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Regulation of Gonadotropin-Releasing Hormone(GnRH)Secretion and mRNA Expression by Dopamine and cAMP Second Messenger Pathway in a GnRH Neuronal Cell Line
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作者 K.L.Yu M.H.Tsang K.W.Dong 《中山大学学报论丛》 1995年第3期197-197,共1页
关键词 GnRH)Secretion and mrna Expression by Dopamine and cAMP Second messenger Pathway in a GnRH Neuronal Cell Line Regulation of Gonadotropin-Releasing Hormone
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长链非编码RNA在急性肺损伤中的作用及分子调控机制研究进展 被引量:1
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作者 罗飞 张红 《山东医药》 CAS 2024年第6期93-97,共5页
急性肺损伤(ALI)是临床上常见的危重症之一。长链非编码RNA(lncRNA)是一类长度超过200个核苷酸的非蛋白质编码RNA,在染色质形成、转录和转录后翻译等基因表达水平直接或间接参与ALI的发生发展。lncRNA核富集丰富转录物1、lncRNA HOX转... 急性肺损伤(ALI)是临床上常见的危重症之一。长链非编码RNA(lncRNA)是一类长度超过200个核苷酸的非蛋白质编码RNA,在染色质形成、转录和转录后翻译等基因表达水平直接或间接参与ALI的发生发展。lncRNA核富集丰富转录物1、lncRNA HOX转录反义基因间RNA及lncRNA牛磺酸上调1等lncRNA可作为竞争性内源RNA,与miR-26a-5p、miR-17-5p及miR-34b-5p等微小RNA结合,调节Wnt1诱导的信号通路蛋白1、Rho关联含卷曲螺旋结合蛋白激酶1蛋白及自噬相关蛋白等下游相关蛋白的表达,参与ALI的发生发展。LncRNA可能通过调控DNA甲基化、组蛋白修饰,在表观遗传水平参与ALI的发生发展;L通过组装转录激活因子和抑制因子,调节白细胞介素6(IL-6)、IL-17、含半胱氨酸的天冬氨酸蛋白水解酶3/9等蛋白质的转录,在转录水平参与ALI的发生发展;与多种RNA结合蛋白相互作用,在转录后水平调控ALI的发生发展。 展开更多
关键词 长链非编码rna lncrna核富集丰富转录物1 lncrna HOX转录反义基因间rna lncrna牛磺酸上调1 微小rna DNA甲基化 转录激活因子 rna结合蛋白 急性肺损伤
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RNA干扰沉默褐飞虱糖转运蛋白基因4的研究
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作者 谢坤 丁汉凤 +6 位作者 李娜娜 贾素平 白静 丛韫喆 李广贤 姚方印 杨永义 《山东农业科学》 北大核心 2025年第1期22-29,共8页
褐飞虱是水稻上危害最严重的害虫之一,目前的防治措施存在各种弊端,开展控制褐飞虱的探索研究可开辟新的防治途径。本研究利用dsRNA(double-stranded RNA,双链RNA)介导的RNAi(RNA interference,RNA干扰)技术,以褐飞虱糖运输蛋白基因(Nls... 褐飞虱是水稻上危害最严重的害虫之一,目前的防治措施存在各种弊端,开展控制褐飞虱的探索研究可开辟新的防治途径。本研究利用dsRNA(double-stranded RNA,双链RNA)介导的RNAi(RNA interference,RNA干扰)技术,以褐飞虱糖运输蛋白基因(Nlst4)为靶标,在体外合成Nlst4的dsRNA,将其饲喂褐飞虱若虫后,其体内目标基因表达量显著下降,产生致死表型;构建Nlst4的RNAi干扰载体,通过农杆菌侵染转化培育转基因水稻,褐飞虱取食后,体内目标基因转录水平显著降低,1龄、2龄若虫发育历期显著延长,但未出现致死表型。试验结果证实,利用RNAi技术通过培育转基因水稻防治褐飞虱存在可行性,可为后续转基因抗褐飞虱水稻的培育提供科学依据。 展开更多
关键词 褐飞虱 rna干扰 糖转运蛋白基因4 人工饲喂 转基因水稻
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宫颈癌患者血清LncRNA SFTA1P和LncRNA UBE2R2-AS1表达水平与预后的关系
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作者 肖献花 郭丽娜 +4 位作者 呼慧军 张伟伟 冀娜娜 段敬梅 高翔 《安徽医学》 2025年第1期22-27,共6页
