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81例产前超声诊断胎儿异常的基因检测分析及临床价值 被引量：2
1
作者 王咏梅 吴云 +2 位作者 周婷 杨玲 张沁欣 《南京医科大学学报(自然科学版)》 北大核心 2025年第1期35-40,共6页
目的:探讨在产前超声诊断胎儿异常(含结构畸形及软指标)但染色体微阵列分析(chromosome microarray analysis,CMA)未明确病因的情况下,行全外显子组测序(whole exome sequencing,WES)分析的价值。方法:收集2022年1月—2024年1月在南京... 目的:探讨在产前超声诊断胎儿异常(含结构畸形及软指标)但染色体微阵列分析(chromosome microarray analysis,CMA)未明确病因的情况下,行全外显子组测序(whole exome sequencing,WES)分析的价值。方法:收集2022年1月—2024年1月在南京医科大学附属妇产医院超声科检查发现胎儿异常,经遗传咨询后选择侵入性产前诊断,抽取绒毛或羊水行CMA检测,结果均为阴性的81例胎儿,对这些样本再行WES检测。基因变异位点的判定参照美国医学遗传学和基因组学学会遗传变异分类标准与指南进行分类。将致病性和可能致病性变异列为阳性结果,将临床意义未明、良性、可能良性列为阴性结果。结果:81例超声异常者包含47例单系统异常(58.02%)和34例多系统异常(41.98%)。WES共检出14例(17.28%)阳性,其中单系统异常和多系统异常各7例,其余67例阴性(82.72%)。阳性胎儿最多见的超声异常为心血管系统异常和骨骼系统异常,均为5例(35.71%),其次为泌尿系统异常4例(28.57%),此外2例胎儿在早期合并颈项透明层(nuchal translucency,NT)增厚(14.29%),中孕期超声发现多系统异常。结论:超声异常胎儿尤其是合并心血管、骨骼、泌尿系统异常或多系统异常时,如CMA检测未能明确病因,建议行WES检测,有可能发现遗传学病因。 展开更多
关键词 产前超声 产前诊断 染色体微阵列分析 全外显子测序
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基因标志物评分预测骨质疏松性髋部骨折患者术后谵妄
2
作者 刘颖 汪文华 赖尚树 《中国骨质疏松杂志》 北大核心 2025年第9期1322-1329,1404,共9页
目的构建基因标志物评分预测骨质疏松性髋部骨折(OHF)患者术后谵妄(POD)风险。方法选择我院2022年1月至2024年1月收治的121例OHF患者为研究对象。对9例POD和9例无POD的OHF患者血浆mRNAs进行微阵列分析。使用Cytoscape构建蛋白质-蛋白质... 目的构建基因标志物评分预测骨质疏松性髋部骨折(OHF)患者术后谵妄(POD)风险。方法选择我院2022年1月至2024年1月收治的121例OHF患者为研究对象。对9例POD和9例无POD的OHF患者血浆mRNAs进行微阵列分析。使用Cytoscape构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,基于度中心性(DC)值筛选前25%的核心基因并利用酶联免疫吸附法(ELISA)验证基因表达。通过最小绝对收缩和选择算子(LASSO)回归筛选并计算特征基因回归系数构建基因标志物评分,将其与临床数据结合构建预测OHF患者POD风险列线图。结果POD和无POD患者微阵列数据识别出161个基因在POD患者血浆中表达上调,63个基因在POD患者血浆中表达下调。PPI网络中基于DC值发现前25%核心基因有16个。ELISA验证表达后通过LASSO回归筛选并构建基因标志物评分:0.205×H3簇状组蛋白12(H3C12)表达量+0.055×整合素αX亚基(ITGAX)表达量-0.457×核糖体蛋白S4 Y-linked 1(RPS4Y1)表达量。基于基因标志物评分结合体质量指数(BMI)和血红蛋白(Hb)构建的列线图可有效预测OHF患者POD风险。结论包含H3C12、ITGAX和RPS4Y1的基因标志物评分和BMI和Hb的列线图可高效预测OHF患者POD风险,为患者术后早期预防和干预提供新的指导思路。 展开更多
关键词 骨质疏松性髋部骨折 术后谵妄 基因标志物 列线图 微阵列分析
