应用巢式RT-PCR结合RFLP、SSCP对山东肾综合征出血热病人血清中HV基因检测和分型研究 被引量：4

1

作者 刘运喜 赵仲堂 +6 位作者 许晓群 李健 高媛 江佳富 张景兰 杨占清 曹务春 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第7期624-628,共5页

目的探讨山东肾综合征出血热重疫区病人血清中HV分子生物学特征,同时寻找准确、简便、迅速的HV检测与分型方法,从而为制定防治决策提供科学根据。方法从山东肾综合征出血热重疫区临沂市费县收集病人早期血清,应用巢式RT-PCR对病人血清中... 目的探讨山东肾综合征出血热重疫区病人血清中HV分子生物学特征,同时寻找准确、简便、迅速的HV检测与分型方法,从而为制定防治决策提供科学根据。方法从山东肾综合征出血热重疫区临沂市费县收集病人早期血清,应用巢式RT-PCR对病人血清中的HV进行基因扩增,采用RFLP、SSCP分型,并进行序列测定与分析。结果48份临床和ELISA检测确诊的HFRS病人血清经巢式RT-PCR扩增后,41份阳性,阳性率85.42%。41份阳性标本巢式RT-PCR产物经HindIII、HinfI酶切后,呈现2种不同的RFLP图谱:33份显示与R22株相似的酶切图谱,应属SEOV型;另外8份显示出与HTN76-118株相似的图谱,属HTNV型,这8份HTNV型标本均为10-12月间收集的病人血清。41份阳性标本巢式RT-PCR产物经SSCP分析,亦呈现2种不同的图谱:33份具有与R22株相似的SSCP图谱,应属SEOV型;而另8份则与HTN76-118株具有相似的SSCP图谱,属HTNV型。对部分扩增产物序列采用系统进化树分析也得出类似的结果:sdp1、sdp2、sdp3与HTN型76-118株亲缘关系相近,属同一簇,而sdp22、sdp37与SEOV型Z37、R22株亲缘关系相近,属另外一簇,这与RFLP和SSCP获得的结果相一致。结论山东肾综合征出血热重疫区病人基因型以SEOV型为主,但在秋冬季节也存在HTNV型。巢式RT-PCR结合RFLP、SSCP法可对HV准确分型,而且简便、迅速,适合于大规模流行病学调查。 展开更多

关键词 HV 巢式RT-pcr RFLP sscp 序列分析 基因型

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应用PCR-SSCP分析技术检测苯丙氨酸羟化酶基因突变和多态 被引量：4

2

作者 张学 孙开来 +5 位作者 姜莉 余明焕 金春莲 董贵章 黄尚志 方炳良 《中国医科大学学报》 CAS CSCD 1992年第3期169-171,共3页

应用聚合酶链式反应—单链构象多态分析(PCR-SSCP分析)技术检测苯丙酮尿症患者和正常人苯丙氨酸羟化酶基因外显子7。在9例苯丙酮尿症患者中检出3例为突变纯合子,在正常人和苯丙酮尿症患者中均检出DNA多态。研究结果对苯丙酮尿症的基因... 应用聚合酶链式反应—单链构象多态分析(PCR-SSCP分析)技术检测苯丙酮尿症患者和正常人苯丙氨酸羟化酶基因外显子7。在9例苯丙酮尿症患者中检出3例为突变纯合子,在正常人和苯丙酮尿症患者中均检出DNA多态。研究结果对苯丙酮尿症的基因诊断和突变基因分析有重要应用价值。 展开更多

关键词 苯丙氨酸 羟化酶基因 突变

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PCR-SSCP方法用于痰标本中结核分支杆菌rpoB基因突变检测 被引量：6

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作者 何秀云 庄玉辉 +3 位作者 李国利 吴雪琼 张晓刚 孙桂芝 《中国防痨杂志》 CAS 1997年第3期126-128,共3页

