利用RIL群体分析小麦淀粉粘度性状与馒头品质的关系 被引量：10

1

作者 范玉顶 李斯深 +1 位作者 孙海艳 李瑞军 《中国粮油学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2005年第1期6-8,26,共4页

利用重组自交系群体对淀粉粘度性状与馒头品质间的关系进行了全面分析。相关分析表明,峰值粘 度、低谷粘度、最终粘度、反弹值、峰值时间均与馒头外观、结构、弹韧性、粘性、总分等5项指标呈显著正相关;回归分 析结果表明,粘度性状与馒... 利用重组自交系群体对淀粉粘度性状与馒头品质间的关系进行了全面分析。相关分析表明,峰值粘 度、低谷粘度、最终粘度、反弹值、峰值时间均与馒头外观、结构、弹韧性、粘性、总分等5项指标呈显著正相关;回归分 析结果表明,粘度性状与馒头品质间存在较强的线性关系,建立了馒头体积、比容、结构、弹韧性、粘性和总分与淀粉 粘度性状的回归方程;通过通径分析明确了各粘度性状对馒头品质的直接效应和间接效应。 展开更多

关键词 性状 馒头品质 ril群体 淀粉粘度 利用 重组自交系群体 通径分析 小麦淀粉 粘性 比容

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甘蓝型油菜(Brassica napus L.)RIL群体抗倒伏及其相关性状的QTL分析 被引量：8

2

作者 李扬 顾慧 戚存扣 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期10-17,共8页

油菜倒伏严重影响了油菜的产量和品质，为了定位甘蓝型油菜（Brassica napus L．）与抗倒伏性状相关的QTL，用抗倒伏品系浙平1号和易倒伏品系高芥1号组合重组自交系（RIL）家系为材料，通过两年两点试验，对该RIL群体的F2：6和F2：7，... 油菜倒伏严重影响了油菜的产量和品质，为了定位甘蓝型油菜（Brassica napus L．）与抗倒伏性状相关的QTL，用抗倒伏品系浙平1号和易倒伏品系高芥1号组合重组自交系（RIL）家系为材料，通过两年两点试验，对该RIL群体的F2：6和F2：7，家系抗压力性状进行了QTL分析，并应用一年两点数据对该群体F2：6。家系结角层性状进行了QTL分析。结果表明，在4个试验中共检测到11个家系抗压力QTL，可解释4．41％～52．64％的表型变异，LOD值范围是2．68～26．58。其中qRP16-1可以在3个不同的试验中（南京-2012、溧水-2012和南京-2013）重复检测到，面P1、qRP4和qRP8-1同时在2个不同的试验中（溧水-2012和溧水-2013）重复检测到。qRP2-1、qRP2-2、qRP8-2、qRP8—3、qRPl6—2、qRP3和qRP8—4等7个QrL只能在特定的试验中检测到。同一地点不同年份间家系抗压力性状QTL相对同一年份不同地点间易被重复检测到。在2个试验中共检测到2个结角层厚度QTL，位于第15连锁群的qTPLl5在2个试验中重复检测到。 展开更多

关键词 甘蓝型油菜 重组近交系 抗倒伏 抗压力 结角层 QTLS

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甘蓝型油菜RIL群体株高性状的全基因组关联分析 被引量：4

3

作者 黄静 程明星 +8 位作者 唐敏强 张凤启 张园园 童超波 刘越英 程晓晖 董彩华 黄军艳 刘胜毅 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第5期543-548,共6页

为提高甘蓝型油菜株高的分子标记辅助育种效率,挖掘与株高相关的功能基因以构建理想株型,利用单个重组自交系（RIL）群体在3个环境下的株高表型数据及7 877个SNP标记的基因型分型数据进行全基因组关联分析。在2个或2个以上环境下同时检... 为提高甘蓝型油菜株高的分子标记辅助育种效率,挖掘与株高相关的功能基因以构建理想株型,利用单个重组自交系（RIL）群体在3个环境下的株高表型数据及7 877个SNP标记的基因型分型数据进行全基因组关联分析。在2个或2个以上环境下同时检测到5个与株高显著相关的SNP（Bn-scaff_15794_3-p62430、Bn-A02-p9599263、Bn-A02-p9409799、Bn-A02-p9993945和Bn-A02-p9636219）,均位于A02染色体上。比较利用连锁分析方法的QTL定位结果,发现标记Bn-A02-p9599263和Bn-scaff_15794_3-p62430分别位于QTL（q PH2-2和q PH2-4）峰值处,标记Bn-A02-p9636219和Bn-A02-p9993945分别落在QTL（q PH2-3和q PH2-4）2-LOD的置信区间内,标记Bn-A02-p9409799距离QTL（q PH2-2）的置信区间0.3c M。利用关联分析定位的区间（69.5~80.7c M）比利用连锁方法定位的QTL区间（60.7~95.9c M）缩小了24c M。依据参考基因组信息,在标记Bn-scaff_15794_3-p62430附近2kb处找到1个与株高性状相关的候选基因（GSBRNA2T00090973001）。结果表明,单个RIL群体进行全基因组关联分析可以对连锁QTL分析结果进行补充,缩小QTL置信区间。 展开更多

