崂山奶山羊硬脂酰-CoA去饱和酶基因(SCD)多态性及其与泌乳性状的相关分析 被引量：7

1

作者 王桂芝 王金凤 +4 位作者 秦孜娟 王建民 赵金山 程明 王建华 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第7期1131-1139,共9页

利用直接测序法检测了174只崂山奶山羊泌乳母羊的硬脂酰-CoA去饱和酶基因(stearoyl-CoA desatu-rase,SCD)外显子3及侧翼序列多态性。采用最小二乘方法分析其在崂山奶山羊(Capra hircus)群体中的多态性及其与泌乳性状之间的关联效应。结... 利用直接测序法检测了174只崂山奶山羊泌乳母羊的硬脂酰-CoA去饱和酶基因(stearoyl-CoA desatu-rase,SCD)外显子3及侧翼序列多态性。采用最小二乘方法分析其在崂山奶山羊(Capra hircus)群体中的多态性及其与泌乳性状之间的关联效应。结果如下:在SCD基因外显子3及侧翼区检测到4个SNPs,即E315E/e、E368H/h,内含子3的I346R/r和I355Q/q,其等位基因和基因型频率在样本群中均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。其中E315E/e和I355Q/q的分布情况一致,呈紧密连锁关系。SCD基因E315和I355位点的EE/QQ基因型与基因型ee/qq的所有乳成分性状差异显著(P<0.05)或极显著(P<0.01),EE/QQ与Ee/Qq基因型的乳蛋白率、乳密度差异显著(P<0.05),等位基因E/Q为乳成分性状的有利等位基因;各乳成分性状的基因加性效应极显著(P<0.01),显性效应不显著(P>0.05)。E368位点hh基因型与HH和Hh基因型的所有乳成分性状差异显著(P<0.05)或极显著(P<0.01),等位基因h为乳成分性状的有利等位基因;所有乳成分的基因加性效应和显性效应极显著(P<0.01)。I346位点rr基因型的300d产奶量极显著(P<0.01)高于RR基因型,等位基因r为300d产奶量的有利等位基因,但其对乳成分性状的影响不显著(P>0.05)。在不同试验群体中分析SCD基因多态性与泌乳性状的关系,发现F群体中,各突变位点的不同基因型在泌乳性状上的差异显著性较低;而P群体中不同基因型间所有乳成分性状的差异显著较高。本研究表明:SCD基因外显子3及侧翼区检测到4个SNPs,即E315E/e、E368H/h、I355Q/q和I346R/r,其中I346R/r在国内其它奶山羊中尚未发现。等位基因E、h和Q分别为乳成分性状的有利基因,等位基因r为300d产奶量的有利基因,SCD基因在崂山奶山羊样本群中对泌乳性状的效应主要来源于对P育种群的影响。 展开更多

关键词 崂山奶山羊 scd 泌乳量 乳成分

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奶牛日粮添加豆油抑制乳腺硬脂酰辅酶A去饱和酶(SCD)基因mRNA表达水平 被引量：10

2

作者 卜登攀 王加启 +3 位作者 刘仕军 刘晓云 谷俊 张瑞超 《中国畜牧兽医》 CAS 2006年第7期3-5,共3页

硬脂酰辅酶A去饱和酶(SCD)是奶牛乳腺合成共轭亚油酸(CLA)的关键酶。奶牛日粮饲喂35 d豆油后,与不添加豆油的对照组相比,抑制了奶牛乳腺组织SCD基因mRNA的表达,研究结果表明,日粮亚油酸对乳腺SCD酶基因表达具有抑制作用。

关键词 豆油 硬脂酰辅酶A去饱和酶(scd) 基因表达 实时定量PCR(RT—PCR) 奶牛

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延边黄牛SCD1基因多态性及其与经济性状的关联分析 被引量：2

3

作者 朴政玉 夏广军 +1 位作者 严昌国 冯健 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2019年第9期2642-2650,共9页

