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应用双向电泳和质谱技术筛选口腔扁平苔藓差异蛋白
被引量:
13
1
作者
王文梅
蒋文晖
+1 位作者
胡勤刚
郑春兰
《实用口腔医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第1期120-123,共4页
目的:筛选口腔扁平苔藓及正常黏膜组织的差异表达蛋白,为口腔扁平苔藓的发病机制及诊断治疗的研究提供实验室依据。方法:收集口腔扁平苔藓组织及正常口腔黏膜组织,提取组织蛋白,蛋白定量,进行双向电泳,图象分析寻找差异点,基质辅助激光...
目的:筛选口腔扁平苔藓及正常黏膜组织的差异表达蛋白,为口腔扁平苔藓的发病机制及诊断治疗的研究提供实验室依据。方法:收集口腔扁平苔藓组织及正常口腔黏膜组织,提取组织蛋白,蛋白定量,进行双向电泳,图象分析寻找差异点,基质辅助激光解吸飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)分析鉴定表达差异量较大的蛋白质点,确定所分析的蛋白质类型和功能。结果:(1)人口腔扁平苔藓及正常黏膜组织的双向电泳图谱的平均蛋白质点数分别为1576±67和1608±73,同一组织凝胶在蛋白质点位置上重复性较好。(2)通过比较人口腔扁平苔藓与正常黏膜组织的双向凝胶电泳图谱,得到差异表达蛋白质点数为13个,其中7个点在口腔扁平苔藓中为高表达,6个点在口腔扁平苔藓中为低表达。选择10个表达差异量较大的蛋白质点进行质谱和生物信息学分析,鉴定了其中的4个点,包括有锰超氧化物歧化酶(Mn-SOD),膜联蛋白I,波形蛋白,未知蛋白等。结论:锰超氧化物歧化酶,膜联蛋白I,波形蛋白,未知蛋白可能参与了口腔扁平苔藓的发生和发展,其相关机制尚待进一步阐明。双向电泳-质谱分析技术为口腔扁平苔藓发生发展过程中差异表达蛋白的研究提供了有效的技术手段。
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关键词
口腔
扁平苔藓
双向凝胶电泳
蛋白质组
肽质量指纹图谱
锰超氧化物歧化酶
膜联蛋白I
波形蛋白
未知蛋白
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职称材料
口腔鳞癌组织与口腔正常黏膜组织蛋白质差异表达的初步研究
被引量:
4
2
作者
王文梅
郑春兰
+3 位作者
胡勤刚
蒋文晖
黄晓峰
唐巍
《实用口腔医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第4期540-543,共4页
目的:筛选口腔鳞癌及正常口腔黏膜组织的差异表达蛋白质,为研究口腔鳞癌发生机制提供实验依据。方法:收集10例口腔鳞癌组织及正常口腔黏膜组织,进行二维电泳,选择在表达差异量较大的29个点进行质谱和生物信息学分析,确定所分析的蛋白质...
目的:筛选口腔鳞癌及正常口腔黏膜组织的差异表达蛋白质,为研究口腔鳞癌发生机制提供实验依据。方法:收集10例口腔鳞癌组织及正常口腔黏膜组织,进行二维电泳,选择在表达差异量较大的29个点进行质谱和生物信息学分析,确定所分析的蛋白质类型。结果:口腔鳞癌及相应正常口腔黏膜组织凝胶的平均蛋白质点数分别为2325±390和2487±281。双向凝胶电泳图显示,口腔鳞癌及正常口腔黏膜组织的差异表达蛋白质点数为29个,这29个点在癌组织中均为低表达,对其进行了质谱(PMF)和生物信息学分析,鉴定了其中的3个点,它们是:β纤维蛋白(fibrin beta)、磷酸丙糖异构酶(tri-osephosphate isomerase TIM)、unknown蛋白。结论:β纤维蛋白、磷酸丙糖异构酶、unknown蛋白在口腔鳞癌发生发展过程中发生了改变,其机制尚待进一步阐明。
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关键词
口腔
鳞癌
双向凝胶电泳
蛋白质组
肽质量指纹图谱
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职称材料
液泡前体蛋白质的双向电泳分离和质谱分析
3
作者
莫蓓莘
姜里文
《华东师范大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2005年第2期91-97,共7页
该文通过改进双向电泳方法克服了膜蛋白由于有疏水性而很难进入双向电泳第一相——等电聚焦电泳凝胶,以及由于从蔗糖密度梯度离心中分离得到的液泡前体富含干扰等电聚焦电泳效果的蔗糖等两大难点,成功地分离了通过蔗糖密度梯度离心分离...
