因此,推荐在SRAP和TRAP标记检测中采用Sanguinetti银染方法。 展开更多
关键词 银染 srap标记 TRAP标记
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26份棉花耐盐相关种质资源遗传多样性SRAP分析 被引量：7
8
作者 刘雅辉 王秀萍 +3 位作者 鲁雪林 张国新 李九欢 李强 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2014年第1期219-221,共3页
土壤盐渍化是影响农业生产的主要胁迫因子.中国的盐渍土近1×10^8hm^2,且盐渍化和次生盐渍化不断扩大,盐渍化土壤结构极差,作物难以正常生长,严重影响了作物的产量和品质.因此合理开发利用盐碱地是一项迫在眉睫的任务.棉花是中国重... 土壤盐渍化是影响农业生产的主要胁迫因子.中国的盐渍土近1×10^8hm^2,且盐渍化和次生盐渍化不断扩大,盐渍化土壤结构极差,作物难以正常生长,严重影响了作物的产量和品质.因此合理开发利用盐碱地是一项迫在眉睫的任务.棉花是中国重要的经济作物,在国民经济中占有举足轻重的地位[1-2],在粮棉争地矛盾日益突显的情况下,棉花以其较好的耐盐性,逐渐成为盐碱地一种新的优势作物.目前,中国是世界上盐碱地植棉规模最大的国家.据不完全统计[3],中国植棉区内盐碱地约有1.7×10^8hm^2,其中2.7×10^6hm^2先后开发植棉. 展开更多
关键词 棉花 耐盐性 遗传多样性 srap
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正交设计优化花菜类SRAP分子标记体系的研究 被引量：8
9
作者 李媛 姚雪琴 +2 位作者 谢祝捷 龚义勤 柳李旺 《上海农业学报》 CSCD 北大核心 2010年第1期42-45,共4页
采用正交设计,从Mg2+、dNTPs、引物三种因素3个水平对青花菜SRAP反应体系进行优化,确立适合青花菜的SRAP反应体系,并在6个青花菜和花椰菜品种中进行验证。结果表明:20μL反应体系中适宜体系的浓度dNTPs为0.2mmol/L、Mg2+为1.25mmol/L、... 采用正交设计,从Mg2+、dNTPs、引物三种因素3个水平对青花菜SRAP反应体系进行优化,确立适合青花菜的SRAP反应体系,并在6个青花菜和花椰菜品种中进行验证。结果表明:20μL反应体系中适宜体系的浓度dNTPs为0.2mmol/L、Mg2+为1.25mmol/L、上下引物各0.4μmol/L、DNA为20ng、Taq酶1.2U、退火温度为50℃。 展开更多
关键词 青花菜 花椰菜 srap 体系优化
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山核桃SRAP体系的建立及与RAPD和ISSR标记的比较 被引量：12
10
作者 李元春 沈林 曾燕如 《浙江农林大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期505-512,共8页
以山核桃Carya cathayensis基因组DNA为模板,对聚合酶链式反应(PCR)体系各组分进行了梯度实验,优化出条带清晰、重复性好的相关序列扩增多态性聚合酶链式反应(SRAP-PCR)扩增体系,并筛选了引物。该体系(25.00μL)为:1×缓冲液0.20 mm... 以山核桃Carya cathayensis基因组DNA为模板,对聚合酶链式反应(PCR)体系各组分进行了梯度实验,优化出条带清晰、重复性好的相关序列扩增多态性聚合酶链式反应(SRAP-PCR)扩增体系,并筛选了引物。该体系(25.00μL)为:1×缓冲液0.20 mmol.L-1,脱氧核糖核苷酸(dNTPs),0.20μmol.L-1引物,2.00 mmol.L-1镁离子(Mg2+),33.34 nkat Taq DNA聚合酶,0.80 mg.L-1基因组DNA(以上均为终浓度)。反应条件为94℃预变性5 min;94℃变性30 s,35℃退火30 s,72℃延伸2 min,5个循环;94℃变性30 s,50℃退火30 s,72℃延伸2 min,30个循环;72℃延伸8 min,4℃保存,反应时间比其他体系缩短了一半。从100对引物中筛选出了适用于山核桃的引物15对。在山核桃中,随机扩增多态性DNA(RAPD),简单序列重复区间(ISSR),SRAP等3种标记,以SRAP标记每对引物扩增的位点数及每对引物扩增的多态性位点数为多,但SRAP多态性引物的比例、多态性位点比例居于另2种标记之间。在山核桃研究中可以考虑使用SRAP及RAPD标记。 展开更多