本文用PCR-SSCP方法直接检测痰标本中结核分支杆菌rpoB基因突变,评价此方法用于结核分支杆菌利福平耐药性试验的意义,以期建立一种直接检测分支杆菌耐利福平的快速方法。本文用PCR-SSCP方法分析了30例肺结核病人(单耐利福平或含利福平... 本文用PCR-SSCP方法直接检测痰标本中结核分支杆菌rpoB基因突变,评价此方法用于结核分支杆菌利福平耐药性试验的意义,以期建立一种直接检测分支杆菌耐利福平的快速方法。本文用PCR-SSCP方法分析了30例肺结核病人(单耐利福平或含利福平的多种耐药)和20例非结核性肺部疾病病人痰标本。30份肺结核病人的痰用PCR-SSCP检测痰中结核分支杆菌rpoB基因突变:21份痰PCR扩增阳性,其中13份SSCP图谱与参考株H_(37)RvSSCP图谱有差别,4份无差别;4份SSCP分析无条带出现SSCP分析阳性率为43.3%。而用套式PCR扩增,27份PCR扩增阳性,其中23份SSCP图谱与参考株H_(37)Rv有差别,阳性率为76.6%。20例非结核病人的痰,只有3份肺癌病人的痰rpoB基因258bp扩增阳性,其它均为阴性。PCR-SSCP成可望为直接检测临床标本中结核分支杆菌耐利福平的快速方法。 展开更多

关键词 结核分支杆菌 pcr-sscp RPOB基因突变 检测

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PCR-SSCP用于针叶树种遗传分析的可行性 被引量：6

4

作者 卢孟柱 王晓茹 AlfredE.Szmidt 《林业科学研究》 CSCD 北大核心 2000年第4期349-354,共6页

利用松树单倍体胚乳、双倍体的针叶材料 ,扩增了叶绿体基因组和核基因组的 5个 DNA片段 ,研究了 SSCP这一分析方法的可靠性。结果表明 SSCP分析方法具有坚实的分子基础、较高的分辨率和试验重复性。通过对 SSCP谱带在杂交子代和单倍体... 利用松树单倍体胚乳、双倍体的针叶材料 ,扩增了叶绿体基因组和核基因组的 5个 DNA片段 ,研究了 SSCP这一分析方法的可靠性。结果表明 SSCP分析方法具有坚实的分子基础、较高的分辨率和试验重复性。通过对 SSCP谱带在杂交子代和单倍体胚乳的分离分析 ,证明了 展开更多

关键词 pcr-sscp 针叶树 遗传分析 多态型

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尼罗罗非鱼Sox基因PCR-SSCP分析 被引量：4

5

作者 杨东 刘红艳 +1 位作者 张繁荣 余来宁 《江西农业学报》 CAS 2008年第9期99-101,104,共4页

参照人SRY基因HMG-box保守区序列,设计1对兼并引物,采用PCR技术扩增了尼罗罗非鱼Sox基因,在雌、雄尼罗罗非鱼个体中均扩增出5条带,大小分别约为200、400、600、800、1200 bp,回收200 bp左右扩增产物进行克隆,阳性克隆采用SSCP分析,筛选... 参照人SRY基因HMG-box保守区序列,设计1对兼并引物,采用PCR技术扩增了尼罗罗非鱼Sox基因,在雌、雄尼罗罗非鱼个体中均扩增出5条带,大小分别约为200、400、600、800、1200 bp,回收200 bp左右扩增产物进行克隆,阳性克隆采用SSCP分析,筛选不同基因片段。进一步对筛选的不同基因进行测序,结果获得了5个不同的228 bpSox基因,与Gen-Bank联机,采用BLAST方法与人类相应SOX基因进行序列比对,发现其与人类相应SOX蛋白的氨基酸序列一致性分别为97.2%、97.2%、94.4%、96%、88.2%,显示出这些基因在分子进化上具有高度的保守性。 展开更多

关键词 尼罗罗非鱼 SOX基因 pcr—sscp分析

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凡纳滨对虾CTSL基因PCR-SSCP多态性与生长性状的关联分析及其mRNA的差异表达 被引量：3