目的探究宫颈癌(CC)患者血清中长链非编码RNA(LncRNA)表面活性剂相关1假基因(SFTA1P)和UBE2R2-AS1表达水平及其与预后的关系。方法选取2018年4月至2021年4月邯郸市妇幼保健院收治的108例CC患者为CC组,100例同期健康体检者为健康组。用... 目的探究宫颈癌(CC)患者血清中长链非编码RNA(LncRNA)表面活性剂相关1假基因(SFTA1P)和UBE2R2-AS1表达水平及其与预后的关系。方法选取2018年4月至2021年4月邯郸市妇幼保健院收治的108例CC患者为CC组,100例同期健康体检者为健康组。用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)法检测血清LncRNA SFTA1P和LncRNA UBE2R2-AS1水平;绘制受试者工作特征(ROC)曲线评估血清LncRNA SFTA1P和LncRNA UBE2R2-AS1对CC的诊断价值;Kaplan-Meier法分析血清LncRNA SFTA1P和LncRNA UBE2R2-AS1表达水平与CC患者预后的关系;Cox回归分析CC患者预后的影响因素。结果与健康组相比,CC患者血清LncRNA SFTA1P表达水平升高(P<0.05),LncRNA UBE2R2-AS1表达水平降低(P<0.05),且其水平与FIGO分期、淋巴结转移、肌层浸润深度有关(P<0.05);血清LncRNA SFTA1P和LncRNA UBE2R2-AS1单独及联合诊断CC发生的曲线下面积分别为0.863、0.817和0.915,联合优于单独诊断(Z_(二者联合-LncRNA SFTA1P)=3.057、P=0.002,Z_(二者联合-LncRNA UBE2R2-AS1)=3.564、P<0.001);血清LncRNA SFTA1P高表达组患者3年生存率低于低表达组患者(64.91%比80.39%,χ^(2)=4.443,P=0.035),LncRNA UBE2R2-AS1高表达组患者3年生存率高于低表达组患者(82.00%比63.79%,χ^(2)=5.938,P=0.015);FIGO分期Ⅱb~Ⅲc期、淋巴结转移、肌层浸润深度≥1/2、LncRNA SFTA1P表达水平升高及LncRNA UBE2R2-AS1表达水平降低均为CC患者预后的危险因素(P<0.05)。结论CC患者血清中LncRNA SFTA1P表达上调,LncRNA UBE2R2-AS1表达下调,其表达水平与肿瘤FIGO分期、淋巴结转移、肌层浸润深度有关,且与患者预后生存密切相关。 展开更多
关键词 宫颈癌 长链非编码rna SFTA1P 长链非编码rna UBE2R2-AS1 临床病理特征 预后
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环状RNA在动脉粥样硬化中的研究进展
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作者 曹汉榆 朱子润 +2 位作者 曾铄雯 张婷 李鹏 《中华老年心脑血管病杂志》 北大核心 2025年第2期241-244,共4页
动脉粥样硬化(atherosclerosis, AS)是一种以血管内膜形成粥样硬化斑块或纤维斑块为特征的病理改变,主要累及大动脉及中等动脉,导致动脉壁增厚变硬、管腔狭窄和弹性下降,引起相应器官的缺血性改变。AS是冠心病等心血管疾病的主要病理学... 动脉粥样硬化(atherosclerosis, AS)是一种以血管内膜形成粥样硬化斑块或纤维斑块为特征的病理改变,主要累及大动脉及中等动脉,导致动脉壁增厚变硬、管腔狭窄和弹性下降,引起相应器官的缺血性改变。AS是冠心病等心血管疾病的主要病理学基础。当斑块破裂或糜烂时,可形成血栓,使血管变窄,阻碍血流,甚至导致心肌梗死。 展开更多
关键词 rna 环状 rnaS 动脉粥样硬化 内皮细胞
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转运RNA的表观遗传修饰及其异常对神经退行性变性疾病的影响
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作者 唐明敏 毕洪运 +1 位作者 董子敬 曾玲晖 《浙江大学学报(医学版)》 北大核心 2025年第1期58-69,共12页
神经退行性变性疾病是一组以中枢或周围神经系统神经元的功能和结构完整性逐渐丧失为特征的神经系统疾病。这类疾病的病因复杂,致病机制及药物靶点的研究仍面临诸多难题。转运RNA(tRNA)修饰在调节密码子识别、维持分子结构稳定性以及影... 神经退行性变性疾病是一组以中枢或周围神经系统神经元的功能和结构完整性逐渐丧失为特征的神经系统疾病。这类疾病的病因复杂,致病机制及药物靶点的研究仍面临诸多难题。转运RNA(tRNA)修饰在调节密码子识别、维持分子结构稳定性以及影响tRNA衍生片段(tRF)产生等方面发挥着关键作用,对神经发育和神经系统的生理功能具有重要作用。异常的tRNA修饰与多种神经退行性变性疾病的发病机制密切相关,特别是延伸因子复合物依赖的tRNA修饰和甲基化修饰异常能导致翻译过程和tRF水平变化,进而干扰蛋白质稳态和细胞应激反应,影响神经元存活。此外,神经退行性变性疾病患者体内tRF水平也显示出显著变化,特定tRF对神经退行性变性疾病有着不同的影响。本文从tRNA表观遗传修饰的生物学功能出发,深入探讨其异常在神经退行性变性疾病中的作用,包括经典的密码子识别功能和非经典的tRF生成机制,最后讨论了tRNA修饰可以作为治疗神经退行性变性疾病的潜在靶点。 展开更多
关键词 神经退行性变性疾病 转运rna 表观遗传修饰 转运rna衍生片段 综述
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微小RNA-195-5p靶向SMAD同源物7调控转化生长因子β_(1)影响心房颤动大鼠心肌纤维化
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作者 杨爱玲 林玲 +4 位作者 申明月 后梅 苏蓉 张浒 李云飞 《中华老年心脑血管病杂志》 北大核心 2025年第1期27-32,共6页
