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利用RAPD-PCR方法鉴定我国烟粉虱的生物型(英文) 被引量:52
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作者 邱宝利 任顺祥 +1 位作者 温硕洋 Nasser S.MANDOUR 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第5期605-608,共4页
收集了国内北京、山东、广东和海南等 14个省市 2 3个地区的蔬菜、园林花卉和杂草上的 2 3个烟粉虱Bemisiatabaci(Gennadius)种群 ,根据报道合成了一个随机引物H1 6 ,运用RAPD PCR技术对所收集的烟粉虱种群进行了生物型鉴定。结果表明在... 收集了国内北京、山东、广东和海南等 14个省市 2 3个地区的蔬菜、园林花卉和杂草上的 2 3个烟粉虱Bemisiatabaci(Gennadius)种群 ,根据报道合成了一个随机引物H1 6 ,运用RAPD PCR技术对所收集的烟粉虱种群进行了生物型鉴定。结果表明在 2 3个烟粉虱种群中 ,有 17个种群同属于危害严重的“B生物型” ,这些种群主要分布在交通便利的城市或沿海地区 ,而非B生物型则主要分布在交通不便的山区或内陆。 展开更多
关键词 烟粉虱 生物型 鉴定 rapdpcr 中国
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猕猴桃模板DNA的提取及RAPD-PCR最佳反应体系的建立 被引量:23
2
作者 陈万秋 李思光 +1 位作者 罗玉萍 陈少风 《生物技术通报》 CAS CSCD 2003年第3期40-43,共4页
以改良CTAB法从猕猴桃叶片中制备模板DNA ,优化了PCR热循环参数 ,建立了RAPD PCR扩增的最佳反应体系。实验结果表明 ,CTAB提取液中EDTA组分的浓度对模板提取影响很大 ,其最适浓度为 80mmol/L ;用异丙醇沉淀后不经乙醇洗涤纯化的DNA不会... 以改良CTAB法从猕猴桃叶片中制备模板DNA ,优化了PCR热循环参数 ,建立了RAPD PCR扩增的最佳反应体系。实验结果表明 ,CTAB提取液中EDTA组分的浓度对模板提取影响很大 ,其最适浓度为 80mmol/L ;用异丙醇沉淀后不经乙醇洗涤纯化的DNA不会影响扩增效果。PCR热循环参数为 :94℃预变性 5min ;94℃变性 1min ,37℃退火 1min ,72℃延伸 2min ,循环 4 0次 ;最后在 72℃延伸 6min。 展开更多
关键词 猕猴桃 模板DNA 提取 rapd-pcr 最佳反应体系
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RAPD-PCR对梨属植物品种鉴定的研究 被引量:13
3
作者 马兵钢 牛建新 +2 位作者 潘立忠 鲁晓燕 冯建荣 《西北农业学报》 CAS CSCD 2004年第1期84-88,共5页
用RAPD-PCR技术分析鉴定了梨属的18份品种材料(包括不同品种、杂交种和芽变种材料)。从OP系列8组共160个10碱基随机引物中,筛选出12种能很好地用于梨品种鉴定的引物。
关键词 rapd-pcr 梨属 品种鉴定 分子标记
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利用正交设计优化兴安落叶松RAPD-PCR反应体系 被引量:11
4
作者 李雪峰 张含国 +1 位作者 贯春雨 张瑶 《植物研究》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期80-85,共6页
