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循环代谢生物标志物与前列腺癌因果关系的双向孟德尔随机化研究
1
作者 徐新宇 彭煜 +7 位作者 朱文静 刘治 刘彦飞 张杰 王韬毓 钟琪 徐静 梁文浩 《山西医科大学学报》 2025年第2期113-120,共8页
目的 采用两样本孟德尔随机化方法研究233种循环代谢生物标志物与前列腺癌的因果关系。方法 利用全基因组关联研究数据(genome-wide association studies,GWAS),暴露因素为233种循环代谢生物标志物,结局变量为前列腺癌。采用逆方差加权(... 目的 采用两样本孟德尔随机化方法研究233种循环代谢生物标志物与前列腺癌的因果关系。方法 利用全基因组关联研究数据(genome-wide association studies,GWAS),暴露因素为233种循环代谢生物标志物,结局变量为前列腺癌。采用逆方差加权(inverse variance weighted,IVW)法、加权中位数(weighted median,WM)法、MR-Egger回归、加权模式和简单模式研究暴露与结局的因果关系,其中以IVW作为主要分析方法,并进行敏感性分析以检验结果可靠性。结果 根据IVW的统计结果,有2种标志物与前列腺癌的发生风险呈正向因果关联:小低密度脂蛋白中甘油三酯与总脂质的比值(P=0.042),乳糜微粒和极大VLDL中总胆固醇与总脂质的比值(P=0.042)。有4种标志物与前列腺癌呈现负向因果关联:高密度脂蛋白中磷脂与总脂质的比值(P=0.025),共轭亚油酸与总脂肪酸的比值(P=0.009),亚油酸与总脂肪酸的比例为18∶2(P=0.045),酪氨酸水平(P=0.045)。其他4种方法的统计结果与IVW不完全一致(多数P>0.05),但5种方法的因果效应方向基本一致,结果仍旧可靠。敏感性分析未发现异质性和多效性,表明结果稳健。反向MR分析未发现前列腺癌能够影响6种循环代谢生物标志物水平。结论 233种循环代谢生物标志物中,小低密度脂蛋白中甘油三酯与总脂质的比值、乳糜微粒和极大VLDL中总胆固醇与总脂质的比值是前列腺癌的危险因素,共轭亚油酸与总脂肪酸的比值、亚油酸与总脂肪酸的比例为18∶2、高密度脂蛋白中磷脂与总脂质的比值、酪氨酸水平是前列腺癌的保护因素。 展开更多
关键词 循环代谢生物标志物 前列腺癌 孟德尔随机化 因果关系 脂蛋白 脂质 全基因组关联研究
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基于多组学数据的孟德尔随机化分析鉴定椎间盘退变可成药靶点及中药预测
2
作者 郭东琪 王浩 +8 位作者 白欣 白建琦 苏红梅 张静茹 郭宵飞 赵小琪 王敏 王源 张平 《中国药物警戒》 2025年第3期241-248,共8页
目的研究治疗椎间盘退变的可成药靶点并评估其安全性,预测调控可成药靶点治疗椎间盘退变的中药。方法从eQTLGen Consortium获取可成药基因的表达数量性状位点作为暴露,GWAS Catalog数据库获取椎间盘退变的全基因组关联研究数据作为结局... 目的研究治疗椎间盘退变的可成药靶点并评估其安全性,预测调控可成药靶点治疗椎间盘退变的中药。方法从eQTLGen Consortium获取可成药基因的表达数量性状位点作为暴露,GWAS Catalog数据库获取椎间盘退变的全基因组关联研究数据作为结局进行药物靶点孟德尔随机化(Mendelian Randomization,MR)分析,寻找椎间盘退变潜在的治疗靶点。对椎间盘退变可成药基因进行GO、KEGG富集分析。从FinnGen数据库获取椎间盘退变可成药基因的蛋白数量性状位点,作为暴露进行MR验证上述可成药基因的有效性。通过PheWAS Portal进行全表型组关联研究,评估药物安全性;利用BATMAN-TCM 2.0及ETCM 2.0平台挖掘中药成分,分析用药规律。通过CBDock 2平台对靶点及中药成分进行分子对接,寻找潜在的先导化合物。结果延胡索、巴戟天、艾叶等35味中药中的20个有效成分可通过调控ZP3、RRM2B、CCL4等3个可成药靶点治疗椎间盘退变;基因表达MR提示248个可成药基因与椎间盘退变存在因果关系,富集分析显示上述基因与细胞因子活性、细胞衰老等过程相关,蛋白MR验证其中6个基因为椎间盘退变的可成药靶点;全表型组关联研究未发现上述可成药靶点存在明显不良反应;分子对接显示上述中药成分与可成药靶点的结合活性较好,最佳结合能-10.2 kcal·mol^(-1)。结论ZP3、RRM2B、CCL4等基因是椎间盘退变的潜在药靶,安全性较好;延胡索、巴戟天、艾叶等中药通过可成药靶点治疗椎间盘退变,其有效成分如黄嘌呤核苷等是新药研发的潜在化合物。 展开更多
关键词 椎间盘退变 孟德尔随机化 药物靶点 全表型组关联研究 安全性 中药预测
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摄入咖啡与免疫球蛋白A肾病的孟德尔随机化研究
3
作者 张晓倩 王艺涵 樊均明 《成都医学院学报》 2025年第1期37-40,共4页