目的探究微小RNA-195-5p(microRNA-195-5p,miR-195-5p)对心房颤动(atrial fibrillation,AF)大鼠心肌纤维化的影响与机制。方法选择雄性SD大鼠72只,随机分为对照组、AF组、阴性对照组、miR-195-5p组(miR-195-5p抑制剂)、9型重组腺相关病... 目的探究微小RNA-195-5p(microRNA-195-5p,miR-195-5p)对心房颤动(atrial fibrillation,AF)大鼠心肌纤维化的影响与机制。方法选择雄性SD大鼠72只,随机分为对照组、AF组、阴性对照组、miR-195-5p组(miR-195-5p抑制剂)、9型重组腺相关病毒(recombinant adeno-associated virus serotype 9,rAAV9)组(miR-195-5p抑制剂+rAAV9-阴性对照)、联合组[miR-195-5p抑制剂+rAAV9-小干扰RNA-SMAD同源物(SMAD homolog,Smad)]7,每组12只。除对照组外,其他组大鼠构建AF模型。给予对应干预措施后,进行心电图测试,记录AF发生率和持续时间;HE染色检测心肌组织病理变化;Masson染色检测心肌组织纤维化程度;实时荧光定量聚合酶链反应检测心肌组织miR-195-5p、Smad7mRNA表达;Western blot检测心肌组织转化生长因子β_(1)(transforming growth factor-β_(1),TGF-β_(1))、Smad2、磷酸化Smad2、Smad3、磷酸化Smad3、Smad7、Ⅰ型胶原蛋白(Collagen-Ⅰ)、Ⅲ型胶原蛋白(Collagen-Ⅲ)表达;双荧光素酶实验验证miR-195-5p对Smad7的调控作用。结果与对照组比较,AF组AF发生率(75.0%vs 0)和持续时间[(27.02±2.65)s vs 0s]、胶原容积分数[(14.47±0.89)%vs(2.12±0.35)%]、心肌组织miR-195-5p(3.27±0.21 vs 1.00±0.10)、TGF-β_(1)(0.76±0.08 vs 0.23±0.04)、Collagen-Ⅰ(0.58±0.07 vs 0.20±0.04)、Collagen-Ⅲ(0.46±0.05 vs 0.11±0.02)、磷酸化Smad2/Smad2(0.92±0.10 vs 0.37±0.05)、磷酸化Smad3/Smad3(0.65±0.06 vs 0.14±0.03)表达明显升高,Smad7mRNA(0.32±0.06 vs 1.02±0.09)和Smad7(0.19±0.03 vs 0.58±0.07)表达明显降低,差异有统计学意义(P<0.05);与AF组和阴性对照组比较,miR-195-5p组AF发生率和持续时间、胶原容积分数、心肌组织miR-195-5p、TGF-β_(1)、Collagen-Ⅰ、Collagen-Ⅲ、磷酸化Smad2/Smad2和磷酸化Smad3/Smad3表达明显降低,Smad7mRNA和蛋白表达明显升高,差异有统计学意义(P<0.05);与miR-195-5p组和rAAV9组比较,联合组AF发生率和持续时间、胶原容积分数、心肌组织TGF-β_(1)、Collagen-Ⅰ、Collagen-Ⅲ、磷酸化Smad2/Smad2和磷酸化Smad3/Smad3表达明显升高,Smad7mRNA和Smad7表达明显降低,差异有统计学意义(P<0.05)。结论下调miR-195-5p可能靶向Smad7抑制TGF-β_(1)信号传导,从而减轻AF心肌纤维化。 展开更多
关键词 心房颤动 大鼠 循环微rna 转化生长因子Β SMAD蛋白质类 心肌纤维化 微小rna-195-5p
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血清tRNA-Gly-GCC-1-1在干燥综合征诊断中的临床价值
8
作者 史波 陈菲 +2 位作者 刘文静 杨平 李智洋 《临床检验杂志》 2025年第1期25-29,共5页
目的检测并鉴定干燥综合征(SS)患者血清样本中差异表达的tRNA来源的小RNA(tsRNA)标志物,初步探究其在SS患者临床诊断中的潜在应用价值。方法收集南京鼓楼医院风湿科确诊为SS的患者以及年龄、性别相匹配的健康人对照血清样本进行小RNA测... 目的检测并鉴定干燥综合征(SS)患者血清样本中差异表达的tRNA来源的小RNA(tsRNA)标志物,初步探究其在SS患者临床诊断中的潜在应用价值。方法收集南京鼓楼医院风湿科确诊为SS的患者以及年龄、性别相匹配的健康人对照血清样本进行小RNA测序,筛选出差异表达的tsRNA。使用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)在2组研究对象血清样本中进行验证。采用ROC曲线评估其诊断SS的临床效能。使用KEGG及GO富集分析预测tRNA-Gly-GCC-1-1在SS发生、发展过程中的潜在机制。结果与健康人对照组[13.34(10.45,18.74)fmol/L]相比,SS组血清样本中tRNA-Gly-GCC-1-1[8.82(7.26,12.20)fmol/L]水平显著降低(P<0.0001),其区分SS患者及健康人对照的ROC曲线下面积(AUC^(ROC))为0.766(95%CI:0.671~0.861),当cut-off值为9.97 fmol/L时,其敏感性为83.33%,特异性为64.58%:生物信息分析提示血清tRNA-Gly-GCC-1-1参与了PI3K-Akt等信号通路的调控。结论tRNA-Gly-GCC-1-1在SS患者血清样本中呈显著低表达,具有潜在辅助诊断SS的临床应用价值。 展开更多