6

作者 钱昭英 李喜莲 +1 位作者 辛静静 刘小林 《海洋学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第6期121-127,共7页

利用PCR-SSCP技术对379尾凡纳滨对虾组织蛋白酶Cathepsin L(CTSL)基因多态性进行检测,采用最小二乘法对多态性与生长性状的相关性进行分析;利用Real-time quantitative PCR检测CTSL基因mRNA的差异表达情况。结果表明:引物C6(F/R)扩增片... 利用PCR-SSCP技术对379尾凡纳滨对虾组织蛋白酶Cathepsin L(CTSL)基因多态性进行检测,采用最小二乘法对多态性与生长性状的相关性进行分析;利用Real-time quantitative PCR检测CTSL基因mRNA的差异表达情况。结果表明:引物C6(F/R)扩增片段具有多态性,其扩增产物具有CC、CT和TT 3种基因型,TT基因型与CC基因型相比在第6外显子92bp处发生了C→T的突变,为沉默突变。最小二乘法分析结果表明,在体重、体长、第一腹节长和尾节长这4个指标上CC和CT基因型显著高于突变型TT(p<0.05),而在头胸甲长和头胸甲宽2个指标上,CC基因型显著高于CT和TT基因型(p<0.05)。CTSL基因mRNA在凡纳滨对虾各组织、不同性别个体肌肉组织、极端体重个体肌肉组织中相对表达量大小顺序分别为:肝胰脏>胃>眼柄>心脏>消化腺;雌虾>雄虾;极大个体>极小个体。结论:CTSL基因多态性对凡纳滨对虾生长性状有显著影响,可以作为影响该虾生长性状的候选基因,为该虾的选育提供分子遗传标记;CTSL基因mRNA的分布情况表明此基因可能正向调控对虾生长。 展开更多

关键词 凡纳滨对虾 组织蛋白酶L基因 pcr-sscp 关联分析 差异表达

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中国荷斯坦牛AGPAT6基因第2内含子PCR-SSCP分析 被引量：3

7

作者 张佳兰 昝林森 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2009年第27期12970-12971,13075,共3页

[目的]寻找影响奶牛产奶性能的候选基因。[方法]以中国荷斯坦牛为研究对象,采用PCR-SSCP方法对AGPAT6基因第2内含子进行单核苷酸多态性检测并分析多态位点对奶牛产奶量、乳脂率、乳蛋白率和乳中体细胞评分的影响。[结果]扩增出462 bp的... [目的]寻找影响奶牛产奶性能的候选基因。[方法]以中国荷斯坦牛为研究对象,采用PCR-SSCP方法对AGPAT6基因第2内含子进行单核苷酸多态性检测并分析多态位点对奶牛产奶量、乳脂率、乳蛋白率和乳中体细胞评分的影响。[结果]扩增出462 bp的中国荷斯坦牛AGPAT6基因第2内含子;PCR-SSCP分析该基因第2内含子有AA、AB和BB 3种基因型,其频率分别为0.151 1、0.657 8和0.191 1;不同基因型与中国荷斯坦牛产奶量、乳脂率和乳蛋白率之间显著相关(P<0.05),与体细胞评分相关不显著(P>0.05)。[结论]初步认为AGPAT6是影响奶牛产奶性能的一个候选基因或分子标记,该研究为奶牛选育提供了理论依据。 展开更多

关键词 AGPAT6基因 中国荷斯坦牛 pcr-sscp分析

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固始鸡与安卡鸡F_2资源群Myf5基因PCR-SSCP分析条件的优化