关键词 甘蓝型油菜 近等基因系 株高 全基因组关联分析 SNP

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利用RIL群体分析HMW-GS对面条品质性状的量化效应 被引量：4

4

作者 赵京岚 李斯深 +2 位作者 范玉顶 孙海燕 李瑞军 《中国粮油学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2005年第3期9-12,21,共5页

利用重组自交系群体———RIL-8群体的80个系及其亲本为材料,分析了不同高分子量麦谷蛋白亚基对面条品质性状影响的量化效应以及不同亚基组合的面条品质差异。结果表明RIL-8群体Glu-A1、Glu-B1、Glu-D1位点编码的亚基分别为1、N,7+9、7+... 利用重组自交系群体———RIL-8群体的80个系及其亲本为材料,分析了不同高分子量麦谷蛋白亚基对面条品质性状影响的量化效应以及不同亚基组合的面条品质差异。结果表明RIL-8群体Glu-A1、Glu-B1、Glu-D1位点编码的亚基分别为1、N,7+9、7+8和5+10、2+12,主要存在6种亚基组合类型。同一位点不同亚基和不同的亚基组合对面条的适口性、韧性、粘性和总分有显著的影响。对于不同亚基,5+10、1亚基是适合制作优质面条的亚基,尤以5+10亚基为好;N、7+8、7+9和2+12亚基不是制作优质面条的适宜亚基。对于不同亚基组合,(1,7+9,5+10)、(N,7+8,5+10)和(1,7+8,5+10)是制作优质面条的适宜亚基组合,而(1,7+8,2+12)、(N,7+8,2+12)和(1,7+9,2+12)不适合制作优质面条。 展开更多

关键词 量化效应 品质性状 HMW-GS 群体分析 高分子量麦谷蛋白亚基 重组自交系群体 亚基组合 优质面条 5+10亚基 Glu 品质差异 组合类型 制作 适口性 位点 亲本

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胡麻RIL群体苗期抗旱性状的主基因+多基因遗传分析 被引量：6

5

作者 王斌 王利民 +3 位作者 张建平 谢亚萍 牛早霞 赵利 《干旱地区农业研究》 CSCD 北大核心 2018年第5期14-20,共7页

以抗旱品种定亚17号与抗旱敏感品种天亚3号构建的重组自交系群体为材料,采用数量性状的主基因+多基因遗传模型分析方法对胡麻苗期株高、根鲜重、茎鲜重、根干重、茎干重、根长、叶干重、叶鲜重等8个性状的抗旱系数进行遗传模型分析。结... 以抗旱品种定亚17号与抗旱敏感品种天亚3号构建的重组自交系群体为材料,采用数量性状的主基因+多基因遗传模型分析方法对胡麻苗期株高、根鲜重、茎鲜重、根干重、茎干重、根长、叶干重、叶鲜重等8个性状的抗旱系数进行遗传模型分析。结果表明,株高、根鲜重、茎鲜重、根干重、茎干重的最适遗传模型为2MG-Inhibiting,受2对抑制性主基因+加性多基因控制。根长、叶干重的最适遗传模型为3MG-CEA,受3对独立主基因+加性多基因控制。叶鲜重的最适遗传模型为4MG-CEA,受4对独立主基因控制。8个性状主基因遗传率在9.59%～50.96%之间。 展开更多

关键词 胡麻 重组自交系群体 苗期抗旱性 主基因+多基因遗传模型 遗传分析

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自然储存条件下水稻种子耐储藏性状QTL的定位

6

作者 陈文凤 黄浩 +9 位作者 丁晓雯 林晋军 姚威 陈倩茹 黄希来 刘雄伦 吴俊 陈哲红 程计华 刘金灵 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 北大核心 2025年第2期1-5,35,共6页