关键词 干燥综合征 rna测序 trna来源的小rna 生物学标志物
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精神分裂症患者外周血中差异表达circRNA、miRNA、mRNA筛选及核心竞争性内源RNA网络构建
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作者 王艺梦 邰旭光 +3 位作者 李小龙 刘鹏 王越 祁冬冬 《山东医药》 CAS 2024年第33期30-34,共5页
目的筛选精神分裂症患者外周血中差异表达的circRNA、miRNA、mRNA,并构建核心竞争性内源RNA(ceRNA)网络,解析精神分裂症发生发展的分子机制。方法精神分裂症患者6例记为精神分裂症组,同期体检健康的人群4例记为健康对照组。采集两组研... 目的筛选精神分裂症患者外周血中差异表达的circRNA、miRNA、mRNA,并构建核心竞争性内源RNA(ceRNA)网络,解析精神分裂症发生发展的分子机制。方法精神分裂症患者6例记为精神分裂症组,同期体检健康的人群4例记为健康对照组。采集两组研究对象的外周血,提取总RNA后构建cDNA文库并进行高通量测序,采用R软件筛选精神分裂症患者外周血中差异表达circRNA、miRNA、mRNA。采用miRanda和qTar数据库共同预测与差异表达miRNA相互作用的circRNA和mRNA,与差异表达的circRNA、mRNA取交集后,采用R软件构建差异表达的ceRNA网络。基于DAVID数据库对精神分裂症患者差异表达ceRNA网络中差异mRNA进行GO和KEGG富集分析。采用string数据库构建精神分裂症患者差异表达ceRNA网络中差异mRNA之间的PPI网络,选用cytoscape软件中cytoHubba插件筛选影响精神分裂症发生发展的核心mRNA,选择与核心mRNA存在相互作用关系的miRNA和circRNA构建精神分裂症患者外周血中差异表达的核心ceRNA网络。结果相比健康对照组,精神分裂症组患者外周血中差异表达circRNA、miRNA、mRNA分别为31、213、2624个。构建了由差异表达的5个circRNA、4个miRNA和57个mRNA组成的ceRNA网络。精神分裂症患者差异表达ceRNA网络中mRNA主要参与化学刺激的感官知觉、多细胞生物生长的负调控等生物过程,涉及泛素-泛素连接酶活性、鸟苷酸结合、酶结合等分子功能,以及细胞质、肌动蛋白细胞骨架、轴突末端等细胞成分,ceRNA网络中mRNA显著富集于NF-κB信号通路、PI3K-Akt信号通路、Ras信号通路、泛素介导的蛋白水解等代谢通路。构建的精神分裂症患者差异表达ceRNA网络中mRNA PPI网络共包含23个节点和22条边,筛选获得影响精神分裂症发生发展的2个核心mRNA为BRCA1、GNAS。构建的精神分裂症患者外周血中差异表达的核心ceRNA网络包含5个节点和4条边。5个节点中包含2个核心mRNA:BRCA1、GNAS,1个miRNA:hsa-miR-502-5p,2个circRNA:hsa_circ_0001423、hsa_circ_0008494。4条边分别为hsa_circ_0001423/hsa-miR-502-5p/BRCA1、hsa_circ_0001423/hsa-miR-502-5p/GNAS、hsa_circ_0008494/hsa-miR-502-5p/BRCA1和hsa_circ_0008494/hsa-miR-502-5p/GNAS。结论与健康对照人群相比,精神分裂症患者外周血中有差异表达的circRNA 31个、miRNA 213个、mRNA 2624个,最终构建了包含5个节点和4条边的核心ceRNA网络。 展开更多
关键词 精神分裂症 circrna-mirna-mrna网络 竞争性内源rna网络 环状rna 微小rna 信使rna
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综合scRNA-Seq和Bulk RNA-Seq技术建立与肝癌CD8^(+)T细胞相关的预后模型
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作者 刘洋 池晴佳 田菲菲 《西安交通大学学报(医学版)》 北大核心 2025年第1期169-177,共9页
目的 通过单细胞测序(scRNA-Seq)和Bulk转录组测序(Bulk RNA-Seq)技术鉴定出与肝癌CD8^(+)T细胞相关的生物标志物并建立预后模型。方法 从GEO数据库中下载肝癌的单细胞数据集,通过scRNA-Seq技术提取患者与对照组间CD8^(+)T细胞的差异表... 目的 通过单细胞测序(scRNA-Seq)和Bulk转录组测序(Bulk RNA-Seq)技术鉴定出与肝癌CD8^(+)T细胞相关的生物标志物并建立预后模型。方法 从GEO数据库中下载肝癌的单细胞数据集,通过scRNA-Seq技术提取患者与对照组间CD8^(+)T细胞的差异表达基因。从TCGA数据库中下载肝癌的基因表达谱数据及临床数据,使用CIBERSORT算法、WGCNA技术筛选出与CD8^(+)T细胞具有相关性的模块基因。将差异基因与模块基因取交集基因并进行GO、KEGG分析,应用单因素COX回归分析和LASSO算法建立预后模型。通过K-M曲线和ROC曲线对模型在内、外部数据集中的预测效果进行验证。根据风险评分的中位值划分高低风险组,对高低风险组间的浸润性免疫细胞分布情况和肿瘤突变情况进行分析。结果 构建出具有9个基因的预后模型,K-M曲线及ROC曲线表明模型在内、外部数据集中均具有良好的预测能力,在高低风险组中,浸润性免疫细胞的分布情况和基因突变情况均存在显著差异。结论 本研究结合scRNA-Seq和Bulk RNA-Seq技术利用生物信息学方法开发出了一种基于CD8^(+)T细胞的新型预后模型,为肝癌患者的预后改善和生存预测提供了可靠的理论依据。 展开更多