本研究旨在探索延边黄牛硬脂酰辅酶A去饱和酶1(stearoy-CoA desaturase 1,SCD1)基因多态性及其与经济性状的相关性。以157头36月龄健康无病、体重相近的延边黄牛为研究对象,颈静脉采血提取基因组DNA,根据GenBank中牛SCD 1基因序列(登录... 本研究旨在探索延边黄牛硬脂酰辅酶A去饱和酶1(stearoy-CoA desaturase 1,SCD1)基因多态性及其与经济性状的相关性。以157头36月龄健康无病、体重相近的延边黄牛为研究对象,颈静脉采血提取基因组DNA,根据GenBank中牛SCD 1基因序列(登录号:AC_000181.1),利用Oligo 6.0软件设计特异性引物,应用PCR扩增SCD 1全长基因后直接测序,分析其多态位点,并应用生物信息学软件分析其蛋白结构;屠宰前测定活体重、胴体重、屠宰率、背膘厚等胴体性状,屠宰后采集背最长肌,测定眼肌面积、蒸煮损失、滴水损失、嫩度、系水力、pH、脂肪酸含量等肉质性状,并通过一般线性模型分析方法对延边黄牛SCD 1基因SNPs与肉质性状的相关性进行了分析。结果发现,延边黄牛SCD 1基因846 bp处存在A→G突变(g846 A→G)、1 022 bp处存在C→T突变(g1022 C→T),其中g1022 C→T突变导致丙氨酸(A)突变为缬氨酸(V),但未引起三级结构改变。关联分析结果表明,g846 A→G多态位点与延边黄牛宰前活重、胴体重、滴水损失及硬脂酸、亚油酸含量存在显著相关(P<0.05);g1022 C→T多态位点与延边黄牛宰前活重、胴体重及硬脂酸含量存在显著相关(P<0.05),说明上述2个位点与延边黄牛相关肉质性状存在显著相关,该突变位点可作为潜在的分子标记。 展开更多

关键词 延边黄牛 scd 1基因 单核苷酸多态性(SNP) 胴体性状 肉质性状

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曼氏无针乌贼SCD蛋白结构和功能预测 被引量：3

4

作者 夏灵敏 马晟杰 +1 位作者 吴常文 徐梅英 《浙江海洋学院学报（自然科学版）》 CAS 2014年第2期161-164,共4页

采用了BLASTp,ProtScale等蛋白质和核酸序列分析软件和数据库对曼氏无针乌贼SCD基因编码的蛋白进行了蛋白质结构域,螺旋卷曲结构等生物信息学分析。结果发现该基因编码的蛋白质为碱性跨膜蛋白质,该蛋白质可能为脂肪酸代谢起到关键调控作... 采用了BLASTp,ProtScale等蛋白质和核酸序列分析软件和数据库对曼氏无针乌贼SCD基因编码的蛋白进行了蛋白质结构域,螺旋卷曲结构等生物信息学分析。结果发现该基因编码的蛋白质为碱性跨膜蛋白质,该蛋白质可能为脂肪酸代谢起到关键调控作用,有进一步研究的价值。 展开更多

关键词 曼氏无针乌贼 scd基因 蛋白结构

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膨化全脂大豆对延边黄牛SCD基因表达及肌肉脂肪酸含量的影响 被引量：3