以兴安落叶松针叶DNA为模板,对影响落叶松RAPD-PCR扩增的重要参数进行了优化试验,以期建立兴安落叶松RAPD-PCR反应的最佳体系。通过采用正交设计L16(45)对兴安落叶松RAPD-PCR反应的5因素(Taq酶、Mg2+、dNTP、模板DNA、引物)在4个水平上... 以兴安落叶松针叶DNA为模板,对影响落叶松RAPD-PCR扩增的重要参数进行了优化试验,以期建立兴安落叶松RAPD-PCR反应的最佳体系。通过采用正交设计L16(45)对兴安落叶松RAPD-PCR反应的5因素(Taq酶、Mg2+、dNTP、模板DNA、引物)在4个水平上进行优化试验,结果表明兴安落叶松最佳的RAPD-PCR的反应体系(20μL)中含有模板90ng,0.5μmol·L-1的引物,1×反应缓冲液,DNTP各为0.25mmol·L-1,1U的TaqDNA聚合酶,Mg2+2.5mmol·L-1。在此基础上筛选出20个扩增稳定、多态性丰富的RAPD引物,并通过梯度PCR试验,确定了引物最佳退火温度。 展开更多
关键词 兴安落叶松 rapd-pcr 正交设计 反应体系
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萝卜基因组DNA RAPD与ISSR-PCR反应体系优化 被引量:8
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作者 宋贤勇 柳李旺 +3 位作者 龚义勤 王明霞 赵丽萍 黄丹琼 《种子》 CSCD 北大核心 2007年第2期1-5,共5页
对影响PCR反应的主要因子——模板DNA、引物、dNTPs和Mg^2+浓度进行优化,建立起适合于萝卜基因组DNA的RAID和IssR反应体系。RAPD反应体系(18μl)为随机引物0.4~0.6μmol/L,dNTPs0.15~0.2mmol/L,Mg^2+ 2.0mmol/L,模板D... 对影响PCR反应的主要因子——模板DNA、引物、dNTPs和Mg^2+浓度进行优化,建立起适合于萝卜基因组DNA的RAID和IssR反应体系。RAPD反应体系(18μl)为随机引物0.4~0.6μmol/L,dNTPs0.15~0.2mmol/L,Mg^2+ 2.0mmol/L,模板DNA10~40ng,TaqDNA聚合酶0.8U;ISSR反应体系(16-)为引物0.5μmol/L,dNTPs 0.16mmol/L,Mg^2+ 2.5mmol/L,模板DNA10~40ng,TaqDNA聚合酶0.64U。对扩增程序中复性温度进行了梯度PCR试验,表明35~42℃(37℃)与52.4-58.3℃(55℃)分别适于萝卜基因组DNA的RAID.PCR和ISSR-PCR反应:应用优化的RAPD和ISSR反应体系对17个萝卜品种进行了鉴定分析。研究结果将为萝卜分子育种、品种鉴定与种子纯度检测提供重要的技术基础。 展开更多
关键词 萝卜 rapd-pcr ISSR-pcr 体系优化
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双孢蘑菇RAPD-PCR反应体系的优化 被引量:6
6
作者 陈文炳 林媛 +5 位作者 王泽生 邵碧英 廖剑华 李寿崧 江树勋 林河通 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2008年第10期428-432,共5页
本研究对6个影响双孢蘑菇RAPD-PCR反应的关键因素进行了一系列优化,目的在于建立理想的RAPD最佳反应条件和反应体系,为大量双孢蘑菇品种间的RAPD多样性分析做准备。各关键因素梯度设置如下:(1)7个退火温度梯度:33.5、36.5、38.3、40.1、... 本研究对6个影响双孢蘑菇RAPD-PCR反应的关键因素进行了一系列优化,目的在于建立理想的RAPD最佳反应条件和反应体系,为大量双孢蘑菇品种间的RAPD多样性分析做准备。各关键因素梯度设置如下:(1)7个退火温度梯度:33.5、36.5、38.3、40.1、43.7、45.4、48.1℃。(2)6个Mg2+浓度梯度:0.5、1.0、1.5、2.0、2.5、3mmol/L。(3)5个Taq酶用量梯度:0.5、1.0、1.5、2.0、2.5U。(4)5个dNTPs浓度梯度:0.10、0.15、0.20、0.25、0.30mmol/L。(5)5个引物浓度梯度:0.1、0.2、0.3、0.4、0.5μmol/L。(6)7个模板DNA用量梯度:100、20、4、0.8、0.16、0.032、0ng。实验结果表明:最佳的RAPD反应体系为:10×buffer2.0μl、Taq酶1.5U、模板DNA4-100ng、MgCl22.0mmol/L、dNTP0.20mmol/L,引物0.3μmol/L,加ddH2O至20μl。PCR热循环参数为94℃预变性5min;94℃变性1min,44℃退火1min50s,72℃延伸2min,循环40次;最后72℃延伸7min。 展开更多