关键词 肝癌 单细胞测序(scrna-Seq) Bulk转录组测序(Bulk rna-Seq) CD8^(+)T细胞 预后模型
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冷冻电镜结构揭示RNA修饰对核糖体组装和翻译的影响
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作者 张云阳 高宁 《电子显微学报》 北大核心 2025年第1期115-123,共9页
RNA修饰广泛存在于所有主要RNA类别(包括信使RNA、转运RNA和核糖体RNA)中,核糖体RNA(ribosomal RNA,rRNA)因其刚性的结构,为使用冷冻电镜(Cryogenic electron microscopy,Cryo-EM)技术探讨RNA修饰的结构与功能之间的关系提供了一个理想... RNA修饰广泛存在于所有主要RNA类别(包括信使RNA、转运RNA和核糖体RNA)中,核糖体RNA(ribosomal RNA,rRNA)因其刚性的结构,为使用冷冻电镜(Cryogenic electron microscopy,Cryo-EM)技术探讨RNA修饰的结构与功能之间的关系提供了一个理想的平台。rRNA的修饰主要包括甲基化修饰和假尿嘧啶化修饰,这些修饰不仅扩展了rRNA的化学和拓扑属性,还显著影响核糖体亚基的组装和翻译的效率。特别是在肽基转移酶中心(Peptidyl transferase center,PTC)的A-loop区域,rRNA修饰通过影响转运RNA(transfer RNA,tRNA)的选择和肽链的延伸,显著提高蛋白质合成效率。冷冻电镜结构分析在揭示RNA修饰对核糖体组装和翻译的影响方面发挥了重要作用。本综述基于生物化学数据和冷冻电镜结构,详细探讨了rRNA修饰的生物学重要性,并特别强调了A-loop在PTC中的功能和其修饰对核糖体性能的影响。研究表明,A-loop的修饰在原核细胞、真核细胞中显示出高度的保守性,这反映了其在确保蛋白质正确延伸中的关键作用。rRNA的修饰主要由小核仁RNA(small nucleolar RNA,snoRNA)介导,但也包括由独立的甲基转移酶(如RrmJ/Spb1家族)执行的2′-O-甲基化,RrmJ/Spb1家族蛋白识别组装中的核糖体并对A-loop进行修饰,成为核糖体组装过程中关键的质量控制检查点,本综述还分析了RrmJ/Spb1功能缺失或者突变对核糖体组装产生的严重影响。 展开更多
关键词 冷冻电镜 rrna修饰 rrna甲基化 肽基转移酶中心(PTC) A⁃loop 核糖体组装 翻译效率
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TRISCO是一种能对机体整个大脑进行RNA分析的新型成像方法
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《生物医学工程与临床》 2025年第1期6-6,共1页
据Kanatani S[Science,2024,386(6724):907-915.]报道,瑞典卡罗琳学院等机构的研究人员通过研究开发出了一种新型显微镜方法,其能对完整的小鼠大脑在细胞分辨率下进行详细的三维(3D)RNA分析,这种称之为TRISCO的新方法或有望改变人们对... 据Kanatani S[Science,2024,386(6724):907-915.]报道,瑞典卡罗琳学院等机构的研究人员通过研究开发出了一种新型显微镜方法,其能对完整的小鼠大脑在细胞分辨率下进行详细的三维(3D)RNA分析,这种称之为TRISCO的新方法或有望改变人们对大脑功能的理解,无论是在正常状态下还是在疾病状态下。对RNA分析的最新研究进展加深了研究人员对生物学组织中细胞状态的理解,然而,在整合RNA表达数据与跨器官空间背景方面之间仍然存在着很大的差距,这主要是由于在完整组织体积内进行RNA检测相关的挑战所致。 展开更多
关键词 rna分析 疾病状态 rna表达 大脑功能 细胞状态 成像方法 最新研究进展 空间背景
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高效液相色谱-串联质谱法分析游离RNA修饰核苷的研究进展
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作者 张绿叶 张维冰 汪海林 《色谱》 CAS 北大核心 2025年第1期3-12,共10页