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利用NASBA技术检测草莓斑驳病毒 被引量：8
3
作者 张志宏 李丽丽 杨洪一 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第6期858-862,共5页
依赖核酸序列的扩增(Nucleic acid sequence based amplification,NASBA)技术是以cDNA为中介体在等温条件下直接扩增单链RNA特异序列的核酸扩增技术,研究探索利用NASBA技术检测草莓斑驳病毒(Strawberry mottle virus,SMoV)。在对14个SMo... 依赖核酸序列的扩增(Nucleic acid sequence based amplification,NASBA)技术是以cDNA为中介体在等温条件下直接扩增单链RNA特异序列的核酸扩增技术,研究探索利用NASBA技术检测草莓斑驳病毒(Strawberry mottle virus,SMoV)。在对14个SMoV分离物序列分析的基础上,设计和筛选出适于SMoV检测的NASBA引物。NASBA检测SMoV的适宜反应温度为40℃。在9份草莓样品上检测SMoV的结果显示,NASBA检测结果与RT-PCR的检测结果一致,这表明初步建立了利用NASBA技术检测SMoV的技术体系。这是利用NASBA检测SMoV的首次报道。 展开更多
关键词 草莓 斑驳病毒 nasba 检测
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一种基于NASBA技术的新型快速肠道病毒检测方法的应用研究 被引量：3
4
作者 唐震 李显 +2 位作者 郭喜玲 吴涛 史智扬 《南京医科大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2010年第12期1729-1731,1759,共4页
目的:基于核酸等温扩增技术(nucleic acid sequence-based amplification,NASBA)荧光分子信标探针检测技术,进行肠道病毒的快速检测与辅助诊断。方法:根据Genebank上肠道病毒5′端非编码区序列,设计特异性引物与捕获探针,应用纳米技术... 目的:基于核酸等温扩增技术(nucleic acid sequence-based amplification,NASBA)荧光分子信标探针检测技术,进行肠道病毒的快速检测与辅助诊断。方法:根据Genebank上肠道病毒5′端非编码区序列,设计特异性引物与捕获探针,应用纳米技术对商品化磁珠进行偶联,NASBA方法进行扩增,NucliSens读数仪检测,荧光定量RT-PCR方法进行验证,同时验证NASBA方法的特异性、灵敏度和重复性。结果:该方法对肠道病毒具有高度特异性,与RSV等呼吸道相关病毒均无交叉反应,反应体系具有很高的稳定性。结论:本研究应用的肠道病毒NASBA检测方法特异、灵敏、快速简便,适用于肠道病毒的日常监测和爆发疫情的应急诊断。 展开更多
关键词 nasba 磁珠 捕获探针 肠道病毒
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硬粒小麦-普通小麦杂交后代农艺与品质性状分析 被引量：1
5
作者 马本兴 崔赫 +7 位作者 赵海波 王营 郑豫川 高翔 杨明明 赵万春 李晓燕 董剑 《麦类作物学报》 北大核心 2025年第4期440-447,共8页
为给小麦遗传改良和新品种选育提供丰富材料,对161份硬粒小麦与普通小麦杂交后代F6株系的农艺性状、条锈病抗性和品质性状进行检测,并对主要性状进行相关分析和主成分分析,利用0.1K基因芯片对其进行功能基因检测。结果发现,161份株系的... 为给小麦遗传改良和新品种选育提供丰富材料,对161份硬粒小麦与普通小麦杂交后代F6株系的农艺性状、条锈病抗性和品质性状进行检测,并对主要性状进行相关分析和主成分分析,利用0.1K基因芯片对其进行功能基因检测。结果发现,161份株系的农艺和品质性状变异较大,遗传多样性较丰富,大多数被测性状出现超亲现象。对被测性状进行主成分分析,综合排名前三株系的编号分别为137、98和155。对被测性状进行Q型聚类分析,161份株系可划分为五个类群,其中第Ⅲ类群综合表现最好,包括60个株系,具有高抗条锈病、小穗排列紧密、蛋白质含量高且质量好等特性,10号株系表现最好。利用0.1K芯片分析群体功能基因的分布,结合性状表现分析发现,F6群体后代中含有TaCwi-A1、Qpht-2D、Yr17基因,分别对提高千粒重、降低株高、抗条锈病有正向效应。主成分分析排名前列和Q聚类分析第三类群性状较好的株系可用于陕西小麦农艺与品质性状的遗传改良。 展开更多