为了筛选出新的水稻耐储藏种质,以在自然条件下储存4年的由粳稻‘魔王谷’(MWG)和籼稻‘CO39’杂交后代衍生的重组自交系群体种子为材料,对群体种子发芽表型进行分析,并利用复合区间作图法对该群体种子耐储藏性状QTL进行定位。结果表明:... 为了筛选出新的水稻耐储藏种质,以在自然条件下储存4年的由粳稻‘魔王谷’(MWG)和籼稻‘CO39’杂交后代衍生的重组自交系群体种子为材料,对群体种子发芽表型进行分析,并利用复合区间作图法对该群体种子耐储藏性状QTL进行定位。结果表明:101份重组自交系中,67%的株系种子的发芽率、发芽势和发芽指数为0,其余株系3个发芽性状指标分别为0~82.67%、0~46.00%和0~6.48;鉴定到1个发芽率达82.67%的高耐储株系;QTL分析定位到3个控制发芽性状(发芽率、发芽势、发芽指数)的QTL,分别为qGR7、q GP7和qGI7,其中qGR7位于SSR标记RM6344与RM5720区间18.43c M的区域,qGP7和qGI7均位于标记RM5672与RM8261区间35.74 cM的区域,3个QTL的LOD值为2.52~2.56,表型贡献率为12.02%~12.22%。 展开更多

关键词 水稻 耐储藏性 重组自交系群体 数量性状基因位点 基因定位

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利用RILs群体分析小麦粉品质性状与面条品质的关系 被引量：2

7

作者 孙彩玲 田纪春 《中国粮油学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2008年第4期33-37,共5页

利用132个小麦重组自交系群体(R ILs),测定了不同群体小麦面粉蛋白品质性状、面条感官品质和面条质构特性,研究了品质性状与面条品质的相关关系,在此基础上,用逐步回归法筛选了影响面条感官品质和质构特性的关键因素,对影响面条品质的... 利用132个小麦重组自交系群体(R ILs),测定了不同群体小麦面粉蛋白品质性状、面条感官品质和面条质构特性,研究了品质性状与面条品质的相关关系,在此基础上,用逐步回归法筛选了影响面条感官品质和质构特性的关键因素,对影响面条品质的所有性状做了通径分析。结果表明,面筋指数、吸水率和干湿面筋含量是影响面条感官总评分的关键性状,而且面筋指数对总评分的直接效应正向最大;面筋指数、面团形成时间和干湿面筋含量是影响面条硬度的关键性状,面筋指数的直接作用和间接作用均为正向较大,与硬度呈极显著正相关关系;吸水率和蛋白质含量是影响煮熟面条最大拉力的关键性状,蛋白质的作用大于吸水率。面筋指数极大地影响着面条品质。 展开更多

关键词 小麦 品质 面条 重组自交系

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小麦RIL群体苗期抗旱性综合评价 被引量：12

8

作者 齐照良 朱昊 李斯深 《山东农业科学》 2010年第9期5-9,共5页

以小麦RIL群体为材料,在水培条件下以PEG-6000模拟干旱胁迫,分析小麦幼苗抗旱相关性状的群体变异,利用主成分分析对抗旱指标进行综合筛选,利用隶属函数值法对供试材料抗旱性进行综合评价,以期为小麦苗期抗旱性状QTL定位及抗旱育种研究... 以小麦RIL群体为材料,在水培条件下以PEG-6000模拟干旱胁迫,分析小麦幼苗抗旱相关性状的群体变异,利用主成分分析对抗旱指标进行综合筛选,利用隶属函数值法对供试材料抗旱性进行综合评价,以期为小麦苗期抗旱性状QTL定位及抗旱育种研究提供依据。15个抗旱相关指标主成分分析表明:前6项主成分累计贡献率达82.799%,所代表的6类指标可作为小麦苗期抗旱性鉴定指标,其相对重要性为生物量>根冠比>地下部失水率>最大根长>相对生长率>地上部失水率。抗旱综合评价结果表明:父本山农483较母本川35050抗旱性强,群体综合抗旱性有较大的分离变异,111个系抗旱性高于双亲,14个系抗旱性介于双亲之间,5个系抗旱性较双亲低。该群体适于小麦苗期抗旱相关性状QTL定位研究。 展开更多

关键词 小麦 重组自交系 抗旱性 苗期 综合评价

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水稻RIL群体单穗重基因加性及其环境互作效应分析 被引量：1

9

作者 贾小丽 苗利国 林红梅 《广东农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第22期1-4,9,共5页