目的利用孟德尔随机化(MR)方法探讨摄入咖啡与免疫球蛋白A肾病(IgAN)发生的因果关系。方法从全基因组关联分析(GWAS)研究数据库中提取与咖啡摄入相关的单核苷酸多态性位点(SNP)作为工具变量,用逆方差加权法(IVW)、加权中位法、加权分析... 目的利用孟德尔随机化(MR)方法探讨摄入咖啡与免疫球蛋白A肾病(IgAN)发生的因果关系。方法从全基因组关联分析(GWAS)研究数据库中提取与咖啡摄入相关的单核苷酸多态性位点(SNP)作为工具变量,用逆方差加权法(IVW)、加权中位法、加权分析、MR-Egger法、简单分析法进行两样本MR分析,评价摄入咖啡与IgAN的因果关系。结果筛选到30个相关SNP,IVW结果表明咖啡摄入与IgAN风险间不存在因果关系(OR=0.887,95%CI:0.591~1.329),加权中位法结果表明咖啡摄入与IgAN风险间不存在因果关系(OR=1.051,95%CI:0.625~1.760),加权分析结果表明咖啡摄入与IgAN风险间不存在因果关系(OR=1.063,95%CI:0.612~1.844),MR-Egger分析结果表明咖啡摄入与IgAN风险间不存在因果关系(OR=1.298,95%CI:0.531~3.172),简单分析结果表明咖啡摄入与IgAN风险间不存在因果关系(OR=0.815,95%CI:0.316~2.098),敏感性分析显示研究结果没有产生偏倚,异质性检验表明SNP不存在异质性。结论摄入咖啡与IgAN之间不存在因果关系。 展开更多
关键词 咖啡摄入 免疫球蛋白A肾病 孟德尔随机化 全基因组关联分析
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特应性皮炎和感染性胃肠炎的因果关系研究:基于双向孟德尔随机化方法
4
作者 邢可 刘怡 +1 位作者 侯楠 张海洋 《皮肤性病诊疗学杂志》 2025年第4期270-279,共10页
目的采用两样本双向孟德尔随机化(MR)方法研究特应性皮炎(AD)与感染性胃肠炎的因果关系,以警惕AD患者发生感染性胃肠炎的可能。方法基于大规模全基因组关联研究(GWAS)汇总数据,选择相互独立且与AD及感染性胃肠炎高度相关的单核苷酸多态... 目的采用两样本双向孟德尔随机化(MR)方法研究特应性皮炎(AD)与感染性胃肠炎的因果关系,以警惕AD患者发生感染性胃肠炎的可能。方法基于大规模全基因组关联研究(GWAS)汇总数据,选择相互独立且与AD及感染性胃肠炎高度相关的单核苷酸多态性(SNP)作为工具变量。利用逆方差加权(IVW)、MR Egger法、加权中位数、加权模式和简单模式进行MR分析。采用Cochran Q检验进行异质性检验,孟德尔随机多态性残差和离群值检验、MR Egger截距测试进行多效性分析,“留一法”进行敏感性分析。以比值比(OR)及95%置信区间(CI)作为效应指标对AD及感染性胃肠炎的双向因果关系进行探讨。结果IVW分析表明AD可增加感染性胃肠炎的患病风险(OR=1.030,95%CI:1.006~1.056,P=0.015),加权中位数法亦证实该结果。在反向MR分析中,IVW分析(OR:1.111,95%CI:0.910~1.357,P=0.299)、简单模式、加权模式、加权中位数法、MR Egger法提示没有证据表明感染性胃肠炎会增加AD的发病风险。结论AD与感染性胃肠炎的风险增加有显著的因果关系,但研究未发现感染性胃肠炎导致AD风险增加的证据。 展开更多
关键词 特应性皮炎 感染性胃肠炎 孟德尔随机化 全基因组关联研究 因果关系
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中医外治法治疗溃疡性结肠炎的meta分析
5
作者 张潇文 陆廷飞 +1 位作者 刘杰民 褚明亮 《中国医药科学》 2025年第7期4-8,共5页
目的旨在对中医外治法对溃疡性结肠炎(UC)治疗的临床效果进行评估。方法通过检索中国知网、万方、维普以及PubMed,收集中医外治法治疗UC的临床随机对照试验(RCT),并采用Revman 5.4和Stata 17.0软件进行数据分析与比较。结果纳入15篇文献... 目的旨在对中医外治法对溃疡性结肠炎(UC)治疗的临床效果进行评估。方法通过检索中国知网、万方、维普以及PubMed,收集中医外治法治疗UC的临床随机对照试验(RCT),并采用Revman 5.4和Stata 17.0软件进行数据分析与比较。结果纳入15篇文献,涉及1196例患者。meta分析结果显示,治疗组有效率高于对照组,差异有统计学意义[RR=1.11,95%CI(1.01,1.21),Z=2.26,P=0.024]。此外,治疗组在降低肠镜Baron评分、白细胞介素(IL)-6、C反应蛋白、肿瘤坏死因子α水平以及提升IL-10水平方面均优于对照组,差异有统计学意义(P<0.001)。尽管两组在减少不良反应方面差异无统计学意义,但治疗组不良反应数量低于对照组。结论中医外治法对于UC的治疗不仅有效,而且能减少治疗的副作用。 展开更多
关键词 中医外治法 溃疡性结肠炎 临床随机对照研究 META分析
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冠心病与溃疡性结肠炎之间的因果关系:一项孟德尔随机化研究
6