关键词 蘑菇 rapdpcr 体系优化
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洋葱(Alliumcepa L.)RAPD-PCR反应体系及扩增程序的优化 被引量:7
7
作者 陈沁滨 侯喜林 +3 位作者 王建军 冷月强 蒋芳玲 薛萍 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2006年第4期434-438,共5页
为建立多态性高、稳定性好的洋葱RAPD-PCR反应体系,采用正交设计,研究了Taq酶、Mg2+、引物和dNTP 4种RAPD-PCR反应组分浓度变化对扩增结果的影响,在此基础上对模板DNA用量、扩增程序中退火温度和反应循环次数进行了筛选。试验结果表明,... 为建立多态性高、稳定性好的洋葱RAPD-PCR反应体系,采用正交设计,研究了Taq酶、Mg2+、引物和dNTP 4种RAPD-PCR反应组分浓度变化对扩增结果的影响,在此基础上对模板DNA用量、扩增程序中退火温度和反应循环次数进行了筛选。试验结果表明,洋葱20μl RAPD-PCR优化反应体系为1×Buffer、2.0 mmo1/L Mg2+、1.0 UTaqDNA聚合酶、200μmo1/L dNTP、0.6μmo1/L引物、2%甘油和15 ng DNA模板;PCR扩增程序为94℃预变性4 m in;94℃变性30 s,35℃退火40 s,72℃延长1.5 m in,45个循环;72℃保温延伸7 m in。 展开更多
关键词 洋葱 rapd-pcr反应体系 扩增程序 正交设计
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11种兰属植物DNA的提取及RAPD-PCR实验体系的建立与优化 被引量:7
8
作者 王国鼎 文晓鹏 +2 位作者 季祥彪 乔光 胡鹏 《种子》 CSCD 北大核心 2007年第3期24-27,共4页
采用改进的CTAB-DNA提取方法,从11种兰属植物的嫩叶中提取总DNA。所得的DNA样品的A260/A280值在1.7~1.9之间,琼脂糖凝胶上主带清晰,较少降解,样品纯度高,DNA量大。另外,对影响RAPD-PCR的Mg^2+、dNTPs、Taq酶、引物浓度等因... 采用改进的CTAB-DNA提取方法,从11种兰属植物的嫩叶中提取总DNA。所得的DNA样品的A260/A280值在1.7~1.9之间,琼脂糖凝胶上主带清晰,较少降解,样品纯度高,DNA量大。另外,对影响RAPD-PCR的Mg^2+、dNTPs、Taq酶、引物浓度等因素进行了优化。确定优化的反应体系为:75ng模板DNA,1×Buffer,2.5mmol/LMg^2+,0.15mmol/LdNTPs,0.75UTaq酶,引物浓度0.4μmol/L,反应总体积为25山。该体系在20个供试兰属实验材料中获得较好的扩增结果。 展开更多
关键词 兰属植物 DNA提取 rapd-pcr
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濒危竹种小蓬竹(Drepanostachyum luodianense)RAPD-PCR反应体系优化 被引量:4
9
作者 刘济明 王敏 +5 位作者 闫国华 赵小鹏 文萍 池馨 颜强 李鹏 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2014年第3期667-674,共8页
为了建立小蓬竹(Drepanostachyum luodianense)RAPD-PCR反应的最优体系,以小蓬竹基因组DNA为模板,对影响其RAPD扩增的dNTPs浓度、模板DNA浓度、Taq DNA聚合酶量、引物浓度、Mg2+浓度等重要参数进行了单因子和正交试验。试验得出小蓬竹R... 为了建立小蓬竹(Drepanostachyum luodianense)RAPD-PCR反应的最优体系,以小蓬竹基因组DNA为模板,对影响其RAPD扩增的dNTPs浓度、模板DNA浓度、Taq DNA聚合酶量、引物浓度、Mg2+浓度等重要参数进行了单因子和正交试验。试验得出小蓬竹RAPD最优反应体系为:20μL反应体系,10×PCR buffer为1/10体积,dNTPs为100μmol·L-1,模板DNA量为30 ng,Taq DNA聚合酶为1.0 U,引物浓度为0.2μmol·L-1,Mg2+浓度为1.5 mmol·L-1。优化后的RAPD-PCR反应程序为:94℃预变性5 min,然后进入35个循环,即94℃变性1 min,35℃退火30 s,72℃延伸90 s,循环完毕后于72℃延伸7 min,最后在4℃保持。 展开更多