为了探知单穗重增加的动态遗传机制，利用由穗型差异大的水稻品种密阳46和FJCD建立的一个包含130个株系的F。重组自交系，测定其在福建武夷山和莆田环境下灌浆期单穗重的动态变化，并进行QTL定位及其环境互作研究。结果检测到27个加性QT... 为了探知单穗重增加的动态遗传机制，利用由穗型差异大的水稻品种密阳46和FJCD建立的一个包含130个株系的F。重组自交系，测定其在福建武夷山和莆田环境下灌浆期单穗重的动态变化，并进行QTL定位及其环境互作研究。结果检测到27个加性QTL，16个存在显著的加性×环境互作效应位点。QTL定位分析检测到27个加性QTL，位于1、2、3、4、5、6、7、8、10号染色体上，对表型变异贡献率为1．09％～31．63％，16个QTL对表型变异贡献率大于10％，尤其是qPW一2～5单个QTL贡献率达31．63％。环境互作分析，共检测到灌浆期5个阶段的16个GE互作位点，分布在水稻2、3、4、5、6、7、8、10号染色体上，大部分为小于5％的微效QTL。此研究揭示了单穗重的动态遗传机制，为水稻穗型育种提供了依据。 展开更多

关键词 QTL定位 水稻 重组自交系 单穗重 环境互作

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不同浓度硫处理小麦RIL群体苗期性状的表型变异及相关分析

10

作者 李家丽 蒲艳艳 +1 位作者 于鸿翔 赵岩 《山东农业科学》 2016年第9期27-31,共5页

本试验以"川35050×山农483"组合衍生的小麦重组自交系(recombinant inbred lines,RIL)群体及其亲本为材料,采用水培法,对低、中、高浓度硫处理下小麦RIL群体的苗高、最大根长、分蘖数、根条数、根干重、苗干重、总干重... 本试验以"川35050×山农483"组合衍生的小麦重组自交系(recombinant inbred lines,RIL)群体及其亲本为材料,采用水培法,对低、中、高浓度硫处理下小麦RIL群体的苗高、最大根长、分蘖数、根条数、根干重、苗干重、总干重、根冠比、根S积累量、苗S积累量、总S积累量、根S利用效率、苗S利用效率和总S利用效率共14个性状进行了测量,并进行了变异分析和相关分析。结果表明,在不同浓度硫处理下,苗期性状的变异都较大。随S浓度增加,根干重、根冠比、根S利用效率、苗S利用效率和总S利用效率5个性状均呈降低趋势,而其余9个性状均呈升高趋势,表明适当提高硫浓度可促进小麦生长,但硫利用效率降低。变异分析表明,在同一环境下双亲各性状的表型值大都表现出较大差异;在RIL群体中,家系间变异系数在不同硫处理下的平均值以S积累量(根S积累量、苗S积累量、总S积累量)的最大,以根条数、根冠比和苗高性状的最小。相关分析表明,干重和S积累量、S利用效率呈极显著正相关,说明可以用干重性状来表征S积累量及S利用效率。 展开更多

关键词 小麦 重组自交系(ril) 硫 苗期 变异分析 相关分析

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栽培种花生RIL群体荚果及籽仁性状遗传变异分析 被引量：6

11

作者 刘佳琪 李英杰 +5 位作者 杨会 刘风珍 万勇善 张昆 吕玉英 张秀荣 《山东农业科学》 2017年第11期13-19,共7页

以花生栽培品种山花15号与中花12号杂交,经多代自交获得的包含441个家系的F_(5-7)重组自交系群体为材料,分别在2014—2016年3个环境条件下(E1、E2和E3)种植,对荚果及籽仁的6个产量相关性状进行遗传变异分析。结果表明,花生果宽、单果重... 以花生栽培品种山花15号与中花12号杂交,经多代自交获得的包含441个家系的F_(5-7)重组自交系群体为材料,分别在2014—2016年3个环境条件下(E1、E2和E3)种植,对荚果及籽仁的6个产量相关性状进行遗传变异分析。结果表明,花生果宽、单果重、单仁重和果壳厚度主要受3对主基因控制,表现为完全等加性效应或加性上位性效应,主基因遗传率分别为88.11%、87.58%、78.12%和87.31%;果长主要受2对或3对主基因控制,基因间存在加性上位性或隐性上位性效应,主基因遗传率为90.29%。以上5个性状除单仁重外,在不同环境中遗传率均表现稳定,适合在早期世代进行选择。单株生产力在3个环境中受主基因和多基因共同控制,主基因遗传率平均为22.49%,多基因遗传率平均为71.24%。 展开更多