作者 张雨晗 刘兴德 +3 位作者 郑玉华 雷雨 熊晓满 吴闵 《山西医科大学学报》 2025年第3期252-256,共5页
目的采用孟德尔随机化分析方法探讨冠心病与溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)之间的因果关联。方法从全基因组关联研究(genome-wide association study,GWAS)汇总数据中筛选与冠心病相关的单核苷酸多态性(single nucleotic polymorp... 目的采用孟德尔随机化分析方法探讨冠心病与溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)之间的因果关联。方法从全基因组关联研究(genome-wide association study,GWAS)汇总数据中筛选与冠心病相关的单核苷酸多态性(single nucleotic polymorphism,SNP)作为基因工具变量,主要分析方法采用逆方差加权法(inverse variance weighted,IVW)评估冠心病对溃疡性结肠炎的效应,用MR-Egger回归、加权中位数法(weighted median,WM)、简单模式(simple mode)和加权模式(weighted mode)来检验结果的稳健型。通过异质性分析、多效性分析及敏感性分析进一步验证结果的可靠性和稳定性。结果共筛选得35个SNP作为工具变量,IVW法分析显示,冠心病与溃疡性结肠炎之间存在正相关关系(OR=1.16,95%CI 1.04~1.29,P<0.05),提示冠心病可能会增加溃疡性结肠炎的患病风险。WM分析也显示出类似的结果(OR=1.23,95%CI 1.05~1.45,P<0.05)。此外,Cochrane Q检验、MR-Egger回归截距和漏斗图结果显示,未发现异质性和水平多效性,结果具有可靠性。结论冠心病可能会诱发溃疡性结肠炎,两者之间存在正向因果关联。 展开更多
关键词 冠心病 溃疡性结肠炎 孟德尔随机化 单核苷酸多态性 因果效应 全基因组关联研究
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回阳通脉汤治疗寒湿阻络型下肢动脉粥样硬化闭塞症的临床研究
7
作者 王雨 徐旭英 《中国现代中药》 CAS 2024年第8期1414-1419,共6页
目的:探讨回阳通脉汤治疗寒湿阻络型下肢动脉粥样硬化闭塞症(LEASO)的临床疗效。方法:将80例脾肾阳虚的LEASO患者按照随机数字表法分为两组,对照组给予贝前列素钠口服(40μg,3次/d),治疗组在对照组基础上联合回阳通脉汤加减治疗,以3个... 目的:探讨回阳通脉汤治疗寒湿阻络型下肢动脉粥样硬化闭塞症(LEASO)的临床疗效。方法:将80例脾肾阳虚的LEASO患者按照随机数字表法分为两组,对照组给予贝前列素钠口服(40μg,3次/d),治疗组在对照组基础上联合回阳通脉汤加减治疗,以3个月为观察终点。比较两组患者中医证候评分,血液内皮素-1(ET-1)、一氧化氮(NO)水平,踝肱指数(ABI),经皮氧分压(TcPO_(2))及足背动脉血流动力学指标。结果:治疗组临床总有效率(90.00%)高于对照组(75.00%,P<0.05),两组患者治疗后中医证候各项评分均较治疗前降低(P<0.05),且治疗组优于对照组(P<0.05);两组患者治疗后ET-1水平均较治疗前降低(P<0.05),且治疗组优于对照组(P<0.05);两组患者治疗后NO水平、ABI、TcPO_(2)、足背动脉血流动力学指标均升高(P<0.05),且治疗组优于对照组(P<0.05)。结论:回阳通脉汤干预寒湿阻络型LEASO能够减轻患者缺血肢体症状,缓解间歇性跛行,提高ABI及TcPO_(2),改善足部血供。 展开更多
关键词 回阳通脉汤 寒湿阻络证 下肢动脉粥样硬化闭塞症 随机对照研究
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受教育程度与胰腺炎的因果关系:一项孟德尔随机化研究 被引量：3
8
作者 曹瑞奇 冯正源 +4 位作者 吴佼星 李杰 王铮 仵正 周灿灿 《西安交通大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期200-205,共6页
目的 通过孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)分析探究受教育程度(educational attainment,EA)与胰腺炎之间的因果关系。方法 采用双样本MR分析,EA和胰腺炎的全基因组关联研究(GWAS)汇总数据分别来自SSGAC数据库和FinnGen数据库R... 目的 通过孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)分析探究受教育程度(educational attainment,EA)与胰腺炎之间的因果关系。方法 采用双样本MR分析,EA和胰腺炎的全基因组关联研究(GWAS)汇总数据分别来自SSGAC数据库和FinnGen数据库R9版本。