关键词 普通小麦 硬粒小麦 杂交株系 农艺性状 芯片分析
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猪传染性胃肠炎病毒NASBA检测方法的建立 被引量：5
6
作者 李小兰 聂福平 +4 位作者 李应国 肖进文 徐自忠 胡世君 王昱 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第6期451-454,共4页
为建立猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)NASBA的检测方法,本研究利用BioEdit和BlastN,根据GenBank中猪TGEV的S基因保守序列设计引物,建立了扩增TGEV的NASBA检测技术。利用该方法建立的反应体系在41℃反应2h即可得到有效扩增。实验结果表明:该... 为建立猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)NASBA的检测方法,本研究利用BioEdit和BlastN,根据GenBank中猪TGEV的S基因保守序列设计引物,建立了扩增TGEV的NASBA检测技术。利用该方法建立的反应体系在41℃反应2h即可得到有效扩增。实验结果表明:该方法对TGEV进行扩增获得约200bp特异性目的条带,而对CSFV、PRRSV、PCV-2、PPV、PEDV和ST细胞扩增结果均为阴性。NASBA的灵敏度高于普通RT-PCR,与病毒分离方法相当,可检测到5pg的核酸。该方法为TGEV的早期诊断提供了新途径。 展开更多
关键词 猪传染性胃肠炎病毒 nasba检测方法
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抑制性消减杂交技术结合cDNA MICROARRAY技术在中国明对虾WSSV感染后差异表达基因研究上的应用 被引量：8
7
作者 王兵 桂朗 +1 位作者 李富花 相建海 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2008年第5期455-461,共7页
以中国明对虾WSSV感染6h的头胸部组织为实验材料,提取总RNA分别进行正反向抑制性PCRcDNA消减杂交,消减杂交后的PCR产物经纯化并克隆到T载体,进而转化成正反向消减文库。消减文库库容分别为:正向库,3.7×104;反向库,1.2×104。... 以中国明对虾WSSV感染6h的头胸部组织为实验材料,提取总RNA分别进行正反向抑制性PCRcDNA消减杂交,消减杂交后的PCR产物经纯化并克隆到T载体,进而转化成正反向消减文库。消减文库库容分别为:正向库,3.7×104;反向库,1.2×104。利用消减文库的克隆构建了cDNA表达谱芯片,共有1536个靶点,其中正、反向文库各768个。使用该cDNA芯片对WSSV感染后6h的对虾组织进行了表达谱分析,对其中80个出现明显表达调控变化的阳性克隆进行了测序。结果显示,在WSSV感染后6h,病毒基因开始大量表达,而宿主糖酵解,嘌呤、嘧啶代谢以及精氨酸代谢等代谢途径的关键基因出现明显下调。这表明病毒已在宿主体内大批量复制并开始抑制宿主代谢。病毒上调表达的WSV482可能与病毒毒力的增强有关,而宿主蛋白的管家基因如Actin,EFα的下调表达提示:在利用基因表达技术研究WSSV病毒的实验中,管家基因的选择要十分慎重。此外,根据作者已有的研究结果,TPI基因是比较好的候选管家基因。而WSV414、WSV215和WSV482是对WSSV进行RNA干涉实验较好的候选靶标基因。 展开更多
关键词 中国明对虾 消减文库 基因芯片
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超高速细胞分选平台结合cDNA microarray技术筛查宫颈癌细胞潜在分子标志物 被引量：1
8
作者 陈红香 周自华 周艳宏 《重庆医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期54-60,共7页