关键词 小蓬竹 rapd-pcr 引物 dNTPs TAQ DNA聚合酶
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黄瓜DNA提取及其RAPD-PCR反应体系的优化 被引量:6
10
作者 孙敏 乔爱民 +1 位作者 王和勇 曾建军 《种子》 CSCD 北大核心 2004年第6期9-14,共6页
利用改良的 SDS方法提取黄瓜干种子与一步法提取的黄花苗总 DNA进行 RAPD扩增 ,其结果与传统的 CTAB和 SDS的结果一样。这两种方法不仅节约成本 ,且简单快速 ,大大降低了 DNA的提取难度 ,适宜黄瓜杂交种子纯度鉴定。不同组织材料对 RAP... 利用改良的 SDS方法提取黄瓜干种子与一步法提取的黄花苗总 DNA进行 RAPD扩增 ,其结果与传统的 CTAB和 SDS的结果一样。这两种方法不仅节约成本 ,且简单快速 ,大大降低了 DNA的提取难度 ,适宜黄瓜杂交种子纯度鉴定。不同组织材料对 RAPD无影响。研究了 RAPD的影响因素 ,改进及优化了 RAPD反应程序。结果表明 :Mg2 +浓度的范围为 1.5~ 3.0 mmol· L- 1 ,d NTPs浓度范围为 0 .15~ 0 .2 5 mmol· L- 1 ,Taq聚合酶浓度范围为 0 .5~ 1.5 U,模板DNA浓度为 2 0~ 10 0 ng,反应以及引物浓度为 0 .2~ 0 .4μmol· L- 1 。引物的碱基组成以及不同存放时间的引物对 RAPD扩增也有影响。 DNA预变性 94℃进行 4 min,94℃变性 30 s,37℃退火 30 s,72℃延伸 1min,循环 35次后 展开更多
关键词 黄瓜 DNA提取 rapd-pcr反应体系 优化
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天牛干标本DNA的提取及RAPD-PCR扩增反应 被引量:10
11
作者 徐光勇 陈斌 +2 位作者 吴蔚文 刘彦群 鲁成 《西南农业大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2003年第2期95-97,共3页
对标本馆保存多年的天牛标本进行基因组DNA的提取,并成功用于PAPD-PCR的扩增。结果显示基因组DNA的提取与标本的保存时间无直接的联系,而与标本保存的质量关系密切。用同一引物扩增,不同种天牛的扩增片段呈现多态性。
关键词 天牛标本 DNA提取 rapd-pcr 干标本
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奶牛乳房炎病例中金黄色葡萄球菌RAPD-PCR基因分型的研究 被引量:8
12
作者 王琳 杨学云 +2 位作者 王治才 李建军 丛府 《中国畜牧兽医》 CAS 2007年第11期76-78,共3页
用随机扩增多态性DNA技术(RAPD)对来自2个集约化奶牛场不同奶牛乳房炎病例分出的16株金黄色葡萄球菌进行了基因分型。分别用3个寡核苷酸引物扩增,仅OLP11引物可扩增出质量良好、具有RAPD特征的条带图谱。对反应体系的退火温度、模板浓... 用随机扩增多态性DNA技术(RAPD)对来自2个集约化奶牛场不同奶牛乳房炎病例分出的16株金黄色葡萄球菌进行了基因分型。分别用3个寡核苷酸引物扩增,仅OLP11引物可扩增出质量良好、具有RAPD特征的条带图谱。对反应体系的退火温度、模板浓度进行了筛选,模板原倍浓度、33℃的退火温度能使所有检测菌株产生清晰、可分辨、具有较好重复性的带谱。分型结果表明,16株菌可分为2个类群,其中14株位于同一类群,大多数菌株的相关系数差距仅为0.04,这一结果提示这些菌株可能具有相同的来源和相似的遗传背景。 展开更多
关键词 金黄色葡萄球菌 随机扩增DNA多态性 基因分型