关键词 花生 ril群体 荚果和籽仁性状 遗传分析

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小麦RIL群体苗期抗旱性综合评价 被引量：1

12

作者 程凯 解树斌 +1 位作者 蒲艳艳 李斯深 《山东农业科学》 2012年第11期17-21,共5页

以小麦"山农0431×鲁麦21"RIL群体的177个系及其父母本为材料,在水培条件下,用PEG-6000模拟干旱胁迫分析小麦苗期抗旱相关性状的群体变异;利用主成分分析对所测定抗旱指标进行综合筛选,并对材料的抗旱性进行综合评价。通... 以小麦"山农0431×鲁麦21"RIL群体的177个系及其父母本为材料,在水培条件下,用PEG-6000模拟干旱胁迫分析小麦苗期抗旱相关性状的群体变异;利用主成分分析对所测定抗旱指标进行综合筛选,并对材料的抗旱性进行综合评价。通过对14个抗旱相关指标的主成分分析表明:前5项主成分累计贡献率为82.15%,所代表的5类指标,可作为小麦苗期抗旱性鉴定指标,其重要性为生物量>根冠比>相对生长率、苗高>失水率>根数、最大根长。抗旱综合评价结果表明:父本鲁麦21的D值为0.57,较母本山农0431抗旱性强,群体综合抗旱性有较大的分离变异,群体中有90个系的抗旱性低于母本山农0431,有11个系抗旱性高于父本鲁麦21,有57个系抗旱性在两亲本之间。 展开更多

关键词 小麦 重组自交系 抗旱性 苗期 综合评价

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济麦44/济麦229重组自交系群体籽粒蛋白质含量QTL分析 被引量：1

13

作者 单宝雪 刘秀坤 +9 位作者 肖延军 展晓孟 黄金鑫 刘百川 张玉梅 李豪圣 刘建军 高欣 曹新有 赵振东 《山东农业科学》 北大核心 2024年第1期1-9,共9页

小麦籽粒蛋白质含量与面团流变学特性及加工特性的关系密不可分。本研究在2020—2021年济南试验基地(E1)及2021—2022年济南试验基地(E2)和济阳试验基地(E3)三个环境下,以“济麦44×济麦229”构建的包含285个家系的重组自交系群体(F... 小麦籽粒蛋白质含量与面团流变学特性及加工特性的关系密不可分。本研究在2020—2021年济南试验基地(E1)及2021—2022年济南试验基地(E2)和济阳试验基地(E3)三个环境下,以“济麦44×济麦229”构建的包含285个家系的重组自交系群体(F2∶6RILs)为材料,利用小麦55K SNP芯片构建高密度遗传连锁图谱,对籽粒蛋白质含量进行QTL分析。结果共筛选到2344个SNP标记用于构建遗传连锁图谱,图谱总长度3349.95 cM,平均标记密度为1.43 cM/标记。通过对籽粒蛋白质含量的QTL分析,共检测到18个籽粒蛋白质含量相关QTL,分布在1A、1B、2B、3D、4B、4D、5A、5B、5D、7A、7B共11条染色体上。Qpc.saas.4B-1在E1、E2和E3三个环境和BLUE(最佳线性无偏估计)值中均被稳定检测到,可以解释3.26%~23.79%的表型变异。Qpc.saas.4D和Qpc.saas.5A在两个环境和BLUE值中被检测到,分别解释2.42%~11.18%和2.48%~5.47%的表型变异,且Qpc.saas.4D与小麦矮秆基因Rht-D1b物理位置重合。本研究中检测到的QTL新位点Qpc.saas.4B-1、Qpc.saas.4D和Qpc.saas.5A是控制籽粒蛋白质含量的主效基因,具有高表型变异解释率。本研究结果可为小麦品质育种提供分子标记及理论参考。 展开更多

关键词 小麦 籽粒蛋白质含量 QTL分析 重组自交系 55K SNP芯片

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基于主成分分析的苦荞麦重组自交系农艺性状综合评价 被引量：2

14

作者 薛贤滨 贾琼 +3 位作者 陈峥峰 黎瑞源 陈庆富 石桃雄 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2024年第4期748-759,共12页

为筛选出综合性状优良的种质,为苦荞麦高产品种的选育推荐材料,对选取的58个具有高产潜质的重组自交系(RILs)及其双亲的10个主要农艺性状进行遗传变异分析、相关性分析、主成分分析和聚类分析。结果表明,58个RILs各性状的变异系数介于5.... 为筛选出综合性状优良的种质,为苦荞麦高产品种的选育推荐材料,对选取的58个具有高产潜质的重组自交系(RILs)及其双亲的10个主要农艺性状进行遗传变异分析、相关性分析、主成分分析和聚类分析。结果表明,58个RILs各性状的变异系数介于5.71%~31.55%,其中,产量、生育期和主茎分枝数的变异系数较大,粒宽和籽粒周长的变异系数较小。产量与籽粒面积、籽粒周长、株高和千粒重呈极显著(P<0.01)正相关,与粒长和粒宽呈显著(P<0.05)正相关,与生育期呈极显著负相关,产量与上述指标的相关系数绝对值从大到小依次为千粒重>株高>籽粒面积>生育期>籽粒周长>粒宽>粒长。主成分分析结果表明,前4个主成分的累计贡献率达86.987%,分别是粒形与产量因子(39.940%)、粒宽因子(24.478%)、株高因子(11.667%)、主茎分枝数与生育期因子(10.893%)。基于综合评价结果及RILs与亲本间的方差分析,共筛选出R64、R103、R164、R84、R192、R153和R214等7个综合性状优良的非米荞型RILs。这7个株系在聚类分析中均被划分在了高产、大粒、高秆和生育期短的C2类群,可将其作为示范推广品种或西南地区常规苦荞育种的优良种质资源加以利用。米荞型株系R52、R198和R101的产量极显著或显著高于米荞型亲本小米荞,可用于苦荞麦高产薄壳品种的选育。 展开更多