采用逆方差加权(inverse variance weighted,IVW)、MR-Egger和weighted median法探究EA与胰腺炎之间的因果关系。通过Cochran’s Q检验和漏斗图等方法评估异质性和定向的水平多效性。结果 共有604个与EA相关的单核苷酸多态性(SNP)被纳入研究,EA与急性胰腺炎和慢性胰腺炎发病风险均具有明显的负相关性(急性胰腺炎:OR=0.52,95%CI:0.44~0.62,P=2.43×10^(-14);慢性胰腺炎:OR=0.51,95%CI:0.41~0.64,P=7.20×10^(-9))。MR-Egger和weighted median的结果也提示EA与胰腺炎发病风险呈负相关。敏感性分析结果表明研究没有违反MR的基本假设。结论 EA与急性、慢性胰腺炎的发生存在因果关系,EA与胰腺炎的发病风险呈负相关。 展开更多
关键词 胰腺炎 受教育程度(EA) 孟德尔随机化(MR) 全基因组关联研究(GWAS) 风险因素
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系统性红斑狼疮与子痫前期因果关系的孟德尔随机化分析 被引量：1
9
作者 桂琦 侯伟 +3 位作者 胡甲琳 姜淑芳 游艳琴 卢彦平 《发育医学电子杂志》 2024年第6期415-421,共7页
目的探究系统性红斑狼疮(systemic lupus erythematosus,SLE)与子痫前期(preeclampsia,PE)之间的因果关系。方法通过R包TwoSampleMR(v 0.6.4)从IEU OpenGWAS数据库中筛选与SLE具有显著差异的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorph... 目的探究系统性红斑狼疮(systemic lupus erythematosus,SLE)与子痫前期(preeclampsia,PE)之间的因果关系。方法通过R包TwoSampleMR(v 0.6.4)从IEU OpenGWAS数据库中筛选与SLE具有显著差异的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)作为工具变量,共获取包含7071163个SNP的SLE数据集和包含24165538个SNP的PE数据集。采用逆方差加权(inverse-variance weighting,IVW)法、孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)-Egger回归法、加权中位数(weighted median estimator,WME)法、简单模式(simple mode,SM)、加权模式(weighted mode,WM)进行MR分析,通过计算优势比(odds ratio,OR)值和95%CI评价SLE和PE之间的因果关系,并进行Cochran's Q异质性检验、MR-Egger回归水平多效性检验和留一法评估验证数据的稳定性和可靠性。结果共纳入42个SNP作为工具变量。IVW分析提示SLE与PE发病风险之间存在因果关系(OR=1.038,95%CI:1.003~1.073,P<0.05),MR-Egger分析也提示SLE与PE之间存在因果关系(OR=1.094,95%CI:1.020~1.174,P<0.05),在WME、SM及WM分析中未发现两者存在因果关系。Cochran's Q异质性检验和MR-Egger水平多效性检验显示,SNP之间不存在异质性及水平多效性。留一法检验提示没有单个SNP对整体结果有较大影响。结论MR分析提示SLE可增加PE的发病风险。 展开更多
关键词 孟德尔随机化 系统性红斑狼疮 子痫前期 全基因组关联分析 单核苷酸多态性
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温水或二氧化碳气体在困难结肠镜检查中的应用效果比较 被引量：1
10
作者 侯思慧 王艳 +2 位作者 汪晓红 孟剑秋 张嫚嫚 《中国内镜杂志》 2024年第11期47-52,共6页
目的对比注温水或二氧化碳(CO_(2))气体在困难结肠镜检查中的安全性和临床价值。方法选取2021年5月-2023年10月于该院门诊行非麻醉困难结肠镜检查的患者150例,随机分为注温水组(W组,n=50)、注CO_(2)气体组(C组,n=50)和注空气组(A组,n=50... 目的对比注温水或二氧化碳(CO_(2))气体在困难结肠镜检查中的安全性和临床价值。方法选取2021年5月-2023年10月于该院门诊行非麻醉困难结肠镜检查的患者150例,随机分为注温水组(W组,n=50)、注CO_(2)气体组(C组,n=50)和注空气组(A组,n=50)。比较3组患者进镜时间、检查中及结束后20 min、结束后1 h腹痛视觉模拟评分法(VAS)、插管成功率、息肉检出率、再检查意愿率和操作过程中是否需外界辅助等。另外随机选取A组和C组部分患者,比较检查前、达回盲部和检查后20 min呼气末二氧化碳分压(PetCO_(2)),以了解体内CO_(2)潴留情况。结果A组检查进镜时间长于W组和C组,且W组短于C组;A组各时间点腹痛VAS高于W组和C组,且W组检查中腹痛VAS低于C组;A组插管成功率和再检查意愿率低于W组和C组,差异均有统计学意义(P<0.05),W组和C组检查结束后20 min和1 h腹痛VAS、插管成功率和再检查意愿率比较,差异均无统计学意义(P>0.05)。W组需要助手腹部按压率明显低于A组和C组,转换体位率明显低于A组,差异有统计学意义(P<0.05)。3组患者息肉检出率比较,差异无统计学意义(P>0.05)。C组各时点的PetCO_(2)均在正常范围内,与A组比较,差异无统计学意义(P>0.05)。结论与注空气法相比,注水或CO_(2)气体在困难结肠镜检查中成功率高,安全性好,可减轻患者腹部不适感,特别是注水肠镜更适合在基层医院推广。 展开更多