5

作者 王冰冰 耿爽 +3 位作者 耿春银 徐畅 庞喆 夏广军 《饲料工业》 北大核心 2017年第11期21-24,共4页

为了探讨饲喂膨化全脂大豆对延边黄牛肝脏、肌肉和脂肪组织中硬脂酰辅酶A去饱和酶(SCD)基因表达的影响及其与肌肉脂肪酸含量的相关性。选取健康、体重相近的延边黄牛阉牛8头,随机分为两个处理组,每组4头,对照组饲喂全混合日粮,试验组用... 为了探讨饲喂膨化全脂大豆对延边黄牛肝脏、肌肉和脂肪组织中硬脂酰辅酶A去饱和酶(SCD)基因表达的影响及其与肌肉脂肪酸含量的相关性。选取健康、体重相近的延边黄牛阉牛8头,随机分为两个处理组,每组4头,对照组饲喂全混合日粮,试验组用膨化全脂大豆替代全混合日粮中的豆粕,并保证日粮营养水平不变,试验期为90 d。试验结束后屠宰,采集肝脏、肌肉、脂肪组织,检测SCD基因的表达量,并与肌肉脂肪酸含量进行相关分析。结果表明:SCD基因在肌肉中的表达量试验组极显著高于对照组(P<0.01);在肝脏和脂肪中的表达量试验组低于对照组,但差异不显著(P>0.05);SCD基因表达量与肌肉中棕榈油酸(C161)含量呈显著正相关(P<0.05),相关系数为0.999;与油酸(C181)含量呈极显著正相关(P<0.01),相关系数为0.995;与亚油酸(C182)含量呈显著正相关(P<0.05),相关系数为0.975。膨化全脂大豆替代全混合日粮中的豆粕增加了SCD基因在肌肉中的表达量,能够改变牛肉脂肪酸组成,使牛肉富含有益人体的不饱和脂肪酸。 展开更多

关键词 延边黄牛 膨化全脂大豆 scd基因 脂肪酸组成

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曼氏无针乌贼(Sepiella maindroni)SCD基因全长cDNA的克隆和序列分析 被引量：1

6

作者 马明华 刘慧慧 +1 位作者 迟长凤 吴常文 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期691-696,共6页

硬脂酰辅酶A去饱和酶(SCD)是脂肪代谢的关键酶。本研究采用RT-PCR和RACE技术克隆了曼氏无针乌贼(Sepiella maindroni)SCDcDNA的全序列,序列全长1513bp,由261bp的5′非翻译区、编码306个氨基酸的921bp开放阅读框和331bp的3′非翻译区组... 硬脂酰辅酶A去饱和酶(SCD)是脂肪代谢的关键酶。本研究采用RT-PCR和RACE技术克隆了曼氏无针乌贼(Sepiella maindroni)SCDcDNA的全序列,序列全长1513bp,由261bp的5′非翻译区、编码306个氨基酸的921bp开放阅读框和331bp的3′非翻译区组成。在线翻译所得多肽理论分子量为34.92kDa,等电点为8.95,是疏水性蛋白,含有丰富的螺旋结构(45.10%),存在4个跨膜区。其氨基酸序列与真蛸(Octopus vulgaris)和长牡蛎(Crassostrea gigas)相似性达到91%,与其它非软体动物也表现为50%以上的相似性,说明SCD结构相对保守;系统进化树结果表明曼氏无针乌贼和真蛸及牡蛎进化关系最近,与鱼类稍远,与人及大鼠等哺乳动物亲缘关系最远。SCD基因是改善曼氏无针乌贼肉质的重要候选基因,其成功克隆及相关分析对于深入探讨软体动物脂肪酸代谢相关基因在生物体内作用机制及调控机理具有重要意义。 展开更多