8

作者 黄煌 马新红 +4 位作者 康相涛 韩瑞丽 孙桂荣 亢娟娟 刘凯 《家畜生态学报》 2010年第1期34-37,共4页

为进行固始鸡与安卡鸡F2资源群Myf5基因的多态性研究,建立适合于该资源群的Myf5基因PCR-SSCP分析方法,对影响单链构象多态性(SSCP)图谱分辨率的凝`胶浓度、甘油浓度、电泳电压、电泳温度、电泳时间、PCR产物与上样缓冲液的比例、电泳缓... 为进行固始鸡与安卡鸡F2资源群Myf5基因的多态性研究,建立适合于该资源群的Myf5基因PCR-SSCP分析方法,对影响单链构象多态性(SSCP)图谱分辨率的凝`胶浓度、甘油浓度、电泳电压、电泳温度、电泳时间、PCR产物与上样缓冲液的比例、电泳缓冲液浓度、上样量等影响因素进行了比较系统的优化试验研究。结果表明:凝胶浓度10%、甘油浓度50%、上样量10μL、PCR产物与变性缓冲液比例为10∶10、电泳缓冲液为1×TBE、室温下300 V预电泳10 min后120 V电压电泳16 h,染色后条带细而清晰,能够准确分辨各基因型,为试验SSCP分析的最佳条件组合。 展开更多

关键词 固始鸡与安卡鸡F2资源群 Myf5基因 pcr-sscp 正交试验 分析条件优化

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光滑假丝酵母菌ITSⅠ区PCR-SSCP分子流行病学分析

9

作者 王菡 于仁涛 +2 位作者 刘建玲 纪蕾 韩黎 《中国感染控制杂志》 CAS 2008年第3期152-156,共5页

目的建立基于聚合酶链反应的单链构象多态性分析(PCR-SSCP)技术,对引起常见医院感染的光滑假丝酵母菌进行基因多态性分析,并探讨改善其灵敏度和分辨率的优化条件。方法采用PCR-SSCP技术对临床分离的19株光滑假丝酵母菌以及1株标准株ATCC... 目的建立基于聚合酶链反应的单链构象多态性分析(PCR-SSCP)技术,对引起常见医院感染的光滑假丝酵母菌进行基因多态性分析,并探讨改善其灵敏度和分辨率的优化条件。方法采用PCR-SSCP技术对临床分离的19株光滑假丝酵母菌以及1株标准株ATCC90030的rDNA的ITSⅠ区(引物ITS1/ITS2)和ITSⅡ区(引物ITS3/ITS4)多态性进行分析,并对PCR-SSCP的条件进行优化。结果ITSⅠ区较ITSⅡ区保守性低,变异性较强,较为适合SSCP分型。针对ITSⅠ区,SSCP电泳在无甘油时,4℃和15℃均将菌株分为6型,但各型所含菌株不同;存在5%甘油时,SSCP电泳分辨率明显增高。结论在15℃及5%甘油存在的条件下,针对ITSI区的PCR-SSCP分型是一种快速、简便的适合于致医院感染光滑假丝酵母菌分型的新流行病学研究手段。 展开更多

关键词 光滑假丝酵母菌 pcr-sscp 流行病学研究 真菌

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非同位素PCR－SSCP分析检测结肠腺瘤与腺癌中K－ras基因改变

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作者 邱红明 季晨阳 +2 位作者 董敬朋 张素娟 李春德 《第一军医大学学报》 CSCD 1994年第3期187-189,共3页

运用非同位素ＰＣＲ－ＳＳＣＰ分析检测结肠腺瘤与腺癌中Ｋ－ｒａｓ基因的改变，探讨该基因改变与结肠腺瘤不典型增生、结肠腺癌分期及分化程度之间的关系。结果显示，与自身正常及癌旁粘膜比较，２４例结肠腺场中，５例出现单链带的泳... 运用非同位素ＰＣＲ－ＳＳＣＰ分析检测结肠腺瘤与腺癌中Ｋ－ｒａｓ基因的改变，探讨该基因改变与结肠腺瘤不典型增生、结肠腺癌分期及分化程度之间的关系。结果显示，与自身正常及癌旁粘膜比较，２４例结肠腺场中，５例出现单链带的泳动变位，阳性率为２１％；１８例腺瘤中检出２例有单链带泳动变位，均为伴局部场变的腺瘤组织，提示当腺瘤发生ｒａｓ基因改变时，其恶性倾向增大。但结肠癌的分期及分化程度与ＰＣＲ－ＳＳＣＰ分析阳性率无明显相关性。增生性及幼年性息肉均未检出有改变。该法简便快速，不用同位素，可适用于临床标本检测。 展开更多