关键词 温水 二氧化碳(CO_(2)) 困难结肠镜检查 随机对照研究
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内在情感对癌症发生风险的影响:基于孟德尔随机化研究 被引量：1
11
作者 杜钦 朱雨萱 +2 位作者 郭一泽 许楠馨 刘棣 《西安交通大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期376-382,共7页
目的探究内在情感(幸福感、抑郁情绪、忧虑和内疚感)与癌症(结直肠癌、肝癌、甲状腺癌、肺癌、乳腺癌)的因果关系。方法采用两样本双向孟德尔随机化方法。所有数据基于全基因关联研究(GWAS)汇总数据。逆方差加权法(IVW)得到的结果作为... 目的探究内在情感(幸福感、抑郁情绪、忧虑和内疚感)与癌症(结直肠癌、肝癌、甲状腺癌、肺癌、乳腺癌)的因果关系。方法采用两样本双向孟德尔随机化方法。所有数据基于全基因关联研究(GWAS)汇总数据。逆方差加权法(IVW)得到的结果作为主要结局指标,加权中值法(WM)、MR-Egger法作为补充结果,评价指标为比值比(OR),并进行敏感性分析。结果对于抑郁情绪,提示与肺癌(OR=1.005,95%CI:1.001~1.009,P=0.015)显著相关。对于忧虑,提示与乳腺癌(OR=1.199,95%CI:1.011~1.423,P=0.038)显著相关。对于内疚感,提示与甲状腺癌(OR=2.083,95%CI:1.080~4.017,P=0.029)显著相关。在去除MR-PRESSO检测到的所有潜在多效性SNPs后,忧虑与乳腺癌的关联无统计学差异(P=0.064),忧虑与结直肠癌显著相关(OR=0.739,95%CI:0.571~0.956,P=0.021)。癌症与内在情感之间的关联未发现存在因果关系。结论抑郁情绪与肺癌发生风险增加相关,内疚感与甲状腺癌发生风险增加相关,忧虑可能与结直肠癌发生风险降低相关。 展开更多
关键词 两样本双向孟德尔随机化 内在情感 癌症 全基因组关联研究 因果效应
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1型糖尿病与卵巢癌之间的因果关系:一项孟德尔随机化研究
12
作者 张玲 吴媛霞 +1 位作者 乔翠峰 杜秀萍 《山西医科大学学报》 CAS 2024年第9期1122-1126,共5页
目的 探计1型糖尿病(type 1 diabetes,T1DM)和卵巢癌(ovarian cancer,OC)之间的双向因果关系。方法 采用两样本孟德尔随机化(MR)设计,使用来自全基因组关联研究(GWAS)的T1DM遗传变异(9 266例欧洲血统病例和15 574例对照)和OC遗传变异(1 ... 目的 探计1型糖尿病(type 1 diabetes,T1DM)和卵巢癌(ovarian cancer,OC)之间的双向因果关系。方法 采用两样本孟德尔随机化(MR)设计,使用来自全基因组关联研究(GWAS)的T1DM遗传变异(9 266例欧洲血统病例和15 574例对照)和OC遗传变异(1 218例欧洲血统病例和198 523例对照)。采用MR-Egger、加权中位数(WME)、逆方差加权法(IVW)、简单模式(simple mode)和加权模式(weighted mode)来检验T1DM与OC之间的因果关系。然后采用留一法(leave-one-out)等敏感度分析来评估结果的可靠性。最后采用MR Steiger检验来测试暴露和结果之间的假设关系。结果 IVW法结果显示T1DM与OC的发病率增高有因果关系(OR=1.000 4,95%CI 1.000 1~1.000 8,P=9.01×10^(-3)),5种方法的估计值在方向上保持一致,表明T1DM是OC发病率的危险因素。MR Egger模型证实了结果无显著异质性(P>0.05),留一法敏感性分析去除单个SNP并重复进行MR分析时,结果较前无显著差异。Egger截距接近于零(截距<-0.001,P=0.191),表明本研究无水平多效性。同时反向MR分析并未发现OC促进T1DM发病风险增高的证据(OR=0.988,95%CI 3.09×10^(-5)~3.16×10^(4),P=0.998)。结论 遗传学证据表明,T1DM与OC的发病风险增加有关,相反,并未发现OC会使T1DM发病风险增高。 展开更多
关键词 1型糖尿病 卵巢癌 全基因组关联研究 孟德尔随机化 因果关系
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铁死亡相关基因热休克蛋白A5与肝细胞癌因果关系的孟德尔随机化和中介分析