关键词 经济林学 山核桃 相关序列扩增多态性(srap) 随机扩增多态性DNA(RAPD) 简单序列重复区间(ISSR)
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基于SRAP标记的刺葡萄亲缘关系分析 被引量：13
11
作者 刘昆玉 徐丰 +3 位作者 石雪晖 钟晓红 杨国顺 倪建军 《湖南农业大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2012年第6期607-611,共5页
运用SRAP标记对分布在湖南省内的21份刺葡萄资源进行遗传多样性与亲缘关系分析。结果表明:从84对SRAP引物组合中筛选出的7个引物组合中共扩增出61条带,其中有34条稳定的多态性条带,多态性比率为55.7%;运用NTSYS软件计算出21份材料的成... 运用SRAP标记对分布在湖南省内的21份刺葡萄资源进行遗传多样性与亲缘关系分析。结果表明:从84对SRAP引物组合中筛选出的7个引物组合中共扩增出61条带,其中有34条稳定的多态性条带,多态性比率为55.7%;运用NTSYS软件计算出21份材料的成对遗传相似系数为0.80～0.99,在遗传相似系数0.92处可将全部材料划分为3个类群;UPGMA聚类分析表明,在湖南省境内分布的刺葡萄有6个基本类型,并推测出了农大1号至农大9号育种材料(2003年由湖南农业大学运用秋水仙素处理不同地区刺葡萄种籽得到的诱变材料,由于经过3次搬迁,现已遗失亲本档案)的亲本。 展开更多
关键词 刺葡萄 亲缘关系 srap标记
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苎麻多胚苗遗传多样性的SRAP标记分析 被引量：5
12
作者 温岚 喻春明 +4 位作者 王延周 陈平 陈继康 谭龙涛 熊和平 《湖南农业大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期243-247,共5页
为分析苎麻多胚苗的遗传多样性,以靖西青麻和中苎1号杂交收获F1代种子,从中筛选出21对双胚苗、3株三胚苗和1株单胚苗,用SRAP标记对这些材料及其亲本进行遗传分析。结果表明:筛选出的24个引物组合共扩增出159个稳定的多态性条带,平均每... 为分析苎麻多胚苗的遗传多样性,以靖西青麻和中苎1号杂交收获F1代种子,从中筛选出21对双胚苗、3株三胚苗和1株单胚苗,用SRAP标记对这些材料及其亲本进行遗传分析。结果表明:筛选出的24个引物组合共扩增出159个稳定的多态性条带,平均每个组合6.8个;48份材料中成对遗传相似系数为0.360～0.876,在遗传相似系数0.51处可将全部材料划分为A、B、C、D四类群,在遗传相似系数0.586处,A类群又可以分为Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ3个亚群;多胚苗与亲本没有出现扩增条带完全一致的情况,本研究中苎麻多胚材料与无融合生殖无关。 展开更多
关键词 苎麻 多胚苗 相关序列扩增多态性(srap) 遗传多样性
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基于SRAP标记构建野生香菇核心种质库 被引量：10
13
作者 刘俊 马超君 +4 位作者 向星洁 李闯 边银丙 张健 肖扬 《食用菌学报》 CSCD 北大核心 2017年第1期7-17,共11页