关键词 苦荞麦 重组自交系 农艺性状 遗传变异 主成分分析 聚类分析

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基于不同遗传群体的大豆分枝数QTL定位分析

15

作者 朱晨博 张东梅 +7 位作者 孙明明 刘淼 袁明 贾晓轲 赵艳强 张艳婷 杨明亮 陈庆山 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期1017-1028,共12页

分枝数是大豆重要的农艺性状,与大豆株型结构、产量潜力和适应性密切相关。为挖掘大豆分枝数稳定遗传位点,本研究以多分枝大豆Charleston和主茎型大豆东农594为亲本构建的148份重组自交系群体(RILs)和以主茎型大豆绥农14和多分枝野生大... 分枝数是大豆重要的农艺性状,与大豆株型结构、产量潜力和适应性密切相关。为挖掘大豆分枝数稳定遗传位点,本研究以多分枝大豆Charleston和主茎型大豆东农594为亲本构建的148份重组自交系群体(RILs)和以主茎型大豆绥农14和多分枝野生大豆ZYD00006为亲本构建的213份染色体片段代换系(CSSLs)2个遗传群体为试验材料,采用ICIMapping软件中的完备区间作图法(inclusive composite interval mapping,ICIM)和Win-QTL-Cart 2.5软件中的复合区间作图法(composite interval mapping,CIM),对2018-2021年两个遗传群体的分枝数表型数据进行QTL分析,对QTL置信区间内的候选基因进行挖掘。共检测到17个与大豆分枝数性状相关的QTL位点,其中qBNA2_1和qBNK_1在不同年份和不同群体中稳定出现,分布在第8和9号染色体。根据基因注释等信息对两个QTL区间内的候选基因进行筛选,并通过qRT-PCR预测Glyma.08G053700、Glyma.08G068200、Glyma.08G082400和Glyma.09G167100为调控分枝数的候选基因。本研究结果有助于探明大豆分枝数形成的遗传机制,为大豆理想株型研究提供候选基因与材料支撑。 展开更多

关键词 大豆 重组自交系(ril) 染色体片段代换系(CSSL) 分枝数 QTL 候选基因

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多环境下的稻谷粒厚QTL定位分析 被引量：1

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作者 徐海峰 彭强 +5 位作者 陈重远 吴娴 吴朝昕 张大双 姜雪 朱速松 《广东农业科学》 CAS 2024年第9期103-110,共8页

【目的】粒厚性状是影响水稻产量和稻米食味品质的控制因子之一,运用籼爪交(V20B/CPSLO17)遗传背景的重组自交系(RIL)开展稻谷粒厚QTL定位分析,获得粒厚性状主效QTL,为新的粒厚基因挖掘和开发功能分子标记提供科学依据。【方法】在水稻... 【目的】粒厚性状是影响水稻产量和稻米食味品质的控制因子之一,运用籼爪交(V20B/CPSLO17)遗传背景的重组自交系(RIL)开展稻谷粒厚QTL定位分析,获得粒厚性状主效QTL,为新的粒厚基因挖掘和开发功能分子标记提供科学依据。【方法】在水稻高密度遗传连锁图谱和籼爪交遗传背景的RIL群体基础上,结合3种不同生态环境(2020年贵州贵阳、2021年贵州贵定、2021年海南三亚)下RIL群体的稻谷粒厚性表型数据,运用IciMapping 4.0软件的ICIM-ADD方法进行粒厚QTL定位及其遗传效应分析。【结果】稻谷粒厚性状在3种生态环境下均呈现连续单峰分布,其受种植环境因子影响不显著。3种不同生态环境的水稻中共检测到分布在第3、5、8和10号染色体上的5个稻谷粒厚QTL(qGT3-1、qGT5-1、qGT5-2、qGT8-1和qGT10-1),它们的增效等位基因均来自亲本V20B,LOD值在3.431~14.081,表型贡献率变幅为5.479%~26.483%。2个QTL(qGT5-1和qGT5-2)的表型贡献率超过10%,其中qGT5-2是唯一在2种生态环境(2020年贵州贵阳、2021年海南三亚)下被反复检测到的,分别解释群体表型变异率的26.483%和14.933%。QTL qGT5-2位点在染色体上的物理距离约为3.9 kb,仅有1个候选基因(LOC_Os05g07920);qGT8-1位点的物理距离约为2.3 kb,仅有1个候选基因(LOC_Os08g10360)。【结论】稻谷粒厚性状呈现出受多基因调控的数量性状遗传特性。qGT5-2是1个稳定遗传且贡献率高的稻谷粒厚主效QTL,对粒厚调控基因挖掘和优质丰产稻新品种培育具有重要的应用潜力。 展开更多