核糖核苷酸(RNA)的转录后修饰在基因表达调控中发挥重要作用,而RNA在降解与再合成过程中产生大量游离核苷,包含未修饰的基础核苷和多种类型的修饰核苷。修饰核苷无法被进一步分解,在胞内积累,或在转运蛋白作用下运输到胞外环境,直到被... 核糖核苷酸(RNA)的转录后修饰在基因表达调控中发挥重要作用,而RNA在降解与再合成过程中产生大量游离核苷,包含未修饰的基础核苷和多种类型的修饰核苷。修饰核苷无法被进一步分解,在胞内积累,或在转运蛋白作用下运输到胞外环境,直到被机体代谢,并在过程中发挥信号分子的作用。对生物样本中各级代谢物中修饰核苷的准确鉴定与定量能够为RNA降解和游离修饰核苷排泄调控提供重要信息,协助研究其生物学功能和发现潜在的临床应用。例如,小分子修饰核苷在应激反应和疾病状态下作为信号分子调控机体的应答;病理状态下体液和组织中发生特异性变化的修饰核苷可作为生物标志物,为疾病的诊断和治疗提供信息。高效液相色谱-串联质谱(HPLC-MS/MS)技术作为一种高灵敏度、高选择性、快速高效的分析工具,已在游离修饰核苷分析中展现出重要的应用价值。但HPLC-MS/MS准确分析游离修饰核苷仍面临一些挑战,如生物样品成分的复杂性,多种类目标物的化学性质差异,多种目标物的含量呈数量级的差异,以及众多的修饰核苷中同分异构体的干扰等。这些因素使得开发同时定量多种核苷的HPLC-MS/MS方法难度增加。本综述介绍了内源性游离RNA修饰核苷的来源及检测方法,概述了HPLC-MS/MS技术在内源性核苷分析中的样品前处理、色谱分离、质谱检测模式和定量方法开发等方面的研究进展,并综述了游离RNA修饰核苷的生物学功能、调控机制研究和作为疾病潜在分子标志物等的应用。 展开更多
关键词 rna修饰 代谢物分析 高效液相色谱-串联质谱 修饰核苷
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lncRNA NEAT1降表达人喉鳞状细胞癌细胞增殖凋亡变化及与miR-214靶向关系
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作者 罗德艳 冯俊 +2 位作者 彭涛 唐一萍 杨久梅 《山东医药》 CAS 2024年第18期26-30,共5页
目的观察长链非编码RNA(lncRNA)核富集转录体1(NEAT1)降表达的人喉鳞状细胞癌(LSCC)细胞增殖凋亡变化,探讨其与微小RNA-214(miR-214)的靶向关系。方法采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)法检测人永生化表皮细胞Hacat和人LSCC细胞系(FD-LSC-1... 目的观察长链非编码RNA(lncRNA)核富集转录体1(NEAT1)降表达的人喉鳞状细胞癌(LSCC)细胞增殖凋亡变化,探讨其与微小RNA-214(miR-214)的靶向关系。方法采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)法检测人永生化表皮细胞Hacat和人LSCC细胞系(FD-LSC-1、Hep-2、TU177)中lncRNA NEAT1、miR-214,选择TU177细胞为受试细胞。取对数生长期TU177细胞,分为甲、乙组,分别转染si-lncRNA NEAT1(敲低lncRNA NEAT1表达)、si-NC(乱序无意义序列),培养至24 h时采用CCK8法观察两组细胞增殖情况、采用平板克隆形成实验观察两组细胞克隆形成情况、采用流式细胞术观察两组细胞周期和细胞凋亡情况、采用RT-qPCR法检测两组细胞lncRNA NEAT1及miR-214。另取对数生长期TU177细胞,分为一二三四组,一组顺序转染WT-lncRNA NEAT1、miR-214 mimic,二组顺序转染WT-lncRNA NEAT1、miR-NC,三组顺序转染MUT-lncRNA NEAT1、miR-214 mimics,四组顺序转染MUT-lncRNA NEAT1、miR-NC。采用双荧光素酶报告基因实验验证lncRNA NEAT1及miR-214的靶向关系。结果与乙组相比,培养24、48、72 h时甲组TU177细胞OD值低,培养14 d时甲组TU177细胞克隆形成数少,甲组TU177细胞G0/G1期细胞比例高、S期细胞比例低,细胞凋亡率高(P均<0.05);与乙组相比,转染24 h时甲组TU177细胞lncRNA NEAT1相对表达量低、miR-214相对表达量高(P均<0.05)。培养48 h时一、二、三、四组TU177细胞细胞荧光素酶活性分别为0.63±0.08、0.99±0.01、1.02±0.02、0.98±0.03,与二组相比,一组细胞荧光素酶活性低(P<0.05)。结论敲低lncRNA NEAT1表达可抑制TU177细胞的增殖和克隆,阻滞细胞周期于G0/G1期,并促进细胞的凋亡。TU177细胞中lncRNA NEAT1与miR-214靶向相关。lncRNA NEAT1可能通过与miR-214靶向结合,抑制TU177细胞的增殖克隆,阻滞细胞周期于G0/G1期,促进细胞的凋亡。 展开更多
关键词 长链非编码rna 长链非编码rna核富集转录体1 微小rna-214 喉鳞状细胞癌 细胞增殖 细胞凋亡 细胞克隆 细胞周期
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lncRNA作为肝细胞癌生物标志物的研究进展
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作者 王运踊 鲁晓航 +3 位作者 曾阳玲 李屏 林洪升 李明芬 《中国医药导报》 2025年第1期38-42,58,共6页
肝细胞癌是全球最常见的恶性肿瘤之一,特点为高发病率、高致死率和高复发率,导致患者预后不佳。尽管近年来免疫治疗的进展为肝细胞癌治疗带来变革,但有限的标志物检测和低临床反应率仍是亟须解决的关键问题。长链非编码RNA(lncRNA)参与... 肝细胞癌是全球最常见的恶性肿瘤之一,特点为高发病率、高致死率和高复发率,导致患者预后不佳。尽管近年来免疫治疗的进展为肝细胞癌治疗带来变革,但有限的标志物检测和低临床反应率仍是亟须解决的关键问题。长链非编码RNA(lncRNA)参与调控肝癌细胞增殖、血管生成、转移、凋亡、自噬、铁死亡,以及免疫逃逸等多个生物学活动,其在肝细胞癌发生和发展中起重要作用。本文旨在综述lncRNA与肝细胞癌调控机制的研究进展,探讨其作为诊断和治疗评估相关标志物的潜力,并讨论当前研究挑战及未来发展方向,以期为肝细胞癌的诊断和治疗提供新思路。 展开更多