以95份野生香菇(Lentinula edodes)种质和1份栽培种质为材料,在利用相关序列扩增多态性(sequence-related amplified polymorphism,SRAP)标记开展遗传多样性分析的基础上,采用属性约简启发式算法和逐步聚类位点优先取样法分别构建核心... 以95份野生香菇(Lentinula edodes)种质和1份栽培种质为材料,在利用相关序列扩增多态性(sequence-related amplified polymorphism,SRAP)标记开展遗传多样性分析的基础上,采用属性约简启发式算法和逐步聚类位点优先取样法分别构建核心种质。两种方法分别得到35份(Core 1)和29份(Core 2)种质,其核心种质保留比分别为36.5%和30.2%,位点保留比分别为100%和94.7%。基于有效等位基因数,Nei’s基因多样性指数,香农信息指数等四个参数对两组核心种质进行t测验,结果显示两组核心样本均能很好的代表原始种质的遗传多样性,但Core1具有更高的位点保留比例且地理来源更加广泛,确定为代表96个原始菌株的核心种质库。 展开更多
关键词 香菇 相关序列扩增多态性 遗传多样性 核心种质库
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甜瓜种质资源遗传多样性的SRAP分析 被引量：42
14
作者 陈芸 李冠 王贤磊 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2010年第7期744-751,共8页
为研究甜瓜材料之间的亲缘关系及其分类,更有效地利用种质资源,为培育新品种提供依据,文章采用SRAP(Sequence-related amplified polymorphism)技术对61份甜瓜种质资源的遗传多样性进行研究。结果表明:从42对引物组合中筛选出16对扩增... 为研究甜瓜材料之间的亲缘关系及其分类,更有效地利用种质资源,为培育新品种提供依据,文章采用SRAP(Sequence-related amplified polymorphism)技术对61份甜瓜种质资源的遗传多样性进行研究。结果表明:从42对引物组合中筛选出16对扩增条带清晰、多态性高的引物组合分析供试材料,共检测出452个位点,其中265个为多态性位点,多态性比率达58.63%,平均每对引物组合产生28.56个位点和16.56个多态性位点。61份材料间的相似系数为0.48～0.93,平均为0.73。这些结果说明,供试甜瓜材料具有较为丰富的遗传多样性。聚类分析结果表明,61个甜瓜品种中首先可分为薄皮甜瓜与厚皮甜瓜两大类,彼此亲缘关系最远。以遗传相似系数0.74为截值,可把供试材料分为5个类群。在生态区域中,新疆厚皮甜瓜的Nei’s基因多样性指数(0.2231)和Shannon’s信息指数(0.3422)最高。 展开更多
关键词 甜瓜 srap 遗传多样性
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新疆枸杞种质资源遗传多样性的SRAP分析 被引量：6
15
作者 查美琴 赵玉玲 +3 位作者 李疆 朱瑜 罗淑萍 胡月 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期681-687,共7页
利用SRAP分子标记技术对新疆枸杞种质资源遗传多样性及亲缘关系进行研究,为新疆枸杞种质资源分类和杂交育种提供理论依据。结果显示：（1）筛选出的12对SRAP引物共扩增出310个位点,其中多态性位点264个,多态性比率平均为84.61%,引物多... 利用SRAP分子标记技术对新疆枸杞种质资源遗传多样性及亲缘关系进行研究,为新疆枸杞种质资源分类和杂交育种提供理论依据。结果显示：（1）筛选出的12对SRAP引物共扩增出310个位点,其中多态性位点264个,多态性比率平均为84.61%,引物多态性信息含量（PIC）变化范围为0.76~0.93,平均为0.83;观测等位基因（Na）、有效等位基因数（Ne）、Neis基因多样性指数（H）、Shannon信息指数（I）平均值分别为1.846 1、1.386 9、0.228 0和0.352 0。（2）聚类分析表明,供试材料间的遗传相似系数为0.590 3~0.903 2,在遗传相似性系数为0.70和0.76时,可将30份样品分别分为2大类和5个亚类;主坐标分析结果和聚类结果基本一致。研究表明,新疆枸杞种质资源遗传多样性较丰富,且野生种与栽培品种（系）间的遗传差异较大,表现出较远的亲缘关系,而栽培品种（系）间的遗传差异相对较小,表现出较近的亲缘关系。 展开更多