关键词 曼氏无针乌贼 scd基因 CDNA 生物信息学

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牦牛SCD基因的克隆和生物信息学分析 被引量：1

7

作者 付东海 吴晓云 +7 位作者 王宏博 褚敏 郭宪 裴杰 包鹏甲 丁学智 阎萍 梁春年 《中国草食动物科学》 CAS 2018年第3期1-6,共6页

为研究牦牛硬脂酰辅酶A去饱和酶(SCD)基因的生物学功能,以正在培育的无角牦牛新品种为研究材料,设计引物对其SCD基因的CDS区进行基因克隆,并利用EMBOSS等程序进行生物信息学分析。结果表明:无角牦牛SCD基因CDS区长度为1 080 bp,蛋白编码... 为研究牦牛硬脂酰辅酶A去饱和酶(SCD)基因的生物学功能,以正在培育的无角牦牛新品种为研究材料,设计引物对其SCD基因的CDS区进行基因克隆,并利用EMBOSS等程序进行生物信息学分析。结果表明:无角牦牛SCD基因CDS区长度为1 080 bp,蛋白编码359个氨基酸残基;相比普通牛,无角牦牛新品种SCD基因的扩增片段共检测出7个碱基差异,分别为1次A颠换为C、2次C颠换为A、1次A转换G、2次C转换T、1次T颠换为A;对氨基酸序列比对发现,仅第1、第6、第7处的差异使得对应的氨基酸发生变化;牦牛SCD基因编码蛋白的分子式为C1922H2912N506O514S11,分子量约41.7 k D,理论等电点(p I)为9.23,消光系数83 895,不稳定系数44.41,疏水指数86.96,平均亲水性-0.235,属不稳定可溶性碱性蛋白质,在哺乳动物网织红细胞内的半衰期30 h;牦牛SCD基因编码蛋白的二级结构由α螺旋、β折叠、延伸链以及随机卷曲结构构成;该蛋白也具有低复杂结构以及跨膜结构。 展开更多

关键词 牦牛 不饱和脂肪酸合成酶 基因克隆 生物信息学分析

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广灵驴SCD基因克隆、生物信息学及组织差异表达分析 被引量：1

8

作者 关家伟 孙瑜彤 +2 位作者 邱丽霞 李武峰 杜敏 《山西农业大学学报（自然科学版）》 CAS 北大核心 2021年第2期65-73,共9页

[目的]本试验旨在对广灵驴SCD基因CDS区进行生物信息学分析,并检测其在广灵驴组织中的表达,为探究SCD基因在广灵驴脂肪沉积中的作用提供理论参考。[方法]设计SCD基因同源引物,RT-PCR法克隆CDS序列,对SCD基因编码产物进行生物信息学预测... [目的]本试验旨在对广灵驴SCD基因CDS区进行生物信息学分析,并检测其在广灵驴组织中的表达,为探究SCD基因在广灵驴脂肪沉积中的作用提供理论参考。[方法]设计SCD基因同源引物,RT-PCR法克隆CDS序列,对SCD基因编码产物进行生物信息学预测,同时使用qRT-PCR法检测广灵驴7个组织中SCD基因的表达量。[结果]广灵驴SCD基因CDS长1080 bp,可编码359个氨基酸,提交到GenBank,获得登录号:MW132164。广灵驴编码序列与马、牛、双峰驼、猪、绵羊、人、小鼠、大鼠的同源性分别为99.4%、89.2%、90.7%、90.1%、89.5%、88.2%、81.2%、82.4%。SCD蛋白分子质量为41.55 ku,等电点为9.29,不稳定指数为45.54,平均疏水指数为-0.146,属于不稳定的碱性亲水蛋白。SCD蛋白既没有信号肽也没有卷曲螺旋,有4个跨膜区,主要定位在内质网。二级、三级结构显示,SCD蛋白主要由α-螺旋(40.67%)和无规则卷曲(40.11%)构成。SCD基因在广灵驴7个组织内都表达,在肝脏、肺脏和皮下脂肪中的表达量最高,心脏和背最长肌最低。[结论]本研究结果可为今后探究SCD基因在广灵驴脂肪沉积中的功能,以及提高广灵驴乳肉品质奠定基础。 展开更多