关键词 肝细胞癌 长链非编码rna 生物标志物 早期诊断 免疫治疗
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长链非编码RNA在继发性脊髓损伤中的作用及中医药干预的研究进展
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作者 许多芳 张彦军 +3 位作者 郭铁峰 李家明 江朔轩 刘晏东 《西部中医药》 2025年第1期99-105,共7页
从长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)与脊髓损伤发生发展的相关性、lncRNA与脊髓损伤治疗的相关性及中医药对脊髓损伤-lncRNA的干预等方面阐述了lncRNA与脊髓损伤相关性及中药干预机制的研究进展,指出lncRNA在脊髓损伤中存在差... 从长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)与脊髓损伤发生发展的相关性、lncRNA与脊髓损伤治疗的相关性及中医药对脊髓损伤-lncRNA的干预等方面阐述了lncRNA与脊髓损伤相关性及中药干预机制的研究进展,指出lncRNA在脊髓损伤中存在差异性表达并在脊髓损伤的发展及治疗过程中有着重要的作用,可以通过调控lncRNA在脊髓损伤过程中的表达,为脊髓损伤找到潜在的治疗靶点,以期为脊髓损伤的防治提供新的参考方向。 展开更多
关键词 脊髓损伤 长链非编码rna 中医药 研究进展
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非编码RNA在传染性法氏囊病病毒感染中的研究进展 被引量:1
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作者 刘伟烨 黄雪伟 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期1488-1498,共11页
传染性法氏囊病(infectious bursal disease, IBD)是由传染性法氏囊病病毒(IBD virus, IBDV)引起的急性、高度传染性和免疫抑制性禽类疾病。近年来,随着新型变异毒株的出现,IBDV仍然威胁着全球家禽养殖业的健康发展,宿主和IBDV之间的“... 传染性法氏囊病(infectious bursal disease, IBD)是由传染性法氏囊病病毒(IBD virus, IBDV)引起的急性、高度传染性和免疫抑制性禽类疾病。近年来,随着新型变异毒株的出现,IBDV仍然威胁着全球家禽养殖业的健康发展,宿主和IBDV之间的“战役”似乎永不停息。因此,迫切需要制定一种更全面和更有效的策略来控制该疾病,而深入了解IBDV与宿主之间的相互作用,将有助于开发新型疫苗。非编码RNA(non-coding RNA,ncRNAs)是一类丰富的不编码蛋白质的RNA分子,其中包括微小RNA(microRNAs, miRNAs)、长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNAs)和环状RNA(circular RNA,circRNAs)。近年来,研究发现ncRNAs广泛参与IBDV与宿主的相互作用过程,在IBDV感染中发挥重要的调控作用。本文阐述了宿主miRNAs、lncRNAs和circRNAs在IBDV感染中的作用,以期为IBDV的感染与致病机制研究提供理论参考和新思路。 展开更多
关键词 传染性法氏囊病病毒 非编码rna MIrna lncrna circrna
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基于非编码RNA的针灸基础研究进展
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作者 魏荧 熊坚 +8 位作者 李萧 胡金群 赵燚 孙雨欣 凌发样 刘渝 杨丽源 梁繁荣 齐文川 《中国中医药信息杂志》 2025年第3期174-179,共6页
针灸疗法是我国具有原创性优势的治疗保健方法。随着表观遗传学和系统生物学技术的迅速发展,非编码RNA(ncRNA)相关研究在针灸领域不断取得突破。本文整理ncRNA相关的针灸基础研究文献,对微小RNA(miRNA)、长链非编码RNA(lncRNA)和环状RNA... 针灸疗法是我国具有原创性优势的治疗保健方法。随着表观遗传学和系统生物学技术的迅速发展,非编码RNA(ncRNA)相关研究在针灸领域不断取得突破。本文整理ncRNA相关的针灸基础研究文献,对微小RNA(miRNA)、长链非编码RNA(lncRNA)和环状RNA(circRNA)相关研究分系统进行综述,ncRNA广泛参与机体的生长、发育、生殖及各疾病的发生发展过程,与针灸疗法多层次、多途径、多靶点的作用网络相契合。以ncRNA为切入点深入探索针灸作用机制,不仅有利于促进针灸效应新靶点的挖掘,还能揭示针灸效应分子的表观遗传调控轴,为疾病的临床诊疗和疗效评估提供思路和方法。 展开更多
关键词 非编码rna 针灸 分子机制 表观遗传学 系统生物学 综述
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牙周病与类风湿关节炎的竞争性内源RNA调控网络构建及免疫相关性分析
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作者 赵晓雪 张欣然 张婷婷 《山东医药》 2025年第2期25-29,共5页