关键词 枸杞 相关序列扩增多态性(srap) 聚类分析 主坐标分析 遗传多样性
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ITS-RFLP及SRAP标记在灰树花种质评价中的应用 被引量：11
16
作者 张美彦 尚晓冬 +3 位作者 李玉 郭倩 陈明杰 谭琦 《食用菌学报》 北大核心 2009年第3期5-10,共6页
以25个灰树花(Grifola frondosa)菌株的子实体为材料提取基因组DNA,ITS扩增后对产物进行酶切,25个菌株的ITS条带处于同一位置,酶切后部分菌株呈现不一样的切点,可将这些菌株大致分为三类。应用扩增清晰、多态性高的47对SRAP引物对这25... 以25个灰树花(Grifola frondosa)菌株的子实体为材料提取基因组DNA,ITS扩增后对产物进行酶切,25个菌株的ITS条带处于同一位置,酶切后部分菌株呈现不一样的切点,可将这些菌株大致分为三类。应用扩增清晰、多态性高的47对SRAP引物对这25个菌株进行SRAP分析,共得到138条多态性条带,树状图显示,这些菌株在相似度77%水平上可分为三类,与ITS-RFLP的分析结果类似。SRAP分析结果显示,有10个菌株可以被有效的区分,15个菌株未能找到其相互之间的差异带,说明ITS-RFLP和SRAP标记可以应用于区分菌株,进行种质评价。 展开更多
关键词 灰树花 srap ITS 种质评价
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东北地区大豆种质遗传多样性的SRAP标记分析 被引量：8
17
作者 张春宝 邱红梅 +3 位作者 赵洪锟 彭宝 赵丽梅 董英山 《大豆科学》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期17-22,共6页
利用12对SRAP引物对东北地区20份大豆材料进行了遗传多样性分析。结果表明：12对引物组合共扩增出1527条多态性条带，各材料之间的遗传相似系数为0．2869～0．5980，平均相似系数为0．4443，显示了东北大豆种质丰富的遗传多样性。经UPGM... 利用12对SRAP引物对东北地区20份大豆材料进行了遗传多样性分析。结果表明：12对引物组合共扩增出1527条多态性条带，各材料之间的遗传相似系数为0．2869～0．5980，平均相似系数为0．4443，显示了东北大豆种质丰富的遗传多样性。经UPGMA聚类分析，在阈值0．46处，可将供试材料分为6大类群，其中黑、吉两省大豆材料及国外种质问遗传相似度较高。研究表明，遗传改良和定向选择造成大豆品种间遗传背景日趋狭窄和混乱，SRAP分子标记技术能有效地分析大豆材料的遗传多样性和亲缘关系。 展开更多
关键词 大豆 种质 srap标记 遗传多样性
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红花SRAP扩增体系的建立和优化 被引量：24
18
作者 彭飒 郭美丽 +1 位作者 陈跃华 郭庆华 《第二军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第5期544-547,共4页
目的:探讨影响红花SRAP扩增的各种因素,建立能够稳定扩增红花基因组的体系,为研究红花重要性状的遗传基础及建立分子辅助标记育种的技术平台奠定基础。方法:用CTAB法提取红花DNA,设计Taq酶浓度(0.02、0.040、.06 U/μl)、dNTP浓度(0.15... 目的:探讨影响红花SRAP扩增的各种因素,建立能够稳定扩增红花基因组的体系,为研究红花重要性状的遗传基础及建立分子辅助标记育种的技术平台奠定基础。