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河鲈RAPD-PCR反应体系的建立与优化及引物筛选 被引量:4
13
作者 董艳艳 胡文革 +4 位作者 路李鹏 陈登稳 杨迪 王艳萍 韩晶 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第9期114-118,共5页
以河鲈为研究材料,对河鲈RAPD-PCR的反应体系进行优化和适用引物的筛选,采用正交设计方法,选用L17(54)正交表,以河鲈基因组DNA为模板,对影响PCR反应较大的4个因素:Taq酶、Mg2+、dNTPs、引物在5个水平上进行优化试验,得到河鲈最优RAPD-PC... 以河鲈为研究材料,对河鲈RAPD-PCR的反应体系进行优化和适用引物的筛选,采用正交设计方法,选用L17(54)正交表,以河鲈基因组DNA为模板,对影响PCR反应较大的4个因素:Taq酶、Mg2+、dNTPs、引物在5个水平上进行优化试验,得到河鲈最优RAPD-PCR反应体系:25μL反应体系中含有30 ng DNA模板1.5μL,10μmol/L引物0.7μL,10×buffer 2.5μL,25μmol/L dNTPs 0.4μL,5 U Taq酶0.2μL,2.5 mmol/L MgCl23.0μL;利用优化体系从50条引物中筛选得到10条适用引物,并确定了引物的最佳退火温度。 展开更多
关键词 河鲈 rapd-pcr 条件优化 适用引物 退火温度
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毁灭炭疽菌RAPD和ISSR-PCR最佳反应体系的建立 被引量:7
14
作者 邢红梅 丁平 +1 位作者 王克荣 周晓云 《广东农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第5期94-98,共5页
对影响PCR反应的主要因子-Mg2+、dNTP、Taq酶、引物浓度进行优化,建立起适合于毁灭炭疽菌基因组DNA的RAPD和ISSR反应体系。RAPD反应体系(25μL):Mg2+浓度为2.5 mmol/L,dNTP浓度为200μmol/L,Taq酶用量为1U,引物浓度1μmol/L。ISSR反应体... 对影响PCR反应的主要因子-Mg2+、dNTP、Taq酶、引物浓度进行优化,建立起适合于毁灭炭疽菌基因组DNA的RAPD和ISSR反应体系。RAPD反应体系(25μL):Mg2+浓度为2.5 mmol/L,dNTP浓度为200μmol/L,Taq酶用量为1U,引物浓度1μmol/L。ISSR反应体系(25μL)为:Mg2+浓度为2 mmol/L,dNTP浓度为150μmol/L,Taq酶用量为0.5 U,引物浓度为1.25μmol/L。 展开更多
关键词 毁灭炭疽菌 rapd-pcr ISSR-pcr 优化体系
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树木溃疡病病原真菌类群分子遗传多样性研究Ⅱ——Botryosphaeria属28S rDNA-PCR-RFLP和RAPD解析 被引量:31
15
作者 张星耀 赵仕光 +2 位作者 吕全 贾秀贞 刘会香 《林业科学》 CSCD 北大核心 2000年第2期75-81,共7页
BotryosphaeriaCes.etdeNot .(无性阶段是DothiorellaSacc .)属病原真菌能引起多种林木溃疡病的发生 ,在我国分布区域十分广泛。病原菌因较大的寄主范围和地理分布区域表现出明显的分子遗传分化 ,通过对来自 5个区 1 4个寄主种 (品种 )... BotryosphaeriaCes.etdeNot .(无性阶段是DothiorellaSacc .)属病原真菌能引起多种林木溃疡病的发生 ,在我国分布区域十分广泛。病原菌因较大的寄主范围和地理分布区域表现出明显的分子遗传分化 ,通过对来自 5个区 1 4个寄主种 (品种 )的 30个菌株进行 2 8SrDNA PCR RFLP和RAPD解析 ,结果表明 ,所有供试菌株都能扩增出稳定一致的 2 8SrDNA条带 ,6种内切酶不能区分该属内部的 2 8SrDNA差异。