13
作者 崔兵 许铖铖 +3 位作者 徐瑗 陈阿琴 毛朝明 陈跃华 《浙江大学学报(医学版)》 CSCD 北大核心 2024年第6期691-698,共8页
目的:探讨铁死亡相关基因热休克蛋白A5(HSPA5)与肝癌发展的因果关系及其作用机制。方法:采用两步两样本孟德尔随机化(MR)设计评估HSPA5、调节性T细胞及肝癌之间的因果关系。首先通过公开的全基因组关联研究(GWAS)数据库筛选与HSPA5、调... 目的:探讨铁死亡相关基因热休克蛋白A5(HSPA5)与肝癌发展的因果关系及其作用机制。方法:采用两步两样本孟德尔随机化(MR)设计评估HSPA5、调节性T细胞及肝癌之间的因果关系。首先通过公开的全基因组关联研究(GWAS)数据库筛选与HSPA5、调节性T细胞、肝癌相关的单核苷酸多态性作为工具变量,采用MR分析HSPA5对肝癌的直接影响,接着通过两步MR分析调节性T细胞在这一过程中可能的中介作用。同时,以肝癌为暴露因素,HSPA5为结局变量进行了反向MR分析。所有MR分析均以逆方差加权法作为主要的因果关联检验方法,通过MR-Egger、加权中值法、加权众数法和简单众数法验证结果的稳健性,并采用Cochrane’s Q统计量评估工具变量的异质性,MR-Egger回归的截距项和MR-PRESSO进行多效性检验,留一法进行敏感性分析。利用癌症基因组图谱(TCGA)数据库和人类蛋白质图谱(HPA)数据库验证HSPA5在肝癌组织中的表达水平及其与调节性T细胞的相关性,揭示HSPA5与调节性T细胞在肝癌进展中的相互作用机制及其与患者预后的关系。结果:MR分析结果显示,HSPA5表达增加与肝癌风险呈正相关(均P<0.01),而反向MR分析未发现肝癌与HSPA5之间存在关联(P>0.05)。HSPA5表达与调节性T细胞功能显著相关(均P<0.05),且调节性T细胞在肝癌微环境中的富集与肝癌进展呈正相关(均P<0.05)。中介效应分析结果显示,调节性T细胞在HSPA5和肝癌间的中介效应分别占5.00%和7.45%。TCGA和HPA数据库分析显示,肝癌组织中HSPA5的mRNA和蛋白质表达水平均高于正常组织,且高表达与患者不良预后显著相关。免疫浸润分析验证了HSPA5与调节性T细胞之间的显著正相关性,且调节性T细胞在肝癌中的高浸润与肝癌进展密切相关。结论:HSPA5的高表达与肝癌的发生及不良预后显著相关,并可能通过调控调节性T细胞在肿瘤微环境中的功能促进肝癌发展。 展开更多
关键词 肝细胞癌 热休克蛋白A5 铁死亡 调节性T细胞 孟德尔随机化 全基因组关联分析
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孟德尔随机化在常见眼病中的研究进展
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作者 张熙然 袁韦辰 +2 位作者 李祥瑞 徐菲儿 赵芳坤 《国际眼科杂志》 CAS 2024年第5期784-789,共6页
病因学研究是正确认识疾病发生和流行规律的必要条件,也是临床疾病诊断预防治疗的前提。孟德尔随机化(Mendelian randomization, MR)作为遗传学和流行病学结合的方法,可以在遗传学层面上探究暴露与疾病的因果关系,同时可以避免混杂因素... 病因学研究是正确认识疾病发生和流行规律的必要条件,也是临床疾病诊断预防治疗的前提。孟德尔随机化(Mendelian randomization, MR)作为遗传学和流行病学结合的方法,可以在遗传学层面上探究暴露与疾病的因果关系,同时可以避免混杂因素、反向因果的干扰,因此被广泛用于疾病的病因学研究。本文对眼科疾病研究中孟德尔随机化的应用进行综述,并为相关眼病机制研究、干预方法的设计提供更多思路和方法。 展开更多
关键词 孟德尔随机化 眼病 病因学研究 因果关系
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基于双样本孟德尔随机化研究二甲双胍治疗与卵巢癌发病风险的因果关系
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作者 曹铁凤 何雨诗 沈慧敏 《中国医药导报》 CAS 2024年第14期9-12,共4页
目的 探讨孟德尔随机化(MR)分析二甲双胍治疗与卵巢癌发病风险的因果关系。方法 本研究基于两样本MR分析,将二甲双胍作为暴露因素,卵巢癌为结局变量。二甲双胍数据来源于IEU OpenGWAS project网站的全基因组关联研究(GWAS)及已发表的药... 目的 探讨孟德尔随机化(MR)分析二甲双胍治疗与卵巢癌发病风险的因果关系。方法 本研究基于两样本MR分析,将二甲双胍作为暴露因素,卵巢癌为结局变量。二甲双胍数据来源于IEU OpenGWAS project网站的全基因组关联研究(GWAS)及已发表的药物靶点研究,卵巢癌的GWAS数据来自卵巢癌协会联盟。使用随机效应逆方差加权(IVW)法、加权模式法、MR-Egger回归法、加权中位数法、简单模式法进行MR分析;科克伦Q检验用于异质性检验,MR-Egger截距法和MR-PRESSO法进行水平多效性检验;留一法确定单个工具变量是否对结果产生影响。结果 对于第一种暴露因素,最终获取了45个单核苷酸多态性位点作为工具变量;对于第二种暴露因素,获取32个工具变量。二甲双胍治疗与卵巢癌发病风险不存在因果关系;对于第一种暴露因素,工具变量不存在异质性及水平多效性;对于第二种暴露因素,工具变量存在异质性,但本研究使用随机效应IVW法,不影响最终结果;留一法均提示无异常工具变量。二甲双胍治疗与不同类型卵巢癌发病风险不存在因果关系。对于两种暴露因素,工具变量均存在部分异质性,但本研究使用随机效应IVW法,不影响最终结果;留一法均提示无异常工具变量。结论 二甲双胍治疗与卵巢癌发病风险之间无明显因果关系。 展开更多