目的:通过超高速细胞分选平台结合cDNA microarray技术,筛查宫颈癌细胞可能潜在的分子标志物。方法:采用MoFlo XDP型超高速细胞分选平台纯化细胞膜表面表达CD38和不表达CD38的宫颈癌细胞,利用RNAlater技术得到cDNA microarray实验所需R... 目的:通过超高速细胞分选平台结合cDNA microarray技术,筛查宫颈癌细胞可能潜在的分子标志物。方法:采用MoFlo XDP型超高速细胞分选平台纯化细胞膜表面表达CD38和不表达CD38的宫颈癌细胞,利用RNAlater技术得到cDNA microarray实验所需RNA,然后进行基因芯片分析。结果:利用MoFlo XDP型超高速细胞分选平台可以获得纯度为99.0%以上的CD38阳性表达宫颈癌细胞。结论:cDNA microarray分析发现了RORA、PLIN4、AUTS2、IFITM1等宫颈癌细胞潜在分子标志物,为宫颈癌研究提供了新的技术方法。 展开更多
关键词 流式细胞术 cDNA microarray 宫颈癌 分子标志物
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联合应用SSH和cDNA Microarray筛选肺癌相关基因 被引量：4
9
作者 范保星 张开泰 +3 位作者 笪冀平 谢玲 王升启 吴德昌 《中国肺癌杂志》 CAS 2003年第2期97-101,共5页
目的　利用抑制消减杂交 (suppressionsubtractivehybridization ,SSH)和cDNAMicroarray筛选肺癌组织、肺癌旁组织和其它肿瘤组织中相互差异表达的基因。方法　将利用SSH构建的BEP2D细胞永生化阶段、恶性转化前阶段和恶性转化阶段三个c... 目的　利用抑制消减杂交 (suppressionsubtractivehybridization ,SSH)和cDNAMicroarray筛选肺癌组织、肺癌旁组织和其它肿瘤组织中相互差异表达的基因。方法　将利用SSH构建的BEP2D细胞永生化阶段、恶性转化前阶段和恶性转化阶段三个cDNA文库中的克隆制作在一张芯片上 ,筛选了 15例肺癌组织、5例肺癌旁组织和其他癌组织 2 4例 (肝癌、胃癌、食管癌、乳腺癌、白血病、子宫内膜癌、脑神经胶质瘤和结肠癌各 3例 )中mRNA的表达差异。结果　获得肺癌组织高于肺癌旁组织表达的cDNA 2 6个 ,肺癌旁组织高于肺癌组织表达的 31个。二者高于其它 8种癌组织的分别为 :肺癌旁组织中 63个 ,肺癌组织中 87个。结论　联合应用SSH和cDNAMicroarray是筛选和鉴定不同样本中差异表达基因的快速和有效的方法 ;肺癌旁组织和肺癌组织中差异表达的基因 ,以及这二者与其它组织差异表达的基因 ,不仅可能是肺癌发生发展机制中的重要基因 。 展开更多
关键词 SSH 基因 肺癌 肿瘤 治疗 诊断 BEP2D细胞
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核酸序列依赖性扩增技术(NASBA)概述 被引量：6
10
作者 张英英 谢鹏 《重庆医科大学学报》 CAS CSCD 2008年第z1期105-106,共2页
　　随着分子牛物学技术的快速发展,体外核酸扩增技术己逐步应用于科研和临床.最近几年才兴起的核酸序列依赖性扩增法(Nuleic and sequerce based amplipicain,NASBA)同传统的实验方法相比有灵敏性高,特异性强,快速,高通量等优点,而倍... 　　随着分子牛物学技术的快速发展,体外核酸扩增技术己逐步应用于科研和临床.最近几年才兴起的核酸序列依赖性扩增法(Nuleic and sequerce based amplipicain,NASBA)同传统的实验方法相比有灵敏性高,特异性强,快速,高通量等优点,而倍受中外学者的青睐.本文就NASBA方法作一综述.…… 展开更多
关键词 nasba 核酸序列依赖性扩增 扩增技术 检测探针 分子灯塔 扩增反应 RNA 实时定量 携带污染 敏感性
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鸭病毒性肝炎病毒NASBA检测方法的建立 被引量：2
11
作者 董航 毛文智 +1 位作者 邵洪泽 郭衍冰 《吉林畜牧兽医》 2016年第1期14-16,共3页
为了建立对鸭病毒性肝炎的检测方法,快速诊断DHV,本研究建立了DHV的NASBA检测方法并加以验证,实验结果表明该方法具有特异性、敏感性可重复性,该方法为鸭病毒性肝炎的诊断提供技术支持。
