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基于PCR的水稻候选RGA标记检验和评估
被引量：
3
1
作者
肖天霞
赵向前
+2 位作者
汪旭升
吴为人
朱军
《浙江大学学报（农业与生命科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第1期51-55,共5页
在生物信息学方法开发的基于e-PCR、共显性的402个水稻候选RGA标记的基础上,随机挑选40对引物,分别以水稻品种Nipponbare和93-11的DNA为模板进行PCR扩增验证.得到清晰条带占所用标记总数的87.5%(35个标记),其中31对引物为共显性标记,4...
在生物信息学方法开发的基于e-PCR、共显性的402个水稻候选RGA标记的基础上,随机挑选40对引物,分别以水稻品种Nipponbare和93-11的DNA为模板进行PCR扩增验证.得到清晰条带占所用标记总数的87.5%(35个标记),其中31对引物为共显性标记,4对引物为显性标记.用这31对RGA引物在24个水稻品种中进行PCR扩增,结果表明标记具有很好的通用性和特异性.RGA引物平均标记多态性指标(PIC)值为0.46,标记具有较好的多态性.
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关键词
水稻
rga
标记
PCR
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职称材料
小麦抗白粉病基因Pm4b的RGA分析
被引量：
3
2
作者
胡楠
伊艳杰
+2 位作者
刘红彦
柴春月
刘新涛
《安徽农业科学》
CAS
北大核心
2007年第21期6379-6380,6430,共3页
为克隆抗性基因和发展Pm4b的特异分子标记奠定基础。利用10对RGA引物,对小麦抗白粉病基因的一些载体品种(系)进行扩增,将引物对R11F/R11R从Pm4b基因的载体品种VPM中扩增出的稳定多态性条带回收、克隆、测序,获得与小麦Pm4b基因的相关抗...
为克隆抗性基因和发展Pm4b的特异分子标记奠定基础。利用10对RGA引物,对小麦抗白粉病基因的一些载体品种(系)进行扩增,将引物对R11F/R11R从Pm4b基因的载体品种VPM中扩增出的稳定多态性条带回收、克隆、测序,获得与小麦Pm4b基因的相关抗病基因的同源片段,并对不同的小麦Pm基因载体品系作了检测分析。该稳定多态性条带全长1 321 bp。序列分析表明这个片段属于RGA类序列。用该标记检测小麦不同Pm基因载体品种(系),发现该多态性片段仅出现在Pm4b基因载体品种中。该研究可为分离抗性基因和发展Pm4b的特异分子标记奠定基础。
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关键词
小麦
白粉病
抗病基因
rga
标记
序列分析
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职称材料
花生RGA-SSCP实验条件的优化
被引量：
1
3
作者
漆燕
李双铃
+6 位作者
袁美
王辉
任艳
石延茂
崔富华
李加纳
禹山林
《山东农业科学》
2010年第6期1-4,9,共5页
单链构象多态性(SSCP)技术是一种简便、灵敏的多态性检测方法,近年在植物研究中得到了较多应用。为了检测花生品种间抗病基因同源序列(RGA)的单核苷酸差异,对影响花生RGA-SSCP的电泳温度、电压、胶浓度、交联度、变性剂等因素进行了优...
单链构象多态性(SSCP)技术是一种简便、灵敏的多态性检测方法,近年在植物研究中得到了较多应用。为了检测花生品种间抗病基因同源序列(RGA)的单核苷酸差异,对影响花生RGA-SSCP的电泳温度、电压、胶浓度、交联度、变性剂等因素进行了优化。结果表明,碱变性后的PCR产物(PCR产物与碱变性剂比例1∶2)在不加甘油的8%非变性聚丙烯酰胺凝胶(交联度为29∶1)、1×TBE电泳缓冲液、恒温4℃和600V条件下电泳5 h为最佳优化组合。用上述优化方法分析了抗、感北方根结线虫病的亲本及F2群体部分单株,获得了电泳条带细而清晰的SSCP图。该体系的建立对RGA-SSCP标记用于花生基因定位、遗传图谱构建、标记辅助选择等具有重要意义。
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关键词
花生
rga
—SSCP
优化
分子标记
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职称材料
题名
基于PCR的水稻候选RGA标记检验和评估
被引量：
3
1
作者
肖天霞
赵向前
汪旭升
吴为人
朱军
机构
浙江大学农业与生物技术学院
出处
《浙江大学学报（农业与生命科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第1期51-55,共5页
基金
国家自然科学基金资助项目(30470916).