关键词 结肠肿瘤 K-RAS基因 聚合酶链反应 单链构象

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4个绒山羊群体KAP13-1基因的遗传多态性分析 被引量：5

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作者 李明娜 刘秀 +2 位作者 王继卿 李少斌 罗玉柱 《西北农林科技大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2013年第4期7-13,共7页

【目的】对中国河西绒山羊、内蒙古绒山羊、辽宁绒山羊和陇东绒山羊4个绒山羊群体KAP13-1基因的遗传特征进行分析,为揭示绒山羊遗传特征和生产利用提供基础数据。【方法】采用PCR-SSCP方法,检测河西绒山羊、内蒙古绒山羊、辽宁绒山羊及... 【目的】对中国河西绒山羊、内蒙古绒山羊、辽宁绒山羊和陇东绒山羊4个绒山羊群体KAP13-1基因的遗传特征进行分析,为揭示绒山羊遗传特征和生产利用提供基础数据。【方法】采用PCR-SSCP方法,检测河西绒山羊、内蒙古绒山羊、辽宁绒山羊及陇东绒山羊(共721只)KAP13-1基因的多态性。同时基于DA遗传距离用UP-GMA法进行聚类分析,以明确各群体间的遗传关系。【结果】基因组DNA扩增后得到491bp的扩增产物,经SSCP分析,从4个绒山羊群体KAP13-1基因中共发现6种基因型,4个等位基因中存在5个变异位点,这些多态位点主要为点突变,且均处于编码区,其中转换位点3个(占60%),颠换位点2个(占40%)。在170和197位分别发生了T→G、C→G的错义突变,导致氨基酸分别由Leu、Thr变为Arg、Ser。该基因在河西绒山羊与陇东绒山羊中均存在4个等位基因,而内蒙古绒山羊未检测到C和D等位基因,辽宁绒山羊未检测到D等位基因。聚类结果显示,河西绒山羊与陇东绒山羊之间的遗传距离较小,在系统发生树中聚为一支,辽宁绒山羊与内蒙古绒山羊聚为一支。【结论】KAP13-1基因在4个绒山羊群体中呈中度多态,群体间存在差异。生态学作用对4个绒山羊品种的进化过程有一定的影响。 展开更多

关键词 KAP13-1基因 绒山羊 pcr—sscp 遗传多态性

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猪H-FABP基因内含子3多态片段的序列分析 被引量：2

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作者 杨文平 李超 +6 位作者 张红梅 吴鹏 李明 沈海娥 王明艳 曹果清 周忠孝 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2009年第9期3972-3973,共2页

[目的]为确定影响肌内脂肪(IMF)沉积的主效基因奠定理论基础。[方法]以马身猪、大白猪、长白猪、杜洛克猪和山西白猪5个品种共383头猪为试验动物,应用PCR-SSCP方法分析猪H-FABP基因内含子3部分片段的多态性,并对每个多态片段进行测序分... [目的]为确定影响肌内脂肪(IMF)沉积的主效基因奠定理论基础。[方法]以马身猪、大白猪、长白猪、杜洛克猪和山西白猪5个品种共383头猪为试验动物,应用PCR-SSCP方法分析猪H-FABP基因内含子3部分片段的多态性,并对每个多态片段进行测序分析。[结果]在猪H-FABP基因内含子3的346位上具有2个等位基因A和B,该位点的变异由碱基A→G的替换造成。[结论]在猪H-FABP基因内含子3发现1个多态位点,为进一步研究H-FABP基因与IMF含量的关系奠定了基础。 展开更多