关键词 稻谷粒厚 重组自交系 连锁图谱 多环境 QTL 遗传效应

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利用高密度遗传图谱挖掘水稻芽期耐盐QTL

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作者 雷蕾 孙世臣 +5 位作者 曹良子 丁国华 周劲松 白良明 洛育 夏天舒 《广东农业科学》 CAS 2024年第9期18-29,共12页

【目的】挖掘水稻芽期耐盐新位点,为进一步开展基因功能分析和盐渍土直播生产提供理论依据。【方法】以耐盐品种‘龙稻133’和盐敏品种‘彩稻’衍生的169个RIL群体为试验材料,利用包含1107个高质量多态性Bin标记的高密度遗传连锁图谱,... 【目的】挖掘水稻芽期耐盐新位点,为进一步开展基因功能分析和盐渍土直播生产提供理论依据。【方法】以耐盐品种‘龙稻133’和盐敏品种‘彩稻’衍生的169个RIL群体为试验材料,利用包含1107个高质量多态性Bin标记的高密度遗传连锁图谱,对对照和0.5%NaCl胁迫下的胚芽鞘长、胚根数、胚根长以及相对胚芽鞘长、相对胚根数和相对胚根长共9个性状进行QTL定位分析。【结果】高密度遗传连锁图谱共覆盖水稻基因组2957.35 cM,标记间的平均距离为2.67 cM。12条染色体含有的平均标记数为92.25个。描述性统计分析表明,亲本‘龙稻133’的耐盐性显著高于‘彩稻’,亲本的性状表型值位于RIL群体的极值之间,群体表现出超亲分离现象。盐胁迫严重抑制RIL群体的胚芽鞘长、胚根数和胚根长,且不同株系受胁迫影响差异较大,各性状基本符合正态分布,具有数量性状的遗传特性。连锁分析共鉴定到19个QTL,贡献率为2.58%~14.83%,发现2个QTL区间内存在已克隆的耐盐相关基因,其中qTCL3区间内包含DST,qRRN10区间内包含OsMSRA4.1。此外,发现控制盐胁迫下胚芽鞘长的qTCL10、控制相对胚芽鞘长的qRCL10以及控制相对胚根长的qRRL10均位于同一QTL区间内;控制盐胁迫下胚根长的qTRL7和控制相对胚根长的qRRL7也位于同一QTL区间内。2个共定位区间内的25个候选基因qRT-PCR分析结果显示,盐处理后,LOC_Os07g44210、LOC_Os07g44240、LOC_Os07g44250、LOC_Os07g44350、LOC_Os10g42940和LOC_Os10g43060在‘彩稻’或‘龙稻133’均显著上调表达。其中,LOC_Os07g44350在盐处理后的‘龙稻133’胚芽鞘和胚根内均极显著上调表达。【结论】发掘19个与水稻芽期耐盐相关QTL,其中包含2个共定位位点qTRL7和qTCL10,2个共定位区间内共有25个候选基因。通过qRT-PCR分析发现6个在盐处理后表达量上调的基因,其中LOC_Os07g44350是芽期耐盐的重要候选基因。 展开更多

关键词 高密度Bin图谱 QTL 重组自交系 耐盐 水稻 芽期

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高州野生稻重组自交系的构建及穗粒数性状QTL鉴定

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作者 霍兴 于咏梅 +4 位作者 邱树青 刘迪林 孔乐 柳武革 王丰 《广东农业科学》 2024年第11期69-77,共9页