目的构建牙周病(PD)与类风湿关节炎(RA)的竞争性内源RNA(ceRNA)调控网络,并分析二者的免疫相关性。方法从美国国立生物技术信息中心建立的基因表达综合数据库获取PD与RA的数据集,通过筛选两疾病的差异基因、加权基因共表达网络分析及免... 目的构建牙周病(PD)与类风湿关节炎(RA)的竞争性内源RNA(ceRNA)调控网络,并分析二者的免疫相关性。方法从美国国立生物技术信息中心建立的基因表达综合数据库获取PD与RA的数据集,通过筛选两疾病的差异基因、加权基因共表达网络分析及免疫数据集取交集获得关键基因。用受试者工作特征曲线(ROC)、基因相关性分析、单样本基因集富集分析对关键基因进行功能富集及外部数据集验证。用关键基因及数据库预测靶基因构建ceRNA调控网络,用免疫浸润分析网站分析PD与RA的免疫相关性。结果共筛选出4个关键基因(白细胞介素10受体A、RAS相关的C3肉毒毒素底物2、布鲁顿酪氨酸激酶、F2型跨膜蛋白信号淋巴细胞活化分子家族受体),对PD与RA诊断价值较高,且基因间具有高相关性。4个关键基因参与了PD与RA的不同通路。4个关键基因和2个关键基因的靶miRNA(hsa-miR-1271-5p、hsa-let-7e-5p),分别获得9个PD的DElncRNA、16个RA的DElncRNA,构建两种疾病的ceRNA网络。PD、RA患者与正常对照者免疫细胞比例存在差异。PD患者外周血浆细胞比例较正常对照者高。而PD患者表面表达CD8亚群的细胞毒性T淋巴细胞(CD8+T淋巴细胞)、活化的自然杀伤细胞(NK细胞)、M2型巨噬细胞、静息的树突状细胞、静息的肥大细胞比例低。与正常对照者比较,RA患者滑膜中浆细胞、γδT淋巴细胞、M1型巨噬细胞的比例高。PD患者静息状态下的树突状细胞与浆细胞呈负相关;RA患者中静息状态下肥大细胞与活化肥大细胞呈负相关,M1型巨噬细胞与单核细胞呈负相关,γδT淋巴细胞与单核细胞呈负相关,M1型巨噬细胞与γδT淋巴细胞呈正相关。结论成功筛选出4个关键基因并分别构建了PD与RA的ceRNA调控网络,PD与RA有部分免疫应答机制相同。 展开更多
关键词 牙周病 类风湿关节炎 竞争性内源rna 基因调控网络 免疫浸润
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口腔鳞状细胞癌预后相关的长链非编码RNA筛选及验证
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作者 刘絮影 李锦存 +3 位作者 翟堃 胡晨 董文 马坚 《口腔医学研究》 北大核心 2025年第2期109-117,共9页
目的:基于口腔癌在线数据库鉴定与口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)预后相关的长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)和mRNA,构建ceRNA网络,分析其在OSCC发生发展中的作用。方法:从癌症基因组图谱(the cancer ge... 目的:基于口腔癌在线数据库鉴定与口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)预后相关的长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)和mRNA,构建ceRNA网络,分析其在OSCC发生发展中的作用。方法:从癌症基因组图谱(the cancer genome atlas program,TCGA)和基因表达综合数据库(gene expression omnibus database,GEO)中筛选出TCGA-OSCC、GSE23558和GSE30784数据集,进行表达谱分析,筛选出差异表达lncRNA和mRNA,并进行生存分析、基因本体论(Gene Ontology,GO)和京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析,确定其与OSCC预后的相关性。利用starBase、miRTarBase数据库预测关键lncRNA及mRNA的共同靶标miRNA,以此构建竞争性内源性RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)网络。通过实时荧光定量聚合酶链反应(real-time quantitative PCR,qRT-PCR)检测这些关键lncRNA在OSCC细胞系和肿瘤组织中表达水平。结果:表达谱分析鉴定出23个差异表达lncRNA,其中有6个lncRNA与OSCC患者预后相关;mRNA的表达分析鉴定出282个差异表达mRNA,主要富集在三磷酸鸟苷(guanosine triphosphate,GTP)酶激活剂活性、核苷酸结合寡聚化域(nucletide-binding oligomerization domain,NOD)样受体等信号通路,其中10个差异表达的mRNA与OSCC预后相关。ceRNA网络构建了包括6个lncRNA、10个mRNA和靶向预测的26个miRNA分子网络。qRT-PCR结果显示包含LINC01980在内的5个lncRNA在OSCC细胞中高表达,而MIR99AHG低表达。在OSCC组织中,LINC01980表达水平明显升高,而MIR99AHG表达水平降低。结论:本研究筛选的LINC01980和MIR99AHG与OSCC进展和预后相关,可作为OSCC的生物学标志物进一步探讨。 展开更多
关键词 口腔鳞状细胞癌 长链非编码rna 预后 LINC01980 MIR99AHG
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