关键词 DHV nasba检测方法
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等温条件下序列特异性核酸扩增技术:NASBA 被引量：1
12
作者 刘敬忠 于力 孙燕 《高技术通讯》 EI CAS CSCD 1994年第2期27-29,共3页
介绍了一种能在等温条件下进行序列特异性核酸体外扩增的技术──ＮＡＳＢＡ（ＮｕｃｌｅｉｃＡｃｉｄＳｐｅｃｉｆｉｃ－ＢａｓｅｄＡｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ）。该技术同时使用ＡＭＶ反转录酶、Ｔ７ＲＮＡ聚合酶及ＲＮａｓｅＨ，在... 介绍了一种能在等温条件下进行序列特异性核酸体外扩增的技术──ＮＡＳＢＡ（ＮｕｃｌｅｉｃＡｃｉｄＳｐｅｃｉｆｉｃ－ＢａｓｅｄＡｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ）。该技术同时使用ＡＭＶ反转录酶、Ｔ７ＲＮＡ聚合酶及ＲＮａｓｅＨ，在同一个恒定温度下协同作用，使特异的核酸序列得以扩增至１０６～１０８倍。起始的模板可以是ＲＮＡ，也可以是ＤＮＡ，尤其适用于微量ｍＲＮＡ的特异性扩增。本文研究了各种因素对ＮＡＳＢＡ扩增效率的影响，找到了最适反应条件。并成功地从人脐带血总ＲＮＡ中扩增了人Ｔ细胞受体γ链ｍＲＮＡ。 展开更多
关键词 核酸体外扩增 序列 等温条件
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NASBA-ELISA检测曲霉菌方法的建立及在侵袭性曲霉病诊断中的应用评价
13
作者 杜丽 夏云 《重庆医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第1期142-146,共5页
目的:建立基于核酸序列依赖扩增的酶联免疫(enzyme-linked immunosorbent assay of nucleic acid sequence-based amplification,NASBA-ELISA)法用于侵袭性曲霉病(invasive aspergillosis,IA)的诊断,并评价其诊断价值。方法:将核酸序列... 目的:建立基于核酸序列依赖扩增的酶联免疫(enzyme-linked immunosorbent assay of nucleic acid sequence-based amplification,NASBA-ELISA)法用于侵袭性曲霉病(invasive aspergillosis,IA)的诊断,并评价其诊断价值。方法:将核酸序列依赖扩增技术(nucleic acid sequence-based amplification,NASBA)方法和高灵敏度的地高辛检测系统相结合,采用地高辛标记NASBA恒温扩增曲霉菌特异性18s RNA基因片段,用生物素标记的DNA探针在链酶亲和素包被的微孔板孔中杂交捕获地高辛标记的NASBA扩增产物,最后加入碱性磷酸酶标记的地高辛抗体和底物进行酶标显色,应用此法分别对梯度数量的曲霉菌孢子和其他临床常见菌株进行检测以评价其灵敏度和特异度,并通过对82例临床标本(32例阳性,50例阴性)的检测分析其临床诊断效能。结果:将含有梯度数量的曲霉菌孢子的样本提取总RNA后进行NASBA-ELISA检测,结果表明光密度值与霉菌孢子量对数存在线性相关关系(y=0.278x+0.119,R2=0.887),该方法的灵敏度可达1个孢子;对照菌株(大肠埃希菌、金黄色葡萄球菌、铜绿假单胞菌、白色念珠菌和新型隐球菌)和曲霉菌提取RNA后进行检测,结果仅曲霉菌的吸光度(absorbance,A)值大于设定的阈值(6个随机阴性标本的平均A值+3倍标准差)呈阳性;对82例临床标本进行NASBA-ELISA检测,其敏感度和特异度分别为80.6%、80.0%,受试者工作特征曲线曲线下面积为0.759(95%CI=0.644~0.874)。结论:NASBA-ELISA方法检测曲霉菌具有敏感性高、特异性强、操作简便的特点,适合常规实验室开展,为侵袭性曲霉病的早期诊断提供了一条新方法。 展开更多
关键词 nasba—ELISA 侵袭性曲霉病:曲霉菌
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SERS@Au微阵列芯片快速检测细菌性结膜炎病原体
14
作者 刘文博 李含 +5 位作者 徐瑗聪 刘梦东 王惠琴 林太凤 郑大威 张萍 《光谱学与光谱分析》 北大核心 2025年第2期476-482,共7页