关键词 二甲双胍 孟德尔随机化 全基因组关联研究 因果推断 卵巢癌
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人体成分与跟骨骨密度因果关联:一项孟德尔随机化研究
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作者 宋继东 刘暾 +2 位作者 张心毅 赵家鑫 王伟 《山西医科大学学报》 CAS 2024年第8期1055-1061,共7页
目的采用孟德尔随机化方法研究人体成分与跟骨骨密度的因果关系。方法利用全基因关联分析数据,暴露因素为全身脂肪量、全身水分量和去脂体质量,结局变量为跟骨骨密度。采用IVW法、MR-Egger法、加权中位数法、简单模式法、加权模式法进... 目的采用孟德尔随机化方法研究人体成分与跟骨骨密度的因果关系。方法利用全基因关联分析数据,暴露因素为全身脂肪量、全身水分量和去脂体质量,结局变量为跟骨骨密度。采用IVW法、MR-Egger法、加权中位数法、简单模式法、加权模式法进行孟德尔随机化分析,并行异质性、敏感性、多效性分析以检验结果可靠性。结果IVW法显示全身脂肪量与跟骨骨密度存在正向因果关系(β=1.10,95%CI 1.05~1.15,P<0.001),MR-Egger法、加权中位数法、加权模式法与IVW法结果一致,敏感性分析显示单核苷酸多态性无异质性和水平多效性;IVW法显示全身水分量与跟骨骨密度因果关系无统计学意义(β=0.96,95%CI 0.91~1.02,P>0.05);IVW法显示去脂体质量与跟骨骨密度之间因果关系无统计学意义(β=0.97,95%CI 0.91~1.03,P>0.05)。结论人体全身脂肪量与跟骨骨密度存在正向因果关系。 展开更多
关键词 人体成分 骨质疏松 全身脂肪量 跟骨骨密度 孟德尔随机化 全基因组关联分析
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双边箱钢-混组合梁失稳模式及分类预测
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作者 杨旻予 卫星 +2 位作者 贾庆霖 赵骏铭 肖林 《铁道建筑》 北大核心 2024年第12期50-55,共6页
建立60个双边箱钢-混组合梁空间有限元模型,考虑3种边界条件,研究横梁间距、混凝土板厚度和边箱加劲肋数量对梁段稳定性的影响。采用随机森林算法,训练并验证了根据多种设计参数预测失稳形式的分类模型。结果表明:大部分箱梁失稳的模态... 建立60个双边箱钢-混组合梁空间有限元模型,考虑3种边界条件,研究横梁间距、混凝土板厚度和边箱加劲肋数量对梁段稳定性的影响。采用随机森林算法,训练并验证了根据多种设计参数预测失稳形式的分类模型。结果表明:大部分箱梁失稳的模态发生在第1阶或第2阶。无混凝土时梁段的屈曲系数最小,容易发生纵梁失稳或箱梁失稳。边界条件为悬臂时,横梁间距越小,屈曲系数越大,梁段越稳定,但存在边界效应。混凝土板厚度与梁段稳定性在大部分条件下呈正相关;加劲肋数量对梁段稳定性影响最大。经过104个数据的数据集训练,机器学习模型可以根据设计参数对失稳形式进行快速预测。 展开更多
关键词 公路桥梁 双边箱钢-混组合梁 有限元分析 结构稳定性 参数研究 随机森林预测模型
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特定肠道菌群和骨质疏松症的因果关系
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作者 高志杰 汪悦东 张志海 《医学研究与战创伤救治》 CAS 北大核心 2024年第5期449-455,共7页