文摘
在生物信息学方法开发的基于e-PCR、共显性的402个水稻候选RGA标记的基础上,随机挑选40对引物,分别以水稻品种Nipponbare和93-11的DNA为模板进行PCR扩增验证.得到清晰条带占所用标记总数的87.5%(35个标记),其中31对引物为共显性标记,4对引物为显性标记.用这31对RGA引物在24个水稻品种中进行PCR扩增,结果表明标记具有很好的通用性和特异性.RGA引物平均标记多态性指标(PIC)值为0.46,标记具有较好的多态性.
关键词
水稻
rga
标记
PCR
Keywords
rice
rga marker
s
PCR
分类号
Q7 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
小麦抗白粉病基因Pm4b的RGA分析
被引量：
3
2
作者
胡楠
伊艳杰
刘红彦
柴春月
刘新涛
机构
河南省农科院植物保护研究所
出处
《安徽农业科学》
CAS
北大核心
2007年第21期6379-6380,6430,共3页
基金
河南省杰出青年科学基金项目(04120001400)
文摘
为克隆抗性基因和发展Pm4b的特异分子标记奠定基础。利用10对RGA引物,对小麦抗白粉病基因的一些载体品种(系)进行扩增,将引物对R11F/R11R从Pm4b基因的载体品种VPM中扩增出的稳定多态性条带回收、克隆、测序,获得与小麦Pm4b基因的相关抗病基因的同源片段,并对不同的小麦Pm基因载体品系作了检测分析。该稳定多态性条带全长1 321 bp。序列分析表明这个片段属于RGA类序列。用该标记检测小麦不同Pm基因载体品种(系),发现该多态性片段仅出现在Pm4b基因载体品种中。该研究可为分离抗性基因和发展Pm4b的特异分子标记奠定基础。
关键词
小麦
白粉病
抗病基因
rga
标记
序列分析
Keywords
Wheat
Powdery mildew
Disease resistant gene
rga marker
Sequence analysis
分类号
S512.1 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
花生RGA-SSCP实验条件的优化
被引量：
1
3
作者
漆燕
李双铃
袁美
王辉
任艳
石延茂
崔富华
李加纳
禹山林
机构
山东省花生研究所/国家花生工程技术研究中心
南充市农业科学研究所
西南大学农学与生物科技学院
出处
《山东农业科学》
2010年第6期1-4,9,共5页
基金
国家自然科学基金(30700509)
青岛科技发展计划(08-1-3-23-jch)
+1 种基金
国家"863"计划(2006AA100106)
山东省农业科学院创新基金(2007YCX013)
文摘
单链构象多态性(SSCP)技术是一种简便、灵敏的多态性检测方法,近年在植物研究中得到了较多应用。为了检测花生品种间抗病基因同源序列(RGA)的单核苷酸差异,对影响花生RGA-SSCP的电泳温度、电压、胶浓度、交联度、变性剂等因素进行了优化。结果表明,碱变性后的PCR产物(PCR产物与碱变性剂比例1∶2)在不加甘油的8%非变性聚丙烯酰胺凝胶(交联度为29∶1)、1×TBE电泳缓冲液、恒温4℃和600V条件下电泳5 h为最佳优化组合。用上述优化方法分析了抗、感北方根结线虫病的亲本及F2群体部分单株,获得了电泳条带细而清晰的SSCP图。该体系的建立对RGA-SSCP标记用于花生基因定位、遗传图谱构建、标记辅助选择等具有重要意义。
关键词
花生
rga
—SSCP
优化
分子标记
Keywords
Peanut （Arachis hypogaea L. ）
rga
-SSCP
Optimization
Molecular
marker
分类号
S565.2 [农业科学—作物学]
Q503 [生物学—生物化学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于PCR的水稻候选RGA标记检验和评估
肖天霞
赵向前
汪旭升
吴为人
朱军
《浙江大学学报（农业与生命科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2007
3
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
小麦抗白粉病基因Pm4b的RGA分析
胡楠
伊艳杰
刘红彦
柴春月
刘新涛
《安徽农业科学》
CAS
北大核心
2007
3
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
花生RGA-SSCP实验条件的优化
漆燕
李双铃
袁美
王辉
任艳
石延茂
崔富华
李加纳
禹山林
《山东农业科学》
2010
1
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职称材料
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