急性细菌性结膜炎是一种常见的眼科疾病,医治不及时会严重损害视力。目前针对细菌性结膜炎常规的诊断方法仍为微生物培养法,该方法灵敏度高,但耗时耗力,难以满足快速检测的需求。该研究开发了一种SERS@Au微阵列芯片,将其作为增强基底收... 急性细菌性结膜炎是一种常见的眼科疾病,医治不及时会严重损害视力。目前针对细菌性结膜炎常规的诊断方法仍为微生物培养法,该方法灵敏度高,但耗时耗力,难以满足快速检测的需求。该研究开发了一种SERS@Au微阵列芯片,将其作为增强基底收集细菌性结膜炎相关金黄色葡萄球菌、大肠杆菌、铜绿假单胞菌和表皮葡萄球菌的SERS图谱。结果表明,该芯片具有良好的增强效果、重现性和稳定性。选取400~1800 cm^(-1)波段,通过建立SVM模型和OPLS-DA模型对四种致病菌进行判别分析,区分准确率分别达到97%和90%。采用SERS@Au微阵列芯片对加标泪液进行检测,仅需短暂培养即可快速、准确、便捷、无损筛查致病菌,减少患者的痛苦。该研究开发的SERS@Au微阵列芯片与便携式拉曼光谱仪配套使用,具有准确、便携、快速、现场检测及微量样品检测的特点,适用于眼科细菌性感染疾病的快速筛查。该方法无需标记、无需鉴定培养基、对患者无损,实现了对复杂生物样本混合感染的快速检测,大大提高了检测效率,有望成为眼科疾病的新型辅助筛查手段。 展开更多
关键词 表面增强拉曼光谱 微阵列芯片 细菌性结膜炎 正交偏最小二乘判别分析 支持向量机 快速检测
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整合生物信息学和实验验证研究续苓健骨方抗骨质疏松作用机制 被引量：1
15
作者 陈玄 黄景文 +8 位作者 谢丽华 陈娟 李生强 叶云金 黄小彬 何艳艳 薛立鹏 陈赛楠 葛继荣 《中国骨质疏松杂志》 北大核心 2025年第3期321-329,共9页
目的系统性预测续苓健骨方治疗骨质疏松症(osteoporosis,OP)的作用机制并实验验证。方法利用整合生物信息学方法分析药物的化合物信息及抗OP靶点、前20(TOP20)关键靶点及相关作用机制和信号通路。基于去卵巢(ovariectomy,OVX)大鼠模型,... 目的系统性预测续苓健骨方治疗骨质疏松症(osteoporosis,OP)的作用机制并实验验证。方法利用整合生物信息学方法分析药物的化合物信息及抗OP靶点、前20(TOP20)关键靶点及相关作用机制和信号通路。基于去卵巢(ovariectomy,OVX)大鼠模型,骨密度(bone mineral density,BMD)、生物力学、Micro CT、HE染色等指标验证疗效;转录组学及GO和KEGG分析初步验证机制和相关靶点;qRT-PCR和Western blot方法进一步验证关键靶点。结果药物的144个有效成分作用于242个靶点,主要参与血管发生;刺激应答;细胞增殖、分化、凋亡、迁移和黏附;骨重建和破骨分化;物质代谢等。其中TOP20关键靶点对应10种中药的55种化学成分,骨碎补和续断的活性成分居多。药物治疗可明显改善OVX大鼠骨组织的BMD、生物力学、Micro CT下骨质量参数及骨组织形态;转录组学检测获差异表达基因679个,GO和KEGG分析其机制与整合生物信息学结果基本相符,在代谢相关信号通路方面有明显富集,TOP20靶点的表达水平均发生相应改变;qRT-PCR和Western blot结果进一步证实了Gapdh、Tnf、Spp1、Mmp2、Mmp1、Mapk3、Hif1a、Esr1等基因表达水平在造模及药物治疗前后发生了相反变化。结论续苓健骨方药效与骨碎补和续断具有密切关系,Gapdh、Hif1a等代谢相关基因调控的代谢信号通路可能在其中发挥重要作用。 展开更多
关键词 骨质疏松 整合生物信息学 续苓健骨方 代谢 mRNA表达谱芯片 转录组学
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NASBA方法制备HIV/SHIV RNA定量测定标准品及其应用
16
作者 丛喆 刘秀英 +3 位作者 侯丽波 蒋虹 陈志伟 魏强 《中国比较医学杂志》 CAS 2009年第8期39-43,共5页