关键词 H-FABP基因 猪 序列分析 pcr-sscp

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MyoG基因多态性与优质肉鸡屠宰性状和肉质性状的相关性分析 被引量：37

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作者 王琼 刘益平 +4 位作者 蒋小松 杨朝武 杜华瑞 邱莫寒 朱庆 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2007年第9期1089-1096,共8页

采用PCR-SSCP分析方法,对8个品系240只个体的大恒优质肉鸡进行了MyoG基因5′调控区的研究。结果表明,MyoG基因5′调控区存在A、B2个多态位点,结合测定的生产资料,分析了该基因5′调控区两个变异位点产生的基因型之间在屠宰性状和肉质性... 采用PCR-SSCP分析方法,对8个品系240只个体的大恒优质肉鸡进行了MyoG基因5′调控区的研究。结果表明,MyoG基因5′调控区存在A、B2个多态位点,结合测定的生产资料,分析了该基因5′调控区两个变异位点产生的基因型之间在屠宰性状和肉质性状的差异并进行了最小二乘分析和显著性检验。表明MyoG基因对鸡的肌纤维生长发育有显著的正相关。 展开更多

关键词 鸡 MYOG基因 pcr-sscp 屠体性状 肉质性状 相关分析

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猪PPARGC1A基因的遗传变异检测及与胴体性状的关联分析 被引量：4

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作者 韩雪蕾 刘榜 +2 位作者 彭勇波 刘雪颖 张庆德 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第5期587-590,共4页

采用PCR-SSCP方法检测PPARGC1A基因第9外显子A1747C位点在通城猪及其杂交群体中的遗传变异,并分析其对胴体性状的影响。猪PPARGC1A基因第9外显子A1747C位点在通城猪(n=24)、瑞典长白猪(n=26)、英国大白猪(n=23)、长大通(n=43)、大长通(n... 采用PCR-SSCP方法检测PPARGC1A基因第9外显子A1747C位点在通城猪及其杂交群体中的遗传变异,并分析其对胴体性状的影响。猪PPARGC1A基因第9外显子A1747C位点在通城猪(n=24)、瑞典长白猪(n=26)、英国大白猪(n=23)、长大通(n=43)、大长通(n=40)存在多态分布,在长白猪中只有AA基因型。基因型频率分析表明国外品种中CC基因型频率低于国内地方品种;性状关联分析结果表明:CC基因型个体的胸腰椎背膘厚、肩部背膘厚和三点平均背膘厚显著高于AA基因型个体,等位基因C是胸腰椎背膘厚和三点平均背膘厚的增效等位基因。 展开更多

关键词 猪 PPARGC1A pcr-sscp 关联分析

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线粒体cox1序列分析支持北半球欧氏对盲囊线虫是一个新种 被引量：4

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作者 陈红玲 林瑞庆 +4 位作者 李国清 翁亚彪 吴绍强 宋慧群 朱兴全 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第1期29-35,共7页

欧氏对盲囊线虫 (Contracaecumogmorhini )是一种重要的人畜共患寄生虫病—异尖线虫病的病原之一。来自南北半球三个不同种群的C ogmorhini有着明显的地理分布差异和宿主特异性。应用PCR_SSCP技术分析了三个不同地理株的C ogmorhini在... 欧氏对盲囊线虫 (Contracaecumogmorhini )是一种重要的人畜共患寄生虫病—异尖线虫病的病原之一。来自南北半球三个不同种群的C ogmorhini有着明显的地理分布差异和宿主特异性。应用PCR_SSCP技术分析了三个不同地理株的C ogmorhini在线粒体DNA(mtDNA)细胞色素c氧化酶第I亚基 (cox1)部分序列的差异及种群遗传关系。用同位素 (γ3 3 P)对保守引物进行标记 ,通过PCR从单个欧氏对盲囊线虫DNA中扩增出一条长为 4 4 1bp的cox1基因片段 ,取阳性PCR扩增产物 ,对三个不同地理株的C ogmorhini进行SSCP分析 ,结果显示 :三个不同地理株的C ogmorhini4 4 1bp的cox1基因片段存在着一定的多态性 ,其中南半球的不同地理株其SSCP带型差异很小 ,而北半球和南半球的带型差异则略微明显。将SSCP分析筛选出的代表性样品进行克隆、测序 ,序列分析表明 :南半球的样品序列同源性很高 ,而北半球种群与南半球种群的序列同源性则相对较低 ,它们之间存在着 3个可作为其遗传标记的基因位点 ,从而说明北半球的C ogmorhini相对于南半球的C ogmorhini来说确实存在着遗传差异 ,很可能代表着一个新种。 展开更多