该文通过改进双向电泳方法克服了膜蛋白由于有疏水性而很难进入双向电泳第一相——等电聚焦电泳凝胶,以及由于从蔗糖密度梯度离心中分离得到的液泡前体富含干扰等电聚焦电泳效果的蔗糖等两大难点,成功地分离了通过蔗糖密度梯度离心分离得到的液泡前体蛋白,并使膜蛋白进入了双向电泳凝胶.双向电泳后分离到约200余个蛋白质点,用基质辅助激光解吸/电离飞行时间串联质谱(MS/MS)进行肽质量指纹谱分析,并通过数据库检索进行蛋白质鉴定与功能预测,分析的23个蛋白中有13个在数据库中没有找到相对应的吻合蛋白,查询到的10个吻合蛋白中有6个功能未知.
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关键词
双向电泳
肽质量指纹谱
液泡前体
膜蛋白
烟草
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职称材料
题名
应用双向电泳和质谱技术筛选口腔扁平苔藓差异蛋白
被引量:
13
1
作者
王文梅
蒋文晖
胡勤刚
郑春兰
机构
江苏南京大学医学院附属口腔医院
出处
《实用口腔医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第1期120-123,共4页
基金
江苏省社会发展科技项目(编号:BS2004504)
文摘
目的:筛选口腔扁平苔藓及正常黏膜组织的差异表达蛋白,为口腔扁平苔藓的发病机制及诊断治疗的研究提供实验室依据。方法:收集口腔扁平苔藓组织及正常口腔黏膜组织,提取组织蛋白,蛋白定量,进行双向电泳,图象分析寻找差异点,基质辅助激光解吸飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)分析鉴定表达差异量较大的蛋白质点,确定所分析的蛋白质类型和功能。结果:(1)人口腔扁平苔藓及正常黏膜组织的双向电泳图谱的平均蛋白质点数分别为1576±67和1608±73,同一组织凝胶在蛋白质点位置上重复性较好。(2)通过比较人口腔扁平苔藓与正常黏膜组织的双向凝胶电泳图谱,得到差异表达蛋白质点数为13个,其中7个点在口腔扁平苔藓中为高表达,6个点在口腔扁平苔藓中为低表达。选择10个表达差异量较大的蛋白质点进行质谱和生物信息学分析,鉴定了其中的4个点,包括有锰超氧化物歧化酶(Mn-SOD),膜联蛋白I,波形蛋白,未知蛋白等。结论:锰超氧化物歧化酶,膜联蛋白I,波形蛋白,未知蛋白可能参与了口腔扁平苔藓的发生和发展,其相关机制尚待进一步阐明。双向电泳-质谱分析技术为口腔扁平苔藓发生发展过程中差异表达蛋白的研究提供了有效的技术手段。
关键词
口腔
扁平苔藓
双向凝胶电泳
蛋白质组
肽质量指纹图谱
锰超氧化物歧化酶
膜联蛋白I
波形蛋白
未知蛋白
Keywords
Mouth
Lichen planus
Two-dimensional gel electrophoresis
Proteome
peptide mass finger print( pmf)
Manganese superoxide disrnutase ( Mn-SOD )
Annexin I
Vimentin
Unknown protein
分类号
R781.5 [医药卫生—口腔医学]
Q503 [生物学—生物化学]
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职称材料
题名
口腔鳞癌组织与口腔正常黏膜组织蛋白质差异表达的初步研究
被引量:
4
2
作者
王文梅
郑春兰
胡勤刚
蒋文晖
黄晓峰
唐巍
机构
南京大学医学院附属口腔医院
出处
《实用口腔医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第4期540-543,共4页
基金
2007年南京市医学科技发展重大项目
文摘