目的应用NASBA方法制备SIV／SHIV RNA定量测定标准品。方法应用NASBA方法直接扩增SIVmac251病毒gag基因上1476～1685之间的片段，扩增的RNA产物（RS-NASBA）纯化后10倍系列稀释，测定定量曲线、标准曲线，测定该标准品的稳定性和重复性... 目的应用NASBA方法制备SIV／SHIV RNA定量测定标准品。方法应用NASBA方法直接扩增SIVmac251病毒gag基因上1476～1685之间的片段，扩增的RNA产物（RS-NASBA）纯化后10倍系列稀释，测定定量曲线、标准曲线，测定该标准品的稳定性和重复性。结果应用Qiagen公司QuantiTect SYBR GREEN RT-PCRKit，该标准品可精确定量到2．033×10 copies／μL。结论外标准品RS．NASBA纯度高，稳定性好，可用于定量测定SIV／SHIV RNA拷贝数。 展开更多
关键词 依赖核酸序列的扩增技术 病毒载量 实时荧光定量RT-PCR
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NASBA技术研究进展 被引量：2
17
作者 张雷 卫广森 《现代畜牧兽医》 2010年第6期67-70,共4页
NASBA （Nucleic acid sequence-based amplifi-cation） 技术是由加拿大Cangen公司于1991年提出的一种核酸序列依赖扩增技术，该技术是由一对特异的引物介导的、三种酶催化的以单链RNA为模板的恒温扩增技术，具有操作简单、特异性强、... NASBA （Nucleic acid sequence-based amplifi-cation） 技术是由加拿大Cangen公司于1991年提出的一种核酸序列依赖扩增技术，该技术是由一对特异的引物介导的、三种酶催化的以单链RNA为模板的恒温扩增技术，具有操作简单、特异性强、灵敏度高、不易被污染等优点， 展开更多
关键词 扩增技术 nasba 核酸序列 加拿大 RNA 酶催化 灵敏度 介导
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NASBA技术及其在畜禽病毒检测中的应用 被引量：6
18
作者 张荣升 鄢明华 +1 位作者 张国伟 张莉 《动物医学进展》 CSCD 北大核心 2011年第7期101-104,共4页
NASBA即核酸序列依赖扩增技术,主要用于扩增RNA,是由一对特异性的引物介导的、连续均一的、体外核酸序列等温扩增反应过程。该技术具有操作简便,特异性强,敏感性高,快速,高通量等优点,目前已经广泛应用于人类与动物的多种病毒性疾病的检... NASBA即核酸序列依赖扩增技术,主要用于扩增RNA,是由一对特异性的引物介导的、连续均一的、体外核酸序列等温扩增反应过程。该技术具有操作简便,特异性强,敏感性高,快速,高通量等优点,目前已经广泛应用于人类与动物的多种病毒性疾病的检测,具有良好的应用前景。在禽流感病毒、新城疫病毒、猪传染性胃肠炎病毒、口蹄疫病毒等的检测中均表现出了很高的敏感性和特异性。论文简要介绍了NASBA技术的原理,特点以及在畜禽病毒检测中的应用,旨为病毒检测技术提供新的途径。 展开更多
关键词 nasba 原理 病毒检测
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自然妊娠、辅助生殖妊娠自然流产与流产组织染色体异常的关联 被引量：1
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作者 江旭 姚迪 +4 位作者 沈晔 郭凌岑 陶荷花 赵馨 杨岚 《中南大学学报(医学版)》 北大核心 2025年第1期36-44,共9页
目的:染色体异常是发生自然流产(spontaneous abortion,SA)的最常见原因。本研究旨在分析SA与流产组织染色体异常的关联,并比较不同的妊娠方式和不同的流产次数对流产组织染色体异常的影响,以期为临床咨询提供参考。方法:选择2019年1月... 目的:染色体异常是发生自然流产(spontaneous abortion,SA)的最常见原因。本研究旨在分析SA与流产组织染色体异常的关联,并比较不同的妊娠方式和不同的流产次数对流产组织染色体异常的影响,以期为临床咨询提供参考。方法:选择2019年1月至2023年12月于江南大学附属妇产医院(无锡市妇幼保健院)就诊的SA患者共1345例。根据妊娠方式分2组:自然妊娠组(S组,n=1242)、辅助生殖妊娠组(ART组,n=103)。按流产次数将S组的1242例患者进一步分为自然妊娠偶发性流产组(S-1组,n=780)、自然妊娠复发性流产组(S-2组,n=462),将ART组的103例患者进一步分为辅助生殖妊娠偶发性流产组(ART-1组,n=68)、辅助生殖妊娠复发性流产组(ART-2组,n=35)。