关键词 scd基因 广灵驴 基因克隆 生物信息学分析 组织表达

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大额牛SCD基因多态性及肉质性状的表达

9

作者 宋宪博 苟潇 刘兴勇 《贵州农业科学》 CAS 北大核心 2014年第10期171-173,177,共4页

为研究大额牛SCD基因突变与其肉质性状的关系,利用DNA直接测序的方法对大额牛、黄牛的SCD基因进行SNP检测,再应用SPSS及BioEdit软件对SCD基因多态性及肉质性状表达的关系进行分析。结果显示:在大额牛SCD基因中有9个SNP位点,第二外显子2 ... 为研究大额牛SCD基因突变与其肉质性状的关系,利用DNA直接测序的方法对大额牛、黄牛的SCD基因进行SNP检测,再应用SPSS及BioEdit软件对SCD基因多态性及肉质性状表达的关系进行分析。结果显示:在大额牛SCD基因中有9个SNP位点,第二外显子2 884bp处发现A→C突变。该基因对其粗脂肪(大额牛背最长肌0.61%,半腱肌0.48%;黄牛背最长肌3.35%,半腱肌2.72%)与粗蛋白(大额牛背最长肌19.48%,半腱肌19.24%;黄牛背最长肌17.75%,半腱肌18.59%)2种肉质性状有显著影响。 展开更多

关键词 大额牛 scd 基因多态性 表达性状

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不同品种猪SCD基因在肝脏、背脂、背最长肌中表达差异研究 被引量：3

10

作者 李盼 赵雨农 +6 位作者 段梦琪 吴绿草 张健 郭新颖 边巴琼达 祁雨田 商鹏 《高原农业》 2019年第5期528-532,538,共6页

本试验旨在揭示脂肪型藏猪和滇南小耳猪与瘦肉型大约克猪SCD基因的表达差异,试验分别选取6月龄藏猪、滇南小耳猪和大约克猪各6头,采用荧光定量PCR(qRT-PCR)的方法检测了SCD基因在背脂、背最长肌和肝脏中相对表达量。结果表明:SCD基因在... 本试验旨在揭示脂肪型藏猪和滇南小耳猪与瘦肉型大约克猪SCD基因的表达差异,试验分别选取6月龄藏猪、滇南小耳猪和大约克猪各6头,采用荧光定量PCR(qRT-PCR)的方法检测了SCD基因在背脂、背最长肌和肝脏中相对表达量。结果表明:SCD基因在背脂、背最长肌和肝脏组织中均有表达,其中背脂中最高,肝脏次之,背最长肌最低。在背脂中,藏猪和滇南小耳猪表达量极显著高于大约克猪(P<0.01);在背最长肌和肝脏中,藏猪表达量极显著高于滇南小耳猪和大约克猪(P<0.01),表达水平基本趋于一致。结果表明,SCD基因在脂肪型和瘦肉型猪种表达量存在明显差异,本试验为进一步开展SCD基因对猪脂肪沉积和肉质性能的调控机制提供了重要依据。 展开更多

关键词 硬脂酰辅酶A去饱和酶(scd) 基因表达 脂肪沉积 猪

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德宏奶水牛SCD基因乳腺组织表达及生物.信息学分析

11

作者 徐维维 庞双龙 +4 位作者 徐正尧 王梦迪 唐娜 杨忠 李卫真 《中国奶牛》 2023年第3期20-24,共5页

本试验旨在研究德宏奶水牛SCD基因表达规律和探究水牛SCD生物学特性。用乳品分析仪测定乳脂率,依照乳脂率高低进行分组,分为高、中、低组(分别为H组、M组、L组)。采用qPCR法检测SCD基因表达量,与乳脂率进行关联分析。利用生物信息学方... 本试验旨在研究德宏奶水牛SCD基因表达规律和探究水牛SCD生物学特性。用乳品分析仪测定乳脂率,依照乳脂率高低进行分组,分为高、中、低组(分别为H组、M组、L组)。采用qPCR法检测SCD基因表达量,与乳脂率进行关联分析。利用生物信息学方法对水牛SCD的结构进行预测。结果表明,H组SCD表达量极显著高于M组和L组(P<0.01),M组极显著高于L组(P<0.01)。其mRNA表达水平与乳脂率呈强正相关。生物信息学分析结果显示,水牛SCD为不稳定亲水蛋白,不存在信号肽,主要在内质网(44.4%)发挥作用。二级结构主要由无规则卷曲(40.39%)、α-螺旋(39.55%)构成。SCD与ELOVL6、SREBP1、FASN等脂质代谢关键分子互作。研究表明,德宏奶水牛SCD基因的表达可能影响乳脂合成。 展开更多