目的:筛选口腔鳞癌及正常口腔黏膜组织的差异表达蛋白质,为研究口腔鳞癌发生机制提供实验依据。方法:收集10例口腔鳞癌组织及正常口腔黏膜组织,进行二维电泳,选择在表达差异量较大的29个点进行质谱和生物信息学分析,确定所分析的蛋白质类型。结果:口腔鳞癌及相应正常口腔黏膜组织凝胶的平均蛋白质点数分别为2325±390和2487±281。双向凝胶电泳图显示,口腔鳞癌及正常口腔黏膜组织的差异表达蛋白质点数为29个,这29个点在癌组织中均为低表达,对其进行了质谱(PMF)和生物信息学分析,鉴定了其中的3个点,它们是:β纤维蛋白(fibrin beta)、磷酸丙糖异构酶(tri-osephosphate isomerase TIM)、unknown蛋白。结论:β纤维蛋白、磷酸丙糖异构酶、unknown蛋白在口腔鳞癌发生发展过程中发生了改变,其机制尚待进一步阐明。
关键词
口腔
鳞癌
双向凝胶电泳
蛋白质组
肽质量指纹图谱
Keywords
Mouth
Squamous cell carcinoma (OSCC)
Two- dimensional gel electrophoresis
Proteome
Pep- tide
mass
finger
print
(
pmf)
分类号
R739.8 [医药卫生—肿瘤]
R781.5 [医药卫生—口腔医学]
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职称材料
题名
液泡前体蛋白质的双向电泳分离和质谱分析
3
作者
莫蓓莘
姜里文
机构
深圳大学生命科学学院
香港中文大学生物系
出处
《华东师范大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2005年第2期91-97,共7页
基金
香港自然科学基金资助项目(CUHK4260)
文摘
该文通过改进双向电泳方法克服了膜蛋白由于有疏水性而很难进入双向电泳第一相——等电聚焦电泳凝胶,以及由于从蔗糖密度梯度离心中分离得到的液泡前体富含干扰等电聚焦电泳效果的蔗糖等两大难点,成功地分离了通过蔗糖密度梯度离心分离得到的液泡前体蛋白,并使膜蛋白进入了双向电泳凝胶.双向电泳后分离到约200余个蛋白质点,用基质辅助激光解吸/电离飞行时间串联质谱(MS/MS)进行肽质量指纹谱分析,并通过数据库检索进行蛋白质鉴定与功能预测,分析的23个蛋白中有13个在数据库中没有找到相对应的吻合蛋白,查询到的10个吻合蛋白中有6个功能未知.
关键词
双向电泳
肽质量指纹谱
液泡前体
膜蛋白
烟草
Keywords
2-D electrophoresis
peptide
mass
finger
print
prevacuolar compartment
membrane protein
tobacco
分类号
Q946 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
应用双向电泳和质谱技术筛选口腔扁平苔藓差异蛋白
王文梅
蒋文晖
胡勤刚
郑春兰
《实用口腔医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2008
13
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
口腔鳞癌组织与口腔正常黏膜组织蛋白质差异表达的初步研究
王文梅
郑春兰
胡勤刚
蒋文晖
黄晓峰
唐巍
《实用口腔医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2009
4
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
液泡前体蛋白质的双向电泳分离和质谱分析
莫蓓莘
姜里文
《华东师范大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2005
0
在线阅读
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职称材料
已选择
0
条
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参考文献
引证文献
统计分析
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