采用染色体微阵列分析(chromosomal microarray analysis,CMA)技术对流产组织进行染色体分析。结果:S-1组和S-2组染色体数目异常的发生率分别为56.79%(443/780)和52.38%(242/462),染色体结构异常的发生率分别为4.36%(34/780)和7.36%(34/462),染色体结构异常发生率组间差异有统计学意义(P<0.05)。在自然妊娠SA病例中,随着流产次数的增多,染色体数目异常的发生率逐渐降低,流产≥4次组的染色体数目异常发生率明显低于流产1次、2次组(均P<0.05);流产1、2、3、≥4次组的染色体结构异常发生率分别为3.46%、5.65%、5.88%、4.35%,组间比较差异均无统计学意义(均P>0.05);致病性拷贝数变异(pathogenic copy number variants,pCNVs)+可能致病性拷贝数变异(likely pathogenic copy number variants,LP-CNVs)的发生率在流产次数1~3次组中逐渐升高,且1次组与2次组之间差异有统计学意义(P<0.05)。ART-1组和ART-2组染色体数目异常的发生率分别为47.06%(32/68)和37.14%(13/35),染色体结构异常发生率分别为2.94%(2/68)和11.43%(4/35),组间差异均无统计学意义(均P>0.05)。S-1与ART-1组、S-2与ART-2组之间染色体数目异常发生率、染色体结构异常发生率的差异均无统计学意义(均P>0.05)。结论:染色体数目异常和染色体结构异常在自然妊娠、辅助生殖妊娠SA患者中均有较高的发生率。在遗传学查因中应重视复发性流产患者。 展开更多
关键词 自然流产 染色体异常 拷贝数变异 染色体微阵列分析 自然妊娠 辅助生殖妊娠
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基于斑点杂交技术的6种水果源性成分膜芯片的检测方法构建
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作者 曲志强 李瑞 李羽翡 《甘肃农业大学学报》 北大核心 2025年第4期295-301,313,共8页
【目的】利用地高辛(digoxigenin,DIG)制备植物核糖体、线粒体片段基因的特异性标记探针,利用斑点杂交技术构建水果及水果饮品中植物源性成分的膜芯片检测方法。【方法】提取苹果、芒果、草莓、香蕉、杏、猕猴桃6种水果的核酸物质,通过... 【目的】利用地高辛(digoxigenin,DIG)制备植物核糖体、线粒体片段基因的特异性标记探针,利用斑点杂交技术构建水果及水果饮品中植物源性成分的膜芯片检测方法。【方法】提取苹果、芒果、草莓、香蕉、杏、猕猴桃6种水果的核酸物质,通过聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)扩增6种水果的特异性基因并测序;以地高辛为探针进行产物标记,并将其固定在尼龙膜表面,形成一系列低密度探针阵列。水果基因变性扩增产物形成的单链DNA与尼龙膜上标记的探针杂交,通过底物颜色变化形成肉眼可见的斑点,实现6种水果源性成分的检测。【结果】6种水果基因PCR扩增产物琼脂糖凝胶电泳结果显示,6种基因组DNA扩增带与目标片段大小相同。测序结果与GeneBank数据库中相应序列一致,GenBank登录号分别为:苹果KY964734.1、芒果MN477188.1、草莓MN601853.1、杏OL662912.1、猕猴桃MK425153.1、香蕉MT555127.1。验证探针的标记效率,将地高辛标记探针稀释至1 ng/μL、10 pg/μL、3 pg/μL、1 pg/μL 4个梯度进行显色反应,地高辛标记探针检测灵敏度为3 pg/μL。6种地高辛标记探针只与其相对应的水果特异性基因PCR扩增产物产生斑点杂交显点,无交叉反应发生,对随机购买的18个水果和果汁饮料样品进行检测,具有良好的特异性和准确性。【结论】结合PCR和可视化膜芯片杂交技术,成功建立了一种可用于水果及水果饮品中植物源性成分检测的膜芯片方法。 展开更多
关键词 地高辛 聚合酶链式反应 探针标记 斑点杂交 膜芯片
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