关键词 欧氏对盲囊俄虫 pcr-sscp 多态性 序列分析

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白羽番鸭脂联素基因内含子多态与肉质的关联分析 被引量：3

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作者 张依裕 徐琪 +4 位作者 段修军 张海波 赵文明 孙国波 陈国宏 《河南农业科学》 CSCD 北大核心 2010年第7期97-99,103,共4页

采用PCR-SSCP法对白羽番鸭脂联素基因内含子进行SNP检测,并分析SNP对肉质的遗传效应。结果表明,检测到3种基因型(CC、CT和TT)和2个等位基因(C和T),CT和C分别为优势基因型和优势等位基因。序列比对发现,在内含子内存在1个SNP位点T290C,... 采用PCR-SSCP法对白羽番鸭脂联素基因内含子进行SNP检测,并分析SNP对肉质的遗传效应。结果表明,检测到3种基因型(CC、CT和TT)和2个等位基因(C和T),CT和C分别为优势基因型和优势等位基因。序列比对发现,在内含子内存在1个SNP位点T290C,该位点在白羽番鸭群体中表现为中度多态,处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05);最小二乘法分析表明,CC基因型个体的IMF显著高于TT基因型个体(P<0.05),失水率极显著低于TT基因型个体(P<0.01);CT基因型个体的失水率显著低于TT基因型个体(P<0.05)。结果揭示,T290C位点可能对脂肪沉积有显著影响,CC基因型是白羽番鸭肉质较为优良的基因型。 展开更多

关键词 白羽番鸭 脂联素基因 pcr-sscp 关联分析

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白羽番鸭脂联素基因外显子1与肉质、TC和TG的关联分析 被引量：2

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作者 张依裕 徐琪 +4 位作者 段修军 张海波 赵文明 孙国波 陈国宏 《江西农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期115-118,134,共5页

采用PCR-SSCP法对白羽番鸭脂联素基因外显子1进行SNP检测,并分析SNP对肉质、血清总胆固醇(TC)和甘油三酯(TG)的遗传效应。结果表明,检测到3种基因型(AA、AB和BB)和2个等位基因(A和B),AA和A分别为优势基因型和优势等位基因,序列比对发现... 采用PCR-SSCP法对白羽番鸭脂联素基因外显子1进行SNP检测,并分析SNP对肉质、血清总胆固醇(TC)和甘油三酯(TG)的遗传效应。结果表明,检测到3种基因型(AA、AB和BB)和2个等位基因(A和B),AA和A分别为优势基因型和优势等位基因,序列比对发现在外显子1存在1个SNP位点:A167G,为沉默突变,该位点在白羽番鸭群体中表现为中度多态,处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05);最小二乘法分析表明,AA基因型个体的肌内脂肪(IMF)和血清总胆固醇(TC)显著高于BB基因型个体(P<0.05),而失水率则显著低于BB基因型个体(P<0.05)。结果揭示,A167G位点对脂肪沉积、失水率和胆固醇浓度可能有显著的遗传效应。 展开更多

关键词 白羽番鸭 脂联素基因 pcr-sscp 关联分析

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猪CACNA1S基因部分序列多态性检测及其与肉质性状的关联分析 被引量：3

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作者 王雪 方晓敏 +3 位作者 武玮 刘源 任守文 刘红林 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2010年第1期101-106,共6页