关键词 德宏奶水牛 scd基因 基因表达 生物信息学

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长白猪和梅山猪脂肪中脂肪沉积相关基因的表达差异 被引量：9

12

作者 张凯 顾以韧 +4 位作者 刘艾晶 蒋岸岸 帅素容 李明洲 李学伟 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第2期129-134,共6页

为了揭示瘦肉型的长白猪和脂肪型的梅山猪脂肪沉积相关基因的表达差异,采用qRT-PCR方法检测了两猪种背部皮下脂肪组织中硬脂酰辅酶A去饱和酶（SCD）、苹果酸酶（ME1）和解耦联蛋白3（UCP3）基因的表达量在30、60、90、120和150 d的变化... 为了揭示瘦肉型的长白猪和脂肪型的梅山猪脂肪沉积相关基因的表达差异,采用qRT-PCR方法检测了两猪种背部皮下脂肪组织中硬脂酰辅酶A去饱和酶（SCD）、苹果酸酶（ME1）和解耦联蛋白3（UCP3）基因的表达量在30、60、90、120和150 d的变化。结果表明,两品种SCD的表达模式除90~120 d相反外,其他各日龄之间基本相同;ME1在30~120 d基本相同,而120~150 d呈现出相反的模式;UCP3除120~150 d相同外,其他各日龄之间呈现相反的模式。以上结果初步揭示了两猪种在生长发育过程中SCD、ME1和UCP3表达的发育性变化模式和品种差异,为深入研究脂肪合成代谢的调控机制提供了基础数据。 展开更多

关键词 猪 背部皮下脂肪 荧光实时定量PCR 硬脂酰辅酶A去饱和酶(scd)基因 苹果酸酶(ME1)基因 解耦联蛋白3(UCP3)基因

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硬脂酰辅酶A去饱和酶-1基因表达及其与鸭肉质和血清生化指标的相关性分析 被引量：2

13

作者 张依裕 李万贵 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2015年第2期432-437,共6页

试验分别在基础日粮中添加含4%亚油酸和4%二十碳五烯酸(EPA)对樱桃谷鸭进行饲养,检测4、6、8和10周龄樱桃谷鸭硬脂酰辅酶A去饱和酶-1(SCD-1)基因mRNA表达丰度,分析其表达与10周龄鸭肉质和血清生化指标的相关性。实时荧光定量PCR结果显示... 试验分别在基础日粮中添加含4%亚油酸和4%二十碳五烯酸(EPA)对樱桃谷鸭进行饲养,检测4、6、8和10周龄樱桃谷鸭硬脂酰辅酶A去饱和酶-1(SCD-1)基因mRNA表达丰度,分析其表达与10周龄鸭肉质和血清生化指标的相关性。实时荧光定量PCR结果显示,亚油酸和二十碳五烯酸均能显著降低各周龄SCD-1基因在鸭肝脏、脂肪和胸肌中的mRNA表达水平(P<0.05),说明亚油酸和二十碳五烯酸均具有抑制SCD-1基因转录的功能,亚油酸组鸭SCD-1基因mRNA表达水平与二十碳五烯酸组相比未达到显著差异(P>0.05);相关性分析结果显示,鸭SCD-1基因mRNA表达丰度与10周龄鸭血清中甘油三酯(TG)、总胆固醇(TCHO)、高密度脂蛋白(HDL)和低密度脂蛋白(LDL)呈显著正相关(P<0.05),与各常规肉质指标的相关性未达到显著水平(P>0.05),表明SCD-1基因在鸭的脂质代谢过程中发挥着重要的调控作用。 展开更多

关键词 鸭 scd-1 基因表达 肉质 血清生化指标

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