【目的】野生稻(Oryza rufipogon)具有丰富的基因资源,通过构建野生稻重组自交系并进行数量性状基因座(QTL)分析,鉴定控制水稻穗粒数的QTL,进而为水稻遗传改良提供分子基础和遗传资源。【方法】通过高州野生稻和‘中花11’的杂交和多代自... 【目的】野生稻(Oryza rufipogon)具有丰富的基因资源,通过构建野生稻重组自交系并进行数量性状基因座(QTL)分析,鉴定控制水稻穗粒数的QTL,进而为水稻遗传改良提供分子基础和遗传资源。【方法】通过高州野生稻和‘中花11’的杂交和多代自交,构建了具有野生稻血缘的重组自交系群体。利用高密度基因芯片对群体进行基因型鉴定,并基于分子标记分析构建了高密度遗传图谱。进一步对群体穗粒数表型进行2年考察,结合表型数据和SNP标记信息,利用QTL IciMapping软件进行了QTL分析。【结果】成功构建了包含316个重组自交系的群体,表型观察显示群体具有丰富的遗传多样性,并在改良穗粒数上具有良好的应用潜力。检测到10个调控水稻穗粒数的QTL,其中2022年检测到4个QTL,2023年检测到6个QTL,第11号染色体上的1个QTL表型贡献率最高、为13.78%。位于2号染色体上的QTL在两年中均可被稳定检测到。2年检测到的10个QTL中,有9个加性效应为正值。【结论】成功构建了高州野生稻重组自交系,揭示出高州野生稻在改良水稻穗粒数中的应用潜力,通过QTL分析揭示了控制水稻穗粒数的遗传基础。 展开更多

关键词 野生稻 重组自交系 穗粒数 高密度基因芯片 QTL分析 遗传图谱

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大豆遗传图谱的构建和含油量的QTL分析 被引量：9

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作者 王贤智 周蓉 +6 位作者 张晓娟 单志慧 沙爱华 陈海峰 邱德珍 李培武 周新安 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期272-278,共7页

以大豆重组自交系soy01群体中的255个家系为作图群体，利用225个分子标记和2个形态标记构建了一张包含27个连锁群的大豆遗传连锁图谱，总遗传距离1315．46cM，平均标记间距5．79eM。在构建遗传图谱的基础上，采用复合区间作图法，检测... 以大豆重组自交系soy01群体中的255个家系为作图群体，利用225个分子标记和2个形态标记构建了一张包含27个连锁群的大豆遗传连锁图谱，总遗传距离1315．46cM，平均标记间距5．79eM。在构建遗传图谱的基础上，采用复合区间作图法，检测到10个与含油量相关的QTL。这些QTL分别位于大豆遗传图谱的A2、C2、D1b、M和N连锁群，解释的遗传变异范围为4．0％～12．2％。这些QTL中，4个与Soybase数据库中的QTL有可能是相同的位点，2个可能是新的位点，其余4个是否是新的位点还有待进一步验证。亲本中豆29和中豆32中均有增效基因分布，通过遗传重组可以提高大豆含油量。 展开更多

关键词 大豆 遗传图谱 含油量 重组自交系 QTL定位

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小麦苗期钾、钠吸收相关性状及其QTL分析 被引量：4

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作者 吴春红 梁雪 +3 位作者 李斯深 李絮花 宫晓平 孔凡美 《植物营养与肥料学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第5期1025-1036,共12页

为进一步了解小麦苗期钾、钠吸收的相关性和遗传特征,本试验在温室环境下,以RIL(Recombinant Inbred Lines,RIL)群体为试验材料,采用营养液培养法对不同K+、Na+浓度处理条件下小麦苗期生长及钾、钠的积累、分配及利用等相关的20个性状... 为进一步了解小麦苗期钾、钠吸收的相关性和遗传特征,本试验在温室环境下,以RIL(Recombinant Inbred Lines,RIL)群体为试验材料,采用营养液培养法对不同K+、Na+浓度处理条件下小麦苗期生长及钾、钠的积累、分配及利用等相关的20个性状进行了鉴定,探讨了K+和Na+的关系及其对小麦苗期生长的影响;并对所有相关性状进行了QTL(Quantitative trait loci,QTL)分析。结果表明,缺钾条件下,供应钠能够显著提高小麦体内的Na/K比,但对小麦的生物量没有显著影响,表明钠替代钾的能力较差。而正常钾条件下,供钠可显著促进钾、钠的吸收,提高了Na/K比,但地上部的生物量反而显著下降,表明大量的钾和钠的累积对小麦地上部生物量的形成不利。小麦苗期对钾、钠离子的吸收与累积呈显著正相关。本试验在小麦全部的21条染色体上共检测到与生物量及钾、钠相关性状有关的QTLs 141个。其中的103个QTLs组成了14个重要的QTL簇,有11个QTL簇同时定位了钾、钠相关性状位点。另外,试验还发现了8个在多个养分环境条件下均可检测到的QTL位点—高频表达的QTL位点(RHF-QTLs),其中4个是新发现的位点。这些重要的QTL位点为K+、Na+关系及其遗传控制的深入研究提供了重要参考。 展开更多

关键词 小麦 重组自交系 钾 钠 QTL分析

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