采用PCR-SSCP技术,对30头苏钟猪和97头金华与皮特兰杂交F2代(JPF2)猪CACNA1S基因进行多态性检测,结合肉质性状作关联分析。结果表明:在猪CACNA1S基因1 234 bp核酸序列中,检测到25个单核苷酸突变点(SNP);关联分析结果显示,引物1S-65的AA... 采用PCR-SSCP技术,对30头苏钟猪和97头金华与皮特兰杂交F2代(JPF2)猪CACNA1S基因进行多态性检测,结合肉质性状作关联分析。结果表明:在猪CACNA1S基因1 234 bp核酸序列中,检测到25个单核苷酸突变点(SNP);关联分析结果显示,引物1S-65的AA、BB基因型对后腿肌肉重存在显著影响(P<0.05),AB基因型对后腿pH存在显著影响(P<0.05);引物1S-66的BB、BC基因型对蹄重存在极显著影响(P<0.01)。 展开更多

关键词 猪 CACNA1S基因 pcr—sscp 肉质性状 相关分析

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肌细胞生成素基因多态性与泸宁鸡生长性状的关联研究 被引量：3

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作者 刘红丽 徐亚欧 +6 位作者 熊斌 胡卫民 梅寒 石浩 左斌 聂晓庆 王海 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2015年第3期629-637,共9页

本研究旨在探讨肌细胞生成素(myogenin,MyoG)基因多态性与泸宁鸡生长性状的关联性。采用PCRSSCP和DNA测序技术,对泸宁鸡MyoG基因5′调控区的多态性进行检测。结果表明,泸宁鸡MyoG基因5′调控区存在4个多态位点(A153G、A267G、A446G和C61... 本研究旨在探讨肌细胞生成素(myogenin,MyoG)基因多态性与泸宁鸡生长性状的关联性。采用PCRSSCP和DNA测序技术,对泸宁鸡MyoG基因5′调控区的多态性进行检测。结果表明,泸宁鸡MyoG基因5′调控区存在4个多态位点(A153G、A267G、A446G和C612T)。在153bp处存在A/G突变,形成3种基因型(AA、AG和GG),其中AA基因型肝脏重显著高于AG、GG基因型(P<0.05)。在446bp处存在的A/G突变,形成3种基因型(AA、AG和GG),该位点GG基因型屠宰率显著高于AA、AG基因型(P<0.05),AG、GG基因型胸肌率显著高于AA基因型(P<0.05)。以上结果显示,MyoG基因5′调控区的多态性与泸宁鸡肝脏重、屠宰率、胸肌率有一定的关联性,可作为泸宁鸡相应生长性状的候选基因。 展开更多

关键词 泸宁鸡 MYOG基因 pcr-sscp 生长性状 关联分析

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Ⅰ型神经纤维瘤病基因28及31号外显子突变的检测 被引量：3

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作者 周列民 刘焯霖 +1 位作者 梁秀龄 周珏倩 《中国神经精神疾病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2000年第5期291-293,共3页

目的　探讨国人Ⅰ型神经纤维瘤病 (NF1)基因突变的热点。方法　用PCR SSCP方法检查NF1基因 2 8和 3 1号外显子共约 10 60bp ,约占NF1基因全部编码区的 6 95 %。结果　在 2 7个家系中 ,发现 4个家系 (14 82 % )、13例病人(2 3 64 % )存... 目的　探讨国人Ⅰ型神经纤维瘤病 (NF1)基因突变的热点。方法　用PCR SSCP方法检查NF1基因 2 8和 3 1号外显子共约 10 60bp ,约占NF1基因全部编码区的 6 95 %。结果　在 2 7个家系中 ,发现 4个家系 (14 82 % )、13例病人(2 3 64 % )存在NF1基因突变。结论　提示本组病例 2 8和 3 1号外显子可能为突变热点。对突变性质的定论有赖于DNA序列分析。 展开更多

关键词 Ⅰ型神经纤维瘤病 基因突变 pcr-sscp

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