目的采用孟德尔随机化分析方法来研究特定肠道菌群与骨质疏松症发病风险的因果关系。方法获取肠道菌群与骨质疏松症的全基因组关联研究数据,将单核苷酸多态性(SNP)作为工具变量并选择敏感的SNPs进行分析。通过逆方差加权法(IVW)、加权... 目的采用孟德尔随机化分析方法来研究特定肠道菌群与骨质疏松症发病风险的因果关系。方法获取肠道菌群与骨质疏松症的全基因组关联研究数据,将单核苷酸多态性(SNP)作为工具变量并选择敏感的SNPs进行分析。通过逆方差加权法(IVW)、加权中位数法(WM)、MR-Egger回归法进行两样本孟德尔随机化分析,以OR值检验肠道菌群与骨质疏松症之间的因果关系,并完成敏感性和多效性检验。结果筛选到1531个SNPs作为工具变量,狭义梭菌属1、粪球菌属3、粪杆菌属、纺锤链杆菌属、考拉杆菌属、瘤胃球菌科NK4A214群、塞利单胞菌属与骨质疏松症的孟德尔随机化分析结果显示,IVW法的OR值分别为1.291(95%CI 1.037~1.607,P=0.022)、0.627(95%CI 0.440~0.894,P=0.010)、1.520(95%CI 1.125~2.054,P=0.006)、1.271(95%CI 1.037~1.558,P=0.021)、0.801(95%CI 0.674~0.951,P=0.012)、1.220(95%CI 1.010~1.473,P=0.039)、0.854(95%CI 0.744~0.979,P=0.024),表明肠道菌群与骨质疏松症之间存在因果关系。IVW(P>0.05)和MR-Egger回归(P>0.05)的CochranQ检验表明SNPs并不存在异质性。MR-Egger法的egger_intercept和0差异无统计学意义(P>0.05),SNPs不存在水平多效性。结论狭义梭菌属1、粪球菌属3、粪杆菌属、纺锤链杆菌属、考拉杆菌属、瘤胃球菌科NK4A214群、塞利单胞菌属与骨质疏松症之间存在因果关系,为探讨肠道菌群介导的骨质疏松症的发病机制提供了新的认知。 展开更多
关键词 孟德尔随机化 肠道菌群 骨质疏松症 基因组关联研究 因果关系
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吸烟与C反应蛋白水平的因果关系:一项双样本孟德尔随机化研究
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作者 曾莹莹 喻明兰 +2 位作者 王婷婷 刘可智 向波 《四川精神卫生》 2024年第6期567-571,共5页
背景 吸烟与C反应蛋白(CRP)有关,但既往研究结果可能受到混杂因素的影响,CRP在吸烟相关病理过程中的因果关系有待一步探究。目的 利用全基因组关联研究(GWAS)结果数据,探讨吸烟与CRP水平之间的因果关系,为制定相关公共健康政策和吸烟干... 背景 吸烟与C反应蛋白(CRP)有关,但既往研究结果可能受到混杂因素的影响,CRP在吸烟相关病理过程中的因果关系有待一步探究。目的 利用全基因组关联研究(GWAS)结果数据,探讨吸烟与CRP水平之间的因果关系,为制定相关公共健康政策和吸烟干预措施提供参考。方法 采用CRP以及开始定期吸烟的年龄、开始吸烟、戒烟、日吸烟量四种吸烟表型的GWAS结果数据,选择相互独立且与吸烟及CRP相关的遗传位点作为工具变量。应用逆方差加权法(IVW)及加权中位数法进行孟德尔随机化(MR)分析,对吸烟及CRP的双向因果关系进行探讨。采用Cochran’s Q检验评估每个单核苷酸多态性(SNP)之间的异质性;采用MR多效性残差总和及异常值检测SNP异常值;采用MR-Egger截距测试检验SNP的水平多效性;采用留一法敏感性分析检验MR研究是否受单个SNP的影响。结果 CRP与开始吸烟之间存在双向因果关系(β=0.170,P=0.010)(开始吸烟是暴露因素)、(β=0.040,P=0.001)(CRP是暴露)。结论 吸烟可能会导致CRP水平改变,而CRP水平改变也可能影响个体开始吸烟的倾向。 展开更多
关键词 吸烟 C反应蛋白 全基因组关联研究 孟德尔随机化
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乌司他丁改善严重脓毒症患者器官功能的前瞻性随机对照研究 被引量：11
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作者 黎文研 周立新 +5 位作者 誉铁鸥 方滨 温伟标 强新华 黎昌 余志辉 《中国医药导报》 CAS 2013年第35期106-108,共3页
目的 研究乌司他丁对严重脓毒症患者循环功能的影响.方法 选择2010年10月～2012年12月收住佛山市第一人民医院ICU的18岁以上严重脓毒症患者,将其分为乌司他丁治疗组和对照组.对照组采用经典脓毒症常规治疗,乌司他丁治疗组在经典脓毒症... 目的 研究乌司他丁对严重脓毒症患者循环功能的影响.方法 选择2010年10月～2012年12月收住佛山市第一人民医院ICU的18岁以上严重脓毒症患者,将其分为乌司他丁治疗组和对照组.对照组采用经典脓毒症常规治疗,乌司他丁治疗组在经典脓毒症常规治疗基础上加用乌司他丁[1万～2万U/（kg·d）],观察两组患者治疗前后器官功能指标和序贯器官衰竭估计（SOFA）评分的变化.结果 与对照组同期比较,乌司他丁治疗组治疗后24 h动脉血乳酸明显降低,治疗后72 h舒张压明显升高（P＜0.05）.乌司他丁治疗组治疗后3d谷丙转氨酶（ALT）、谷草转氨酶（AST）明显低于对照组同期（P＜0.05）;治疗后3d和7d血肌酐和SOFA评分亦低于对照组同期,氧合指数高于对照组同期,但差异无统计学意义（P＞0.05）.结论 乌司他丁治疗可以明显改善严重脓毒症患者的循环功能和肝脏功能,对肺和肾脏功能也可能具有保护作用. 展开更多
关键词 乌司他丁 严重脓毒症 器官功能 随机对照试验
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