RAPD结果表现出该属丰富的多样性 (92 81 % ) ,在 0 845相似系数的水平上所有菌株被识别为 1 3类 ,其中有地理分化、寄主分化的表现 ,也有不表现地理、寄主分化的。从DNA水平上证实引起雪松溃疡病的病原为B .dothidea ,表明B .dothidea不仅能够寄生被子植物 ,还能寄生裸子植物 ,有非常宽阔的寄主范围。随机扩增引物K1 6和R1 4可以作为陕西菌株和湖南菌株与其它地区菌株区别的鉴别性引物。传统上认为苹果轮纹病菌 (B .berengerianadeNot.f.sp .piricola (Nose)KoganezawaetSakuma)为苹果干腐病菌 (B .berengerianabeNot.)的专化型 ,它们与杨树溃疡病原分属两个种。本试验分析表明这种分类较为合理。 展开更多
关键词 Botryosphaeria属 树木溃疡 病原真菌 28SrDNA
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长心卡帕藻RAPD-PCR反应体系的正交优化研究 被引量:7
16
作者 赵素芬 张婷 +1 位作者 应成琦 何培民 《生物技术通报》 CAS CSCD 2008年第4期161-165,共5页
采用SD(S十二烷基硫酸钠,20%)法提取了大型海藻长心卡帕藻(Kappaphycus alvarezii)基因组DNA。通过单因子梯度试验,确定了影响随机扩增DNA多态性(RAPD)扩增结果的模板、Mg2+、dNTPs、S22引物、Taq的适宜浓度、退火温度和反应的最佳循环... 采用SD(S十二烷基硫酸钠,20%)法提取了大型海藻长心卡帕藻(Kappaphycus alvarezii)基因组DNA。通过单因子梯度试验,确定了影响随机扩增DNA多态性(RAPD)扩增结果的模板、Mg2+、dNTPs、S22引物、Taq的适宜浓度、退火温度和反应的最佳循环次数;利用正交试验优化了模板、Mg2+、dNTPs、S22引物、Taq的配比浓度。结果表明,在进行长心卡帕藻的RAPD扩增时,在总体积为25μl的反应体系中,模板、Mg2+、dNTPs、S22引物、Taq的最佳浓度分别为15ng、2.0mmol/L、0.2mmol/L、0.25μmol/L、2.5U;退火温度为37℃。反应程序为94℃预变性5min,然后经94℃变性30s、37℃退火1min,72℃延伸2min,进行30次循环,最后在72℃再延伸10min。 展开更多
关键词 长心卡帕藻 DNA提取 随机扩增DNA多态性 反应体系
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南瓜属植物RAPD-PCR反应体系的建立与应用 被引量:5
17
作者 庄东红 黄秀丽 +2 位作者 吴奕瑞 林奕韩 郑汉藩 《武汉植物学研究》 CAS CSCD 北大核心 2005年第5期422-426,共5页
采用混合DNA样品池,利用正交法对南瓜属植物RAPD反应条件进行了探讨,并利用建立起来的优化体系,从35条引物中筛选出7条引物,对供试中国南瓜、印度南瓜和黑籽南瓜3个栽培种的7个品种进行了RAPD分析,结果均获得了较多的多态性位点。RAPD-... 采用混合DNA样品池,利用正交法对南瓜属植物RAPD反应条件进行了探讨,并利用建立起来的优化体系,从35条引物中筛选出7条引物,对供试中国南瓜、印度南瓜和黑籽南瓜3个栽培种的7个品种进行了RAPD分析,结果均获得了较多的多态性位点。RAPD-PCR反应扩增结果还显示,日本南瓜兼有中国南瓜和印度南瓜的特征带,聚类分析的结果则表明,它与中国南瓜的亲缘关系更近。 展开更多
关键词 南瓜属 rapd-pcr 混合DNA样品池 聚类分析
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松材线虫RAPD-PCR反应体系的优化与分子鉴定标记的筛选 被引量:3
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作者 张克云 张崇星 +3 位作者 吕毅 徐春花 王旭 林茂松 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第2期61-65,共5页