方法:用CTAB法提取红花DNA,设计Taq酶浓度(0.02、0.040、.06 U/μl)、dNTP浓度(0.15、0.25、0.30 mmol/L)、Primer浓度(0.15、0.30、0.45μmol/L)3因素3水平27次实验和Mg2+浓度(0.5、1.0、1.5、2.0、2.5、3.0、3.5、4.0 mmol/L)8水平单因素实验。在25μl体系中加入模板DNA 20 ng。对体系进行优化,用琼脂糖进行检测。结果:本研究建立了适合红花的SRAP体系,Taq酶浓度为0.02 U/μl,dNTP浓度为0.25 mmol/L,Primer浓度为0.30μmol/L,Mg2+的浓度为3.0 mmol/L,优化后的体系目标条带增多,重现性好,得到了较好的扩增效果。结论:本研究建立的反应体系适合红花SRAP的研究。 展开更多
关键词 红花 相关序列扩增多态性 核酸扩增技术
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利用SRAP分子标记研究美洲海蓬子实生群体遗传多样性 被引量：5
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作者 张旭 邢锦城 +3 位作者 陈健华 余桂红 张春银 马鸿翔 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2009年第6期1252-1257,共6页
选取28株不同形态的海蓬子株系,调查植株高度、分枝夹角、果荚长度等生物性状,并采用SRAP技术对海蓬子株系进行遗传多样性分析。测定数据显示,海蓬子的不同株系在植株高度、分枝夹角、果荚长度均存在显著差异。SRAP标记多态条带比率(PPB... 选取28株不同形态的海蓬子株系,调查植株高度、分枝夹角、果荚长度等生物性状,并采用SRAP技术对海蓬子株系进行遗传多样性分析。测定数据显示,海蓬子的不同株系在植株高度、分枝夹角、果荚长度均存在显著差异。SRAP标记多态条带比率(PPB)、Shannon多样性指数(I)以及Nei氏基因多样度(h)均显示海蓬子实生群体具有较为丰富的遗传多样性。SRAP标记相似系数变异范围为0.42～0.92。以相似系数平均值0.76为阈值,可将所有供试材料划分为11个亚类,表明海蓬子不同株系间存在明显的表型差异与遗传多样性。建议在实生群体内通过选择来培育海蓬子新品种。 展开更多
关键词 盐生植物 海蓬子 遗传多样性 srap标记
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利用SRAP分子标记分析47份杂草稻样品遗传多样性 被引量：11
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作者 刘丹 孙健 +4 位作者 马殿荣 王嘉宇 唐亮 苗微 陈温福 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期70-76,共7页
利用SRAP分子标记分析了采集于杂草稻多发地区的47份样本的遗传多样性,旨在从基因的开放式阅读框区域(ORFs)深入研究杂草稻的遗传背景,为进一步揭示其来源提供依据。结果表明,参试的我国杂草稻材料在110对引物组合中共扩增出845种类型... 利用SRAP分子标记分析了采集于杂草稻多发地区的47份样本的遗传多样性,旨在从基因的开放式阅读框区域(ORFs)深入研究杂草稻的遗传背景,为进一步揭示其来源提供依据。结果表明,参试的我国杂草稻材料在110对引物组合中共扩增出845种类型的谱带,多态性谱带590种,多态率为69.82%,平均每对引物可以检测到5.4条多态性谱带。说明SRAP分子标记对于杂草稻基因组开放式阅读框区域序列的多态性具有很高的检测效率,适用于遗传多样性研究。我国杂草稻材料Shannon-Weaver多样性指数(I)为0.63,且南北方杂草稻多样性指数(I)相当,分别为0.63和0.62。聚类分析结果表明,南方收集的杂草稻与北方收集杂草稻群体间遗传分化较大,遗传差异明显。程氏指数判定结果也表明杂草稻呈南籼北粳的分布状态。 展开更多
关键词 杂草稻 开放式阅读框 相关序列扩增多态性 遗传多样性
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