应用随机引物S344、S356和S360比较分析了PCR热循环复性温度、Mg^2+浓度和模板浓度对松材线虫基因组DNA的RAPD扩增结果的影响,旨在建立松材线虫的最佳反应体系,并以此进行松材线虫的分子鉴定标记筛选。结果表明:37℃的复性温度、3.... 应用随机引物S344、S356和S360比较分析了PCR热循环复性温度、Mg^2+浓度和模板浓度对松材线虫基因组DNA的RAPD扩增结果的影响,旨在建立松材线虫的最佳反应体系,并以此进行松材线虫的分子鉴定标记筛选。结果表明:37℃的复性温度、3.0mmol·L^-1Mg^2+、10μL反应体系中松材线虫基因组DNA模板1~25ng是研究松材线虫RAPD特征的最佳反应体系。利用此反应体系,通过对100个随机引物的分析,获得了3条松材线虫区别于拟松材线虫的分子鉴定标记。 展开更多
关键词 松材线虫 rapd优化反应体系 分子鉴定标记
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七株微囊藻系统进化关系的RAPD-PCR分析(英文) 被引量:2
19
作者 潘卉 宋立荣 +1 位作者 李寿东 刘永定 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 1999年第5期469-474,共6页
应用RAPD-PCR的方法,选用24个随机引物,分析来自不同地区的7株微囊藻的基因组多态性.结果显示,Microcystis.viridis及M.wesenbergii明显与M.aeruginosa区分开.M.aeruginosa分为两个可视为不同种的异源分类单位.作为对照的Anab... 应用RAPD-PCR的方法,选用24个随机引物,分析来自不同地区的7株微囊藻的基因组多态性.结果显示,Microcystis.viridis及M.wesenbergii明显与M.aeruginosa区分开.M.aeruginosa分为两个可视为不同种的异源分类单位.作为对照的Anabaenasp.7120与其他微囊藻株表现出完全不同的基因型及更远的遗传距离.此项研究表明,以基因型而不是表现型为基础,分析蓝藻种内及种间区别是可能的.因此,为解决蓝藻分类问题,特别是在种和属的水平上,提供了重要的线索.结合正在进行的用特异性及准确性强的引物区分微囊藻产毒及非产毒株的方法,RAPD-PCR可望将微囊藻产毒及非产每株进化关系澄清. 展开更多
关键词 微囊藻 rapd pcr 系统进化关系
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用SSR-PCR和RAPD技术研究中国不同地域旋毛虫株的遗传变异 被引量:17
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作者 李莉 牛安欧 +1 位作者 刘蓉 方正明 《中国人兽共患病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第9期757-761,共5页
目的 对中国不同地域的旋毛虫株基因组DNA进行多态性分析 ,并为其种及种下分类提供依据。方法 采用微卫星锚定PCR(SSR PCR)及随机扩增多态性DNA技术 (RAPD)对我国 6旋毛虫株基因组DNA进行PCR扩增 ,根据扩增产物电泳条带情况进行SAS分... 目的 对中国不同地域的旋毛虫株基因组DNA进行多态性分析 ,并为其种及种下分类提供依据。方法 采用微卫星锚定PCR(SSR PCR)及随机扩增多态性DNA技术 (RAPD)对我国 6旋毛虫株基因组DNA进行PCR扩增 ,根据扩增产物电泳条带情况进行SAS分析 ,计算遗传距离并构建进化树。结果 T3、T7与国内各地域株间遗传距离均大于 0 85 ;湖北株与天津株、黑龙江株与云南株之间的遗传距离均小于 0 2。河南株与前 4株的遗传距离在SSR PCR小于 0 3,在RAPD小于0 6。结论 中国 6株旋毛虫在基因水平可分为不同层次的 3类 :a 湖北株、天津株为一类 ;b 黑龙江株、云南株为一类 ;c 不明株与河南株归为一类或者不明株归为a类中。国内 6株归属于T1。此外 ,国际标准株T3。 展开更多
关键词 旋毛虫 遗传变异 rapd SSR-pcr 种株
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